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Maggot, outil de catalogage des données de recherche
Daniel Jacob
,
François Ehrenmann
Printemps de la Donnée 2024, INRAE; Université Haute-Alsace; Université de Strasbourg; INSA; PNDB; AgroParisTech; Université de Lille; Sorbonne Université; Data Terra, Jun 2024, Bordeaux, France
Communication dans un congrès
hal-04682198
v1
|
|
Combining phenotypic, metabolome and proteome data to study maize response to a mild nitrogen deficit
Maria Urrutia
,
Melisande Blein-Nicolas
,
Olivier Fernandez
,
Stéphane Bernillon
,
Mickael Maucourt
et al.
Journées du Protéome Vert, Jun 2022, Gif-sur-Yette, France
Communication dans un congrès
hal-03878405
v1
|
|
RMN métabolomique, aliments & nutrition : quelques exemples de la plateforme Métabolome-MetaboHUB -Bordeaux
Catherine Deborde
,
Blandine Madji Hounoum
,
Simon Roques
,
Daniel Jacob
,
Mickaël Maucourt
et al.
Animation scientifique : La Résonance Magnétique Nucléaire dans tous ses états…., UR370 QuaPA et PF AgroResonance, INRAE, Jun 2021, distanciel, France
Communication dans un congrès
hal-03728319
v1
|
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Hyperpolarized NMR Metabolomics at Natural 13C Abundance
Arnab Dey
,
Benoit Charrier
,
Estelle Martineau
,
Catherine Deborde
,
Elodie Gandriau
et al.
GERM 2021, Apr 2021, En ligne, France
Communication dans un congrès
hal-04432708
v1
|
|
Hyperpolarized NMR metabolomics at natural 13C abundance
Arnab Dey
,
Benoit Charrier
,
Estelle Martineau
,
Catherine Deborde
,
Elodie Gandriau
et al.
Hyp21, Sep 2021, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-04432581
v1
|
|
An integrated fruit model toolkit: combining fruit biophysical processes with central carbon metabolism
J.L. Chen
,
Bertrand Beauvoit
,
Sophie Colombie
,
Léa Roch
,
Coffi Belmys Cakpo
et al.
Communication dans un congrès
hal-03125090
v1
|
|
NMR-based metabolomics workflow for quality and effect assessment of alternative plant-based diets in rainbow trout.
Catherine Deborde
,
Blandine Madji Hounoum
,
Daniel Jacob
,
Mickael Maucourt
,
Simon Roques
et al.
11èmes JS du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique, RFMF, May 2018, Liège, Belgium
Communication dans un congrès
hal-03058513
v1
|
|
An overview of NMR applications in metabolite profiling of small molecules for plant metabolism studies
Catherine Deborde
,
Daniel Jacob
,
Jean-Xavier J.-X. Fontaine
,
R. Molinie
,
Léa Roch
et al.
2. International Plant Spectroscopy Conference (IPSC), Mar 2019, Berlin, Germany
Communication dans un congrès
hal-02786819
v1
|
|
NMR-based metabolomics at Bordeaux Metabolome Facility: 4 short stories
Catherine Deborde
,
Daniel Jacob
,
Simon Roques
,
Léa Roch
,
Anaïs Clave
et al.
A Franco-Israeli Symposium in Magnetic Resonance, Jan 2019, Rehovot, Israel
Communication dans un congrès
hal-02786826
v1
|
|
FAIR principles, an new opportunity to improve the data lifecycle
Daniel Jacob
ado2019 : journée thématique sur les autorités de données, Pascal Dayre - CNRS ENSEEIHT-IRIT, Apr 2019, Toulouse, France
Communication dans un congrès
hal-02070883
v1
|
|
Integrative and predictive biology outside the plant: linking computational tools to fleshy fruit systems
Cecile Cabasson
,
Sophie Colombie
,
Bertrand Beauvoit
,
Christine Nazaret
,
Camille Benard
et al.
Colloque Biologie synthétique et systémique, BioSynSys, Jun 2016, Bordeaux, France
Communication dans un congrès
hal-02739719
v1
|
|
Leaf marker metabolites for low nitrogen stress in maize
Maria Urrutia Rosauro
,
Stéphane Bernillon
,
M. Maucourt
,
Catherine Deborde
,
Daniel Jacob
et al.
Plant Biology Europe EPSO/FESPB 2016, Jun 2016, Prague, Czech Republic
Communication dans un congrès
hal-01605806
v1
|
|
Development of metabolomics approaches for quality assessment of plant-based diet in rainbow trout
Catherine Deborde
,
Annick Moing
,
Valentin Joubert
,
Blandine Madji Hounoum
,
Daniel Jacob
et al.
Aquaculture Europe 2015, European Aquaculture Society (EAS). BEL., Oct 2015, Rotterdam, Netherlands
Communication dans un congrès
hal-02740877
v1
|
|
PeakForest: a spectral reference database made from metabolomic experts for metabolomic analyses
Nils Paulhe
,
Pierrick Roger
,
Marie-Françoise Olivier
,
Marie Lefebvre
,
Christophe Duperier
et al.
9. Journées scientifiques du RFMF, Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF). FRA., Jun 2015, Lille, France
Communication dans un congrès
hal-02742965
v1
|
|
Using developmental and diurnal compositional changes of tomato to study metabolism
Camille Bénard
,
Stéphane Bernillon
,
Benoit Biais
,
Sonia Osorio-Algar
,
Mickael M. Maucourt
et al.
8. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique RFMF, May 2014, Lyon, France. 1 p
Communication dans un congrès
hal-02793195
v1
|
|
Deciphering ascorbic acid regulation in tomato fruit ripening
Celine Bournonville
,
Carine Ferrand
,
Daniel Just
,
Virginie V. Garcia
,
Daniel Jacob
et al.
18. EUCARPIA Meeting of the Tomato Working Group, Apr 2014, Avignon, France. 1 p
Communication dans un congrès
hal-02800985
v1
|
|
Ontology usage in Omics Standards Initiatives: Pros and Cons of enriching XML data formats with controlled vocabulary terms
Daniel Schober
,
Michael Wilson
,
Daniel Jacob
,
Annick Moing
,
Gerhard Mayer
et al.
ODLS 2014 – Ontologies and Data in Life Sciences, Aug 2014, Freibourg, Germany
Communication dans un congrès
hal-02797986
v1
|
|
La métabolomique : un outil de la génomique fonctionnelle au service de la biologie des systèmes
Dominique D. Rolin
,
Bertrand Beauvoit
,
Stéphane Bernillon
,
Camille Bénard
,
Patricia Ballias
et al.
8e Congrès Jeunes Chercheurs de la SFBV, Société Française de Biologie Végétale (SFBV). FRA., Jun 2014, Tours, France. 1 p
Communication dans un congrès
hal-02801036
v1
|
|
MetaboHUB: une infrastructure nationale au service de la métabolomique
Dominique D. Rolin
,
Alice A. Agasse
,
Justine Bertrand-Michel
,
R. R. Cole
,
B. B. Colsch
et al.
Séance thématique "La métabolomique : son application en recherche pharmaceutique et diagnostique", Académie Nationale de Pharmacie. FRA., Feb 2013, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-01002248
v1
|
|
MetaboHUB: a national infrastructure dedicated to metabolomics and fluxomics
Dominique D. Rolin
,
Alice A. Agasse
,
Justine Bertrand-Michel
,
R. R. Cole
,
B. B. Colsch
et al.
7. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et de Fluxomique (RFMF), Jun 2013, Amiens, France
Communication dans un congrès
hal-01002241
v1
|
|
MetaboHUB: a french infrastructure dedicated to metabolomics and fluxomics
Dominique D. Rolin
,
Alice A. Agasse
,
Justine Bertrand-Michel
,
R. R. Cole
,
Sophie S. Colombie
et al.
Metabolomics 2013 - 9. Annual conference of the Metabolomics Society, Jul 2013, Glasgow, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-01002247
v1
|
|
ERVA: a novel method of binning, allowing chemical information to be highlighted, from 1H-NMR metabolics data
Daniel Jacob
,
Catherine Deborde
,
Annick Moing
7. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Jun 2013, Amiens, France. 1 p
Communication dans un congrès
hal-02805015
v1
|
|
Diurnal compositional changes of tomato fruit and leaf
Camille Benard
,
Stéphane Bernillon
,
Sonia Osorio-Algar
,
Mickael M. Maucourt
,
Benoit Biais
et al.
Metabolomics 2013, Jul 2013, Glasgow, United Kingdom. 1 p
Communication dans un congrès
hal-02803658
v1
|
|
Standardisation et stockage des données numériques de MetaboHub dans le contexte des initiatives européennes
Daniel Jacob
1. Journée scientifique de MétaboHUB, Oct 2012, Villevave d'Ornon, France
Communication dans un congrès
hal-02802257
v1
|
|
Peut-on faire confiance à la métabolomique: résultats de l'initiative MetaboRing
Alexandre Verdu
,
Bernard Lyan
,
Carole Migné
,
Catherine Defoort
,
Cécile Canlet
et al.
6. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique (RFMF), May 2012, Nantes, France
Communication dans un congrès
hal-01594993
v1
|
|
Can we trust untargeted metabolomics: results of the metabo-ring study
Alexandre Verdu
,
Bernard Lyan
,
Carole Migné
,
Catherine Defoort
,
Cécile Canlet
et al.
2. African-European Conference on Chemometrics - Afrodata 2012, Nov 2012, Stellenbosch, South Africa
Communication dans un congrès
hal-01595486
v1
|
|
WP3 Bioinformatics Framework
Daniel Jacob
1. Journée scientifique de MétaboHUB, Oct 2012
Communication dans un congrès
hal-02802614
v1
|
|
Tools and applications in plant metabolomics at Bordeaux Metabolome Fluxome Facility (PMFB; http://www.bordeaux.inra.fr/umr619/NMR.htm)
Catherine Deborde
,
Stéphane Bernillon
,
Mickael M. Maucourt
,
Cécile Cabasson
,
Benoit Biais
et al.
5. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Labo/service de l'auteur, Ville service., May 2011, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02749839
v1
|
|
Développement d'outils informatiques pour le traitement et l'analyse des données en RMN-1H, dans un contexte d'expériences métabolomiques
Daniel Jacob
,
Catherine Deborde
,
Stéphane Bernillon
,
Annick Moing
5. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Labo/service de l'auteur, Ville service., May 2011, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02747402
v1
|
|
Mery-B: a web knowledgebase for the storage, visualization, analysis and annotation of plant metabolomics profiles obtained by NMR
Hélène Ferry-Dumazet
,
Laurent Gil
,
Catherine Deborde
,
Annick Moing
,
Stéphane Bernillon
et al.
Metabolomics 2010, Jun 2010, Amsterdam, Netherlands
Communication dans un congrès
hal-02755793
v1
|
|
PROTIC workshop: A bioinformatics environment for proteome data validation, analysis and integration
Renaud Flores
,
Johann J. Joets
,
Olivier Langella
,
Benoit B. Valot
,
Michel M. Zivy
et al.
Plant Genomics seminar 2010, Mar 2010, Pont Royal en Provence, France
Communication dans un congrès
hal-02758409
v1
|
|
Plant metabolomics at Bordeaux Metabolome-Fluxome Facility. Tools and applications at PMFB
Catherine Deborde
,
Stéphane Bernillon
,
Mickael M. Maucourt
,
Cécile Cabasson
,
Isabelle Quintana
et al.
4. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, May 2010, Marseille, France
Communication dans un congrès
hal-02756773
v1
|
|
Mery-B: a web knowledgebase for the storage, visualization, analysis and annotation of plant metabolomics profiles obtained by NMR
Hélène Ferry-Dumazet
,
Laurent Gil
,
Catherine Deborde
,
Annick Moing
,
Stéphane Bernillon
et al.
4. Journées scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, May 2010, Marseille, France
Communication dans un congrès
hal-02756823
v1
|
|
Applications and tools in plant metabolomics at Bordeaux Metabolome-Fluxome Facility
Catherine Deborde
,
Stéphane Bernillon
,
Mickael M. Maucourt
,
Cécile Cabasson
,
Patricia Ballias
et al.
Metabolomics 2010, Jun 2010, Amsterdam, Netherlands
Communication dans un congrès
hal-02757642
v1
|
|
Direct correlation of 1H-NMR and GC-EI-TOF-MS profiling data reveals significant spatial localisations and metabolite gradients in Charentais melon fr
William Allwood
,
Benoit Biais
,
Catherine Deborde
,
Yun Xu
,
Mickael M. Maucourt
et al.
Metabomeeting 2009, Jul 2009, Norwich, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-02755485
v1
|
|
Mery-B : management and analysis of plant metabolomics 1H-NMR profiles
Daniel Jacob
,
Hélène Ferry-Dumazet
,
Laurent Gil
,
Catherine Deborde
,
Stéphane Bernillon
et al.
Metabomeeting 2009, Jul 2009, Norwich, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-02751144
v1
|
|
Mery-B : Base de Données Métabolomiques dédiée au végétal et outils d’intégration, de visualisation et de traitement statistique de profils RMN 1H
Catherine Deborde
,
Hélène Ferry-Dumazet
,
Cécile Cabasson
,
Mickael M. Maucourt
,
Laurent Gil
et al.
2. Journée scientifique du réseau RMN aquitain, Apr 2009, Bordeaux, France
Communication dans un congrès
hal-02752654
v1
|
|
Tools and applications in plant metabolomics at Bordeaux metabolome-fluxome facility (PMFB)
Stéphane Bernillon
,
Catherine Deborde
,
Mickael M. Maucourt
,
Benoit Biais
,
Karine Pardon
et al.
Metabomeeting 2009, Jul 2009, Norwich, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-02753447
v1
|
|
Insights into genome plasticity of the wine-making bacterium Oenococcus oeni strain ATCC BAA-1163 by decryption of its whole genome.
Elisabeth Bon
,
Cosette Granvalet
,
Fabienne Remize
,
Diliana Dimova
,
Patrick Lucas
et al.
9th Symposium on Lactic Acid Bacteria, Sep 2008, Egmond aan Zee, Netherlands. pp.A047
Communication dans un congrès
inria-00340073
v1
|
|
Small but dynamic genomes: evidences for massive horizontal gene transfer between ruminant pathogenic mycoplasmas
Pascal P. Sirand-Pugnet
,
Marc Marenda
,
Daniel Jacob
,
Aurélien Barré
,
Valérie Barbe
et al.
Genomes 2008, Apr 2008, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02751198
v1
|
|
The genome sequence of Mycoplasma hominis and comparison with the minimal bacterial genomes of the human pathogens, M. genitalium and Ureaplasma parvum
Sabine Pereyre
,
Pascal P. Sirand-Pugnet
,
A. Barre
,
A. Charron
,
P. Avenaud
et al.
108. General meeting of the American Society for Microbiology, Jun 2008, Boston, United States
Communication dans un congrès
hal-02752888
v1
|
|
Evolution des génomes de mollicutes : une histoire pleine de rebondissements
Pascal P. Sirand-Pugnet
,
Christine Citti
,
A Barre
,
D Jacob
,
Alain A. Blanchard
7e Rencontre Francophone de Mycoplasmologie, 2007, Lyon, France. pp.Inconnu
Communication dans un congrès
hal-02813016
v1
|
|
Evolution des génomes de mollicutes : une histoire pleine de rebondissements
Pascal P. Sirand-Pugnet
,
Christine Citti
,
Aurélien Barré
,
Daniel Jacob
,
Alain A. Blanchard
7. Rencontre francophone de mycoplasmologie, Jul 2007, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-02755457
v1
|
|
The complete genome sequence of the human urogenital mycoplasma, Mycoplasma hominis
Sabine Pereyre
,
Philippe Avenaud
,
Alain Charron
,
Pascal P. Sirand-Pugnet
,
Daniel Jacob
et al.
16. International congress of the International Organization for Mycoplasmology, Jul 2006, Cambridge, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-02756026
v1
|
|
MétaboP: a French initiative supported by Génoplante for the development of analytical and bioinformatic tools for plant metabolomics
Annick Moing
,
Graham Noctor
,
Catherine Deborde
,
Mickael M. Maucourt
,
Christel Renaud
et al.
4. International conference, Apr 2006, Reading, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-02754317
v1
|
|
The Metabolome pole of the Functional Genomics Platform of Bordeaux
Catherine Deborde
,
Stéphane Bernillon
,
Cécile Cabasson
,
Mickaël Maucourt
,
Christel Renaud-Gentié
et al.
2. Journées, Dec 2006, Saint-Sauves-d'Auvergne, France
Communication dans un congrès
hal-02753989
v1
|
|
Bioinformatics resources for the study of plant metabolomics
H. Ferry-Dumazet
,
A. Barre
,
D. Jacob
,
A. de Daruvar
,
Annick Moing
et al.
4. International conference, Apr 2006, Reading, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-02754398
v1
|
|
Metabolome-Fluxome facility at the Plant Systems Biology Institute in Bordeaux, France
Catherine Deborde
,
Mickael M. Maucourt
,
Christel Renaud
,
Monique Gaudillère
,
Cécile Cabasson
et al.
4. International conference, Apr 2006, Reading, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-02754805
v1
|
|
Mycoplasma agalactiae genome: evidence for massive horizontal gene transfer between pathogenic, ruminant mycoplasmas
Pascal P. Sirand-Pugnet
,
Marc Marenda
,
Carole Lartigue Prat
,
Daniel Jacob
,
Valérie Barbe
et al.
16. International congress of the International Organization for Mycoplasmology, Jul 2006, Cambridge, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-02752179
v1
|
|
Pôle Métabolome à l'IFR 103 Biologie Végétale Intégrative de Bordeaux
Catherine Deborde
,
Cécile Cabasson
,
Mickael M. Maucourt
,
Christel Renaud
,
Monique Gaudillère
et al.
Premières journées scientifiques, Dec 2005, Toulouse, France
Communication dans un congrès
hal-02764501
v1
|
|
Un outil informatique générique pour le stockage et le data-mining de données de métabolome de plantes
Hélène Ferry-Dumazet
,
Daniel Jacob
,
Aurélien Barré
,
Cécile Cabasson
,
Christel Renaud
et al.
Premières journées scientifiques, Dec 2005, Toulouse, France
Communication dans un congrès
hal-02759485
v1
|
|
Chemical fingerprinting for the evaluation of polar and non polar metabolite changes during fruit development in tomato (Solanum lycopersicum) by means of H NMR
Catherine Deborde
,
G. Fourloubey
,
Daniel Jacob
,
Fabien F. Mounet
,
Cécile Cabasson
et al.
6. Colloque national de la SFBV, Apr 2005, Arcachon, France
Communication dans un congrès
hal-02762461
v1
|
|
Pilotage d'une plate-forme de filtration tangentielle : le placement de pôles comme stratégie de mise au point des régulations
D. Jacob
,
A. Lecomte
,
G. Daufin
4. Journées de la mesure, Oct 1996, Carry Le Rouet, France
Communication dans un congrès
hal-02764605
v1
|
|
Démonstration d'un exemple d'utilisation du logiciel Acsyde en vue de la synthèse de différents régulateurs
D. Jacob
,
A. Lecomte
4. Journées de la mesure, Oct 1996, Carry Le Rouet, France
Communication dans un congrès
hal-02768835
v1
|