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Véronique Jorge



**Research topics** =================== My research activities fall under two thematic axes aiming at: (1) Determine the genetic architecture of complex poplar traits in order to use these genes (markers) in the selection programs developed in the unit on this model tree; (2) To study the diversity and genetic structure of black poplar populations. Within the framework of European and national collaborative projects (EVOLTREE, Noveltree, GenTree), I have contributed significantly to the acquisition of whole genome sequence data, polymorphisms and genotyping to develop these two themes. Theme 1: I use association genetics and genetic mapping approaches based on the study of more or less complex pedigrees. One of the long-term objectives is to generate QTL effects information that can be used in breeding programs and serve to establish new models for genomic selection. Theme 2: I have been involved since 2004 in the description of the diversity and its structuring of black poplar populations at the French and European scale using molecular markers. This activity has grown with the development of high throughput sequencing and allows me to study more precisely the factors structuring the diversity of black poplar at the European scale. Education and academic degrees 1996-2000 Ph. D. of Phytopathology : "Mapping of cassava (Manihot esculenta Crantz) resistance to bacterial blight caused by Xanthomonas axonopodis pv. manihotis" – University of Paris XI-Orsay (France). Working Laboratory : Biotechnology and Cassava Pathology Unit at C.I.A.T. (Centro Internacional de Agricultura Tropical), A.A. 6713, Cali, Colombia 1995-96 One year degree required before doctoral studies, equivalent to a M. Sc. "Biology, Diversity and Adaptation of Crop Plants, Option Phytopathology"- University of Paris XI 1994-95 Equivalent to a M. Sc. in Plant Biology, University of Paris XI 1990-94 Equivalent to a B. Sc. in Plant Biology, University of Paris XI
**AXES de RECHERCHE** ====================== Mes activités de recherches s’inscrivent dans deux axes thématiques visant à : (1) **Déterminer l’architecture génétique de caractères complexes les peupliers en vue d’utiliser ces gènes (marqueurs) dans les programmes de sélection développés dans l’unité sur cet arbre modèle** ; (2) **Etudier la diversité et la structure génétique des populations de peuplier noir.** Dans le cadre de projets collaboratifs européens et nationaux, (EVOLTREE, Noveltree, [GenTree](, j’ai ainsi contribué significativement à l’acquisition de données de séquence de génomes entiers, de polymorphismes et de génotypage permettant de développer ces deux thématiques. Thématique 1 : j’utilise des approches de **génétique d’association et de cartographie génétique** basées sur l’obtention et l’étude de pédigrés plus ou moins complexes. L’un des objectifs à terme est de générer des informations d’effets aux QTL qui peuvent être utilisés dans les programmes de sélection et servir à l’établissement de nouveaux modèles de **sélection génomique**. Thématique 2 : je suis impliquée depuis 2004 dans la description de la diversité et de sa structuration des populations de peuplier noir à l’échelle française et européenne à l’aide de **marqueurs moléculaires**. Cette activité a pris de l’ampleur avec les développements du séquençage haut débit et me permet aujourd’hui d’étudier plus finement les **facteurs structurant la diversité du peuplier noir à l’échelle européenne.** **CURSUS** ========== 2000-2001: Stage postdoctoral, Laboratoire “Génomes et développement des Plantes", Université de Perpignan, France. 1996-2000: Thèse en Phytopathologie : "Cartographie de la résistance du manioc (Manihot esculenta Crantz) à la bactériose vasculaire causée par Xanthomonas axonopodis pv. manihotis" - Université Paris XI. Lieu d'exécution des travaux de thèse : Laboratoires de Biotechnologie et de Pathologie du Manioc, C.I.A.T., A.A. 6713, Cali, Colombie. 1995-1996: D. E. A. "Biologie, Diversité et Adaptation des Plantes Cultivées, Option Phytopathologie"- Université Paris XI, France. 1994-1995 : Maîtrise de Biologie Végétale, Université Paris XI, France. 1990-1994 : Licence de Biologie Végétale, Université Paris XI, France.


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Diversity and enrichment of breeding material for resilience in European forests

Sanna Olsson , Benjamin Dauphin , Véronique Jorge , Delphine Grivet , Anna Maria Farsakoglou
Forest Ecology and Management, 2023, 530, pp.120748. ⟨10.1016/j.foreco.2022.120748⟩
Journal articles hal-04118477v1
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The GenTree Platform: growth traits and tree-level environmental data in 12 European forest tree species

Lars Opgenoorth , B. Dauphin , Raquel Benavides , Katrin Heer , Paraskevi Alizoti
GigaScience, 2021, 10 (3), pp.giab010. ⟨10.1093/gigascience/giab010⟩
Journal articles hal-03282821v1
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The GenTree Leaf Collection: Inter‐ and intraspecific leaf variation in seven forest tree species in Europe

Raquel Benavides , Bárbara Carvalho , Cristina Bastias , David López‐quiroga , Antonio Mas
Global Ecology and Biogeography, 2021, 30 (3), pp.590-597. ⟨10.1111/geb.13239⟩
Journal articles hal-03282266v1
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Gene expression predictions and networks in natural populations supports the omnigenic theory

Aurélien Chateigner , Marie-Claude Lesage-Descauses , Odile Rogier , Véronique Jorge , Jean-Charles Leplé
BMC Genomics, 2020, 21 (1), pp.1-16. ⟨10.1186/s12864-020-06809-2⟩
Journal articles hal-02902844v1
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Favorable Conditions for Genomic Evaluation to Outperform Classical Pedigree Evaluation Highlighted by a Proof-of-Concept Study in Poplar

Marie Pégard , Vincent Segura , Facundo Muñoz , Catherine Bastien , Véronique Jorge
Frontiers in Plant Science, 2020, 11, ⟨10.3389/fpls.2020.581954⟩
Journal articles hal-03025048v1
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Sequence imputation from low density single nucleotide polymorphism panel in a black poplar breeding population

Marie Pegard , Odile Rogier , Aurélie Berard , Patricia Faivre-Rampant , Marie-Christine Le Paslier
BMC Genomics, 2019, 20, ⟨10.1186/s12864-019-5660-y⟩
Journal articles hal-02621320v1
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Accuracy of RNAseq based SNP discovery and genotyping in Populus nigra

Odile Rogier , Aurélien Chateigner , Souhila Amanzougarene , Marie-Claude Lesage Descauses , Sandrine Balzergue
BMC Genomics, 2018, 19, pp.909. ⟨10.1186/s12864-018-5239-z⟩
Journal articles hal-02622249v1

Narrow-sense heritability and P-ST estimates of DNA methylation in three Populus nigra L. populations under contrasting water availability

Mamadou Dia Sow , Vincent Segura , Sylvain Chamaillard , Véronique Jorge , Alain Delaunay
Tree Genetics and Genomes, 2018, 14 (5), ⟨10.1007/s11295-018-1293-6⟩
Journal articles hal-02624096v1

New resources for genetic studies in Populus nigra: genome-wide SNP discovery and development of a 12k Infinium array

Patricia P. Faivre-Rampant , Giusi Zaina , Véronique V. Jorge , Stefania Giacomello , Vincent Segura
Molecular Ecology Resources, 2016, 16 (4), pp.1023-1036. ⟨10.1111/1755-0998.12513⟩
Journal articles hal-02636258v1
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Characterization of the poplar pan-genome by genome-wide identification of structural variation.

Sara Pinosio , Stefania Giacomello , Patricia P. Faivre-Rampant , Gail Taylor , Véronique V. Jorge
Molecular Biology and Evolution, 2016, 33 (10), pp.2706-2719. ⟨10.1093/molbev/msw161⟩
Journal articles hal-02636741v1

Potential for Marker-Assisted Selection for forest tree breeding: lessons from 20 years of MAS in crops

Helene Muranty , Véronique V. Jorge , Catherine Bastien , Camille Lepoittevin , Laurent Bouffier
Tree Genetics and Genomes, 2014, 10 (6), pp.1491-1510. ⟨10.1007/s11295-014-0790-5⟩
Journal articles hal-02635335v1
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Integrating genome annotation and QTL position to identify candidate genes for productivity, architecture and water-use efficiency in Populus spp

Romain Monclus , Jean-Charles Leplé , Catherine Bastien , Pierre-François P.-F. Bert , Marc M. Villar
BMC Plant Biology, 2012, 12, ⟨10.1186/1471-2229-12-173⟩
Journal articles hal-02647348v1

The obscure events contributing to the evolution of an incipient sex chromosome in Populus: a retrospective working hypothesis

Gerald Tuskan , Steve Difazio , Patricia Faivre-Rampant , Muriel Gaudet , Antoine Harfouche
Tree Genetics and Genomes, 2012, 8 (3), pp.559-571. ⟨10.1007/s11295-012-0495-6⟩
Journal articles hal-01267797v1

Identification of quantitative trait loci affecting ectomycorrhizal symbiosis in an interspecific F1 poplar cross and differential expression of genes in ectomycorrhizas of the two parents: Populus deltoides and Populus trichocarpa

Jessy Labbé , Véronique V. Jorge , Annegret Kohler , Patrice Vion , Benoit Marçais
Tree Genetics and Genomes, 2011, 7 (3), pp.617-627. ⟨10.1007/s11295-010-0361-3⟩
Journal articles hal-02652297v1

Bud set in poplar – genetic dissection of a complex trait in natural and hybrid populations

Antje Rohde , Véronique Storme , Véronique V. Jorge , Muriel Gaudet , Nicola Vitacolonna
New Phytologist, 2011, 189 (1), pp.106-121. ⟨10.1111/j.1469-8137.2010.03469.x⟩
Journal articles hal-02652178v1

Qualitative and quantitative resistances to leaf rust finely mapped within two nucleotide-binding site leucine-rich repeat (NBS-LRR)-rich genomic regions of chromosome 19 in poplar

Alois Bresson , Véronique V. Jorge , Arnaud A. Dowkiw , Vanina Guérin , Isabelle Bourgait
New Phytologist, 2011, 192 (1), pp.151-163. ⟨10.1111/j.1469-8137.2011.03786.x⟩
Journal articles hal-02652374v1

Genetic linkage maps of Populus alba L. and comparative mapping analysis of sex determination across Populus species

Isabella Paolucci , Muriel Gaudet , Véronique V. Jorge , Isacco Beritognolo , Serena Terzoli
Tree Genetics and Genomes, 2010, 6 (6), pp.863-875. ⟨10.1007/s11295-010-0297-7⟩
Journal articles hal-02663110v1

Genetic linkage maps of Populus nigra L. including AFLPs, SSRs, SNPs, and sex trait

Muriel Gaudet , Véronique V. Jorge , Isabella Paolucci , Isacco Beritognolo , Giuseppe Scarascia Mugnozza
Tree Genetics and Genomes, 2008, 4 (1), pp.25-36. ⟨10.1007/s11295-007-0085-1⟩
Journal articles hal-02660529v1

Genetic architecture of qualitative and quantitative Melampsora larici-populina leaf rust resistance in hybrid poplar: genetic mapping and QTL detection

Véronique V. Jorge , Arnaud A. Dowkiw , Patricia P. Faivre-Rampant , Catherine Bastien
New Phytologist, 2005, 167 (1), pp.113-127. ⟨10.1111/j.1469-8137.2005.01424.x⟩
Journal articles hal-02678676v1

An EST resource for cassava and other species of Euphorbiaceae.

James V Anderson , Michel Delseny , Martin A Fregene , Veronique Jorge , Chikelu Mba
Plant Molecular Biology, 2004, 56 (4), pp.527-39. ⟨10.1007/s11103-004-5046-6⟩
Journal articles hal-00169060v1

A unigene catalogue of 5700 expressed genes in cassava.

Camilo Lopez , Véronique Jorge , Benoit Piegu , Chickelu Mba , Diego Cortes
Plant Molecular Biology, 2004, 56 (4), pp.541-54. ⟨10.1007/s11103-004-0123-4⟩
Journal articles hal-00168792v1

Amélioration génétique des peupliers

Catherine Bastien , Véronique V. Jorge , Arnaud A. Dowkiw , Marc M. Villar , Patricia P. Faivre-Rampant
Biofutur, 2004, 23 (247), pp.33-37
Journal articles hal-02672140v1

Recent progress in the characterization of molecular determinants in the Xanthomonas axonopodis pv. manihotis-cassava interaction.

Valérie Verdier , Silvia Restrepo , Gloria Mosquera , Véronique Jorge , Camilo Lopez
Plant Molecular Biology, 2004, 56 (4), pp.573-84. ⟨10.1007/s11103-004-5044-8⟩
Journal articles hal-00169054v1
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Identification of pathotypes of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in Africa and detection of quantitative trait loci and markers for resistance to bacterial blight of Cassava

Kerstin Wydra , Valerien Zinsou , Véronique V. Jorge , Valérie Verdier
Phytopathology, 2004, 94 (10), pp.1084-1093
Journal articles hal-02677399v1

Qualitative and quantitative evaluation of cassava bacterial blight resistance in F1 progeny of a cross between elite cassava clones

Véronique V. Jorge , Valérie Verdier
Euphytica, 2002, 123 (1), pp.41-48. ⟨10.1023/A:1014400823817⟩
Journal articles hal-02681929v1

Sequence characterized amplified region markers for the rice blast fungus, Magnaporthe grisea

O. Soubabère , Véronique V. Jorge , Jean-Loup Notteghem , Marc-Henri Lebrun , Didier Tharreau
Molecular Ecology Notes, 2001, 1 (1/2), pp.19-21. ⟨10.1046/j.1471-8278.2000.00008.x⟩
Journal articles hal-02676586v1

QTL analysis of field resistance to Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in cassava

Véronique V. Jorge , Martin Fregene , M. Velez , Myriam C. Duque , Joe Tohme
TAG Theoretical and Applied Genetics, 2001, 102 (4), pp.564-571. ⟨10.1007/s001220051683⟩
Journal articles hal-02678591v1

Genetic mapping of resistance to bacterial blight disease in cassava (Manihot esculenta Crantz)

Véronique V. Jorge , Martin A. Fregene , Myriam C. Duque , Merideth W. Bonierbale , Joe Tohme
TAG Theoretical and Applied Genetics, 2000, 101 (5/6), pp.865-872. ⟨10.1007/s001220051554⟩
Journal articles hal-02695548v1
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Marqueurs moléculaires : intérêt et utilisation pour l'amélioration et la conservation de arbres forestiers

Vanina Guérin , Véronique Jorge
Agrosciences, Environnement, Territoires, Paysage, Forêt - Parcours Biologie Intégrative et Changement Globaux (BICG), 2019
Lectures hal-02789231v1
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Development and use of molecular markers for characterisation of Forest Genetic Resources and for Breeding : a case study, Black poplar (Populus nigra L.)

Véronique Jorge
Master. Advanced Studies in Environmental Interactions (DPPS-105) 2018: Engineered Plant Immunity, 2018
Lectures hal-02789398v1
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Genome scans (TD)

Véronique Jorge
Master. Agrosciences, Environnement, Territoires, Paysage, Forêt - Parcours Biologie Intégrative et Changement Globaux (BICG) (UE Génomique des populations), 2018
Lectures hal-02787572v1
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Genome scans (Cours)

Véronique Jorge
Master. Agrosciences, Environnement, Territoires, Paysage, Forêt - Parcours Biologie Intégrative et Changement Globaux (BICG) (UE Génomique des populations), 2018
Lectures hal-02785579v1
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Atelier Mesure de la diversité génétique par le phénotype

Véronique Jorge
Maison Pour la Science - Action "La forêt: un écosystème fragile géré par l'homme", 2016
Lectures hal-02801280v1
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Recherche de parenté chez les arbres forestiers

Véronique Jorge
Maison Pour la Science (La forêt : un écosystème fragile géré par l'homme), 2015
Lectures hal-02795037v1
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Déterminisme génétique de caractères complexes chez les arbres forestiers : un exemple chez les peupliers

Véronique V. Jorge
Master. Master bioingénieur Gestion des forêts et des espaces naturels (Déterminisme génétique de caractères complexes chez les arbres forestiers : un exemple chez les peupliers), 2014
Lectures hal-02798078v1
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Les métiers à l'INRA

Véronique V. Jorge , Christine Rety
Licence. Licence Biologie, 2011
Lectures hal-02805056v1
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Workshop : Comparative mapping in Salicaceae

Véronique Jorge
3rd cycle. (Workshop : Comparative mapping in Salicaceae), 2010
Lectures hal-02818186v1
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La Sélection Assistée par Marqueurs: application chez le peuplier

Véronique Jorge
Master. Formation Ingénieur Forestier (FIF) de l’ENGREF, 2002
Lectures hal-02831305v1