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Annabelle Déjardin

Directrice de recherche, INRAE, Département ECODIV
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Affiliation actuelle
  • Biologie intégrée pour la valorisation de la diversité des Arbres et de la Forêt (BioForA)
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Présentation

Physiologiste moléculaire, je mène des recherches pour décrypter les mécanismes moléculaires de la formation du bois ou xylogenèse, en utilisant le peuplier comme arbre modèle. Je développe des approches à l'échelle cellulaire (micro-phénotypage des parois secondaires et micro-transcriptomique - SnRNA-Seq). J'utilise des approches biotechnologiques - transgénèse et édition du génome- pour comprendre le rôle de certains gènes identifiés.

Je suis co-responsable de l'équipe GFP2 (Génomique Fonctionnelle, des Populations et Prédiction) de l'UMR BioForA. Je suis la directrice scientifique du PEPR Sélection Végétale Avancée depuis 2025.

Domaines de recherche

Biologie végétale Biotechnologies Génomique, Transcriptomique et Protéomique [q-bio.GN] Biologie moléculaire

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Publications

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Cinnamyl alcohol dehydrogenase downregulation in poplar wood increases saccharification after dilute acid pretreatment: a key role for lignin revealed by a multimodal investigation

Julien du Pasquier , Aya Zoghlami , Youri Naudin , Annabelle Déjardin , Gilles Pilate et al.
Biotechnology for Biofuels and Bioproducts, 2025, 18 (1), pp.30. ⟨10.1186/s13068-025-02623-8⟩
Article dans une revue hal-05018736 v1
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Natural variation in chalcone isomerase defines a major locus controlling radial stem growth variation among Populus nigra populations

Harold Duruflé , Annabelle Déjardin , Véronique Jorge , Marie Pégard , Gilles Pilate et al.
Peer Community Journal, 2025, 5, pp.e50. ⟨10.24072/pcjournal.559⟩
Article dans une revue hal-05070106 v1
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Perspective Can genome editing help transitioning to agroecology?

Fabien Nogué , Mathilde Causse , Philippe Debaeke , Annabelle Déjardin , Stéphane Lemarié et al.
iScience, 2024, 27 (3), pp.109159. ⟨10.1016/j.isci.2024.109159⟩
Article dans une revue hal-04508623 v1

Field and saccharification performances of poplars severely downregulated in CAD1

Barbara de Meester , Rebecca van Acker , Marlies Wouters , Silvia Traversari , Marijke Steenackers et al.
New Phytologist, 2022, 236 (6), pp.2075-2090. ⟨10.1111/nph.18366⟩
Article dans une revue hal-04031596 v1
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Duplication of NRAMP3 gene in poplars generated two homologous transporters with distinct functions

Mathieu Pottier , van Anh Le Thi , Catherine Primard-Brisset , Jessica Marion , Michele Bianchi et al.
Molecular Biology and Evolution, 2022, BioRxiv, 39 (6), pp.msac129. ⟨10.1093/molbev/msac129⟩
Article dans une revue hal-03528379 v1
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The PMT-driven p -coumaroylation of poplar lignins impacts lignin structure and improves wood saccharification

Catherine Lapierre , Richard Sibout , Françoise Laurans , Marie-Claude Lesage-Descauses , Annabelle Déjardin et al.
Plant Physiology, 2021, 187 (3), pp.1374-1386. ⟨10.1101/2021.02.16.431462⟩
Article dans une revue hal-03190443 v1
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ATR-FTIR Microspectroscopy Brings a Novel Insight Into the Study of Cell Wall Chemistry at the Cellular Level

Clément Cuello , Paul Marchand , Françoise F. Laurans , Camille Grand-Perret , Veronique Laine-Prade et al.
Frontiers in Plant Science, 2020, 11, pp.105. ⟨10.3389/fpls.2020.00105⟩
Article dans une revue hal-02486559 v1
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Simultaneous manipulation of lignin structure and secondary cell wall formation in transgenic poplar

X Nabuqi , X Nuoendagula , Sejirihu Wu , Naoki Takata , Shingo Sakamoto et al.
Journal of Wood Science, 2020, 66 (1), ⟨10.1186/s10086-020-01902-2⟩
Article dans une revue hal-02967389 v1
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Analytical Py-GC/MS of Genetically Modified Poplar for the Increased Production of Bio-aromatics

Gorugantu Sribala , Hilal Ezgi Toraman , Steffen Symoens , Annabelle Déjardin , Gilles Pilate et al.
Computational and Structural Biotechnology Journal, 2019, 17, pp.599 - 610. ⟨10.1016/j.csbj.2019.04.007⟩
Article dans une revue hal-02622567 v1

Crop plants with improved culture and quality traits for food, feed and other uses

Fabien Nogué , Philippe Vergne , Anne-Marie Chèvre , Jean-Eric Chauvin , Oumaya Bouchabke-Coussa et al.
Transgenic Research, 2019, 28 (S2), pp.65-73. ⟨10.1007/s11248-019-00135-4⟩
Article dans une revue hal-02563918 v1
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Is the G-Layer a Tertiary Cell Wall?

Bruno Clair , Annabelle Dejardin , Gilles Pilate , Tancrède Alméras
Frontiers in Plant Science, 2018, 9, pp.623. ⟨10.3389/fpls.2018.00623⟩
Article dans une revue hal-01897601 v1

The effect of altered lignin composition on mechanical properties of CINNAMYL ALCOHOL DEHYDROGENASE (CAD) deficient poplars

Merve Ozparpucu , Notburga Gierlinger , Ingo Burgert , Rebecca van Acker , Ruben Vanholme et al.
Planta, 2018, 247 (4), pp.887 - 897. ⟨10.1007/s00425-017-2828-z⟩
Article dans une revue hal-02621180 v1
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Opportunities for Innovation in Genetic Transformation of Forest Trees

Michael Nagle , Annabelle Dejardin , Gilles Pilate , Steven H. Strauss
Frontiers in Plant Science, 2018, 9, ⟨10.3389/fpls.2018.01443⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-02622213 v1
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Corrigendum: Opportunities for innovation in genetic transformation of forest trees (vol 9, 1443, 2018)

Michael Nagle , Annabelle Dejardin , Gilles Pilate , Steven H. Strauss
Frontiers in Plant Science, 2018, 9, ⟨10.3389/fpls.2018.01729⟩
Article dans une revue hal-02618177 v1

Different Routes for Conifer- and Sinapaldehyde and Higher Saccharification upon Deficiency in the Dehydrogenase CAD1

Rebecca van Acker , Annabelle Dejardin , Sandrien Desmet , Lennart Hoengenaert , Ruben Vanholme et al.
Plant Physiology, 2017, 175 (3), pp.1018 - 1039. ⟨10.1104/pp.17.00834⟩
Article dans une revue hal-02624701 v1

Non-cellulosic polysaccharide distribution during G-layer formation in poplar tension wood fibers: abundance of rhamnogalacturonan I and arabinogalactan proteins but no evidence of xyloglucan

Fernanda Trilstz Perassolo Guedes , Françoise Laurans , Bernard Quemener , Carole Antoine Assor , Véronique Laine-Prade et al.
Planta, 2017, 246 (5), pp.857-878. ⟨10.1007/s00425-017-2737-1⟩
Article dans une revue hal-01603838 v1
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Forest tree genomics: 10 achievements from the past 10 years and future prospects

Christophe Plomion , Catherine Bastien , Marie-Béatrice Bogeat-Triboulot , Laurent Bouffier , Annabelle Déjardin et al.
Annals of Forest Science, 2016, 73 (1), pp.77-103. ⟨10.1007/s13595-015-0488-3⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01330031 v1
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Expression analysis of LIM gene family in poplar, toward an updated phylogenetic classification.

Dominique Arnaud , Annabelle Déjardin , Jean-Charles Leplé , Marie-Claude Lesage-Descauses , Nathalie Boizot et al.
BMC Research Notes, 2012, 5, pp.102. ⟨10.1186/1756-0500-5-102⟩
Article dans une revue hal-00721759 v1
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Wood formation in Angiosperms

Annabelle Dejardin , Françoise F. Laurans , Dominique Arnaud , Christian Breton , Gilles G. Pilate et al.
Comptes Rendus. Biologies, 2010, 333 (4), pp.325-334. ⟨10.1016/j.crvi.2010.01.010⟩
Article dans une revue hal-02664282 v1

Cloning and expression analysis of a wood-associated xylosidase gene (PtaBXL1) in poplar tension wood.

Raphael Decou , Sabine Lhernould , Françoise Laurans , Elodie Sulpice , Jean-Charles Leplé et al.
Phytochemistry, 2009, 70 (2), pp.163-72. ⟨10.1016/j.phytochem.2008.12.019⟩
Article dans une revue istex hal-00696082 v1
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Genome-wide analysis of LIM gene family in Populus trichocarpa, Arabidopsis thaliana and Oryza sativa

Dominique Arnaud , Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé , Marie-Claude Lesage Descauses , Gilles G. Pilate
DNA Research, 2007, 14 (3), pp.1-14. ⟨10.1093/dnares/dsm013⟩
Article dans une revue hal-02666164 v1

The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray)

Gerald A. Tuskan , Stephen Difazio , Stefan Jansson , Jörg Bohlmann , Igor Grigoriev et al.
Science, 2006, 313 (5793), pp.1596-1604. ⟨10.1126/science.1128691⟩
Article dans une revue hal-02669155 v1

Physiologie de la formation des parois de fibres de bois

Françoise F. Laurans , Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé , Gilles G. Pilate
Revue des composites et des matériaux avancés = Journal of Composite and Advanced Materials, 2006, 16 (1), pp.25-40
Article dans une revue hal-02665320 v1

Evidence for a protein transported through the secretory pathway en route to the higher plant chloroplast.

Arsenio Villajero , Stefan Burén , Susanne Larsson , Annabelle Déjardin , Magnus Monné et al.
Nature Cell Biology, 2005, 7(12) (12), pp.1224-1231. ⟨10.1038/ncb1330⟩
Article dans une revue hal-00016732 v1

Tension wood as a model for functional genomics of wood formation

Gilles G. Pilate , Annabelle Dejardin , Françoise F. Laurans , Jean-Charles Leplé
New Phytologist, 2004, 164 (1), pp.63-72. ⟨10.1111/j.1469-8137.2004.01176.x⟩
Article dans une revue hal-02682383 v1

Expressed Sequence Tags from Poplar Wood Tissues - A Comparative Analysis from Multiple Libraries

Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé , Marie-Claude Lesage Descauses , Guy Costa , Gilles G. Pilate
Plant Biology, 2004, 6 (1), pp.55-64. ⟨10.1055/s-2003-44744⟩
Article dans une revue istex hal-02681152 v1

Transgénèse chez le peuplier : apport aux études sur la formation du bois

Gilles G. Pilate , Annabelle Dejardin , Daniel Cornu , Jean-Charles Leplé
Biofutur, 2004, 23 (247), pp.49-53
Article dans une revue hal-02681788 v1

Physiologie et génomique de la formation du bois

Jean-Charles Leplé , Annabelle Dejardin , Françoise F. Laurans , Gilles G. Pilate , Nadia Goué et al.
Biofutur, 2004, 247, pp.43-48
Article dans une revue hal-02679521 v1

Poplar genes encoding fasciclin-like arabinogalactan proteins are highly expressed in tension wood

Florian Lafarguette , Jean-Charles Leplé , Annabelle Dejardin , Françoise F. Laurans , Guy Costa et al.
New Phytologist, 2004, 164 (1), pp.107-121. ⟨10.1111/j.1469-8137.2004.01175.x⟩
Article dans une revue hal-02682928 v1

Sugar/osmoticum levels modulate differential abscisic acid-independent expression of two stress-responsive sucrose synthase genes in Arabidopsis

Annabelle Déjardin , Lubomir Sokolov , Leszek Kleczkowski
Biochemical Journal, 1999, 344 (2), pp.503-509. ⟨10.1042/bj3440503⟩
Article dans une revue hal-02967581 v1

Mutations at therug4locus alter the carbon and nitrogen metabolism of pea plants through an effect on sucrose synthase

Josephine Craig , Paul Barratt , Helma Tatge , Annabelle Déjardin , Linda Handley et al.
The Plant Journal, 1999, 17 (4), pp.353-362. ⟨10.1046/j.1365-313X.1999.00382.x⟩
Article dans une revue hal-02967569 v1

Sugars and light/dark exposure trigger differential regulation of ADP-glucose pyrophosphorylase genes in Arabidopsis thaliana (thale cress)

Lubomir Sokolov , Annabelle Déjardin , Leszek Kleczkowski
Biochemical Journal, 1998, 336 (3), pp.681-687. ⟨10.1042/bj3360681⟩
Article dans une revue hal-02967590 v1

Purification, characterization and physiological role of sucrose synthase in the pea seed coat (Pisum sativum L.)

Annabelle Dejardin , Christine Rochat , Sébastien Maugenest , J.P. Boutin
Planta, 1997, 201, pp.128-137
Article dans une revue hal-02688090 v1

Molecular cloning and expression of the large subunit of ADP-glucose pyrophosphorylase from barley (Hordeumvulgare) leaves

Klaus Eimert , Cheng Luo , Annabelle Déjardin , Per Villand , Tine Thorbjørnsen et al.
Gene, 1997, 189 (1), pp.79-82. ⟨10.1016/S0378-1119(96)00837-2⟩
Article dans une revue istex hal-02967597 v1

Contribution of sucrose synthase, ADP-glucose pyrophosphorylase and starch synthase to starch synthesis in developing pea seeds

Annabelle Dejardin , Christine Rochat , Sylvie Wuillème , J.P. Boutin
Plant, Cell and Environment, 1997, 20, pp.1421-1430
Article dans une revue hal-02689522 v1

Differential Processing of Homologues of the Small Subunit of ADP-Glucose Pyrophosphorylase from Barley (Hordeum vulgare) Tissues

Cheng Luo , Annabelle Déjardin , Per Villand , Danny Doan , Leszek Kleczkowski
Zeitschrift fur Naturforschung C, 1997, 52 (11-12), pp.807-811. ⟨10.1515/znc-1997-11-1213⟩
Article dans une revue hal-03289505 v1

Is sucrose synthase a key parameter in sink strength determination of the developping pea seed ?

Christine Rochat , Annabelle Dejardin , Sébastien Maugenest , Claire Lemontey , Bertrand Hirel et al.
Journal of Experimental Botany, 1996, 47, pp.1329
Article dans une revue hal-02684590 v1

Role of the seed coat in the development of the pea embryo

A. Déjardin-Séry
Grain Légumes, 1996, 11, pp.9
Article dans une revue hal-02685603 v1

Does sucrose synthase a reversible reaction in vivo in the pea seed coat ?

Annabelle Dejardin , Christine Rochat , J.P. Boutin
Journal of Experimental Botany, 1996, 47, pp.1307
Article dans une revue hal-02684592 v1

Lessons from 25 Years of GM Tree Field Trials in Europe and Prospects for the Future

Gilles G. Pilate , Isabel Allona , Wout Boerjan , Annabelle Dejardin , Matthias Fladung et al.
Biosafety of Forest Transgenic Trees : Improving the Scientific Basis for Safe Tree Development and Implementation of EU Policy Directives, 82 (Chapter 4), Editions Springer, 2016, Forestry Sciences, 978-94-017-7529-8. ⟨10.1007/978-94-017-7531-1_4⟩
Chapitre d'ouvrage hal-02799990 v1

Scientific research related to genetically modified trees

Armand Séguin , Denis Lachance , Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé , Gilles Pilate
Challenges and opportunities for the world’s forests in the 21st century, Section 6. Biotechnological approaches, 81, Editions Springer, 2014, Forestry Sciences, 978-94-007-7076-8. ⟨10.1007/978-94-007-7076-8_22⟩
Chapitre d'ouvrage hal-01268875 v1
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Field Trials with Lignin-Modified Transgenic Trees. Chapter 1

Gilles Pilate , Annabelle Dejardin , Jean-Charles Leplé
Lignins — Biosynthesis, Biodegradation and Bioengineering, 61, Academic Press - Elsevier, 2012, Advances in Botanical Research, 978-0-12-416023-1. ⟨10.1016/B978-0-12-416023-1.00001-X⟩
Chapitre d'ouvrage hal-01267883 v1