Accéder directement au contenu

Valérie LABAS

8
Documents
Identifiants chercheurs

Présentation

Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI). J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa). Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics). En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up). Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques : 1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ; 2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ; 3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ; 4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI). I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled). My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics). I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project). To carry out these projects, I use different analytical strategies: 1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence; 2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections; 3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and 4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.

Publications

"rozenn-dalbies-tran"

Global transcriptome and proteome analysis of bovine cumulus cells in relation to maturation and developmental competence of enclosed oocyte

Svetlana Uzbekova , Audrey Gargaros , Sylvain Auclair , Grégoire Harichaux , Valérie Labas
4. Mammalian Embryo Genomics Meeting, EmbryoGene Network. CAN., Oct 2014, Québec, Canada. 94 p
Communication dans un congrès hal-02744650v1

Oocytomics: combining transcriptomics and proteomics to understand post-transcriptional regulation in bovine oocytes

Rozenn Dalbies-Tran , Christelle Hennequet-Antier , Cédric Cabau , Leslie Angulo , Sylvain Auclair
1. International Symposium of Microgenomics, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Génétique Animale et Biologie Intégrative (1313)., May 2014, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02740352v1

Transcript and protein stockpiles, lipid content and ultrastructure of bovine oocytes enclosed or not within cumulus cells are differently affected by in vitro maturation: implications for developmental competence

Svetlana Uzbekova , Sylvain Auclair , Rustem Uzbekov , Valérie Labas , Christine Perreau
17. International Congress on Animal Reproduction, Society for the Study of Reproduction (SSR). Labo/service de l'auteur, USA., Jul 2012, Vancouver, Canada. 613 p
Communication dans un congrès hal-02745228v1

Differences of developmental potential, transcriptome, proteome and ultrastructure between cumulus denuded and cumulus enclosed bovine oocytes after in vitro maturation

Svetlana Uzbekova , Sylvain Auclair , Rustem Uzbekov , Valérie Labas , Christine Perreau
GEMINI Group III Workshop, May 2011, Jerusalem, Israel
Communication dans un congrès hal-02744585v1

Approches non invasives de l'embryon : protéomique, métabolomique, dialogue ovocyte-cumulus

Dominique Royère , Prisca P. Feuerstein , Véronique Cadoret , Vincent Puard , Svetlana Uzbekova
14. Journées Nationales de la FFER, Nov 2009, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-02754731v1