
Romain David
- European Research Infrastructure on Highly Pathogenic Agents (ERINHA-AISBL)
Présentation
Ingénieur de Recherche - Data Manager de ERINHA AISBL (European Research Infrastructure on Highly Pathogenic Agents)
- Développement de la politique de gestion des données dans le cadre d'ERINHA
- Mise en place et développement du catalogue de données d'ERINHA, et de son DMP
- Conceptialisation d'un centre de ressource de données dans le cloud respectant les principes FAIR, et des étapes pour y faire parvenir les partenaires d'ERINHA
- Mise en place de procédures garantissant la sécurité des données, ainsi que les restrictions d'accès nécessaires, leur stockage et archivage et les méthodologies de transfert des données sensibles,
- Identification, déploiement et implémentation des outils web (VRE) et e-infrastructures pour le management des données dans le cadre du réseau d'ERINHA et des projets de recherche afférents.
Responsabilités particulières
- WP Leader du projet européen OSCARS
- WP Leader du projet européen ISIDORe
- Task Leader du projet européen By-COVID
- en charge du Data Management Plan des projets européens EVORA, NAVIPP, CCHFVACIM, INTERCEPTOR
- 2024 - 2025 Membre élu du Technical Advisory Board (TAB) de Research Data Alliance
- 2020 - 2024 Co-chair du R.D.A. IG PDS (Professionnalising Data Stewardship Interest Group in Research Data Alliance)
- 2020 - 2024 Co-chair du R.D.A. IG SD (Sensitive Data Interest Group in Research Data Alliance)
- 2020 - 2024 Co-chair de la liste "RDA France FAIR Data" 30 lettres archivées consultables sur le site de la RDA -> pour s'inscrire à : RDA France FAIR Data
- 2024 - 2026 Membre actif de EOSC Task Force FAIR Metrics and Digital Object
- 2024 - 2026 Membre actif de EOSC OA2: Metadata, Ontologies & Interoperability & OA5 skills-training-rewards-recognition
- 2022 - 2024 Representation de ERINHA à l'Assemblée Générae de EOSC Association
Et anciennement:
- 2017 - 2024 Co-chair du R.D.A. IG SHARC(SHAring for Rewarding and Credits Interest Group in Research Data Alliance)
- 2020 - 2022 Membre actif de FDO Forum sous groupe "FDO type" et "FDO Sem"
- 2020 - 2023 Co-chair de la liste RDA France Santé -> pour s'inscrire à RDA France Santé
- 2021 - 2023 Membre EOSC Task Force FAIR Metrics and Data Quality
précédemment Ingénieur de Recherche à l'INRAE (Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement) Laboratoire Mathématiques, Informatique et STatistique pour l'Environnement et l'Agronomie (UMR MISTEA)
- Interopération des plates-formes (Phenotyping Hybrid Information System) et animation des échanges entre les acteurs de différentes disciplines (concernant l’adoption, le choix et la mise en oeuvre d’ontologies et de normes notamment)
- Participation au développement des standards de domaine.
- Co-chair du R.D.A. IG Group SHARC (SHAring for Rewarding and Credits Interest Group in Research Data Alliance)
précédemment PhD Océanographie - Fouille de données à l'Institut Ecologie et Environnement du CNRS
Institut Méditerranéen de Biodiversité et d'Ecologie marine et continentale (IMBE UMR 7263)
- Initiateur et animateur du consortium IndexMed devenu depuis IndexMEED
- Co-chair du R.D.A. IG Group SHARC (SHAring for Rewarding and Credits Interest Group in Research Data Alliance)
- WP Leader du programme européen CIGESMED
- Administrateur de différentes bases de données concernant des systèmes d'observations côtiers
Domaine d’activité
Mes travaux concernent les systèmes d’observation et d'expérimentation à large échelle des (agro)écosystèmes terrestres et marins et les systèmes d'information et de la valorisation de la connaissance sur la biodiversité qui y sont couplés. Je m'intéresse particulièrement aux nouvelles méthodes de fouille de données et à la représentation des données sous forme de graphes (mono ou multilayers, mono ou pluripartites, sémantiques ou non). Cette formalisation de la connaissance permet d'envisager l'usage de nouvelles méthodes d'analyse de données hétérogènes, de proposer des questionnements scientifiques émergeant des données (et non l'inverse, qui est l'approche scientifique classique), et de faire des propositions de scenarios dépendant de variables de contextes utilisables dans le domaine de l'aide à la décision. Je souhaite continuer à m’investir dans le développement de programmes de recherche pluri voire transdisciplinaires et des partenariats associant scientifiques et acteurs publics. Je m'implique dans les initiatives et démarches pour la science ouverte aux niveaux européen et international (FAIRness literacy, Data Management Plan, FAIRisation training).
Thèmes et intérêts
Informatique dans le domaine de la biodiversité et de l'agronomie, bases de données, représentations des connaissances, gestion de données scientifiques, Plan de gestion de données, fouille de données, développement de communautés autour de la donnée, visualisation de données, dissémination, science ouverte, big data
Ecologie côtière, Macro-écologie, Benthos, écologie Marine, suivi de la Biodiversité, suivi des impacts environnementaux, Océanographie biologique, Restauration écologique, Gestion des ressources en Milieu marin, systèmes d’aide à la décision
Programmes de recherches récents et en cours
En cours
- OSCARS – Open Science Cluster Action for Research & Society est un projet de quatre ans financé à hauteur de 25 millions d'euros dans le cadre de l'appel HORIZON-INFRA-2023-EOSC-01-01 de la Commission européenne, sous l'accord de subvention n° 101129751. Il réunit des infrastructures de recherche européennes de premier plan, visant à encourager l'adoption de la science ouverte en Europe à travers diverses disciplines et communautés scientifiques. Les objectifs principaux incluent la consolidation des services de données FAIR interdisciplinaires et des pratiques de travail durables. Le projet lancera deux appels ouverts pour le développement de nouveaux projets innovants de science ouverte, totalisant environ 16 millions d'euros, afin de promouvoir la recherche intensive en données FAIR dans l'Espace européen de la recherche (ERA). Le premier appel a été lancé en mars 2024 et le second est prévu pour novembre 2024. (under CE grant agreement Nº101129751)
- EVORA – European Viral Outbreak Research Alliance, est un projet de quatre ans financé par l'accord de subvention Horizon Europe n° 101131959. EVORA rassemble les infrastructures de recherche de premier plan comme ELIXIR, ERINHA, et EVA pour renforcer la préparation et la réponse aux pandémies en Europe. Les objectifs principaux incluent la consolidation des infrastructures durables de l'UE, l'élaboration de mécanismes de gouvernance communs, la mise en place de normes de qualité et l'amélioration de la capacité de l'UE à mener des recherches coordonnées sur les menaces infectieuses. EVORA vise à offrir des ressources intégrées et des services de recherche préclinique pour l'étude des pathogènes viraux. (under CE grant agreement Nº101131959)
- ISIDORe – Integrated Services for Infectious Diseases Outbreak Research a pour objectif d’accroître la réactivité et la préparation de l'UE à toute menace épidémique en fournissant une très large gamme de services innovants et de haute qualité à toutes les communautés d'utilisateurs scientifiques ayant des projets dans le domaine des agents hautement pathogènes. Le consortium ISIDORe représente le plus grand instrument de recherche dédié à l'étude des pathogènes à haut risque jamais mis en place. Suite à l'appel à manifestation d'intérêt de l'incubateur de l'HERA sur les variantes du SARS‑CoV_2, le projet ISIDORe (Integrated Services for Infectious Disease Outbreak Research) dirigé par ERINHA a été sélectionné comme l'une des premières actions d'Horizon Europe. Le consortium ISIDORe comprend 154 participants de 32 pays du monde entier et contribuera aux efforts de recherche sur les variants du SRAS-CoV-2 et tout autre agent pathogène à tendance épidémique, en assemblant un portefeuille intégré et complémentaire d'état de l'art, de services de pointe au profit de la communauté scientifique. (under CE grant agreement Nº101046133)
- By-COVID: Le monde a généré de grandes quantités de données en réponse à la pandémie de COVID-19, et en génère toujours plus. Ces données proviennent de nombreuses sources différentes, et les identifier, les connecter et les intégrer pour une analyse efficace reste un défi majeur. Le projet BeYond-COVID vise à rendre les données sur la COVID-19 accessibles aux scientifiques dans les laboratoires mais aussi à toute personne pouvant les utiliser, comme le personnel médical des hôpitaux ou les responsables gouvernementaux. Au-delà des données sur le SRAS-CoV-2, le projet fournira un cadre pour rendre les données d'autres maladies infectieuses ouvertes et accessibles à tous. (under CE grant agreement Nº101046203)
- INTERCEPTOR – INTERnational Cooperation of high containment research infrastructures: from Epidemic Preparedness TO Response, est un projet de quatre ans financé à hauteur de 1,5 millions d'euros dans le cadre de l'appel Horizon Europe, sous l'accord de subvention n° 101095532. Il réunit 14 infrastructures de recherche de premier plan en Europe pour renforcer la préparation et la réponse aux épidémies. Les principaux objectifs du projet sont d'améliorer l'accès aux infrastructures de recherche à haut confinement, de renforcer les compétences des chercheurs et des gestionnaires de laboratoires, et de promouvoir le partage des connaissances, des compétences et des expériences. En offrant des programmes de formation communs et des échanges de personnel, INTERCEPTOR vise à pousser les frontières de la science et de l'innovation dans le domaine des maladies infectieuses émergentes (EID).
- NAVIPP – New AntiVirals for Infections with Pandemic Potential, est un projet de quatre ans financé par l'accord de subvention Horizon Europe. NAVIPP vise à renforcer la capacité de l'UE à répondre aux menaces virales en assemblant une plateforme internationale de R&D pour le développement de médicaments antiviraux contre les pathogènes à potentiel pandémique. Les principaux objectifs incluent le développement de médicaments antiviraux à large spectre pour atténuer les effets précoces des épidémies et des pandémies. Le consortium comprend plusieurs partenaires de divers pays européens.
- CCHFVACIM – Crimean Congo Haemorrhagic Fever Virus, est un projet de recherche financé par l'Union Européenne, visant à développer des contre-mesures prophylactiques et thérapeutiques efficaces contre le virus de la fièvre hémorragique de Crimée-Congo (CCHFV). Ce projet de quatre ans se concentre sur l'optimisation d'un candidat vaccin à base d'ARNm, l'étude de la biologie structurelle des glycoprotéines virales, et le développement d'anticorps monoclonaux immunothérapeutiques.
Passés
- QUAMPO (QUAlité des Milieux côtiers POrtuaire en haute-Corse) développe une méthode innovante de monitoring de la qualité des eaux basée sur des techniques d’écotoxicologie de mesure de biomarqueurs chez des invertébrés et à développer des outils pour les gestionnaires des ports.
- EOSC Life - EOSC-Life brings together the 13 Biological and Medical ‘ESFRI’ research infrastructures (BMS RIs) to create an open, digital and collaborative space for biological and medical research. The project will publish ‘FAIR’ data and a catalogue of services provided by participating RIs for the management, storage and reuse of data in the European Open Science Cloud (EOSC). (under CE grant agreement Nº824087)
- PARSEC - The PARSEC project is designed to provide a unique opportunity for data and synthesis scientists to collaborate and exchange in real-time toward the goal of improving research outcomes, data sharing, and data reuse. It will also help pioneer new scientific and data science technologies aimed at improving both the management and conservation of global biodiversity.
- Foosin - project is working to facilitate the progressive implementation of FAIR principles by data managers and producers in agriculture and agri-food. Improved data management will facilitate interdisciplinarity and reproducibility of work while reducing data duplication. We are particularly interested in the application of FAIR principles to semantic resources (ontologies, thesauri…) which are themselves key elements for making data more FAIR (Principle I2).
- TRAFIC - Areas of potential high-interaction between marine traffic and marine mammals in French West Indies: this project aims at improving the knowledge on the pressure of maritime activities on the marine environment in the Caribbean Sea. In particular, a master internship focuses on studying the spatiotemporal co-occurrence between marine traffic and cetaceans.
- Erinha Advance - ERINHA Research Infrastructure was successfully set up and has now entered into its operational phase. ERINHA-Advance is a H2020-funded project which aims to continue supporting the successful operation of the ERINHA Research Infrastructure to ensure its long-term sustainability. (under CE grant agreement Nº824061)
- D2KAB - Data to Knowledge in Agronomy and Biodiveristy project create a framework to turn agronomy and biodiversity data into knowledge –semantically described, interoperable, actionable, open– and investigate scientific methods and tools to exploit this knowledge for applications in science & agriculture
- EPPN2020 - European Plant Phénotyping Network (Horizon 2020 research and innovation programme under grant agreement Nº731013)
- IndexMEED - Indexing for Mining Ecological and Environmental Data : www.indexmed.eu (Financement 2016 - MI du CNRS)
- GRAMINEES - GRAphe data Mining In Natural, Ecological and Environnemental Sciences (Financement GDR MaDICS)
- EVACOR et EVACOR2 - EVAluation des services écosystémiques des habitats CORalligènes (1 et 2)
- VIGI-GEEK - VIsualisation of Graph In transdisciplinary Global Ecology, Economy and Sociology data-Kernel (Défi Imag'in, Financement MI du CNRS)
- CHARLIE - CHAnger de Regard En Liant dans Indexmed l’Environnement et les Etoiles (PEPS Blanc, Financement INEE - CNRS)
- [CIGESMED ](http://www.cigesmed.eu "Coralligenous based Indicators to evaluate and monitor the "Good Environmental Status" of the MEDiterranean coastal waters")- Coralligenous based Indicators to evaluate and monitor the "Good Environmental Status" of the MEDiterranean coastal waters (ANR conventions n° 12-SEAS-0001-01, 02 and 03 for France; GSRT - 12SEAS-12-C2 for Greece; TUBITAK Project No: 112Y393 for Turkey)
- DEVOTES - DEVelopment Of innovative Tools for understanding marine biodiversity and assessing good Environmental Status www.devotes-project.eu (European Union's Seventh Framework Programme for research, technological development and demonstration under grant agreement n°308392)
- Proteker - Effects of global change on the marine benthos and habitats in Kerguelen Islands. Establishment of a base line for ecological and genetic monitoring, protection and conservation. www.proteker.net (Programme IPEV 1044)
Vous trouverez les slides des présentations orales - non acceptés dans hal sur researchgate : Romain David sur ResearchGate
Domaines de recherche
Compétences
Publications
Publications
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Converging on a Semantic Interoperability Framework for the European Data Space for Science, Research and Innovation (EOSC)2nd Workshop on Ontologies for FAIR and FAIR Ontologies (Onto4FAIR), 9th Joint Ontology Workshops (JOWO 2023),, Cassia Trojahn; Luiz Olavo Bonino da Silva Santos; Giancarlo Guizzardi; Clement Jonquet, Jul 2023, Sherbrooke, Québec, Canada. ⟨10.5281/zenodo.8042997⟩
Communication dans un congrès
hal-04149754
v1
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Insights into the practicalities of collaboration, data and code sharing across the globeResearch Data Alliance 20th Plenary (RDA P20), RDA, Mar 2023, Gothenburg, Sweden. ⟨10.5281/zenodo.7770148⟩
Communication dans un congrès
hal-04371759
v1
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Baleines et dauphins : des belles espèces sentinelles à étudier dans le cadre d'un OHM littoral, mais d'un abord bien complexeInternational Symposium of Labex DRIIHM 2021, Labex DRIIHM; CNRS InEE, Sep 2021, Toulouse, France. ⟨10.34972/driihm-dab5a4⟩
Communication dans un congrès
hal-03353044
v1
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Fairness and immunogenetics34th European Immunogenetics and Histocompatibility and 31st British Society for Histocompatibility and Immunogenetics Conference, Apr 2020, Glasgow, United Kingdom. pp.415-416
Communication dans un congrès
hal-03128281
v1
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Community ecology of coralligenous assemblages using a metabarcoding approach3rd Mediterranean Symposium on the conservation of Coralligenous & other Calcareous Bio-Concretions, Specially Protected Areas Regional Activity Centre (SPA/RAC), Jan 2019, Antalya, Turkey. pp.41-45, ⟨10.5281/zenodo.12755700⟩
Communication dans un congrès
hal-02048506
v1
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Building a consistent Information System in the different nodes and defining standardisation strategies2. Annual Meeting EPPN2020, Wageningen University and Research Centre (WUR). NLD., May 2019, Wageningen, Netherlands. 32 p
Communication dans un congrès
hal-02787524
v1
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Developing crediting/rewarding mechanisms to foster resources (data and materials) sharing in Research: towards recommendations First draft of recommendations from the SHARC biodiversity research communityRDA 11th Plenary meeting, Mar 2018, Berlin, Germany
Communication dans un congrès
hal-01861827
v1
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Analysis on the Graph Techniques for Data-mining and Visualization of Heterogeneous Biodiversity Data SetsComplexis 2017, Apr 2017, Porto, Portugal. pp.144 - 151, ⟨10.5220/0006379701440151⟩
Communication dans un congrès
hal-01541140
v1
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A new submarine observatory of the Sub-Antarctic coastal benthos facing climate change in Kerguelen IslandsXIIth SCAR Biology Symposium, A. Van de Putte, Jul 2017, Leuven, Belgium. pp.457, ⟨10.5281/zenodo.3241855⟩
Communication dans un congrès
hal-04651868
v1
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Strike-Alert: Towards Real-time, High Resolution Navigational Software for Whale AvoidanceSUSTECH 2017 : 5th annual IEEE Conference on Technologies for Sustainability, Nov 2017, Phoenix, United States. ⟨10.1109/SusTech.2017.8333534⟩
Communication dans un congrès
hal-01623903
v1
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Community composition of macroinvertebrates in the Mediterranean Sea41st CIESM Congress, CIESM, Sep 2016, Kiel (Allemagne), Germany. pp.470, ⟨10.5281/zenodo.12760940⟩
Communication dans un congrès
hal-04651995
v1
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A comparison among coralligenous-based indices for the assessment of the marine ecological quality51st European Marine Biology Symposium (EMBS), EMBS, Sep 2016, Rhodes (Grèce), Greece. pp.23, ⟨10.5281/zenodo.12773785⟩
Communication dans un congrès
hal-04653393
v1
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CIGESMED project: evidence-based management for coralligenous habitats in the Mediterranean Sea51st European Marine Biology Symposium (EMBS), EMBS, Sep 2016, Rhodes (Grèce), Greece. ⟨10.5281/zenodo.12772391⟩
Communication dans un congrès
hal-04652719
v1
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Architecture, concepts et services d'un système d'indexation de données distribuées pour l'observation à large échelle en écologie marine32ème Conférence sur la Gestion de Données - Principes, Technologies et Applications, laboratoire d’Informatique et d’Automatique pour les Systèmes (LIAS), Nov 2016, POITIERS, France. ⟨10.5281/zenodo.12772074⟩
Communication dans un congrès
hal-01426497
v1
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Citizen science for CIGESMED: involving divers in marine biological monitoring51st European Marine Biology Symposium (EMBS), EMBS, Sep 2016, Rhodes (Grèce), Greece. pp.39, ⟨10.5281/zenodo.12773961⟩
Communication dans un congrès
hal-04653452
v1
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IndexMed projects: new tools using the CIGESMED DataBase on Coralligenous for indexing, visualizing and data mining based on graphs 8th International Congress on Environmental Modelling and Software, Toulouse, France, Sabine Sauvage, José-Miguel Sánchez-Pérez, Andrea Rizzoli (Eds.), Jul 2016, Toulouse, France. pp.32, ⟨10.5281/zenodo.6047140⟩
Communication dans un congrès
hal-01425559
v1
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Project IndexMed: original solutions to manage the heterogeneity of marine ecology data in the Mediterranean Sea.51st European Marine Biology Symposium (EMBS), EMBS, Sep 2016, Rhodes (Grèce), Greece. pp.37, ⟨10.5281/zenodo.12773540⟩
Communication dans un congrès
hal-04653349
v1
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Preliminary assessment of macrobenthic assemblages of coralligenous habitats across the Mediterranean Sea2nd Mediterranean Symposium on the conservation of Coralligenous & other Calcareous Bio-Concretions , RAC/ASP, Oct 2014, Portorož, Slovenia. pp.207-208
Communication dans un congrès
hal-01790493
v1
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A first prototype for indexing, visualizing and mining heterogeneous data in Mediterranean ecology11th International Conference on Signal-Image Technology & Internet-Based Systems (SITIS), Kokou Yetongnon, Albert Dipanda, University Of Bourgogne, France and Richard Chbeir, University of Pau, France, Nov 2015, Bangkok, Thailand. pp. 232-239, ⟨10.1109/SITIS.2015.119⟩
Communication dans un congrès
hal-01433600
v1
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An ecosystem-based approach to assess the status of the Mediterranean coralligenous habitat.RAC/SPA 2nd Mediterranean Symp. on the Conservation of coralligenous and other calcareous bio-concretions, RAC/SPA, Oct 2014, Portorož Slovenia. pp.153-158
Communication dans un congrès
hal-01790546
v1
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CIGESMED. Protocols: how to implement a multidisciplinary approach on a large scale for coralligenous habitats surveysRAC/SPA 2nd Mediterranean Symp. on the Conservation of coralligenous and other calcareous bio-concretions, RAC/SPA, Oct 2014, Portorož, Slovenia. pp.66-71, ⟨10.13140/2.1.1895.0086⟩
Communication dans un congrès
hal-01620550
v1
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CIGESMED habitat's characterization: a simple ans reusable typology at the Mediterranean scaleRAC/ASP 2nd Mediterranean Symposium on the conservation of Coralligenous & other Calcareous Bio-Concretions, Oct 2014, Portorož, Slovenia. pp.211-212
Communication dans un congrès
hal-01620541
v1
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Defining keystone species in European regional seas: what are the candidates for the Mediterranean?11th Panhellenic Symposium on Oceanography and Fisheries, HCMR, May 2015, Mytilene, Lesbos Island, Greece. pp.553-556, ⟨10.5281/zenodo.12775587⟩
Communication dans un congrès
hal-04653609
v1
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AN INTEGRATED APPROACH TO EVALUATE AND MONITOR THE CONSERVATION STATE OF CORALLIGENOUS BOTTOMS: THE INDEX-COR METHODConference: 2nd Mediterranean Symposium on the conservation of Coralligenous & other Calcareous Bio-Concretions, Oct 2014, Portorož, Slovenia. ⟨10.13140/2.1.3180.6405⟩
Communication dans un congrès
hal-01620618
v1
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CIGESMED: Coralligenous based indicators to evaluate and monitor the "good environmental statut" of the Mediterranean coastal waters, a SeasEra project2nd Mediterranean Symposium on the conservation of Coralligenous & other Calcareous Bio-Concretions, Oct 2014, Portorož, Slovenia
Communication dans un congrès
hal-01620607
v1
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CIGESMED’s protocol and network (Coralligenous basEd. Indicators to evaluate and monitor the “Good Environmental Status” of Mediterranean coastal waters)5th International Symposium Monitoring of Mediterranean coastal areas: problems and measurement techniques, CNR-IBIMET Firenze, Jun 2014, Livorno, Italy. pp.828-843
Communication dans un congrès
hal-01790542
v1
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Improving data identification and tagging for more effective decision making in agricultureLeisa Armstrong. Improving Data Management and Decision Support Systems in Agriculture, 85, Burleigh Dodds Science Publishing, 2020, Series in Agricultural Science, 978-1-78676-340-2
Chapitre d'ouvrage
hal-02164149
v1
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CIGESMED’s protocol and network (Coralligenous based Indicators to evaluate and monitor the “Good Environmental Status” of Mediterranean coastal waters)CNR-IBIMET Proceedings of Fifth International Symposium MONITORING OF MEDITERRANEAN COASTAL AREAS: PROBLEMS AND MEASUREMENT TECHNIQUES, , pp.828-843, 2014, 978-88-95597-19-5
Chapitre d'ouvrage
hal-01620518
v1
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Zones côtières et développement durable : une équation à résoudreA. Euzen, L. Eymard, F. Gaill. Le devéloppement durable à découvert, Le devéloppement durable à découvert (Chapter: 2-22), CNRS editions, pp.96-97, 2013, 978-2-271-07896-4
Chapitre d'ouvrage
hal-01620564
v1
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De la conception d'un système d'observation à large échelle au déploiement et à l'exploitation de son système d'information : application à l'observation des habitats coralligènes et à la colonisation de récifs artificiels (ARMS)Biodiversité et Ecologie. Aix Marseille Université, 2018. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse
tel-01839376
v1
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Open data to support European pandemic preparedness BY-COVID learnings and policy recommendations after 18 months of cross-disciplinary collaboration2023, https://doi.org/10.5281/zenodo.7950479
Autre publication scientifique
hal-04140149
v1
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Check-liste pour la Présence Numérique2023, ⟨10.5281/zenodo.7847715⟩
Autre publication scientifique
hal-04590466
v1
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IndexMEED cases studies using "Omics" data with graph theory2017, pp.340-361. ⟨10.3897/tdwgproceedings.1.20740⟩
Autre publication scientifique
hal-01761535
v1
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Report on identification of keystone species and processes across regional seas2014, pp.1-103. ⟨10.131140/2.1.2093.3929⟩
Autre publication scientifique
hal-01790558
v1
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PARSEC Data and Digital Output Management Plan and Workbook2020
Pré-publication, Document de travail
hal-02885254
v1
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Identification of objects with Uniform Resource Identifier (URI): recommendations for application in plant phenotyping2019
Pré-publication, Document de travail
hal-02390920
v1
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Application of the Ecosystem Service Concept to a Local-Scale: The Cases of Coralligenous Habitats in the North-Western Mediterranean Sea2017
Pré-publication, Document de travail
halshs-01624589
v1
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Ecological Data Preservation in the context of IndexMed -PREDON 20152015
Pré-publication, Document de travail
hal-01620554
v1
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Prepare your team for Open Science - RESEARCH/PROJECT TEAM OPEN SCIENCE PRACTICESAGU; ERINHA. 2023, https://zenodo.org/record/8043545
Rapport
hal-04179564
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Share your software -SOFTWARE DOCUMENTATION AND CITATION CHECKLISTAGU; ERINHA. 2023, https://doi.org/10.5281/zenodo.7841908
Rapport
hal-04179562
v1
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Equip your team for Open Science - RESOURCES AND GUIDANCE FOR TEAMSAGU; ERINHA. 2023, https://doi.org/10.5281/zenodo.8043645
Rapport
hal-04179565
v1
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Increase the visibility of your work - DIGITAL PRESENCE CHECKLISTAGU; ERINHA. 2023, https://doi.org/10.5281/zenodo.7841734
Rapport
hal-04179559
v1
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DATA DOCUMENTATION AND CITATION CHECKLISTAGU; ERINHA. 2023, https://zenodo.org/record/7841823
Rapport
hal-04179560
v1
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PARSEC D(DO)MP. Project tracksheets: scholarly publications, non peer-reviewed digital outputs, dataset log, and software log.University of Queensland; AGU; ERINHA. 2023
Rapport
hal-04185433
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Develop a Team Preservation Process - DIGITAL OBJECTS PRESERVATION CHECKLIST FOR TEAMSAGU. 2023
Rapport
hal-04177045
v1
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PARSEC Data and Digital Output Management Plan and WorkbookBELMONT Forum; AGU; ERINHA. 2023, https://zenodo.org/record/8231464
Rapport
(plan de gestion de données/data management plan)
hal-04180992
v1
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BY-COVID D2.2: Data Access and Transfer across research domains and jurisdictions2.2, BBMRI-ERIC; EMBL-EBI; INFRAFRONTIER; Sciensano; BSC; ELIXIR-NL/VUmc; ERINHA; Lygature; CESSDA. 2023
Rapport
(rapport contrat/projet)
hal-04149733
v1
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TOWARDS A DATA QUALITY FRAMEWORK FOR EOSC Authorship CommunityEOSC Association. 2022
Rapport
hal-04017152
v1
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Community-driven Governance of FAIRness Assessment: An Open Issue, an Open Discussion Authorship CommunityEOSC Association; EOSC. 2022, pp.10.5281/zenodo.7390482
Rapport
hal-03888650
v1
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RDA for Data Management Planning Community Cross-fertilisation Workshop SummaryResearch Data Alliance. 2022
Rapport
(rapport d’expertise collective)
hal-03892700
v1
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Repository Guidelines[Research Report] 1, PARSEC. 2022
Rapport
(rapport de recherche)
hal-03738319
v1
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BY-COVID D3.2: Implementation of cloud-based, high performance, scalable indexing system.3.2, ELIXIR-Hub; EMBL-EBI; CESSDA/TAU-FSD; ERINHA; UOXF; ECRIN; ELIXIR-NL/VUmc; ELIXIR-NL; Lygature. 2022
Rapport
(rapport contrat/projet)
hal-04149738
v1
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D8.1 EOSC-Life Methodology framework to enhance reproducibility within EOSC-Life – revised versionEOSC-Life; INFRAFRONTIER; VIB; EMBRC; ERINHA; IRFMN; EMBL-HD; UNIMAN; Fraunhofer; BBMRI-ERIC; NKI; EMBL-EBI; CSR4; HU; CSIC; BSC. 2022
Rapport
hal-04161693
v1
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D4.1 EOSC-Life Requirements for hosting/ distributing and access control for sensitive dataD4.1, ECRIN; BBMRI-ERIC; EATRIS; Charité; Lygature; ERINHA; EMBRC; INFRAFRONTIER; EuroBioImaging. 2022
Rapport
hal-04161744
v1
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BY-COVID - D3.1 - Metadata standards.3.1, EMBL; CESSDA; ERINHA; CESSDA/TAU-FSD; ECRIN,; ELIXIR-NL/VUmc; ELIXIR-NL; Lygature; ELIXIR-UK/UNIMAN; UOXF. 2022, pp.3.1
Rapport
hal-04149751
v1
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EOSC-Life -D1.3 EOSC-Life EOSC FAIR services deployment for open callsD1.3, Fraunhofer-Institut für Offene Kommunikationssysteme (FOKUS Fraunhofer); EMBL; CSIC; VU; BBMRI; KNAW; UVEG; USMI; IMG; UNIMAN; LUMC; EATRIS; UNIMIB; EBI; ECRIN; EMBRC; EMPHASIS (FZJ); ERINHA; INFRAFRONTIER; INRAE; UNIVDUN; HMGU; CERBM; BSCRC; UOULU; CRRMMP. 2022
Rapport
hal-04161824
v1
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EOSC-Life D3.2 Report on the work of the initial demonstratorsInstruct-ERIC; CSIC; BSC; CRG; EMBL-HD; INRAE; CNRS; CCMAR; EMBRC ERIC; ALUFR; UNIVDUN; UNITO; ERINHA; CNR; FZJ; UNIMAN; NIB; UNI Bielefeld; Fraunhofer; Diamond; IMG; EATRIS. 2021
Rapport
hal-04161943
v1
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EOSC-Life Report on data standards for observational and interventional studies, and interoperability between healthcare and research dataEOSC-Life. 2021
Rapport
hal-04017153
v1
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PARSEC DDOMP Workbook Checklist[Research Report] 1, AGU. 2021
Rapport
(plan de gestion de données/data management plan)
hal-03738316
v1
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Manage your Digital Objects – Research Team Member Checklist[Research Report] PARSEC. 2021
Rapport
(rapport de recherche)
hal-03738318
v1
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EOSC-Life D1.2 EOSC repository deployment for project demonstrators1.2, Fraunhofer-Institut für Offene Kommunikationssysteme (FOKUS Fraunhofer); EMBL; LUMC; EATRIS; INRAE; ECRIN; EMBRC; EMPHASIS (FZJ); ERINHA; INFRAFRONTIER; UNIMIB; UNIVDUN; VU; HMGU; CERBM; BSCRC; UOULU; CIRMMP; CSIC; KNAW; BBMRI; UVEG; USMI; IMG; CNRI; UNIMAN. 2021
Rapport
hal-04162006
v1
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EOSC-LIFE WP4 TOOLBOX: Toolbox for sharing of sensitive data - a concept description[Research Report] EATRIS/Lygature; ECRIN; CRS4; Charité; BBMRI; INSERM; EMBRC; ERINHA; EATRIS/IRFMN; EU-OPENSCREEN; IME; ELIXIR. 2021
Rapport
hal-03739125
v1
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EOSC-Life D4.3 - Guidance and policy on standards and tools to facilitate sharing and reuse of multimodal data (including imaging), cohort integration, and biosamples4.3, ECRIN; BBMRI; IRFMN; EU-OPENSCREEN; ELIXIR; VHIR; Charité; UNITO; Lygature; INSERM; EMBRC; ERINHA; EATRIS. 2021
Rapport
hal-04161974
v1
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EOSC-Life WP4 Toolbox: Categorisation system for resources to be referenced in the toolbox for sharing of sensitive data[Research Report] ECRIN. 2020
Rapport
hal-03739126
v1
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CIGESMED for divers - Citizen Science for CIGESMED[Technical Report] IMBE Institut Méditerranéen de Biodiversité et d'Ecologie marine et continentale. 2016
Rapport
(rapport technique)
hal-02156469
v1
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CIGESMED : Coralligenous based Indicators to evaluate and monitor the "Good Environmental Status" of the Mediterranean coastal waters[Research Report] ANR. 2016, 107 pp
Rapport
(rapport de recherche)
hal-01448881
v1
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