Corinne Vacher
Présentation
THEMATIQUES DE RECHERCHE: Rôle du microbiote dans la santé des plantes; Bioindicateurs microbiens de la santé des plantes; Biocontrôle microbien des maladies; Réseaux d’interactions entre microorganismes; Phyllosphère; Mildiou de la vigne DIPLOMES: 2012 : HDR en écologie à l’Université de Bordeaux « La science des réseaux au service de l’écologie »; 2004 : Doctorat en écologie évolutive à l’Université de Montpellier; 2001 : Master 2 en écologie évolutive à l’Université de Montpellier
Domaines de recherche
Compétences
Publications
Publications
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Monitor and steer the microbiota to protect grapevines against downy mildew2025 Annual Meeting of the VITAE project, PPR 'Growing and Protecting Differently', Mar 2025, Angers, France |
Developing a microfluidic qPCR chip to quantify microbial taxa with a potential biocontrol activity against grapevine downy mildewGiESCO 2025 - 23rd international GiESCO conference, Jul 2025, Geisenheim, Germany |
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Révéler les consortiums microbiens qui interfèrent avec le mildiou de la vigne grâce à l'épidémiologie du microbiome.17e rencontres Plantes-Bactéries 2025, Jan 2025, Aussois, France |
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Mining belowground and aboveground microbiome data to identify microbial biomarkers of grapevine health and yield20. Congrès national de la SFM : Microbes dans un monde de transition (MICROBES 2025), Société Française de Microbiologie (SFM), Sep 2025, Bordeaux, France |
Mining microbiome data to identify antagonists of grapevine downy mildew (Plasmopara viticola)colloque INRAE Genomics 2025, Nov 2025, Bordeaux, France |
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Mining microbiota data to identify antagonists of grapevine downy mildew.E3GP3 2025 - Webinaire “Microbiome & Santé des Plantes”, Jun 2025, Online, France |
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Development of a microfluidic quantitative PCR chip to monitor the dynamics of a synthetic microbial community on grapevine with potential biocontrol effects against downy mildewApéro VITAE - webinaire interne, VITAE (Léa Cabrol-Froget), Feb 2025, Villenave-d'Ornon, France |
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Apport des recherches sur le microbiote aux futures stratégies de biocontrôle - Résultats du projet VITAESéminaire Chaire ASVV & INNO’VIN – « Vins & Environnement » #8 | Le biocontrôle est-il opérant ?, Apr 2025, Villenave d'Ornon, France |
Un nouveau scénario d'interactions pathogène-microbiote pour l'oomycète Plasmopara viticola15ème Journée des Doctorants de l'Ecole Doctorale Sciences et Environnements, Feb 2025, Talence, France |
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Exploration des données du microbiote pour identifier les antagonistes du mildiou de la vigneJournée Scientifique Vigne & Vin 2025 – Les communautés microbiennes en œnologie, May 2025, Montpellier, France |
Projet GetUp - Gérer le microbiote pour protéger la vigne contre le mildiouSéminaires de l'IRHS, Mar 2025, Angers, France |
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Towards pesticide-free viticulture: analysing the microbiota of grapevines and vineyard soils to develop microbial biocontrol of downy mildewIW 2025 - International scientific workshop French Priority Research Programme 'Growing and Protecting crops Differently', Sep 2025, Online, France |
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Mining belowground and aboveground microbiome data to identify microbial biomarkers of grapevine health and yield23. GiESCO 2025 - 23. Group of International Experts of vitivinicultural Systems for CoOperation, Jul 2025, Geisenheim, Germany |
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Gérer le microbiote de la vigne pour réduire l’utilisation des pesticides - Synthèse des résultats du WP1 du projet VITAE et perspectivesAssemblée générale du projet VITAE, PPR "Cultiver et Protéger Autrement", Mar 2024, Cognac, France |
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Arbuscular mycorrhizal fungi as biomarkers of vineyard yield in ChampagneCentenary of the OIV - 45th world congress of vine and wine, OIV, Oct 2024, Dijon, France |
A new scenario of pathogen-microbiota interactions for the oomycete Plasmopara viticolaE3GP3 2024 - Réunion plénière du réseau "Ecologie, Evolution, Epidémiologie et Génétique des Populations des microorganismes Pathogènes de Plantes", Nov 2024, Paris, France |
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Pesticide-Free viticulture: towards agroecological wine-producing socioecosystems45. World Congress of Vine and Wine, Oct 2024, Dijon, France |
Exploitation des données du microbiote pour identifier les antagonistes du mildiou de la vigne (Plasmopara viticola)Rencontre à destination des équipes techniques des crus du Médoc et de Sauterne, Inno'vin; Conseil des Grands Crus Classés en 1855, Mar 2024, Saint-Julien-Beychevelle, France |
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Microbial bioindicators of vineyard resilience in ChampagneJournées Jean Chevaugeon, Jan 2024, Aussois, France |
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Mining microbiome data to identify antagonists of grapevine downy mildew (Plasmopara viticola)Journées Jean-Chevaugeon (JJC) - Rencontres de Phytopathologie - Mycologie, Jan 2024, Aussois, France |
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Mining microbiome data to identify antagonists of grapevine downy mildew (Plasmopara viticola)Open GPB 2024 - Open Conference on Grapevine Physiology and Biotechnology, Jul 2024, Logrono La Riora, Spain |
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Deciphering ecological interactions between grapevine leaf microbiome and pathogens"Phytobiomes Research for Plant Health” workshop – ICPP 2023, Aug 2023, Lyon, France |
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En quoi l’étude du microbiote peut apporter des protections à la plante?17ème édition des Rencontres du Clos-Vougeot, "La biodiversité dans la vigne et en cave : ressource et outil de l'agroécologie", Chaire internationale "Culture et Traditions du Vin" de l'Université de Bourgogne", Oct 2023, Vougeot, France |
Analyser, modéliser et piloter le microbiote pour renforcer la santé de la vigneJournée d'échange et de partage chercheurs-professionnels, Moët-Hennessy, May 2023, Paris, France |
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En quoi l'étude du microbiote peut apporter des protections à la plante?2ème séminaire du Plan Mildiou, Conseil Interprofessionnel du Vin de Bordeaux (CIVB), Dec 2023, Bordeaux, France |
Microbial bioindicators of agronomic variables of interest in grapevineMH Knowledge Days, Moët Hennessy, Apr 2023, Epernay, France |
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Protocoles de préparation des échantillons avant séquençage du microbioteRéunion d'échange chercheurs-professionnels, Château Cheval Blanc, Apr 2023, Saint Emilion, France |
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Towards microbiota-based disease management of downy mildewMid-term general meeting of the VITAE project, PPR ‘Growing and Protecting crops Differently’, Apr 2023, Dijon, France |
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Towards microbiota-based disease management: analysis of grapevine microbiota in plots with contrasted levels of downy mildew infection22nd GiESCO (Group of international Experts for Cooperation on Vitivinicultural Systems) 2023, Jul 2023, Ithaca, New York, United States |
Recherche de bioindicateurs microbiens de la santé et de la résilience de l'écosystème viticoleLe microbiote : Du sol et des plantes vers les intestins – Regards croisés entreprise/recherche, Vegepolys Valley, Carnot Plant2Pro®, Qualiment® et France Futur Elevage, Nov 2023, Paris, France |
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Mining microbiome data to identify antagonists of grapevine downy mildew (Plasmopara viticola)INRAE Genomics, Nov 2023, Bordeaux, France |
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Network-informed design of resilient microbial consortia with a biocontrol activityJournées annuelles du Consortium Biocontrôle, Nov 2023, Angers, France |
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Recherche de bioindicateurs microbiens de la résilience de la vigne en ChampagneLa microbiologie du sol au service d’une agriculture durable : diagnostics et solutions innovantes, AdeBiotech, Think Tank One Health, Jun 2023, Romainville, France |
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Analyser le microbiote pour identifier de nouveaux agents de biocontrôle des maladies de la vigneRencontre Chercheurs - Professionnels : Sortir des pesticides en viticulture, PPR Cultiver et Protéger Autrement, Mar 2022, Bordeaux, Beaune et Montpellier, France |
Microbial interactions between grapevine pathogens and the leaf microbiomeMontpellier Vine & Wine Sciences International Seminar, Oct 2022, Montpellier, France |
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Analyser le microbiote pour identifier de nouveaux agents de bio-contrôle des maladies de la vigneRencontres chercheurs professionnels Sortir des pesticides en viticulture. INRAE, Cultiver Protéger Autrement, Mar 2022, Beaune, Bordeaux, Montpellier, France |
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Machine learning of microbial interactions using abductive ILP and hypothesis frequency/compression estimation30th International Conference on Inductive Logic Programming (ILP) held as part of the 1st International Joint Conference on Learning and Reasoning (IJCLR), Oct 2021, Virtuel, France |
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Maternal effects shape seed mycobiota in a foundation tree species (Quercus petraea)SFR QuaSav, 2019, NA, France |
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Influence of landscape structure and cropping system on microbial diversity and microbial interactions in vineyardsSéminaire Pôle de Protection des Plantes (CIRAD 3P), Nov 2018, St-Pierre de la Réunion, France |
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MEM Days - The phyllosphere is a microbial jungle at the plant–climate interfaceJournées du Métaprogramme MEM, Jan 2017, Paris, France |
Microbial associations and interactions at the plant-climate interfaceWorkshop "Réseaux, Invasions et Emergences", CBGP, May 2017, Montpellier, France |
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The phyllosphere: microbial jungle at the plant–climate interfaceEawag Spring Series, May 2017, Kastanienbaum, Switzerland |
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Microbial metacommunity: a METABAR coding approach2017 Scientific MEM days: Journées scientifiques MEM (Métaomiques et écosystèmes microbiens), Jan 2017, Paris, France |
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Phytophthora community structure in soils and litters from three neo-tropical forest sites through three different methodological approaches.The 8th Meeting of IUFRO Working Party, Phytophthora in Forests and Natural Ecosystems, Mar 2017, Sapa, Vietnam |
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Table Ronde "Phytobiome2017 Scientific MEM days: Journées scientifiques MEM (Métaomiques et écosystèmes microbiens), Feb 2017, Paris, France |
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Apprendre les réseaux microbiens à partir de données NGS: potentiel d'utilisation en lutte biologiqueRéunion du Consortium Biocontrôle, Feb 2017, Paris, France |
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Le phytobiome: concept et potentiel d'utilisation en amélioration des plantesConseil scientifique du Département BAP, Feb 2017, Paris, France |
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Deciphering microbial interactions in the phyllosphereGroupe de travail "Modélisation" du métaprogramme MEM, 2016, NA, France |
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Deciphering microbial interactions in the phyllosphereSéminaires de l'UMR Biogeco, Mar 2016, Bordeaux, France |
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Atténuation des effets du changement climatique sur la biodiversité et les services écosystémiques des forêts d'AquitaineRéunion du Pôle de Compétitivité XyloFutur, Feb 2016, Bordeaux, France |
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Learning microbial interaction networks from NGS dataEcole-chercheur Métaprogramme Métaomique des Ecosystèmes Microbiens, Jun 2016, Pont-à-Mousson, France |
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Modéliser les couplages forêt-atmosphère-rivière pour prédire la durabilité des forêts-galeriesRencontre avec les Gestionnaires de la Vallée du Ciron, Apr 2016, Bernos-Beaulac, France |
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Deciphering the pathobiome: intra- and interkingdom interactions involving the pathogen Erysiphe alphitoides10. International symposium on phyllosphere microbiology, Jul 2015, Ascona, Switzerland |
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Monitoring microbial networks: current challengesAtelier Réseaux Trophiques 2 (ART2) - Reconciling social, economic and ecological complexity in agro-ecosystems, Feb 2015, Paris, France |
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Foliar microbial communities: from patterns to functionsSéminaires de l'UMR ISPA, Jun 2015, Bordeaux, France |
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Host species dominates over landscape structure in shaping foliar fungal communities10. International symposium on phyllosphere microbiology, Jul 2015, Ascona, Switzerland |
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Clustering methods differ in their ability to detect patterns in ecological networksJoint 2014 Annual Meeting British Ecological Society and Société Française d’Ecologie (BES & SFE ), Dec 2014, Lille, France |
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Network science in ecologySéminaires de l'UMR Mathématiques et Informatique Appliquées, AgroParisTech, Sep 2014, Paris, France |
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Investigating microbial networks in the phyllosphere using high-throughput sequencingFormation "Traitement des données issues des nouvelles techniques de séquençage", Jun 2014, Montpellier, France |
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QIIME OverviewFormation "Traitement des données issues des nouvelles techniques de séquençage", Jun 2014, Montpellier, France |
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La phyllosphère des arbres forestiers: un habitat peu exploré mais très peuplé!Séminaires de l'UMR Biogeco, Apr 2013, Bordeaux, France |
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La phyllosphère des arbres forestiers: un habitat peu exploré mais très peuplé!Think Tank MétaProgramme MEM INRA, Mar 2013, Paris, France |
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La phyllosphère des arbres forestiers: un habitat peu exploré mais très peuplé!Séminaire AIP Bioressources, Feb 2013, Paris, France |
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La phyllosphère des arbres forestiers: un habitat peu exploré mais très peuplé!Séminaires de l'UMR EDB, Apr 2013, Toulouse, France |
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Mating networks to delimit species according to the biological species conceptIUFRO working group "Genetics of Quercus and Nothofagus", Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biodiversité, Gènes et Communautés (1202)., Oct 2012, Bordeaux, France. 1 p |
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Compartmentalization in antagonistic networks: how to assess the relative contribution of the underlying mechanisms?Conférence européenne d’écologie (EEF), Sep 2011, Avila, Spain |
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Uncovering latent structure in valued graphs: a variational approachProbability and Discrete Mathematics in Mathematical Biology, May 2011, Singapore, Singapore. 47 diapos |
Predicting invasion success in forest pathogenic fungi from species traits?Conference Jacques Monod on ‘New and Emerging Fungal Diseases of Animals and Plants”, Jun 2011, Roscoff, France |
Unravelling the web of dark interactions: Explainable inference of the diversity of microbial interactionsAdvances in Ecological Research: Roadmaps: Part A, 68, Elsevier, pp.155-183, 2023, Advances in Ecological Research, ⟨10.1016/bs.aecr.2023.09.005⟩ |
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Plant Microbiota: Diversity, Transmission and FunctionExtended Biocontrol, Springer Netherlands, pp.111-117, 2022, ⟨10.1007/978-94-024-2150-7_9⟩ |
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Machine learning of microbial interactions using abductive ILP and hypothesis frequency/compression estimationKatzouris, N.; Artikis, A. Inductive Logic Programming. ILP 2021. Lecture Notes in Computer Science, 13191, Springer International Publishing, pp.26-40, 2022, Lecture Notes in Computer Science, ⟨10.1007/978-3-030-97454-1_3⟩ |
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Le microbiote des plantes : diversité, transmission et fonctionBiocontrôle. Éléments pour une protection agroécologique des cultures., Editions Quae, 2020, Savoir Faire, 978-2-7592-3076-1 |
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Key questions for next-generation of biomonitoringA next-generation of biomonitoring to detect global ecosystem change. Frontiers Research Topics, Frontiers in Ecology and Evolution, pp.91-104, 2020, 978-2-88966-027-8. ⟨10.3389/978-2-88966-027-8⟩ |
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Sources, niches and routes of colonization by beneficial bacterial endophytes.Endophyte biotechnology: potential for agriculture and pharmacology, CABI, pp.32-41, 2019, 9781786399427. ⟨10.1079/9781786399427.0032⟩ |
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Biomonitoring for the 21st century: integrating next-generation sequencing into ecological network analysisNext Generation Biomonitoring: Part 1, 58, 293 p., 2018, Advances In Ecological Research, 978-0-12-813949-3. ⟨10.1016/bs.aecr.2017.12.001⟩ |
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Plant communication with associated microbiota in the spermosphere, rhizosphere and phyllosphereHow plants communicate with their biotic environment, 82, Academic Press - Elsevier, 2017, Advances in Botanical Research, 978-0-12-801431-8. ⟨10.1016/bs.abr.2016.10.007⟩ |
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Learning ecological networks from next-generation sequencing dataEcosystem Services: From Biodiversity to Society, Part 2, 54, 2016, Advances In Ecological Research, ⟨10.1016/bs.aecr.2015.10.004⟩ |
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Revealing microbial consortia that interfere with grapevine downy mildew through microbiome epidemiology2025 |
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Marine holobiont in the high throughput sequencing era2020, pp.100045. ⟨10.24072/pci.ecology.100045⟩ |
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Assembly processes of bacterial endophytic and epiphytic communities in the canopy of neotropical trees2022 |
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Microbial association networks give relevant insights into plant pathobiomes2021 |
VITAE – Cultiver la vigne sans pesticides : vers des socio-écosystèmes viticoles agroécologiquesINRAE. 2024 |
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Métagénomique de la phyllosphère des arbres forestiers (METAPHORE)[Contrat] auto-saisine. 2013 |
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La science des réseaux au service de l’écologieSciences du Vivant [q-bio]. Université des Sciences et Technologies (Bordeaux 1), 2014 |