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Véronique LEFEBVRE

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Présentation

Je suis directrice de recherche à INRAE (France), dans l'unité GAFL en Avignon, responsable de l’équipe « Résistance aux bio-agresseurs : diversité et durabilité ». Mes travaux de recherche visent à décortiquer les bases génétiques et moléculaires des interactions plante-parasite-environnement. L’enjeu est de proposer des outils d’aide à la sélection variétale et à la transition agroécologique afin d’assurer la gestion durable de l’immunité des plantes vis-à-vis de leurs agents pathogènes. Ces travaux portent sur la résistance des Solanacées (piment, pomme de terre, tomate) vis-à-vis de leurs agents pathogènes, et plus particulièrement vis-à-vis des oomycètes *Phytophthora infestans* et *P. capsici*, responsables des mildious, de l’ascomycète *Leveillula taurica*, responsable des oïdiums, des virus (*Potato virus Y*, *Cucumber mosaic virus*) et des nématodes (*Globodera palida*, *Meloidogyne incognita*). Ils s’appuient sur les ressources génétiques scientifiques et patrimoniales des Solanacées, ce qui m’amène à conduire en parallèle des travaux génériques sur la génomique du piment et les processus de domestication de cette espèce. Mes travaux s’articulent autour de 3 thématiques : · Comprendre l’effet de l’environnement abiotique sur l’efficacité, la robustesse et la durabilité de l’immunité, · Comprendre le rôle des déterminants génétiques de l’hôte sur la dynamique adaptative des parasites et l’émergence de nouvelles épidémies, · Intégrer les connaissances génomiques et génétiques chez le piment pour accélérer la découverte de gènes d’intérêt.
I am a research director at INRAE (France), in the GAFL unit in Avignon, in charge of the team " Resistance to pests and pathogens, Diversity and Durability". My research work aims to unravel the genetic and molecular basis of plant-parasite-environment interactions. The challenge is to propose tools to assist varietal selection and agroecological transition in order to ensure the sustainable management of plant immunity to their pathogens. This work focuses on the resistance of Solanaceae (pepper, potato, tomato) to their pathogens, and more particularly to the oomycetes *Phytophthora infestans* and *P. capsici*, which are responsible for mildew, the ascomycete *Leveillula taurica*, which is responsible for powdery mildew, viruses (*Potato virus Y*, *Cucumber mosaic virus*) and nematodes (*Globodera palida*, *Meloidogyne incognita*). They are based on genetic resources of Solanaceae, which leads me to conduct in parallel generic work on the genomics of pepper and the domestication processes of this species. My work is organized in 3 axes: \- Understanding the effect of the abiotic environment on the efficiency, robustness and durability of immunity, \- Understanding the role of host genetic determinants on the adaptive dynamics of parasites and the emergence of new epidemics, \- Integrate genomic and genetic knowledge in pepper to accelerate the discovery of genes of agronomic interest.

Publications

jeremy-salinier
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The Human History of Chilli Peppers Told by 10,000 Genebank Samples

Mark Timothy Rabanus-Wallace , Pasquale Tripodi , Lorenzo Barchi , Sandip Mallikarjun Kale , Alberto Acquadro
Virtual Plant and Animal Genome XXIX Conference, Jan 2022, San Diego (CA), United States
Communication dans un congrès hal-03551615v1
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Worldwide Population Structure of Eggplant Identified by SPET Genotyping over 3,400 Accessions

Lorenzo Barchi , Ezio Portis , Sergio Lanteri , David Alonso , Maria José Diez
Virtual Plant and Animal Genome XXIX Conference, Jan 2022, San Diego (CA), United States
Communication dans un congrès hal-03551609v1
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Genebank genomics highlights novel centres of diversity and routes of migration in pepper (Capsicum spp.)

Pasquale Tripodi , Lorenzo Barchi , S Kale , S Esposito , M T Rabanus-Wallace
SOL International Meeting 2020, Nov 2020, on line, United States
Communication dans un congrès hal-03551675v1
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Single Primer Enrichment Genotyping Highlights the Worldwide Population Structure of Tomato and Eggplant Germplasm.

Lorenzo Barchi , Alberto Acquadro , Ezio Portis , Sergio Lanteri , David Alonso
XXVII Plant and Animal Genome Conference, Jan 2019, San Diego (CA), United States
Communication dans un congrès hal-03551688v1

Capsicum spp. and eggplant genome sequencing and resequencing provide new tools for the characterization of genetic resources

L Barchi , Acquadro A , E. Portis , Alonso D , P. Gramazio
17th Eucarpia Meeting on Genetics and Breeding of Capsicum and Eggplant, Sep 2019, Avignon, France
Communication dans un congrès hal-03551755v1
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Unlocking genomic diversity of pepper (Capsicum spp.) collections held in genebanks: perspectives for breeding and germplasm management

Tripodi P , L Barchi , Acquadro A , Schafleitner R , J. Prohens
. 17th Eucarpia Meeting on Genetics and Breeding of Capsicum and Eggplant, Sep 2019, Avignon, France. pp.1-3
Communication dans un congrès hal-03551764v1

Single Primer Enrichment genotyping highlights the worldwide population structure of tomato and eggplant germplasm.

Lorenzo Barchi , A. Acquadro , Ezio Portis , Sergio Lanteri , David Alonso
15th Solanaceae Conference, Sep 2018, Chiang Mai, Thailand
Communication dans un congrès hal-03551780v1