Sophie Lorber

Chargée de Recherche Hors Classe INRAE TOXALIM Equipe Biosynthèse et Toxicité des Mycotoxines
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Présentation

Sophie Lorber est chargée de recherche hors classe à INRAE au sein de l’UMR ToxAlim. Elle fait partie de l’équipe Biosynthèse et Toxicité des Mycotoxines depuis 2016, dans le groupe mycotoxinogenèse. Elle est co-auteur de 36 publications et 39 communications et a dirigé 6 doctorants (3 sur la thématique des mycotoxines). Elle possède une double expertise sur le devenir des contaminants organiques dans les plantes et sur la biosynthèse et la régulation des mycotoxines chez les champignons filamenteux. Ses principaux thèmes de recherche actuels concernent l’élucidation des voies de biosynthèse de la patuline et des bases moléculaires de sa régulation chez le champignon filamenteux Penicillium expansum, responsable de la pourriture bleue de la pomme. Plus généralement, elle s'intéresse à la caractérisation du métabolome spécialisé de plusieurs genres d’ascomycètes (Aspergillus sp., Penicillium sp., Fusarium sp.). Elle s’intéresse également au contrôle de la production des mycotoxines majeures de ces champignons par l'utilisation d'agents biologiques ou de molécules actives issues de micro-organismes ou d'extraits végétaux et à comprendre les mécanismes d'inhibition par des analyses transcriptomiques. Elle participe régulièrement à des projets régionaux et nationaux (Région Occitanie-Toulouse et Occitanie-Montpellier, ANR, ANSES, CASDAR) et a fait partie de comités d’organisation de congrès.

CURSUS UNIVERSITAIRE (Université Louis Pasteur de Strasbourg I)

1989-1992 Doctorat en Biochimie, soutenu le 4 décembre 1992 Titre : « Biosynthèse des phytostérols (Zea mays) : identification et caractérisation des systèmes enzymatiques impliqués dans les déméthylations en position 4 » Directeur de thèse Professeur Pierre BENVENISTE Laboratoire Institut de Biologie Moléculaire des Plantes - Strasbourg

1989 DEA de Biologie Cellulaire et Moléculaire Titre : « La méthylène-24-cycloartanol-4-méthyl-déméthylase : enzymologie et mécanisme moléculaire » 1988 Maîtrise de Biochimie 1987 Licence de Biochimie 1986 DEUG de Biologie

PARCOUR PROFESSIONNEL

Depuis le 01/01/2016 INRAE UMR 1331 TOXALIM Toulouse Equipe E5 Biosynthèse et Toxicité des Mycotoxines (Chef d’équipe, Olivier PUEL)

01/01/2011 - 31/12/2015 USC 1400 Ecolab Toulouse (CNRS, UPS, INPT-ENSAT), convention INRA-CNRS-UPS-INPT

17/10/1994 - 31/12/2010 INRA UMR 1089 Xénobiotiques Toulouse Depuis le 01/01/2020 Chargée de Recherche hors classe 01/01/2000 – 31/12/2019 Chargée de Recherche première classe 01/10/1995 - 01/01/2000 Chargée de Recherche deuxième classe 17/10/1994 - 30/09/1995 Stage post-doctoral Thème de recherche « Caractérisation et purification des glutathion transférases de blé et d’arabette »

01/08/1993 – 01/09/1994 Stage post-doctoral à la B.A.S.F. (Limburgerhof, Allemagne) « Métabolisation de la bentazone in vitro et in vivo par des systèmes oxydatifs de plantes » Directeur Dr Alan AKERS

THEMATIQUES DE RECHERCHE

Depuis le 01/01/2016 Champignons filamenteux : élucidation des voies de biosynthèse des mycotoxines et de leur régulation, caractérisation du métabolome spécialisé, biocontrôle.

1994-2015 Devenir des produits phytosanitaires chez les plantes en vue de l’évaluation du risque des contaminants organiques et de leurs résidus vis-à-vis de l’environnement et de la santé humaine. 1994-2001 Aspects enzymologiques : purification et caractérisation chez le blé des glutathion transférases (GST), isoenzymes impliquées dans la détoxication de composés électrophiles exogènes et endogènes. 2001-2015 Etablissement de cartes métaboliques : détermination de la nature des résidus et de leur répartition à l’intérieur de la plante, identification de métabolites, biodisponibilité des résidus végétaux chez l’animal (plantes cultivées), devenir dans l’environnement (plantes non cibles).

1988-1994 Caractérisation de systèmes enzymatiques chez les plantes 1988-1992 Caractérisation de systèmes enzymatiques impliqués dans la biosynthèse de métabolites spécialisés, les phytostérols. 1993-1994 Caractérisation d’un système enzymatique impliqué dans le devenir métabolique d’un herbicide, la bentazone.

Domaines de recherche

Mycologie Chimie Sciences du Vivant [q-bio]

Compétences

Biochimie Biologie moléculaire Chimie analytique

Publications

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Publications

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Implantation of Aspergillus Section Flavi in French Maize and Consequences on Aflatoxin Contamination of Maize at Harvest: Three-Year Survey

Sylviane Bailly , Anwar Elmahgubi , Olivier Puel , Sophie Lorber , Jean-Denis Bailly et al.
Toxins, 2025, 17, pp.155. ⟨10.3390/toxins17040155⟩
Article dans une revue hal-05004802 v1
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Role of the osaA Gene in Aspergillus fumigatus Development, Secondary Metabolism and Virulence

Apoorva Dabholkar , Sandesh Pandit , Ritu Devkota , Sourabh Dhingra , Sophie Lorber et al.
Journal of Fungi, 2024, 10, pp.103. ⟨10.3390/jof10020103⟩
Article dans une revue hal-04642969 v1

Implication of VelB in the development, pathogenicity, and secondary metabolism of Penicillium expansum

Nadia Tahtah , Chrystian Zetina-Serrano , Ophélie Rocher , Claire Naylies , Yannick Lippi et al.
Postharvest Biology and Technology, 2023, 195, pp.112121. ⟨10.1016/j.postharvbio.2022.112121⟩
Article dans une revue hal-03835274 v1
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Effect of Streptomyces roseolus Cell-Free Supernatants on the Fungal Development, Transcriptome, and Aflatoxin B1 Production of Aspergillus flavus

Louise Maud , Florian Boyer , Julie Bornot , Julie Bornot , Yannick Lippi et al.
Toxins, 2023, 15 (7), pp.428. ⟨10.3390/toxins15070428⟩
Article dans une revue hal-04148843 v1
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Homeobox transcription factor HbxA influences expression of over one thousand genes in the model fungus Aspergillus nidulans

Sandesh S Pandit , Jinfang Zheng , Yanbin Yin , Sophie Lorber , Olivier Puel et al.
PLoS ONE, 2023, 18 (7), pp.e0286271. ⟨10.1371/journal.pone.0286271⟩
Article dans une revue hal-04169210 v1
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Mycotoxines majeures et émergentes dans les filières cidre et vin : observatoire, lutte biologique au champ et devenir au cours des procédés.

Morvan Coarer , Olivier Puel , Sophie Lorber , H. Guichard , Jean J. Lemaguet et al.
Innovations Agronomiques, 2021, 82, pp.246-261. ⟨10.15454/6z4f-7s10⟩
Article dans une revue hal-03499869 v1
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The Transcriptional Regulator HbxA Governs Development, Secondary Metabolism, and Virulence in Aspergillus fumigatus

Timothy Satterlee , Binita Nepal , Sophie Lorber , Olivier Puel , Ana Calvo
Applied and Environmental Microbiology, 2020, 86 (3), 37 p. ⟨10.1128/AEM.01779-19⟩
Article dans une revue hal-02613971 v1
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The brlA Gene Deletion Reveals That Patulin Biosynthesis Is Not Related to Conidiation in Penicillium expansum

Chrystian Zetina-Serrano , Ophélie Rocher , Claire Naylies , Yannick Lippi , Isabelle P. Oswald et al.
International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21 (18), pp.6660. ⟨10.3390/ijms21186660⟩
Article dans une revue hal-02944746 v1
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Application of MALDI-TOF MS to species complex differentiation and strain typing of food related fungi: Case studies with Aspergillus section Flavi species and Penicillium roqueforti isolates

Laura Quéro , Priscillia Courault , Beatrice Cellière , Sophie Lorber , Jean-Luc Jany et al.
Food Microbiology, 2020, 86, pp.103311. ⟨10.1016/j.fm.2019.103311⟩
Article dans une revue hal-02271931 v1
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Diversity within Aspergillus niger Clade and Description of a New Species: Aspergillus vinaceus sp. nov.

Josué J. da Silva , Beatriz T. Iamanaka , Larissa S. Ferranti , Fernanda P. Massi , Marta H. Taniwaki et al.
Journal of Fungi, 2020, 6 (4), pp.371. ⟨10.3390/jof6040371⟩
Article dans une revue hal-03080830 v1
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Aflatoxin biosynthesis and genetic regulation: A review

Isaura Caceres , Anthony Al Khoury , Rhoda El Khoury , Sophie Lorber , Isabelle P. Oswald et al.
Toxins, 2020, 12 (3), pp.150. ⟨10.3390/toxins12030150⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-02623009 v1
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Regulation of Secondary Metabolism in the Penicillium Genus

Christelle El Hajj Assaf , Chrystian Zetina-Serrano , Nadia Tahtah , André El Khoury , Ali Atoui et al.
International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21 (24), pp.9462. ⟨10.3390/ijms21249462⟩
Article dans une revue hal-03064407 v1
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Morphologic, molecular and metabolic characterization of Aspergillus section Flavi in spices marketed in Lebanon

Joya Makhlouf , Amaranta Carvajal-Campos , Arlette Querin , Souria Tadrist , Olivier Puel et al.
Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-41704-1⟩
Article dans une revue hal-02625983 v1

Occurrence and diversity of Aspergillus in commercial yerba mate elaborated for the Brazilian beverage ‘chimarrão’

Josué José Silva , Olivier Puel , Sophie Lorber , Larissa S. Ferranti , Luryan F. Ortiz et al.
Food Research International, 2019, 121, pp.940-946. ⟨10.1016/j.foodres.2019.01.023⟩
Article dans une revue hal-02628919 v1
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Does intraspecific variability matter in ecological risk assessment? Investigation of genotypic variations in three macrophyte species exposed to copper

Eva Roubeau Dumont , Camille Larue , Sophie Lorber , Hervé Gryta , Elise Billoir et al.
Aquatic Toxicology, 2019, 211, pp.29-37. ⟨10.1016/j.aquatox.2019.03.012⟩
Article dans une revue hal-02324925 v1

Impact of veA on the development, aggressiveness, dissemination and secondary metabolism of Penicillium expansum

Christelle El Hajj Assaf , Selma P Snini , Souria Tadrist , Sylviane Bailly , Claire Naylies et al.
Molecular Plant Pathology, 2018, 19 (8), pp.1971-1983. ⟨10.1111/mpp.12673⟩
Article dans une revue hal-04777219 v1
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Occurrence and identification of <em>Aspergillus</em> section <em>Flavi</em> in the context of the emergence of aflatoxins in french maize

Sylviane Bally , Anwar El Mahgubi , Amaranta Carvajal-Campos , Sophie Lorber , Olivier Puel et al.
Toxins, 2018, 10 (12), ⟨10.3390/toxins10120525⟩
Article dans une revue hal-02624195 v1

Growth parameters influencing uptake of chlordecone by Miscanthus species

Yohan Liber , Clarisse Létondor , Sophie Lorber , Francois Laurent
Science of the Total Environment, 2018, 624, pp.831-837. ⟨10.1016/j.scitotenv.2017.12.071⟩
Article dans une revue hal-01678089 v1
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Impact of veA on the development, aggressiveness, dissemination and secondary metabolism of Penicillium expansum

Christelle El Hajj Assaf , Selma Snini , Souria Tadrist , Sylviane Bally , Claire Naylies et al.
Molecular Plant Pathology, 2018, 19 (8), pp.1971-1983. ⟨10.1111/mpp.12673⟩
Article dans une revue hal-02061925 v1
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<em>Aspergillus korhogoensis</em>, a novel aflatoxin producing species from the Côte d’Ivoire

Amaranta Carvajal-Campos , Ama Lethicia Manizan , Souria Tadrist , David Koffi Akaki , Rose Koffi-Nevry et al.
Toxins, 2017, 9 (12), ⟨10.3390/toxins9110353⟩
Article dans une revue hal-02625529 v1

Uptake and distribution of chlordecone in radish: different contamination routes in edible roots

Clarisse Létondor , Sophie Lorber , Francois Laurent
Chemosphere, 2015, 118, pp.20-28. ⟨10.1016/j.chemosphere.2014.03.102⟩
Article dans une revue hal-02634225 v1
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Metabolic Fate of 2,4-Dichlorophenol and Related Plant Residues in Rats

Sophie Lorber , Sabrina Despoux , Emilien L. Jamin , Cécile Canlet , Jean Pierre J. P. Cravedi et al.
Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2012, 60 (7), pp.1728-1736. ⟨10.1021/jf203666k⟩
Article dans une revue hal-01137073 v1

Metabolic Fate of [C-14]Diuron and [C-14]Linuron in Wheat (Triticum aestivum) and Radish (Raphanus sativus)

Sophie Lorber , Haifaa Al-Sayeda , Isabelle Jouanin , Laurent Debrauwer , Cécile Canlet et al.
Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2010, 58 (20), pp.10935-10944. ⟨10.1021/jf101937x⟩
Article dans une revue hal-02668715 v1

Transfer of the insecticide [14C] imidacloprid from soil to tomato plants

Haifaa Al-Sayeda , Sophie Lorber , Nallanthigal Shirdhara Chary , Laurent Debrauwer , Francois Laurent
Environmental Chemistry Letters, 2008, 6 (4), pp.229-234. ⟨10.1007/s10311-007-0121-2⟩
Article dans une revue istex hal-02666129 v1

Metabolic fate of [14C] chlorophenols in radish ([i]Raphanus sativus[/i]), lettuce ([i]Lactuca sativa[/i]), and spinach ([i]Spinacia oleracea[/i])

Sophie Lorber , Sabrina Despoux , Estelle Rathahao-Paris , Cécile Canlet , Laurent Debrauwer et al.
Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2008, 56 (18), pp.8461-8469. ⟨10.1021/jf8016354⟩
Article dans une revue istex hal-01321084 v1

Metabolic fate of [14c]-2,4-dichlorophenol in tobacco cell suspension cultures

Francois Laurent , Cécile Canlet , Laurent Debrauwer , Sophie Lorber
Environmental Toxicology and Chemistry, 2007, 26 (11), pp.2299-2307. ⟨10.1897/07-036R.1⟩
Article dans une revue istex hal-02655577 v1

Fate of RDX and TNT in agronomic plants

Mireille Vila , Sophie Lorber , Francois Laurent
Environmental Pollution, 2007, 148 (1), pp.148-154. ⟨10.1016/j.envpol.2006.10.030⟩
Article dans une revue istex hal-02666646 v1

Phytotoxicity to and uptake of RDX by rice

Mireille Vila , S. Mehier , Sophie Lorber , Francois Laurent
Environmental Pollution, 2007, 145 (3), pp.813-817. ⟨10.1016/j.envpol.2006.05.009⟩
Article dans une revue istex hal-02665852 v1

Metabolism of [14C]-2,4-dichlorophenol in edible plants

Francois Laurent , Laurent Debrauwer , Sophie Lorber
Pest Management Science, 2006, 62 (6), pp.558-564. ⟨10.1002/ps.1213⟩
Article dans une revue istex hal-02655576 v1

Metabolism of [14C]-2,4,6-trinitrotoluene in tobacco cell suspension cultures

Mireille Vila , Sophie Lorber , Estelle Rathahao-Paris , Laurent Debrauwer , Cécile Canlet et al.
Environmental Science and Technology, 2005, 39 (2), pp.663-72
Article dans une revue hal-01763222 v1

Metabolic fate of [14C]-2,4-dichlorophenol in macrophytes

Sophie Lorber , Estelle Rathahao-Paris , Jean Pierre J. P. Cravedi , Francois Laurent
Chemosphere, 2004, 56 (3), pp.275-84. ⟨10.1016/j.chemosphere.2004.02.017⟩
Article dans une revue istex hal-01763221 v1

Uptake and metabolic fate of [14C]-2,4-dichlorophenol and [14C]-2,4-dichloroaniline in wheat (Triticum aestivum) and soybean (Glycine max)

Sophie Lorber , Estelle Rathahao-Paris , Jean Pierre J. P. Cravedi , Francois Laurent
Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2003, 51 (16), pp.4712-4718. ⟨10.1021/jf034230j⟩
Article dans une revue istex hal-01763224 v1

Selective induction of glutathione s-transferase subunits in wheat plants exposed to the herbicide acifluorfen

Sophie Lorber , Gabor Gullner , Tamäs Kömives , René Scalla
Zeitschrift für Naturforschung, 2000, 55c, pp.37-39. ⟨10.1515/znc-2000-1-208⟩
Article dans une revue hal-02103883 v1

Phytotoxicity to and uptake of TNT by rice

Mireille Vila , Sophie Lorber , Francois Laurent
4th International Workshop on Bioavailability of Pollutants and Soil Remediation, Sep 2006, Seville, Spain. 4 p., ⟨10.1007/s10653-008-9145-1⟩
Communication dans un congrès istex hal-02758323 v1

Influence of the complexity of aquatic test systems on the fate of vinclozolin and its reprotoxic effects in Lymnaea stagnalis.

Laurent Lagadic , Julian Bursztyka , Maryse Baradat , Sophie Lorber , Micheline Heydorff et al.
15. Europe Annual Meeting of SETAC, May 2005, Lille, France. pp.Inconnue
Communication dans un congrès hal-01453616 v1

La patuline

Olivier Puel , Sophie Lorber , Chrystian Zetina-Serrano , Sabine Schorr-Galindo , Thierry Gauthier
Isabelle OSWALD, Florence FORGET, Olivier PUEL. Les mycotoxines: Connaissances actuelles et futurs enjeux, QUAE, pp.38-48, 2024, 978-2-7592-3975-7
Chapitre d'ouvrage hal-05013608 v1
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Biodiversity of Aflatoxigenic Aspergillus section Flavi Species According to Food Matrices and Geographic Areas

Amaranta Carvajal-Campos , Ama Lethicia Manizan , Didier Montet , Sophie Lorber , Olivier Puel et al.
Mycotoxins in Food and Beverages Innovations and Advances Part I Food Biology Series, 2021, 978-0-367-42209-7
Chapitre d'ouvrage hal-03773672 v1

Phytoremediation techniques for pesticide contaminations

Sophie Lorber , Francois Laurent
Alternative Farming Systems, Biotechnology, Drought Stress and Ecological Fertilisation, Chapter 4, Editions Springer, 2011, 978-94-007-0185-4. ⟨10.1007/978-94-007-0186-1_4⟩
Chapitre d'ouvrage hal-02807075 v1

Devenir des contaminants organiques dans les plantes

Sophie Lorber
Sciences du Vivant [q-bio]. Institut National Polytechnique (Toulouse), 2010
HDR tel-02819129 v1