Accéder directement au contenu

Sébastien Hergalant

74%
Libre accès
54
Documents
Affiliations actuelles
  • 409232
  • 303623
  • 413289
Identifiants chercheurs

Compétences

Bioinformatique Cancer Biologie des systèmes Biostatistiques Multi-omiques (Epi)Génétique (Epi)Génomique Cancers cérébraux Lymphomes Maladies métaboliques Obésité Clusters de calcul Ingénierie système Plateforme de bioinformatique

Publications

ZNF683 marks a CD8+ T cell population associated with anti-tumor immunity following anti-PD-1 therapy for Richter syndrome

Erin Parry , Camilla Lemvigh , Stephanie Deng , Nathan Dangle , Neil Ruthen
Cancer Cell, 2023, 41 (10), pp.1803-1816.e8. ⟨10.1016/j.ccell.2023.08.013⟩
Article dans une revue hal-04253414v1
Image document

Molecular characterization of Richter syndrome identifies de novo diffuse large B-cell lymphomas with poor prognosis

Julien Broséus , Sébastien Hergalant , Julia Vogt , Eugen Tausch , Markus Kreuz
Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.309. ⟨10.1038/s41467-022-34642-6⟩
Article dans une revue hal-03950368v1

Somatic and Germline HLA Determinants of Immune Surveillance and Escape in Myelodysplastic Syndromes

Carmelo Gurnari , Arda Durmaz , Benjamin Kroger , Hussein Awada , Jacky Chen
Blood, 2023, 142 (Supplement 1), pp.3220. ⟨10.1182/blood-2023-178890⟩
Article dans une revue hal-04320855v1
Image document

MicroRNAs miR-16 and miR-519 control meningioma cell proliferation via overlapping transcriptomic programs shared with the RNA-binding protein HuR

Sébastien Hergalant , Jean-Matthieu Casse , Abderrahim Oussalah , Rémi Houlgatte , Deborah Helle
Frontiers in Oncology, 2023, 13, pp.1158773. ⟨10.3389/fonc.2023.1158773⟩
Article dans une revue hal-04176105v1

Molecular landscape of immune pressure and escape in aplastic anemia

Simona Pagliuca , Carmelo Gurnari , Colin Hercus , Sébastien Hergalant , Niroshan Nadarajah
Leukemia, 2023, 37 (1), pp.202-211. ⟨10.1038/s41375-022-01723-w⟩
Article dans une revue hal-03950335v1

In vivo modeling of CLL transformation to Richter’s syndrome reveals convergent evolutionary paths and therapeutic vulnerabilities

Elisa ten Hacken , Tomasz Sewastianik , Shanye Yin , Gabriela Brunsting Hoffmann , Michaela Gruber
Blood Cancer Discovery, 2023, 4 (2), pp.150-169. ⟨10.1158/2643-3230.BCD-22-0082⟩
Article dans une revue hal-03950340v1
Image document

A high MCM6 proliferative index in atypical meningioma is associated with shorter progression free and overall survivals

Guillaume Gauchotte , Charles Bédel , Emilie Lardenois , Sébastien Hergalant , Laura Cuglietta
Cancers, 2023, 15 (2), pp.535. ⟨10.3390/cancers15020535⟩
Article dans une revue hal-03950329v1

Evolutionary history of transformation from chronic lymphocytic leukemia to Richter syndrome

Erin Parry , Ignaty Leshchiner , Romain Guièze , Connor Johnson , Eugen Tausch
Nature Medicine, 2023, 29 (1), pp.158-169. ⟨10.1038/s41591-022-02113-6⟩
Article dans une revue hal-03950358v1
Image document

Leukemia relapse via genetic immune escape after allogeneic hematopoietic cell transplantation

Simona Pagliuca , Carmelo Gurnari , Colin Hercus , Sébastien Hergalant , Sanghee Hong
Nature Communications, 2023, 14 (1), pp.3153. ⟨10.1038/s41467-023-38113-4⟩
Article dans une revue hal-04162108v1
Image document

Correlation between DNA Methylation and cell proliferation identifies new candidate predictive markers in meningioma

Sébastien Hergalant , Chloé Saurel , Marion Divoux , Fabien Rech , Celso Pouget
Cancers, 2022, 14 (24), pp.6227. ⟨10.3390/cancers14246227⟩
Article dans une revue hal-03939191v1

ZNF683 (Hobit) Marks a CD8+ T Cell Population Associated with Anti-Tumor Immunity Following Anti-PD-1 Therapy for Richter Syndrome

Camilla Lemvigh , Erin Michelle Parry , Stephanie Deng , Nathan Dangle , Neil Ruthen
Blood, 2022, 140 (Supplement 1), pp.1807-1808. ⟨10.1182/blood-2022-162550⟩
Article dans une revue hal-03950370v1
Image document

Epimutations in both the TESK2 and MMACHC promoters in the Epi-cblC inherited disorder of intracellular metabolism of vitamin B12

Abderrahim Oussalah , Youssef Siblini , Sébastien Hergalant , Céline Chéry , Pierre Rouyer
Clinical Epigenetics, 2022, 14 (1), pp.52. ⟨10.1186/s13148-022-01271-1⟩
Article dans une revue hal-03664165v1
Image document

ALDH1L2 Knockout in U251 Glioblastoma Cells Reduces Tumor Sphere Formation by Increasing Oxidative Stress and Suppressing Methionine Dependency

Maëlle Quéré , Jean-Marc Alberto , Franck Broly , Sébastien Hergalant , Christo Christov
Nutrients, 2022, 14 (9), pp.1887. ⟨10.3390/nu14091887⟩
Article dans une revue hal-03664166v1

Fetal Programming by Methyl Donor Deficiency Produces Pathological Remodeling of the Ascending Aorta

Brittany Balint , Sébastien Hergalant , Jean-Michel Camadro , Sébastien Blaise , Laetitia Vanalderwiert
Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology, 2021, 41 (6), pp.1928-1941. ⟨10.1161/atvbaha.120.315587⟩
Article dans une revue hal-03238712v1

Facteurs pronostiques clinico-biologiques et génomiques de la survie dans le syndrome de Richter

C. Moulin , F. Guillemin , T. Remen , F. Bouclet , H. Augé
Epidemiology and Public Health = Revue d'Epidémiologie et de Santé Publique, 2021, 69 (1), pp.52. ⟨10.1016/j.respe.2020.11.010⟩
Article dans une revue hal-03238804v1
Image document

Long-Term Overconsumption of Fat and Sugar Causes a Partially Reversible Pre-inflammatory Bowel Disease State

Djésia Arnone , Marie Vallier , Sébastien Hergalant , Caroline Chabot , Ndeye Coumba Ndiaye
Frontiers in Nutrition, 2021, 8, pp.758518. ⟨10.3389/fnut.2021.758518⟩
Article dans une revue hal-03430881v1

Low-frequency coding variants associated with body-mass-index impact the success of bariatric surgery

Darlène Antoine , Rosa-Maria Guéant-Rodriguez , Jean-Claude Chèvre , Sébastien Hergalant , Tanmay Sharma
Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism, 2021, pp.dgab774. ⟨10.1210/clinem/dgab774⟩
Article dans une revue hal-03411898v1
Image document

Ionizing radiations induce shared epigenomic signatures unraveling adaptive mechanisms of cancerous cell lines with or without methionine dependency

Youssef Siblini , Céline Chéry , Pierre Rouyer , Jérémie Raso , Amélia Julien
Clinical Epigenetics, 2021, 13 (1), pp.212. ⟨10.1186/s13148-021-01199-y⟩
Article dans une revue hal-03465924v1

Vitamin B 12 Deficiency Dysregulates m6A mRNA Methylation of Genes Involved in Neurological Functions

Pauline Mosca , Aurélie Robert , Jean‐marc Alberto , Marie Meyer , Urbi Kundu
Molecular Nutrition and Food Research, 2021, 65 (17), pp.2100206. ⟨10.1002/mnfr.202100206⟩
Article dans une revue hal-03300551v1
Image document

Clinical, biological, and molecular genetic features of Richter syndrome and prognostic significance: a study of the French Innovative Leukemia Organization

Charline Moulin , Francis Guillemin , Thomas Remen , Florian Bouclet , Sébastien Hergalant
American Journal of Hematology, 2021, 96 (9), pp.E311-E314. ⟨10.1002/ajh.26239⟩
Article dans une revue hal-03238759v1
Image document

First identification of dopamine receptors in pikeperch, Sander lucioperca, during the pre-ovulatory period

Jennifer Roche , Sébastien Hergalant , Amandine Depp , Imen Ben Ammar , Anne-Gaelle Lafont
Comparative Biochemistry and Physiology - Part D: Genomics and Proteomics, 2020, 36, pp.100747. ⟨10.1016/j.cbd.2020.100747⟩
Article dans une revue hal-02975537v1
Image document

Microenvironment Remodeling and Subsequent Clinical Implications in Diffuse Large B-Cell Histologic Variant of Richter Syndrome

Hélène Augé , Anne-Béatrice Notarantonio , Romain Morizot , Anne Quinquenel , Luc-Matthieu Fornecker
Frontiers in Immunology, 2020, 11, pp.594841. ⟨10.3389/fimmu.2020.594841⟩
Article dans une revue hal-03087137v1
Image document

Analysis of fibroblasts from patients with cblC and cblG genetic defects of cobalamin metabolism reveals global dysregulation of alternative splicing

Charif Rashka , Sébastien Hergalant , Natacha Dreumont , Abderrahim Oussalah , Jean-Michel Camadro
Human Molecular Genetics, 2020, 29 (12), pp.1969-1985. ⟨10.1093/hmg/ddaa027⟩
Article dans une revue hal-03100129v1

Clinico-Biological, Molecular and Prognostic Features of Patients with Diffuse Large B-Cell Lymphoma-Variant of Richter Syndrome: A Multicenter Retrospective Study of the French Innovative Leukemia Organization

Charline Moulin , Francis Guillemin , Thomas Rémen , Florian Bouclet , Hélène Augé
Blood, 2020, 136 (Suppl 1), pp.3-5. ⟨10.1182/blood-2020-137101⟩
Article dans une revue hal-03054135v1
Image document

Ki‐67 and MCM6 labelling indices are correlated with overall survival in anaplastic oligodendroglioma, IDH1 ‐mutant and 1p/19q‐codeleted: a multicenter study from the French POLA network

Celso Pouget , Sébastien Hergalant , Emilie Lardenois , Stéphanie Lacomme , Rémi Houlgatte
Brain Pathology, 2020, 30 (3), pp.465-478. ⟨10.1111/bpa.12788⟩
Article dans une revue hal-02299833v1

Large-Scale Proteomics Identifies Distinct Signatures for Richter Syndrome and De Novo Diffuse Large B-Cell Lymphoma: A French Study from the Filo Group

Romain Morizot , Sébastien Hergalant , Romain Piucco , Florian Bouclet , Anne Quinquenel
Blood, 2020, 136 (Supplement 1), pp.29-30. ⟨10.1182/blood-2020-137061⟩
Article dans une revue hal-03054165v1
Image document

Mobilized Multipotent Hematopoietic Progenitors Stabilize and Expand Regulatory T Cells to Protect Against Autoimmune Encephalomyelitis

Sarantis Korniotis , Maud d'Aveni , Sébastien Hergalant , Hélène Letscher , Emmanuel Tejerina
Frontiers in Immunology, 2020, 11, pp.607175. ⟨10.3389/fimmu.2020.607175⟩
Article dans une revue hal-03087148v1
Image document

Folate can promote the methionine-dependent reprogramming of glioblastoma cells towards pluripotency

Racha Zgheib , Shyue-Fang Battaglia-Hsu , Sébastien Hergalant , Maelle Quéré , Jean-Marc Alberto
Cell Death and Disease, 2019, 10 (8), pp.596. ⟨10.1038/s41419-019-1836-2⟩
Article dans une revue hal-02265213v1

Wnt Signaling Pathways Are Dysregulated in Rat Female Cerebellum Following Early Methyl Donor Deficiency

Jérèmy Willekens , Sébastien Hergalant , Grégory Pourié , Fabian Marin , Jean-Marc Alberto
Molecular Neurobiology, 2019, 56 (2), pp.892-906. ⟨10.1007/s12035-018-1128-3⟩
Article dans une revue hal-01804097v1
Image document

Inherited disorders of cobalamin metabolism disrupt nucleocytoplasmic transport of mRNA through impaired methylation/phosphorylation of ELAVL1/HuR

Shyue-Fang Battaglia-Hsu , Rose Ghemrawi , David Coelho , Natacha Dreumont , Pauline Mosca
Nucleic Acids Research, 2018, 46 (15), pp.7844-7857. ⟨10.1093/nar/gky634⟩
Article dans une revue hal-01844820v1

Cytoplasmic overexpression of RNA-binding protein HuR is a marker of poor prognosis in meningioma, and HuR knockdown decreases meningioma cell growth and resistance to hypoxia

Guillaume Gauchotte , Sébastien Hergalant , Charlène Vigouroux , Matthieu Casse , Rémi Houlgatte
The Journal of pathology and bacteriology, 2017, 242 (4), pp.421 - 434. ⟨10.1002/path.4916⟩
Article dans une revue hal-01718786v1
Image document

Relapsed diffuse large B-cell lymphoma present different genomic profiles between early and late relapses

Julien Broséus , Gaili Chen , Sébastien Hergalant , Gérard Ramstein , Nicolas Mounier
Oncotarget, 2016, 7 (51), pp.83987-84002. ⟨10.18632/oncotarget.9793⟩
Article dans une revue hal-02314515v1

Identification of master genes involved in liver key functions through transcriptomics and epigenomics of methyl donor deficiency in rat: Relevance to nonalcoholic liver disease

Gaili Chen , Julien Broséus , Sébastien Hergalant , Audrey Donnart , Catherine Chevalier
Molecular Nutrition and Food Research, 2015, 59 (2), pp.293 - 302. ⟨10.1002/mnfr.201400483⟩
Article dans une revue hal-01755906v1
Image document

A new data mining approach for the detection of bacterial promoters combining stochastic and combinatorial methods

Catherine Eng , Charu Asthana , Bertrand Aigle , Sébastien Hergalant , Jean-Francois Mari
Journal of Computational Biology, 2009, 16 (9), pp.1211-1225. ⟨10.1089/cmb.2008.0122⟩
Article dans une revue inria-00419969v1
Image document

Multi-omics characterization of Richter syndrome unlocks classifiers and predictors of outcome into broader and heterogeneous lymphoma datasets

Sébastien Hergalant , Romain Piucco , Ghislain Fiévet , Emil Chteinberg , Stephan Stilgenbauer
JOBIM2023, Jun 2023, Plouzané (Brest), France
Communication dans un congrès hal-04147573v1

Description d'une nouvelle signature immunitaire dans le contexte de la rechute après allogreffe de Cellules Souches Hématopoïétiques

Anne-Béatrice Notarantonio , Romain Piucco , Sébastien Hergalant , Laura Boulangé , Jordan Brouard
6ème Journée de la French Innovative Leukemia Organization, Oct 2020, Nancy, France
Communication dans un congrès hal-02976925v1

Caractérisation du profil protéomique du Syndrome de Richter

Romain Piucco , Romain Morizot , Luc-Matthieu Fornecker , Pierre Feugier , Sébastien Hergalant
6e journées de la French Innovative Leukemia Organization, Oct 2020, Nancy, France
Communication dans un congrès hal-03176937v1

Etude du méthylome et du transcriptome dans le Syndrome de Richter

Sébastien Hergalant , Julien Broséus
6e journées du FILO, Oct 2020, Nancy, France
Communication dans un congrès hal-03177006v1

Ki-67 and MCM6 labelling index are correlated with overall survival in anaplastic oligodendroglioma, IDH1-mutant and 1p/19q codeleted: a multicenter study from the French POLA Network

Celso Pouget , Sébastien Hergalant , Emilie Lardenois , Shyue-Fang Battaglia-Hsu , Rémi Houlgatte
31 st European Congress of Pathology, Sep 2019, Nice, France. pp.1-436, ⟨10.1007/s00428-019-02631-8⟩
Communication dans un congrès hal-03012220v1
Image document

Data Mining Using Hidden Markov Models (HMM2) to Detect Heterogeneities into Bacteria Genomes

Catherine Eng , Annabelle Thibessard , Sébastien Hergalant , Jean-François Mari , Pierre Leblond
Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques - JOBIM 2005, JOBIM, Jul 2005, Lyon/France, France
Communication dans un congrès inria-00000142v1
Image document

Fouille de données du génome à l'aide de modèles de Markov cachés

Sébastien Hergalant , Bertrand Aigle , Pierre Leblond , Jean-François Mari
Extraction et Gestion de Connaissances - EGC 2005, Jan 2005, Paris/France, France. pp.141 -- 148
Communication dans un congrès inria-00001213v1
Image document

Classification non supervisée par HMM de sites de fixation de facteurs de transcription chez les bactéries

Sébastien Hergalant , Bertrand Aigle , Bernard Decaris , Jean-François Mari , Pierre Leblond
5èmes Journées Ouvertes : Biologie, Informatique et Mathématiques - JOBIM'04, 2004, Montréal, Canada, 1 p
Communication dans un congrès inria-00107788v1

HMM, an Efficient Way to Detect Transcriptional Promoters in Bacterial Genomes?

Sébastien Hergalant , Bertrand Aigle , Bernard Decaris , Jean-François Mari , Pierre Leblond
European Conference on Computational Biology - ECCB'2003, Sep 2003, Paris, France, pp.417--419
Communication dans un congrès inria-00099570v1

Fouille de données à l'aide de HMM : Application à la détection de réitérations intragénomiques

Sébastien Hergalant , Bertrand Aigle , Bernard Decaris , Pierre Leblond , Jean-François Mari
Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques - JOBIM'02, François Coste - Elisabeth Lebret, 2002, Saint Malo, France, pp.269-273
Communication dans un congrès inria-00100752v1

Intragenomic reiterations detection using hidden Markov models

Sébastien Hergalant , Bertrand Aigle , Bernard Decaris , Pierre Leblond , Jean-François Mari
10th International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology - ISMB 2002, Aug 2002, Edmonton, Canada, 1 p
Communication dans un congrès inria-00100914v1
Image document

Fouille de données du génome à l'aide de modèles de Markov cachés

Sébastien Hergalant , Bertrand Aigle , Pierre Leblond , Jean-François Mari
Extraction et gestion des connaissances. EGC 2005, Cépaduès, 2005, Revue des Nouvelles Technologies de l'Information, 2-85428-677-4 2-85428-682-0 (vol. 1) 2-85428-683-9 (vol. 2)
Chapitre d'ouvrage hal-02832934v1