Arnaud Chaumot

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RiverLy - Fonctionnement des hydrosystèmes (RiverLy)

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Development of an integrated multi-omic targeted workflow for Gammarus fossarum : a proof-of-concept application to study endocrine disruption in environmental species

Rémy de Boni , Delphine Arquier , Melanie Nguyen , Sophie Ayciriex , Davide Degli-Esposti et al.

International Journal of Environmental Analytical Chemistry, 2026, pp.1-29. ⟨10.1080/03067319.2026.2739413⟩

Article dans une revue hal-05782108v1

Characterization of the female molting cycle and embryonic development in Hyalella azteca : application for short-term reproductive toxicity assessment.

Thalita Tieko Silva , Olivier Geffard , Hervé Quéau , Laura Garnero , Rémi Wattier et al.

Environmental Toxicology and Chemistry, 2026, 45 (3), pp.698-709. ⟨10.1093/etojnl/vgag013⟩

Article dans une revue hal-05700625v1

Improving the identification of pesticide transformation products and assessing their ecotoxicity for aquatic organisms

Christelle Margoum , Joan Artigas , Pierre Benoit , Arnaud Chaumot , Marina Coquery et al.

Innovations Agronomiques, 2026, 105, pp.33-46. ⟨10.17180/ciag-2026-vol105-art04-GB⟩

Article dans une revue hal-05519115v1

N-Alkylpyridinium sulfonates as versatile scout compounds for multi-mode highly targeted metabolomics: Application to Gammarus fossarum

Remy de Boni , Delphine Arquier , Sophie Ayciriex , Arnaud Chaumot , Davide Degli-Esposti et al.

Journal of Chromatography B - Analytical Technologies in the Biomedical and Life Sciences, 2026, 1284, pp.125291. ⟨10.1016/j.jchromb.2026.125291⟩

Article dans une revue hal-05782096v1

Rank Ordering of Species Sensitivities to Chemicals: Discrepancies between Behavioral and Lethal Responses in Freshwater and Marine Invertebrates

Julien Mocq , George Ruck , Michaël Demortier , Flavie Brun , Romain Coulaud et al.

Environmental Science and Technology, 2025, 59 (38), pp.20156-20167. ⟨10.1021/acs.est.5c04457⟩

Article dans une revue hal-05268571v1

Neglected impacts of plant protection products on invertebrate aquatic biodiversity: a focus on eco-evolutionary processes

Marie-Agnès Coutellec , Arnaud Chaumot , Elliott Sucré

Environmental Science and Pollution Research, 2025, 32 (6), pp.2847-285. ⟨10.1007/s11356-024-32767-3⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-04501458v1

Correction to: Main conclusions and perspectives from the collective scientific assessment of the effects of plant protection products on biodiversity and ecosystem services along the land–sea continuum in France and French overseas territories

Stéphane Pesce , Laure Mamy , Wilfried Sanchez , Marcel Amichot , Joan Artigas et al.

Environmental Science and Pollution Research, 2025, 32 (8), pp.4927-4928. ⟨10.1007/s11356-025-36011-4⟩

Article dans une revue hal-05509978v1

Combined effects of parasitism and anthropogenic stressors on behaviour and biomarkers in the freshwater amphipod Gammarus fossarum: dominant and additive effects prevail.

Marie-Jeanne Perrot-Minnot , Olivier Geffard , Gwennaëlle Caillot , Patrice Noury , Arnaud Chaumot

Ecotoxicology and Environmental Safety, 2025, 305, pp.119220. ⟨10.1016/j.ecoenv.2025.119220⟩

Article dans une revue hal-05346818v1

Increased assimilation efficiency and mortality rate in Gammarus fossarum exposed to PVC microplastics

Nans Barthelemy , Florian Mermillod-Blondin , Anabelle Espeyte , Mohammad Wazne , Frédéric Hervant et al.

Environmental Pollution, 2025, 372, pp.126029. ⟨10.1016/j.envpol.2025.126029⟩

Article dans une revue hal-05099610v1

The use of copper as plant protection product contributes to environmental contamination and resulting impacts on terrestrial and aquatic biodiversity and ecosystem functions

Stéphane Pesce , Laure Mamy , Wilfried Sanchez , Joan Artigas , Annette Bérard et al.

Environmental Science and Pollution Research, 2025, 32 (6), pp.2830-2846. ⟨10.1007/s11356-024-32145-z⟩

Article dans une revue hal-04461684v1

National assessment of bioavailable contamination level using caged Gammarus fossarum (Crustacean): towards optimisation and extension of the list of monitored substances

Vivien Lecomte , Marina Coquery , Cécile Miège , Olivier Perceval , Arnaud Chaumot et al.

Environmental Sciences Europe , 2025, 37 (1), pp.154. ⟨10.1186/s12302-025-01203-9⟩

Article dans une revue hal-05598456v1

Cadmium tolerance is associated with tissue-specific plasticity of metallothionein gene expression in Gammarus fossarum field populations

Auréline Lalouette , Arnaud Chaumot , Louveline Lepeule , Karen Gaget , Nicolas Delorme et al.

Scientific Reports, 2025, 15 (1), pp.13913. ⟨10.1038/s41598-025-98937-6⟩

Article dans une revue hal-05068990v1

Mieux identifier les produits de transformation des pesticides et évaluer leur écotoxicité pour les organismes aquatiques

Christelle Margoum , Joan Artigas , Pierre Benoit , Arnaud Chaumot , Marina Coquery et al.

Innovations Agronomiques, 2025, 105, pp.36-49. ⟨10.17180/ciag-2025-vol105-art04⟩

Article dans une revue hal-05219655v1

Impacts of neonicotinoids on biodiversity: a critical review

Laure Mamy , Stéphane Pesce , Wilfried Sanchez , Stéphanie Aviron , Carole Bedos et al.

Environmental Science and Pollution Research, 2025, 32 (6), pp.2794-2829. ⟨10.1007/s11356-023-31032-3⟩

Article dans une revue hal-04321892v1

Multivariate Functional Data Analysis Uncovers Behavioral Fingerprints in Invertebrate Locomotor Response to Micropollutants

George Ruck , Jean-Baptiste Aubin , Alexandre Delétang , Didier Neuzeret , Olivier Geffard et al.

Environmental Science and Technology, 2025, 59 (47), pp.25163-25172. ⟨10.1021/acs.est.5c10192⟩

Article dans une revue hal-05379636v1

Main conclusions and perspectives from the collective scientific assessment of the effects of plant protection products on biodiversity and ecosystem services along the land–sea continuum in France and French overseas territories

Stéphane Pesce , Laure Mamy , Wilfried Sanchez , Marcel Amichot , Joan Artigas et al.

Environmental Science and Pollution Research, 2025, 32, pp.2757-2772. ⟨10.1007/s11356-023-26952-z⟩

Article dans une revue hal-04083391v1

Chronic metal contamination shapes the size structure of Gammarus fossarum populations in French headwater rivers

A. Lalouette , D. Degli Esposti , C. Colomb , L. Garnero , H. Quéau et al.

Ecotoxicology, 2024, 33 (7), pp.772-785. ⟨10.1007/s10646-024-02777-5⟩

Article dans une revue hal-04717939v1

ToF-SIMS imaging shows specific lipophilic vitamin alterations in chronic reprotoxicity caused by the emerging contaminant Pravastatin in Gammarus fossarum.

Tingting Fu , Valentina Calabrese , Anabelle Espeyte , Sarah Bancel , Hervé Quéau et al.

Aquatic Toxicology, 2024, 271, pp.106935. ⟨10.1016/j.aquatox.2024.106935⟩

Article dans une revue hal-04565127v1

Concomitant investigation of crustacean amphipods lipidome and metabolome during the molting cycle by Zeno SWATH data-independent acquisition coupled with electron activated dissociation and machine learning

Thomas Alexandre Brunet , Yohann Clément , Valentina Calabrese , Jérôme Lemoine , Olivier Geffard et al.

Analytica Chimica Acta, 2024, 1304, pp.342533. ⟨10.1016/j.aca.2024.342533⟩

Article dans une revue hal-04535105v1

Electron-activated dissociation (EAD) for the complementary annotation of metabolites and lipids through data-dependent acquisition analysis and feature-based molecular networking, applied to the sentinel amphipod Gammarus fossarum

Valentina Calabrese , Thomas Alexandre Brunet , Davide Degli-Esposti , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard et al.

Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2024, 416 (12), pp.2893-2911. ⟨10.1007/s00216-024-05232-w⟩

Article dans une revue hal-04507595v1

Proteogenomic reconstruction of organ-specific metabolic networks in an environmental sentinel species, the amphipod Gammarus fossarum

Natacha Koenig , Patrice Baa-Puyoulet , Amélie Lafont , Isis Lorenzo-Colina , Vincent Navratil et al.

Comparative Biochemistry and Physiology - Part D: Genomics and Proteomics, 2024, 52, pp.101323. ⟨10.1016/j.cbd.2024.101323⟩

Article dans une revue hal-04704294v1

Advancing environmental monitoring across the water continuum combining biomarker analysis in multiple sentinel species: A case study in the Seine-Normandie Basin (France)

Sylvain Slaby , Alain Geffard , Cédric Fisson , Matthieu Bonnevalle-Normand , Anne-Sophie Allonier-Fernandes et al.

Journal of Environmental Management, 2024, 358, pp.120784. ⟨10.1016/j.jenvman.2024.120784⟩

Article dans une revue hal-04542022v1

Identification and organ-specific patterns of expression of two metallothioneins in the sentinel species Gammarus fossarum

Davide Degli Esposti , Auréline Lalouette , Karen Gaget , Louveline Lepeule , Zineb Chaabi et al.

Comparative Biochemistry and Physiology. Part B, Biochemistry and Molecular Biology, 2024, 269, pp.110907. ⟨10.1016/j.cbpb.2023.110907⟩

Article dans une revue hal-04704318v1

Dynamic Multiple Reaction Monitoring of amphipod Gammarus fossarum caeca expands molecular information for understanding the impact of contaminants

Maxime Leprêtre , Arnaud Chaumot , Rayan Aboud , Nicolas Delorme , Anabelle Espeyte et al.

Science of the Total Environment, 2023, 893, pp.164875. ⟨10.1016/j.scitotenv.2023.164875⟩

Article dans une revue hal-04358369v1

Challenges and perspectives in MS-based omics approaches for ecotoxicology studies: An insight on Gammarids sentinel amphipods

Valentina Calabrese , Arnaud Salvador , Yohann Clément , Thomas Alexandre Brunet , Anabelle Espeyte et al.

Frontiers in Analytical Science, 2023, 3, pp.1118494. ⟨10.3389/frans.2023.1118494⟩

Article dans une revue hal-03986050v1

Acute toxicity of nanoplastics on Daphnia and Gammarus neonates: Effects of surface charge, heteroaggregation, and water properties

Zijiao Meng , Rémi Recoura-Massaquant , Arnaud Chaumot , Serge Stoll , Wei Liu

Science of the Total Environment, 2023, 854, pp.158763. ⟨10.1016/j.scitotenv.2022.158763⟩

Article dans une revue hal-03788333v1

Identifying the impact of toxicity on stream macroinvertebrate communities in a multi-stressor context based on national ecological and ecotoxicological monitoring databases

Noëlle Sarkis , Olivier Geffard , Yves Souchon , Jeremy Piffady , Adeline François et al.

Science of the Total Environment, 2023, 859, pp.160179. ⟨10.1016/j.scitotenv.2022.160179⟩

Article dans une revue hal-04001803v1

Organ-oriented proteogenomics functional atlas of three aquatic invertebrate sentinel species

Maxime Leprêtre , Davide Degli Esposti , Kevin Sugier , Anabelle Espeyte , Jean-Charles Gaillard et al.

Scientific Data , 2023, 10 (1), pp.643. ⟨10.1038/s41597-023-02545-w⟩

Article dans une revue (data paper) hal-04372093v1

Development of a multi-omics extraction method for ecotoxicology: investigation of the reproductive cycle of Gammarus fossarum

Julien Faugere , Thomas Alexandre Brunet , Yohann Clément , Anabelle Espeyte , Olivier Geffard et al.

Talanta, 2023, 253, pp.123806. ⟨10.1016/j.talanta.2022.123806⟩

Article dans une revue hal-03773623v1

Acclimation and transgenerational plasticity support increased cadmium tolerance in Gammarus populations exposed to natural metal contamination in headwater streams

Auréline Lalouette , Davide Degli Esposti , Laura Garnero , Maxime Allibert , Lysiane Dherret et al.

Science of the Total Environment, 2023, 903, pp.166216. ⟨10.1016/j.scitotenv.2023.166216⟩

Article dans une revue hal-04371960v1

Avoidance behaviour of aquatic macroinvertebrates for real-time detection of micropollutant surge in wastewater effluents

George Ruck , Alexandre Decamps , Jean-Baptiste Aubin , Hervé Quéau , Laura Garnero et al.

Water Research, 2023, 242, pp.120228. ⟨10.1016/j.watres.2023.120228⟩

Article dans une revue hal-04372023v1

Hypoxia is common in temperate headwaters and driven by hydrological extremes

Jacob Diamond , Florentina Moatar , Rémi Recoura-Massaquant , Arnaud Chaumot , Jay Zarnetske et al.

Ecological Indicators, 2023, 147, pp.109987. ⟨10.1016/j.ecolind.2023.109987⟩

Article dans une revue hal-04212038v1

From Extrapolation to Precision Chemical Hazard Assessment: The Ecdysone Receptor Case Study

Raquel Ruivo , João Sousa , Teresa Neuparth , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot et al.

Toxics, 2022, 10 (1), pp.8. ⟨10.3390/toxics10010006⟩

Article dans une revue hal-03788309v1

Pharmaceutical pollution of the world’s rivers

John Wilkinson , Alistair Boxall , Dana Kolpin , Kenneth Leung , Racliffe Lai et al.

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2022, 119 (8), ⟨10.1073/pnas.2113947119⟩

Article dans une revue hal-03788318v1

A critical review of effect modeling for ecological risk assessment of plant protection products

Floriane Larras , Sandrine Charles , Arnaud Chaumot , Céline Pélosi , Morgane Le Gall et al.

Environmental Science and Pollution Research, 2022, 29, pp.43448-43500. ⟨10.1007/s11356-022-19111-3⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-03713533v1

Generic Solving of Physiologically-based Kinetic Models in Support of Next Generation Risk Assessment Due to Chemicals

Sandrine Charles , Ophelia Gestin , Jérémie Bruset , Dominique Lamonica , Virgile Baudrot et al.

Journal of Exploratory Research in Pharmacology, 2022, 8 (2), pp.140-154. ⟨10.14218/JERP.2022.00043⟩

Article dans une revue hal-04468979v1

Metal bioavailable contamination engages richness decline, species turnover but unchanged functional diversity of stream macroinvertebrates at the scale of a French region

Benjamin Alric , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot

Environmental Pollution, 2022, 308, pp.119565. ⟨10.1016/j.envpol.2022.119565⟩

Article dans une revue hal-03788200v1

Multiple reaction monitoring mass spectrometry for the discovery of environmentally modulated proteins in an aquatic invertebrate sentinel species, Gammarus fossarum

Maxime Leprêtre , Olivier Geffard , Anabelle Espeyte , Julien Faugere , Sophie Ayciriex et al.

Environmental Pollution, 2022, 315, pp.120393. ⟨10.1016/j.envpol.2022.120393⟩

Article dans une revue hal-04045037v1

Interest of a multispecies approach in active biomonitoring: Application in the Meuse watershed

Audrey Catteau , Jean-Marc Porcher , Anne Bado-Nilles , Isabelle Bonnard , Marc Bonnard et al.

Science of the Total Environment, 2022, 808, pp.152148. ⟨10.1016/j.scitotenv.2021.152148⟩

Article dans une revue ineris-03563548v1

Determination of biomarkers threshold values and illustration of their use for the diagnostic in large-scale freshwater biomonitoring surveys

Maxime Leprêtre , Alain Geffard , Mélissa Palos Ladeiro , Odile Dedourge-Geffard , Elise David et al.

Environmental Sciences Europe , 2022, 34 (1), pp.115. ⟨10.1186/s12302-022-00692-2⟩

Article dans une revue hal-04047998v1

A meta-analysis of ecotoxicological models used for plant protection product risk assessment before their placing on the market

Floriane Larras , Rémy Beaudouin , Philippe Berny , Sandrine Charles , Arnaud Chaumot et al.

Science of the Total Environment, 2022, 844, pp.157003. ⟨10.1016/j.scitotenv.2022.157003⟩

Article dans une revue hal-03741237v1

Des bioessais écotoxicologiques in situ pour évaluer les impacts biologiques de la contamination chimique des cours d'eau nationaux : l'expérience du gammare

Arnaud Chaumot , Olivier Perceval , Rémi Recoura-Massaquant , Davide Degli Esposti , Olivier Geffard

Sciences Eaux & Territoires, 2021, 37, pp.88-91. ⟨10.14758/SET-REVUE.2021.4.16⟩

Article dans une revue hal-03601759v1

La biosurveillance active pour le suivi de l'état chimique des cours d’eau continentaux

Olivier Geffard , Marina Coquery , Rémi Recoura-Massaquant , Olivier Perceval , Dorothée Bolzan et al.

Sciences Eaux & Territoires, 2021, 37, pp.82-87. ⟨10.14758/SET-REVUE.2021.4.15⟩

Article dans une revue hal-03601278v1

Subcellular Distribution of Dietary Methyl-Mercury in Gammarus fossarum and Its Impact on the Amphipod Proteome

Claudia Cosio , Davide Degli-Esposti , Christine Almunia , Véronique Gaillet , Hervé Sartelet et al.

Environmental Science and Technology, 2021, 55 (15), pp.10514 - 10523. ⟨10.1021/acs.est.1c02385⟩

Article dans une revue hal-03376460v1

Quantification of multi-scale links of anthropogenic pressures with PAH and PCB bioavailable contamination in French freshwaters

Noëlle Sarkis , Chloé Meymy , Olivier Geffard , Yves Souchon , André Chandesris et al.

Water Research, 2021, 203, pp.117546. ⟨10.1016/j.watres.2021.117546⟩

Article dans une revue hal-03517299v1

Shotgun lipidomics and mass spectrometry imaging unveil diversity and dynamics in Gammarus fossarum lipid composition

Tingting Fu , Oskar Knittelfelder , Yohann Clément , Eric Testet , Nicolas Elie et al.

iScience, 2021, 24 (2), pp.1-44. ⟨10.1016/j.isci.2021.102115⟩

Article dans une revue hal-03134038v1

Co-expression network analysis identifies novel molecular pathways associated with cadmium and pyriproxyfen testicular toxicity in Gammarus fossarum

Natacha Koenig , Christine Almunia , Aurore Bonnal-Conduzorgues , Jean Armengaud , Arnaud Chaumot et al.

Aquatic Toxicology, 2021, 235, ⟨10.1016/j.aquatox.2021.105816⟩

Article dans une revue hal-03487859v1

Ardières‐Morcille in the Beaujolais, France: A research catchment dedicated to study of the transport and impacts of diffuse agricultural pollution in rivers

Véronique Gouy , Lucie Liger , Samira Ahrouch , Chloé Bonnineau , Nadia Carluer et al.

Hydrological Processes, 2021, 35 (10), pp.e14384. ⟨10.1002/hyp.14384⟩

Article dans une revue hal-03466902v1

Continental-scale patterns of hyper-cryptic diversity within the freshwater model taxon Gammarus fossarum (Crustacea, Amphipoda).

Rémi Wattier , Tomasz Mamos , Denis Copilaş-Ciocianu , Mišel Jelić , Anthony Ollivier et al.

Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.16536. ⟨10.1038/s41598-020-73739-0⟩

Article dans une revue hal-02970981v1

In situ isobaric lipid mapping by MALDI-ion mobility separation-mass spectrometry imaging

Tingting Fu , Janina Oetjen , Manuel Chapelle , Alexandre Verdu , Matthias Szesny et al.

Journal of Mass Spectrometry, 2020, 55 (9), pp.e4531. ⟨10.1002/jms.4531⟩

Article dans une revue hal-03113280v1

A “Population Dynamics” Perspective on the Delayed Life-History Effects of Environmental Contaminations: An Illustration with a Preliminary Study of Cadmium Transgenerational Effects over Three Generations in the Crustacean Gammarus

Pauline Cribiu , Alain Devaux , Laura Garnero , Khedidja Abbaci , Thérèse Bastide et al.

International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21 (13), pp.4704. ⟨10.3390/ijms21134704⟩

Article dans une revue hal-02921628v1

In Situ Reproductive Bioassay with Caged Gammarus fossarum (Crustacea): Part 2—Evaluating the Relevance of Using a Molt Cycle Temperature‐Dependent Model as a Reference to Assess Toxicity in Freshwater Monitoring

Christelle Lopes , Arnaud Chaumot , Benoit Xuereb , Romain Coulaud , Guillaume Jubeaux et al.

Environmental Toxicology and Chemistry, 2020, 39 (3), pp.678-691. ⟨10.1002/etc.4656⟩

Article dans une revue hal-03113305v1

How to quantify the links between bioavailable contamination in watercourses and pressures of anthropogenic land cover, contamination sources and hydromorphology at multiple scales?

Noëlle Sarkis , Olivier Geffard , Yves Souchon , André Chandesris , Martial Ferréol et al.

Science of the Total Environment, 2020, 735, pp.139492. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.139492⟩

Article dans une revue hal-03123651v1

Proteogenomics‐Guided Evaluation of RNA‐Seq Assembly and Protein Database Construction for Emergent Model Organisms

Yannick Cogne , Duarte Gouveia , Arnaud Chaumot , Davide Degli Esposti , Olivier Geffard et al.

Proteomics, 2020, 20 (10), pp.1-11. ⟨10.1002/pmic.201900261⟩

Article dans une revue hal-02922078v1

High-multiplexed monitoring of protein biomarkers in the sentinel Gammarus fossarum by targeted scout-MRM assay, a new vision for ecotoxicoproteomics

Julien Faugère , Duarte Gouveia , Sophie Ayciriex , Arnaud Chaumot , Christine Almunia et al.

Journal of Proteomics, 2020, 226, pp.103901. ⟨10.1016/j.jprot.2020.103901⟩

Article dans une revue hal-02903090v1

In Situ Reproductive Bioassay with Caged Gammarus fossarum (Crustacea): Part 1—Gauging the Confounding Influence of Temperature and Water Hardness

Arnaud Chaumot , Romain Coulaud , Olivier Adam , Herve Queau , Christelle Lopes et al.

Environmental Toxicology and Chemistry, 2020, 39 (3), pp.667-677. ⟨10.1002/etc.4655⟩

Article dans une revue hal-02921609v1

Combining proteogenomics and metaproteomics for deep taxonomic and functional characterization of microbiomes from a non-sequenced host

Duarte Gouveia , Olivier Pible , Karen Culotta , Virginie Jouffret , Olivier Geffard et al.

npj Biofilms and Microbiomes, 2020, 6 (1), pp.7. ⟨10.1038/s41522-020-0133-2⟩

Article dans une revue hal-02922047v1

De novo transcriptomes of 14 gammarid individuals for proteogenomic analysis of seven taxonomic groups

Yannick Cogne , Davide Degli Esposti , O. Pible , D. Gouveia , Adeline François et al.

Scientific Data , 2019, 6 (1), pp.7. ⟨10.1038/s41597-019-0192-5⟩

Article dans une revue (data paper) hal-02610005v1

Multi-substance indicators based on caged Gammarus bioaccumulation reveal the influence of chemical contamination on stream macroinvertebrate abundances across France

Benjamin Alric , Olivier Geffard , A. Chandesris , Martial Ferreol , Adeline François et al.

Environmental Science and Technology, 2019, 53 (10), pp.5906-5915. ⟨10.1021/acs.est.9b01271⟩

Article dans une revue hal-02609322v1

Nongenetic inheritance of increased Cd tolerance in a field Gammarus fossarum population: Parental exposure steers offspring sensitivity

A. Vigneron , Olivier Geffard , H. Quéau , Adeline François , Arnaud Chaumot

Aquatic Toxicology, 2019, 209, pp.91-98. ⟨10.1016/j.aquatox.2019.02.001⟩

Article dans une revue hal-02609321v1

Comparative proteomics in the wild: Accounting for intrapopulation variability improves describing proteome response in a Gammarus pulex field population exposed to cadmium

Yannick Cogne , Christine Almunia , Duarte Gouveia , Olivier Pible , Adeline François et al.

Aquatic Toxicology, 2019, 214, pp.105244. ⟨10.1016/j.aquatox.2019.105244⟩

Article dans une revue hal-02922064v1

Ecotoxicoproteomics: A decade of progress in our understanding of anthropogenic impact on the environment

Duarte Gouveia , Christine Almunia , Yannick Cogne , Olivier Pible , Davide Degli Esposti et al.

Journal of Proteomics, 2019, 198, pp.66-77. ⟨10.1016/j.jprot.2018.12.001⟩

Article dans une revue hal-02109172v1

Biomarkers as tools for monitoring within the Water Framework Directive context: concept, opinions and advancement of expertise

T. Milinkovitch , Olivier Geffard , Alain Geffard , Catherine Mouneyrac , Arnaud Chaumot et al.

Environmental Science and Pollution Research, 2019, 26, pp.32759-32763. ⟨10.1007/s11356-019-06434-x⟩

Article dans une revue hal-02610039v1

Assessment of sperm DNA integrity within the Palaemon longirostris (H. Milne-Edwards, 1837) population of the Seine estuary

Alexandre Erraud , Marc Bonnard , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot , Aurélie Duflot et al.

Environmental Pollution, 2019, 245, pp.485-493. ⟨10.1016/j.envpol.2018.11.006⟩

Article dans une revue hal-01918845v1

Co-expression network analysis identifies gonad- and embryo- associated protein modules in the sentinel species Gammarus fossarum

Davide Degli Esposti , Christine Almunia , Marc-Antoine Guery , Natacha Koenig , J. Armengaud et al.

Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.1-10. ⟨10.1038/s41598-019-44203-5⟩

Article dans une revue hal-02622270v1

Shotgun proteomics datasets acquired on Gammarus pulex animals sampled from the wild

D. Gouveia , Yannick Cogne , J.C. Gaillard , C. Almunia , O. Pible et al.

Data in Brief, 2019, 27, pp.6. ⟨10.1016/j.dib.2019.104650⟩

Article dans une revue (data paper) hal-02610033v1

On-Line Solid Phase Extraction Liquid Chromatography-Mass Spectrometry Method for Multiplexed Proteins Quantitation in an Ecotoxicology Test Specie: Gammarus fossarum

Aurore Charnot , Duarte Gouveia , Sophie Ayciriex , Jérôme Lemoine , J. Armengaud et al.

Journal of Applied Bioanalysis, 2018, 4 (3), pp.81-101. ⟨10.17145/jab.18.012⟩

Article dans une revue hal-01860702v1

Additive effect of calcium depletion and low resource quality on Gammarus fossarum (Crustacea, Amphipoda) life history traits

Marc Rollin , Romain Coulaud , Michael Danger , Benedicte Sohm , Justine Flayac et al.

Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (12), pp.11264 - 11280. ⟨10.1007/s11356-017-9390-x⟩

Article dans une revue hal-01917263v1

Digging deeper into the pyriproxyfen-response of the amphipod Gammarus fossarum with a next-generation ultra-high-field Orbitrap analyser: new perspectives for environmental toxicoproteomics

J. Trapp , D. Gouveia , C. Almunia , O. Pible , Davide Degli Esposti et al.

Frontiers in Environmental Science, 2018, 6, 31 p. ⟨10.3389/fenvs.2018.00054⟩

Article dans une revue hal-02074284v1

Interactive Effects of Pesticides and Nutrients on Microbial Communities Responsible of Litter Decomposition in Streams

Florent Rossi , Stéphane Pesce , Clarisse Mallet , Christelle Margoum , Arnaud Chaumot et al.

Frontiers in Microbiology, 2018, 9, pp.13. ⟨10.3389/fmicb.2018.02437⟩

Article dans une revue hal-01906322v1

Application of a multidisciplinary and integrative weight-of-evidence approach to a 1-year monitoring survey of the Seine River

Iris Barjhoux , Lise C. Fechner , Jérémie D. Lebrun , Adriana Anzil , Sophie Ayrault et al.

Environmental Science and Pollution Research, 2018, 25 (24), pp.23404-23429. ⟨10.1007/s11356-016-6993-6⟩

Article dans une revue hal-02153600v1

Natural variability and modulation by environmental stressors of global genomic cytosine methylation levels in a freshwater crustacean, Gammarus fossarum

Pauline Cribiu , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard , Jean-Luc Ravanat , Thérèse Bastide et al.

Aquatic Toxicology, 2018, 205, pp.11-18. ⟨10.1016/j.aquatox.2018.09.015⟩

Article dans une revue hal-01974768v1

Use of sperm DNA integrity as a marker for exposure to contamination in Palaemon serratus (Pennant 1777): Intrinsic variability, baseline level and in situ deployment

Alexandre Erraud , Marc Bonnard , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard , Aurelie Duflot et al.

Water Research, 2018, 132, pp.124-134. ⟨10.1016/j.watres.2017.12.057⟩

Article dans une revue hal-01917353v1

Identification, expression, and endocrine-disruption of three ecdysone-responsive genes in the sentinel species Gammarus fossarum

D. Gouveia , F. Bonneton , C. Almunia , J. Armengaud , H. Queau et al.

Scientific Reports, 2018, 8 (3793), ⟨10.1038/s41598-018-22235-7⟩

Article dans une revue hal-02073105v1

Osmoregulatory responses to cadmium in reference and historically metal contaminated Gammarus fossarum (Crustacea, Amphipoda) populations

Paul Dayras , Guy Charmantier , Arnaud Chaumot , Amandine Vigneron , Marina Coquery et al.

Chemosphere, 2017, 180, pp.412-422. ⟨10.1016/j.chemosphere.2017.04.016⟩

Article dans une revue hal-01681622v1

Assessing the relevance of a multiplexed methodology for proteomic biomarker measurement in the invertebrate species Gammarus fossarum : A physiological and ecotoxicological study

D. Gouveia , Arnaud Chaumot , A. Charnot , H. Quéau , J. Armengaud et al.

Aquatic Toxicology, 2017, 190, pp.199 - 209. ⟨10.1016/j.aquatox.2017.07.007⟩

Article dans une revue istex hal-01682339v1

Ecotoxico-Proteomics for Aquatic Environmental Monitoring: First in Situ Application of a New Proteomics-Based Multibiomarker Assay Using Caged Amphipods

Duarte Gouveia , Arnaud Chaumot , Aurore Charnot , Christine Almunia , Adeline François et al.

Environmental Science and Technology, 2017, 51 (22), pp.13417-13426. ⟨10.1021/acs.est.7b03736⟩

Article dans une revue hal-01663631v1

Caged Gammarus as biomonitors identifying thresholds of toxic metal bioavailability that affect gammarid densities at the French national scale

A. Ciliberti , Arnaud Chaumot , R. Recoura Massaquant , A. Chandesris , A. Francois et al.

Water Research, 2017, 118, pp.131-140. ⟨10.1016/j.watres.2017.04.031⟩

Article dans une revue istex hal-02606674v1

Impact of micropollutants on the life-history traits of the mosquito Aedes aegypti: On the relevance of transgenerational studies

Sophie Prud'Homme , Arnaud Chaumot , Eva Cassar , Jean-Philippe David , Stephane Reynaud

Environmental Pollution, 2017, 220, pp.242-254. ⟨10.1016/j.envpol.2016.09.056⟩

Article dans une revue hal-02359358v1

Multiplexed assay for protein quantitation in the invertebrate Gammarus fossarum by liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry

Aurore Charnot , Duarte Gouveia , J. Armengaud , Christine Almunia , Arnaud Chaumot et al.

Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2017, 409 (16), pp.3969-3991. ⟨10.1007/s00216-017-0348-0⟩

Article dans une revue hal-01539762v1

Comparison in waterborne Cu, Ni and Pb bioaccumulation kinetics between different gammarid species and populations: Natural variability and influence of metal exposure history

Nastassia Urien , Antoine Farfarana , Emmanuelle Uher , Lise C. Fechner , Arnaud Chaumot et al.

Aquatic Toxicology, 2017, 193, pp.245-255. ⟨10.1016/j.aquatox.2017.10.016⟩

Article dans une revue hal-01695094v1

Phenotypic defects in newborn Gammarus fossarum (Amphipoda) following embryonic exposure to fenoxycarb

Hélène Arambourou , Arnaud Chaumot , Emmanuelle Vulliet , Gaëlle Daniele , Nicolas Delorme et al.

Ecotoxicology and Environmental Safety, 2017, 144, pp.193-199. ⟨10.1016/j.ecoenv.2017.06.017⟩

Article dans une revue hal-01574975v1

Use of Gammarus fossarum (Amphipoda) embryo for toxicity testing: a case study with Cadmium

H. Arambourou , H. Quéau , A. Dabrin , D. Neuzeret , Arnaud Chaumot

Environmental Toxicology and Chemistry, 2017, 39 (6), pp.2436-2443. ⟨10.1002/etc.3779⟩

Article dans une revue hal-02606518v1

Validation of a two-generational reproduction test in Daphnia magna : An interlaboratory exercise

Carlos Barata , Bruno Campos , Claudia Rivetti , Gerald A. Leblanc , Stephanie Eytcheson et al.

Science of the Total Environment, 2017, 579, pp.1073-1083. ⟨10.1016/j.scitotenv.2016.11.066⟩

Article dans une revue ineris-01853420v1

Combined effects of drought and the fungicide tebuconazole on aquatic leaf litter decomposition

S. Pesce , O. Zoghlami , C. Margoum , J. Artigas , Arnaud Chaumot et al.

Aquatic Toxicology, 2016, 173, pp.120-131. ⟨10.1016/j.aquatox.2016.01.012⟩

Article dans une revue hal-01804836v1

Active biomonitoring for assessing effects of metal polluted sediment resuspension on gammarid amphipods during fluvial traffic

E. Prygiel , Gabriel Billon , A. François , D. Dumoulin , Arnaud Chaumot et al.

Environmental Pollution (1970), 2016, 218, pp.129 - 139. ⟨10.1016/j.envpol.2016.08.010⟩

Article dans une revue istex hal-01387982v1

Role of cellular compartmentalization in the trophic transfer of mercury species in a freshwater plant-crustacean food chain

R. Beauvais Fluck , Arnaud Chaumot , F. Gimbert , H. Quéau , Olivier Geffard et al.

Journal of Hazardous Materials, 2016, 320, pp.401-407. ⟨10.1016/j.jhazmat.2016.08.055⟩

Article dans une revue hal-02604681v1

Environmental relevance of laboratory-derived kinetic models to predict trace metal bioaccumulation in gammarids: Field experimentation at a large spatial scale (France)

Nastassia Urien , Jérémie D. Lebrun , Lise C. Fechner , Emmanuelle Uher , Adeline François et al.

Water Research, 2016, 95, pp.330-339. ⟨10.1016/j.watres.2016.03.023⟩

Article dans une revue hal-01569657v1

Proteogenomic insights into the core-proteome of female Reproductive tissues from crustacean amphipods

Judith Trapp , C. Almunia , J.C. Gaillard , O. Pible , Arnaud Chaumot et al.

Journal of Proteomics, 2016, 135, pp.51-61. ⟨10.1016/j.jprot.2015.06.017⟩

Article dans une revue istex hal-02604682v1

Ovary and embryo proteogenomic dataset revealing diversity of vitellogenins in the crustacean Gammarus fossarum

Judith Trapp , Jean-Charles Gaillard , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard , Olivier Pible et al.

Data in Brief, 2016, 8, pp.1259-1262. ⟨10.1016/j.dib.2016.07.045⟩

Article dans une revue (data paper) hal-03902171v1

High-throughput proteome dynamics for discovery of key proteins in sentinel species: Unsuspected vitellogenins diversity in the crustacean Gammarus fossarum

Judith Trapp , J. Armengaud , J.C. Gaillard , O. Pible , Arnaud Chaumot et al.

Journal of Proteomics, 2016, 146, pp.207-214. ⟨10.1016/j.jprot.2016.07.007⟩

Article dans une revue istex hal-02604683v1

Outils intégratifs pour évaluer l'impact des pratiques phytosanitaires sur les cours d'eau

M. Le Dreau , Arnaud Chaumot , A. Foulquier , A. François , Olivier Geffard et al.

Innovations Agronomiques, 2015, 46, pp.51-61. ⟨10.15454/1.4622668913387212E12⟩

Article dans une revue hal-01338198v1

Proteomic Investigation of Male Gammarus fossarum, a Freshwater Crustacean, in Response to Endocrine Disruptors

Judith Trapp , J. Armengaud , O. Pible , J.C. Gaillard , K. Abbaci et al.

Journal of Proteome Research, 2015, 14 (1), pp.292-303. ⟨10.1021/pr500984z⟩

Article dans une revue hal-02600747v1

Linking feeding inhibition with reproductive impairment in Gammarus confirms the ecological relevance of feeding assays in environmental monitoring

Romain Coulaud , Olivier Geffard , Amandine Vigneron , Herve Queau , Adeline François et al.

Environmental Toxicology and Chemistry, 2015, 34 (5), pp.1031 - 1038. ⟨10.1002/etc.2886⟩

Article dans une revue istex hal-01917267v1

Evolution of cadmium tolerance and associated costs in a Gammarus fossarum population inhabiting a low-level contaminated stream

A. Vigneron , Olivier Geffard , Marina Coquery , A. Francois , H. Quéau et al.

Ecotoxicology, 2015, 24 (6), pp.1239-1249. ⟨10.1007/s10646-015-1491-z⟩

Article dans une revue hal-02601473v1

Data for comparative proteomics of ovaries from five non-model, crustacean amphipods

Judith Trapp , C Almunia , J.C. Gaillard , O. Pible , Arnaud Chaumot et al.

Data in Brief, 2015, 5, pp.1-6. ⟨10.1016/j.dib.2015.07.037⟩

Article dans une revue (data paper) hal-02602338v1

Consequences of Lower Food Intake on the Digestive Enzymes Activities, the Energy Reserves and the Reproductive Outcome in Gammarus fossarum

L. Charron , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot , Romain Coulaud , A. Jaffal et al.

PLoS ONE, 2015, 10 (4), pp.1-14. ⟨10.1371/journal.pone.0125154⟩

Article dans une revue hal-01181614v1

Mothers and not genes determine inherited differences in cadmium sensitivities within unexposed populations of the freshwater crustacean Gammarus fossarum

A. Vigneron , Olivier Geffard , H. Quéau , Arnaud Chaumot

Evolutionary Applications, 2015, 9 (2), 12 p. ⟨10.1111/eva.12327⟩

Article dans une revue hal-01250213v1

Non-model organisms, a species endangered by proteogenomics

J. Armengaud , Judith Trapp , O. Pible , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot et al.

Journal of Proteomics, 2014, 105, pp.5-18. ⟨10.1016/j.jprot.2014.01.007⟩

Article dans une revue hal-02600746v1

Proteogenomics of Gammarus fossarum to Document the Reproductive System of Amphipods

Judith Trapp , Olivier Geffard , G. Imbert , J.C. Gaillard , A.H. Davin et al.

Molecular and Cellular Proteomics, 2014, 13 (12), pp.3612-3625

Article dans une revue hal-02600748v1

Ecological Modeling for the Extrapolation of Ecotoxicological Effects Measured during in Situ Assays in Gammarus

Romain Coulaud , Olivier Geffard , A Coquillat , H. Quéau , Sandrine Charles et al.

Environmental Science and Technology, 2014, 48 (11), pp.6428-6436. ⟨10.1021/es501126g⟩

Article dans une revue hal-01191544v1

Influence of Molting and Starvation on Digestive Enzyme Activities and Energy Storage in Gammarus fossarum

L. Charron , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot , Romain Coulaud , A. Jaffal et al.

PLoS ONE, 2014, 9 (4), 9 p. ⟨10.1371/journal.pone.0096393⟩

Article dans une revue hal-01070508v1

Next-generation proteomics: toward customized biomarkers for environmental biomonitoring

Judith Trapp , J. Armengaud , Arnaud Salvador , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard

Environmental Science and Technology, 2014, 48 (23), pp.13560-13572. ⟨10.1021/es501673s⟩

Article dans une revue hal-01230133v1

Life-history phenology strongly influences population vulnerability to toxicants: a case study with the mudsnail Potamopyrgus antipodarum.

Romain Coulaud , Jacques Mouthon , Hervé Quéau , Sandrine Charles , Arnaud Chaumot

Environmental Toxicology and Chemistry, 2013, 32 (8), pp.1727-36. ⟨10.1002/etc.2235⟩

Article dans une revue istex hal-00972342v1

Caged Gammarus fossarum (crustacea) as a robust tool for the characterization of bioavailable contamination levels in continental waters. Toward the determination of threshold values

J.P. Besse , Marina Coquery , C. Lopes , Arnaud Chaumot , H. Budzinski et al.

Water Research, 2013, 47 (2), p. 650 - p. 660. ⟨10.1016/j.watres.2012.10.024⟩

Article dans une revue hal-00773522v1

Effect of water quality and confounding factors on digestive enzyme activities in Gammarus fossarum

L. Charron , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot , Romain Coulaud , H. Quéau et al.

Environmental Science and Pollution Research, 2013, 20 (12), pp.9044 - 9056. ⟨10.1007/s11356-013-1921-5⟩

Article dans une revue istex hal-01920248v1

Vitellogenin-like proteins among invertebrate species diversity: potential of proteomic mass spectrometry for biomarker development

Guillaume Jubeaux , Fabien Audouard-Combe , Romain Simon , Renaud Tutundjian , Arnaud Salvador et al.

Environmental Science and Technology, 2012, 46 (11), pp.6315-6323. ⟨10.1021/es300550h⟩

Article dans une revue hal-00875198v1

Vitellogenin-like proteins in the freshwater amphipod Gammarus fossarum (Koch, 1835): Functional characterization throughout reproductive process, potential for use as an indicator of oocyte quality and endocrine disruption biomarker in males

Guillaume Jubeaux , Romain Simon , Arnaud Salvador , Hervé Quéau , Arnaud Chaumot et al.

Aquatic Toxicology, 2012, 112-113, pp.72-82. ⟨10.1016/j.aquatox.2012.01.011⟩

Article dans une revue istex hal-00697838v1

Towards a renewed research agenda in ecotoxicology

Joan Artigas , Gertie Arts , Marc Babut , Anna Barra Caracciolo , Sandrine Charles et al.

Environmental Pollution, 2012, 160 (1), pp.201-206. ⟨10.1016/j.envpol.2011.08.011⟩

Article dans une revue istex hal-00965657v1

Vitellogenin-like protein measurement in caged Gammarus fossarum males as a biomarker of endocrine disruptor exposure: Inconclusive experience

G. Jubeaux , R. Simon , A. Salvador , C. Lopes , Emilie Lacaze et al.

Aquatic Toxicology, 2012, 122-123, pp.9-18

Article dans une revue hal-02597546v1

Molecular adaptation and resilience of the insect's nuclear receptor USP

Arnaud Chaumot , J.L. da Lage , O. Maestro , D. Martin , T. Iwema et al.

BMC Evolutionary Biology, 2012, 12 (199), 16 p. ⟨10.1186/1471-2148-12-199⟩

Article dans une revue hal-00778587v1

Vitellogenin-like Proteins among Invertebrate Species Diversity: Potential of Proteomic Mass Spectrometry for Biomarker Development

G. Jubeaux , F. Audouard Combe , R. Simon , R. Tutundjian , A. Salvador et al.

Environmental Science and Technology, 2012, 46 (11), pp.6315-6323. ⟨10.1021/es300550h⟩

Article dans une revue hal-02597545v1

Vitellogenin-like protein measurement in caged Gammarus fossarum males as a biomarker of endocrine disruptor exposure: Inconclusive experience

Guillaume Jubeaux , Romain Simon , Arnaud Salvador , Christelle Lopes , Emilie Lacaze et al.

Aquatic Toxicology, 2012, 122, pp.9-18. ⟨10.1016/j.aquatox.2012.05.007⟩

Article dans une revue istex hal-00875205v1

Vitellogenin-like gene expression in freshwater amphipod Gammarus fossarum (Koch, 1835): functional characterization in females and potential for use as an endocrine disruption biomarker in males

Benoît Xuereb , Laurent Bezin , Arnaud Chaumot , Hélène Budzinski , Sylvie Augagneur et al.

Ecotoxicology, 2011, 20 (6), pp.1286 - 1299. ⟨10.1007/s10646-011-0685-2⟩

Article dans une revue istex hal-01918567v1

In situ feeding assay with Gammarus fossarum (Crustacea): Modelling the influence of confounding factors to improve water quality biomonitoring

Romain Coulaud , Olivier Geffard , Benoît Xuereb , Emilie Lacaze , Herve Queau et al.

Water Research, 2011, 45 (19), pp.6417 - 6429. ⟨10.1016/j.watres.2011.09.035⟩

Article dans une revue istex hal-01920247v1

Comprendre la sensibilité des espèces face à la contamination des milieux : un jeu complexe entre toxicologie, biologie et écologie des espèces

Arnaud Chaumot , J. Garric , Soizic Morin

Sciences Eaux & Territoires, 2010, 1, pp.26-29. ⟨10.14758/SET-REVUE.2010.1.06⟩

Article dans une revue hal-00490421v1

Mass spectrometry assay as an alternative to the enzyme-linked immunosorbent assay test for biomarker quantitation in ecotoxicology : application to vitellogenin in Crustacea (Gammarus fossarum)

R. Simon , G. Jubeaux , Arnaud Chaumot , J. Lemoine , Olivier Geffard et al.

Journal of Chromatography A, 2010, 1217, pp.5109-5115

Article dans une revue hal-02593846v1

Adaptation des espèces et contamination des milieux ?

Arnaud Chaumot , Soizic Morin , Françoise Vincent-Hubert , Bernard Montuelle

Sciences Eaux & Territoires, 2010, 1, pp.30-33. ⟨10.14758/SET-REVUE.2010.1.07⟩

Article dans une revue hal-00490427v1

Les expérimentations in situ : principes et perspectives

Olivier Geffard , B. Ferrari , Arnaud Chaumot , B. Montuelle

Sciences Eaux & Territoires, 2010, 1, p. 20 - p. 25. ⟨10.14758/SET-REVUE.2010.1.05⟩

Article dans une revue hal-00490025v1

Ovarian cycle and embryonic development in Gammarus fossarum: Application for reproductive toxicity assessment

Olivier Geffard , Benoît Xuereb , Arnaud Chaumot , Alain Geffard , Sylvie Biagianti et al.

Environmental Toxicology and Chemistry, 2010, 29 (10), pp.2249 - 2259. ⟨10.1002/etc.268⟩

Article dans une revue istex hal-01918571v1

Matrix Population Models as Relevant Modeling Tools in Ecotoxicology

Sandrine Charles , E. Billoir , Christelle Lopes , Arnaud Chaumot

incollection, 2009, 2, pp.261-298

Article dans une revue hal-00539407v1

Acetylcholinesterase activity in Gammarus fossarum (Crustacea Amphipoda) - Intrinsic variability, reference levels, and a reliable tool for field surveys

Benoît Xuereb , Arnaud Chaumot , Raphaël Mons , Jeanne Garric , Olivier Geffard

Aquatic Toxicology, 2009, 93 (4), pp.225 - 233. ⟨10.1016/j.aquatox.2009.05.006⟩

Article dans une revue istex hal-01918557v1

Additive vs non-additive genetic components in lethal cadmium tolerance of Gammarus (Crustacea): Novel light on the assessment of the potential for adaptation to contamination

Arnaud Chaumot , P. Gos , J. Garric , Olivier Geffard

Aquatic Toxicology, 2009, 94, p. 294 - p. 299

Article dans une revue hal-00455556v1

Structural and evolutionary innovation of the heterodimerization interface between USP and the ecdysone receptor ECR in insects.

Thomas Iwema , Arnaud Chaumot , Romain A. Studer , Marc Robinson-Rechavi , Isabelle Ml Billas et al.

Molecular Biology and Evolution, 2009, 26 (4), pp.753-68. ⟨10.1093/molbev/msn302⟩

Article dans une revue inserm-00384307v1

Annotation of Tribolium nuclear receptors reveals an evolutionary overacceleration of a network controlling the ecdysone cascade

François Bonneton , Arnaud Chaumot , Vincent Laudet

Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2008, 38 (4), pp.416-429. ⟨10.1016/j.ibmb.2007.10.006⟩

Article dans une revue ensl-00288743v1

The genome of the model beetle and pest Tribolium castaneum

Stephen Richards , R. Gibbs , George Matthew Weinstock , Susan E. Brown , R. Denell et al.

Nature, 2008, 452 (7190), pp.949-955. ⟨10.1038/nature06784⟩

Article dans une revue hal-02590501v1

Effects of chronic dietary and waterborne Cd exposures on the contamination level and reproduction of Daphnia magna

Olivier Geffard , Adeline Geffard , Arnaud Chaumot , C. Alvarez , B. Vollat et al.

Environmental Toxicology and Chemistry, 2008, 27 (5), pp.1128-1134. ⟨10.1897/07-431.1⟩

Article dans une revue istex hal-02589446v1

Conserved features and evolutionary shifts of the EDA signaling pathway involved in vertebrate skin appendage development.

Sophie Pantalacci , Arnaud Chaumot , Gérard Benoît , Alexa Sadier , Frédéric Delsuc et al.

Molecular Biology and Evolution, 2008, 25 (5), pp.912-28. ⟨10.1093/molbev/msn038⟩

Article dans une revue halsde-00315537v1

Annotation of Tribolium nuclear receptors reveals an increase in evolutionary rate of a network controlling the ecdysone cascade

F. Bonneton , Arnaud Chaumot , V. Laudet

Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2008, 38 (4), p. 416 - p. 429. ⟨10.1016/j.ibmb.2007.10.006⟩

Article dans une revue hal-00453844v1

Unexpected Novel Relational Links Uncovered by Extensive Developmental Profiling of Nuclear Receptor Expression.

Stéphanie Bertrand , Bernard Thisse , Raquel Tavares , Laurent Sachs , Arnaud Chaumot et al.

PLoS Genetics, 2007, 3 (11), pp.e188. ⟨10.1371/journal.pgen.0030188⟩

Article dans une revue hal-00207389v1

Structural and functional characterization of a novel type of ligand-independent RXR-USP receptor

Thomas Iwema , Isabelle M.L. Billas , Yannick Beck , François Bonneton , Helène Nierengarten et al.

EMBO Journal, 2007, 26 (16), pp.3770-3782. ⟨10.1038/sj.emboj.7601810⟩

Article dans une revue hal-02589453v1

First step of a modeling approach to evaluate spatial heterogeneity in a fish (Cottus gobio) population dynamics

Arnaud Chaumot , Nadège Milioni , Asghar Abdoli , Didier Pont , Sandrine Charles

Ecological Modelling, 2006, 197 (3-4), pp.263-273. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2006.03.024⟩

Article dans une revue istex halsde-00288590v1

First step of a modeling approach to evalue spatial heterogeneity in fish (<i>Cottus gobio</i>) population dynamics

Arnaud Chaumot , N. Milioni , A. Abdoli , D. Pont , Sandrine Charles

Ecological Modelling, 2006, 197, pp.263-273

Article dans une revue hal-00427921v1

Ecotoxicology and population dynamics: on the use of DEBtox models in a Leslie modelling approach

C. Lopes , A. Pery , Arnaud Chaumot , S. Charles

Ecological Modelling, 2005, 188, pp.30-40

Article dans une revue hal-02587157v1

Ecotoxicology and population dynamics: Using DEBtox models in a Leslie modeling approach

C. Lopes , A.R.R. Péry , Arnaud Chaumot , S. Charles

Ecological Modelling, 2005, 188 (1), pp.30-40. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2005.05.004⟩

Article dans une revue istex hal-03343382v1

Food availability effect on population dynamics of the midge Chironomus riparius: a Leslie modeling approach

S. Charles , M. Ferreol , Arnaud Chaumot , A.R. Pery

Ecological Modelling, 2004, 175 (3), pp.217-229. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2003.10.016⟩

Article dans une revue istex hal-02583817v1

Ecotoxicology and spatial modeling in population dynamics: an illustration with brown trout

Arnaud Chaumot , Sandrine Charles , P. Flammarion , P. Auger

Environmental Toxicology and Chemistry, 2003, 22, pp.958-969

Article dans une revue hal-00427386v1

Do migratory or demographic disruptions rule the population impact of pollution in spatial networks?

Arnaud Chaumot , Sandrine Charles , P. Flammarion , P. Auger

Theoretical Population Biology, 2003, 64, pp.473-480

Article dans une revue hal-00427387v1

Using aggregation methods to assess toxicant effects on population dynamics in spatial systems

Arnaud Chaumot , Sandrine Charles , P. Flammarion , J. Garric , P. Auger

Ecological Applications, 2002, 12, pp.1771-1784

Article dans une revue hal-00427256v1

Development of an ecotoxicological model in an arborescent river network: an attempt with a brown trout population

Arnaud Chaumot , Sandrine Charles , P. Auger

Aspects of Applied Biology - Challenges in applied population biology, 1999, 53, pp.131-136

Article dans une revue hal-00428423v1

La biosurveillance active à l'aide de l'amphipode Gammarus fossarum : proposition d'indicateurs de risque toxique pour les communautés dulçaquicoles

Vivien Lecomte , Benjamin Alric , Rémi Recoura-Massaquant , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard

INRAE RiverLy. 2026

Rapport hal-05663401v1

Protéomique ciblée pour la quantification multiplexée de biomarqueurs : perspectives pour la surveillance environnementale

Anabelle Espeyte , Davide Degli Esposti , Maxime Leprêtre , Hugo Detante , Kévin Sugier et al.

INRAE; OFB. 2023

Rapport hal-04246106v1

Projet SASHIMI : Surveillance active de l'impact de la pression chimique par des biomarqueurs

B Xuereb , K Abbaci , Rachid Amara , Michel Auffret , Anne Bado-Nilles et al.

UMR I-02 SEBIO; OFB. 2023

Rapport hal-04246387v1

Protéomique ciblée pour la quantification multiplexée de biomarqueurs, perspectives pour la surveillance environnementale

Anabelle Espeyte , Davide Degli Esposti , Maxime Leprêtre , Hugo Detante , Kevin Sugier et al.

INRAE RiverLy. 2023

Rapport hal-04138910v1

Impacts des produits phytopharmaceutiques sur la biodiversité et les services écosystémiques. Synthèse de l’expertise scientifique collective

Sophie Leenhardt , Laure Mamy , Stéphane Pesce , Wilfried Sanchez , Anne Laure Achard et al.

INRAE; IFREMER Institut Francais de Recherche pour l'Exploitation de la Mer. 2022, 136 p

Rapport (rapport d’expertise collective) hal-03759553v1

Vers une vision multipression explicative des niveaux de contamination biodisponible et de toxicité des cours d'eau.

Rémi Recoura-Massaquant , Olivier Geffard , Noëlle Sarkis , Laurent Valette , N. Delorme et al.

[Rapport de recherche] INRAE RiverLy. 2022

Rapport hal-03788403v1

Dynamiques écologiques temporelles des lacs du littoral aquitain - DYLAQ. Tome 4 : Interactions biologiques et impacts écotoxicologiques

Soizic Morin , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard , Adeline François , Aurélien Jamoneau et al.

[Rapport de recherche] INRAE UR EABX. 2022, 53 p

Rapport (rapport de recherche) hal-03602225v1

Impacts des produits phytopharmaceutiques sur la biodiversité et les services écosystémiques. Rapport de l’expertise scientifique collective

Laure Mamy , Stéphane Pesce , Wilfried Sanchez , Marcel Amichot , Joan Artigas et al.

[Rapport de recherche] INRAE; IFREMER. 2022, 1408 p

Rapport (rapport d’expertise collective) hal-03777257v1

PROJET IMPACT-CE : Développement et transfert aux opérationnels d’outils intégratifs de mesure chimique et biologique au sein des cours d’eau pour le suivi de l’impact des pratiques agricoles et de leur évolution - Rapport Final

Véronique Gouy , Joan Artigas , Chloé Bonnineau , Arnaud Chaumot , Eric Chauvet et al.

Ecophyto II. 2021

Rapport (rapport de recherche) hal-04830061v1

Développement et transfert aux opérationnels d’outils intégratifs de mesure chimique et biologique au sein des cours d’eau pour le suivi de l’impact des pratiques agricoles et de leur évolution

Véronique Gouy , Joan Artigas , Chloé Bonnineau , Arnaud Chaumot , Eric Chauvet et al.

[Rapport de recherche] INRAE UR-RiverLy; INRAE UR EABX; LIEC Université de Lorraine; INRAE Dijon agroécologie; Université Blaise Pascal, Clermont-Ferrand; Université Paul Sabatier Toulouse; Hyfe. 2021

Rapport (rapport de recherche) hal-03423016v1

Compte-rendu de fin de projet

Olivier Geffard , Arnaud Chaumot , S. Azoulay , Christine Almunia , J. Armengaud

[Rapport de recherche] INRAE. 2020

Rapport hal-03800301v1

Protéomique ciblée pour la quantification multiplexée de biomarqueurs: perspectives pour la surveillance environnementale. Construction d'une stratégie partagée et généralisable entre espèces pour l'identification de protéines d'intérêt - Cas d'étude chez Gammarus fossarum (Rapport d'étape)

Anabelle Espeyte , Davide Degli-Esposti , Julien Faugère , Sophie Ayciriex , Arnaud Salvador et al.

INRAE; OFB. 2019

Rapport hal-03971107v1

Lien entre la toxicité, la contamination des milieux aquatiques mesurés chez Gammarus fossarum et la perturbation des communautés biologiques : Proposition de valeurs seuils au niveau national pour la mesure de marqueurs de toxicité chez Gammarus fossarum.

Olivier Geffard , Benjamin Alric , Adeline François , Nicolas Delorme , Patrice Noury et al.

[Rapport de recherche] IRSTEA. 2019

Rapport (rapport de recherche) hal-03799794v1

Lien entre la toxicité, la contamination des milieux aquatiques mesurés chez Gammarus fossarum et la perturbation des communautés biologiques : Indicateurs de la contamination biodisponible des eaux douces.

Olivier Geffard , Benjamin Alric , André Chandesris , Martial Ferréol , Adeline François et al.

[Rapport de recherche] INRAE. 2019

Rapport hal-03799780v1

Lien entre la toxicité, la contamination des milieux aquatiques mesurés chez Gammarus fossarum et la perturbation des communautés biologiques

Olivier Geffard , Benjamin Alric , André Chandesris , Martial Ferréol , Adeline François et al.

[Rapport de recherche] Irstea; Agence française pour la biodiversité. 2019

Rapport hal-03799812v1

Lien entre la toxicité, la contamination des milieux aquatiques mesurés chez Gammarus fossarum et la perturbation des communautés biologiques Rapport final

Olivier Geffard , Alexandre Ciliberti , Adeline François , Marina Coquery , Martial Ferréol et al.

[Rapport de recherche] INRAE. 2018

Rapport hal-03799759v1

Intérêt d'un indicateur écotoxicologique pour diagnostiquer et comprendre l'état des milieux aquatiques et aider à la restauration

A. Francois , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard

[Rapport de recherche] irstea. 2016, pp.36

Rapport (rapport de recherche) hal-02607334v1

Mise en application et évaluation d’outils intégratifs chimiques et biologiques pour mesurer l’impact des produits phytosanitaires sur les cours d’eau

M. Le Dreau , Arnaud Chaumot , A. Foulquier , A. Francois , Olivier Geffard et al.

[Rapport de recherche] irstea. 2015, pp.111

Rapport (rapport de recherche) hal-02602398v1

Programme PIREN-Seine - Phase 6 Axe 4 : « Ecologie & Ecotoxicologie » Les déterminants de la qualité écologique du milieu aquatique

Alain Geffard , Evelyne Tales , Céline Le Pichon , Aurélia Mathieu , Amandine Zahm et al.

[Rapport de recherche] irstea. 2015, pp.172

Rapport (rapport de recherche) hal-02602455v1

Développement d’une méthodologie pour l'amélioration du suivi chimique des eaux continentales

R. Recoura Massaquant , Olivier Geffard , Jean-Philippe Besse , Arnaud Chaumot , Adeline François et al.

[Rapport de recherche] irstea. 2014, pp.66

Rapport (rapport de recherche) hal-02601928v1

Développement d’une méthodologie pour l'amélioration du suivi chimique des eaux continentales. Rapport de synthèse de l’étude pilote : déploiement de l’outil gammare encagé au niveau national, résultats pour les métaux ciblés

Olivier Geffard , J.P. Besse , Arnaud Chaumot , A. Francois , J. Gahou et al.

[Rapport de recherche] Irstea. 2014, pp.60

Rapport (rapport de recherche) hal-02599952v1

Développement d'une méthodologie pour l'amélioration du suivi chimique des eaux continentales. Approche de biosurveillance active sur Gammarus fossarum

J.P. Besse , Olivier Geffard , C. Lopes , Arnaud Chaumot , Marina Coquery

[Rapport de recherche] irstea. 2012, pp.63

Rapport (rapport de recherche) hal-02599951v1

Effet des substances chimiques sur les organismes aquatiques. Développement d’une batterie multi spécifique pour l’évaluation écotoxicologique de la qualité du milieu

C. Lopes , Jeanne Garric , Marina Coquery , B. Ferrari , Arnaud Chaumot et al.

irstea. 2011, pp.93

Rapport hal-02600059v1

Rapport AO Maîtrises "Tox-Indic" 1ère année

Virginie Archaimbault , Marc Babut , Arnaud Chaumot , François Delmas , Bernard Dumont et al.

[Rapport de recherche] Cemagref. 2008, pp.177

Rapport (rapport de recherche) hal-03139978v1

Empreinte de la pression chimique toxique sur l’évolution actuelle des communautés de macroinvertébrés des cours d’eau nationaux.

Jeanne Thill , David Eme , Rémi Recoura-Massaquant , Arnaud Chaumot

Colloque annuel de la Société Française d’Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée (SEFA), Société Française d’Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée, Jul 2026, Angers (France), France

Communication dans un congrès hal-05774702v1

Does Data Conversion Matter ? Assessing Its Impact on LC–MS Untargeted Metabolomics

Rémy de Boni , Arnaud Salvador , Thomas Alexandre Brunet , Valentina Calabrese , Delphine Arquier et al.

CHEMIOMETRIE XXV, Groupe Français de Chimiométrie, Feb 2026, Nancy, France

Communication dans un congrès hal-05522522v1

Ecotoxicité des rayonnements ionisants dans un contexte de multipollution : vers une amélioration de l’évaluation du risque radioécologique

Olivier Simon , Frederic Alonzo , Béatrice Gagnaire , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot et al.

Congrès national de Radioprotection – SFRP 2025, SFRP – Société Française de Radioprotection, Jun 2025, La Baule, France

Communication dans un congrès hal-05453345v1

The genome of G. fossarum: a genomic toolkit to investigate endocrine and metabolic disruption in amphipod sentinel species

Davide Degli Esposti , Damien Hinsinger , Joao Sousa , Patrice Baa-Puyoulet , Aurélie Bérard et al.

Colloque INRAE Genomics, Jun 2025, Clermon-Ferrand, France

Communication dans un congrès hal-05137926v1

The genome of G. fossarum: a genomic toolkit to investigate endocrine and metabolic disruption in amphipod sentinel species

Davide Degli Esposti , Damien Hinsinger , Joao Sousa , Patrice Baa-Puyoulet , Aurélie Bérard et al.

20th International Conference on Amphipoda, Sep 2025, Lodz, Poland

Communication dans un congrès hal-05419622v1

Impacts des néonicotinoïdes sur la biodiversité

Laure Mamy , Stéphane Pesce , Wilfried Sanchez , Stéphanie Aviron , Carole Bedos et al.

Séminaire EcoScience, INRAE UMR EcoSys, Apr 2024, Palaiseau, France

Communication dans un congrès hal-04665322v1

Impacts des néonicotinoïdes sur la biodiversité

Laure Mamy , Stéphane Pesce , Wilfried Sanchez , Stéphanie Aviron , Carole Bedos et al.

52. Congrès du Groupe Français des Pesticides (GFP), INRAE; Groupe Français de recherche sur les Pesticides, May 2024, Lyon, France

Communication dans un congrès hal-04664974v1

Utilisation des fragmentations activées par électrons (EAD) et des réseaux moléculaires pour une annotation exhaustive des métabolites et des lipides en spectrométrie de masse haute résolution chez l'espèce sentinelle d'eau douce Gammarus fossarum

Valentina Calabrese , Thomas Alexandre Brunet , Davide Degli Esposti , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard et al.

colloque du GDR Ecotoxicologie Aquatique, Nov 2024, Grenoble, France

Communication dans un congrès hal-04768427v1

Décrypter les mécanismes de reprotoxicité radio-induite chez l'amphipode Gammarus fossarum

Sandrine Frelon , Rémi Recoura-Massaquant , Marie-Laure Delignette-Muller , Jean-Charles Gaillard , Nicolas Dubourg et al.

Société d'écotoxicologie fondamentale et appliquée (SEFA), UMR Chrono-environnement (CNRS – université de Franche-Comté), Jul 2024, Besançon (Doubs), France

Communication dans un congrès hal-04867780v1

DYLAQ - Dynamiques écologiques temporelles des lacs et étangs du littoral Aquitain

Aurélien Jamoneau , Gaït Archambaud‐suard , Christine Argillier , Vincent Bertrin , Thu Bizat et al.

Lacs Naturels Atlantiques : observer pour s'adapter - Journée technique, Agence de l'Eau Adour Garonne, Mar 2024, Lacanau-Océan, France

Communication dans un congrès hal-04569828v1

Ecotoxicité des produits de transformation des pesticides dans les milieux aquatiques

Soizic Morin , Joan Artigas , Arnaud Chaumot , Mélaine Claitte , Nicolas Creusot et al.

VIIIème Colloque du Réseau Ecotox, Nov 2023, La Rochelle, France

Communication dans un congrès hal-04332015v1

Ecotoxicité des produits de transformation des pesticides dans les milieux aquatiques

Soizic Morin , Joan Artigas , Arnaud Chaumot , Mélaine Claitte , Nicolas Creusot et al.

VIIIème Colloque du Réseau Ecotox, Nov 2023, La Rochelle, France

Communication dans un congrès hal-04352912v1

A meta-analysis of ecotoxicological models used for plant protection product risk assessment before their placing on the market

Floriane Larras , Rémy Beaudouin , Sandrine Charles , Arnaud Chaumot , Céline Pelosi et al.

11th European Modelling Workshop, Sep 2023, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-04665461v1

Projet SASHIMI. Surveillance active de l’impact de la pression chimique par des biomarqueurs

Benoit Xuereb , Khedidja Abbaci , Rachid Amara , Michel Auffret , Anne Bado-Nilles et al.

Office Français de la Biodiversité, Oct 2023, Vincennes, France

Communication dans un congrès hal-04424604v1

Improving comprehensive analysis and compound annotation in complex biological samples through molecular networking based on SWATH-MS and EAD fragmentation

Valentina Calabrese , Thomas Alexandre Brunet , Davide Degli Esposti , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard et al.

15èmes journées scientifiques du réseau francophone de Métabolomique et fluxomique, May 2023, Perpignan, France

Communication dans un congrès hal-04770449v1

Optimisation de l'analyse globale et de l'annotation des composés dans des échantillons biologiques complexes, grâce à l'application de réseaux moléculaires et à l'utilisation des techniques de dissociation activée par les électrons (EAD)

Valentina Calabrese , Thomas Alexandre Brunet , Davide Degli Esposti , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard et al.

13ème journée du réseau des lipidomystes, Nov 2023, Paris, France

Communication dans un congrès hal-04770444v1

Identification et écotoxicité des produits de transformation des pesticides dans les milieux aquatiques

Christelle Margoum , Kevin Rocco , Yoce Aprianto , Joan Artigas , Pierre Benoit et al.

51ème Congrès du Groupe Français de recherches sur les Pesticides, May 2023, Paris, France

Communication dans un congrès hal-04173298v1

Effect of diet on the gut microbiota of the freshwater sentinel Gammarus fossarum

Thibaut Dumas , Olivier Pible , Lucia Grenga , Davide Degli-Esposti , Nicolas Delorme et al.

5th International Metaproteomics Symposium, Lucia Grenga & Jean Armengaud - EuPA Metaproteomics Initiative, Apr 2023, Avignon, France

Communication dans un congrès hal-04476222v1

In depth-investigation of the reproductive cycle of Gammarus fossarum by a targeted multi-omics approach and multivariate data analysis

Thomas Alexandre Brunet , Yohann Clément , Valentina Calabrese , Arnaud Salvador , Olivier Geffard et al.

Analytics, SFSM-RFMS-FPS-AFSEP, Sep 2022, Nantes, France

Communication dans un congrès hal-03995879v1

In depth-investigation of the reproductive cycle of Gammarus fossarum by a targeted multi-omics approach and multivariate data analysis

Thomas Alexandre Brunet , Yohann Clément , Valentina Calabrese , Arnaud Salvador , Olivier Geffard et al.

1st European School of Metabolomics (EuSM), RFMF, Mar 2022, Moustiers-Sainte-Marie, France

Communication dans un congrès hal-03995867v1

An Innovative Metaproteomics Pipeline To Investigate HostMicrobiota Functions And Interactions From An Aquatic Sentinel Species

Thibaut Dumas , Duarte Gouveia , Lucia Grenga , Olivier Pible , Davide Degli Esposti et al.

3rd International Conference on Holobionts, International Symbiosis Society, Jul 2022, Lyon, France

Communication dans un congrès hal-04476257v1

Dynamique du microbiome d'un organisme sentinelle aquatique en réponse à la contamination chimique

Jean Armengaud , Arnaud Chaumot

Journées scientifiques du GDR écotoxicologie aquatique, INRAE, Nov 2021, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-04476371v1

Intégration de données multi-omiques pour l’identification d’enzymes clés du métabolisme lipidique chez l’espèce sentinelle Gammarus fossarum

Natacha Koenig , Patrice Baa-Puyoulet , Maxime Leprêtre , Jean-Charles Gaillard , J. Armengaud et al.

GDR Ecotoxicologie, Nov 2021, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-03810311v1

Spatially resolved lipid profiling of crustacean G. fossarum to provide molecular understanding of the toxicity of pharmaceutical residue pravastatin

Tingting Fu , Nicolas Elie , David Touboul , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot et al.

24h IMSI, Nov 2020, Virtual congress, Germany

Communication dans un congrès hal-03996557v1

Spatially resolved lipidome profiling of freshwater sentinel species Gammarus fossarum by shotgun lipidomics and mass spectrometry imaging

Tingting Fu , Oskar Knittelfelder , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot , Davide Degli Esposti et al.

SETAC Europe 30th Annual Meeting, May 2020, Dublin, Ireland

Communication dans un congrès hal-02550464v1

Spatially resolved lipidome profiling of freshwater sentinel species Gammarus fossarum by shotgun lipidomics and mass spectrometry imaging

Tingting Fu , Oskar Knittelfelder , Nicolas Elie , David Touboul , Olivier Geffard et al.

8TH EUROPEAN LIPIDOMICS Meeting, International Lipidomics Society, Sep 2020, Regensburg (virtual), Germany

Communication dans un congrès hal-03996551v1

Des outils chimiques et biologiques pour améliorer le diagnostic d’impact in situ des produits phytosanitaires

J. Jabiol , M. Le Dréau , J. Artigas , C. Bonnineau , Arnaud Chaumot et al.

L’écotoxicologie du continuum sol-eau, opportunités suite à la fusion INRA-Irstea, Webinar Réseau Ecotox, Nov 2020, "Webinaire", France

Communication dans un congrès hal-03245511v1

Impact des pressions toxiques multiples dans les cours d'eau : de la difficulté à déterminer un indice unique

Hugo Lepage , Rodolphe Gilbin , Karine Beaugelin , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot et al.

Multi-expositions, conditions de vie et santé - De la connaissance à l'action, Société Française de Santé et Environnement, Nov 2020, Lille, France

Communication dans un congrès irsn-04065935v1

A novel metaproteomics approach to better assess the dynamics and functions of microbiomes from bioindicator species

Duarte Gouveia , Olivier Pible , Karen Culotta , Christine Almunia , Davide Degli-Esposti et al.

SETAC Europe 29th Annual Meeting, The Society of Environmental Toxicology and Chemistry (SETAC), May 2019, Helsinki, Finland

Communication dans un congrès hal-04476775v1

Molecular omics resources and tools for amphipod investigation

Yannick Cogne , Duarte Gouveia , Olivier Pible , Arnaud Chaumot , Davide Degli-Esposti et al.

18th ICA - International Colloquium on Amphipoda, Thierry Rigaud & Rémi Wattier - University of Burgundy, Aug 2019, Dijon, France

Communication dans un congrès hal-04476760v1

Multi-Stressor's Effects on Contamination and Toxicity in French Streams Using Ecotoxicological Indicators based on Caged Gammarids

Noëlle Sarkis , Bertrand Villeneuve , Jeremy Piffady , Yves Souchon , Arnaud Chaumot et al.

Symposium for European Freshwater Sciences (SEFS11), Jun 2019, Zagreb, Croatia

Communication dans un congrès hal-02610071v1

From proteogenomics to systems biology in the freshwater amphipod G. fossarum

Davide Degli-Esposti , Natacha Koenig , Yannick Cogne , Duarte Gouveia , Arnaud Chaumot et al.

18th ICA - International Colloquium on Amphipoda, Thierry Rigaud & Rémi Wattier - University of Burgundy, Aug 2019, Dijon, France

Communication dans un congrès hal-04476766v1

Impact des PressiOns TOxiques MUltipleS sur les écosystèmes aquatiques du bassin versant du Rhône

Hugo Lepage , Rodolphe Gilbin , Karine Beaugelin-Seiller , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot et al.

Séminaire scientifique annuel de l'OHM Vallée du Rhône, Graie, OHM Vallée du Rhône, May 2019, Villeurbanne, France. pp.73-79

Communication dans un congrès hal-05339068v1

Proteogénomique pour le developpement des biomarqueurs pour la surveillance ecotoxicologique des environnements aquatiques

Christine Almunia , Duarte Gouveia , Arnaud Salvador , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard et al.

Colloque de la Société Française d'Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée - SEFA 2018, Jun 2018, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-02519648v1

The alliance of proteogenomics & multiplexed targeted ecotoxicoproteomics for environmental monitoring of river water quality

Duarte Gouveia , Arnaud Chaumot , Arnaud Salvador , Christine Almunia , Olivier Geffard et al.

EuPA 2018 - XII EuPA Congress "Translating genomes into biological functions", The European Proteomics Association (EuPA), Jun 2018, Santiago de Compostela, Spain

Communication dans un congrès hal-04476856v1

Use of Gammarus sp. for toxicity testing. A case study with the growth regulator insecticide fenoxycarb

H. Arambourou , I. Fuertes , E. Vulliet , G. Daniele , V. Debat et al.

SETAC Europe 28th annual meeting, May 2018, Rome, Italy. pp.22

Communication dans un congrès hal-02607479v1

Projet IPOTOMUS - Impact des Pressions TOxiquesMultiplessur les écosystèmes aquatiquesdu Bassin Versant du Rhône

Noëlle Sarkis , Rodolphe Gilbin , Hugo Lepage , Karine Beaugelin-Seiller , Olivier Geffard et al.

Séminaire scientifique annuel de l'OHM Vallée du Rhône, Graie, OHM Vallée du Rhône, May 2018, Lyon, France. pp.86-88

Communication dans un congrès hal-05338747v1

Effects of a mixture of pharmaceuticals in a freshwater model ecosystem

Sandrine Joachim , Viviane David , K. Nott , Arnaud Chaumot , Hervé Queau et al.

28. SETAC Europe annual meeting, May 2018, Rome, Italy

Communication dans un congrès ineris-01853353v1

Transgenerational effects of a parental exposure in the sentinel species Gammarus fossarum

Pauline Cribiu , Alain Devaux , Olivier Geffard , K. Abbaci , H. Quéau et al.

SETAC Europe 28th annual meeting, May 2018, Rome, Italy. pp.35

Communication dans un congrès hal-02608340v1

PROTEOGENOMIC FOR NON-MODEL ORGANISM: THE REVOLUTION IN ECOTOXICOLOGY

Christine Almunia , Duarte Domingos Gouveia , Davide Degli Esposti , Chaumot Arnaud , Arnaud Salvador et al.

Société d’Écotoxicologie Fondamentale et Appliquée (SEFA) 2018, Jun 2018, Montpellier (34000), France

Communication dans un congrès hal-04475739v1

ToxMate, évaluation en ligne de la qualité toxique d'une eau par analyse du comportement locomoteur d'invertébrés aquatiques

Alexandre Decamps , Arnaud Chaumot , Françoise Moulin , M. Dauphin , H. Quéau et al.

Colloque EcoBIM 2018, May 2018, Bordeaux, France. pp.15

Communication dans un congrès hal-02608343v1

Biosurveillance active pour l'évaluation de la variabilité temporelle de l'écotoxicité des milieux aquatiques continentaux

Adeline François , N. Delorme , H. Quéau , P. Noury , Arnaud Chaumot et al.

Colloque SEFA, Jun 2018, Montpellier, France. pp.32

Communication dans un congrès hal-02608344v1

Combined effects of parasitism and anthropogenic stressors in the freshwater amphipod Gammarus fossarum: impacts on multiple traits

M.J. Perrot Minnot , Arnaud Chaumot , G. Caillot , P. Noury , H. Quéau et al.

9th Acanthocephalan Workshop, Sep 2018, Stará Lesná, Slovakia. pp.23

Communication dans un congrès hal-02608341v1

Toxmate, station d'évaluation en ligne de la qualité toxique des eaux de rejets par l'analyse du comportement locomoteur d'invertébrés aquatiques autonome sur 30 jours

Alexandre Decamps , Françoise Moulin , M. Dauphin , D. Neuzeret , Arnaud Chaumot et al.

23èmes Journées Information Eaux, Oct 2018, Poitiers, France. pp.38

Communication dans un congrès hal-02608342v1

Dynamiques écologiques des lacs du littoral aquitain

Guillaume Bourguetou , Aurélien Jamoneau , Christine Argillier , Vincent Bertrin , Sébastien Boutry et al.

Journées techniques La chaîne des Lacs et étangs du littoral aquitain. Un territoire unique, l'implication de tous., Oct 2018, Biscarrosse, France

Communication dans un congrès hal-05227684v1

La biosurveillance des micropolluants : Comment en sommes nous arrivés à encager des gammares?

Olivier Geffard , Arnaud Chaumot

Journée connaissance au service de l'action: la qualité des milieux aquatiques, Oct 2017, Lille, France. pp.42

Communication dans un congrès hal-02606889v1

Phenotypic defects in Gammarus fossarum exposed to fenoxycarb as embryo

Hélène Arambourou , Arnaud Chaumot , Emmanuelle Vulliet , Gaëlle Daniele , N. Delorme et al.

SETAC Europe 27th Annual Meeting, May 2017, Brussels, Belgium, Belgium

Communication dans un congrès hal-01575044v1

Assessment of DNA integrity of Palaemonidae spermatozoa using the alkaline Comet assay: a pertinent tools for environmental biomonitoring

A. Erraud , M. Bonnard , A. Duflot , Adeline Geffard , Arnaud Chaumot et al.

SETAC Europe 27th Annual Meeting, May 2017, Brussels, Belgium. pp.2

Communication dans un congrès hal-02606951v1

When proteogenomics helps ecotoxicology

C. Almunia , D. Gouveia , Judith Trapp , Yannick Cogne , O. Pible et al.

SETAC Europe 27th Annual Meeting, May 2017, Brussels, Belgium. pp.3

Communication dans un congrès hal-02606948v1

Développement d’un biomarqueur de qualité spermatique chez les crevettes Palaemonidae : État des lieux en Baie de Seine

Alexandre Erraud , Marc Bonnard , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot , Alain Geffard et al.

Colloque annuel de la Société Française d’Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée (SEFA), Jun 2017, Lille, France

Communication dans un congrès hal-02418012v1

Protéomique ciblée pour la quantification multiplexée de biomarqueurs protéiques chez le crustacé Gammarus fossarum : perspectives pour la surveillance environnementale

D. Gouveia , Arnaud Chaumot , A. Charnot , C. Almunia , J. Armengaud et al.

Jun 2016, Lille, France. pp.30

Communication dans un congrès hal-02606958v1

Dietary transfer of Hg from Elodea nuttallii to Gammarus fossarum

R. Beauvais Fluck , Arnaud Chaumot , F. Gimbert , Olivier Geffard , C. Cosio

SETAC Europe 26th, Annual Meeting, May 2016, Nantes, France. pp.2

Communication dans un congrès hal-02604694v1

Development of an OECD two-generations reproduction test in Daphnia magna

C. Barata , B. Campos , K. de Schamphelaere , M. Coutellec , I. Lopes et al.

26. SETAC Europe annual meeting, May 2016, Nantes, France

Communication dans un congrès ineris-01854199v1

Evaluation intégrée et multidisciplinaire de la qualité du milieu par l’approche “Weight-of-Evidence” : application à une étude de cas le long de la Seine (PIREN-Seine)

I. Barjhoux , Lise C. Fechner , Jérémie D. Lebrun , A. Anzil , S. Ayrault et al.

Colloque 2016 de la Société Française d'Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée, Jun 2016, Reims, France. pp.26

Communication dans un congrès hal-02604700v1

Effets combinés des assèchements et d’un fongicide sur la décomposition de litière en milieu aquatique

A. Foulquier , O. Zoghlami , C. Bender , Joan Artigas , C. Margoum et al.

3ème journées d’écotoxicologie microbienne, Mar 2016, Valence, France. pp.19

Communication dans un congrès hal-02605176v1

Shotgun & multiplexed targeted proteomics define robust, specific protein biomarkers from non-model species for environmental monitoring

D. Gouveia , A. Charnot , A. Salvador , C. Almunia , J. Armengaud et al.

SETAC/iEOS Joint Focused Topic Meeting, Sep 2016, Ghent, Belgium. pp.24

Communication dans un congrès hal-02604689v1

Multiplexed quantitation of protein biomarkers in the invertebrate species Gammarus fossarum: new perspectives for molecular environmental monitoring

D. Gouveia , A. Charnot , A. Salvador , C. Almunia , J. Armengaud et al.

30th ESCPB Congress, Sep 2016, Barcelona, Spain. pp.24

Communication dans un congrès hal-02604691v1

The GAMMA project: Variability – diversity and Ecotoxicology in Gammarids, implications for environmental monitoring

Olivier Geffard , G. Charmantier , Marina Coquery , A. Dabrin , O. Dedourge Geffard et al.

Colloque 2016 de la Société Française d'Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée, Jun 2016, Reims, France. pp.46

Communication dans un congrès hal-02604695v1

Développement de gènes biomarqueurs pour l'évaluation de l’impact des perturbateurs endocrines dans l’espèce non-modèle Gammarus fossarum

D. Gouveia , François Bonneton , C. Almunia , J. Armengaud , Olivier Geffard et al.

Colloque 2016 de la Société Française d'Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée, Jun 2016, Reims, France. pp.19

Communication dans un congrès hal-02604697v1

Impact de la remise en suspension de sédiments contaminés par les métaux en milieu navigué sur les gammares encagés (Gammarus fossarum)

E. Prygiel , Gabriel Billon , A. Francois , David Dumoulin , Arnaud Chaumot et al.

Colloque 2016 de la Société Française d'Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée, Jun 2016, Reims, France. pp.17

Communication dans un congrès hal-02604698v1

De la bioaccumulation aux effets écotoxicologiques : comment modéliser le cycle de vie de Gammarus fossarum pour prédire et évaluer l’impact d’une contamination sur les populations d’une espèce sentinelle en biosurveillance ?

C. Lopes , S. Charles , Marc Babut , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard

Colloque 2016 de la Société Française d'Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée, Jun 2016, Reims, France. pp.56

Communication dans un congrès hal-02604696v1

Les effets de la contamination des cours d’eau sur les populations d’un crustacé d’eau douce, le gammare

Olivier Geffard , A. Ciliberti , Arnaud Chaumot

Journée eau & connaissance : contamination chimique des milieux aquatiques, Nov 2015, Lyon, France. pp.26

Communication dans un congrès hal-02604701v1

Effets unitaire et combiné de faibles concentrations en calcium et de faibles qualités de ressources sur la reproduction de Gammarus fossarum (Crustacés amphipodes)

Marc Rollin , Romain Coulaud , M. Danger , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard et al.

Colloque 2016 de la Société Française d'Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée, Jun 2016, Reims, France. pp.1

Communication dans un congrès hal-02604699v1

Application of a multiplexed quantitation of protein biomarkers in the invertebrate species Gammarus fossarum: interest to environmental monitoring

D. Gouveia , A. Charnot , A. Salvador , C. Almunia , J. Armengaud et al.

SETAC Europe 26th, Annual Meeting, May 2016, Nantes, France. pp.23

Communication dans un congrès hal-02604692v1

La contamination métallique de Gammarus fossarum pour prédire la perturbation écologique: détermination de concentrations seuils d'altération des communautés de macroinvertébrés benthiques

A. Ciliberti , M. Ferreol , Marina Coquery , R. Recoura Massaquant , Q. Chabanne et al.

Colloque 2015 de la Société Française d'Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée (SEFA), Jun 2015, Bordeaux, France. pp.24

Communication dans un congrès hal-02602095v1

Approche analytique et moléculaire innovante pour la découverte, le développement et l’application de biomarqueurs chez les gammaridés

D. Gouveia , A. Charnot , A. Salvador , C. Almunia , J. Armengaud et al.

2ième Colloque d’EcoPhysiologie Animale - CEPA, Nov 2015, La Rochelle, France. pp.2

Communication dans un congrès hal-02602090v1

Modélisation dynamique des processus physiologiques liés à la gestion de l’énergie chez Gammarus fossarum

C. Lopes , F. Mounier , S. Charles , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard

Journées de Modélisation BioMathématique de Besançon, Jul 2015, Métabief, France. pp.78

Communication dans un congrès hal-02602072v1

Proteogenomics to probe non-model organisms and biodiversity

J. Armengaud , Judith Trapp , F. Allain , D. Gouveia , C. Almunia et al.

SMAP2015, Sep 2015, Ajaccio, France. pp.1

Communication dans un congrès hal-02602071v1

Metal contamination of caged Gammarus fossarum to predict ecological disturbance: Determining threshold concentrations above which Gammarid numbers are abnormally low

A. Ciliberti , M. Ferreol , Marina Coquery , R. Recoura Massaquant , Q. Chabbane et al.

9th Symposium of European Freshwater Sciences - SEFS 9, Jul 2015, Geneva, Switzerland. pp.32

Communication dans un congrès hal-02604687v1

Combined effects of drought and fungicide exposure on aquatic leaf litter decomposition

Stéphane Pesce , O. Zoghlami , C. Bender , C. Margoum , Joan Artigas et al.

2015 Aquatic Sciences Meeting (ASLO), Feb 2015, Granada, Spain. pp.20

Communication dans un congrès hal-02602286v1

Gammarus : espèce sentinelle en écotoxicologie pour la surveillance des milieux aquatiques d’eau douce

Olivier Geffard , Arnaud Chaumot

2ième Colloque d’EcoPhysiologie Animale - CEPA, Nov 2015, La Rochelle, France. pp.69

Communication dans un congrès hal-02602091v1

Active biomonitoring with the freshwater amphipod Gammarus fossarum: example of a relevant approach for multi-Scale effect assessment of contaminants

A. Ciliberti , Arnaud Chaumot , A. Francois , P. Noury , H. Quéau et al.

17th International Symposium on Toxicity Assessment (ISTA), Aug 2015, Bellingham, United States. pp.48

Communication dans un congrès hal-02604686v1

Calibrating metal contents in caged Gammarus fossarum towards ecological disturbance: identifying threshold concentrations above which macroinvertebrate populations collapse

A. Ciliberti , A. Chandesris , Marina Coquery , R. Recoura Massaquant , Q. Chabanne et al.

9th Symposium for European Freshwater Sciences, Jul 2015, Genève, Switzerland. pp.1

Communication dans un congrès hal-02602070v1

Complémentarité d'échantillonneurs passifs et de bio-indicateurs pour évaluer la contamination en pesticides des eaux de surface de bassins versants agricoles

M. Le Dreau , Arnaud Chaumot , A. Foulquier , A. François , Olivier Geffard et al.

45e congrès du Groupe Français des Pesticides, May 2015, Versailles, France. 6 p

Communication dans un congrès hal-01318036v1

Cd-resistance in field Gammarus populations: genetic adaptation, transgenerational effect, or selection of phylogenetic cryptic lineages?

A. Vigneron , R. Wattier , H. Quéau , Thierry Rigaud , Olivier Geffard et al.

SETAC Europe 24th Annual Meeting, May 2014, Basel, Switzerland. pp.2

Communication dans un congrès hal-02600160v1

The GAMMA project: Variability – diversity and Ecotoxicology in Gammarids

Olivier Geffard , A. Assoumani , G. Charmantier , L. Charron , Marina Coquery et al.

8th International Crustacean Congress, Aug 2014, Frankfurt, Germany. pp.29

Communication dans un congrès hal-02600159v1

Expérimentation in situ (caging) en écotoxicologie : modélisation de la variabilité naturelle des mesures biologiques pour la définition de valeurs de référence permettant le diagnostic de la toxicité des milieux

Arnaud Chaumot

7èmes rencontres du réseau mesures, Apr 2014, Villeurbanne, France. pp.44

Communication dans un congrès hal-02600374v1

Réponses populationnelles à la contamination chez Gammarus (Crustacea): modifications des sensibilités toxicologiques et des traits d'histoire de vie

A. Vigneron , Olivier Geffard , H. Quéau , Arnaud Chaumot

36ème réunion du Groupe d'Etude de Biologie et Génétique des Populations "petit pois déridé", Aug 2014, Orsay, France. pp.1

Communication dans un congrès hal-02600163v1

Développement d’indicateurs chimiques et toxicologiques pour l’évaluation de la qualité des milieux

Olivier Geffard , A. Bado Nilles , W. Sanchez , Arnaud Chaumot , Marina Coquery

Colloque Hydroécologie 2013, Oct 2013, Clamart, France. pp.1

Communication dans un congrès hal-02599191v1

Étude de biomarqueurs chez les invertébrés aquatiques

Adeline Geffard , C. Amiard Triquet , L. Charron , Arnaud Chaumot , O. Dedourge Geffard et al.

Colloque de l'ARET 2013, Jun 2013, Paris, France. pp.3

Communication dans un congrès hal-02599192v1

In situ reproductive bioassay with caged Gammarus fossarum (Crustacea): a tool to diagnose toxicity of wastewater effluents

C. Lopes , Olivier Geffard , B. Xuereb , Romain Coulaud , G. Jubeaux et al.

23rd SETAC Europe, May 2013, Glasgow, United Kingdom. pp.2

Communication dans un congrès hal-02599186v1

Effects of food starvation on digestive activities, energy reserves and reproductive outcomes in Gammarus fossarum

L. Charron , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot , Romain Coulaud , Adeline Geffard et al.

23rd SETAC Europe, Jun 2013, Glasgow, United Kingdom. pp.2

Communication dans un congrès hal-02599188v1

Adaptation to pollutants through modifications of sensitivities and life-history traits: a case study based on nine field Gammarus populations

A. Vigneron , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot

23rd SETAC Europe, May 2013, Glasgow, United Kingdom. pp.2

Communication dans un congrès hal-02599185v1

Proteogenomics, a straightforward approach for protein discovery in non-model organism

Judith Trapp , Olivier Geffard , G. Imbert , J.C. Gaillard , A.H. Davin et al.

23rd SETAC Europe, May 2013, Glasgow, United Kingdom. pp.15

Communication dans un congrès hal-02599187v1

Life-history phenology strongly influences the vulnerability of populations to toxicants: a case study with the mudsnail Potamopyrgus antipodarum

Romain Coulaud , S. Charles , Arnaud Chaumot

CREAM Open Conference: Mechanistic Effect Models for Ecological Risk Assessment of Chemicals, Jun 2013, Leipzig, Germany. pp.41

Communication dans un congrès hal-02599189v1

Documenting the unique biology of gammarids by means of high-throughput proteogenomics

Judith Trapp , Olivier Geffard , J.C Gaillard , A.H. Davin , G. Imbert et al.

15th International Colloquium on Amphipoda, Sep 2013, Szczawnica, Poland. pp.1

Communication dans un congrès hal-02599196v1

Caged gammarids for the characterization of contamination levels in continental waters

J.P. Besse , Marina Coquery , C. Lopes , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard

Society for Environmental Geochemistry and Health 29th International Conference, Jul 2013, Toulouse, France. pp.25

Communication dans un congrès hal-02598673v1

Variabilité entre populations de la sensibilité aux contaminants et des traits d'histoire de vie chez Gammarus fossarum

A. Vigneron , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot

Colloque d'écophysiologie animale, Nov 2013, Lyon, France. pp.29

Communication dans un congrès hal-02599190v1

Le gammare, outil biologique pour caractériser la contamination chimique et la toxicité des eaux douces

Olivier Geffard , Arnaud Chaumot , Marina Coquery

3eme forum national des éco-entreprises, Feb 2012, Paris, France. pp.8

Communication dans un congrès hal-02597757v1

Les activités cholinestérasiques chez l’amphipode Gammarus fossarum : caractérisation, variabilité naturelle et application comme outil de diagnostic des effets neurotoxiques

Olivier Geffard , Arnaud Chaumot , B. Xuereb

ARET, Jul 2012, Paris, France. pp.5

Communication dans un congrès hal-02597744v1

De la validation des méthodes à celle des indicateurs biologiques

Wilfried Sanchez , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot , Jean-Marc Porcher

ECOBIM 2012 : Colloque d'Ecotoxicologie Franco-Québécois, Jun 2012, Reims, France

Communication dans un congrès ineris-00971009v1

In situ toxicity testing in Gammarus (Crustacea): addressing environmental and biological variability for a multi-scale effect assessment of contaminants

Arnaud Chaumot , Olivier Geffard

Ecostress Workshop, Nov 2012, Paimpont, France. pp.35

Communication dans un congrès hal-02597743v1

Caractérisation de la contamination chimique des eaux continentales par une approche de biosurveillance active sur le macroinvertébéré Gammarus fossarum. Vers la détermination de valeurs seuil de contamination

J.P. Besse , Marina Coquery , C. Lopes , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard

SEFA, Société d'écotoxicologie fondamentale et appliquée, Jul 2012, Lyon, France. pp.16

Communication dans un congrès hal-02597233v1

Réalisme environnemental des modèles de populations pour l'évaluation de l'impact démographique de la toxicité des contaminants : exemple de la prise en compte de la variabilité saisonnière chez les invertébrés aquatiques

Romain Coulaud , Olivier Geffard , H. Quéau , S. Charles , Arnaud Chaumot

SEFA, Jul 2012, Lyon, France. pp.43

Communication dans un congrès hal-02597786v1

Approche multi-échelle chez le crustacé Gammarus pour le diagnostic de la qualité des milieux : développement d'indicateurs robustes, sensibles et pertinents

Olivier Geffard , Arnaud Chaumot

Journée de travail GIP Seine-Aval, Mar 2011, Rouen, France. pp.27

Communication dans un congrès hal-02595380v1

Measurement of vitellogenin protein in invertebrates : relevance and usefulness of mass spectrometry (LC-MS/MS) to propose a specific and transferable method across species

G. Jubeaux , R. Simon , F. Audouard Combe , R. Tutundjian , H. Quéau et al.

SETAC Europe 21st Annual Meeting, May 2011, Milan, Italy. pp.14

Communication dans un congrès hal-02595238v1

In situ feeding assay with Gammarus fossarum: move forward to an ecologically relevant biomonitoring of water chemical quality

Romain Coulaud , Olivier Geffard , H. Quéau , Jeanne Garric , S. Charles et al.

SETAC Europe 21st Annual Meeting, May 2011, Milan, Italy. pp.21

Communication dans un congrès hal-02595237v1

Quantification of vitellogenin by mass spectrometry in the freshwater amphipod, Gammarus fossarum: a potential endocrine disruption biomarker

G. Jubeaux , R. Simon , F. Audouard Combe , H. Quéau , A. Salvador et al.

SETAC Europe 21st Annual Meeting, May 2011, Milan, Italy. pp.16

Communication dans un congrès hal-02595239v1

Measurement of vitellogenin protein in invertebrates: relevance and usefulness of mass spectrometry (LC-MS/MS) to propose a specific and transferable method across species

Romain Simon , Fabien Audouard-Combe , Guillaume Jubeaux , Renaud Tutundjian , Hervé Quéau et al.

Congrès français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP 2011), Sep 2011, Avignon, France

Communication dans un congrès hal-00960729v1

From toxicological to eco-toxicological effects : how matrix population models can help to assess population sensitivity to contaminants in ecosystems

Arnaud Chaumot

Séminaire Rhône-Alpin de Modélisation du Vivant (SEMOVI), Apr 2011, Lyon, France. pp.36

Communication dans un congrès hal-02595236v1

Mesure du taux d'alimentation in situ avec Gammarus fossarum (Crustacé) : un outil écologiquement pertinent pour l'évaluation de la qualité chimique des milieux aquatiques

Romain Coulaud , Olivier Geffard , H. Quéau , Jeanne Garric , S. Charles et al.

Colloque de la SEFA, Jun 2011, Paris, France. pp.22

Communication dans un congrès hal-02595241v1

Modelling and in situ caging for a realistic extrapolation of ecotoxicological effects at the population level: a methodological approach with Gammarus fossarum (Crustacean) and Potamopyrgus antipodarum (Gastropod)

Romain Coulaud , O. Adam , Olivier Geffard , H. Quéau , Jeanne Garric et al.

20th SETAC annual meeting, May 2010, Seville, Spain. pp.24

Communication dans un congrès hal-02593331v1

Construire une évaluation multi-échelle des effets des contaminants dans les milieux aquatiques d'eau douce avec les macro-invertébrés

Arnaud Chaumot , Olivier Geffard , B. Ferrari , Jeanne Garric

Colloque de la SEFA, Mar 2010, Versailles, France. pp.31

Communication dans un congrès hal-02593332v1

Coupler modèles de dynamique de population et encagements in situ pour appréhender les effets populationnels des contaminations : illustration de la démarche chez le crustacé Gammarus fossarum

Romain Coulaud , Olivier Geffard , O. Adam , H. Quéau , Jeanne Garric et al.

Ecologie 2010, Sep 2010, Montpellier, France. pp.25

Communication dans un congrès hal-02593850v1

A temperature-dependent Leslie model to describe the dynamics of a bullhead (Cottus gobio) population

J. Kielbassa , Arnaud Chaumot , M.L. Delignette-Müller , S. Charles

Conference on Computational and Mathematical Population Dynamics, May 2010, Bordeaux, France. pp.1

Communication dans un congrès hal-02593330v1

Evolution of nuclear receptors in insects

François Bonneton , Arnaud Chaumot , T. Iwema , I. Billas , D. Moras et al.

18th International Ecdysone Workshop 2010, Jul 2010, Ceske Budejovice, Czech Republic. pp.1

Communication dans un congrès hal-02593438v1

In situ bio-monitoring of water quality: multi-scale effect assessment in Gammarus fossarum

Olivier Geffard , Romain Coulaud , O. Adam , H. Quéau , Arnaud Chaumot

14th international colloquium on Amphipoda, Sep 2010, Sevilla, Spain. pp.24

Communication dans un congrès hal-02593848v1

Multi-scale effect assessment in Gammarus fossarum

Olivier Geffard , Arnaud Chaumot

Gammarus day, Jun 2009, Zürich, Switzerland. pp.34

Communication dans un congrès hal-02592615v1

Mode d'action des toxiques et sensibilité des espèces

Arnaud Chaumot , Jeanne Garric , Soizic Morin

AO Maîtrises "Tox-Indic" (Ecotoxicologie-Bioindication), Dec 2008, Lyon, France. pp.9

Communication dans un congrès hal-02594685v1

Quantitative genetics meets ecotoxicology to assess the ability of adaptation to contamination: lessons learned from one assay with the crustacean Gammarus pulex

Arnaud Chaumot , Pierre Gos , Olivier Geffard , Jeanne Garric

SETAC Europe 18th Annual Meeting, May 2008, Warsaw, Poland. pp.17

Communication dans un congrès hal-02590554v1

Adaptation et tolérance à la contamination des milieux

Arnaud Chaumot , Soizic Morin , F. Vincent Hubert , Bernard Montuelle

AO Maîtrises "Tox-Indic" (Ecotoxicologie-Bioindication), Dec 2008, Lyon, France. pp.8

Communication dans un congrès hal-02594686v1

Stochasticity and spatial heterogeneity in population dynamics: implications for ecotoxicological risk assessment

Arnaud Chaumot , Elise Billoir , S. Charles

SETAC Europe 17th Annual Meeting, Porto, Portugal, PRT, 20-24 May 2007, 2007, pp.1

Communication dans un congrès hal-02589497v1

Using variables aggregation methods to assess toxicant effects on fish populations in river networks

Arnaud Chaumot , S. Charles , Patrick Flammarion , Jeanne Garric , P. Auger

10th annual meeting of SETAC Europe, Brighton, GBR, 21-25 mai 1999, 2000, United Kingdom

Communication dans un congrès hal-02579112v1

Development of an ecotoxicological model in an arborescent river network: an attempt with a brown trout population

Arnaud Chaumot , S. Charles , P. Auger , Patrick Flammarion , Jeanne Garric

Challenges in applied population biology AAB meeting Aspects of Applied Biology 53, University London, GBR, 8-9 juillet 1999, 1999, United Kingdom. pp.131-136

Communication dans un congrès hal-02578520v1

Integrating the cocktail effect in environmental footprint based on Life Cycle Assessment

Anouar Mejait , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard , Eric Latrille , Dominique Patureau et al.

Society of Environmental Toxicology and Chemistry (SETAC), May 2026, Maastricht, Netherlands.

Poster de conférence hal-05634229v1

Robust Integrated Multi-Omics Workflow for Systems Ecotoxicology: Validation and Application to Endocrine Disruption in Non-Model Species

Rémy de Boni , Delphine Arquier , Mélanie Nguyen , Sophie Ayciriex , Davide Degli-Esposti et al.

IMSC26, Aug 2026, Lyon, France

Poster de conférence hal-05735523v1

Lipidomics and metabolomics investigation of organ-specific perturbations induced by Pravastatine and Cadmium exposure on the freshwater sentinel crustaceans Gammarus fossarum by high resolution mass spectrometry

Valentina Calabrese , Thomas Alexandre Brunet , Delphine Arquier , Arnaud Chaumot , Arnaud Salvador et al.

16èmes JS du RFMF Saint-Malo 2024, Jun 2024, Saint-malo, France

Poster de conférence hal-04776001v1

Approches de modélisation pour évaluer les effets écotoxicologiques des pesticides : revue critique

Floriane Larras , Sandrine Charles , Arnaud Chaumot , Céline Pelosi , Morgane Le Gall et al.

51ème congrès du Groupe Français de recherche sur les Pesticides, May 2023, Paris, France. 51e congrès du Groupe Français de recherches sur les Pesticides (GFP) - Recueil des résumés

Poster de conférence hal-04664932v1

Stratégie de déploiement de biomarqueurs en appui à la surveillance de la qualité des masses d’eau, le long du continuum bassin verssant-littoral

Benoit Xuereb , Khedidja Abbaci , Rachid Amara , Michel Auffret , Anne Bado-Nilles et al.

Colloque annuel de la Société Française d’Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée (SEFA), Jul 2023, Le Havre, France

Poster de conférence hal-04342861v1

Development of a multi-omics extraction method for ecotoxicology: in-depth investigation of the reproductive cycle of the sentinel species Gammarus fossarum

Thomas Alexandre Brunet , Julien Faugère , Yohann Clément , Anabelle Espeyte , Olivier Geffard et al.

Gordon Research Conference Lipidomics, Aug 2022, Newry, United States.

Poster de conférence hal-03995876v1

Development of a multi-omics extraction method for ecotoxicology: in-depth investigation of the reproductive cycle of the sentinel species Gammarus fossarum

Thomas Alexandre Brunet , Julien Faugère , Yohann Clément , Anabelle Espeyte , Olivier Geffard et al.

18th International Conference of the Metabolomics Society, Jun 2022, Valence, Spain.

Poster de conférence hal-03995871v1

A review of modelling approaches for ecological risk assessment of pesticides

Floriane Larras , Sandrine Charles , Arnaud Chaumot , Céline Pélosi , Morgane Le Gall et al.

SETAC Europe 32nd annual meeting, May 2022, Copenaghe, Denmark

Poster de conférence hal-03788931v1

In situ isobaric lipid mapping by MALDI-ion mobility separation-mass spectrometry imaging

Tingting Fu , Janina Oetjen , Manuel Chapelle , Alexandre Verdu , Matthias Szesny et al.

68th Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, May 2020, Online, United States. , 2020

Poster de conférence hal-03996540v1

Caractérisation spatio-temporelle de la contamination en pesticides et de son impact écotoxique dans un cours d'eau agricole jurassien

M. Le Dreau , Adeline François , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard , C. Margoum et al.

Groupe Français des Pesticides 2018, May 2018, Limoges, France. pp.1, 2018

Poster de conférence hal-02607532v1

Effects of a mixture of pharmaceuticals in a freshwater model ecosystem

S. Joachim , V. David , K. Nott , Arnaud Chaumot , H. Quéau et al.

SETAC Europe 28th annual meeting, May 2018, Rome, Italy. pp.1, 2018

Poster de conférence hal-02608377v1

Caractériser la toxicité des effluents de station de traitements 1. Expérimentations ex-situ et in-situ à la station d'épuration de Sophia-Antipolis : Réalisation de bio essais pour évaluer les performances épuratoires sur la toxicité du rejet et son impact sur le milieu récepteur.

Adeline François , R. Recoura Massaquant , Alexandre Decamps , N. Delorme , P. Noury et al.

Colloque SEFA, Jun 2018, Montpellier, France. pp.1, 2018

Poster de conférence hal-02608470v1

Utilisation de l’essai des comètes pour la surveillance des milieux aquatiques – problématique de la conservation des échantillons

K. Taïr-Abbaci , Catherine Labbé , Alexandra Depince , L. Garnero , Sylvie Bony et al.

14. Colloque International Francophone en Ecotoxicologie Aquatique, May 2018, Talence, France. , 78 p., 2018, EcoBIM 2018

Poster de conférence hal-02738412v1

Caractériser la toxicité des effluents de station de traitements: 2. ToxMate, nouvel outil de pilotage pour les usines de traitements des eaux par le suivi en ligne du comportement d'invertébrés aquatiques

Alexandre Decamps , Arnaud Chaumot , Adeline François , M. Dauphin , Françoise Moulin et al.

Colloque SEFA, Jun 2018, Montpellier, France. pp.1, 2018

Poster de conférence hal-02608471v1

Caractérisation in situ de la pression chimique dans les plan d'eau aquitains à l'aide de l'encagement de gammares

Adeline François , N. Delorme , L. Garnero , G. Jan , H. Quéau et al.

Journée technique "la chaîne des lacs et étangs du littoral Aquitain", Oct 2018, Biscarosse, France. pp.1, 2018

Poster de conférence hal-02608478v1

Genomic cytosine methylation level: a molecular marker of stress in the species Gammarus fossarum?

Pauline Cribiu , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard , J.L. Ravanat , T. Bastide et al.

SETAC Europe 28th annual meeting, May 2018, Rome, Italy. pp.1, 2018

Poster de conférence hal-02608378v1

Expérimentations ex-situ et in-situ à la station d'épuration de Sophia-Antipolis : Réalisation de bioessais pour évaluer les performances épuratoires sur la toxicité du rejet et son impact sur le milieu récepteur.

A. Francois , R. Recoura Massaquant , Alexandre Decamps , N. Delorme , P. Noury et al.

6e Conférence Eau et Santé, Réduire les rejets de micropolluants liés aux pratiques de soin : quels leviers possibles ?, Mar 2017, Lyon, France. pp.1, 2017

Poster de conférence hal-02607055v1

Assessment of sperm quality using the Comet assay: from its optimization until its deployment on the field

Alexandre Erraud , Marc Bonnard , Arnaud Chaumot , Alain Geffard , Olivier Geffard et al.

PRIMO – 19th annual meeting, Jun 2017, Matsuyama, Japan

Poster de conférence hal-02417847v1

Effects of biotic and abiotic factors on the DNA methylation status in Gammarus fossarum

Pauline Cribiu , J.L. Ravanat , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard , Sylvie Bony et al.

18th International Symposium on Toxicity Assessment (ISTA), Jul 2017, Limeira, Brazil. 2017

Poster de conférence hal-02606964v1

Phenotypic defects in Gamamrus fossarum (Amphipoda) exposed to fenoxycarb as embryo

H. Arambourou , Arnaud Chaumot , E. Vulliet , G. Daniele , N. Delorme et al.

SETAC Europe 27th annual meeting, May 2017, Bruxelles, Belgium. pp.1, 2017

Poster de conférence hal-02606520v1

Trans- and multigenerational impacts of micropollutants on life-history traits of the mosquito Aedes Aegyptus

S.M. Prud'Homme , Arnaud Chaumot , Eva Cassar , J.P. David , S. Reynaud

SETAC Europe 27th Annual Meeting, May 2017, Brussels, Belgium. 2017

Poster de conférence hal-02606959v1

Active biomonitoring using the freshwater crustacean Gammarus fossarum: an operational tool to monitor chemical contamination and toxicity in continental surface waterbodies

R. Recoura Massaquant , Aurélie Maurice , A. Tsoukalas , T. Hombert , Y. Penru et al.

SETAC Europe 27th Annual Meeting, May 2017, Brussels, Belgium. 2017

Poster de conférence hal-02606963v1

Proteome analysis of male gonads in Gammarus fossarum exposed to Pyriproxyfen: mining for endocrine disruption biomarkers

D. Gouveia , Judith Trapp , K. Abbaci , L. Guillet Revol , Olivier Geffard et al.

SETAC Europe 27th Annual Meeting, May 2017, Brussels, Belgium. pp.1, 2017

Poster de conférence hal-02606961v1

Development of biomarker genes for endocrine disruption assessment in the non-model crustacean species Gammarus fossarum

D. Gouveia , François Bonneton , C. Almunia , Sara Viala , J. Armengaud et al.

SETAC Europe 27th Annual Meeting, May 2017, Brussels, Belgium. pp.1, 2017

Poster de conférence hal-02606955v1

Active biomonitoring for assessment of chemical contamination and toxicity of aquatic environments

R. Recoura Massaquant , Aurélie Maurice , A. Tsoukalas , T. Hombert , Y. Penru et al.

96ème édition du congrès de l’ASTEE, Jun 2017, Liège, Belgium. pp.1, 2017

Poster de conférence hal-02606888v1

Development of a SRM-based multiplexed quantitation of protein biomarkers in Gammarus fossarum

A. Charnot , D. Gouveia , Arnaud Chaumot , J. Lemoine , Olivier Geffard et al.

SETAC Europe 26th Annual Meeting, May 2016, Nantes, France. pp.1, 2016

Poster de conférence hal-02604703v1

Development of an OECD two-generations reproduction test in Daphnia magna

C. Barata , B. Campos , C. Rivetti , G.A. Le Blanc , S. Eytcheson et al.

SETAC Europe 26th Annual Meeting, May 2016, Nantes, France. pp.1, 2016

Poster de conférence hal-02604704v1

Resuspension of metal contaminated sediments and caged gammarid responses in navigated channelized rivers

E. Prygiel , David Dumoulin , Gabriel Billon , A. Francois , Arnaud Chaumot et al.

18th International Conference on Heavy Metals in the Environment, Sep 2016, Ghent, Belgium. pp.1, 2016

Poster de conférence hal-02604706v1

Expression des récepteurs nucléairs RXR E75 pendant le cycle reproductif du crustacé Gammarus fossarum et modulation lors de l'exposition à 3 insecticides perturbateurs endocriniens

D. Gouveia , François Bonneton , C. Almunia , J. Armengaud , Olivier Geffard et al.

Colloque 2017 de la Société Française d'Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée, Jun 2016, Lille, France. pp.1, 2017

Poster de conférence hal-02606957v1

Role of cellular compartmentalization in the trophic transfer of Mercury species in a plant-crustacean food chain

R. Beauvais Fluck , Arnaud Chaumot , F. Gimbert , H. Quéau , Olivier Geffard et al.

SETAC Europe 26th Annual Meeting, May 2016, Nantes, France. pp.1, 2016

Poster de conférence hal-02604702v1

Passive samplers and in situ bio-monitoring tools to assess pesticide impacts in the surface water of agricultural catchments.

C. Margoum , M. Le Dreau , Arnaud Chaumot , A. Francois , Nicolas Mazzella et al.

Pesticides 2016, 9th European Conference on Pesticides and Related Organic Micropollutants in the Environment,15th Symposium on Chemistry and Fate of Modern Pesticides, Oct 2016, Santiago de Compostela, Spain. 2016

Poster de conférence hal-02604959v1

Development of biomarker genes for endocrine disruption assessment in the non-model crustacean species Gammarus fossarum

D. Gouveia , François Bonneton , C. Almunia , J. Armengaud , Olivier Geffard et al.

30th ESCPB Congress, Sep 2016, Barcelona, Spain. pp.1, 2016

Poster de conférence hal-02604705v1

Complementarity of passive samplers and biomonitoring tools to evaluate surface water contamination by pesticides in agricultural catchments

M. Le Dreau , Arnaud Chaumot , A. Francois , Olivier Geffard , C. Margoum et al.

Symposium in Pesticide Chemistry, Sep 2015, Piacenza, Italy. pp.1, 2015

Poster de conférence hal-02602027v1

Metal contamination of in situ caged Gammarus fossarum as an indicator to predict ecological disturbance: a national scale case-study

A. Ciliberti , A. Chandesris , Marina Coquery , R. Recoura Massaquant , Q. Chabanne et al.

SETAC Europe 25th Annual Meeting, May 2015, Barcelona, Spain. pp.1-, 2015

Poster de conférence hal-02602094v1

Contrasting abilities of metal bioaccumulation in Gammarus populations with different exposure histories

Nastassia Urien , Jérémie D. Lebrun , Antoine Farfarana , Arnaud Chaumot , Lise C. Fechner et al.

SETAC Europe 25th Annual Meeting, May 2015, Barcelone, Spain. Chair: Karel A.C. and De Schamphelaere, pp.1, 2015

Poster de conférence hal-02601293v1

Consideration of inter-population variability to improve ecological relevance of biomarkers

O. Dedourge Geffard , Arnaud Chaumot , L. Charron , A. Jaffal , Adeline Geffard et al.

SETAC Europe 25th Annual Meeting, May 2015, Barcelona, Spain. pp.1, 2015

Poster de conférence hal-02602093v1

Dynamic modeling of physiological processes related to energy management in Gammarus fossarum

C. Lopes , F. Mounier , S. Charles , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard

SETAC Europe 25th Annual Meeting, May 2015, Barcelona, Spain. pp.1, 2015

Poster de conférence hal-02602092v1

Variability of Cd-sensitivity and phylogenetic diversity of field populations throughout the Gammarus fossarum/pulex species complex

A. Vigneron , Olivier Geffard , H. Pellerin , R. Recoura Massaquant , A. Francois et al.

SETAC Europe 24th Annual Meeting, May 2014, Basel, Switzerland. pp.1, 2014

Poster de conférence hal-02600162v1

Measuring trace element contamination in surface waters using chemical and biological monitoring tools

A. Larrose , A. Dabrin , R. Recoura Massaquant , A. Francois , J. Gahou et al.

The 38th International Symposium on Environmental Analytical Chemistry – ISEAC38, Jun 2014, Lausanne, Switzerland. pp.2, 2014

Poster de conférence hal-02600719v1

10 ans de recherche sur le gammare à Irstea: développement d'une espèces sentinelle de la pollution des milieux aquatiques

Arnaud Chaumot , Olivier Geffard

Colloque 2014 de la Société Française d'Ecotoxicologie Fondamentale et Appliquée, Jul 2014, Besançon, France. pp.1, 2014

Poster de conférence hal-02600161v1

Unravel the reproductive biology of Gammarus fossarum by comparative proteomics

Judith Trapp , Olivier Geffard , G. Imbert , J.C. Gaillard , A.H. Davin et al.

Colloque d'écophysiologie animale, Nov 2013, Lyon, France. pp.1, 2013

Poster de conférence hal-02599194v1

Comparative proteomics of the freshwater amphipod Gammarus fossarum: focus on endocrine regulation

Judith Trapp , Olivier Geffard , J.C. Gaillard , A.H. Davin , G. Imbert et al.

23rd SETAC Europe, May 2013, Glasgow, United Kingdom. pp.1, 2013

Poster de conférence hal-02599195v1

Les activités cholinestérasiques chez l’amphipode Gammarus fossarum : caractérisation, variabilité naturelle et application comme outil de diagnostic des effets neurotoxiques

Olivier Geffard , Arnaud Chaumot

PollDiff'Eau 2013, Sep 2013, Paris, France. pp.1, 2013

Poster de conférence hal-02599193v1

Etude de l’influence de facteurs confondants sur les activités digestives et les réserves énergétiques de Gammarus fossarum

L. Charron , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot , H. Quéau , Véronique Gaillet et al.

ECOBIM, Jun 2012, Reims, France. pp.1, 2012

Poster de conférence hal-02597741v1

Caged Gammarus fossarum to improve the characterization of contamination levels in continental waters: toward the determination of threshold values

J.P. Besse , Marina Coquery , C. Lopes , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard

Ecobim, Jun 2012, Reims, France. pp.1, 2012

Poster de conférence hal-02597737v1

Développement de biomarqueurs protéiques chez les invertébrés aquatiques : diversité phylogénétique, validité fonctionnelle et sensibilité

Olivier Geffard , G. Jubeaux , R. Simon , A. Salvador , Arnaud Chaumot

ECOBIM, Jun 2012, Reims, France. pp.1, 2012

Poster de conférence hal-02597740v1

Encagement de Gammarus fossarum pour le diagnostic de toxicité des milieux : modélisation de la variabilité naturelle des marqueurs biologiques pour la définition de valeurs de référence

Arnaud Chaumot , Romain Coulaud , B. Xuereb , Olivier Geffard

ECOBIM, Jun 2012, Reims, France. pp.1, 2012

Poster de conférence hal-02597738v1

Caged gammarids to improve the characterization of contamination levels in continental waters - toward the determination of threshold values

J.P. Besse , Marina Coquery , C. Lopes , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard

EMEC ( European Meeting on Environmental Chemistry) 12th, Dec 2011, Clermont Ferrand, France. pp.1, 2011

Poster de conférence hal-02597234v1

Mesure de la vitellogénine par spectrométrie de masse (LC-MS/MS) chez un amphipode dulçaquicole, Gammarus fossarum : un biomarqueur potentiel de la perturbation endocrinienne

G. Jubeaux , R. Simon , F. Audouard Combe , H. Quéau , A. Salvador et al.

Colloque de la SEFA, Jun 2011, Paris, France. pp.1, 2011

Poster de conférence hal-02595243v1

La capacité digestive de gammares transplantés : Indicatrice d'un stress chimique dans les études in situ ?

L. Charron , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot , H. Quéau , Adeline Geffard et al.

Colloque de la Sefa, Jun 2011, Paris, France. pp.1, 2011

Poster de conférence hal-02595246v1

Responses of a battery of macroinvertebrate bioassays for the hazard assessment of sediments: Approach integrating the natural variability of the organisms life-traits

C. Durand , R. Mons , A. Dabrin , Marina Coquery , Olivier Geffard et al.

15th International Symposium on Toxicity assessment (ISTA 15), Jul 2011, Hong-Kong, pp.1, 2011

Poster de conférence hal-02597802v1

Mesure de la vitellogénine chez les invertébrés : pertinence et application de la spectrométrie de masse (LC-MS/MS)en vue de proposer une méthode spécifique et transférable entre espèces

G. Jubeaux , R. Simon , F. Audouard Combe , H. Quéau , A. Salvador et al.

Colloque de la SEFA, Jun 2011, Paris, France. pp.1, 2011

Poster de conférence hal-02595244v1

Approche multi-échelle chez le crustacé Gammarus fossarum pour l'évaluation de la qualité chimique des milieux aquatiques

Olivier Geffard , M. Gust , G. Jubeaux , Romain Coulaud , R. Simon et al.

Ecobim, Jun 2011, Mont Joli, Canada. pp.1, 2011

Poster de conférence hal-02595247v1

Population dynamics and integration of individual toxicological effects for in situ water quality assessment: a modelling approach with Gammarus fossarum and Potamopyrgus antipodarum

Arnaud Chaumot , Olivier Geffard , Romain Coulaud , O. Adam , H. Quéau et al.

Colloque de la SEFA, Mar 2010, Versailles, France. pp.1, 2010

Poster de conférence hal-02593333v1

Developing a method for vitellogenin quantification to investigate the reproductive investment in Gammarids

G. Jubeaux , R. Simon , Arnaud Chaumot , F. Audouard Combe , A. Salvador et al.

14th international colloquium on Amphipoda, Sep 2010, Seville, Spain. pp.1, 2010

Poster de conférence hal-02593853v1

Déterminisme de l’impact des pesticides en cours d’eau : influence de la dynamique de l’exposition sur les effets biologiques

Véronique Gouy , A. Berard , Agnes Bouchez , Nadia Carluer , S. Charles et al.

Colloque de restitution du programme EC2CO, Nov 2010, Toulouse, France. pp.1, 2010

Poster de conférence hal-02606344v1

Population level integration of individual effect measurements for in situ water quality assessment: a modelling approach with Gammarus fossarum

Romain Coulaud , Olivier Geffard , H. Quéau , S. Charles , Arnaud Chaumot

14th international colloquium on Amphipoda, Sep 2010, Séville, Spain. pp.1, 2010

Poster de conférence hal-02593852v1

Development of vitellogenin measurement in the freshwater amphipod Gammarus fossarum: first step to propose a relevant biomarker for reproductive impact assessment of endocrine disruptors

G. Jubeaux , R. Simon , J. Lemoine , A. Salvador , H. Quéau et al.

SETAC Europe, 20th annual meeting, May 2010, Seville, Spain. pp.1, 2010

Poster de conférence hal-02593854v1

Bio-surveillance in situ de la qualité des eaux douces : approche multi-échelle chez Gammarus fossarum

Olivier Geffard , Arnaud Chaumot , B. Xuereb , Emilie Lacaze , Adeline Geffard et al.

Colloque de la SEFA, Mar 2010, Versailles, France. pp.1, 2010

Poster de conférence hal-02593856v1

In situ experiments to develop ecological relevant tools in individual and population levels

O. Adam , Romain Coulaud , Olivier Geffard , H. Quéau , Jeanne Garric et al.

SETAC Europe, 19th annual meeting, May 2009, Göteborg, Sweden. pp.1, 2009

Poster de conférence hal-02591888v1

Population level integration of individual effect measurements for in situ water quality assessment: a modelling approach with Gammarus fossarum (Crustacean) and Potamopyrgus antipodarum (Gastropod)

Arnaud Chaumot , Olivier Geffard , Romain Coulaud , O. Adam , H. Quéau et al.

Final MODELKEY Conference, Nov 2009, Leipzig, Germany. pp.1, 2009

Poster de conférence hal-02592301v1

Modeling and in situ caging for a realistic extrapolation of ecotoxicological effects at the population level: a methodological approach with Gammarus fossarum (Crustacean) and Potamopyrgus antipodarum (Gastropod)

Romain Coulaud , O. Adam , Olivier Geffard , H. Quéau , Jeanne Garric et al.

14th ISTA, Sep 2009, Metz, France. pp.1, 2009

Poster de conférence hal-02592102v1

In situ bio-monitoring of water quality: multi-scale effect assessment in Gammarus fossarum

Olivier Geffard , Arnaud Chaumot , O. Adam , B. Xuereb , Emilie Lacaze et al.

MODELKEY Conference "How to assess the impact of key pollutants in aquatic ecosystems", Nov 2009, Leipzig, Germany. pp.1, 2009

Poster de conférence hal-02592646v1

Chronic effects of ivermectin on Daphnia magna and Ceriodaphnia dubia: between-species and between-strains comparisons

C. Lopes , S. Charles , Arnaud Chaumot , B. Vollat , Jeanne Garric

SETAC Europe 18th Annual Meeting, May 2008, Warsaw, Poland. pp.1, 2008

Poster de conférence hal-02590556v1

Chronic effects of ivermectin chronic effects of ivermectin on daphnia magna and ceriodaphnia dubia: between-species and between-strains comparisons

C. Lopes , S. Charles , Arnaud Chaumot , B. Vollat , Jeanne Garric

SETAC Europe 18th Annual Meeting, May 2008, Warsaw, Poland. pp.1, 2008

Poster de conférence hal-02595544v1

Cadmium tolerance is associated with metallothionein gene expression plasticity in Gammarus fossarum field populations

Auréline Lalouette , Arnaud Chaumot , Louveline Lepeule , Karen Gaget , Nicolas Delorme et al.

2024

Pré-publication, Document de travail hal-04792699v1

Concomitant investigation of crustacean amphipods lipidome and metabolome during molting stage by Zeno SWATH Data-Independent Acquisition coupled with Electron Activated Dissociation and machine learning

Thomas Alexandre Brunet , Yohann Clement , Valentina Calabrese , Jerome Lemoine , Olivier Geffard et al.

2023

Pré-publication, Document de travail hal-04328990v1

Ecotoxicology, aquatic invertebrates

Arnaud Chaumot , Davide Degli Esposti , Miguel Santos , Olivier Geffard

Encyclopedia of Toxicology, Elsevier, pp.23-30, 2024, ⟨10.1016/B978-0-12-824315-2.00116-0⟩

Chapitre d'ouvrage hal-04372207v1

Étude de la qualité des milieux aquatiques : caractérisation des impacts écotoxiques

Thierry Burgeot , P. Bustamante , J. Fort , Marie-Agnès Coutellec , Didier Azam et al.

Détection des impacts toxiques dans l'environnement - du terrain à la règlementation, Burgeot, T., Minier, C., Cuny, D., Cuny, M.A., Bispo, A., Grand, C. (eds), ISTE éditions, pp.70, 2018, 9781784054687

Chapitre d'ouvrage hal-02608339v1

Gammarids as Reference Species for Freshwater Monitoring

Arnaud Chaumot , Olivier Geffard , L. Maltby , J. Armengaud , Catherine Mouneyrac et al.

Aquatic Ecotoxicology: Advancing Tools for Dealing with Emerging Risks, Elsevier Inc., pp.253-280, 2015

Chapitre d'ouvrage hal-02602067v1

Ecotoxicology, Aquatic Invertebrates

Arnaud Chaumot , B. Ferrari , Olivier Geffard , Jeanne Garric , P. Wexler

Encyclopedia of Toxicology, 3rd edition vol 2, Elsevier Inc., Academic Press, pp.284-288, 2014

Chapitre d'ouvrage hal-02600053v1

In Situ Bioassays in Ecotoxicology

B.J.D. Ferrari , Olivier Geffard , Arnaud Chaumot

Encyclopedia of Aquatic Ecotoxicology, Férard, J.F. & Blaise, C. (eds), Springer, pp.635-642, 2013

Chapitre d'ouvrage hal-02599184v1

Impairments of endocrine functions; causes and consequences

J.C. Amiard , Arnaud Chaumot , Martine Couderc , Jeanne Garric , Olivier Geffard et al.

Ecological biomarkers: Indicators of ecotoxicological Effects, CRC Press, pp.187-218, 2012

Chapitre d'ouvrage hal-02600060v1

Impairment of endocrine Functions: causes and consequences

Jean-Claude Amiard , Arnaud Chaumot , Mickaël Couderc , Garric Jeanne , Olivier Geffard et al.

Amiard–Triquet C., Amiard J.-C. & Rainbow P. Ecological biomarkers: Indicators of ecotoxicological effects., CRC Press, Taylor & Francis Group, pp.187-213, 2012

Chapitre d'ouvrage hal-01925773v1

Les mathématiques au secours de la faune aquatique

Arnaud Chaumot , S. Charles , C. Schmidt Laine , B. Chocat

Rhône-Alpes et l'environnement : 100 questions pour la recherche, Région Rhône-Alpes, pp.124-125, 2011

Chapitre d'ouvrage hal-02595248v1

Matrix population models as relevant modeling tools in ecotoxicology

S. Charles , Elise Billoir , C. Lopes , Arnaud Chaumot , James Devillers

Ecotoxicology Modeling, Emerging Topics in Ecotoxicology: Principles, Approaches and Perspectives 2, Springer Science, pp.261-298, 2009

Chapitre d'ouvrage hal-02592300v1

Pollution, stochasticity and spatial heterogeneity in the dynamics of an age-structured population of brown trout living in a river network

Arnaud Chaumot , S. Charles , H.R. Akçakaya , J.D. Stark , T.S. Bridges

Demographic toxicity: Methods in ecological risk assessment, Oxford Unviersity Press, pp.168-183, 2008, 978-0-19-533296-4

Chapitre d'ouvrage hal-02589490v1

Procédé de détermination de la présence d'un contaminant dans un liquide

D. Neuzeret , M. Dauphin , Françoise Moulin , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard et al.

France, N° de brevet: FR3069325 - WO2019016273. 2019

Brevet hal-02608946v1

Cage pour toximètre à séparations inclinées

D. Neuzeret , M. Dauphin , Françoise Moulin , Arnaud Chaumot , Olivier Geffard et al.

France, N° de brevet: FR3064447 - WO2018178585. 2018

Brevet hal-02608945v1

Ecotoxicologie des populations chez le crustacé d'eau douce Gammarus sp.

Arnaud Chaumot

Sciences de l'environnement. Habilitation à diriger des recherches, Université Claude Bernard Lyon I, 2019

HDR tel-02609326v1

Metadata record for: De novo transcriptomes of 14 gammarid individuals for proteogenomic analysis of seven taxonomic groups

Yannick Cogne , Davide Degli Esposti , Olivier Pible , Duarte Gouveia , Adeline François et al.

Dataset 10.6084/m9.figshare.9777905

Proteogam02_Supplementary File 5_COI.pdf

Yannick Cogne , Davide Degli Esposti , Olivier Pible , Duarte Gouveia , Olivier Geffard et al.

Dataset 10.6084/m9.figshare.8798051

Proteogam02_Supplementary File 4_Transrate results.xlsx

Yannick Cogne , Davide Degli Esposti , Olivier Pible , Duarte Gouveia , Olivier Geffard et al.

Dataset 10.6084/m9.figshare.7679819

Metadata record for: De novo transcriptomes of 14 gammarid individuals for proteogenomic analysis of seven taxonomic groups

Yannick Cogne , Davide Degli Esposti , Olivier Pible , Duarte Gouveia , Adeline François et al.

Dataset 10.6084/m9.figshare.9777905.v1

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