Nicolas Pech

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Microbiota associated with the skin, gills, and gut of the fish Parachondrostoma toxostoma from the Rhône basin

Emmanuel Guivier , Nicolas Pech , Rémi Chappaz , André Gilles
Freshwater Biology, 2020, ⟨10.1111/fwb.13437⟩
Article dans une revue hal-02505021 v1

Canals as ecological corridors and hybridization zones for two cyprinid species

Emmanuel Guivier , André Gilles , Nicolas Pech , Nicolas Duflot , Laurence Tissot et al.
Hydrobiologia, 2019, 830 (1), pp.1-16. ⟨10.1007/s10750-018-3843-1⟩
Article dans une revue hal-03438478 v1
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Microbiota Diversity Within and Between the Tissues of Two Wild Interbreeding Species

Emmanuel Guivier , Jean-François Martin , Nicolas Pech , Arnaud Ungaro , Rémi Chappaz et al.
Microbial ecology, 2018, 75 (3), pp.799-810. ⟨10.1007/s00248-017-1077-9⟩
Article dans une revue hal-02270253 v1
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Challenges and advances for transcriptome assembly in non-model species

Arnaud Ungaro , Nicolas Pech , Jean-François Martin , R. J. Scott Mccairns , Jean-Philippe Mévy et al.
PLoS ONE, 2017, 12 (9), pp.e0185020. ⟨10.1371/journal.pone.0185020⟩
Article dans une revue hal-01681642 v1

Multi-scale biomarker evaluation of the toxicity of a commercial azo dye (Disperse Red 1) in an animal model, the freshwater cnidarian Hydra attenuata

Laetitia de Jong , Nicolas Pech , Gisela de Aragao Umbuzeiro , Xavier Moreau
Water Research, 2016, 96, pp.62-73. ⟨10.1016/j.watres.2016.03.043⟩
Article dans une revue hal-01452189 v1
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When anthropogenic river disturbance decreases hybridisation between non-native and endemic Cyprinids and drives an ecomorphological displacement towards juvenile state in both species

Emmanuel Corse , Nicolas Pech , Melthide Sinama , Caroline Costedoat , Rémi Chappaz et al.
PLoS ONE, 2015, 10 (11), pp.e0142592. ⟨10.1371/journal.pone.0142592⟩
Article dans une revue hal-01445169 v1

QDD version 3.1: a user-friendly computer program for microsatellite selection and primer design revisited: experimental validation of variables determining genotyping success rate

Emese Meglécz , Nicolas Pech , André Gilles , Vincent Dubut , Pascal Hingamp et al.
Molecular Ecology Resources, 2014, 14 (6), pp.1302-1313. ⟨10.1111/1755-0998.12271⟩
Article dans une revue istex hal-02356473 v1
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Evolutionary history of Chaetognatha inferred from molecular and morphological data: a case study for body plan simplification

Samah Gasmi , Gabriel Nève , Nicolas Pech , Sada Tekaya , André Gilles et al.
Frontiers in Zoology, 2014, 11 (1), pp.84. ⟨10.1186/s12983-014-0084-7⟩
Article dans une revue hal-01785760 v1
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Phylogenetic Analysis of Thecosomata Blainville, 1824 (Holoplanktonic Opisthobranchia) Using Morphological and Molecular Data

Emmanuel Corse , Jeannine Rampal , Corinne Cuoc , Nicolas Pech , Yvan Perez et al.
PLoS ONE, 2013, 8 (4), pp.59439 - 59439. ⟨10.1371/journal.pone.0059439⟩
Article dans une revue hal-01771570 v1
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Non-homogeneous combination of two porous genomes induces complex body shape trajectories in cyprinid hybrids

Melthide Sinama , André Gilles , Caroline Costedoat , Emmanuel Corse , Jean-Michel Olivier et al.
Frontiers in Zoology, 2013, 10 (1), pp.1-16. ⟨10.1186/1742-9994-10-22⟩
Article dans une revue halsde-00837911 v1
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A shot in the genome: how accurately do shotgun 454 sequences represent a genome?

Emese Meglécz , Nicolas Pech , André Gilles , Jean-François Martin , Michael G Gardner
BMC Research Notes, 2012, 5 (1), pp.259. ⟨10.1186/1756-0500-5-259⟩
Article dans une revue hal-02356481 v1
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Challenges of microsatellite development in Lepidoptera: Euphydryas aurinia (Nymphalidae) as a case study

Melthide Sinama , Vincent Dubut , Caroline Costedoat , André Gilles , M. Junker et al.
European Journal of Entomology, 2011, 108 (108), pp.261-266
Article dans une revue hal-01294296 v1
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Accuracy and quality assessment of 454 GS-FLX Titanium pyrosequencing

André Gilles , Emese Meglécz , Nicolas Pech , Stéphanie Ferreira , Thibaut Malausa et al.
BMC Genomics, 2011, 12 (1), ⟨10.1186/1471-2164-12-245⟩
Article dans une revue hal-01995051 v1
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High-throughput microsatellite isolation through 454 GS-FLX Titanium pyrosequencing of enriched DNA libraries

Thibaut Malausa , André Gilles , Emese Meglécz , Hélène Blancard , Stéphanie Duthoy et al.
Molecular Ecology Resources, 2011, 11 (4), pp.638-644. ⟨10.1111/j.1755-0998.2011.02992.x⟩
Article dans une revue hal-01506135 v1
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SESAME (SEquence Sorter & AMplicon Explorer): genotyping based on high-throughput multiplex amplicon sequencing

Emese Meglécz , Sylvain Piry , Erick Desmarais , Maxime Galan , André Gilles et al.
Bioinformatics, 2011, 27 (2), pp.277-278. ⟨10.1093/bioinformatics/btq641⟩
Article dans une revue hal-02356496 v1
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Representativeness of microsatellite distributions in genomes, as revealed by 454 GS-FLX Titanium pyrosequencing

Jean-Francois Martin , Nicolas Pech , Emese Meglécz , Stéphanie Ferreira , Caroline Costedoat et al.
BMC Genomics, 2010, 11, pp.560. ⟨10.1186/1471-2164-11-560⟩
Article dans une revue hal-02663878 v1

A PCR-based method for diet analysis in freshwater organisms using rDNA barcoding on faeces

Emmanuel Corse , Caroline Costedoat , Rémi Chappaz , Nicolas Pech , Jean-Francois Martin et al.
Molecular Ecology Resources, 2010, 10 (1), pp.96-108. ⟨10.1111/j.1755-0998.2009.02795.x⟩
Article dans une revue istex hal-02666530 v1
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QDD: a user-friendly program to select microsatellite markers and design primers from large sequencing projects

Emese Meglécz , Caroline Costedoat , Vincent Dubut , André Gilles , Thibaut Malausa et al.
Bioinformatics, 2010, 26 (3), pp.403-404. ⟨10.1093/bioinformatics/btp670⟩
Article dans une revue (data paper) hal-02667917 v1
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Development of 55 novel polymorphic microsatellite loci for the critically endangered L. (Actinopterygii: Perciformes: Percidae) and cross-species amplification in five other percids

Vincent Dubut , Rémi Grenier , Emese Meglécz , Rémi Chappaz , Caroline Costedoat et al.
European Journal of Wildlife Research, 2010, 56 (6), pp.931-938. ⟨10.1007/s10344-010-0421-x⟩
Article dans une revue hal-00609749 v1

Inter- and Extra-Indian Admixture and Genetic Diversity in Reunion Island Revealed by Analysis of Mitochondrial DNA

Vincent Dubut , Pascal Murail , Nicolas Pech , Marie-Dominique Thionville , François Cartault
Annals of Human Genetics, 2009, 73, pp.314-334
Article dans une revue halshs-00433392 v1
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Garden plants dynamics at urban fallow land interfaces : influence of local versus landscape factors

Audrey Marco , Sébastien Oliveau , Nicolas Pech , Thierry Dutoit , Valérie Bertaudiere-Montes
Salzburger Geographische Arbeiten, 2008, 42, pp.25-41
Article dans une revue halshs-00372633 v1

Etude de l’hybridation introgressive entre Chondrostoma t. toxostoma et Chondrostoma n. nasus (Téléostéen, Cyprinidae) en utilisant une approche multiple

Caroline Costedoat , Nicolas Pech , Rémi Chappaz , Marie-Dominique Salducci , Puy Lim et al.
Cybium : Revue Internationale d’Ichtyologie, 2004
Article dans une revue hal-03517491 v1

Étude de la compatibilité génomique entre deux espèces de cyprinidés et son implication dans la réorganisation du transcriptome chez les hybrides

Florence Petit , Arnaud Ungaro , Jean-François Martin , Morgane Ardisson , Bernard Barascud et al.
6. Rencontres de l'Ichtyologie en France, Mar 2015, Paris, France. 2015, RIF 2015
Poster de conférence hal-02743393 v1

Cryptic species in western and central Africa cichlids

Charles Bilong Bilong , C Costedoat , K Elmer , Gilles André , Axel Meyer et al.
European Congres of Evolution ESEB, Aug 2009, Torino, Italy
Poster de conférence hal-03535679 v1

Chondrostoma hybrid zone: interaction between genes and environment

C Costedoat , Nicolas Pech , Remi Chappaz , Gilles André
International Meeting "Genetic of Speciation", Jul 2006, Vancouver, Canada
Poster de conférence hal-03535690 v1

La prise en compte des phénomènes d'hybridation dans les politiques de conservation : illustration par l'étude d'une zone hybride entre deux espèces de Cyprinidae

C Costedoat , Nicolas Pech , Remi Chappaz , Gilles André
2e congrès le réveil du Dodo Journées des Sciences de la Conservation de la Biodiversité, Mar 2006, Paris, France
Poster de conférence hal-03535693 v1

Etude dans l’espace et dans le temps d’une zone hybride de Cyprinidae

C Costedoat , Nicolas Pech , Marie-Dominique Salducci , Remi Chappaz , Gilles André
2emes Journées de la Biodiversité organisées par l'Institut Français de la Biodiversité (IFB), May 2004, Marseille, France
Poster de conférence hal-03535705 v1

Study of a cyprinid's hybrid zone over space and time

C Costedoat , Nicolas Pech , Marie-Dominique Salducci , Remi Chappaz , Gilles André
VIIIth Evolutionary Biology Meeting, Sep 2004, Marseille, France
Poster de conférence hal-03535699 v1

The evolutionary biology of Leuciscus souffia souffia, a french endemic cyprinidae : implication for its conservation

Marie-Dominique Salducci , Jean-François Martin , Nicolas Pech , Remi Chappaz , C Costedoat et al.
VIIth Evolutionary Biology Meeting, Jun 2003, Marseille, France
Poster de conférence hal-03535710 v1

Pertinence d'une approche combinée Sciences de la Nature et Sciences de l'Homme, pour prévoir et gérer les invasions d'espèces ornementales en région méditerranéenne

Audrey Marco , Thierry Dutoit , Carole Barthélemy , Nicolas Pech , Sébastien Lavergne et al.
3ème Journées francophones des Sciences de la Conservation de la Biodiversité, Mar 2009, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-01141312 v1

Les crottes passent à la caisse: développement d’un barcoding alimentaire adapté aux poissons de rivières

Emmanuel Corse , C Costedoat , Nicolas Pech , Remi Chappaz , Gilles Andre
4e rencontre de l’Ichtyologie en France, RIF, Mar 2009, Paris, France
Communication dans un congrès hal-03533432 v1

Crossroads between population genomic and ecological approaches in the study of hybrid zone

C Costedoat , Nicolas Pech , Remi Chappaz , Gilles André
European congres of Ichthyology ECI XII, Sep 2007, Cavtat - Dubrovnik, Croatia
Communication dans un congrès hal-03533436 v1

Comparaison de la croissance et de la reproduction de Chondrostoma t. toxostoma, Chondrostoma n. nasus et des hybrides entre les deux espèces dans une rivière aménagée, la Durance

N. Stolzenberg , Laurent Cavalli , Nicolas Pech , C Costedoat
IIe Rencontre de l’ichtyologie en France (RIF), Mar 2003, Paris, France
Communication dans un congrès hal-03533484 v1

Déchiffrer l'histoire évolutive en utilisant des approches multiples- Implications pour la conservation du blageon, Leuciscus souffia souffia (Téléostei : Cyprinidae)

Marie-Dominique Salducci , Jean-François Martin , Nicolas Pech , Remi Chappaz , C Costedoat et al.
Journées Francophones de Conservation de la Biodiversité, Apr 2003, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès hal-03533468 v1

Introgression mitochondriale et nucléaire entre deux espèces Chondrostoma t. toxostoma et Chondrostoma n. nasus (Teleostei: Cyprinidae) : implication dans la politique de conservation des espèces européennes

C Costedoat , N. Stolzenberg , Nicolas Pech , Remi Chappaz , Gilles André
IIe Rencontre de l’ichtyologie en France (RIF), Mar 2003, Paris, France
Communication dans un congrès hal-03533474 v1