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Annabelle Déjardin

Directrice de recherche, INRAE, Département ECODIV
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  • Biologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt (BioForA)
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Présentation

Physiologiste moléculaire, je mène des recherches pour décrypter les mécanismes moléculaires de la formation du bois ou xylogenèse, en utilisant le peuplier comme arbre modèle. Je développe des approches à l'échelle cellulaire (micro-phénotypage des parois secondaires et micro-transcriptomique - SnRNA-Seq). J'utilise des approches biotechnologiques - transgénèse et édition du génome- pour comprendre le rôle de certains gènes identifiés.

Je suis co-responsable de l'équipe GFP2 (Génomique Fonctionnelle, des Populations et Prédiction) de l'UMR BioForA. Je suis la directrice scientifique du PEPR Sélection Végétale Avancée depuis 2025.

Domaines de recherche

Biologie végétale Biotechnologies Génomique, Transcriptomique et Protéomique [q-bio.GN] Biologie moléculaire

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Publications

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Cinnamyl alcohol dehydrogenase downregulation in poplar wood increases saccharification after dilute acid pretreatment: a key role for lignin revealed by a multimodal investigation

Julien du Pasquier , Aya Zoghlami , Youri Naudin , Annabelle Déjardin , Gilles Pilate et al.

Biotechnology for Biofuels and Bioproducts, 2025, 18 (1), pp.30. ⟨10.1186/s13068-025-02623-8⟩

Article dans une revue hal-05018736v1
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Natural variation in chalcone isomerase defines a major locus controlling radial stem growth variation among Populus nigra populations

Harold Duruflé , Annabelle Déjardin , Véronique Jorge , Marie Pégard , Gilles Pilate et al.

Peer Community Journal, 2025, 5, pp.e50. ⟨10.24072/pcjournal.559⟩

Article dans une revue hal-05070106v1
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Perspective Can genome editing help transitioning to agroecology?

Fabien Nogué , Mathilde Causse , Philippe Debaeke , Annabelle Déjardin , Stéphane Lemarié et al.

iScience, 2024, 27 (3), pp.109159. ⟨10.1016/j.isci.2024.109159⟩

Article dans une revue hal-04508623v1
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RNAseq based variant dataset in a black poplar association panel

Odile Rogier , Aurélien Chateigner , Marie-Claude Lesage-Descauses , Claire Mandin , Véronique Brunaud et al.

BMC Research Notes, 2023, 16, pp.248. ⟨10.1186/s13104-023-06521-w⟩

Article dans une revue hal-04225417v1

Field and saccharification performances of poplars severely downregulated in CAD1

Barbara de Meester , Rebecca van Acker , Marlies Wouters , Silvia Traversari , Marijke Steenackers et al.

New Phytologist, 2022, 236 (6), pp.2075-2090. ⟨10.1111/nph.18366⟩

Article dans une revue hal-04031596v1
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Duplication of NRAMP3 gene in poplars generated two homologous transporters with distinct functions

Mathieu Pottier , van Anh Le Thi , Catherine Primard-Brisset , Jessica Marion , Michele Bianchi et al.

Molecular Biology and Evolution, 2022, BioRxiv, 39 (6), pp.msac129. ⟨10.1093/molbev/msac129⟩

Article dans une revue hal-03528379v1
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The PMT-driven p -coumaroylation of poplar lignins impacts lignin structure and improves wood saccharification

Catherine Lapierre , Richard Sibout , Françoise Laurans , Marie-Claude Lesage-Descauses , Annabelle Déjardin et al.

Plant Physiology, 2021, 187 (3), pp.1374-1386. ⟨10.1101/2021.02.16.431462⟩

Article dans une revue hal-03190443v1
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Simultaneous manipulation of lignin structure and secondary cell wall formation in transgenic poplar

X Nabuqi , X Nuoendagula , Sejirihu Wu , Naoki Takata , Shingo Sakamoto et al.

Journal of Wood Science, 2020, 66 (1), ⟨10.1186/s10086-020-01902-2⟩

Article dans une revue hal-02967389v1
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ATR-FTIR Microspectroscopy Brings a Novel Insight Into the Study of Cell Wall Chemistry at the Cellular Level

Clément Cuello , Paul Marchand , Françoise F. Laurans , Camille Grand-Perret , Veronique Laine-Prade et al.

Frontiers in Plant Science, 2020, 11, pp.105. ⟨10.3389/fpls.2020.00105⟩

Article dans une revue hal-02486559v1

Crop plants with improved culture and quality traits for food, feed and other uses

Fabien Nogué , Philippe Vergne , Anne-Marie Chèvre , Jean-Eric Chauvin , Oumaya Bouchabke-Coussa et al.

Transgenic Research, 2019, 28 (S2), pp.65-73. ⟨10.1007/s11248-019-00135-4⟩

Article dans une revue hal-02563918v1
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Analytical Py-GC/MS of Genetically Modified Poplar for the Increased Production of Bio-aromatics

Gorugantu Sribala , Hilal Ezgi Toraman , Steffen Symoens , Annabelle Déjardin , Gilles Pilate et al.

Computational and Structural Biotechnology Journal, 2019, 17, pp.599 - 610. ⟨10.1016/j.csbj.2019.04.007⟩

Article dans une revue hal-02622567v1

The effect of altered lignin composition on mechanical properties of CINNAMYL ALCOHOL DEHYDROGENASE (CAD) deficient poplars

Merve Ozparpucu , Notburga Gierlinger , Ingo Burgert , Rebecca van Acker , Ruben Vanholme et al.

Planta, 2018, 247 (4), pp.887 - 897. ⟨10.1007/s00425-017-2828-z⟩

Article dans une revue hal-02621180v1
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Is the G-Layer a Tertiary Cell Wall?

Bruno Clair , Annabelle Dejardin , Gilles Pilate , Tancrède Alméras

Frontiers in Plant Science, 2018, 9, pp.623. ⟨10.3389/fpls.2018.00623⟩

Article dans une revue hal-01897601v1
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Opportunities for Innovation in Genetic Transformation of Forest Trees

Michael Nagle , Annabelle Dejardin , Gilles Pilate , Steven H. Strauss

Frontiers in Plant Science, 2018, 9, ⟨10.3389/fpls.2018.01443⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02622213v1
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Corrigendum: Opportunities for innovation in genetic transformation of forest trees (vol 9, 1443, 2018)

Michael Nagle , Annabelle Dejardin , Gilles Pilate , Steven H. Strauss

Frontiers in Plant Science, 2018, 9, ⟨10.3389/fpls.2018.01729⟩

Article dans une revue hal-02618177v1

Different Routes for Conifer- and Sinapaldehyde and Higher Saccharification upon Deficiency in the Dehydrogenase CAD1

Rebecca van Acker , Annabelle Dejardin , Sandrien Desmet , Lennart Hoengenaert , Ruben Vanholme et al.

Plant Physiology, 2017, 175 (3), pp.1018 - 1039. ⟨10.1104/pp.17.00834⟩

Article dans une revue hal-02624701v1

Non-cellulosic polysaccharide distribution during G-layer formation in poplar tension wood fibers: abundance of rhamnogalacturonan I and arabinogalactan proteins but no evidence of xyloglucan

Fernanda Trilstz Perassolo Guedes , Françoise Laurans , Bernard Quemener , Carole Antoine Assor , Véronique Laine-Prade et al.

Planta, 2017, 246 (5), pp.857-878. ⟨10.1007/s00425-017-2737-1⟩

Article dans une revue hal-01603838v1
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Forest tree genomics: 10 achievements from the past 10 years and future prospects

Christophe Plomion , Catherine Bastien , Marie-Béatrice Bogeat-Triboulot , Laurent Bouffier , Annabelle Déjardin et al.

Annals of Forest Science, 2016, 73 (1), pp.77-103. ⟨10.1007/s13595-015-0488-3⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-01330031v1
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Expression analysis of LIM gene family in poplar, toward an updated phylogenetic classification.

Dominique Arnaud , Annabelle Déjardin , Jean-Charles Leplé , Marie-Claude Lesage-Descauses , Nathalie Boizot et al.

BMC Research Notes, 2012, 5, pp.102. ⟨10.1186/1756-0500-5-102⟩

Article dans une revue hal-00721759v1
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Wood formation in Angiosperms

Annabelle Dejardin , Françoise F. Laurans , Dominique Arnaud , Christian Breton , Gilles G. Pilate et al.

Comptes Rendus. Biologies, 2010, 333 (4), pp.325-334. ⟨10.1016/j.crvi.2010.01.010⟩

Article dans une revue hal-02664282v1

Cloning and expression analysis of a wood-associated xylosidase gene (PtaBXL1) in poplar tension wood.

Raphael Decou , Sabine Lhernould , Françoise Laurans , Elodie Sulpice , Jean-Charles Leplé et al.

Phytochemistry, 2009, 70 (2), pp.163-72. ⟨10.1016/j.phytochem.2008.12.019⟩

Article dans une revue istex hal-00696082v1
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Genome-wide analysis of LIM gene family in Populus trichocarpa, Arabidopsis thaliana and Oryza sativa

Dominique Arnaud , Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé , Marie-Claude Lesage Descauses , Gilles G. Pilate

DNA Research, 2007, 14 (3), pp.1-14. ⟨10.1093/dnares/dsm013⟩

Article dans une revue hal-02666164v1

The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray)

Gerald A. Tuskan , Stephen Difazio , Stefan Jansson , Jörg Bohlmann , Igor Grigoriev et al.

Science, 2006, 313 (5793), pp.1596-1604. ⟨10.1126/science.1128691⟩

Article dans une revue hal-02669155v1

Physiologie de la formation des parois de fibres de bois

Françoise F. Laurans , Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé , Gilles G. Pilate

Revue des composites et des matériaux avancés = Journal of Composite and Advanced Materials, 2006, 16 (1), pp.25-40

Article dans une revue hal-02665320v1

Evidence for a protein transported through the secretory pathway en route to the higher plant chloroplast.

Arsenio Villajero , Stefan Burén , Susanne Larsson , Annabelle Déjardin , Magnus Monné et al.

Nature Cell Biology, 2005, 7(12) (12), pp.1224-1231. ⟨10.1038/ncb1330⟩

Article dans une revue hal-00016732v1

Tension wood as a model for functional genomics of wood formation

Gilles G. Pilate , Annabelle Dejardin , Françoise F. Laurans , Jean-Charles Leplé

New Phytologist, 2004, 164 (1), pp.63-72. ⟨10.1111/j.1469-8137.2004.01176.x⟩

Article dans une revue hal-02682383v1

Expressed Sequence Tags from Poplar Wood Tissues - A Comparative Analysis from Multiple Libraries

Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé , Marie-Claude Lesage Descauses , Guy Costa , Gilles G. Pilate

Plant Biology, 2004, 6 (1), pp.55-64. ⟨10.1055/s-2003-44744⟩

Article dans une revue istex hal-02681152v1

Transgénèse chez le peuplier : apport aux études sur la formation du bois

Gilles G. Pilate , Annabelle Dejardin , Daniel Cornu , Jean-Charles Leplé

Biofutur, 2004, 23 (247), pp.49-53

Article dans une revue hal-02681788v1

Poplar genes encoding fasciclin-like arabinogalactan proteins are highly expressed in tension wood

Florian Lafarguette , Jean-Charles Leplé , Annabelle Dejardin , Françoise F. Laurans , Guy Costa et al.

New Phytologist, 2004, 164 (1), pp.107-121. ⟨10.1111/j.1469-8137.2004.01175.x⟩

Article dans une revue hal-02682928v1

Physiologie et génomique de la formation du bois

Jean-Charles Leplé , Annabelle Dejardin , Françoise F. Laurans , Gilles G. Pilate , Nadia Goué et al.

Biofutur, 2004, 247, pp.43-48

Article dans une revue hal-02679521v1

Sugar/osmoticum levels modulate differential abscisic acid-independent expression of two stress-responsive sucrose synthase genes in Arabidopsis

Annabelle Déjardin , Lubomir Sokolov , Leszek Kleczkowski

Biochemical Journal, 1999, 344 (2), pp.503-509. ⟨10.1042/bj3440503⟩

Article dans une revue hal-02967581v1

Mutations at therug4locus alter the carbon and nitrogen metabolism of pea plants through an effect on sucrose synthase

Josephine Craig , Paul Barratt , Helma Tatge , Annabelle Déjardin , Linda Handley et al.

The Plant Journal, 1999, 17 (4), pp.353-362. ⟨10.1046/j.1365-313X.1999.00382.x⟩

Article dans une revue hal-02967569v1

Sugars and light/dark exposure trigger differential regulation of ADP-glucose pyrophosphorylase genes in Arabidopsis thaliana (thale cress)

Lubomir Sokolov , Annabelle Déjardin , Leszek Kleczkowski

Biochemical Journal, 1998, 336 (3), pp.681-687. ⟨10.1042/bj3360681⟩

Article dans une revue hal-02967590v1

Purification, characterization and physiological role of sucrose synthase in the pea seed coat (Pisum sativum L.)

Annabelle Dejardin , Christine Rochat , Sébastien Maugenest , J.P. Boutin

Planta, 1997, 201, pp.128-137

Article dans une revue hal-02688090v1

Molecular cloning and expression of the large subunit of ADP-glucose pyrophosphorylase from barley (Hordeumvulgare) leaves

Klaus Eimert , Cheng Luo , Annabelle Déjardin , Per Villand , Tine Thorbjørnsen et al.

Gene, 1997, 189 (1), pp.79-82. ⟨10.1016/S0378-1119(96)00837-2⟩

Article dans une revue istex hal-02967597v1

Differential Processing of Homologues of the Small Subunit of ADP-Glucose Pyrophosphorylase from Barley (Hordeum vulgare) Tissues

Cheng Luo , Annabelle Déjardin , Per Villand , Danny Doan , Leszek Kleczkowski

Zeitschrift fur Naturforschung C, 1997, 52 (11-12), pp.807-811. ⟨10.1515/znc-1997-11-1213⟩

Article dans une revue hal-03289505v1

Contribution of sucrose synthase, ADP-glucose pyrophosphorylase and starch synthase to starch synthesis in developing pea seeds

Annabelle Dejardin , Christine Rochat , Sylvie Wuillème , J.P. Boutin

Plant, Cell and Environment, 1997, 20, pp.1421-1430

Article dans une revue hal-02689522v1

Is sucrose synthase a key parameter in sink strength determination of the developping pea seed ?

Christine Rochat , Annabelle Dejardin , Sébastien Maugenest , Claire Lemontey , Bertrand Hirel et al.

Journal of Experimental Botany, 1996, 47, pp.1329

Article dans une revue hal-02684590v1

Role of the seed coat in the development of the pea embryo

A. Déjardin-Séry

Grain Légumes, 1996, 11, pp.9

Article dans une revue hal-02685603v1

Does sucrose synthase a reversible reaction in vivo in the pea seed coat ?

Annabelle Dejardin , Christine Rochat , J.P. Boutin

Journal of Experimental Botany, 1996, 47, pp.1307

Article dans une revue hal-02684592v1

Lessons from 25 Years of GM Tree Field Trials in Europe and Prospects for the Future

Gilles G. Pilate , Isabel Allona , Wout Boerjan , Annabelle Dejardin , Matthias Fladung et al.

Biosafety of Forest Transgenic Trees : Improving the Scientific Basis for Safe Tree Development and Implementation of EU Policy Directives, 82 (Chapter 4), Editions Springer, 2016, Forestry Sciences, 978-94-017-7529-8. ⟨10.1007/978-94-017-7531-1_4⟩

Chapitre d'ouvrage hal-02799990v1

Scientific research related to genetically modified trees

Armand Séguin , Denis Lachance , Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé , Gilles Pilate

Challenges and opportunities for the world’s forests in the 21st century, Section 6. Biotechnological approaches, 81, Editions Springer, 2014, Forestry Sciences, 978-94-007-7076-8. ⟨10.1007/978-94-007-7076-8_22⟩

Chapitre d'ouvrage hal-01268875v1
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Field Trials with Lignin-Modified Transgenic Trees. Chapter 1

Gilles Pilate , Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé

Lignins — Biosynthesis, Biodegradation and Bioengineering, 61, Academic Press - Elsevier, 2012, Advances in Botanical Research, 978-0-12-416023-1. ⟨10.1016/B978-0-12-416023-1.00001-X⟩

Chapitre d'ouvrage hal-01267883v1