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Valérie LABAS
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Documents
Identifiants chercheurs
- valerie-labas
- 0000-0002-5094-6844
Présentation
Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI).
J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa).
Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics).
En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up).
Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques :
1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ;
2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ;
3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ;
4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI).
I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled).
My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics).
I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project).
To carry out these projects, I use different analytical strategies:
1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence;
2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections;
3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and
4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.
Publications
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Welfare barriers and levers for improvement in organic and low-input outdoor pig and poultry production systems74. Annual meeting of the european federation of animal science (EAAP 2023), EAAP, Aug 2023, Lyon, France. pp.731
Communication dans un congrès
hal-04198015v1
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Proteome and biological functions of inner and outer perivitelline layers in the chicken egg26. World’s Poultry Congress, Aug 2022, Paris, France. pp.ID: 1676
Communication dans un congrès
hal-03750662v1
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The PPILOW project: Innovations improving welfare in low input and organic pig and poultry farms73. Annual meeting of the european federation of animal science (EAAP), EAAP, Sep 2022, Porto, Portugal. pp.350
Communication dans un congrès
hal-04128847v1
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PPILOW: innovations for improving animal welfare and human well-being in low-input outdoor and organic poultry and pig production systemsOne Welfare World Conference, 2021, One Welfare CIC, Sep 2021, Online meeting, Spain. pp.46
Communication dans un congrès
hal-03632430v1
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Proteomic study of inner and outer hen egg vitelline membranes: insights into the biological functions of vitelline membrane layersCombined Worshop of "Fundamental Physiology and Perinatal development in Poultry" and "Incubation and Fertility Research Group", Aug 2019, Tours, France
Communication dans un congrès
hal-03624410v1
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Gga-AvBD11, the archetype of a new structural family of defensins21e réunion du Groupe Français des Peptides et des Protéines (GFPP21), May 2019, Amboise, France
Communication dans un congrès
hal-02892790v1
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1ère structure 3D d’une défensine à double motif β-défensine, Gga-AvBD11 du poulet Gallus gallus, et explorations fonctionnelles5es Journées GDR MuFoPAM, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS). FRA., Oct 2018, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02788993v1
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L’ovalbumin-related protein X (OVAX) est une protéine apparentée à l'ovalbumine qui possède des activités antibactériennes11.Journées de la Recherche Avicole et Palmidèdes à Foie Gras, Apr 2015, Tours, France
Communication dans un congrès
hal-02740850v1
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Egg ovalbumins revisited: investigating the specificities of ovalbumin, ovalbumin-related protein X and ovalbumin-related protein YCongres Eggmeat, May 2015, Nantes, France
Communication dans un congrès
hal-02800219v1
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Insights into the structure-function relationship of egg defensinsXIVth European Poultry Conference, World's Poultry Science Association (WPSA). INT., Jun 2014, Stavanger, Norway
Communication dans un congrès
hal-02743609v1
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Functional and structural characterization of egg defensinsBanff Egg Forum, Jun 2014, Wroclaw, Poland. 12 diapositives
Communication dans un congrès
hal-02797356v1
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Ovocalyxin-36 and other LBP/BPI/Plunc- like proteins as molecular actors of the mechanism of the avian egg natural defencesProteins with a BPI/LBP/Plunc-like domain: revisiting the old and characterizing the new, Jan 2011, Nottingham, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-02745100v1
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Identification de molécules participant à la protection antimicrobienne de l'œuf par analyse protéomique ou transcriptomiqueDemi-journée scientifique : La protéomique et Métabolomique au Service de la Recherche Biomédicale, Jun 2011, Tours, France
Communication dans un congrès
hal-02744556v1
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Ovoinhibiteur : spécificité tissulaire et activités biologiques9. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2011, Tours, France
Communication dans un congrès
hal-02746471v1
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Ovoinhibitor: Tissular specificity and biological activities6. International Symposium in Turquey Production, World's Poultry Science Association (WPSA). Labo/service de l'auteur, Berlin, INT., Jun 2011, Berlin, Germany
Communication dans un congrès
hal-02745325v1
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Identification, purification et caractérisation de la beta-defensine aviaire 11 dans l'oeuf de poule8. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2009, Saint-Malo, France
Communication dans un congrès
hal-02753441v1
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Avian beta-defensin 11: Identification, purification and characterization25. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique, Oct 2008, Tours, France
Communication dans un congrès
hal-02755694v1
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Use of high-throughput methods to identify novel egg components25. Congrès de la Société d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique, Oct 2008, Tours, France
Communication dans un congrès
hal-02751763v1
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Identification of putative functional proteins in chicken eggshell23. World's Poultry Congress, Jun 2008, Brisbane, Australia
Communication dans un congrès
hal-02757962v1
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Identification of the precursor form of chicken matrix metalloprotease 2 (pro-MMP-2) in hen egg18. European Symposium on the Quality of Poultry Meat, Sep 2007, Prague, Czech Republic
Communication dans un congrès
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Identification et caractérisation de la métalloprotéase matricielle de type 2 (pro-MMP-2) dans l'oeuf de poule5. Colloque du groupe thématique "Protéolyse Cellulaire" SFBBM, Mar 2007, Seillac, France
Communication dans un congrès
hal-02752979v1
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Identification of matrix metalloprotease 2 (MMP-2) in unfertilized eggFinal Semilnar Cost 923: Multidisciplinary Hen Egg Reseach, Jun 2006, Turku, Finland
Communication dans un congrès
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Etude protéomique et fonctionnelle des couches interne et externe de la membrane vitelline de l’œuf de poule32. Colloque Biotechnocentre, Oct 2019, Seillac, France
Poster de conférence
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Projet PPILOW : des innovations pour améliorer le bien-être des porcs et volailles en élevage et expérimentation en systèmes de production plein air et biologiques à bas intrants (2019-2024)Défis scientifiques Phase, Nov 2019, Rennes, France. pp.83, Recueil des résumés
Poster de conférence
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Altération de l’activité des protéases digestives du poulet par un inhibiteur trypsique (Bowman-Birk inhibitor) présent dans l’aliment à base de poisRFL2 : 2eme Rencontres Francophones sur les Légumineuses, Oct 2018, Toulouse, France. 2018
Poster de conférence
hal-02785479v1
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Analyse protéomique des couches interne et externe de la membrane vitelline de l’œuf de poule (Gallus gallus)31. Colloque Biotechnocentre, Oct 2018, Seillac, France
Poster de conférence
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Caractériser pour mieux comprendre le rôle des fluides amniotique et allantoïque au cours du développement de l’embryon de poulet12. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Apr 2017, Tours, France. ITAVI - Institut Technique de l'Aviculture, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 12, 1222 p., 2017, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras
Poster de conférence
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Exploring the role of the chicken amniotic fluid during embryonic development2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group", Dec 2016, Brugge, Belgium. 2016, 2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group"
Poster de conférence
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Identification de la β-défensine 11 aviaire (AvBD11) dans l’oeuf de cane (Anas platyrhynchos)2. Journées du GDR MuFoPAM « MultiFonction des Peptides antimicrobiens », Oct 2015, Orléans, France. , 2015
Poster de conférence
hal-02800807v1
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Gallin is a chicken egg beta-defensin with a narrow antibacterial spectrum4. International Symposium on Antimicrobial Peptides, Jun 2014, Lorient, France. 1 p., 2014
Poster de conférence
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Fraction de protéines et peptides issus du blanc d'oeuf et protéine issue du blanc d'oeuf et leur utilisation comme agent anti-listeriaN° de brevet: WO 2011151407 A1. 2011, 28 p. + annexes
Brevet
hal-02810703v1
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Plateforme PAIB2 : Dossier de labellisation[0] 2013
Rapport
hal-02811389v1
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