Damien Hinsinger

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  • Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux (EPGV)

Publications

Publications

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Phylogenomics and a revised tribal classification of subfamily Dipterocarpoideae (Dipterocarpaceae)

Tijana Cvetković , Damien Hinsinger , Daniel Thomas , Jan Wieringa , Elango Velautham et al.
Taxon, the journal of the International Association for Plant Taxonomy, 2022, 71 (1), pp.85-102. ⟨10.1002/tax.12648⟩
Article dans une revue hal-03935018 v1
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Genetic Variability in Balkan Paleoendemic Resurrection Plants Ramonda serbica and R. nathaliae Across Their Range and in the Zone of Sympatry

Maja Lazarević , Sonja Siljak-Yakovlev , Agathe Sanino , Marjan Niketić , Françoise Lamy et al.
Frontiers in Plant Science, 2022, 13, ⟨10.3389/fpls.2022.873471⟩
Article dans une revue hal-03933886 v1
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Genome-wide supermatrix analyses of maples (Acer, Sapindaceae) reveal recurring inter-continental migration, mass extinction, and rapid lineage divergence

Fabiola Areces-Berazain , D. D. Hinsinger , Joeri Strijk
Genomics, 2021, 113 (2), pp.681-692. ⟨10.1016/j.ygeno.2021.01.014⟩
Article dans une revue hal-03370594 v1
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Chromosome‐level reference genome of the soursop ( Annona muricata ): A new resource for Magnoliid research and tropical pomology

Joeri Strijk , D. D. Hinsinger , Mareike Roeder , Lars Chatrou , Thomas Couvreur et al.
Molecular Ecology Resources, 2021, 21 (5), pp.1608-1619. ⟨10.1111/1755-0998.13353⟩
Article dans une revue hal-03370609 v1
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Phylogenomics resolves deep subfamilial relationships in Malvaceae s.l.

Tijana Cvetković , Fabiola Areces-Berazain , D. D. Hinsinger , Daniel Thomas , Jan Wieringa et al.
Article dans une revue hal-03370590 v1
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Genomics of the critically endangered monotypic genus Sinopora: the plastome of S. hongkongensis (Lauraceae)

Angelo Damian Armijos Carrion , D. D. Hinsinger , Joeri Sergej Strijk
Mitochondrial DNA Part B Resources, 2020, 5 (1), pp.379-381. ⟨10.1080/23802359.2019.1703590⟩
Article dans une revue hal-03370630 v1

Plastome comparative genomics in maples resolves the infrageneric backbone relationships

Fabiola Areces-Berazain , Yixi Wang , D. D. Hinsinger , Joeri Strijk
PeerJ, 2020, 8, pp.e9483. ⟨10.7717/peerj.9483⟩
Article dans une revue hal-03370614 v1
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Museomics for reconstructing historical floristic exchanges: Divergence of stone oaks across Wallacea

Joeri Strijk , Nguyen Van Ngoc , Joan Pereira , J. Slik , Rahayu Sukri et al.
PLoS ONE, 2020, 15 (5), pp.e0232936. ⟨10.1371/journal.pone.0232936⟩
Article dans une revue hal-03370625 v1
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ECuADOR—Easy Curation of Angiosperm Duplicated Organellar Regions, a tool for cleaning and curating plastomes assembled from next generation sequencing pipelines

Angelo Armijos Carrion , D. D. Hinsinger , Joeri Strijk
PeerJ, 2020, 8, pp.e8699. ⟨10.7717/peerj.8699⟩
Article dans une revue hal-03370620 v1
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Exploring evolution and diversity of Chinese Dipterocarpaceae using next-generation sequencing

Tijana Cvetković , D. D. Hinsinger , Joeri Sergej Strijk
Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-48240-y⟩
Article dans une revue hal-03370635 v1
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The plastome sequence of Laurus azorica (Seub.) Franco, an endemic tree species of the Azores islands

Xi-Jian Liang , D. D. Hinsinger , Rui Bento Elias , Joeri Sergej Strijk
Mitochondrial DNA Part B Resources, 2019, 4 (1), pp.363-365. ⟨10.1080/23802359.2018.1545536⟩
Article dans une revue hal-03370647 v1
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Plastome of Quercus xanthoclada and comparison of genomic diversity amongst selected Quercus species using genome skimming

D. D. Hinsinger , Joeri Sergej Strijk
PhytoKeys, 2019, 132, pp.75-89. ⟨10.3897/phytokeys.132.36365⟩
Article dans une revue hal-03370655 v1

Trochodendron aralioides, the first chromosome-level draft genome in Trochodendrales and a valuable resource for basal eudicot research

Joeri Strijk , D. D. Hinsinger , Fengping Zhang , Kunfang Cao
GigaScience, 2019, 8 (11), ⟨10.1093/gigascience/giz136⟩
Article dans une revue (data paper) hal-03370633 v1
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Characterization of the complete chloroplast genome of endangered Cycads Zamia fischeri Miq. ex Lem

Jin-Yan Lei , D. D. Hinsinger , Guo-Feng Jiang
Mitochondrial DNA Part B Resources, 2018, 3 (2), pp.1059-1061. ⟨10.1080/23802359.2018.1508387⟩
Article dans une revue hal-03370662 v1
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The complete mitochondrial genome of the Basidiomycete fungus Pleurotus cornucopiae (Paulet) Rolland

Li-Ming Xu , D. D. Hinsinger , Guo-Feng Jiang
Mitochondrial DNA Part B Resources, 2018, 3 (1), pp.73-75. ⟨10.1080/23802359.2017.1422405⟩
Article dans une revue hal-03370666 v1
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The first complete chloroplast genome of a major mangrove species Sonneratia alba Sm. and its implications on conservation efforts

Tianhui Yu , D. D. Hinsinger , Joeri Sergej Strijk , Alison Kim Shan Wee
Mitochondrial DNA Part B Resources, 2018, 3 (2), pp.500-502. ⟨10.1080/23802359.2018.1463828⟩
Article dans une revue hal-03370663 v1
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Fishing for barcodes in the Torrent: from COI to complete mitogenomes on NGS platforms

Damien Hinsinger , Régis Debruyne , Maeva Thomas , Gaël Denys , Marion I. Mennesson et al.
DNA Barcodes, 2015, 3 (1), pp.170-186. ⟨10.1515/dna-2015-0019⟩
Article dans une revue mnhn-02309917 v1

The phylogeography of Eurasian Fraxinus species reveals ancient transcontinental reticulation

D. Hinsinger , M. Gaudeul , A. Couloux , J. Bousquet , Nathalie Frascaria-Lacoste
Molecular Phylogenetics and Evolution, 2014, 77, pp.223-237
Article dans une revue hal-01569392 v1

The Phylogeny and Biogeographic History of Ashes (Fraxinus, Oleaceae) Highlight the Roles of Migration and Vicariance in the Diversification of Temperate Trees

D.D. Hinsinger , Jolly Basak , Myriam Gaudeul , Corinne Cruaud , Paola Bertolino et al.
PLoS ONE, 2013, 8 (11), pp.e80431. ⟨10.1371/journal.pone.0080431⟩
Article dans une revue hal-01569388 v1

Deciduous Trees and the Application of Universal DNA Barcodes: A Case Study on the Circumpolar Fraxinus

M. Arca , D.D. Hinsinger , C. Cruaud , A. Tillier , J. Bousquet et al.
PLoS ONE, 2012, 7 (3), ⟨10.1371/journal.pone.0034089⟩
Article dans une revue hal-01569306 v1

Phylogenetic footprints of an Antarctic radiation: The Trematominae (Notothenioidei, Teleostei)

A. -C. Lautredou , D. D. Hinsinger , C. Gallut , C. -H. C. Cheng , M. Berkani et al.
Molecular Phylogenetics and Evolution, 2012, 65 (1), pp.87-101. ⟨10.1016/j.ympev.2012.05.032⟩
Article dans une revue istex hal-01544915 v1

Pseudorhabdosynochus venus n. sp. (Monogenea, Diplectanidae) from Epinephelus howlandi (Perciformes: Serranidae) off New Caledonia

Jean-Lou Justine , Damien Hinsinger
Systematic Parasitology, 2006, 92, pp.155-160
Article dans une revue hal-00079778 v1

Nanopore Only Assembly of Populus deltoides with Trio Binning Illustrates Benefits of Diploid Assembly for poplars

Damien Hinsinger
PAG XXI. Plant and Animal Genome Conference, Jan 2024, San Diego (California), United States
Communication dans un congrès hal-04670388 v1

Séquençage sélectif Nanopore ( chez une espèce maraichère, le melon : premiers essais)

Damien Hinsinger
AG France Genomique, Jun 2022, Paris, France
Communication dans un congrès hal-04670364 v1
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Exploitation de la puissance du séquençage pour l’amélioration des plantes

Damien Hinsinger
Mini congrès, CEA - Genoscope, Jun 2022, Evry, France
Communication dans un congrès hal-03937956 v1

Evolution des technologies de séquençage et génotypage

Patricia Faivre Rampant , Damien Hinsinger
séminaire INRAE, Nov 2022, Orléans (45), France
Communication dans un congrès hal-04670356 v1

Exploitation de la puissance du séquençage pour l’amélioration des plantes

Damien Hinsinger
Séminaire Genoscope, Mar 2022, Evry, France
Communication dans un congrès hal-03975365 v1

Allegro Genotyping solution : Application in crops

Damien Hinsinger
Séminaire EFFOR, May 2021, Evry (en distanciel), France
Communication dans un congrès hal-04670462 v1
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Pipeline for Haplotype Frequencies Estimation from Pooled Targeted Sequencing in Maize

Minguella Raphaël , Aurélie Canaguier , Delphine Madur , Aurélie Bérard , Isabelle Le Clainche et al.
AG France Génomique, Jun 2024, Evry courcouronnes, France. 2013, ⟨10.1093/molbev/mst016⟩
Poster de conférence hal-04670307 v1
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A chromosome-level assembly of lavender ‘Maillette’ using long-reads and a newly generated linkage map

Aurélie Canaguier , Damien Hinsinger , Aurélie Bérard , Isabelle Le Clainche , Berline Fopa Fomeju et al.
PAG XXI. Plant and Animal Genome Conference, Jan 2024, San Diego (California), United States. ⟨10.1371/journal.pone.0243853⟩
Poster de conférence hal-04670399 v1
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Estimation of Haplotype Frequencies from Pooled Targeted Sequencing in Maize Landraces

Minguella Raphaël , Aurélie Canaguier , Delphine Madur , Damien Hinsinger , Stephane Nicolas et al.
2ème carrefour de la sélection maïs, May 2024, Saclay, France. 2013, ⟨10.1093/molbev/mst016⟩
Poster de conférence hal-04670321 v1
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Un an de MGI à l'EPGV

Isabelle Le Clainche , Aurélie Bérard , Romain Mesnil , Damien Hinsinger , Patricia Faivre Rampant
AG France Génomique, Jun 2024, Evry courcouronnes, France
Poster de conférence hal-04670299 v1
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Feedback on tGBS with Allegro : Does it hit the target ?

Aurélie Berard , Aurélie Canaguier , Romane Guilbaud , Isabelle Le Clainche , Marie-Christine Le Paslier et al.
PAG XXX. Plant and Animal Genome, Jan 2023, San Diego (California), United States. , ⟨10.15454/4NYHD6⟩
Poster de conférence hal-03937923 v1
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Long Reads for Long-Term Goals : A Genome Resource for Lavander Genetic Improvement

Berline Fopa Fomeju , Aurélie Berard , Isabelle Le Clainche , Aurélie Canaguier , Elodie Belmonte et al.
PAG XXX Plant and Animal Genome Conference, Jan 2023, San Diego (California), United States
Poster de conférence hal-03937877 v1
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Étude du polymorphisme des génomes végétaux

Damien Hinsinger , Romane Guilbaud , Sandrine Contenot , Aurélie Canaguier , Patricia Faivre-Rampant et al.
Colloque INRAE Genomics, May 2022, Orléans, France.
Poster de conférence hal-03935707 v1
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La fibre génomique du Lin

Damien Hinsinger , Romane Guilbaud , Sandrine Contenot , Aurélie Canaguier , Patricia Faivre-Rampant et al.
30ème édition du Festival du Lin et de la Fibre Artistique, Jul 2022, Saint-Pierre-Le-Viger, France.
Poster de conférence hal-03937438 v1