
Samuel Alizon
Directeur de Recherche CNRS, responsable de l'équipe Écologie et évolution de la santé
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Documents
Affiliation actuelle
- Centre interdisciplinaire de recherche en biologie (CIRB)
Identifiants chercheurs
Site web
Présentation
Je suis Directeur de recherche au CNRS, affecté au Centre Interdisciplinaire de Recherches en Biologie (CIRB) au Collège de France à Paris.
Mes travaux portent sur l'écologie et l'évolution de la santé, notamment les virus humains causant des infections sexuellement transmissible ou encore le microbiote vaginal. Je développe en particulier des modèles mathématiques et des simulations numériques.
Je suis l'auteur d'un livre grand public intitulé Évolution, écologie et pandémies, publié en 2020 au Points Seuil.
Pour plus de détails, voir mon site internet personnel.
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Publications
Évolution, écologie et pandémiesPoints Sciences, 2020, 2757887238
Ouvrages
hal-03045497
v1
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Ecologie de la santéEdition du Cherche Midi CNRS, 176 p., 2017, Documents (Cherche Midi), ISBN: 9782749154251 9782749154251
Ouvrages
(ouvrage de synthèse)
hal-02785631
v1
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C'est grave Dr Darwin ? L'évolution, les microbes et nousLe Seuil, 2016, 2021102920
Ouvrages
hal-01638066
v1
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Épidémiologie et évolution du SARS-CoV-2Les années COVID : comment y survivre, , pp.65-74, 2023, 978-2-493270-69-6
Chapitre d'ouvrage
hal-04184205
v1
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|
PhylodynamiqueISTE. Modèles et méthodes pour l’évolution biologique, , 2022, 9781789480696. ⟨10.51926/ISTE.9069.ch11⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-02884408
v1
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Invasions of Host-Associated Microbiome NetworksResearch, BT - Advances in Ecological. Networks of Invasion: Empirical Evidence and Case Studies, 57, Academic Press, 2017, Advances in Ecological Research, ⟨10.1016/bs.aecr.2016.11.002⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-01567903
v1
|
L’être vivant dans son environnementCNRS Editions. Etonnant vivant. Découvertes et promesses du XXIème siècle (Livre blanc)., 2017
Chapitre d'ouvrage
hal-01923240
v1
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Emerging diseases and the evolution of virulence: the case of the Spanish influenza pandemicMarc Silberstein and Gérard Lambert and Philippe Huneman. Disease, Classification, and Evidence. New Essays in the Philosophy of Medicine, 7, Springer, pp.93-130, 2015, History, Philosophy and Theory of the Life Sciences, ⟨10.1007/978-94-017-8887-8_5⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-01567906
v1
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Evolution of Infectious Disease VirulenceJonathan Losos. Evolutionary biology, Oxford Bibliographies, 2014, ⟨10.1093/OBO/9780199941728-0018⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-01567916
v1
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|
Mobilisation de la FRB par les pouvoirs publics français sur les liens entre Covid-19 et biodiversité[0] FRB. 2021, 63 p
Rapport
(rapport d’expertise collective)
hal-04179836
v1
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|
De Delta à Omicron, scénarios de tendances hospitalières pour l'hiver 2021-2022[Rapport de recherche] 16, CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique; IRD - Institut de recherche pour le developpement; Université de Montpellier. 2021
Rapport
(rapport de recherche)
hal-03502127
v1
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|
SARS-CoV-2 Through the Lens of Computational Biology: How bioinformatics is playing a key role in the study of the virus and its origins[Research Report] CNRS. 2021, pp.1-35
Rapport
(rapport de recherche)
hal-03170023
v1
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|
Immunité de groupe et contrôle de l’épidémie de COVID-19[Rapport Technique] 2, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de Recherche pour le Développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
(rapport technique)
hal-02882682
v1
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|
Stochasticité et épidémie de COVID-19[Rapport de recherche] 8, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de Recherche pour le Développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
(rapport de recherche)
hal-02950660
v1
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|
Limites et délais dans l’estimation du nombre de reproduction[Rapport de recherche] 5, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
(rapport de recherche)
hal-02882697
v1
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|
Analyse de l’épidémie de COVID-19 en France et scénarios de contrôle[Rapport de recherche] 9, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
(rapport de recherche)
hal-02950665
v1
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|
Les effets sexe spécifiques de COVID-19 en France et l’implication potentielle des déficits en G6PD[Rapport de recherche] 11, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
(rapport de recherche)
hal-02950702
v1
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|
Évolution de la virulence et COVID-19[Rapport de recherche] 12, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
(rapport de recherche)
hal-02950712
v1
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Les effets sexe spécifiques de COVID-19 en France pourraient-ils être expliqués par des comorbidités ?[Rapport de recherche] 10, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
(rapport de recherche)
hal-02950676
v1
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|
Estimation du nombre de reproduction de l’épidémie de COVID-19 en France[Rapport de recherche] 1, Centre national de la recherche scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
(rapport de recherche)
hal-02882680
v1
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Phylodynamique du COVID-19 en France[Rapport de recherche] 4, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de Recherche pour le Développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
(rapport de recherche)
hal-02882688
v1
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Modéliser l'épidémie de COVID-19 (résumé)[Rapport de recherche] 7, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
(rapport de recherche)
hal-02950651
v1
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Phylodynamique du COVID-19 en France : variations temporelles de la croissance épidémique[Rapport de recherche] 6, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de Recherche pour le Développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
(rapport de recherche)
hal-02882698
v1
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Modélisation de l’épidémie de COVID-19 : modèle SEAIR[Rapport de recherche] 3, Centre national de la recherche scientifique (CNRS); Institut de Recherche pour le Développement (IRD); Université de Montpellier. 2020
Rapport
(rapport de recherche)
hal-02882687
v1
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Utilisation des phylogénies d'infections en épidémiologieAnses. 2017, pp.42-43
Rapport
anses-01533229
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Évolution de la virulence des parasites : apports des modèles emboîtésEvolution [q-bio.PE]. Université Pierre et Marie Curie (Paris VI), 2006. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse
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Dynamics and evolution of infectious diseasesPopulations and Evolution [q-bio.PE]. Université Montpellier 2, 2013
HDR
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Modelling parasitoid virulence evolution with seasonality2021, pp.100129. ⟨10.24072/pci.evolbiol.100129⟩
Autre publication scientifique
hal-03289840
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