Melen Leclerc

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Affiliations actuelles
  • Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP)
  • Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
  • Département Santé des Plantes et Environnement (DPT SPE)
Identifiants chercheurs

Présentation

CURRENT POSITION

Researcher in plant disease epidemiology from the Plant Health and Environment (SPE) division of INRAE, located in the UMR IGEPP research unit (Rennes) and working in the Dynamics-Evolution-Modelling & Ecology team.

RESEARCH INTERESTS

plant disease epidemiology, mathematical modelling, statistics, combining modelling and experiments, IoT for agricultural and environmental monitoring, computer vision, plant architecture and resistance for disease mitigation

EDUCATION

  • 2009-2012 : PhD Thesis in Applied Ecology and Agronomy at INRA, Rennes, France.
  • 2006-2009 : Master in Engineering majoring in Fisherie Sciences at ENSAR, Rennes, France.

RESEARCH EXPERIENCE

  • Since 2014 : Permanent researcher at INRAE in plant disease epidemiology, UMR IGEPP, Rennes, France.
  • 2013-2014 : Post-doc at INRA in ecological modelling, UR BioSP, Avignon, France.
  • 2009-2012 : PhD student at INRA in closed collaboration with the Epidemiology and Modelling Group of the University of Cambrigde, URM IGEPP, Rennes, France.
  • 2009 : Intern at Agrocampus Ouest in marine ecology and fisheries science, UMR ESE, Rennes, France.
  • 2007 : Intern at Macquarie University in marine ecology, Marine Ecology Group, Sydney, Australia.

RESEARCH SUPERVISION

  • 2024-2027 : Romane Dubois, PhD, Computer vision for the quantification of plant disease severity, supervised with Lydia Bousset, Nicolas Parisey and Alexis Joly.
  • 2022-2025 : Hassan Hammoud,PhD, Software mechanisms for agile data collection in connected fields, supervised with Frédéric Weis and Jean-Marie Bonnin.
  • 2021-2025 : Sheila Permanes, PhD, Imaging and modelling of the spatio-temporal spread of parasites with growing lesions, supervised with Youcef Mammeri.

RESEARCH NETWORK

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Conception d’un support de prises de vue et d’une chaine d’analyse d’images pour l’estimation rapide de la surface foliaire sur feuilles détachées

Stéphane Jumel , Laurent Glais , Frederic Boulard , Christophe Langrume , Melen Leclerc

NOV'AE, 2025, régulier 04 NOV'AE, ⟨10.20870/Revue-NOVAE.2025.9729⟩

Article dans une revue hal-05418960v1
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Opportunities and Challenges in Combining Optical Sensing and Epidemiological Modelling

Alexey Mikaberidze , C. D. Cruz , Ayalsew Zerihun , Abel Barreto , Pieter Beck et al.

Phytopathology, 2025, 115 (10), pp.1260-1285. ⟨10.1094/phyto-11-24-0359-fi⟩

Article dans une revue hal-05100639v1
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Spatiotemporal modeling of host–pathogen interactions using level-set method

Sheila Rae Permanes , Melen Leclerc , Youcef Mammeri

Computers in Biology and Medicine, 2025, 193, pp.110340. ⟨10.1016/j.compbiomed.2025.110340⟩

Article dans une revue hal-05086840v2
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Building integrated plant health surveillance: a proactive research agenda for anticipating and mitigating disease and pest emergence

S. Soubeyrand , Arnaud Estoup , Astrid Cruaud , Sylvie Malembic-Maher , Christine Meynard et al.

CABI Agriculture and Bioscience, 2024, 5, pp.72. ⟨10.1186/s43170-024-00273-8⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-04672656v1

Investigating phenotypic traits as potential drivers of the emergence of EU_37_A2, an invasive new lineage of Phytophthora infestans in Western Europe

Britt Puidet , Romain Mabon , Michele Guibert , Riinu Kiiker , Kaire Loit et al.

Plant Pathology, 2023, 72 (4), pp.797-806. ⟨10.1111/ppa.13700⟩

Article dans une revue hal-04169443v1
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Imaging with spatio-temporal modelling to characterize the dynamics of plant-pathogen lesions

Melen Leclerc , Stéphane Jumel , Frédéric M. Hamelin , Rémi Treilhaud , Nicolas Parisey et al.

PLoS Computational Biology, 2023, 19 (11), pp.e1011627. ⟨10.1371/journal.pcbi.1011627⟩

Article dans une revue hal-04312350v2
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Impact of the potato inoculation date on potato virus Y load and viral distribution in daughter tubers at harvest

Frederic Boulard , Gallien Rohaut , David Dupre , Florian Barbe Barrailh , Amelie Person et al.

Plant Pathology, 2022, 71 (6), pp.1323-1334. ⟨10.1111/ppa.13573⟩

Article dans une revue hal-03711569v1

Examining Phenotypic Traits Contributing to the Spread in Northern European Potato Crops of EU_41_A2, a New Clonal Lineage of Phytophthora infestans

Britt Puidet , Romain Mabon , Michele Guibert , Riinu Kiiker , Liina Soonvald et al.

Phytopathology, 2022, 112 (2), pp.414-421. ⟨10.1094/phyto-12-20-0542-r⟩

Article dans une revue hal-03651826v1
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Optimal spatial monitoring of populations described by reaction–diffusion models

Nicolas Parisey , Melen Leclerc , Katarzyna Adamczyk-Chauvat

Journal of Theoretical Biology, 2022, 534, pp.110976. ⟨10.1016/j.jtbi.2021.110976⟩

Article dans une revue hal-03651840v1
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Besides stem canker severity, oilseed rape host genotype matters for the production of Leptosphaeria maculans fruit bodies

Lydia Bousset , Patrick Vallée , Régine Delourme , Nicolas Parisey , Marcellino Palerme et al.

Fungal Ecology, 2021, 52, pp.101076. ⟨10.1016/j.funeco.2021.101076⟩

Article dans une revue hal-03313558v1

Competition and facilitation among fungal plant parasites affect their life-history traits

Agathe Dutt , Rault Anthony , Didier Andrivon , Stéphane Jumel , Gwenola Le Roy et al.

Oikos, 2021, 130 (4), pp.652-667. ⟨10.1111/oik.07747⟩

Article dans une revue hal-03227966v1

Life history traits and trade‐offs between two species of the ascochyta blight disease complex of pea

Agathe Dutt , Didier Andrivon , Stéphane Jumel , Gwenola Le Roy , Alain Baranger et al.

Plant Pathology, 2020, 69 (6), pp.1108-1124. ⟨10.1111/ppa.13180⟩

Article dans une revue hal-03141975v1

A spatio-temporal exposure-hazard model for assessing biological risk and impact

Emilie Walker , Melen Leclerc , Jean-François Rey , Rémy Beaudouin , Samuel Soubeyrand et al.

Risk Analysis, 2019, 39 (1), Accepté. ⟨10.1111/risa.12941⟩

Article dans une revue ineris-01853555v1

Automated image processing framework for analysis of the density of fruiting bodies of Leptosphaeria maculans oilseed rape stems

Lydia Bousset , Marcellino Palerme , Melen Leclerc , Nicolas Parisey

Plant Pathology, 2019, 68 (9), pp.1749-1760. ⟨10.1111/ppa.13085⟩

Article dans une revue hal-02457189v1
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Assessing the effects of quantitative host resistance on the life-history traits of sporulating parasites with growing lesions

Melen Leclerc , Julie a J Clément , Didier Andrivon , Frédéric Marie Hamelin

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2019, 286 (1912), pp.20191244. ⟨10.1098/rspb.2019.1244⟩

Article dans une revue hal-02352206v1

Spatial exposure-hazard and landscape models for assessing the impact of GM crops on non-target organisms

Melen Leclerc , Emily Walker , Antoine Messean , Samuel Soubeyrand

Science of the Total Environment, 2018, 624, pp.470 - 479. ⟨10.1016/j.scitotenv.2017.11.329⟩

Article dans une revue hal-02623371v1
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Reducing the use of pesticides with site-specific application: the chemical control of Rhizoctonia solani as a case of study for the management of soil- borne diseases

Ronan Le Cointe , Thomas Simon , Patrick Delarue , Maxime Hervé , Melen Leclerc et al.

PLoS ONE, 2016, 11 (9), pp.1-18. ⟨10.1371/journal.pone.0163221⟩

Article dans une revue hal-01462777v1
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Estimating the delay between host infection and disease (incubation period) and assessing its significance to the epidemiology of plant diseases

Melen Leclerc , Thierry Doré , Christopher A Gilligan , Philippe Lucas , João a N Filipe

PLoS ONE, 2014, 9 (1), pp.e86568. ⟨10.1371/journal.pone.0086568⟩

Article dans une revue hal-01173303v1
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Host growth can cause invasive spread of crops by soilborne pathogens

Melen Leclerc , Thierry Doré , Christopher A. Gilligan , Philippe Lucas , Joao A. N. Filipe

PLoS ONE, 2013, 8 (5), pp.e63003. ⟨10.1371/journal.pone.0063003⟩

Article dans une revue hal-01186843v1

Mobilising agricultural equipment and digital technology for pesticide-free cropping systems

Xavier Reboud , Laurent Bedoussac , Vincent Cellier , Stéphane Cordeau , Sylvain Delzon et al.

Towards pesticide-free agriculture. Research and innovations in a future crop protection paradigm, Editions Quae, 1ère édition, 2024

Chapitre d'ouvrage hal-04948622v1
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Mobiliser les agroéquipements et le numérique pour des systèmes de culture sans pesticides

Xavier Reboud , Laurent Bedoussac , Vincent Cellier , Stephane Cordeau , Sylvain Delzon et al.

Zéro pesticide : un nouveau paradigme de recherche pour une agriculture durable, Editions QUAE, 2022, 978-2-7592-3310-6

Chapitre d'ouvrage hal-03609281v1
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Toward a More Realistic Energy Consumption Model for IoT Nodes in Extreme-Edge Computing Environments

Hassan Hammoud , Frédéric Weis , Melen Leclerc , Jean-Marie Bonnin

IoTBDS 2025, 10th International Conference on Internet of Things, Big Data and Security, Apr 2025, Porto, Portugal. ⟨10.5220/0013273800003944⟩

Communication dans un congrès hal-04910952v1
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Monitoring of in-field risk of infection events by foliar pathogens using smart IoT nodes

Hassan Hammoud , Frédéric Weis , Christophe Langrume , Melen Leclerc , Jean-Marie Bonnin

2024 IEEE Cybermatics Congress - International Conference on Internet of Things, Aug 2024, Copenhagen, Denmark. pp.324-330, ⟨10.1109/ithings-greencom-cpscom-smartdata-cybermatics62450.2024.00071⟩

Communication dans un congrès hal-04752653v2
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Estimation de ligne de base de capteurs d'humectation : intégration et minimums locaux à différentes échelles

Jean-Yves Baudais , Melen Leclerc , Christophe Langrume

Colloque GRETSI, Sep 2022, Nancy, France. pp.773-776

Communication dans un congrès hal-03775373v1

Effets combinés de l’architecture, de la résistance de la plante, de produits de biocontrôle et du mélange de variétés pour la lutte contre le mildiou de la pomme de terre

Claudine Pasco , Bruno B. Marquer , Serge Carrillo , Herve Douchy , Melen Leclerc et al.

12ème rencontres de Phytopathologie - Mycologie Aussois, Jan 2018, AUSSOIS, France

Communication dans un congrès hal-03417333v1
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Modélisation du mouvement des chevreuils dans un paysage bocager simulé : premiers résultats, projets

Nicolas Parisey , Marcellino Palerme , Goulard Michel , Melen Leclerc , Nicolas Morellet et al.

Colloque PAYOTTE 2017, Oct 2017, Paris, France. 31 p

Communication dans un congrès hal-02737836v1

An epidemiological modelling framework to help agronomists defining crop protection strategies : the risk of R. solani in sugar beet using biofumigation

Melen Leclerc , Thierry Doré , Christopher A. Gilligan , Philippe Lucas , Joao A. N. Filipe

ESA 12th congress, Aug 2012, Helsinki, Finland

Communication dans un congrès hal-01359406v1
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Imagerie pour la quantification de symptômes sur feuilles détachées.

Stéphane Jumel , Nicolas Parisey , Lydia Bousset , Melen Leclerc

13e Rencontre de phytopathologie-mycologie (Journées Jean Chevaugeon), Sep 2022, AUSSOIS, France

Poster de conférence hal-04164177v1
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Acquisition standardisée et traitement d'images pour l'estimation rapide de la surface foliaire sur feuilles détachées

Stéphane Jumel , Laurent Glais , Melen Leclerc

13e rencontre de phytopathologie-mycologie (Journée Jean Chevaugeon), Sep 2022, Aussois, France

Poster de conférence hal-04164124v1
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Towards control of Ascochyta Blight in pea/wheat intercrops using qualitative modeling Centre Occitanie-Toulouse

David Camilo Corrales , Alain Baranger , Stéphane Jumel , Melen Leclerc , Christophe Langrume et al.

2nd International Crop Modelling Symposium (iCROPM2020), Feb 2020, Montpellier, France.

Poster de conférence hal-02484929v1

Towards control of Ascochyta Blight in pea/wheat intercrops using qualitative modeling

David Camilo Corrales Munoz , Alain Baranger , Stéphane Jumel , Melen Leclerc , Christophe Langrume et al.

2. International Crop Modelling Symposium (iCROPM2020), Feb 2020, Montpellier, France. , 2020, Crop modelling for Agriculture and Food Security under Global Change (ICROPM 2020)

Poster de conférence hal-02737546v1

EPIDEMIOLOGICAL ANALYSIS OF THE EFFECTS OF BIOFUMIGATION ON THE SPREAD OF RHIZOCTONIA SOLANI IN SUGAR BEET

Melen Leclerc , Joao A. N. Filipe , Sylvain Poggi , Thierry Doré , Françoise Montfort et al.

73rd IIRB Congress, Feb 2012, Bruxelles, Belgium

Poster de conférence hal-01359412v1

Évaluation des effets combinés de différents leviers : architecture, résistance, produits de biocontrôle et mélange de variétés.

Claudine Pasco , Bruno B. Marquer , Serge Carrillo , Herve Douchy , Melen Leclerc et al.

[Rapport de recherche] Présentation en COPIL du projet MilPomBio AAP Pour et sur le plan Ecophyto – Contribuer à l’essor du biocontrôle. 2017

Rapport (rapport de recherche) hal-03419754v1