
Stéphanie DAVAL
Présentation
Les plantes hébergent des communautés microbiennes (microbiotes) composées de bactéries, champignons, oomycètes, virus, archae et protistes. Ces organismes se trouvent notamment dans les racines et la rhizosphère (région du sol directement formée et influencée par les racines), ainsi que dans les feuilles et les graines. Les microbes sont attirés par les nutriments fournis par la plante et sont sélectionnés à partir du milieu environnant (sol, eau et air), vraisemblablement par le système immunitaire de la plante, les exsudats que la plante sécrète dans le sol à proximité immédiate de la racine et leur capacité de compétition vis-à-vis d’autres microbes. La structure et la composition des communautés microbiennes associées aux plantes, ainsi que le réseau complexe d'interactions entre les espèces microbiennes, sont cruciaux pour la tolérance au stress, la dynamique de développement des plantes, le rendement, la nutrition mais aussi la santé. Afin de mieux comprendre les interactions complexes tripartites entre les plantes, les parasites des racines et les microbiotes associés aux plantes, et plus particulièrement les mécanismes par lesquels les microbes du sol stimulent la croissance et la défense des plantes et/ou modulent le développement et la pathogénicité des agents pathogènes, un défi majeur consiste à coupler les études descriptives à des études fonctionnelles. Dans ce cadre, mon projet de recherche vise à identifier les gènes et fonctions (du microbiote, du bioagresseur et/ou de la plante) impliqués dans cette modulation du dialogue tripartite, valider leur(s) rôle(s) fonctionnel(s), par des approches de (méta)-transcriptomique, et mobiliser ces connaissances en santé des cultures.
Publications
Publications
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Soil microbiota influences clubroot disease by modulating Plasmodiophora brassicae and Brassica napus transcriptomes2020
Pré-publication, Document de travail
(preprint/prepublication)
hal-02487262
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AskoR, un outil R pour l'analyse de données RNAseq. Illustré par l'étude d'interactions complexes plante - bioagresseurs telluriques – microbiote.Webinaire CATI BARIC, 2023, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-04719752
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AskoR, A R Package for Easy RNASeq Data AnalysisIECE 2021 - 1st International Electronic Conference on Entomology, Jul 2021, Virtual, France. pp.1-8, ⟨10.3390/IECE-10646⟩
Communication dans un congrès
hal-03347665
v1
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Santé des plantes : décryptage d’une partie du dialogue complexe entre la plante, le microbiote et un bioagresseur.Webinaire Biogenouest Journée de l'Axe Génomique "Fronts de connaissances sur le microbiote des plantes"., 2021, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-04719755
v1
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Influence of nitrogen constraint on quantitative resistance to clubroot in Brassica napus21st Crucifer Genetics Conference - Brassica - Wokshop Clubroot, 2018, Saint-Malo, France
Communication dans un congrès
hal-03348628
v1
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Quantitative resistance to clubroot and interactions with abiotic stressesIOBC-WPRS WG 'Pesticides and Beneficial Organisms', 2018, Zagreb, Croatia. pp.25-26
Communication dans un congrès
hal-03349115
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Influence of nitrogen constraint on quantitative resistance to clubroot in Brassica napusInternational Clubroot Workshop, 2018, Edmonton, Canada
Communication dans un congrès
hal-03349054
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Quels effets la diversité microbienne du sol a-t-elle sur la croissance et la santé des plantes ?Colloque de Génomique Environnementale, Oct 2015, Montpellier, France
Communication dans un congrès
hal-03349078
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Influence de T6SS sur la compétence rhizosphérique de la souche phytoprotectrice Pseudomonas fluorescens Pf29Arp.11e Rencontres Plantes-Bactéries, Feb 2014, Aussois, France
Communication dans un congrès
hal-03347772
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Ggt genetic diversity and development of detection method to test the competition between strains on wheat rootsProjet bilateral INRA / BBSRC, 2011, Cambridge, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-03349047
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Gaeumannomyces graminis var. tritici polymorphism and dynamicsJohn Innes Center, 2009, Norwich, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-03349032
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The Fads3 gene encodes for three different FADS3 proteins in rodent tissues6ème Congrès de Lipidomique, Jul 2009, Rennes (FR), France
Communication dans un congrès
hal-00730094
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Expression of fatty acid desaturase 3 (FADS3) in rat tissues: From the gene to the protein50th International Conference on Bioscience of Lipids, Sep 2009, Regensburg, Germany
Communication dans un congrès
hal-00729200
v1
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Genetic evidence for differentiation of Ggt populations into two major cladesTake-all Workshop, Feb 2009, Cambridge, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-03349037
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Gaeumannomyces graminis var. tritici polymorphism and dynamicsTake-all Workshop, 2009, Broom's Barn, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-03349034
v1
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Expression and activity of two recombinant isoforms of rat NMT16th Congress of International Society for the Study of Fatty Acids and Lipids (ISSFAL), Jun 2004, Brighton, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-03348632
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Activité de la myristoyl-CoA: protéine N-myristoyltransférase de rat exprimée dans les cellules COS-7.Groupe d’Etude et de Recherche sur les Lipides et les Lipoprotéines (GERLI), Diversité moléculaire et physiopathologie, Sep 2003, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-03348639
v1
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Effet des acides gras saturés sur l’activité et l’expression des D6- et D5-désaturases4èmes Journées Francophones de Nutrition, Nov 2002, Dijon, France
Communication dans un congrès
hal-03348641
v1
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Lipogenesis genes and fatness in the chicken.27th International Conference on Animal Genetics, Jul 2000, Minnesota, United States
Communication dans un congrès
hal-02769050
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Activité transcriptionnelle de genes impliqués dans le métabolisme des lipides chez des lignées grasse et maigre de poulet3. Journées de la recherche avicole, Mar 1999, Saint-Malo, France
Communication dans un congrès
hal-02768808
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Lipogenic gene expression in divergently selected egg-laying lines on residual food consumption10. European Poultry Congress, Jun 1998, Jérusalem, Israel
Communication dans un congrès
hal-02769105
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Lipogenesis gene expression in divergently selected lean and fat chickens10. European Poultry Congress, Jun 1998, Jérusalem, Israel
Communication dans un congrès
hal-02768929
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Apoprotein A1 mRNA levels differ in genetically lean and fat chickens.XXV International Conference on Animal Genetics, Jul 1996, Tours, France
Communication dans un congrès
hal-02768958
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The biocontrol bacterium Pseudomonas fluoresens Pf29Arp strain affects the pathogenesis-related gene expression of the take-all fungus Gaeumannomyces graminis var. tritici on wheat rootsMolecular Microbial Ecology of the Rhizosphere: Volume 1 & 2, Wiley, 2013, 978-1-118-29617-2. ⟨10.1002/9781118297674.ch59⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-02803301
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Combined effects of wheat roots and pathogenic fungus Gaeumannomyces graminis var tritici on Gene Expression of the biocontrol bacterium Pseudomonas fluorescens Pf29ArpMolecular Microbial Ecology of the Rhizosphere: Volume 1 & 2, Wiley, 2013, 978-1-118-29617-2. ⟨10.1002/9781118297674.ch61⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-02803298
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