Severine Martini

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Présentation

Chargée de recherche au CNRS à l'Institut Méditerranéen d'Océanologie (MIO, CNRS/AMU/IRD/UTLN), situé sur le campus de Luminy (Aix-Marseille Université) au sein de l'OSU PYTHEAS.

Intérêts scientifiques :

  • Comprendre les rôles de la bioluminescence (bactérienne et eucaryotique) et son impact dans la pompe biologique du carbone.
  • Comprendre l’influence de la bioluminescence sur l’atténuation des flux de carbone particulaire
  • Décrire la diversité des organismes bioluminescents (de l'océan pélagique au milieu benthique), afin d'utiliser la mesure de cette capacité comme proxy des communautés du milieu obscur (des bactéries aux eucaryotes).
  • Comprendre l'impact de la bioluminescence dans les réseaux trophiques mésopélagiques

Instrumentation :

  • Adapter et développer l'instrumentation nécessaire (et jusqu'alors inexistante en océanographie) au suivi des communautés et à leurs caractéristiques fonctionnelles (bioluminescence).
  • Techniques: Véhicules Opérés à Distance (ROVs), observatoires câblés, plongées en bouteilles (scientifique), échantillonnages Niskin, CTD, expérimentations en laboratoire​
  • ​Méthodes statistiques: Programmation (R-studio), analyse du signal, analyse de séries temporelles, modèles logistiques, analyses multivariées, statistiques, visualisation dynamique de données.

Activités d'enseignement

  • Cours “Dynamic of marine ecosystems”, École Nationale Supérieure de Techniques Avancées – ENSTA ParisTech, France
  • Cours de Master “Oceanography and Marine Environments”, Sorbonne Université, France
  • Cours “Continental Ecosystems and Environmental risks”, CEREGE-Aix, France
  • Cours “Programmation pour les sciences de l'environnement”, “Ecologie théorique”, “Microbiologie”, Aix-Marseille Université, France

Missions océanographiques et plongées scientifiques

(63 jours en mer, une mission en temps que chef scientifique (plongée ROV, MBARI 2017)

  • N/O L’Europe, Mediterranean Sea, HROV dives
  • N/O L’Atalante, North western mediterranean Sea Nautile submarine dive (1 submarine cruise) .
  • N/O L’AntedonII, Marseille Bay, Plankton nets (MultiNet, WP2, CTD)
  • N/O L’AntedonII, Marseille Bay, Plankton nets (WP2)
  • R/V Western Flyer, Monterey Bay, Pacific Ocean (ROV dives, sampling, scientific SCUBA diving)
  • R/V Ka’imikai-O-Kanaloa, Hawaii (ROV dives, sampling, scientific SCUBA diving)
  • R/V Rachel Carson, Monterey Bay, Pacific Ocean (led as chief scientist, ROV dive, managing 5 scientists and engineers on board, sampling, collection), ROV dives and sampling
  • R/V Antedon-II, MOOSE program, Mediterranean Sea (Biogeochemical samplings (CTD-rosette))
  • R/V Téthys II, EUROSITES mission, Mediterranean Sea (Biogeochemical samplings (CTD-rosette), moorings deployments)

Financements et projets

  • 2020 Axes transverses - MIO - BICYCLEt project (PI: S. Martini)
  • 2020-2021 Mission Initiatives LUMIN&SENS project (PI: S. Martini)
  • 2019 GDR Ecology - Statistics - project "Classification of bioluminescence spectra recorded by elephant seal in the dark ocean: links with environmental variables and predator-preys relationships" - S. Martini (LOV - Centre d’Etudes Biologiques de Chizé)
  • 2017 DEFI-instrumentation aux limites CNRS - project CENSOR - equipment of elephant seal for bioluminescence detection PIs: S. Martini LOV/C. Tamburini MIO
  • 2016 Travel grant for the OBIS-INDEEP workshop
  • 2015-2017 "Light-on-MARS" project (MBARI internal fundings) PI: S. Martini
  • 2015-2017 MBARI postdoc fellowship
  • 2015 Award from the Bettencourt-Schueller foundation for past research and postdoctoral "DeepLUCY" project at MBARI on bioluminescence study at the deep-sea MARS observatory
  • 2015 DEFI-instrumentation aux limites CNRS - project DEEP-BLUE - PI: R. Barbier Institut de Physique Nucleaire de Lyon - In2P3

Publications

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Publications

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Machine learning techniques to characterize functional traits of plankton from image data

Eric C. Orenstein , Sakina-Dorothée Ayata , Frédéric Maps , Érica C. Becker , Fabio Benedetti et al.
Limnology and Oceanography, 2022, 67 (8), pp.1647-1669. ⟨10.1002/lno.12101⟩
Article dans une revue hal-03482282 v2
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Integrating Diel Vertical Migrations of Bioluminescent Deep Scattering Layers Into Monitoring Programs

Damianos Chatzievangelou , Nixon Bahamon , Séverine Martini , Joaquin del Rio , Giorgio Riccobene et al.
Frontiers in Marine Science, 2021, 8, pp.661809. ⟨10.3389/fmars.2021.661809⟩
Article dans une revue hal-03256342 v1
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Macroscale patterns of oceanic zooplankton composition and size structure

Manoela Brandão , Fabio Benedetti , Séverine Martini , Yawouvi Dodji Soviadan , Jean-Olivier Irisson et al.
Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.15714. ⟨10.1038/s41598-021-94615-5⟩
Article dans une revue hal-03318806 v1
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Functional trait-based approaches as a common framework for aquatic ecologists

Severine Martini , Floriane Larras , Aurélien Boyé , Emile Faure , Nicole Aberle et al.
Limnology and Oceanography, 2021, 66 (3), pp.965-994. ⟨10.1002/lno.11655⟩
Article dans une revue hal-02996072 v1
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Bioluminescence in an Undescribed Species of Carnivorous Sponge (Cladorhizidae) From the Deep Sea

Severine Martini , Darrin T Schultz , Lonny Lundsten , Steven H D Haddock
Frontiers in Marine Science, 2020, 7, ⟨10.3389/fmars.2020.576476⟩
Article dans une revue hal-03040193 v1
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Reviews and syntheses: Bacterial bioluminescence – ecology and impact in the biological carbon pump

Lisa Tanet , Severine Martini , Laurie Casalot , Christian Tamburini
Biogeosciences, 2020, 17 (14), pp.3757-3778. ⟨10.5194/bg-17-3757-2020⟩
Article dans une revue hal-02901948 v1
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The Dark Ocean Is Full of Lights

Séverine Martini , Warren R Francis
Frontiers for Young Minds, 2020, 8, ⟨10.3389/frym.2020.00069⟩
Article dans une revue hal-02991421 v1
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Distribution and quantification of bioluminescence as an ecological trait in the deep sea benthos

Severine Martini , Linda Kuhnz , Jérôme Mallefet , Steven H D Haddock
Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-50961-z⟩
Article dans une revue hal-02344802 v1
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Global Trends in Marine Plankton Diversity across Kingdoms of Life

Federico Ibarbalz , Nicolas Henry , Manoela Brandão , Severine Martini , Greta Busseni et al.
Cell, 2019, 179 (5), pp.1084-1097.e21. ⟨10.1016/j.cell.2019.10.008⟩
Article dans une revue hal-03094778 v1
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Pressure-Retaining Sampler and High-Pressure Systems to Study Deep-Sea Microbes Under in situ Conditions

Marc Garel , Patricia Bonin , Severine Martini , Sophie Guasco , Marie Roumagnac et al.
Frontiers in Microbiology, 2019, 10, pp.453. ⟨10.3389/fmicb.2019.00453⟩
Article dans une revue hal-02094373 v1
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Using fluorescence and bioluminescence sensors to characterize auto- and heterotrophic plankton communities

Monique Messié , Igor Shulman , Severine Martini , Steven H.D. Haddock
Progress in Oceanography, 2019, 171, pp.76-92. ⟨10.1016/j.pocean.2018.12.010⟩
Article dans une revue hal-01968126 v1
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Insights into the Biodiversity, Behavior, and Bioluminescence of Deep-Sea Organisms Using Molecular and Maritime Technology

Steven Haddock , Lynne Christianson , Warren Francis , Severine Martini , Casey Dunn et al.
Oceanography, 2018, 30 (4), pp.38-47. ⟨10.5670/oceanog.2017.422⟩
Article dans une revue hal-02071200 v1
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Quantification of bioluminescence from the surface to the deep sea demonstrates its predominance as an ecological trait

Severine Martini , Steven H D Haddock
Scientific Reports, 2017, 7, ⟨10.1038/srep45750⟩
Article dans une revue hal-03053928 v1

Bacteria as part of bioluminescence emission at the deep ANTARES station (North-Western Mediterranean Sea) during a one-year survey

Severine Martini , Valerie Michotey , Laurie Casalot , Patricia Bonin , Sophie Guasco et al.
Deep Sea Research, 2016, 116, pp.33-40. ⟨10.1016/j.dsr.2016.07.014⟩
Article dans une revue hal-01408722 v1

Genomic and physiological analysis reveals versatile metabolic capacity of deep-sea Photobacterium phosphoreum ANT-2200.

Sheng-Da Zhang , Claire-Lise Santini , Wei-Jia Zhang , Valérie Barbe , Sophie Mangenot et al.
Extremophiles life under extreme conditions, 2016, 20 (3), pp.301-10. ⟨10.1007/s00792-016-0822-1⟩
Article dans une revue hal-01410136 v1

High-frequency internal wave motions at the ANTARES site in the deep Western Mediterranean

H. van Haren , S. Adrián-Martínez , Imen Al Samarai , A. Albert , M. André et al.
Ocean Dynamics, 2014, 64, pp.507-517. ⟨10.1007/s10236-014-0702-0⟩
Article dans une revue in2p3-00988069 v1
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Relation between deep bioluminescence and oceanographic variables: A statistical analysis using time–frequency decompositions

S. Martini , David Nerini , Christian Tamburini
Progress in Oceanography, 2014, 127, pp.117-128. ⟨10.1016/j.pocean.2014.07.003⟩
Article dans une revue hal-01076992 v1

Genome Sequence of Luminous Piezophile Photobacterium phosphoreum ANT-2200

S.-D. Zhang , Valérie Barbe , M. Garel , W.-J. Zhang , H. Chen et al.
Genome Announcements, 2014, 2 (2), ⟨10.1128/genomeA.00096-14⟩
Article dans une revue hal-02463133 v1
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Effects of Hydrostatic Pressure on Growth and Luminescence of a Moderately-Piezophilic Luminous Bacteria Photobacterium phosphoreum ANT-2200

Severine Martini , Badr Al Ali , Marc Garel , David Nerini , Vincent Grossi et al.
PLoS ONE, 2013, 8 (6), pp.e66580. ⟨10.1371/journal.pone.0066580⟩
Article dans une revue hal-01988033 v1
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Deep-Sea Bioluminescence Blooms after Dense Water Formation at the Ocean Surface

Christian Tamburini , Miquel Canals , Xavier Durrieu de Madron , Loïc Houpert , Dominique Lefèvre et al.
PLoS ONE, 2013, 8 (7), pp.e67523. ⟨10.1371/JOURNAL.PONE.0067523⟩
Article dans une revue hal-01012135 v1

How to analyse bioluminescence time series from in situ observatories? Example from high frequency records and real time data at the ANTARES site

Severine Martini , David Nerini , Christian Tamburini
Luminescence, 2012, 27 (2), pp.139-140
Article dans une revue hal-00741759 v1
Image document

Glider, ship and satellite measurements of marine bioluminescence in the Mediterranean Sea: the BIOLUMOPS project

Frédéric Jourdin , Séverine Martini
EGU General Assembly 2024, Apr 2024, Vienna & Online, Austria. ⟨10.5194/egusphere-egu24-8144⟩
Communication dans un congrès hal-04799118 v1

L’interdisciplinarité dans le projet ABYSSES

Sophie Gambardella , Martini Séverinne
Les Sciences humaines et sociales et l’interdisciplinarité, INSHS, Oct 2024, Paris, France
Communication dans un congrès halshs-04849166 v1

Functional trait-based approaches as a common framework for aquatic ecologists: Synthesis and recent results

Sakina-Dorothée Ayata , Séverine Martini , Martin Laviale , Beatrix E Beisner , Floriane Larras et al.
ALSO Aquatic Sciences Meeting, Association for the Sciences of Limnology and Oceanography (ASLO), Jun 2023, Palma de Mallorca, Spain. ⟨10.1002/lno.11655⟩
Communication dans un congrès hal-04117032 v1
Image document

The REINFORCE Project: Inviting Citizen Scientists to analyse KM3NeT data

Rémy Le Breton , Vincent Bertin , Paschal Coyle , Gwenhaël de Wasseige , Hervé Glotin et al.
37th International Cosmic Ray Conference, Jul 2021, Berlin, Germany. pp.1392, ⟨10.22323/1.395.1392⟩
Communication dans un congrès hal-03373316 v1

How to analyse bioluminescence time series from in situ observatories ? Example from high frequency records and real time data at the ANTARES site.

Severine Martini , Christian Tamburini , David Nerini
International symposium on bioluminescence and chemiluminescence (17th), May 2012, Guelph, Canada
Communication dans un congrès hal-00756806 v1
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Functional trait-based approaches as a common framework for freshwater and marine ecologists

Severine Martini , Floriane Larras , Aurélien Boyé , Emile Faure , Nicole Aberle et al.
11th Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS), Jun 2019, Zagreb, Croatia
Poster de conférence hal-03232606 v1

Data management plan BIOLUMOPS

Martini Séverinne
MIO-Mediterranean Institute of Oceanography, Aix-Marseille Université. 2024
Rapport (plan de gestion de données/data management plan) hal-04778494 v1

Evaluation and Selection of the MEUST Submarine Site

V. Bertin , M. Billault , P. Coyle , C. Curtil , S. Deguero et al.
2013, pp.1-15
Rapport in2p3-01071770 v1