Véronique Jorge

Chargée de Recherche Hors Classe, Directrice Adjointe
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Affiliation actuelle
  • Biologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt (BioForA)
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AXES de RECHERCHE

Mes activités de recherches s’inscrivent dans deux axes thématiques visant à :

(1) Déterminer l’architecture génétique de caractères complexes les peupliers en vue d’utiliser ces gènes (marqueurs) dans les programmes de sélection développés dans l’unité sur cet arbre modèle ;

(2) Etudier la diversité et la structure génétique des populations de peuplier noir.

Dans le cadre de projets collaboratifs européens et nationaux, (EVOLTREE, Noveltree, GenTree), j’ai ainsi contribué significativement à l’acquisition de données de séquence de génomes entiers, de polymorphismes et de génotypage permettant de développer ces deux thématiques.

Thématique 1 : j’utilise des approches de génétique d’association et de cartographie génétique basées sur l’obtention et l’étude de pédigrés plus ou moins complexes. L’un des objectifs à terme est de générer des informations d’effets aux QTL qui peuvent être utilisés dans les programmes de sélection et servir à l’établissement de nouveaux modèles de sélection génomique.

Thématique 2 : je suis impliquée depuis 2004 dans la description de la diversité et de sa structuration des populations de peuplier noir à l’échelle française et européenne à l’aide de marqueurs moléculaires. Cette activité a pris de l’ampleur avec les développements du séquençage haut débit et me permet aujourd’hui d’étudier plus finement les facteurs structurant la diversité du peuplier noir à l’échelle européenne.

CURSUS

2000-2001: Stage postdoctoral, Laboratoire “Génomes et développement des Plantes", Université de Perpignan, France.

1996-2000: Thèse en Phytopathologie : "Cartographie de la résistance du manioc (Manihot esculenta Crantz) à la bactériose vasculaire causée par Xanthomonas axonopodis pv. manihotis" - Université Paris XI. Lieu d'exécution des travaux de thèse : Laboratoires de Biotechnologie et de Pathologie du Manioc, C.I.A.T., A.A. 6713, Cali, Colombie.

1995-1996: D. E. A. "Biologie, Diversité et Adaptation des Plantes Cultivées, Option Phytopathologie"- Université Paris XI, France.

1994-1995 : Maîtrise de Biologie Végétale, Université Paris XI, France.

1990-1994 : Licence de Biologie Végétale, Université Paris XI, France.

Domaines de recherche

Génétique des plantes Génétique des populations [q-bio.PE]

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Publications

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Resilience of genetic diversity in forest trees over the Quaternary

Pascal Milesi , Chedly Kastally , Benjamin Dauphin , Sandra Cervantes , Francesca Bagnoli et al.
Nature Communications, 2024, 15 (1), pp.8538. ⟨10.1038/s41467-024-52612-y⟩
Article dans une revue hal-04746980 v1
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RNAseq based variant dataset in a black poplar association panel

Odile Rogier , Aurélien Chateigner , Marie-Claude Lesage-Descauses , Claire Mandin , Véronique Brunaud et al.
BMC Research Notes, 2023, 16, pp.248. ⟨10.1186/s13104-023-06521-w⟩
Article dans une revue hal-04225417 v1
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Between but Not Within-Species Variation in the Distribution of Fitness Effects

Jennifer James , Chedly Kastally , Katharina B Budde , Santiago C. Gonzalez-Martinez , Pascal Milesi et al.
Molecular Biology and Evolution, 2023, 40 (11), ⟨10.1093/molbev/msad228⟩
Article dans une revue hal-04598142 v1
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Diversity and enrichment of breeding material for resilience in European forests

Sanna Olsson , Benjamin Dauphin , Véronique Jorge , Delphine Grivet , Anna Maria Farsakoglou et al.
Forest Ecology and Management, 2023, 530, pp.120748. ⟨10.1016/j.foreco.2022.120748⟩
Article dans une revue hal-04118477 v1
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The GenTree Leaf Collection: Inter‐ and intraspecific leaf variation in seven forest tree species in Europe

Raquel Benavides , Bárbara Carvalho , Cristina Bastias , David López‐quiroga , Antonio Mas et al.
Global Ecology and Biogeography, 2021, 30 (3), pp.590-597. ⟨10.1111/geb.13239⟩
Article dans une revue (data paper) hal-03282266 v1
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The GenTree Platform: growth traits and tree-level environmental data in 12 European forest tree species

Lars Opgenoorth , Benjamin Dauphin , Raquel Benavides , Katrin Heer , Paraskevi Alizoti et al.
GigaScience, 2021, 10 (3), pp.giab010. ⟨10.1093/gigascience/giab010⟩
Article dans une revue (data paper) hal-03282821 v1
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Favorable Conditions for Genomic Evaluation to Outperform Classical Pedigree Evaluation Highlighted by a Proof-of-Concept Study in Poplar

Marie Pégard , Vincent Segura , Facundo Muñoz , Catherine Bastien , Véronique Jorge et al.
Frontiers in Plant Science, 2020, 11, ⟨10.3389/fpls.2020.581954⟩
Article dans une revue hal-03025048 v1
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Gene expression predictions and networks in natural populations supports the omnigenic theory

Aurélien Chateigner , Marie-Claude Lesage-Descauses , Odile Rogier , Véronique Jorge , Jean-Charles Leplé et al.
BMC Genomics, 2020, 21 (1), pp.1-16. ⟨10.1186/s12864-020-06809-2⟩
Article dans une revue hal-02902844 v1
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Sequence imputation from low density single nucleotide polymorphism panel in a black poplar breeding population

Marie Pegard , Odile Rogier , Aurélie Berard , Patricia Faivre-Rampant , Marie-Christine Le Paslier et al.
BMC Genomics, 2019, 20, ⟨10.1186/s12864-019-5660-y⟩
Article dans une revue hal-02621320 v1
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Accuracy of RNAseq based SNP discovery and genotyping in Populus nigra

Odile Rogier , Aurélien Chateigner , Souhila Amanzougarene , Marie-Claude Lesage Descauses , Sandrine Balzergue et al.
BMC Genomics, 2018, 19, pp.909. ⟨10.1186/s12864-018-5239-z⟩
Article dans une revue hal-02622249 v1

Narrow-sense heritability and P-ST estimates of DNA methylation in three Populus nigra L. populations under contrasting water availability

Mamadou Dia Sow , Vincent Segura , Sylvain Chamaillard , Véronique Jorge , Alain Delaunay et al.
Tree Genetics and Genomes, 2018, 14 (5), ⟨10.1007/s11295-018-1293-6⟩
Article dans une revue hal-02624096 v1
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New resources for genetic studies in Populus nigra: genome-wide SNP discovery and development of a 12k Infinium array

Patricia P. Faivre-Rampant , Giusi Zaina , Véronique V. Jorge , Stefania Giacomello , Vincent Segura et al.
Molecular Ecology Resources, 2016, 16 (4), pp.1023-1036. ⟨10.1111/1755-0998.12513⟩
Article dans une revue istex hal-02636258 v1
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Characterization of the poplar pan-genome by genome-wide identification of structural variation.

Sara Pinosio , Stefania Giacomello , Patricia P. Faivre-Rampant , Gail Taylor , Véronique V. Jorge et al.
Molecular Biology and Evolution, 2016, 33 (10), pp.2706-2719. ⟨10.1093/molbev/msw161⟩
Article dans une revue hal-02636741 v1
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Potential for Marker-Assisted Selection for forest tree breeding: lessons from 20 years of MAS in crops

Helene Muranty , Véronique V. Jorge , Catherine Bastien , Camille Lepoittevin , Laurent Bouffier et al.
Tree Genetics and Genomes, 2014, 10 (6), pp.1491-1510. ⟨10.1007/s11295-014-0790-5⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-02635335 v1
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Integrating genome annotation and QTL position to identify candidate genes for productivity, architecture and water-use efficiency in Populus spp

Romain Monclus , Jean-Charles Leplé , Catherine Bastien , Pierre-François P.-F. Bert , Marc M. Villar et al.
BMC Plant Biology, 2012, 12, ⟨10.1186/1471-2229-12-173⟩
Article dans une revue hal-02647348 v1

The obscure events contributing to the evolution of an incipient sex chromosome in Populus: a retrospective working hypothesis

Gerald Tuskan , Steve Difazio , Patricia Faivre-Rampant , Muriel Gaudet , Antoine Harfouche et al.
Tree Genetics and Genomes, 2012, 8 (3), pp.559-571. ⟨10.1007/s11295-012-0495-6⟩
Article dans une revue hal-01267797 v1

Bud set in poplar – genetic dissection of a complex trait in natural and hybrid populations

Antje Rohde , Véronique Storme , Véronique V. Jorge , Muriel Gaudet , Nicola Vitacolonna et al.
New Phytologist, 2011, 189 (1), pp.106-121. ⟨10.1111/j.1469-8137.2010.03469.x⟩
Article dans une revue hal-02652178 v1

Qualitative and quantitative resistances to leaf rust finely mapped within two nucleotide-binding site leucine-rich repeat (NBS-LRR)-rich genomic regions of chromosome 19 in poplar

Alois Bresson , Véronique V. Jorge , Arnaud A. Dowkiw , Vanina Guérin , Isabelle Bourgait et al.
New Phytologist, 2011, 192 (1), pp.151-163. ⟨10.1111/j.1469-8137.2011.03786.x⟩
Article dans une revue hal-02652374 v1

Identification of quantitative trait loci affecting ectomycorrhizal symbiosis in an interspecific F1 poplar cross and differential expression of genes in ectomycorrhizas of the two parents: Populus deltoides and Populus trichocarpa

Jessy Labbé , Véronique V. Jorge , Annegret Kohler , Patrice Vion , Benoit Marçais et al.
Tree Genetics and Genomes, 2011, 7 (3), pp.617-627. ⟨10.1007/s11295-010-0361-3⟩
Article dans une revue istex hal-02652297 v1

Genetic linkage maps of Populus alba L. and comparative mapping analysis of sex determination across Populus species

Isabella Paolucci , Muriel Gaudet , Véronique V. Jorge , Isacco Beritognolo , Serena Terzoli et al.
Tree Genetics and Genomes, 2010, 6 (6), pp.863-875. ⟨10.1007/s11295-010-0297-7⟩
Article dans une revue istex hal-02663110 v1

Genetic linkage maps of Populus nigra L. including AFLPs, SSRs, SNPs, and sex trait

Muriel Gaudet , Véronique V. Jorge , Isabella Paolucci , Isacco Beritognolo , Giuseppe Scarascia Mugnozza et al.
Tree Genetics and Genomes, 2008, 4 (1), pp.25-36. ⟨10.1007/s11295-007-0085-1⟩
Article dans une revue istex hal-02660529 v1

Genetic architecture of qualitative and quantitative Melampsora larici-populina leaf rust resistance in hybrid poplar: genetic mapping and QTL detection

Véronique V. Jorge , Arnaud A. Dowkiw , Patricia P. Faivre-Rampant , Catherine Bastien
New Phytologist, 2005, 167 (1), pp.113-127. ⟨10.1111/j.1469-8137.2005.01424.x⟩
Article dans une revue hal-02678676 v1

A unigene catalogue of 5700 expressed genes in cassava.

Camilo Lopez , Véronique Jorge , Benoit Piegu , Chickelu Mba , Diego Cortes et al.
Plant Molecular Biology, 2004, 56 (4), pp.541-54. ⟨10.1007/s11103-004-0123-4⟩
Article dans une revue istex hal-00168792 v1
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Identification of pathotypes of Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in Africa and detection of quantitative trait loci and markers for resistance to bacterial blight of Cassava

Kerstin Wydra , Valerien Zinsou , Véronique V. Jorge , Valérie Verdier
Phytopathology, 2004, 94 (10), pp.1084-1093
Article dans une revue hal-02677399 v1

Amélioration génétique des peupliers

Catherine Bastien , Véronique V. Jorge , Arnaud A. Dowkiw , Marc M. Villar , Patricia P. Faivre-Rampant
Biofutur, 2004, 23 (247), pp.33-37
Article dans une revue hal-02672140 v1

Recent progress in the characterization of molecular determinants in the Xanthomonas axonopodis pv. manihotis-cassava interaction.

Valérie Verdier , Silvia Restrepo , Gloria Mosquera , Véronique Jorge , Camilo Lopez
Plant Molecular Biology, 2004, 56 (4), pp.573-84. ⟨10.1007/s11103-004-5044-8⟩
Article dans une revue istex hal-00169054 v1

Recent progress in the characterization of molecular determinants in the Xanthomonas axonopodis pv. manihotis-cassava interaction

Valérie Verdier , Silvia Restrepo , Gloria M Mosquera , Véronique Jorge , Camilo López
Plant Molecular Biology, 2004, 56, pp.573-584
Article dans une revue hal-04639806 v1

An EST resource for cassava and other species of Euphorbiaceae.

James V Anderson , Michel Delseny , Martin A Fregene , Veronique Jorge , Chikelu Mba et al.
Plant Molecular Biology, 2004, 56 (4), pp.527-39. ⟨10.1007/s11103-004-5046-6⟩
Article dans une revue istex hal-00169060 v1

Qualitative and quantitative evaluation of cassava bacterial blight resistance in F1 progeny of a cross between elite cassava clones

Véronique V. Jorge , Valérie Verdier
Euphytica, 2002, 123 (1), pp.41-48. ⟨10.1023/A:1014400823817⟩
Article dans une revue istex hal-02681929 v1

Sequence characterized amplified region markers for the rice blast fungus, Magnaporthe grisea

O. Soubabère , Véronique V. Jorge , Jean-Loup Notteghem , Marc-Henri Lebrun , Didier Tharreau
Molecular Ecology Notes, 2001, 1 (1/2), pp.19-21. ⟨10.1046/j.1471-8278.2000.00008.x⟩
Article dans une revue istex hal-02676586 v1

QTL analysis of field resistance to Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in cassava

Véronique V. Jorge , Martin Fregene , M. Velez , Myriam C. Duque , Joe Tohme et al.
TAG Theoretical and Applied Genetics, 2001, 102 (4), pp.564-571. ⟨10.1007/s001220051683⟩
Article dans une revue istex hal-02678591 v1

Genetic mapping of resistance to bacterial blight disease in cassava (Manihot esculenta Crantz)

Véronique V. Jorge , Martin A. Fregene , Myriam C. Duque , Merideth W. Bonierbale , Joe Tohme et al.
TAG Theoretical and Applied Genetics, 2000, 101 (5/6), pp.865-872. ⟨10.1007/s001220051554⟩
Article dans une revue hal-02695548 v1
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Marqueurs moléculaires : intérêt et utilisation pour l'amélioration et la conservation de arbres forestiers

Vanina Guérin , Véronique Jorge
Agrosciences, Environnement, Territoires, Paysage, Forêt - Parcours Biologie Intégrative et Changement Globaux (BICG), 2019
Cours hal-02789231 v1
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Development and use of molecular markers for characterisation of Forest Genetic Resources and for Breeding : a case study, Black poplar (Populus nigra L.)

Véronique Jorge
Master. Advanced Studies in Environmental Interactions (DPPS-105) 2018: Engineered Plant Immunity, 2018
Cours hal-02789398 v1
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Genome scans (Cours)

Véronique Jorge
Master. Agrosciences, Environnement, Territoires, Paysage, Forêt - Parcours Biologie Intégrative et Changement Globaux (BICG) (UE Génomique des populations), 2018
Cours hal-02785579 v1
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Genome scans (TD)

Véronique Jorge
Master. Agrosciences, Environnement, Territoires, Paysage, Forêt - Parcours Biologie Intégrative et Changement Globaux (BICG) (UE Génomique des populations), 2018
Cours hal-02787572 v1
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Atelier Mesure de la diversité génétique par le phénotype

Véronique Jorge
Maison Pour la Science - Action "La forêt: un écosystème fragile géré par l'homme", 2016
Cours hal-02801280 v1
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Recherche de parenté chez les arbres forestiers

Véronique Jorge
Maison Pour la Science (La forêt : un écosystème fragile géré par l'homme), 2015
Cours hal-02795037 v1
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Déterminisme génétique de caractères complexes chez les arbres forestiers : un exemple chez les peupliers

Véronique V. Jorge
Master. Master bioingénieur Gestion des forêts et des espaces naturels (Déterminisme génétique de caractères complexes chez les arbres forestiers : un exemple chez les peupliers), 2014
Cours hal-02798078 v1
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Les métiers à l'INRA

Véronique V. Jorge , Christine Rety
Licence. Licence Biologie, 2011
Cours hal-02805056 v1
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Workshop : Comparative mapping in Salicaceae

Véronique Jorge
3rd cycle. (Workshop : Comparative mapping in Salicaceae), 2010
Cours hal-02818186 v1
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La Sélection Assistée par Marqueurs: application chez le peuplier

Véronique Jorge
Master. Formation Ingénieur Forestier (FIF) de l’ENGREF, 2002
Cours hal-02831305 v1