
Sébastien Boutry
- Ecosystèmes aquatiques et changements globaux (UR EABX)
Présentation
Ingénieur d’études en bio-statistiques dans l’unité EABX (1454), je travaille au sein l’équipe ECOVEA (Écologie des COmmunautés VEgétales Aquatiques et impact des pressions multiples), où j'ai développé des indices de bio-indications à partir des communautés végétales aquatiques. Aujourd'hui, je m'intéresse aux effets des changements globaux sur les plantes aquatiques (dynamiques spatio-temporelles, traits éco-morpholologiques, composition spécifique, abondances). Je prends part aux travaux sur l’écosystème lacustre du Pôle ECLA (écosystèmes lacustres) regroupant de nombreux chercheurs et techniciens.
Dans le Pôle données et analyses de l’unité, j’accompagne les projets de l’unité dans tout le cycle des données (création de la base de données, acquisition des données, … et analyses statistiques) et propose des formations et le transfert de compétences envers les agents de l’unité. Membre du comité DIS (Déontologie et intégrité scientifique), je participe aux actions de ce comité et notamment à la sensibilisation de ces thématiques au sein de l'unité. Ces différentes actions transversales s'intègrent dans mes actions au sein de la CATI PROSODIE (Centre Automatisé de Traitement de l'Information Partage, Reproductibilité et Ouvertue Scientifique des Objets Digitaux de INRAE).
Domaines de recherche
Compétences
Publications
Publications
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Évaluation de l'état écologique des plans d'eau basée sur les communautés de plantes aquatiquesMaster. MASTER 2 BSE : EDT UE Bioindicateurs, Pessac, Université de Bordeaux, France. 2024
Cours
hal-04324555
v2
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Dans l'air du temps : logiciel RÉcole d'ingénieur. Organisation et bonnes pratiques avec R, ENSEGID, France. 2023
Cours
hal-04235446
v1
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Tableurs et base de donnéesÉcole d'ingénieur. Tableurs et base de données, ENSEGID, France. 2023
Cours
hal-04234952
v1
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Impacts des altérations physiques d’origine anthropique sur les dynamiques écologiques des macrophytes aquatiques dans les lacs et étangs aquitains6e Journées Internationales de Limnologie et d'Océanographie (JILO), Oct 2024, Bordeaux, France
Communication dans un congrès
hal-04968449
v1
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Évaluation de qualité écologique des plans d’eau basée sur les communautés de diatomées benthiquesSéminaire national du Pôle R&D ECLA, Pôle ECLA, Dec 2024, Aix-En-Provence, France
Communication dans un congrès
hal-04840122
v1
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Model-based management of macrophytes in shallow lakes of southwestern France under warming6e Journées Internationales de Limnologie et d'Océanographie (JILO), Oct 2024, Bordeaux, France
Communication dans un congrès
hal-05008725
v1
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Différence interspécifique dans la réponse d’organismes autotrophes à l’exposition à l’atrazine et au S-métolachlore6èmes Journées Internationales de Limnologie et Océanographie (JILO), Inrae EABX, AFL, Oct 2024, Bordeaux, France
Communication dans un congrès
hal-04892840
v1
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Léon-Bloom : Etude sur l’origine du développement des cyanobactéries dans l’étang de LéonLac Naturels Atlantique : Observer pour s"adapter - Journée Technique, Agence de l'Eau Adour Garonne, Mar 2024, Lacanau-Océan, France
Communication dans un congrès
hal-04569623
v1
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DYLAQ - Dynamiques écologiques temporelles des lacs et étangs du littoral AquitainLacs Naturels Atlantiques : observer pour s'adapter - Journée technique, Agence de l'Eau Adour Garonne, Mar 2024, Lacanau-Océan, France
Communication dans un congrès
hal-04569828
v1
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Development of a collaborative web-based approach for quantifying diatom deformities14th European Diatom Meeting (EDM 14), May 2023, Meise, Belgium
Communication dans un congrès
hal-04092991
v1
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Evaluation de qualité écologique des plans d'eau basée sur les communautés de diatomées benthiques.Séminaire Pôle ECLA, Pôle ECLA, Jun 2023, Aix-en-Provence, France
Communication dans un congrès
hal-04151024
v1
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Démonstration : une application web pour la collecte des images de diatomées tératologiques41ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2023, Besançon, France
Communication dans un congrès
hal-04331994
v1
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Développement d’une approche collaborative pour la collecte et l’analyse des images de diatomées d’eau douce : le cas des tératologies40ème colloque de l'Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2022, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès
hal-03791615
v1
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Suivis des restaurations hydromorphologiques en plans d'eau - Suivi des biotopes et des communautés végétales aquatiquesCLE COPIL N2000 Lacs médocains, Jun 2022, Lacanau, France
Communication dans un congrès
hal-03722744
v1
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Impact des altérations anthropiques de l’hydromorphologie des zones littorales lacustres sur les communautés d’isoétides5e Journées internationales de Limnologie et d’Océanographie (JILO), AFL, Oct 2022, Corte (Corse), France
Communication dans un congrès
hal-04013980
v1
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Species-area relationship of freshwater diatoms12th Symposium for European Freshwater Sciences, Jul 2021, Dublin, Ireland
Communication dans un congrès
hal-03331342
v1
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L’eau : un exemple de contribution scientifique alimentant la prise de décision et l’évaluation - Les communautés végétales aquatiquesLes grandes rencontres du Parc naturel régional Médoc, Oct 2021, Carcans, France
Communication dans un congrès
hal-04013933
v1
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La courbe aire-espèces des diatomées benthiques – comparaison entre les régions continentales et insulaires39ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2021, Aix-en-Provence, France
Communication dans un congrès
hal-03350972
v1
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Contamination polymétallique des Lacs AQuitains et impacts Humains (CLAQH)CLE COPIL Lacs Médocains, SIAEBVELG, Feb 2020, Carcans, France
Communication dans un congrès
hal-03052724
v1
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No-kill in restocking programs: Advances in non lethal detection of fluorochromes in marked juveniles, glass eel case study43ème Larval Fish Early Life History. American Fisheries Society, May 2019, Palma de Majorque, Spain
Communication dans un congrès
hal-02610184
v1
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Évaluation écologique des plans d'eau basés sur les communautés de diatomées benthiques38ème colloque de l'Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2019, Metz, France. pp.29-29
Communication dans un congrès
hal-02609843
v1
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Bioindication par les diatomées en DOM-COM : Bilan des productions ECOVEA et perspectivesVisite de Nicolas HETTE-TRONQUARD & Réunion de bilan-programmation AFB-Irstea Bordeaux-Equipe ECOVEA, Jun 2019, Cestas, France. pp.13
Communication dans un congrès
hal-02609636
v1
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Un nouvel indice diatomique multimétrique dédié à l'évaluation de l'état écologique des cours d'eau de Nouvelle-Calédonie37ème Colloque de l'ADLaF, Sep 2018, Meise, Belgique. pp.24-25
Communication dans un congrès
hal-02609487
v1
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Big data ou Big cleaning ? Problématiques autour de la gestion des données dans les réseaux de suivis aquatiques continentauxJILO Journées Internationales de Limnologie et d'Océanographie, Nov 2018, Strasbourg, France
Communication dans un congrès
hal-02610035
v1
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Drivers of Stream diatom beta-diversity from local to global scales1st International Conference on Community Ecology, Sep 2017, Budapest, Hungary. pp.44
Communication dans un congrès
hal-02606786
v1
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Drivers of Stream diatom beta-diversity from local to global scalesFunctional Ecology and Environment Conference, Jul 2017, Toulouse, France
Communication dans un congrès
hal-02606785
v1
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Shifts in beta-diversity déterminants from local to global scales: the case study of aquatic diatom communities10th Symposium for European Freshwater Science, Jul 2017, Olomuc, Czech Republic. pp.44
Communication dans un congrès
hal-02606784
v1
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L'Indice Biologique Macrophytique en Lac (IBML) ou comment évaluer l'état écologique des plans d'eau à l'aide des communautés de macrophytes aquatiques dans le contexte de la Directive Cadre sur l'Eau en FranceJournée technique Macrophytes Lacustres, Jun 2017, Bourget du Lac, France. pp.28
Communication dans un congrès
hal-02606557
v1
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Présentation de la démarche d'élaboration de l'Indice Diatomique Nouvelle-Calédonie (IDNC) à l'aide du programme TITAN36ème Colloque de l'ADLaF, Sep 2017, Dijon, France. pp.13
Communication dans un congrès
hal-02606897
v1
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Transfer and distribuion of diuron in biofilms and joint toxic effectsEcotoxicomic 2017 - First International Conference on Microbial Ecotoxicology, Nov 2017, Lyon, France. pp.43
Communication dans un congrès
hal-02606836
v1
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Bilan de campagne : Phytobenthos-Plans d'Eau36ème colloque de l'Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2017, Dijon, France. pp.23
Communication dans un congrès
hal-02606787
v1
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Is herbicide toxicity on micro-algae influenced by the natural Dissolved Organic Matter (DOM)?3èmes Journées d'Ecotoxicologie Microbienne, Mar 2016, Valence, France. pp.26
Communication dans un congrès
hal-02603372
v1
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Etat des connaissances sur les végétaux aquatiques des lacs médocainsSIAEBVELG, Mar 2016, Carcans, France. pp.23
Communication dans un congrès
hal-02603352
v1
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Indice Diatomique Antilles (IDA): a new diatom index dedicated to the rivers of the French West Indies9th Use of Algae for Monitoring Rivers and Comparable Habitats (UAMRiCH) & International Workshop on Benthic Algae Taxonomy (InBAT), Jun 2015, Trento, Italy. pp.56-56
Communication dans un congrès
hal-02601424
v1
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Ecology and distribution of Characeae communities in Lobelia lakes of South-West France20th Meeting of the Group of European Charophytologists (GEC), Jul 2015, Genève, Switzerland. pp.29
Communication dans un congrès
hal-02602159
v1
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Recherches en écologie végétale appliquées aux lacs du littoral aquitainRéunion avec la délégation chinoise de Wuhan (Laboratoire d'Hydrobiologie) et l'Agence de l'Eau Adour-Garonne, Jun 2015, Carcans, France. pp.57
Communication dans un congrès
hal-02602162
v1
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Effects of hydromorphological conditions on macrophytes in French shallow lakes14th International Symposium on Aquatic Plants, Sep 2015, Edinburgh, pp.16
Communication dans un congrès
hal-02602309
v1
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Les écosystèmes lacustres, dynamique naturelle au long cours et interactions avec les activités humainesSéminaire du Conseil scientifique du comité de bassin Adour-Garonne, Jun 2015, Toulouse, France. pp.17
Communication dans un congrès
hal-02602308
v1
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L’équipe CARMA et les pressions-impactsJournée d’échange QUASARE, Feb 2015, Villeurbanne, France. pp.20
Communication dans un congrès
hal-02605012
v1
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Indice diatomique pour les cours d'eau de la Réunion (IDR) : Production d'une nouvelle version (IDR-V5), résultats, modalités de mise en oeuvre dans le dispositif national d'évaluation des Masses d'Eau33ème Colloque de l'ADLAF, Oct 2014, Clermont-Ferrand, France. pp.18
Communication dans un congrès
hal-02600924
v1
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Assemblages et fonctionnement écologique des macrophytes des zones littorales des lacs du littoral aquitainEcoveg10, Mar 2014, Lyon, France. pp.19
Communication dans un congrès
hal-02601290
v1
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Phytobenthos des cours d’eau des Antilles : l’IDASéminaire ONEMA-DOM 2014 : « Les méthodes de bio-indication adaptées aux DOM : situation et perspectives dans le contexte du 2ème cycle DCE », Mar 2014, Paris, France. pp.13
Communication dans un congrès
hal-02600946
v1
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Méthodes phytobenthiques cours d’eau (Réunion et Antilles) : Cadre général et méthodologiqueSéminaire ONEMA-DOM 2014 : « Les méthodes de bio-indication adaptées aux DOM : situation et perspectives dans le contexte du 2ème cycle DCE », Mar 2014, Paris, France. pp.19
Communication dans un congrès
hal-02600944
v1
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Du développement au transfert : Indices diatomiques des Départements d'Outre-Mer33ème colloque de l'ADLAF, Oct 2014, Clermont-Ferrand, France. pp.19
Communication dans un congrès
hal-02600929
v1
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Approches biomathématiques pour la mise au point d'un indice diatomique adapté aux Antilles françaises, l'IDA, et pour l'évaluation écologique de leurs cours d'eau33ème Colloque de l'ADLAF, Oct 2014, Clermont-Ferrand, France. pp.24-24
Communication dans un congrès
hal-02600923
v1
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Phytobenthos des cours d’eau de la Réunion : l’Indice Diatomées Réunion (IDR)Séminaire ONEMA-DOM 2014 : « Les méthodes de bio-indication adaptées aux DOM : situation et perspectives dans le contexte du 2ème cycle DCE », Paris - Aquarium de la Porte Dorée, 20-21 Mars 2014, Mar 2014, Paris, France. pp.15
Communication dans un congrès
hal-02600945
v1
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Diatomées des eaux côtières de MartiniqueSéminaire ONEMA-DOM 2014 : « Les méthodes de bio-indication adaptées aux DOM : situation et perspectives dans le contexte du 2ème cycle DCE », Mar 2014, Paris, France. pp.13
Communication dans un congrès
hal-02600939
v1
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Phytobenthos des cours d’eau de Guyane : résultats préliminaires et perspectivesSéminaire ONEMA-DOM 2014 : « Les méthodes de bio-indication adaptées aux DOM : situation et perspectives dans le contexte du 2ème cycle DCE », Mar 2014, Paris, France. pp.15
Communication dans un congrès
hal-02600942
v1
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Recherches appliquées à la gestion : les macrophytes exotiques envahissants des lacs et étangs du littoral aquitainForum COTE 2014 - Vivre avec des invasions biologiques ?, Sep 2014, Bordeaux, France. pp.11
Communication dans un congrès
hal-02600213
v1
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Mise au point d’indices diatomiques pour les cours d’eau de la Réunion (IDR), des Antilles (IDA), de Guyane et de Mayotte : Bilan des actions 2008-2012, perspectives et suites à donnerSéminaire ONEMA-DOM, Mar 2013, Vincennes, France. pp.44
Communication dans un congrès
hal-02600937
v1
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Structure et organisation spatiale des communautés de macrophytes aquatiques des lacs du littoral AquitainMacrophytes !, May 2013, Pessac, France. pp.18
Communication dans un congrès
hal-02599127
v1
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Modifications apportées à l'IDR (de la V1 à la V5), application à l'atelier de réflexion sur l'élaboration de l'EDL pour le nouveau Plan de Gestion des Masses d'Eau à la RéunionAtelier REEE pour les cours d'eau de la Réunion, Aug 2013, Saint Denis de la Réunion, France. pp.23
Communication dans un congrès
hal-02601210
v1
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Communautés végétales aquatiques des lacs médocainsColloque ECOVEG 8 : Ecologie des Communautés Végétales, Mar 2012, Nancy, France. pp.24
Communication dans un congrès
hal-02598036
v1
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Flore diatomique des Antilles françaises : Présentation des principaux éléments taxonomiques justifiant et participant à la conception d’un indice diatomique des Antilles françaises31ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2012, Le Mans, France. pp.1
Communication dans un congrès
hal-02597583
v1
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Evaluation de l’état écologique des plans d’eau basée sur les communautés de plantes aquatiques dans le contexte de la Directive Cadre sur l’Eau en France : l’Indice Biologique Macrophytique en Lac (IBML)Journées Internationales de Limnologie et d’Océanographie (JILO), Oct 2012, Clermont-Ferrand, France. pp.18
Communication dans un congrès
hal-02598037
v1
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Les cartes auto-organisatrices de Kohonen appliquées à l'étude des communautés de micro-algues des cours d'eau1ères Rencontres R, Jul 2012, Bordeaux, France
Communication dans un congrès
hal-00717538
v1
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Mise au point d’un indice diatomique pour les cours d’eau de la Réunion (IDR) : Construction de la démarche biomathématique, résultats et perspectives31ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2012, Le Mans, France. pp.22
Communication dans un congrès
hal-02597581
v1
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Approche biomathématique pour la mise au point d’un indice diatomique adapté aux Antilles françaises31ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2012, Le Mans, France. pp.23
Communication dans un congrès
hal-02597580
v1
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Indice Diatomique Réunion (IDR): a new river diatom index dedicated to a specific ultramarine and tropical biogeographical contextUse of Algae for Monitoring Rivers, Jun 2012, Madrid, Spain. pp.1
Communication dans un congrès
hal-02597586
v1
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Mise au point d'un indice diatomique adapté aux Antilles Françaises : aspects taxonomiques et écologiques31ème Colloque de l’Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2012, Le Mans, France. pp.2
Communication dans un congrès
hal-02597582
v1
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Les cartes auto-organisantes de Kohonen appliquées à l’étude des communautés de micro-algues des cours d’eau1 ères Rencontres R, Jul 2012, Bordeaux, France. pp.43
Communication dans un congrès
hal-02597653
v1
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Quelques diatomées des cours d'eau de l'île de la Réunion : aspects floristiques et autoécologie30ème Colloque de l'ADLaF (Association des Diatomistes de Langue Française), Sep 2011, Boulogne sur mer, France. pp.1
Communication dans un congrès
hal-02595783
v1
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Analyse de données hydroécologiques sur les flores diatomiques des cours d'eau de Guyane, applications en bio-indication30ème Colloque de l'ADLaF (Association des Diatomistes de langue Française), Sep 2011, Boulogne-sur-Mer, France. pp.19
Communication dans un congrès
hal-02595762
v1
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Mise en ½uvre de la bio-indication diatomique en cours d'eau avec l'IBD 2007 : pratique actuelle, questionnements, pistes d'améliorationSéminaire Cemagref "Méthodes de Bio-indication", Sep 2010, Lyon, France. pp.38
Communication dans un congrès
hal-02595816
v1
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Bioindication de l'état écologique des cours d'eau et des plans d'eau : les outils basés sur le phytobenthos (diatomées)Séminaire évaluation dans le contexte de la DCE, Apr 2011, Paris, France. pp.17
Communication dans un congrès
hal-02595262
v1
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Mise au point d'un indice diatomique pour les cours d'eau de la Réunion : présentation de la démarche biomathématique d'élaboration de l'indice30ème Colloque de l'ADLaF (Association des Diatomistes de Langue Française), Sep 2011, Boulogne-sur-Mer, France. pp.2
Communication dans un congrès
hal-02595761
v1
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Approche floristique des diatomées des eaux courantes de Guyane française, premiers résultats et perspectives d'évaluation du bon état écologique29° colloque de l'Association des Diatomistes de Langue Française (ADLaF), Sep 2010, Québec, Canada. pp.32
Communication dans un congrès
hal-02594402
v1
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Application de la DCE en France métropolitaine à l'aide de l'IBD : pistes méthodologiques pour le développement d'indices diatomiques DOMBio-indication des écosystèmes aquatiques d'eau douce en milieux tropicaux, Dec 2010, Fort de France, France. pp.1
Communication dans un congrès
hal-02594406
v1
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Trois nouvelles espèces de diatomées des cours d'eau de l'Ile de la RéunionBio-indication des écosystèmes aquatiques d'eau douce en milieux tropicaux, Dec 2010, Fort de France, France. pp.1
Communication dans un congrès
hal-02594410
v1
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Evaluation de la qualité écologique des plans d'eau basée sur les communautés de macrophytes : développement et premières applications de la méthode standardisée d'échantillonnage dans le contexte de la Directive Cadre Européenne sur l'Eau (DCE) en FranceColloque ECOVEG 6, Ecologie des Communautés Végétales, Mar 2010, Rouen, pp.24
Communication dans un congrès
hal-02594177
v1
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Développement et premières applications de la méthode standardisée d'échantillonnage des communautés de macrophytes en plan d'eau dans le contexte de la Directive Cadre Européenne sur l'Eau (DCE) en France. Application au plan d'eau de Miribel-Jonage (Eaux Bleues, Rhône)Journées Internationales de Limnologie 2010, Oct 2010, Thonon les Bains, France. pp.20
Communication dans un congrès
hal-02593562
v1
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Evaluation de la qualité écologique des plans d'eau basée sur les communautés de macrophytesSéminaire évaluation dans le contexte de la DCE, Apr 2011, Paris, pp.18
Communication dans un congrès
hal-02595779
v1
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Présentation de l'IBD 2006, de ses performances comparées avec l'IBD normalisé AFNOR 2000 et avec l'IPS, perspectives26ème Colloque de l'ADLaF, Aveiro, PRT, 5-8 Sept. 2007, 2007, pp.1
Communication dans un congrès
hal-02589813
v1
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Phytoplankton and macrophytes in two connected lakes with different trophic status in the Aquitaine region (France)30th Congress of the International Association of Theoretical and Applied Limnology, Montreal, CAN, 12-18 August 2007, 2007, pp.1
Communication dans un congrès
hal-02589856
v1
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Modulation de la toxicité des métaux lourds vis-à-vis des biofilms de cours d'eau3ème Colloque d'Ecologie des Communautés Végétales (ECOVEG), Mar 2007, Talence, France. pp.17
Communication dans un congrès
hal-02589795
v1
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C16 : Etude des relations entre les niveaux de nutriments et les flores diatomiques en rivières, et utilisation des résultats en appui à la mise en application de la Directive Cadre sur l'eau (DCE)25ème Colloque de l'ADLAF, Sep 2006, Caen, France. pp.55-55
Communication dans un congrès
hal-02610337
v1
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C9 : Le point sur les tentatives d'amélioration apportées à l'I.B.D - Etat d'avancement et perspectives25ème Colloque de l'ADLAF, Sep 2020, Caen, France. pp.39-39
Communication dans un congrès
hal-02610336
v1
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Use of auto-ecological characteristics of diatoms taxa to assess the level of man-made trophic enrichment throughout European ecoregions and river types6th International Symposium on Use of Algae for Monitoring Rivers, Sep 2006, Balatonfüred, Hungary. pp.29
Communication dans un congrès
hal-02610335
v1
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Application de méthodes statistiques pour la mise en oeuvre d'une nouvelle version de l'Indice Biologique DiatoméesSciences de l'environnement. 2006
Mémoire d'étudiant
hal-02594416
v1
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