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Vanina BENOIT

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Documents

Présentation

A l’Inra depuis 2001, d’abord en CDD sur des projets scientifiques en rapport avec les biotechnologies, j’ai été recrutée en 2003. Je suis actuellement en charge des activités de **génotypage** conduites dans l’unité. A ce titre, je développe et mets au point les protocoles pour détecter plusieurs types de **marqueurs moléculaires** sur différentes espèces forestières et à partir de différents tissus. J’interviens également dans la coordination des activités de génotypage réalisées sur des plateformes externes pour le compte de l’UMR BioForA. En pratique, j’organise les campagnes de marquage réalisées dans l’unité. Avec l’aide d’une technicienne, [Corinne Buret](https://www6.val-de-loire.inra.fr/biofora/Personnel/Permanents/BURET-Corinne), nous récoltons sur le terrain les tissus à analyser, stockons et préparons les échantillons au laboratoire, réalisons les manipulations et validons les résultats obtenus. Ensuite, j’effectue les premières étapes d’analyse des données : **validation de génotypes, recherche de paternité, calculs de diversité génétique.** Les marqueurs moléculaires que nous utilisons en routine sont majoritairement des marqueurs de type **[microsatellites](https://www.gnis-pedagogie.org/biotechnologie-amelioration-marqueur-microsatellite.html)**. Après amplification de l’ADN, la détection de ces marqueurs est réalisée à l’aide d’un séquenceur Applied Biosystem 3500. Nous travaillons principalement sur le peuplier, le mélèze, le frêne, le pin sylvestre et le merisier. Nous avons obtenu pour ces espèces de nombreuses données de référence. Au laboratoire, j’encadre les stagiaires de tous niveaux : BTS, Master, thèse. Je suis aussi impliquée dans la mise en place d’un TD de génétique auprès des Master 1 Agrosciences de l’université d’Orléans. Je suis également la **personne référente qualité** de notre unité. Dans ce cadre, j’assure l’animation de groupes de travail, l’accès aux différents documents qualité et le suivi des appareils soumis à métrologie.

Publications

"leopoldo-sanchez-rodriguez"
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Development of a new tool (4TREE) for adapted genome selection in European tree species

Romane Guilbaud , Chiara Biselli , Joukje Buiteveld , Luigi Cattivelli , Paul Copini
GenTree, Jan 2020, Avignon, France.
Poster de conférence hal-02928391v1
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A systems biology approach for identifying candidate genes involved in the natural variability of biomass yield and chemical properties in black poplar

Vincent Segura , Marie-Claude Lesage Descauses , Jean-Paul Charpentier , Kévin Kinkel , Claire Mandin
IUFRO Genomics and Forest Tree Genetics, May 2016, Arcachon, France. , 2016, IUFRO Genomics and Forest Tree Genetics. Book of Abstract
Poster de conférence hal-01456004v1
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A case study in marker‐assisted breeding for disease resistance

Helene Muranty , Véronique Jorge , Arnaud Dowkiw , Vanina Guérin , Patricia Faivre-Rampant
Final Conference Noveltree project "Tree Breeding, Genomics and Evolutionary Biology", Oct 2012, Helsinki, Finland. , 2012, Final Conference Noveltree "Tree Breeding, Genomics and Evolutionary Biology : new synergies to tackle the impact of climate change in the 21st century"
Poster de conférence hal-01268642v1
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Les gènes supports de l’hérédité et mémoire de l’évolution

Véronique Jorge , Catherine Bastien , Olivier Bertel , Vanina Guérin , Leopoldo Sanchez Rodriguez
Fête de la Science, Nov 2009, Orléans, France. 2009
Poster de conférence hal-02818609v1