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Stéphanie DAVAL

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Présentation

Analyses fonctionnelles des interactions "Microbiote / Plante / Bio-agresseur"
Les plantes hébergent des communautés microbiennes (microbiotes) composées de bactéries, champignons, oomycètes, virus, archae et protistes. Ces organismes se trouvent notamment dans les racines et la rhizosphère (région du sol directement formée et influencée par les racines), ainsi que dans les feuilles et les graines. Les microbes sont attirés par les nutriments fournis par la plante et sont sélectionnés à partir du milieu environnant (sol, eau et air), vraisemblablement par le système immunitaire de la plante, les exsudats que la plante sécrète dans le sol à proximité immédiate de la racine et leur capacité de compétition vis-à-vis d’autres microbes. La structure et la composition des communautés microbiennes associées aux plantes, ainsi que le réseau complexe d'interactions entre les espèces microbiennes, sont cruciaux pour la tolérance au stress, la dynamique de développement des plantes, le rendement, la nutrition mais aussi la santé. Afin de mieux comprendre les interactions complexes tripartites entre les plantes, les parasites des racines et les microbiotes associés aux plantes, et plus particulièrement les mécanismes par lesquels les microbes du sol stimulent la croissance et la défense des plantes et/ou modulent le développement et la pathogénicité des agents pathogènes, un défi majeur consiste à coupler les études descriptives à des études fonctionnelles. Dans ce cadre, mon projet de recherche vise à identifier les gènes et fonctions (du microbiote, du bioagresseur et/ou de la plante) impliqués dans cette modulation du dialogue tripartite, valider leur(s) rôle(s) fonctionnel(s), par des approches de (méta)-transcriptomique, et mobiliser ces connaissances en santé des cultures.

Publications

"muriel-marchi"

Influence of type VI secretion system (T6SS) on rhizosphere competence of a rhizobacterium.

Marchi Muriel , Charline Lecomte , Morgane Boutin , Kévin Gazengel , C. Rispe
ISME 15th conference., 2014, Séoul, South Korea
Poster de conférence hal-03347842v1

Description du système de sécrétion de type VI chez la rhizobactérie Pseudomonas fluorescens Pf29Arp.

Marchi Muriel , Morgane Boutin , Stéphanie Daval , Alain Sarniguet
10e Rencontres Plantes-Bactéries, Jan 2012, Aussois, France
Poster de conférence hal-03347759v1

Role of the Type VI secretion system of Pseudomonas fluorescens Pf29Arp in biofilm process.

Marchi Muriel , Maxime R Hervé , Charline Lecomte , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Kévin Gazengel
14th International Symposium on Microbial Ecology., Aug 2012, Copenhague, Denmark
Poster de conférence hal-03347835v1

Multiple approach at gene, genome and transcriptome levels for deciphering biological mechanisms of soil suppressiveness of a plant root disease.

Alain Sarniguet , Lionel Lebreton , Stéphanie Daval , Morgane Boutin , Kévin Gazengel
28th New Phytologist Symposium Functions and ecology of the plant microbiome., 2012, Rhodes, Greece
Poster de conférence hal-03347848v1

Méthode innovante de real-time PCR développée à partir du système KASPar : application au suivi simultané de deux génotypes d’un champignon phytopathogène sur racines de blé par quantification de SNP.

Kévin Gazengel , Lionel Lebreton , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Marchi Muriel , Alain Sarniguet
9e Rencontres de Phytopathologie - Mycologie de la Société Française de Phytopathologie, Jan 2012, Aussois, France
Poster de conférence hal-03347741v1

Multiple approach at gene, genome and transcriptome levels for deciphering biological mechanisms of soil suppressiveness of a plant root disease.

Alain Sarniguet , Lionel Lebreton , Stéphanie Daval , Morgane Boutin , Kévin Gazengel
Ecole Thématique Expert Génomique Environnementale, Evolution, Diversité et Fonctionnement des Organismes et Ecosystes à l’ère des Nouvelles Technologies de Séquençage, 2012, Aussois, France
Poster de conférence hal-03347784v1