Pascal CROISEAU

141
Documents

Présentation

GABI, équipe G2B
Domaine de Vilvert,
78352 Jouy en Josas
01-34-65-21-97
pascal.croiseau@inrae.fr

FORMATIONS et EXPERIENCES PROFESSIONNELLES

Parcours professionnel

2008: Recrutement CRCN à l’INRAE de Jouy en Josas, unité GABI, équipe G2B

Mes travaux de recherches portent sur l’exploitation de données génomiques bovine. Je peux en isoler deux composantes complémentaires : (1) D’une part l’identification et la comparaison de méthodes statistiques pour la sélection génomique. La sélection génomique consiste à prédire la valeur génétique d’animaux candidats à la sélection en exploitant les informations apportées par une population de référence. Je contribue à la mise en place et à l’amélioration des modèles de sélection génomique utilisés pour les évaluations génétiques nationales. (2) D’autre part, la sélection génomique s’appuie sur la connaissance des régions QTL. Pour améliorer la qualité de prédiction de nos méthodes, l’identification et la localisation des QTL est une étape clé.

Si durant la période 2008-2015, mes travaux ont été guidés par l’accès à de nouvelles technologies (exploitation de la puce 50K pour la mise en place d’une évaluation génomique officielle en France chez les grandes races bovines laitières ; exploitation d’une puce haute densité pour améliorer la précision des évaluations génomiques et étendre ces évaluations aux races régionales), depuis 2015, mes travaux visent à exploiter les propriétés des méthodes d’évaluation génomique ainsi que de la sélection génomique mise en place dans les entreprises de sélection pour répondre aux grands enjeux de demain tel que le maintien de la diversité génétique ou encore le développement d’une évaluation génomique en croisement.

Diplômes

2021: Habilitation à Diriger des Recherches (Université Paris-Saclay)

2004-2008: Doctorat de l’Université de Paris-Sud, Ecole doctorale Gène Génome Cellule, spécialité : génétique statistique (Mention très honorable).

Cette thèse a été réalisée sous la direction de E. Génin à l’unité INSERM 535 (Hôpital Paul Brousse, Villejuif, directrice : F. Clerget-Darpoux) et soutenue le 14 janvier 2008 devant le jury :

  • Mr De Vienne, professeur à l’université Paris Sud (Président)
  • Mme Bickeböller, professeur à l’université de Gottingen, Allemagne (Rapporteur)
  • Mr Tregouet, CR à l’unité INSERM U525 (Rapporteur)
  • Mr Alizadeh, CR à l’Etablissement Français du Sang (Examinateur)
  • Mme Le Roy, DR à l’Agrocampus INRA de Rennes (Examinateur)

Sujet: Influence et traitement des données manquantes dans les études d’association en génétique: application à la Sclérose en Plaques.

2003-2004: D.E.A. de génétique multifactorielle, Université Paris Sud.
2001-2003: Licence-Maîtrise de Biologie Informatique, Université Paris VII.
1999-2001: DEUG de biologie, Université Paris VII.

Formations complémentaires en France

2004: Déterminisme génétique de la Sclérose en Plaques : Rôle de 2 gène candidats (CTLA4 et HLA-DRB1). Directrice de stage : E. Génin ; INSERM U535, stage de DEA : 6 mois.
2004: Analyse génétique de lignées de poules sélectionnées pour des réponses immunitaires. Directrice de stage : M.H. Pinard ; INRA (Jouy en Josas), stage de DEA, 3 mois.

Formations complémentaires à l’étranger

2007: Post-doctorat à l’Institut de Génétique Humaine de l’Université de Newcastle (Angleterre). Responsable : Heather Cordell.

ENSEIGNEMENTS

2008-2020 : Master PRIAM

  • Responsable de la filière "animal breeding and genetics"
  • Intervenant dans le module "Genome Analysis"

Encadrements :

  • Encadrement de 6 stages de niveau M2
  • Encadrement de 7 doctorants

EXPERTISES SCIENTIFIQUES

  • Membre de comités de thèse
  • Membre de jury de thèse
  • Membre de jury de recrutement de M2 et de thèses
  • Membre du jury pour les concours de Chargé de Recherche Classe Normal.
  • Membre nommé au sein de la section "production animale" de la Comission Nationale des Enseignants-Chercheurs relevant du ministre de l'Agriculture (CNECA)
  • Membre élu du Conseil Scientifique du département de Génétique Animale de l'INRAE.

LANGUE et LANGAGES

Langue

  • Anglais (parlé, lu, écrit)

Compétences informatiques

  • Système d’exploitation : Linux, Unix, Windows.
  • Langage de programmation : Awk, C, fortran, R

COMPETENCES SCIENTIFIQUES ET GESTION DE PROJETS

Compétences en génétique

  • Génétique quantitative
  • Détection de QTL
  • Sélection génomique

Montage et Gestion de projets

  • Animateur de work package dans différents projets (projet ANR Gembal, projet CASDAR RT UniGeno, projet APIS-GENE ASAP, EvaGenoc, ...)
  • Animateur d'une tache du projet européen RUMIGEN
  • Porteur de projets (méta-programme SELGEN : INCOMINGS, GDivSelGen, méta-programme DigitBio : DeepPhenomic)

Production scientifique :

  • 26 publications dans des revues avec comité de lecture
  • 71 publications dans des actes de congrès avec comité de lecture
  • 2 chapitres de livres
  • 2 licences de savoir-faire en tant que co-inventeur du procédé de sélection génomique en France.

Publications

66
48
41
21
19
16
13
13
13
12
12
12
11
11
11
10
9
9
9
9
8
8
7
7
6
6
6
6
6
6
6
5
5
5
5
5
5
5
5
4
4
4
4
4
4
4
4
4
4
4
4
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
3
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2

Publications

Deposit thumbnail

Guiding eQTL mapping and genomic prediction of gene expression in three pig breeds with tissue-specific epigenetic annotations from early development

Fanny Mollandin , Hervé Acloque , Maria Ballester , Marco Bink , Mario Calus et al.

Genomics, 2026, 118 (1), pp.111158. ⟨10.1016/j.ygeno.2025.111158⟩

Article dans une revue hal-05511224v1
Deposit thumbnail

QTL detection in multi-breed cattle populations including crossbred animals: a simulation study

A. Guillenea , B.C.D. Cuyabano , P. Croiseau , M.S. Lund , E. Karaman

Animal, 2025, 19 (10), pp.101639. ⟨10.1016/j.animal.2025.101639⟩

Article dans une revue hal-05543470v1
Deposit thumbnail

Genomic evaluation for juvenile mortality including causal variants in French Holstein and Montbéliarde cattle breeds

Léa Chapard , Florian Besnard , Thierry Tribout, , Sophie Aguerre , Clémentine Escouflaire et al.

Journal of Dairy Science, In press, 109 (1), pp.527-541. ⟨10.3168/jds.2025-27072⟩

Article dans une revue hal-05333674v1
Deposit thumbnail

Sequence-based genome-wide association study reveals host genomic regions and candidate genes influencing the fecal microbiota of Holstein cows

L. Brulin , M.-P. Sanchez , Z. Cai , S. Ducrocq , G. Even et al.

Journal of Dairy Science, 2025, TBC (TBC), ⟨10.3168/jds.2024-26203⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-05120249v1
Deposit thumbnail

Deep learning and genomic best linear unbiased prediction integration: An approach to identify potential nonlinear genetic relationships between traits

F. Shokor , P. Croiseau , H. Gangloff , R. Saintilan , T. Tribout et al.

Journal of Dairy Science, 2025, 108 (6), pp.6174-6189. ⟨10.3168/jds.2024-26057⟩

Article dans une revue hal-05218863v1
Deposit thumbnail

Erosion of estimated genomic breeding values with generations is due to long distance associations between markers and QTL

Didier Boichard , Sébastien Fritz , Pascal Croiseau , Vincent Ducrocq , Thierry Tribout et al.

Genetics Selection Evolution, 2025, 57 (1), pp.14. ⟨10.1186/s12711-025-00963-5⟩

Article dans une revue hal-05000911v1
Deposit thumbnail

Short communication: Bifidobacterium abundance in the faecal microbiota is strongly associated with milk traits in dairy cattle

L. Brulin , S. Ducrocq , G. Even , M.P. Sanchez , S. Martel et al.

Animal, 2024, 18 (8), pp.101243. ⟨10.1016/j.animal.2024.101243⟩

Article dans une revue hal-04669072v1
Deposit thumbnail

Characterization of bovine vaginal microbiota using 16S rRNA sequencing: associations with host fertility, longevity, health, and production

L. Brulin , Sebastien Ducrocq , G. Even , M. Sanchez , S. Martel et al.

Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.19277. ⟨10.1038/s41598-024-69715-7⟩

Article dans une revue hal-04673894v1
Deposit thumbnail

The fecal microbiota of Holstein cows is heritable and genetically correlated to dairy performances

L. Brulin , S. Ducrocq , J. Estellé , G. Even , S. Martel et al.

Journal of Dairy Science, 2024, 107 (12), pp.11254-11268. ⟨10.3168/jds.2024-25003⟩

Article dans une revue hal-05010432v1
Deposit thumbnail

Sequence-based GWAS meta-analyses for beef production traits

Marie-Pierre Sanchez , Thierry Tribout , Naveen Kadri , Praveen Chitneedi , Steffen Maak et al.

Genetics Selection Evolution, 2023, 55 (1), pp.70. ⟨10.1186/s12711-023-00848-5⟩

Article dans une revue hal-04248281v1
Deposit thumbnail

Accounting for overlapping annotations in genomic prediction models of complex traits

Fanny Mollandin , Hélène Gilbert , Pascal Croiseau , Andrea Rau

BMC Bioinformatics, 2022, 23 (1), 22 p. ⟨10.1186/s12859-022-04914-5⟩

Article dans une revue hal-03770583v1
Deposit thumbnail

An evaluation of the predictive performance and mapping power of the BayesR model for genomic prediction

Fanny Mollandin , Andrea Rau , Pascal Croiseau

G3, 2021, 11 (11), ⟨10.1093/g3journal/jkab225⟩

Article dans une revue hal-03485736v1
Deposit thumbnail

Intensified Use of Reproductive Technologies and Reduced Dimensions of Breeding Schemes Put Genetic Diversity at Risk in Dairy Cattle Breeds

Anna-Charlotte Doublet , Gwendal Restoux , Sébastien Fritz , Laura Balberini , Guillaume Fayolle et al.

Animals, 2020, 10 (10), pp.1903. ⟨10.3390/ani10101903⟩

Article dans une revue hal-02975056v1
Deposit thumbnail

Confirmed effects of candidate variants for milk production, udder health, and udder morphology in dairy cattle

Thierry Tribout , Pascal Croiseau , Rachel Lefebvre , Anne Barbat , Mekki Boussaha et al.

Genetics Selection Evolution, 2020, 52 (1), ⟨10.1186/s12711-020-00575-1⟩

Article dans une revue hal-03155461v1
Deposit thumbnail

The impact of genomic selection on genetic diversity and genetic gain in three French dairy cattle breeds

Anna-Charlotte Doublet , Pascal Croiseau , Sébastien Fritz , Alexis Michenet , Chris Hozé et al.

Genetics Selection Evolution, 2019, 51 (1), pp.52. ⟨10.1186/s12711-019-0495-1⟩

Article dans une revue hal-02300856v1
Deposit thumbnail

Which individuals to choose to update the reference population? Minimizing the loss of genetic diversity in animal genomic selection programs

Sonia Eynard , Pascal Croiseau , Denis Laloë , Sébastien Fritz , Mario P. L. Calus et al.

G3, 2018, 8 (1), pp.113-121. ⟨10.1534/g3.117.1117⟩

Article dans une revue hal-01684895v1

Meta-analysis of genome-wide association studies for cattle stature identifies common genes that regulate body size in mammals

Aniek C. Bouwman , Hans D. Daetwyler , Amanda J. Chamberlain , Carla Hurtado Ponce , Mehdi Sargolzaei et al.

Nature Genetics, 2018, 50 (3), pp.362-367. ⟨10.1038/s41588-018-0056-5⟩

Article dans une revue hal-02628780v1
Deposit thumbnail

Use of meta-analyses and joint analyses to select variants in whole genome sequences for genomic evaluation : An application in milk production of French dairy cattle breeds

Marc Teissier , Marie-Pierre Sanchez , Mekki Boussaha , Anne Barbat , Chris Hoze et al.

Journal of Dairy Science, 2018, 101 (4), ⟨10.3168/jds.2017-13587⟩

Article dans une revue hal-02623397v1
Deposit thumbnail

Within-breed and multi-breed GWAS on imputed whole-genome sequence variants reveal candidate mutations affecting milk protein composition in dairy cattle

Marie-Pierre Sanchez , Armelle Govignon-Gion , Pascal Croiseau , Sébastien Fritz , Chris Hozé et al.

Genetics Selection Evolution, 2017, 49 (1), pp.68. ⟨10.1186/s12711-017-0344-z⟩

Article dans une revue hal-01589691v1

The combined use of linkage disequilibrium-based haploblocks and allele frequency-based haplotype selection methods enhances genomic evaluation accuracy in dairy cattle

David Jonas , Vincent Ducrocq , Pascal Croiseau

Journal of Dairy Science, 2017, 100 (4), pp.2905-2908. ⟨10.3168/jds.2016-11798⟩

Article dans une revue hal-01605119v1

Genomic evaluation of regional dairy cattle breeds in single-breed and multibreed contexts

David Jonas , Vincent Ducrocq , S. Fritz , A. Baur , Marie-Pierre Sanchez et al.

Journal of Animal Breeding and Genetics, 2017, 134 (1), pp.3-13. ⟨10.1111/jbg.12249⟩

Article dans une revue hal-01484842v1

Alternative haplotype construction methods for genomic evaluation

David Jonas , Vincent Ducrocq , Marie-Noelle Fouilloux , Pascal Croiseau

Journal of Dairy Science, 2016, 99 (6), pp.4537-4546. ⟨10.3168/jds.2015-10433⟩

Article dans une revue hal-01533890v1
Deposit thumbnail

Genomic selection in domestic animals: Principles, applications and perspectives

Didier Boichard , Vincent Ducrocq , Pascal Croiseau , Sebastien S. Fritz

Comptes Rendus. Biologies, 2016, 339 (7-8), pp.274-277. ⟨10.1016/j.crvi.2016.04.007⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02641310v1
Deposit thumbnail

A comparison of methods for whole-genome QTL mapping using dense markers in four livestock species

Andres Legarra , Pascal Croiseau , Marie-Pierre Sanchez , Simon Teyssedre , Guillaume Salle et al.

Genetics Selection Evolution, 2015, 47 (1), pp.1-10. ⟨10.1186/s12711-015-0087-7⟩

Article dans une revue hal-01190172v1

Efficiency of multi-breed genomic selection for dairy cattle breeds with different sizes of reference population

C. Hozé , Sébastien Fritz , Florence Phocas , Didier Boichard , Vincent Ducrocq et al.

Journal of Dairy Science, 2014, 97 (6), pp.3918-3929. ⟨10.3168/jds.2013-7761⟩

Article dans une revue hal-01193830v1
Deposit thumbnail

Application of Bayesian least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) and BayesCπ methods for genomic selection in French Holstein and Montbéliarde breeds

Carine Colombani Colombani , Andres Legarra , Sebastien S. Fritz , François F. Guillaume , Pascal Croiseau et al.

Journal of Dairy Science, 2013, 96 (1), pp.575-591. ⟨10.3168/jds.2011-5225⟩

Article dans une revue hal-01001340v1
Deposit thumbnail

High-density marker imputation accuracy in sixteen French cattle breeds

Chris Hoze Hozé , Marie-Noëlle M.-N. Fouilloux , Eric Venot , François F. Guillaume , Romain R. Dassonneville et al.

Genetics Selection Evolution, 2013, 45 (1), pp.1-11. ⟨10.1186/1297-9686-45-33⟩

Article dans une revue hal-01001056v1

Genomic selection in French dairy cattle

Didier Boichard , Francois F. Guillaume , A. A. Baur , Pascal Croiseau , Marie-Noëlle M.-N. Rossignol et al.

Animal Production Science, 2012, 52 (3), pp.115-120. ⟨10.1071/AN11119⟩

Article dans une revue hal-01000202v1
Deposit thumbnail

A comparison of partial least squares (PLS) and sparse PLS regressions in genomic selection in French dairy cattle

Carine Colombani Colombani , Pascal Croiseau , S. S. Fritz , F. F. Guillaume , Andres Legarra et al.

Journal of Dairy Science, 2012, 95 (4), pp.2120-2131. ⟨10.3168/jds.2011-4647⟩

Article dans une revue hal-01000898v1
Deposit thumbnail

Fine tuning genomic evaluations in dairy cattle through SNP pre-selection with the Elastic-Net algorithm

Pascal Croiseau , Andres Legarra , François F. Guillaume , Sébastien S. Fritz , Aurélia A. Baur et al.

Genetics Research, 2011, 93 (6), pp.409-417. ⟨10.1017/S0016672311000358⟩

Article dans une revue hal-01000269v1
Deposit thumbnail

Improved lasso for genomic selection

Andres Legarra , Christèle Robert-Granié , Pascal Croiseau , François F. Guillaume , Sébastien S. Fritz

Genetics Research, 2011, 93 (1), pp.77-87. ⟨10.1017/S0016672310000534⟩

Article dans une revue hal-01000151v1
Deposit thumbnail

Dealing with missing phase and missing data in phylogeny-based analysis.

Claire Bardel , Pascal Croiseau , Emmanuelle Génin

BMC Proceedings, 2007, 1 Suppl 1 (1), pp.S22

Article dans une revue inserm-00284150v1
Deposit thumbnail

Dealing with missing data in family-based association studies: a multiple imputation approach

Emmanuelle Génin , Pascal Croiseau , Heather J. Cordell

Human Heredity, 2007, 63 (3-4), pp.229

Article dans une revue inserm-00143682v1
Deposit thumbnail

Efficiency of multiple imputation to test for association in the presence of missing data.

Pascal Croiseau , Emmanuelle Génin , Claire Bardel

BMC Proceedings, 2007, 1 Suppl 1 (Suppl 1), pp.S24

Article dans une revue inserm-00143688v1
Deposit thumbnail

Validation of the reshaped shared epitope HLA-DRB1 classification in rheumatoid arthritis.

Laëtitia Michou , Pascal Croiseau , Elisabeth Petit-Teixeira , Sophie Tezenas Du Montcel , Isabelle Lemaire et al.

Arthritis Research and Therapy, 2006, 8, pp.R79. ⟨10.1186/ar1949⟩

Article dans une revue inserm-00080406v1

Fast and accurate estimation of breed origin of alleles in crossbred populations

D. Boichard , I. Croué , L. H. Maugan , R. Saintilan , S. Fritz et al.

76th EAAP Annual Meeting, Sep 2025, Innsbruck, Austria

Communication dans un congrès hal-05233300v1

Deep Learning for Crossbred Genomic Prediction: Integrating Transfer Learning and Heterosis Effects

F. Shokor , P. Croiseau , H. Gangloff , S. Fritz , T. Mary-Huard et al.

76th EAAP Annual Meeting, Sep 2025, Innsbruck, Austria

Communication dans un congrès hal-05233294v1

Genetic correlations: more than a parameter that defines relationships between traits

Bcd Cuyabano , P Croiseau , F Shokor , Mr Motta , S Aguerre et al.

International Conference of Quantitative Genetics, Feb 2025, Lucca, Italy

Communication dans un congrès hal-05012407v1

Genomic prediction integrating indirect breeding values from MIR spectra data in dairy cows

P. Croiseau , E. O. Odah , S. Fritz , G. Rovere , M. P. Sanchez et al.

76th EAAP Annual Meeting, Sep 2025, Innsbruck, Austria

Communication dans un congrès hal-05233279v1

Detecting genetic load: A GWAS model accounting for identity by descent

G. Restoux , T. Tribout , R. Bonifazi , T. H. Meuwissen , J. J. Windig et al.

76th EAAP Annual Meeting, Aug 2025, Innsbruck, Austria

Communication dans un congrès hal-05233307v1

The impact of using individual-specific genetic correlations on the ranking and genetic covariance parameters of selection candidates

B. Cuyabano , P. Croiseau

76th EAAP Annual Meeting, Sep 2025, Innsbruck, Austria

Communication dans un congrès hal-05233289v1
Deposit thumbnail

Unraveling the influence of the host genetic on vaginal microbiota composition in Holstein cows

A. A. M. Sabuj , Marie-Pierre Sanchez , S. Ducrocq , G. Even , S. Martel et al.

European Federation of Animal Science, Sep 2024, Florence, Italy

Communication dans un congrès hal-05012343v1

Genetic correlations: a parameter or a latent phenotype in genetic evaluations?

Bcd Cuyabano , P Croiseau , F Shokor , Mr Motta , S Aguerre et al.

Interbull annual meeting, May 2024, Bled (Slovénie), Slovenia

Communication dans un congrès hal-05012452v1
Deposit thumbnail

Evaluating the Efficiency of Phenomic Selection in Dairy Cattle

E.O. Odah , M.P. Sanchez , B. Cuyabano , P. Croiseau

European Federation of Animal Science, Sep 2024, Florence, Italy

Communication dans un congrès hal-05012311v1
Deposit thumbnail

Genomic prediction using functional annotations and QTL features in dairy and beef cattle.breeds

Pascal Croiseau , Fanny Mollandin , Andrea Rau , Marie-Pierre Sanchez , Didier Boichard

75. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP 2024), European Federation of Animal Science (EAAP), Sep 2024, Florence, Italy. pp.292

Communication dans un congrès hal-04694136v1

Sequence-based GWAS analyses revealed genome regions associated with the fecal microbiota in Holstein

L. Brulin , M.P. Sanchez , Z. Cai , S. Ducrocq , G. Even et al.

27. Rencontres autour des recherches sur les ruminants (3R 2024), Institut de l'Elevage - INRAE, Dec 2024, Paris, France. pp.65-69

Communication dans un congrès hal-04982139v1
Deposit thumbnail

Benchmarking predictive models: evaluating parametric, ensemble, and deep learning approaches for animal phenotype prediction from genotypes.

Eric Barrey , Blaise Hanczar , Julien Chiquet , Didier Boichard , Jocelyn de Goër de Herve et al.

AI and biology Symposium, EMBO EMBL, Heidelberg, Mar 2024, Heidelberg, Germany

Communication dans un congrès hal-04510253v1
Deposit thumbnail

GBLUP AND DEEP LEARNING INTEGRATION: A NOVEL APPROACH TO EVALUATING NONLINEARLY RELATED GENETIC TRAITS

Fatima Shokor, , Pascal Croiseau, , Hugo Gangloff, , Romain Saintilan, , Thierry Tribout, et al.

International Conference of Quantitative Genetics, Jul 2024, Vienne, Austria

Communication dans un congrès hal-05012364v1
Deposit thumbnail

Host genes shape the lower gut microbiota of Holstein cows: evidence from sequence-based GWAS

Marie-Pierre Sanchez , L. Brulin , Z. Cai , S. Ducrocq , G. Even et al.

European Federation of Animal Science, Sep 2024, Florence, Italy

Communication dans un congrès hal-05012331v1

Loss of diversity in the Holstein breed

A.C. Doublet , G. Restoux , P. Croiseau

World Holstein Conference, Nov 2023, Puy-du-Fou, France

Communication dans un congrès hal-05013757v1

Impact of genomic selection on genetic diversity in five European local cattle breeds

J.J. Winding , Theo H. E. Meuwissen , Pascal Croiseau , Gwendal Restoux , Renzo Bonifazi

Book of Abstracts of the 74. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, INRAE, Aug 2023, Lyon, France. pp.180

Communication dans un congrès hal-04197287v1
Deposit thumbnail

Host genetics affects the composition of the lower gut microbiota in dairy cows

L Brulin , S Ducrocq , J Estellé , G Even , S Martel et al.

74th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, Aug 2023, Lyon, France. ⟨10.3920/978-90-8686-936-7⟩

Communication dans un congrès hal-04197145v1
Deposit thumbnail

Methods to Estimate Erosion Factors of Genomic Breeding Values of Candidates due to Long-Distance Linkage Disequilibrium

D Boichard , S Fritz , P Croiseau , V Ducrocq , T Tribout et al.

2023 Interbull Meeting, Interbull, Aug 2023, Lyon, France. pp.33-41

Communication dans un congrès hal-04345884v1
Deposit thumbnail

Exploring Non-Linear Genetic Relationships Between Correlated Traits

F Shokor , P Croiseau , R Saintilan , T Mary-Huard , H Gangloff et al.

74th Annual Meeting of the European Association for Animal Production, INRAE, Aug 2023, Lyon, France

Communication dans un congrès hal-04247381v1

Host genetics affect the composition of the lower gut microbiota in dairy cows

L Brulin , S. Ducrocq , J. Estellé , G. Even , S. Martel et al.

Book of Abstracts of the 74. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, EAAP, Aug 2023, Lyon, France. pp.518

Communication dans un congrès hal-04330888v1
Deposit thumbnail

Incorporating biological information into genomic prediction models

Andrea Rau , Fanny Mollandin , Pascal Croiseau

VistaMilk Artificial Intelligence in Agriculture Masterclass, Feb 2023, Online, Ireland

Communication dans un congrès hal-04173250v1
Deposit thumbnail

Characterization of bovine vaginal microbiota and its relationship with host phenotypes

Louise Brulin , S. Ducrocq , G. Even , M.P. Sanchez , S. Martel et al.

European Federation of Animal Science, Sep 2022, Porto, Portugal

Communication dans un congrès hal-05012265v1

Leveraging multi-omic data for integrative exploratory and predictive analyses

Andrea Rau , Fanny Mollandin , Florence Jaffrezic , Denis Laloë , Hallgeir Rui et al.

Journées Math Bio Santé du GDR MATHSAV, Oct 2022, Besançon, France

Communication dans un congrès hal-04173247v1
Deposit thumbnail

Long-distance associations generate erosion of genomic breeding values of candidates for selection

D Boichard , S Fritz , P Croiseau , V Ducrocq , B Cuyabano et al.

12th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Jul 2022, Rotterdam, Netherlands

Communication dans un congrès hal-03731274v1
Deposit thumbnail

Accuracy of prediction for a genomic evaluation in rotational crossbreeding scheme (Montbéliarde x Holstein x Red Danish)

R Saintilan , P Croiseau , A Baur , I Croue , V Ducrocq et al.

ICAR/Interbull Annual Conference, May 2022, Montréal, Canada

Communication dans un congrès hal-03744840v1
Deposit thumbnail

Accuracy of prediction for a genomic evaluation in rotational crossbreeding scheme (Montbéliarde x Holstein x Red Danish)

Romain Saintilan , Beatriz C. D. Cuyabano , Aurélia Baur , Iola Croué , Vincent Ducrocq et al.

26èmes Rencontres Recherches Ruminants, Idele-Inrae, Dec 2022, Paris, France. pp.183-186

Communication dans un congrès hal-04033756v1

272. Accuracy of prediction for a genomic evaluation in rotational crossbreeding scheme (Montbéliarde × Holstein × Red Danish)

P. Croiseau , R. Saintilan , A. Baur , I. Croue , V. Ducrocq et al.

World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Jul 2022, Rotterdam, Netherlands. pp.1148-1151, ⟨10.3920/978-90-8686-940-4_272⟩

Communication dans un congrès hal-04127788v1

Exploiting prior knowledge into genomic prediction models with BayesRCO

Fanny Mollandin , Pascal Croiseau , Andrea Rau

50th European Mathematical Genetics Meeting (EMGM), Apr 2022, Cambridge, United Kingdom

Communication dans un congrès hal-03744755v1
Deposit thumbnail

Accuracy of prediction for a genomic evaluation in rotational crossbreeding scheme (Montbéliarde x Holstein x Red Danish)

P Croiseau , R Saintilan , A Baur , I Croue , V Ducrocq et al.

12th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Jul 2022, Rotterdam, Netherlands

Communication dans un congrès hal-03731279v1

288. Long-distance associations generate erosion of genomic breeding values of candidates for selection

D. Boichard , S. Fritz , P. Croiseau , V. Ducrocq , Beatriz C. D. Cuyabano et al.

World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Jul 2022, Rotterdam, Netherlands. pp.1213-1216, ⟨10.3920/978-90-8686-940-4_288⟩

Communication dans un congrès hal-04127779v1
Deposit thumbnail

Accuracy of prediction for a genomic evaluation in rotational crossbreeding scheme (Montbéliarde × Holstein × Red Danish)

Pascal Croiseau , Romain Saintilan , Aurélia Baur , Iola Croue , Vincent Ducrocq et al.

12th World congress of genetics applied to livestock production, Jul 2022, Rotterdam (NL), Netherlands

Communication dans un congrès hal-05010576v1
Deposit thumbnail

Mise en place d'une évaluation génomique pour les animaux issus d'un croisement trois voies : Montbéliarde X Holstein X Rouge Danoise

Romain Saintilan , Beatriz Cuyabano , Aurélia Baur , Iola Croué , Vincent Ducrocq et al.

3R2022 : 26èmes Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants., Institut de l'élevage [IDELE] INRAE, Dec 2022, Paris, France

Communication dans un congrès hal-04734635v1
Deposit thumbnail

Sequence-based GWAS meta-analyses for beef production traits

M P Sanchez , T Tribout , N Kadri , P K Chitneedi , S Maak et al.

12th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Jul 2022, Rotterdam, Netherlands

Communication dans un congrès hal-03731341v1
Deposit thumbnail

Capitalizing on complex annotations in Bayesian genomic prediction for a backcross population of growing pigs

Fanny Mollandin , Hélène Gilbert , Pascal Croiseau , Andrea Rau

12th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Jul 2022, Rotterdam, Netherlands

Communication dans un congrès hal-03742045v1

Evaluating the Interpretability of SNP Effect Size Classes in Bayesian Genomic Prediction Models

Fanny Mollandin , Andrea Rau , Pascal Croiseau

49th European Mathematical Genetics Meeting (EMGM), Apr 2021, Paris, France. pp.69-100, ⟨10.1159/000516194⟩

Communication dans un congrès hal-03744745v1
Deposit thumbnail

The Use of A Priori Biological Information to Evaluate the Ability of BayesRC Model in Genomic Prediction

Baber Ali , Fanny Mollandin , Pascal Croiseau

72st Annual Meeting of the European Association for Animal Production, Aug 2021, Davos, Switzerland

Communication dans un congrès hal-03742059v1
Deposit thumbnail

Sequence -based GWAS for milk production traits, udder health and morphology in French dairy cattle

Thierry Tribout , Pascal Croiseau , Rachel Lefebvre , Anne Barbat , Mekki Boussaha et al.

71th Annual Meeting of the European Association for Animal Production, Dec 2020, Virtual, France

Communication dans un congrès hal-03037105v1
Deposit thumbnail

Impact of multiple ovulation and embryo transfer on genetic gain and diversity in dairy cattle

Anna-Charlotte Doublet , Gwendal Restoux , Sébastien Fritz , Alexis Michenet , Chris Hozé et al.

70. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2019, Gant, Belgium

Communication dans un congrès hal-02948778v1

Evolution of ROH’s distribution along the genome over a decade of genomic selection in dairy cattle

Katy Paul , Anna-Charlotte Doublet , Denis Laloë , Pascal Croiseau , Gwendal Restoux

70tH Annual meeting of the European Federation of Animal Science, Aug 2019, Ghent, Belgium

Communication dans un congrès hal-03002817v1

Impact of multiple ovulation and embryo transfer on genetic gain and diversity in dairy cattle

Anna-Charlotte Doublet , Gwendal Restoux , Susanne Fritz , Alexis Michenet , Chris Hozé et al.

70th Annual Meeting of European Federation of Animal Science, Aug 2019, Ghent, Belgium

Communication dans un congrès hal-03002820v1

Use of haploblocks in genomic evaluation of Holsteins.

Vincent Ducrocq , Pascal Croiseau , David Jonas , Sebastien Fritz

World congress on Genetics Applied to Livestock Production, Feb 2018, Auckland, Australia

Communication dans un congrès hal-02948405v1
Deposit thumbnail

Inclusion of candidate mutations in genomic evaluation for French dairy cattle breeds

Pascal Croiseau , Chris Hozé , Sebastien Fritz , Marie-Pierre Sanchez , Thierry Tribout

69. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2018, Dubrovnik, Croatia

Communication dans un congrès hal-02948756v1
Deposit thumbnail

Use of whole sequence GWAS to improve genomic evaluation in dairy cattle

Thierry Tribout , D Boichard , M P Sanchez , Sebastien Fritz , Pascal Croiseau

World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Feb 2018, Auckland, Australia

Communication dans un congrès hal-02948451v1
Deposit thumbnail

Evolution of ROH's distribution along the genome over a decade of genomic selection in dairy cattle

Katy Paul , Anna-Charlotte Doublet , Denis Laloë , Pascal Croiseau , Gwendal Restoux

69. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2018, Dubrovnik, Croatia

Communication dans un congrès hal-02948765v1
Deposit thumbnail

Experience from large scale use of the EuroGenomics custom SNP chip in cattle

Didier Boichard , Mekki Boussaha , Aurelien Capitan , Dominique Rocha , Chris Hoze et al.

11. World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, Feb 2018, Auckland, New Zealand

Communication dans un congrès hal-02737523v1

The impact of genomic selection on genetic diversity and genetic gain in French dairy cattle breeds.

Pascal Croiseau , Sebastien Fritz , Chris Hozé , Alexis Michenet , Denis Laloë et al.

69. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2017, Dubrovnik, Croatia

Communication dans un congrès hal-02948746v1
Deposit thumbnail

Use of whole sequence GWAS to improve genomic evaluation in dairy cattle

Pascal Croiseau , Thierry Tribout , Didier Boichard , Marie-Pierre Sanchez , Sebastien Fritz

Plant and Animal Genome Conference, Jan 2017, San Diego, United States

Communication dans un congrès hal-02949244v1
Deposit thumbnail

Use of whole sequence GWAS to improve genomic evaluation in dairy cattle

Pascal Croiseau , Thierry Tribout , Didier Boichard , Marie-Pierre Sanchez , Sebastien Fritz

24. Plant and Animal Genome Conference, Jan 2017, San Diego, United States

Communication dans un congrès hal-01608241v1
Deposit thumbnail

French genomic experience: genomics for all ruminant species

Eric Venot , Anne Barbat , Didier Boichard , Pascal Croiseau , Vincent Ducrocq et al.

2016 Interbull Meeting, Oct 2016, Puerto Varas, Chile

Communication dans un congrès hal-02743221v1
Deposit thumbnail

Identification of candidate causal variants underlying QTL in dairy cattle through GWAS and Bayesian approach at the sequence level

Didier Boichard , Marie-Pierre Sanchez , Anne Barbat , Mekki Boussaha , Thierry Tribout et al.

PAG XXIV - Plant and Animal Genome Conference, Jan 2016, San Diego, United States

Communication dans un congrès hal-02792675v1
Deposit thumbnail

French genomic experience: genomics for all ruminant species

Eric Venot , Didier Boichard , Vincent Ducrocq , Pascal Croiseau , S. Fritz et al.

40. Biennal session of ICAR, Oct 2016, Puerto Varas, Chile

Communication dans un congrès hal-01606324v1
Deposit thumbnail

Mise en place d’une évaluation génomique en races Abondance, Tarentaise et Vosgienne

Marie-Pierre Sanchez , David Jonas , Aurélia Baur , Vincent Ducrocq , Chris Hoze et al.

23. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2016, Paris, France

Communication dans un congrès hal-01602322v1
Deposit thumbnail

How is genomics changing cattle breeding?

Didier Boichard , Vincent Ducrocq , Pascal Croiseau , Sebastien S. Fritz

JAM Joint Annual Meeting, Jul 2016, Salt Lake City, United States

Communication dans un congrès hal-02738726v1
Deposit thumbnail

Using whole genome sequences to identify QTL for udder health and morphology in French dairy cattle

Thierry Tribout , Marine Barbat , Armelle Gion , Amandine Launay , Rachel Lefebvre et al.

67. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2016, Belfast, United Kingdom

Communication dans un congrès hal-02739792v1
Deposit thumbnail

Using genomes sequences to identify causal variants for milk fatty acids in dairy cattle

Armelle Gion Govignon-Gion , Marie-Pierre Sanchez , Pascal Croiseau , Anne Barbat , Sebastien S. Fritz et al.

66. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), European Federation of Animal Science (EAAP). INT., Aug 2015, Warsaw, Poland

Communication dans un congrès hal-02738654v1

Using sequences data to identify causal variants for milk fatty acids composition in dairy cattle

Armelle Gion , Marie-Pierre Sanchez , Pascal Croiseau , Anne Barbat , S. Fritz et al.

66. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2015, Varsovie, Poland. 577 p

Communication dans un congrès hal-01536474v1

Haplotype construction methods to enhance genomic evaluation

David Jonas , Vincent Ducrocq , Pascal Croiseau

66. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2015, Varsovie, Poland. 577 p

Communication dans un congrès hal-01535255v1
Deposit thumbnail

ldentification de mutations candidates affectant la composition du lait en acides gras et protéines par analyse d’association sur la séquence du génome dans les races Holstein, Montbéliarde et Normande

Armelle Gion Govignon-Gion , Didier Boichard , Pascal Croiseau , Anne Barbat-Leterrier , Chris Hoze Hoze et al.

22. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2015, Paris, France. 409 p

Communication dans un congrès hal-02744189v1
Deposit thumbnail

Identification of causal variants for milk protein composition using sequence data in dairy cattle

Marie-Pierre Sanchez , Armelle Gion Govignon-Gion , Pascal Croiseau , Anne Barbat , M. Gelé et al.

66. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), European Federation of Animal Science (EAAP). INT., Aug 2015, Warsaw, Poland

Communication dans un congrès hal-02739078v1

Multibreed association studies at the sequence level : comparison between meta and joint analyses.

Marc Teissier , Marie-Pierre Sanchez , Eric Venot , Rabia Letaief , Pascal Croiseau

66. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2015, Varsovie, Poland

Communication dans un congrès hal-02949217v1
Deposit thumbnail

Comparison of different Marker-Assisted BLUP models for a new French genomic evaluation

Pascal Croiseau , Aurélia A. Baur , David Jonas , Chris Hoze Hoze , Julie Promp et al.

66. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), European Federation of Animal Science (EAAP). INT., Aug 2015, Warsaw, Poland

Communication dans un congrès hal-02743878v1

In silico detection of causal mutation in beef cattle.

Romain Philippe , Gilles Renand , Sebastien Fritz , Pascal Croiseau , Romain Saintilan et al.

Journée ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématique, Sep 2015, Clermont Ferrand, France

Communication dans un congrès hal-02949227v1
Deposit thumbnail

Genomic evaluation using QTL information

Vincent Ducrocq , Pascal Croiseau , Aurélia Baur , Romain Saintilan , Sebastien Fritz et al.

10. World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2014, Vancouver, Canada

Communication dans un congrès hal-01193914v1
Deposit thumbnail

Mise en place de l’évaluation génomique française officielle en race Brune

Aurélia Baur , Sebastien Fritz , Julie Promp , O. Bulot , Didier Boichard et al.

21. Rencontres Recherches Ruminants, Dec 2014, Paris, France

Communication dans un congrès hal-01194027v1
Deposit thumbnail

Mise en place d’évaluations génomiques dans les races bovines laitières à effectifs limités en France

Chris Hoze , Sebastien Fritz , Aurélia Baur , Florence Phocas , Didier Boichard et al.

21. Rencontres Recherches Ruminants, Dec 2014, Paris, France

Communication dans un congrès hal-01194024v1
Deposit thumbnail

Genomic evaluation using combined reference populations from Montbéliarde and French Simmental breeds

Chris Hoze , Sebastien Fritz , Florence Phocas , Didier Boichard , Vincent Ducrocq et al.

10. World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2014, Vancouver, Canada

Communication dans un congrès hal-01193909v1
Deposit thumbnail

Extension to haplotypes of genomic evaluation algorithms

Pascal Croiseau , Marie-Noelle Fouilloux , David Jonas , Sebastien Fritz , Aurélia Baur et al.

10. World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2014, Vancouver, Canada

Communication dans un congrès hal-01193907v1
Deposit thumbnail

Application of a three-haplotype LDLA model to the French Holstein population

David Jonas , Chris Hoze , Didier Boichard , Pascal Croiseau

10. World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2014, Vancouver, Canada

Communication dans un congrès hal-01193915v1
Deposit thumbnail

Implementation of the French official genomic evaluation in Brown Swiss dairy cattle

Aurélia Baur , Sebastien Fritz , Julie Promp , O. Bulot , Didier Boichard et al.

10. World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2014, Vancouver, Canada

Communication dans un congrès hal-01193910v1
Deposit thumbnail

Comparison of genomic selection approaches for small breeds

Chris Hoze , Sébastien Fritz , Didier Boichard , Vincent Ducrocq , Pascal Croiseau

Interbull Meeting 2013, Aug 2013, Nantes, France. pp.90-94

Communication dans un congrès hal-01189867v1
Deposit thumbnail

From the 50K chip to the HD: Imputation efficiency in 9 French dairy cattle breeds

Chris Hoze Hoze , Marie-Noëlle Fouilloux , Eric Venot , François Guillaume , Romain Dassonneville et al.

EAAP, Aug 2012, Bratislava, Slovakia. pp.308

Communication dans un congrès hal-02748900v1
Deposit thumbnail

Could genomic selection methods be efficient to detect QTLs? Application in French dairy cattle

Carine Colombani , Pascal Croiseau , Chris Hoze , Sebastien Fritz , François Guillaume et al.

QTLMAS, May 2011, Rennes, France. pp.30

Communication dans un congrès hal-01190269v1
Deposit thumbnail

Use of phenotypes from multi-trait national evaluations in genomic evaluation

C. Hoze , Pascal Croiseau , F. Guillaume , Aurélia Baur , L. Journaux et al.

62. Annual meeting of the EAAP, Aug 2011, Stavanger, Norway. pp.28

Communication dans un congrès hal-01189857v1
Deposit thumbnail

Genomic selection: implementation in dairy cattle

Vincent Ducrocq , Sébastien S. Fritz , François F. Guillaume , Pascal Croiseau , Jean-Jacques J. J. Colleau et al.

5th QTL-MAS workshop, May 2011, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-01001363v1
Deposit thumbnail

State of the art of genomics for selection

Didier Boichard , Francois Guillaume , A. Baur , Pascal Croiseau , M.N. Rossignol et al.

Workshop of ICAR 2011 "New technologies and new challenges for breeding and herd management", Jun 2011, Bourg-en-Bresse, France. 1 p

Communication dans un congrès hal-01019343v1
Deposit thumbnail

Genomic Selection In French Dairy Cattle

Didier Boichard , Francois F. Guillaume , A. A. Baur , Pascal Croiseau , Mn. Mn. Rossignol et al.

Applied Genomics for Sustainable Livestock Breeding, May 2011, Melbourne, Australia. 1 p

Communication dans un congrès hal-01000520v1
Deposit thumbnail

État de l'art de la sélection génomique en France et approche multiraciale

Didier Boichard , François Guillaume , Aurélia Baur , Pascal Croiseau , Marie-Noelle Rossignol et al.

Colloque International, La génomique bovine Contribution de la génomique à l’avenir de l’élevage bovin - International Workshop, Bovine genomics Contributions to the future of livestock, Oct 2011, Clermont-Ferrand/Cournon, France. 2 p

Communication dans un congrès hal-01193641v1
Deposit thumbnail

Genomic selection in French dairy cattle.

Didier Boichard , François Guillaume , Aurélia A. Baur , Pascal Croiseau , Marie-Noëlle M.-N. Rossignol et al.

9th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 2010, Leipzig, pp.Inconnu

Communication dans un congrès hal-02822373v1
Deposit thumbnail

Lasso bayesiano mejorado para seleccion genomica

Andres Legarra , Christèle Robert-Granié , Pascal Croiseau , Guillaume François , Sébastien Fritz

XV Reunion Nacional de Mejora Genetica Animal, Jun 2010, Vigo, España. pp.1-6

Communication dans un congrès hal-01193386v1

Aptitude of Bayesian lasso for genomic selection

Andres Legarra , Christèle Robert-Granié , Pascal Croiseau , F. Guillaume , S. Fritz et al.

9. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany

Communication dans un congrès hal-01193524v1

Application of PLS and Sparse PLS regression in genomic selection

Carine Colombani , Andres Legarra , Pascal Croiseau , F. Guillaume , S. Fritz et al.

9. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany

Communication dans un congrès hal-01193580v1
Deposit thumbnail

Intérêt d'une puce basse densité pour l'évalution génomique des vaches laitières.

Romain Dassonneville , Sebastien Fritz , Francois Guillaume , Pascal Croiseau , Aurélia Baur et al.

17. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2010, Paris, France

Communication dans un congrès hal-01193611v1

Improving genomic evaluation strategies in dairy cattle through SNP pre-selection

Pascal Croiseau , Carine Colombani , Andres Legarra , F. Guillaume , S. Fritz et al.

9. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany

Communication dans un congrès hal-01193548v1
Deposit thumbnail

Mise en place de la sélection génomique dans les trois principales races françaises de bovins laitiers

S Fritz , Francois Guillaume , Pascal Croiseau , Aurélia Baur , C. Hoze et al.

17. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2010, Paris, France

Communication dans un congrès hal-01193615v1

Use of the elastic-net algorithm for genomic selection in dairy cattle.

Pascal Croiseau , Vincent Ducrocq

60th Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), 2427 August 2009, 2009, Barcelona

Communication dans un congrès hal-02751291v1
Deposit thumbnail

Use of the Elastic-Net algorithm for genomic selection in dairy cattle

Pascal Croiseau , Vincent Ducrocq

13th Quantitative Trait Locus and Marker Assisted Selection Workshop, Apr 2009, Wageningen, Netherlands. pp.Book of Abstracts: 15

Communication dans un congrès hal-01193784v1

Modèles d'évaluation génomique : application aux populations bovines laitières françaises

F. Guillaume , S. Fritz , Pascal Croiseau , Andres Legarra , Christèle Robert-Granié et al.

16. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2009, Paris, France

Communication dans un congrès hal-01193599v1

Marker assisted EBV using a dense SNP markers map: application to the Normande and Montbéliarde breeds.

François Guillaume , Sebastien S. Fritz , Vincent Ducrocq , Pascal Croiseau , Didier Boichard

60th Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), 2427 August 2009, 2009, Barcelona

Communication dans un congrès hal-02751164v1

Sequence-based GWAS identify genomic regions associated with resistance to gastrointestinal strongyles in Holstein heifers

P. Croiseau , P. Martin , D. Boichard , D. Aubriot , A. Delafosse et al.

76th EAAP Annual Meeting, Aug 2025, Innsbruck, Austria

Poster de conférence hal-05233324v1
Deposit thumbnail

Sequence-based GWAS meta-analyses for beef production traits

M.-P Sanchez , T Tribout , N K Kadri , P K Chitneedi , S Maak et al.

39th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2023, Cape Town / Le Cap, South Africa

Poster de conférence hal-04170983v1
Deposit thumbnail

Impact of the correlation between SNP effects in different breeds on the accuracy of predictions

P Croiseau , R Saintilan , D Boichard , B Cuyabano

74th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, Aug 2023, Lyon, France. Wageningen Academic Publishers, Book of Abstracts of the 74th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, ⟨10.3920/978-90-8686-936-7⟩

Poster de conférence hal-04195858v1

A hierarchical Bayesian mixture model for predicting phenotypes from genomic data with prior biological information

Fanny Mollandin , Pascal Croiseau , Andrea Rau

Working Group on Model-Based Clustering Summer Session, Jul 2022, Online, France.

Poster de conférence hal-04173246v1
Deposit thumbnail

A SNP-BLUP genomic evaluation with breed-specific SNP effects for three-way dairy crossbreds

Iola Croué , Didier Boichard , Pascal Croiseau

71st Annual Meeting of the European Association for Animal Production, Dec 2020, Virtual, France

Poster de conférence hal-03037012v1
Deposit thumbnail

Imputation accuracy of crossbred dairy cows

L.-H Maugan , Iola Croué , Sebastien Fritz , Rachel Lefebvre , Pascal Croiseau et al.

71. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Dec 2020, Virtual meeting, Portugal. Wageningen Academic Publishers, Book of abstracts, 26, 2020, Book of abstracts of the 71st annual meeting of the european federation of animal science

Poster de conférence hal-03634220v1

Updating reference population in Genomic Selection for genetic diversity conservation What can we learn from real data and simulations?

Sonia Eynard , Pascal Croiseau , Denis Laloë , Mario P.L. Calus , Sebastien Fritz et al.

Gordon Research Conference in Quantitative Genetics and Genomics, Feb 2017, Galveston Texas, United States. 2017

Poster de conférence hal-02787529v1

Implementation of genomic selection in three French regional dairy cattle breeds

Marie-Pierre Sanchez , David Jonas , Aurélia Baur , Vincent Ducrocq , Chris Hoze et al.

67. Annual meeting of the European Federation of Animal Science EAAP 2016, Aug 2016, Belfast, United Kingdom. 2016, Book of Abstract of the 67th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science

Poster de conférence hal-01531682v1
Deposit thumbnail

Using whole genome sequences to identify candidate mutations of bovine milk fatty acids and proteins in fairy cattle

Marie-Pierre Sanchez , Armelle Gion , Anne Barbat , Sebastien S. Fritz , Guy Miranda et al.

PAG XXIV - Plant and Animal Genome Conference, Jan 2016, San Diego, United States. pp.P0526, 2016

Poster de conférence hal-02793489v1

Which individual to phenotype? Optimal design of reference population for genomic selection while maintaining genetic diversity

Sonia Eynard , Denis Laloë , Pascal Croiseau , Mario P. L. Calus , Sebastien Fritz et al.

ICQG 5, Jun 2016, Madison, Wisconsin, United States. 2016

Poster de conférence hal-02796864v1

Valoriser la diversité génétique en sélection végétale et animale

Jean Pierre Bidanel , Nathalie Couix , Pascal Croiseau , Christian Ducrot , Pauline Ezanno et al.

INRAE. Agroécologie : des recherches pour la transition des filières et des territoires, Editions Quae, pp.59-69, 2020, 978-2-7592-3129-4

Chapitre d'ouvrage hal-04559548v1
Deposit thumbnail

Quel futur pour l’amélioration génétique chez les espèces animales domestiques ?

Didier Boichard , Pascal Croiseau , Sebastien Fritz , Vincent Ducrocq

Potentiels de la science pour l’avenir de l’agriculture, de l’alimentation et de l’environnement, Académie d'Agriculture, 2014

Chapitre d'ouvrage hal-01193805v1