Victor Epain

Chercheur postdoc en biologie computationnelle à l'Université de Milano-Bicocca (Italie). Assemblage de génome, pangénomique | Programmation mathématique, programmation par contraintes | Algorithmique des graphes. Membre de l'association ALIA pour la liberté académique
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Affiliation actuelle
  • Università degli Studi di Milano-Bicocca = University of Milano-Bicocca (UNIMIB)
Identifiants chercheurs

Présentation

I am a 3rd year PhD student at Inria Rennes laboratory (FR), at the GenScale team. I am working on genome assembly and scaffolding. For this purpose, I am implementing graphs’ algorithms and graphs’ structures, and formalise these problems thanks to linear programming. I also play the piano. You can find here some improvisations ;)

Domaines de recherche

Informatique [cs] Bio-informatique [q-bio.QM]

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Publications

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Linear integer programming approach for chloroplast genome scaffolding

Victor Epain , Rumen Andonov
23ème congrès annuel de la Société Française de Recherche Opérationnelle et d'Aide à la Décision, INSA Lyon, Feb 2022, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-03558978 v1
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Optimal Scaffolding for Chloroplasts' Inverted Repeats

Victor Epain , Rumen Andonov , Dominique Lavenier
JOBIM2022, Jul 2022, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-03625229 v1
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Optimal de novo assemblies for chloroplast genomes based on inverted repeats patterns

Rumen Andonov , Victor Epain , Dominique Lavenier
BiATA 2021 - 4th International conference Bioinformatics: from Algorithms to Applications, Jul 2021, St. Petersbourg, Russia. pp.1-2
Communication dans un congrès hal-03534195 v1