Didier Boichard

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Réduction des émissions de méthane entérique chez les ruminants : enjeux, solutions et perspectives à l’échelle de l’animal et des systèmes d’élevage

Florence Gondret , Donato Andueza , Mohamed Habibou Assouma , Valérie Berthelot , Didier Boichard et al.

INRAE Productions Animales, 2026, 39 (1), pp.9470. ⟨10.20870/productions-animales.2026.39.1.9470⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-05526674v1

Effect of methylation on genome mutability in cattle

Corentin Fouéré , Valentin Costes , Chris Hozé , Florian Besnard , Gabriel Costa Monteiro Moreira et al.

Genetics Selection Evolution, 2026, 58, pp.42. ⟨10.1186/s12711-026-01051-y⟩

Article dans une revue hal-05712467v1

Assembly of a pangenome uncovers novel non-reference unique insertion sequences in cattle highlighting their genetic diversity

Valentin Sorin , Florian Besnard , Aurélien Capitan , Cécile Grohs , Maulana Mughitz Naji et al.

Journal of Animal Science and Biotechnology , 2026, 17 (1), pp.47. ⟨10.1186/s40104-026-01373-3⟩

Article dans une revue hal-05543227v1

An autosomal recessive nonsense variant in the EGFR gene induces perinatal lethality in “Blonde d'Aquitaine” calves

Sandrine Floriot , Sébastien Fritz , Vincent Herry , Christian Beauvallet , Mekki Boussaha et al.

BMC Veterinary Research, 2026, 22 (1), pp.89. ⟨10.1186/s12917-025-05225-6⟩

Article dans une revue hal-05512782v1

A novel reusable transcriptome-wide association study workflow used to map key genes linked to important cattle traits

S. Jayaraman , R. Zhao , P. Krishna Chitneedi , N. Kumar Kadri , G. Costa-Monteiro-Moreira et al.

Genomics, 2026, 118 (5), pp.111284. ⟨10.1016/j.ygeno.2026.111284⟩

Article dans une revue hal-05705919v1

Pangenome-based association testing between a structural variant located upstream of the KIT gene and head depigmentation across a diverse panel of cattle breeds

V. Sorin , M P Sanchez , L. Drouilhet , G. Tosser-Klopp , M M Naji et al.

Genetics Selection Evolution, 2026, 58 (1), pp.17. ⟨10.1186/s12711-026-01037-w⟩

Article dans une revue hal-05538738v1

Bilan de la sélection génomique bovine en France

Didier Boichard , Pascal Croiseau , Florence Phocas , Romain Saintilan , François Guillaume et al.

INRAE Productions Animales, 2026, 39 (2), pp.9986. ⟨10.20870/productions-animales.2026.39.2.9986⟩

Article dans une revue hal-05695586v1

Enjeux et orientations de la sélection génétique bovine en France d’ici 2040 : propositions issues d’une réflexion collective

Henri Lagarde , Pauline Martin , Philippe Barre , René Baumont , Mickaël Brochard et al.

INRAE Productions Animales, 2026, 39 (2), pp.9738. ⟨10.20870/productions-animales.2026.39.2.9738⟩

Article dans une revue hal-05695590v1

Accuracy of local ancestry inference and its impact on genomic prediction in admixed dairy cattle populations

Huiming Liu , Ole Fredslund Christensen , Jón H Eiríksson , Didier Boichard , Viktor Milkevych et al.

Journal of Dairy Science, 2026, 109 (3), pp.2743-2758. ⟨10.3168/jds.2025-27019⟩

Article dans une revue hal-05554176v1

Learning inherent genetic patterns and trait associations with deep generative models for discrete genotype simulation

Sihan Xie , Thierry Tribout , Didier Boichard , Blaise Hanczar , Julien Chiquet et al.

GigaScience, 2026, 15, pp.giag044. ⟨10.1093/gigascience/giag044⟩

Article dans une revue hal-05595894v1

Sequence-based GWAS reveals genes and variants associated with predicted methane emissions in French dairy cows

Solène Fresco , Marie-Pierre Sanchez , Didier Boichard , Sébastien Fritz , Pauline Martin

Genetics Selection Evolution, 2025, 57 (1), pp.32. ⟨10.1186/s12711-025-00977-z⟩

Article dans une revue hal-05120211v1

Whole genome short read data from 567 bulls of 14 breeds provides insight into genetic diversity of French cattle

Mekki Boussaha , Camille Eché , Christophe Klopp , Cécile Grohs , Marine Milhes et al.

Data in Brief, 2025, 62, pp.112049. ⟨10.1016/j.dib.2025.112049⟩

Article dans une revue (data paper) hal-05268512v1

Functional impact of splicing variants in the elaboration of complex traits in cattle

Mathieu Charles , Nicolas Gaiani , Marie-Pierre Sanchez , Mekki Boussaha , Chris Hozé et al.

Nature Communications, 2025, 16 (1), pp.3893. ⟨10.1038/s41467-025-58970-5⟩

Article dans une revue hal-05050421v1

Genetic regulation of sperm DNA methylation in cattle through meQTL mapping

Corentin Fouéré , Valentin Costes , Chris Hozé , Amrita Raja Ravi Shankar , Florian Besnard et al.

BMC Genomics, 2025, 26 (1), pp.771. ⟨10.1186/s12864-025-11934-x⟩

Article dans une revue hal-05220883v1

Application of a French cattle pangenome, from structural variant discovery to association studies on key phenotypes

Valentin Sorin , Maulana Mughitz Naji , Clément Birbes , Cécile Grohs , Clémentine Escouflaire et al.

Genetics Selection Evolution, 2025, 57, pp.61. ⟨10.1186/s12711-025-01012-x⟩

Article dans une revue hal-05330359v1

Comprehensive detection of structural variations in long and short reads dataset of French cattle

Maulana Mughitz Naji , Christophe Klopp , Camille Eché , Arnaud Di Franco , Clément Birbes et al.

Scientific Reports, 2025, 15 (1), pp.40758. ⟨10.1038/s41598-025-24477-8⟩

Article dans une revue hal-05391915v1

Short communication: First insights into response to selection for reducing methane emissions in dairy cows

S. Fresco , D. Boichard , S. Aguerre , S. Fritz , Pauline Martin

Animal, 2025, 19 (12), pp.101700. ⟨10.1016/j.animal.2025.101700⟩

Article dans une revue hal-05388818v1

Méthane 2030 : un programme de recherche collectif de réduction des émissions de méthane entérique chez les bovins

Mickaël Brochard , Didier Boichard , Mathieu Diribarne , André Le Gall , Cécile Martin

Bulletin des G.T.V., 2025, 120, pp.59-64

Article dans une revue (article de synthèse) hal-05352315v1

Erosion of estimated genomic breeding values with generations is due to long distance associations between markers and QTL

Didier Boichard , Sébastien Fritz , Pascal Croiseau , Vincent Ducrocq , Thierry Tribout et al.

Genetics Selection Evolution, 2025, 57 (1), pp.14. ⟨10.1186/s12711-025-00963-5⟩

Article dans une revue hal-05000911v1

A bovine model of rhizomelic chondrodysplasia punctata caused by a deep intronic splicing variant in the GNPAT gene

Arnaud Boulling , Julien Corbeau , Cécile Grohs , Anne Barbat , Jérémy Mortier et al.

Genetics Selection Evolution, 2025, 57 (1), pp.23. ⟨10.1186/s12711-025-00969-z⟩

Article dans une revue hal-05075769v1

Meta-analysis of six dairy cattle breeds reveals biologically relevant candidate genes for mastitis resistance

Zexi Cai , Terhi Iso-Touru , Marie-Pierre Sanchez , Naveen Kadri , Aniek C Bouwman et al.

Genetics Selection Evolution, 2024, 56 (1), pp.54. ⟨10.1186/s12711-024-00920-8⟩

Article dans une revue hal-04648082v1

Genetic parameters for methane production, intensity, and yield predicted from milk mid-infrared spectra throughout lactation in Holstein dairy cows

S. Fresco , D. Boichard , S. Fritz , P. Martin

Journal of Dairy Science, 2024, 107 (12), pp.11311-11323. ⟨10.3168/jds.2024-25231⟩

Article dans une revue hal-04885713v1

Investigating the impact of paternal age, paternal heat stress, and estimation of non-genetic paternal variance on dairy cow phenotype

Corentin Fouéré , Chris Hozé , Florian Besnard , Mekki Boussaha , Didier Boichard et al.

Genetics Selection Evolution, 2024, 56 (1), pp.46. ⟨10.1186/s12711-024-00918-2⟩

Article dans une revue hal-04621354v1

Quelles génétiques pour les systèmes d’élevages certifiés en agriculture biologique ?

Laurianne Canario , Nicolas Bédère , Marc Vandeputte , Didier Boichard , Jérôme Raoul et al.

INRAE Productions Animales, 2024, 37 (2), pp.8177. ⟨10.20870/productions-animales.2024.37.2.8177⟩

Article dans une revue hal-04703177v1

Genetic parameters, GWAS and selection perspective on gestation length in 16 French cattle breeds

Jeanlin Jourdain , Aurélien Capitan , Romain Saintilan , Chris Hozé , Corentin Fouéré et al.

Journal of Dairy Science, 2024, ⟨10.3168/jds.2024-24736⟩

Article dans une revue hal-04722582v1

Short communication: Correlation of methane production, intensity, and yield with residual feed intake throughout lactation in Holstein cows

Solène Fresco , Didier Boichard , Rachel Lefebvre , Sarah Barbey , M. Gaborit et al.

Animal, 2024, 18 (3), pp.101110. ⟨10.1016/j.animal.2024.101110⟩

Article dans une revue hal-04623769v1

Expected values for the accuracy of predicted breeding values accounting for genetic differences between reference and target populations

Beatriz C. D. Cuyabano , Didier Boichard , Cedric Gondro

Genetics Selection Evolution, 2024, 56 (1), pp.15. ⟨10.1186/s12711-024-00876-9⟩

Article dans une revue hal-04487620v1

Utilisation de la semence sexée en production bovine

Didier Boichard , Sandra Dominique , Marie Bérodier , Sébastien Fritz , Luc Delaby et al.

INRAE Productions Animales, 2024, 37 (4), pp.8320. ⟨10.20870/productions-animales.2024.37.4.8320⟩

Article dans une revue hal-04850550v1

Massive detection of cryptic recessive genetic defects in dairy cattle mining millions of life histories

Florian Besnard , Ana Guintard , Cécile Grohs , Laurence Guzylack-Piriou , Margarita Cano et al.

Genome Biology, 2024, 25 (1), pp.248. ⟨10.1186/s13059-024-03384-7⟩

Article dans une revue hal-04714371v1

Combining short-term breath measurements to develop methane prediction equations from cow milk mid-infrared spectra

Solène Fresco , A. Vanlierde , Didier Boichard , Rachel Lefebvre , M. Gaborit et al.

Animal, 2024, 18 (7), pp.101200. ⟨10.1016/j.animal.2024.101200⟩

Article dans une revue hal-04623789v1

Long-lasting effects of in utero heat stress on subsequent performances of heifers and primiparous cows

A. Vinet , C. Fouéré , B.C.D. Cuyabano , S. Mattalia , R. Vallée et al.

Journal of Dairy Science, 2024, 107 (12), pp.11065-11077. ⟨10.3168/jds.2024-25168⟩

Article dans une revue hal-04885784v1

Genetic parameters, genome-wide association study, and selection perspective on gestation length in 16 French cattle breeds

Jeanlin Jourdain , Aurélien Capitan , Romain Saintilan , Chris Hozé , Corentin Fouéré et al.

Journal of Dairy Science, 2024, 107 (10), pp.8157-8169. ⟨10.3168/jds.2023-24632⟩

Article dans une revue hal-04842563v1

Effect of temperature-humidity index on the evolution of trade-offs between fertility and production in dairy cattle

Aurélie Vinet , Sophie Mattalia , Roxane Vallée , Christine Bertrand , Anne Barbat et al.

Genetics Selection Evolution, 2024, 56 (1), pp.23. ⟨10.1186/s12711-024-00889-4⟩

Article dans une revue hal-04531071v1

A large population study to assess the magnitude of prenatal programming in dairy cattle

C Fouéré , M P Sanchez , M Boussaha , S Fritz , A Vinet et al.

Journal of Dairy Science, 2024, 107, pp.5913-5923. ⟨10.3168/jds.2023-24051⟩

Article dans une revue hal-04569709v2

A recurrent de novo missense mutation in COL1A1 causes osteogenesis imperfecta type II and preterm delivery in Normande cattle

Julien Corbeau , Cécile Grohs , Jeanlin Jourdain , Mekki Boussaha , Florian Besnard et al.

Genetics Selection Evolution, 2024, 56 (1), pp.39. ⟨10.1186/s12711-024-00909-3⟩

Article dans une revue hal-04581779v1

Comparison of methane production, intensity, and yield throughout lactation in Holstein cows

S Fresco , D Boichard , S Fritz , R Lefebvre , S Barbey et al.

Journal of Dairy Science, 2023, 106 (6), pp.4147-4157. ⟨10.3168/jds.2022-22855⟩

Article dans une revue hal-04083019v1

The Bovine Pangenome Consortium: democratizing production and accessibility of genome assemblies for global cattle breeds and other bovine species

Timothy P L Smith , Derek M Bickhart , Didier Boichard , Amanda J Chamberlain , Appolinaire Djikeng et al.

Genome Biology, 2023, 24 (1), pp.139. ⟨10.1186/s13059-023-02975-0⟩

Article dans une revue hal-04136901v1

Large-scale detection and characterization of interchromosomal rearrangements in normozoospermic bulls using massive genotype and phenotype data sets

Jeanlin Jourdain , Harmonie Barasc , Thomas Faraut , Anne Calgaro , Nathalie Bonnet et al.

Genome Research, 2023, 33 (6), pp.957-971. ⟨10.1101/gr.277787.123⟩

Article dans une revue hal-04170739v1

Association between body condition genomic values and feed intake, milk production, and body weight in French Holstein cows

Rachel Lefebvre , Philippe Faverdin , S. Barbey , J. Jurquet , Thierry Tribout et al.

Journal of Dairy Science, 2023, 106 (1), pp.381-391. ⟨10.3168/jds.2022-22194⟩

Article dans une revue hal-03876258v1

X-linked genes influence various complex traits in dairy cattle

Marie-Pierre Sanchez , Clémentine Escouflaire , Aurélia Baur , Fiona Bottin , Chris Hozé et al.

BMC Genomics, 2023, 24 (1), pp.338. ⟨10.1186/s12864-023-09438-7⟩

Article dans une revue hal-04135678v1

Genetic relationships between weight loss in early lactation and daily milk production throughout the lactation in Holstein cows

T. Tribout , S. Minéry , R. Vallée , S. Saille , D. Saunier et al.

Journal of Dairy Science, 2023, 106, pp.4799-4812. ⟨10.3168/jds.2022-22813⟩

Article dans une revue hal-04092080v1

Estimation of genotype by temperature-humidity index interactions on milk production and udder health traits in Montbeliarde cows

Aurélie Vinet , Sophie Mattalia , Roxane Vallée , Christine Bertrand , Beatriz Cuyabano et al.

Genetics Selection Evolution, 2023, 55 (1), pp.4. ⟨10.1186/s12711-023-00779-1⟩

Article dans une revue hal-03950525v1

Detailed analysis of mortality rates in the female progeny of 1,001 Holstein bulls allows the discovery of new dominant genetic defects

Florian Besnard , H Leclerc , Mekki Boussaha , Cécile Grohs , N Jewell et al.

Journal of Dairy Science, 2023, 106 (1), pp.439-451. ⟨10.3168/jds.2022-22365⟩

Article dans une revue hal-03844760v1

A Bos taurus sequencing methods benchmark for assembly, haplotyping, and variant calling

Camille Eché , Carole Iampietro , Clément Birbes , Andreea Dréau , Claire Kuchly et al.

Scientific Data , 2023, 10 (1), pp.369. ⟨10.1038/s41597-023-02249-1⟩

Article dans une revue (data paper) hal-04122201v1

Sequence-based GWAS meta-analyses for beef production traits

Marie-Pierre Sanchez , Thierry Tribout , Naveen Kadri , Praveen Chitneedi , Steffen Maak et al.

Genetics Selection Evolution, 2023, 55 (1), pp.70. ⟨10.1186/s12711-023-00848-5⟩

Article dans une revue hal-04248281v1

Integrin alpha 6 homozygous splice-site mutation causes a new form of junctional epidermolysis bullosa in Charolais cattle

Mekki Boussaha , Arnaud Boulling , Valérie Wolgust , Lorraine Bourgeois-Brunel , Pauline Michot et al.

Genetics Selection Evolution, 2023, 55 (1), pp.40. ⟨10.1186/s12711-023-00814-1⟩

Article dans une revue hal-04125597v1

Invited review: Good practices in genome-wide association studies to identify candidate sequence variants in dairy cattle

Goutam Sahana , Z. Cai , M.P. Sanchez , A.C. Bouwman , D. Boichard

Journal of Dairy Science, 2023, 106, ⟨10.3168/jds.2022-22694⟩

Article dans une revue hal-04135625v1

Predicting male fertility from the sperm methylome: application to 120 bulls with hundreds of artificial insemination records

Valentin Costes , Aurélie Chaulot-Talmon , Eli Sellem , Jean-Philippe Perrier , Anne Aubert-Frambourg et al.

Clinical Epigenetics, 2022, 14 (1), pp.54. ⟨10.1186/s13148-022-01275-x⟩

Article dans une revue hal-03654993v1

Opportunities for genomic selection of cheese-making traits in Montbéliarde cows

M.P. Sanchez , T. Tribout , S. Fritz , V. Wolf , C. Laithier et al.

Journal of Dairy Science, 2022, ⟨10.3168/jds.2021-21558⟩

Article dans une revue hal-03655719v1

New insights into the genetic resistance to paratuberculosis in Holstein cattle via single-step genomic evaluation

Marie-Pierre Sanchez , Thierry Tribout , Sébastien Fritz , Raphaël Guatteo , Arnaud Delafosse et al.

Genetics Selection Evolution, 2022, 54 (1), pp.67. ⟨10.1186/s12711-022-00757-z⟩

Article dans une revue hal-03816238v1

Mutation of the MYH3 gene causes recessive cleft palate in Limousine cattle

Anne Vaiman , Sébastien Fritz , Christian Beauvallet , Mekki Boussaha , Cécile Grohs et al.

Genetics Selection Evolution, 2022, 54 (1), pp.71. ⟨10.1186/s12711-022-00762-2⟩

Article dans une revue hal-03839198v1

Genome-wide association study with imputed whole-genome sequence variants including large deletions for female fertility in 3 Nordic dairy cattle breeds

Md Mesbah-Uddin , Bernt Guldbrandtsen , Aurélien Capitan , Mogens Sandø Lund , Didier Boichard et al.

Journal of Dairy Science, 2022, 105 (2), pp.1298-1313. ⟨10.3168/jds.2021-20655⟩

Article dans une revue hal-03533717v1

Standardized Whole Blood Assay and Bead-Based Cytokine Profiling Reveal Commonalities and Diversity of the Response to Bacteria and TLR Ligands in Cattle

Jérémy Lesueur , Sarah Walachowski , S. Barbey , Nathan Cebron , Rachel Lefebvre et al.

Frontiers in Immunology, 2022, 13, pp.871780. ⟨10.3389/fimmu.2022.871780⟩

Article dans une revue hal-03704013v1

Sequence-based GWAS and post-GWAS analyses reveal a key role of SLC37A1, ANKH, and regulatory regions on bovine milk mineral content

Marie-Pierre Sanchez , Dominique Rocha , Mathieu Charles , Mekki Boussaha , Chris Hozé et al.

Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-87078-1⟩

Article dans une revue hal-03191450v1

Exploring simultaneous perturbation profiles in milk yield and body weight reveals a diversity of animal responses and new opportunities to identify resilience proxies

Ahmed Ben Abdelkrim , Thierry Tribout , Olivier Martin , D. Boichard , Vincent Ducrocq et al.

Journal of Dairy Science, 2021, 104 (1), pp.459-470. ⟨10.3168/jds.2020-18537⟩

Article dans une revue hal-03093297v1

A missense mutation in the FZD7 gene is associated with dilution of the red areas of the coat in Montbéliarde cattle

S. Floriot , A. Duchesne , C. Grohs , C. Hozé , M.C. Deloche et al.

Animal Genetics, 2021, 52 (3), pp.351-355. ⟨10.1111/age.13055⟩

Article dans une revue hal-04478130v1

Improved dairy cattle mating plans at herd level using genomic information

M. Bérodier , P. Berg , T. Meuwissen , D. Boichard , M. Brochard et al.

Animal, 2021, 15 (1), pp.100016. ⟨10.1016/j.animal.2020.100016⟩

Article dans une revue hal-03093304v1

In silico identification of variations in microRNAs with a potential impact on dairy traits using whole ruminant genome SNP datasets

Céline Bourdon , Mekki Boussaha , Philippe Bardou , Marie-Pierre Sanchez , Sandrine Le Guillou et al.

Scientific Reports, 2021, 11, ⟨10.1038/s41598-021-98639-9⟩

Article dans une revue hal-03371440v1

Influence of production, reproduction, morphology, and health traits on true and functional longevity in French Holstein cows

Roberta Rostellato , J. Promp , H. Leclerc , S. Mattalia , Nicolas N.C. Friggens et al.

Journal of Dairy Science, 2021, 104 (12), pp.12664-12678. ⟨10.3168/jds.2020-19974⟩

Article dans une revue hal-03528049v1

Genome-wide association study for age at puberty and resumption of cyclicity in a crossbred dairy cattle population

Rachel Lefebvre , Helene Larroque , S. Barbey , Y. Gallard , J.J. J Colleau et al.

Journal of Dairy Science, 2021, 104 (5), pp.5794 - 5804. ⟨10.3168/jds.2020-18228⟩

Article dans une revue hal-03204539v1

Meta-analysis for milk fat and protein percentage using imputed sequence variant genotypes in 94,321 cattle from eight cattle breeds

Irene van den Berg , Ruidong Xiang , Janez Jenko , Hubert Pausch , Mekki Boussaha et al.

Genetics Selection Evolution, 2020, 52 (1), pp.37. ⟨10.1186/s12711-020-00556-4⟩

Article dans une revue hal-02897829v1

FROM’MIR : Développer des outils de prédiction et de conseil pour maîtriser la fromageabilité des laits destinés à la fabrication des fromages traditionnels franc-comtois

Cécile Laithier , Valerie Wolf , Mickael Brochard , Marie-Pierre Sanchez , Nicolas Gaudilliere et al.

Innovations Agronomiques, 2020, 79, pp.227-244. ⟨10.15454/q8rx-az02⟩

Article dans une revue hal-02457192v1

Frequencies of milk protein variants and haplotypes estimated from genotypes of more than 1 million bulls and cows of 12 French cattle breeds

Marie-Pierre Sanchez , S. Fritz , C. Patry , A. Delacroix-Buchet , D. Boichard

Journal of Dairy Science, 2020, 103 (10), pp.9124-9141. ⟨10.3168/jds.2020-18492⟩

Article dans une revue hal-02969677v1

Genetic architecture of individual variation in recombination rate on the X chromosome in cattle

Junjie Zhang , Naveen Kumar Kadri , Erik Mullaart , Richard Spelman , Sébastien Fritz et al.

Heredity, 2020, 125 (5), pp.304-316. ⟨10.1038/s41437-020-0341-9⟩

Article dans une revue hal-03155457v1

imputation for sequencing variants preselected to a customized low-density chip

Aoxing Liu , Mogens Sandø Lund , Didier Boichard , Xiaowei Mao , Emre Karaman et al.

Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.9524. ⟨10.1038/s41598-020-66523-7⟩

Article dans une revue hal-02969666v1

Identification of the ABCC4, IER3, and CBFA2T2 candidate genes for resistance to paratuberculosis from sequence-based GWAS in Holstein and Normande dairy cattle

Marie-Pierre Sanchez , Raphaël Guatteo , Aurore Davergne , Judikael Saout , Cécile Grohs et al.

Genetics Selection Evolution, 2020, 52 (1), pp.14. ⟨10.1186/s12711-020-00535-9⟩

Article dans une revue hal-02514814v1

Weighted single-step genomic best linear unbiased prediction integrating variants selected from sequencing data by association and bioinformatics analyses

Aoxing Liu , Mogens Sandø Lund , Didier Boichard , Emre Karaman , Bernt Guldbrandtsen et al.

Genetics Selection Evolution, 2020, 52 (1), pp.48. ⟨10.1186/s12711-020-00568-0⟩

Article dans une revue hal-02969616v1

Improvement of genomic prediction by integrating additional single nucleotide polymorphisms selected from imputed whole genome sequencing data.

Aoxing Liu , Mogens Sandø Lund , Didier Boichard , Emre Karaman , Sebastien Fritz et al.

Heredity, 2020, 124 (1), pp.37-49. ⟨10.1038/s41437-019-0246-7⟩

Article dans une revue hal-02627427v1

Short communication: a splice site mutation in CENPU is associated with recessive embryonic lethality in Holstein cattle.

Chris Hoze , Clémentine Escoulflaire , Mohammad Elias Mesbah Uddin , Anne Barbat , Mekki Boussaha et al.

Journal of Dairy Science, 2020, 103 (1), pp.607-612. ⟨10.3168/jds.2019-17056⟩

Article dans une revue hal-02625089v1

Confirmed effects of candidate variants for milk production, udder health, and udder morphology in dairy cattle

Thierry Tribout , Pascal Croiseau , Rachel Lefebvre , Anne Barbat , Mekki Boussaha et al.

Genetics Selection Evolution, 2020, 52 (1), ⟨10.1186/s12711-020-00575-1⟩

Article dans une revue hal-03155461v1

Analyse génétique de la « fromageabilité » du lait de vache prédite par spectrométrie dans le moyen infrarouge en race Montbéliarde

Marie-Pierre Sanchez , Valérie Wolf , Cécile Laithier , Mohammed El Jabri , Eric Beuvier et al.

INRA Productions Animales, 2019, 32 (3), pp.379-398. ⟨10.20870/productions-animales.2019.32.3.2950⟩

Article dans une revue hal-02618893v1

A missense mutation (p.Tyr452Cys) in the CAD gene compromises reproductive success in French Normande cattle

M. Mesbah-Uddin , Chris Hoze , Pauline Michot , Anne Barbat , Rachel Lefebvre et al.

Journal of Dairy Science, 2019, 102 (7), pp.6340-6356. ⟨10.3168/jds.2018-16100⟩

Article dans une revue hal-02620263v1

GSE's 50th anniversary: where do we go from now?

Didier Boichard , Hélène Hayes , Jacobus Dekkers , - Julius van Der Werf

Genetics Selection Evolution, 2019, 51, pp.1-3. ⟨10.1186/s12711-019-0504-4⟩

Article dans une revue hal-02628229v1

La génétique animale à l‘INRA

Pierre P. Sellier , Didier Boichard , Etienne Verrier

Histoire de la recherche contemporaine : la revue du Comité pour l’histoire du CNRS , 2019, VIII (1), pp.86-97. ⟨10.4000/hrc.3222⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02618378v1

Joint imputation of whole-genome sequence variants and large chromosomal deletions in cattle.

M.Mesbah Uddin , Bernt Guldbrandtsen , Mogens Sand Lund , Didier Boichard , Goutam Sahana

Journal of Dairy Science, 2019, 102 (12), pp.11193-11206. ⟨10.3168/jds.2019-16946⟩

Article dans une revue hal-02621886v1

Use of sexed semen and female genotyping affects genetic and economic outcomes of Montbéliarde dairy herds depending on the farming system considered.

Marie Bérodier , Mickael Brochard , Didier Boichard , Charlotte Dezetter , Nathalie Bareille et al.

Journal of Dairy Science, 2019, 102 (11), pp.10073-10087. ⟨10.3168/jds.2018-16041⟩

Article dans une revue hal-02628334v1

Comparison of Bayesian and partial least squares regression methods for mid-infrared prediction of cheese-making properties in Montbéliarde cows

M. El Jabri , Marie-Pierre Sanchez , P. Trossat , C. Laithier , V. Wolf et al.

Journal of Dairy Science, 2019, 102 (8), pp.6943-6958. ⟨10.3168/jds.2019-16320⟩

Article dans une revue hal-02619829v1

Le croisement entre races bovines laitières : intérêts et limites pour des ateliers en race pure Prim’Holstein ?

Charlotte Dezetter , Didier Boichard , Nathalie Bareille , Bénédicte Grimard , Pascale Le Mezec et al.

INRA Productions Animales, 2019, 32 (3), pp.359-378. ⟨10.20870/productions-animales.2019.32.3.2575⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02625070v1

Sequence-based GWAS, network and pathway analyses reveal genes co-associated with milk cheese-making properties and milk composition in Montbéliarde cows

Marie-Pierre Sanchez , Yuliaxis Ramayo-Caldas , Valérie Wolf , Cécile Laithier , Mohammed El Jabri et al.

Genetics Selection Evolution, 2019, 51 (1), pp.34. ⟨10.1186/s12711-019-0473-7⟩

Article dans une revue hal-02176238v1

Sequence-based GWAS, network and pathway analyses reveal genes co-associated with milk cheese-making properties and milk composition in Montbéliarde cows

Marie-Pierre Sanchez , Yuliaxis Ramayo-Caldas , Valérie Wolf , Cécile Laithier , Mohammed El Jabri et al.

Genetics Selection Evolution, 2019, ⟨10.1186/s12711-019-0473-7⟩

Article dans une revue hal-03162144v1

Longitudinal study of Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis fecal shedding patterns and concurrent serological patterns in naturally infected dairy cattle

Nora Navarro-Gonzalez , Christine Fourichon , Philippe Blanquefort , Arnaud Delafosse , Alain Joly et al.

Journal of Dairy Science, 2019, 102 (10), pp.9117-9137. ⟨10.3168/jds.2018-15897⟩

Article dans une revue hal-02623346v1

An initiator codon mutation in SDE2 causes recessive embryonic lethality in Holstein cattle

Sebastien Fritz , Chris Hoze , Emmanuelle Rebours , Anne Barbat , Méline Bizard et al.

Journal of Dairy Science, 2018, 101 (7), pp.6220-6231. ⟨10.3168/jds.2017-14119⟩

Article dans une revue hal-02623515v1

Faibles concentrations cellulaires du lait et sensibilité aux mammites des ruminants laitiers

Pascal Rainard , Gilles Foucras , Didier Boichard , Rachel Rupp

INRA Productions Animales, 2018, 31 (4), pp.365-376. ⟨10.20870/productions-animales.2018.31.4.2393⟩

Article dans une revue hal-02621013v1

Genetic parameters for cheese-making properties and milk composition predicted from mid-infrared spectra in a large data set of Montbéliarde cows

Marie-Pierre Sanchez , M El Jabri , S Minéry , V Wolf , E Beuvier et al.

Journal of Dairy Science, 2018, 101 (11), pp.10048-10061. ⟨10.3168/jds.2018-14878⟩

Article dans une revue hal-02626138v1

Genome-wide association study for milking speed in French Holstein cows.

Andrew Marete , Goutam Sahana , Sebastien Fritz , Rachel Lefebvre , Anne Barbat et al.

Journal of Dairy Science, 2018, 101 (7), pp.6205-6219. ⟨10.3168/jds.2017-14067⟩

Article dans une revue hal-02623282v1

Meta-analysis of genome-wide association studies for cattle stature identifies common genes that regulate body size in mammals

Aniek C. Bouwman , Hans D. Daetwyler , Amanda J. Chamberlain , Carla Hurtado Ponce , Mehdi Sargolzaei et al.

Nature Genetics, 2018, 50 (3), pp.362-367. ⟨10.1038/s41588-018-0056-5⟩

Article dans une revue hal-02628780v1

Short communication: Confirmation of candidate causative variants on milk composition and cheesemaking properties in Montbéliarde cows

Marie-Pierre Sanchez , V Wolf , M. El Jabri , Eric Beuvier , Odile Rolet-Répécaud et al.

Journal of Dairy Science, 2018, 101 (11), pp.10076-10081. ⟨10.3168/jds.2018-14986⟩

Article dans une revue hal-02623400v1

A meta-analysis including pre-selected sequence variants associated with seven traits in three French dairy cattle populations

Andrew G. Marete , Bernt Guldbrandtsen , Mogens S. Lund , Sebastien Fritz , Goutam Sahana et al.

Frontiers in Genetics, 2018, 9, pp.522. ⟨10.3389/fgene.2018.00522⟩

Article dans une revue hal-02625793v1

Genome-wide mapping of large deletions and their population-genetic properties in dairy cattle

Md Mesbah Uddin , Bernt Guldbrandtsen , Terhi Iso-Touru , Johanna Vilkki , Dirk-Jan de Koning et al.

DNA Research, 2018, 25 (1), pp.49-59. ⟨10.1093/dnares/dsx037⟩

Article dans une revue hal-02621609v1

A system-based analysis of the genetic determinism of udder conformation and health phenotypes across three French dairy cattle breeds

Andrew Marete , Mogens Sandø Lund , Didier Boichard , Yuliaxis Ramayo Caldas

PLoS ONE, 2018, 13 (7), pp.1-17. ⟨10.1371/journal.pone.0199931⟩

Article dans une revue hal-02626366v1

La sélection dans l’espèce bovine et ses perspectives

Didier Boichard , Sophie Mattalia , Sebastien Fritz

Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2018, 170 (5), pp.215-221

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02617862v1

Invited review: Low milk somatic cell count and susceptibility to mastitis

Pascal Rainard , Gilles Foucras , Didier Boichard , Rachel Rupp

Journal of Dairy Science, 2018, 101 (8), pp.6703-6714. ⟨10.3168/jds.2018-14593⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02626573v1

Genetic parameters of milk production traits in response to a short once-daily milking period in crossbred Holstein × Normande dairy cows

Clémentine Charton , Jocelyne Guinard-Flament , Rachel Lefebvre , Sarah Barbey , Yves Gallard et al.

Journal of Dairy Science, 2018, 101 (3), pp.2235-2247. ⟨10.3168/jds.2017-13173⟩

Article dans une revue hal-02622344v1

Progressive ataxia of Charolais cattle highlights a role of KIF1C in sustainable myelination

Amandine Duchesne , Anne Vaiman , Magali Frah , Sandrine Floriot , Sabrina Legoueix et al.

PLoS Genetics, 2018, 14 (8), pp.1-25. ⟨10.1371/journal.pgen.1007550⟩

Article dans une revue hal-02624522v1

A multi-scale analysis of bull sperm methylome revealed both species peculiarities and conserved tissue-specific features

Jean-Philippe Perrier , Eli Sellem , Audrey Prézelin , Maxime Gasselin , Luc Jouneau et al.

BMC Genomics, 2018, 19 (1), pp.404. ⟨10.1186/s12864-018-4764-0⟩

Article dans une revue hal-01975403v1

Rapid discovery of de novo deleterious mutations in cattle enhances the value of livestock as model species

Emmanuelle Bourneuf , P. Otz , H. Pausch , V. Jagannathan , Pauline Michot et al.

Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.11466. ⟨10.1038/s41598-017-11523-3⟩

Article dans une revue hal-01608270v1

Identification of copy number variation in French dairy and beef breeds using next-generation sequencing

Rabia Letaief , Emmanuelle Rebours , Cécile Grohs , Cédric Meersseman , Sébastien Fritz et al.

Genetics Selection Evolution, 2017, 49 (1), pp.77. ⟨10.1186/s12711-017-0352-z⟩

Article dans une revue hal-01622967v1

Genetic and nongenetic factors contributing to differences in αS-casein phosphorylation isoforms and other major milk proteins

Zih-Hua Fang , H. Bovenhuis , Agnès Delacroix-Buchet , Guy Miranda , Didier Boichard et al.

Journal of Dairy Science, 2017, 100 (7), pp.5564-5577. ⟨10.3168/jds.2016-12338⟩

Article dans une revue hal-01608323v1

A missense mutation in PFAS (phosphoribosylformylglycinamidine synthase) is likely causal for embryonic lethality associated with the MH1 haplotype in Montbéliarde dairy cattle

Pauline Michot , Sebastien Fritz , Anne Barbat , Mekki Boussaha , Marie-Christine Deloche et al.

Journal of Dairy Science, 2017, 100 (10), pp.8176-8187. ⟨10.3168/jds.2017-12579⟩

Article dans une revue hal-02619062v1

Within-breed and multi-breed GWAS on imputed whole-genome sequence variants reveal candidate mutations affecting milk protein composition in dairy cattle

Marie-Pierre Sanchez , Armelle Govignon-Gion , Pascal Croiseau , Sébastien Fritz , Chris Hozé et al.

Genetics Selection Evolution, 2017, 49 (1), pp.68. ⟨10.1186/s12711-017-0344-z⟩

Article dans une revue hal-01589691v1

Bovine and murine models highlight novel roles for SLC25A46 in mitochondrial dynamics and metabolism, with implications for human and animal health

Amandine Duchesne , Anne Vaiman , Johan Castille , Christian Beauvallet , Pauline Gaignard et al.

PLoS Genetics, 2017, 13 (4), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pgen.1006597⟩

Article dans une revue hal-01605182v1

Short Communication : Genetic parameters for milk protein composition predicted using mid-infrared spectroscopy in the French Montbéliarde, Normande, and Holstein dairy cattle breeds

Marie-Pierre Sanchez , M. Ferrand , M. Gelé , D. Pourchet , Guy Miranda et al.

Journal of Dairy Science, 2017, 100 (8), pp.6371-6375. ⟨10.3168/jds.2017-12663⟩

Article dans une revue hal-01607785v1

L’Observatoire National des Anomalies Bovines, son action et ses résultats pour une aide efficace à la gestion des anomalies génétiques

Cécile Grohs , Amandine Duchesne , Sandrine Floriot , Marie-Christine Deloche , Didier Boichard et al.

INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.307-318

Article dans une revue (article de synthèse) hal-01602238v1

Du phénotype à la mutation causale : le cas des anomalies récessives bovines

Amandine Duchesne , Cécile Grohs , Pauline Michot , Maud Bertaud , Didier Boichard et al.

INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.319-328

Article dans une revue (article de synthèse) hal-01608800v1

Whole-genome scan to detect quantitative trait loci associated with milk protein composition in 3 French dairy cattle breeds

Marie-Pierre Sanchez , Armelle Gion , M. Ferrand , M. Gelé , D. Pourchet et al.

Journal of Dairy Science, 2016, 99 (10), pp.8203-8215. ⟨10.3168/jds.2016-11437⟩

Article dans une revue hal-01533901v1

Genomic selection in domestic animals: Principles, applications and perspectives

Didier Boichard , Vincent Ducrocq , Pascal Croiseau , Sebastien S. Fritz

Comptes Rendus. Biologies, 2016, 339 (7-8), pp.274-277. ⟨10.1016/j.crvi.2016.04.007⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02641310v1

Construction of a large collection of small genome variations in French dairy and beef breeds using whole-genome sequences

Mekki Boussaha , Pauline Michot , Rabia Letaief , Chris Hozé , Sébastien Fritz et al.

Genetics Selection Evolution, 2016, 48 (1), pp.87. ⟨10.1186/s12711-016-0268-z⟩

Article dans une revue hal-01479216v1

Sequence variants selected from a multi-breed GWAS can improve the reliability of genomic predictions in dairy cattle

Irene van den Berg , Didier Boichard , Mogens S. Lund

Genetics Selection Evolution, 2016, 48 (1), pp.83. ⟨10.1186/s12711-016-0259-0⟩

Article dans une revue hal-01479248v1

A reverse genetic approach identifies an ancestral frameshift mutation in RP1 causing recessive progressive retinal degeneration in European cattle breeds

Pauline Michot , Sabine Chahory , Andrew Marete , Cécile Grohs , Dimitri Dagios et al.

Genetics Selection Evolution, 2016, 48 (1), pp.56. ⟨10.1186/s12711-016-0232-y⟩

Article dans une revue hal-01479315v1

Les anomalies génétiques chez les espèces d’élevage - Avant-propos

Didier Boichard , Aurélien Capitan , Coralie Danchin-Burge , Cécile Grohs

INRAE Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.293-296. ⟨10.20870/productions-animales.2016.29.5.2995⟩

Article dans une revue hal-04045143v1

Coding and noncoding variants in <em>HFM1, MLH3, MSH4, MSH5, RNF212,</em> and <em>RNF212B</em> affect recombination rate in cattle

Naveen Kumar Kadri , Chad Harland , Pierre Faux , Nadine Cambisano , Latifa Karim et al.

Genome Research, 2016, 26 (10), pp.1323-1332. ⟨10.1101/gr.204214.116⟩

Article dans une revue hal-02637972v1

Identification and characterization of copy number variations in cattle

Rabia Letaief , Diane Esquerre , Johanna Barbieri , Cécile Grohs , Sebastien Fritz et al.

Journal of Animal Science, 2016, 94, pp.183-183. ⟨10.2527/jas2016.94supplement4183a⟩

Article dans une revue hal-01605684v1

Using sequence variants in linkage disequilibrium with causative mutations to improve across breed prediction in dairy cattle: a simulation study

Irene van den Berg , Didier Boichard , Bernt Guldbrandtsen , Mogens S Lund

G3, 2016, 6 (8), pp.2553-2561. ⟨10.1534/g3.116.027730⟩

Article dans une revue hal-02630862v1

Les anomalies génétiques : définition, origine, transmission et évolution, mode d’action

Didier Boichard , Cécile Grohs , Coralie Danchin-Burge , Aurelien Capitan

INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.297-306

Article dans une revue (article de synthèse) hal-01602233v1

Anticiper l'émergence d'anomalies génétiques grâce aux données génomiques

Sebastien Fritz , Pauline Michot , Chris Hoze , Cécile Grohs , Anne Barbat et al.

INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.339-350

Article dans une revue (article de synthèse) hal-01602234v1

Prise en compte des anomalies génétiques en sélection : le cas des bovins

Didier Boichard , Cécile Grohs , Pauline Michot , Coralie Danchin-Burge , Aurelien Capitan et al.

INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.351-358

Article dans une revue (article de synthèse) hal-01602349v1

Dossier : Anomalies génétiques - Avant-propos

Didier Boichard , Aurelien Capitan , Coralie Danchin-Burge , Cécile Grohs

INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.293-295

Article dans une revue hal-01533956v1

Comparing power and precision of within-breed and multibreed genome-wide association studies of production traits using whole-genome sequence data for 5 French and Danish dairy cattle breeds

Irene van den Berg , Didier Boichard , Mogens Sandø Lund

Journal of Dairy Science, 2016, 99 (11), pp.8932-8945. ⟨10.3168/jds.2016-11073⟩

Article dans une revue hal-01533908v1

Sustainable dairy cattle selection in the genomic era

Didier Boichard , Vincent Ducrocq , Sebastien Fritz

Journal of Animal Breeding and Genetics, 2015, 132 (2), pp.135-143. ⟨10.1111/jbg.12150⟩

Article dans une revue (article de synthèse) istex hal-01194086v1

Genetics Selection Evolution reviewer acknowledgement 2014

Didier Boichard , Jack Dekkers , Hélène Hayes , Julius van Der Werf

Genetics Selection Evolution, 2015, 47 (1), pp.73. ⟨10.1186/s12711-015-0147-z⟩

Article dans une revue hal-01341308v1

Inbreeding and crossbreeding parameters for production and fertility traits in Holstein, Montbéliarde, and Normande cows

C. Dezetter , Helene Leclerc , Sophie Mattalia-Elie , Anne Barbat , Didier Boichard et al.

Journal of Dairy Science, 2015, 98 (7), pp.4904-4913. ⟨10.3168/jds.2014-8386⟩

Article dans une revue hal-01194131v1

Simulation des potentialités de la sélection génomique chez les bovins laitiers

J Jacques J. J. Colleau , Sebastien S. Fritz , François Guillaume , Aurélia A. Baur , D. Dupassieux et al.

INRA Productions Animales, 2015, 28 (3), pp.251-258

Article dans une revue hal-02629942v1

C-Nap1 mutation affects centriole cohesion and is associated with a Seckel-like syndrome in cattle

Sandrine Floriot , Christine Vesque , Sabrina Rodriguez , Florence Bourgain-Guglielmetti , Anthi Karaiskou et al.

Nature Communications, 2015, 6, pp.1-9. ⟨10.1038/ncomms7894⟩

Article dans une revue hal-01194104v1

Genetic tools to improve reproduction traits in dairy cattle

Aurelien Capitan , Pauline Michot , Aurélia Baur , Romain Saintilan , Chris Hoze et al.

Reproduction, Fertility and Development, 2015, 27 (1), pp.14-21. ⟨10.1071/RD14379⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-01194016v1

Quantitative trait loci markers derived from whole genome sequence data increases the reliability of genomic prediction

R.F. Brøndum , G. Su , L. Janss , G. Sahana , B. Guldbrandtsen et al.

Journal of Dairy Science, 2015, 98 (6), pp.4107-4116. ⟨10.3168/jds.2014-9005⟩

Article dans une revue hal-01194114v1

Sélection génomique chez les bovins laitiers : les raisons de son succès

Didier Boichard

Sélectionneur Français, 2015, 66, pp.11-20

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02633329v1

GRAIN: a computer program to calculate ancestral and partial inbreeding coefficients using a gene dropping approach

R. Baumung , J. Farkas , Didier Boichard , G. Mészáros , J. Sölkner et al.

Journal of Animal Breeding and Genetics, 2015, 132 (2), pp.100-108. ⟨10.1111/jbg.12145⟩

Article dans une revue istex hal-01194087v1

Whole-genome sequencing identifies a homozygous deletion encompassing exons 17 to 23 of the [i]integrin beta 4[/i] gene in a Charolais calf with junctional epidermolysis bullosa

Pauline Michot , Oscar Fantini , Régis Braque , Aurélie Allais-Bonnet , Romain Saintilan et al.

Genetics Selection Evolution, 2015, 47 (1), pp.1-7. ⟨10.1186/s12711-015-0110-z⟩

Article dans une revue hal-01194111v1

Genome-wide study of structural variants in bovine Holstein, Montbéliarde and Normande dairy breeds

Mekki Boussaha , Diane Esquerre , Johanna Barbieri , Anis Djari , Alain Pinton et al.

PLoS ONE, 2015, 10 (8), pp.1-21. ⟨10.1371/journal.pone.0135931⟩

Article dans une revue hal-01194172v1

Whole-genome sequencing of 234 bulls facilitates mapping of monogenic and complex traits in cattle

Hans D Daetwyler , Aurelien Capitan , Hubert Pausch , Paul Stothard , Rianne van Binsbergen et al.

Nature Genetics, 2014, 46 (8), pp.858-865. ⟨10.1038/ng.3034⟩

Article dans une revue hal-01193853v1

Implications organisationnelles de la sélection génomique chez les bovins et ovins laitiers en France : analyses et accompagnement

Julie Labatut , Jean-Michel Astruc , Francis Barillet , Didier Boichard , Vincent Ducrocq et al.

INRA Productions Animales, 2014, 27 (4), pp.303-316

Article dans une revue hal-01193850v1

Genetics Selection Evolution reviewer acknowledgement 2013

Didier Boichard , Jack Cm Dekkers , Hélène Hayes

Genetics Selection Evolution, 2014, 46 (1), pp.1. ⟨10.1186/1297-9686-46-1⟩

Article dans une revue hal-01341220v1

Identification of the putative ancestral allele of bovine single-nucleotide polymorphisms.

Dominique Rocha , Coline Billerey , Franck Samson , Didier Boichard , Mekki Boussaha

Journal of Animal Breeding and Genetics, 2014, 131 (6), pp.483-486. ⟨10.1111/jbg.12095⟩

Article dans une revue istex hal-01193845v1

Déterminisme génétique de la composition en acides gras et protéines du lait des ruminants et potentialités de sélection

Didier Boichard , Armelle Gion , Helene Larroque , Cyrielle Maroteau , Isabelle Palhiere et al.

INRA Productions Animales, 2014, 27 (4), pp.283-298

Article dans une revue (article de synthèse) hal-01194000v1

Efficiency of multi-breed genomic selection for dairy cattle breeds with different sizes of reference population

C. Hozé , Sébastien Fritz , Florence Phocas , Didier Boichard , Vincent Ducrocq et al.

Journal of Dairy Science, 2014, 97 (6), pp.3918-3929. ⟨10.3168/jds.2013-7761⟩

Article dans une revue hal-01193830v1

Optimalait : Gestion des ressources génétiques et alimentaires pour la maîtrise de la composition en acides gras du lait

Marine Gele , Philippe Brunschwig , Didier Boichard , Armelle Govignon-Gion , Gilles Lagriffoul et al.

Innovations Agronomiques, 2014, 34, pp.189-206. ⟨10.17180/a3yv-2650⟩

Article dans une revue hal-04525055v1

Concordance analysis for QTL detection in dairy cattle: a case study of leg morphology

Irene van den Berg , Sébastien Fritz , Sabrina Rodriguez , Dominique Rocha , Mekki Boussaha et al.

Genetics Selection Evolution, 2014, 46 (1), pp.1-14. ⟨10.1186/1297-9686-46-31⟩

Article dans une revue hal-01193829v1

Dossier "PhénoFinlait : Phénotypage et génotypage pour la compréhension et la maîtrise de la composition fine du lait" - Avant propos

Mickaël Brochard , Koenraad Duhem , Didier Boichard

INRA Productions Animales, 2014, 27 (4), pp.251-254

Article dans une revue hal-01194060v1

Quel futur pour l'amélioration génétique chez les espèces domestiques ?

Didier Boichard

Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2014, 167 (2), pp.103-108

Article dans une revue hal-01193941v1

La sélection pour des vaches et une production laitière plus durables : acquis de la génétique et opportunités offertes par la sélection génomique

Mickael M. Brochard , Didier Boichard , Vincent Ducrocq , Sébastien S. Fritz

INRA Productions Animales, 2013, 26 (2), pp.145-156

Article dans une revue hal-01000791v1

Novel insights into the bovine polled phenotype and horn ontogenesis in Bovidae

Aurélie Allais-Bonnet , Cécile Grohs , Ivica I. Medugorac , Stefan S. Krebs , Anis Djari et al.

PLoS ONE, 2013, 8, online (5), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0063512⟩

Article dans une revue hal-01000794v1

Detection of haplotypes associated with prenatal death in dairy cattle and identification of deleterious mutations in GART, SHBG and SLC37A2

Sebastien S. Fritz , Aurelien A. Capitan , Anis Djari , Sabrina S. Rodriguez , Anne Barbat et al.

PLoS ONE, 2013, 8, online (6), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0065550⟩

Article dans une revue hal-01000118v1

QTL fine mapping with Bayesian C(π): a simulation study

Irene van den Berg van den Berg , Sébastien S. Fritz , Didier Boichard

Genetics Selection Evolution, 2013, 45 (june), Non paginé. ⟨10.1186/1297-9686-45-19⟩

Article dans une revue hal-01000784v1

La sélection génomique, une opportunité pour améliorer la santé des animaux d'élevage

Didier Boichard

Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2013, 166 (1), pp.25-31

Article dans une revue hal-01001353v1

High-density marker imputation accuracy in sixteen French cattle breeds

Chris Hoze Hozé , Marie-Noëlle M.-N. Fouilloux , Eric Venot , François F. Guillaume , Romain R. Dassonneville et al.

Genetics Selection Evolution, 2013, 45 (1), pp.1-11. ⟨10.1186/1297-9686-45-33⟩

Article dans une revue hal-01001056v1

Short communication: Imputation performances of 3 low-density marker panels in beef and dairy cattle

Romain Dassonneville , S. Fritz , Vincent Ducrocq , Didier Boichard

Journal of Dairy Science, 2012, 95 (7), pp.4136 - 4140. ⟨10.3168/jds.2011-5133⟩

Article dans une revue hal-01003420v1

LDSO : A progroam to simulate pedigrees and molecular information under various evolutionary forces

Florence F. Ytournel , Simon S. Teyssedre , Dana D. Roldan , M. M. Erbe , H. H. Simianer et al.

Journal of Animal Breeding and Genetics, 2012, 129 (5), pp.417-421. ⟨10.1111/j.1439-0388.2011.00986.x⟩

Article dans une revue istex hal-01000612v1

Genomic selection in French dairy cattle

Didier Boichard , Francois F. Guillaume , A. A. Baur , Pascal Croiseau , Marie-Noëlle M.-N. Rossignol et al.

Animal Production Science, 2012, 52 (3), pp.115-120. ⟨10.1071/AN11119⟩

Article dans une revue hal-01000202v1

A 3.7 Mb deletion encompassing ZEB2 causes a novel polled and multisystemic syndrome in the progeny of a somatic mosaic bull

Aurelien Capitan , Aurélie Allais-Bonnet , Alain Pinton , Brigitte Marquant-Le Guienne , Daniel Le Bourhis et al.

PLoS ONE, 2012, 7, online (11), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0049084⟩

Article dans une revue hal-01019835v1

New phenotypes for new breeding goals in dairy cattle

Didier Boichard , Mickael Brochard

Animal, 2012, 6 (4), pp.544-550. ⟨10.1017/S1751731112000018⟩

Article dans une revue hal-01019802v1

Design of a bovine low-density SNP array optimized for imputation

Didier Boichard , Hoyoung Chung , Romain Dassonneville , Xavier David , Andre Eggen et al.

PLoS ONE, 2012, 7, online (3), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0034130⟩

Article dans une revue hal-01019774v1

Fine mapping of copy number variations on two cattle genome assemblies using high density SNP array

Yali Hou , Derek M Bickhart , Miranda L Hvinden , Congjun Li , Jiuzhou Song et al.

BMC Genomics, 2012, 13, online (august), Non paginé. ⟨10.1186/1471-2164-13-376⟩

Article dans une revue hal-01019852v1

Association studies in QTL regions linked to bovine trypanotolerance in a West African crossbred population

G.K. Dayo , Mathieu Gautier , D. Berthier , Jean Paul Poivey , I. Sidibe et al.

Animal Genetics, 2012, 43 (2), pp.123-132. ⟨10.1111/j.1365-2052.2011.02227.x⟩

Article dans une revue istex hal-01019326v1

Inclusion of cow records in genomic evaluations and impact on bias due to preferential treatment

Romain R. Dassonneville , Aurelia A. Baur , Sebastien S. Fritz , Didier Boichard , Vincent Ducrocq

Genetics Selection Evolution, 2012, 44, online (december), Non paginé. ⟨10.1186/1297-9686-44-40⟩

Article dans une revue hal-01000386v1

Fine tuning genomic evaluations in dairy cattle through SNP pre-selection with the Elastic-Net algorithm

Pascal Croiseau , Andres Legarra , François F. Guillaume , Sébastien S. Fritz , Aurélia A. Baur et al.

Genetics Research, 2011, 93 (6), pp.409-417. ⟨10.1017/S0016672311000358⟩

Article dans une revue hal-01000269v1

Utilisation de la sélection génomique chez les bovins laitiers

Francois F. Guillaume , Didier Boichard , Vincent Ducrocq , Sébastien S. Fritz

INRA Productions Animales, 2011, 24 (4), pp.363-368

Article dans une revue hal-01000227v1

Genetics Selection Evolution: news for the period January 2009 - May 2010 and editorial announcements

Hélène Hayes , Didier Boichard

Genetics Selection Evolution, 2010, 42, online (may), Non paginé. ⟨10.1186/1297-9686-42-15⟩

Article dans une revue hal-01193680v1

Évolution des objectifs et des méthodes de sélection des bovins laitiers

Etienne Verrier , Pascale Le Mezec , Didier Boichard , Sophie Mattalia

Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2010, 163 (1), pp.73-78

Article dans une revue hal-01193376v1

Female fertility in French dairy breeds: current situation and strategies for improvement

Anne Barbat , Pascale Le Mézec , Vincent Ducrocq , Sophie Mattalia , Sébastien Fritz et al.

Journal of Reproduction and Development, 2010, 56, pp.S15-S21. ⟨10.1262/jrd.1056S15⟩

Article dans une revue hal-01193597v1

Abord des anomalies génétiques bovines

Didier Boichard , Sandrine Floriot , Carine Capel , Amandine Duchesne

International Economics, 2010, 311 (décembre), pp.66-69

Article dans une revue hal-01193633v1

La sélection des ruminants laitiers pour des numérations cellulaires faibles et les conséquences sur leur sensibilité aux mammites

Rachel Rupp , Jean-Michel Astruc , Sébastien Fritz , Anne Barbat , Didier Boichard

Bulletin des G.T.V., 2010, 54 (Juin), pp.53-60

Article dans une revue hal-01193564v1

Vingt ans de recherche et d’innovation en productions animales à l’INRA

Bernard Charley , Philippe Chemineau , Didier Boichard , Jean-Marc Meynard , Gilles Aumont et al.

Productions Animales, 2008, 21 (1), pp.11-14

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02659218v1

Correlations of marker-assisted breeding values with progeny-test breeding values for eight hundred ninety-nine French Holstein bulls

François Guillaume , Sébastien Fritz , Didier Boichard , Tom T. Druet

Journal of Dairy Science, 2008, 91 (6), pp.2520-2522. ⟨10.3168/jds.2007-0829⟩

Article dans une revue hal-02653309v1

Estimation by simulation of the efficiency of the French marker-assisted selection program in dairy cattle (Open Access publication)

François Guillaume , Sébastien Fritz , Didier Boichard , Tom Druet

Genetics Selection Evolution, 2008, 40 (1), pp.91-102

Article dans une revue hal-00894611v1

De la génétique à la génomique

Jean Pierre Bidanel , Didier Boichard , Claude C. Chevalet

Productions Animales, 2008, 21 (1), pp.15-32. ⟨10.20870/productions-animales.2008.21.1.3372⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02655255v1

Estimation by simulation of the efficiency of the French marker assisted selection program in dairy cattle

François Guillaume , Sébastien Fritz , Didier Boichard , Tom T. Druet

Genetics Selection Evolution, 2008, 40, pp.91-102

Article dans une revue hal-02655027v1

Fine mapping of quantitative trait loci affecting female fertility in dairy cattle on BTA03 using a dense single-nucleotide polymorphism map

Tom T. Druet , Sébastien Fritz , Mekki Boussaha , Slim Ben-Jemaa , François Guillaume et al.

Genetics, 2008, 178, pp.2228-2235

Article dans une revue hal-02663723v1

Comment affiner la localisation d'un QTL ?

Florence F. Ytournel , Hélène Gilbert , Didier Boichard

Productions Animales, 2008, 21 (2), pp.147-158

Article dans une revue hal-02665716v1

Functional and positional genomics in beef cattle : current programs and potential progress

Jean-François Hocquette , Didier Boichard , Isabelle Cassar-Malek , Elisabeth Laville , Gilles G. Renand et al.

Sciences des aliments = Food science : an international journal of food science and technology, 2008, 28 (4-5), pp.335-350. ⟨10.3166/sda.28.335-350⟩

Article dans une revue istex hal-02663499v1

Refinement of two female fertility QTL using alternative phenotypes in French Holstein dairy cattle

François Guillaume , Mathieu M. Gautier , Slim Ben Jemaa , Sébastien Fritz , Andre A. Eggen et al.

Animal Genetics, 2007, 38, pp.72-74

Article dans une revue hal-02659988v1

Extent of linkage disequilibrium in a large cattle population of Western Africa and consequences for association studies.

S. Thevenon , Guiguigbaza-Kossigan Dayo , S. Sylla , Issa Sidibé , Daphné Berthier et al.

Animal Genetics, 2007, 38, pp.277-286

Article dans une revue hal-02655973v1

Characterization of the K232A and VNTR polymorphisms in the DGAT1 gene in French dairy cattle.

Mathieu M. Gautier , Aurelien A. Capitan , Sébastien Fritz , Andre A. Eggen , Didier Boichard et al.

Journal of Dairy Science, 2007, 90, pp.2980

Article dans une revue hal-02654039v1

The extent of linkage disequilibrium in a large cattle population of western Africa and its consequences for association studies

S. Thevenon , G. Dayo , S. Sylla , I. Sidibe , D. Berthier et al.

Animal Genetics, 2007, 38, pp.277

Article dans une revue hal-02656325v1

Characterization of the DGAT1 K232A and variable number of tandem repeat polymorphisms in French dairy cattle.

Mathieu M. Gautier , Aurelien A. Capitan , Sebastien S. Fritz , Andre A. Eggen , Didier Boichard et al.

Journal of Dairy Science, 2007, 90, pp.2980-2988

Article dans une revue hal-02654424v1

Genetic and haplotypic structure in 14 European and African cattle breeds

Mathieu M. Gautier , Thomas Faraut , Katayoun Moazami-Goudarzi , Vincent Navratil , Mario Foglio et al.

Genetics, 2007, 177, pp.1059-1070

Article dans une revue hal-02660515v1

Estimation of genetic parameters for quantitative trait loci for dairy traits in the French Holstein population.

Tom T. Druet , Sebastien S. Fritz , Didier Boichard , J Jacques J. J. Colleau

Journal of Dairy Science, 2006, 89, pp.4070-4076

Article dans une revue hal-02653661v1

Fine mapping and physical characterization of two linked Quantitative Trait Loci affecting milk fat yield in dairy cattle on BTA26.

Mathieu M. Gautier , R. Roy Barcelona , Sebastien S. Fritz , Cécile Grohs , Tom T. Druet et al.

Genetics, 2006, 172, pp.425-436

Article dans une revue hal-02653456v1

Multiple quantitative trait loci mapping with cofactors and application of alternative variants of the false discovery rate in a enlarged granddauhgter design.

J. Bennewitz , N. Reinsch , V. Guiard , Sebastien S. Fritz , H. Thomsen et al.

Genetics, 2004, 168, pp.1019-1027

Article dans une revue hal-02673110v1

A first generation bovine BAC-based physical map

Laurent Schibler , Anne Roig , Marie-Françoise Mahé , Jean-Claude Save , Mathieu Gautier et al.

Genetics Selection Evolution, 2004, 36 (1), pp.105-122. ⟨10.1051/gse:2003054⟩

Article dans une revue hal-00894477v1

Management practices from questionnaire surveys in herds with very low somatic cell score through a national mastitis program in France

Jacques Barnouin , Michelle Chassagne , Serge Bazin , Didier Boichard

Journal of Dairy Science, 2004, 87 (11), pp.3989-3999

Article dans une revue hal-02678170v1

A first generation bovine BAC-based physical map.

Laurent L. Schibler , Anne Roig , M Francois Mahe , J.C. Save , Mathieu M. Gautier et al.

Genetics Selection Evolution, 2004, 36, pp.105-122

Article dans une revue hal-02676457v1

Un projet d'épidémiosurveillance pour les anomalies héréditaires bovines

Alain Ducos , Andre A. Eggen , Roland Darré , Didier Boichard

Bulletin des G.T.V., 2003, 18, pp.41-45

Article dans une revue hal-02679289v1

Identifier les anomalies héréditaires des bovins et comprendre leurs mécanismes de transmission

Alain Ducos , Andre A. Eggen , Roland Darré , Didier Boichard

Bulletin des G.T.V., 2003, 18, pp.31-38

Article dans une revue hal-02675432v1

L'amélioration génétique des caprins. Caractères laitiers et de morphologie

Virginie Clément , Agnès Piacere , Eduardo Manfredi , B. Lamaix , Patrice Martin et al.

Elevage et Insémination, 2003, 313, pp.3-11

Article dans une revue hal-02682937v1

Genetics of resistance to mastitis in dairy cattle

Rachel Rupp , Didier Boichard

Veterinary Research, 2003, 34, pp.671-688

Article dans une revue hal-02673095v1

Detection of genes influencing economic traits in three French dairy cattle breeds

Didier Boichard , Cécile Grohs , Florence Bourgeois , Frédérique Cerqueira , Rémi Faugeras et al.

Genetics Selection Evolution, 2003, 35 (1), pp.77-101. ⟨10.1051/gse:2002037⟩

Article dans une revue hal-00894436v1

Comment accéder aux informations sur les anomalies héréditaires bovines

Alain Ducos , Andre A. Eggen , Roland Darré , Didier Boichard

Bulletin des G.T.V., 2003, 18, pp.39-40

Article dans une revue hal-02675440v1

Modeling lactation curves and estimation of genetic parameters to first lactation test-day records of French Holstein cows

T. Druet , Florence Jaffrezic , Didier Boichard , Vincent Ducrocq

Journal of Dairy Science, 2003, 86 (7), pp.2480-2490

Article dans une revue hal-02671393v1

Combined analysis of data from two granddaughter designs: a simple strategy for QTL confirmation and increasing experimental power in dairy cattle.

J. Bennewitz , N. Reinsch , Cécile Grohs , Hubert H. Levéziel , A. Malafosse et al.

Genetics Selection Evolution, 2003, 35, pp.319-338

Article dans une revue hal-01211860v1

Genetics of resistance to mastitis in dairy cattle

Rachel Rupp , Didier Boichard

Veterinary Research, 2003, 34 (5), pp.671-688. ⟨10.1051/vetres:2003020⟩

Article dans une revue hal-00902761v1

Combined analysis of data from two granddaughter designs: A simple strategy for QTL confirmation and increasing experimental power in dairy cattle

Jörn Bennewitz , Norbert Reinsch , Cécile Grohs , Hubert Levéziel , Alain Malafosse et al.

Genetics Selection Evolution, 2003, 35 (3), pp.319-338. ⟨10.1051/gse:2003011⟩

Article dans une revue hal-00894449v1

Résultats de recherche : Priorité au traitement intramammaire

Emilie Gay , Severine Bord , Didier Boichard , Jacques Barnouin

Cahiers de l'Abstract Elevage, 2003, 3, pp.3

Article dans une revue hal-02669927v1

Use of maternal information for QTL detection in a (grand)daughter design

Marc Bolard , Didier Boichard

Genetics Selection Evolution, 2002, 34 (3), pp.335-352. ⟨10.1051/gse:2002011⟩

Article dans une revue hal-00894415v1

Use of maternal information for QTL detection in a (grand)daughter design.

M. Bolard , Didier Boichard

Genetics Selection Evolution, 2002, 34, pp.335-352

Article dans une revue hal-02673230v1

Comment améliorer la résistance génétique aux mammites chez les bovins laitiers en France par la sélection

Rachel Rupp , Didier Boichard

Bulletin des G.T.V., 2001, 12, pp.47-51

Article dans une revue hal-02675059v1

Evaluation génétique assistée par marqueurs.

Didier Boichard

Elevage et Insémination, 2001, n° 304, pp.13-22

Article dans une revue hal-02669357v1

Bilan démographique et analyse de la variabilité génétique des principales races bovines laitières françaises

Sophie Moureaux , Didier Boichard , Etienne Verrier

Elevage et Insémination, 2001, 301, pp.10-21

Article dans une revue hal-02674691v1

Implementation of an approximate multitrait BLUP evaluation to combine production traits and functional traits into a total merit index.

Vincent Ducrocq , Didier Boichard , Anne Barbat , Helene H. Larroque

Journal of Animal Science, 2001, suppl. 1, pp.25

Article dans une revue hal-02671555v1

Numérations cellulaires du lait et mammites cliniques : relations phénotypique et génétique chez les vaches Prim'Holstein

Rachel Rupp , Didier Boichard

Productions Animales, 2001, 14 (3), pp.193-200

Article dans une revue hal-02678110v1

Relationship between milk somatic-cell counts in the first lactation and clinical mastitis occurrence in the second lactation of French Holstein cows

Rachel Rupp , F. Beaudeau , Didier Boichard

Preventive Veterinary Medicine, 2000, 46, pp.99-111

Article dans une revue hal-02694093v1

La recherche de QTL à l'aide de marqueurs : résultats chez les bovins laitiers

Didier Boichard , Cécile Grohs , F. Cerqueira , Remy Faugeras , André Neau et al.

Productions Animales, 2000, HS 2000, pp.217-222

Article dans une revue hal-02685086v1

A new reciprocal translocation in a subfertile bull (chromosome abnormality, semen quality)

A. Ducos , Paul Dumont , A. Seguela , Alain Pinton , Helene Berland et al.

Genetics Selection Evolution, 2000, 32 (6), pp.589-598

Article dans une revue hal-02690352v1

Relationship of early first lactation somatic cell count with risk of subsequent first clinical mastitis

Rachel Rupp , Didier Boichard

Livestock Production Science, 2000, 62, pp.169-180

Article dans une revue hal-02696242v1

A new reciprocal translocation in a subfertile bull

Alain Ducos , Pascal Dumont , Anne Séguéla , Alain Pinton , Hélène Berland et al.

Genetics Selection Evolution, 2000, 32 (6), pp.589-598. ⟨10.1051/gse:2000139⟩

Article dans une revue hal-00894358v1

Connectedness in the French Holstein cattle population

Eric Hanocq , Didier Boichard

Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (2), pp.163-176

Article dans une revue hal-00894260v1

Alternative models for QTL detection in livestock. I. General introduction

Jean Michel J. M. Elsen , Brigitte B. Mangin , Bruno B. Goffinet , Didier Boichard , Pascale P. Le Roy

Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (3), pp.213-224

Article dans une revue hal-00490772v1

Alternative models for QTL detection in livestock. I. General introduction

J.M. Elsen , B. Mangin , B. Goffinet , D. Boichard , P. Le Roy

Genetics Selection Evolution, 1999, 31, pp.213-224

Article dans une revue hal-00199719v1

Alternative models for QTL detection in livestock. II. Likelihood approximations and sire marker genotype estimations

Brigitte B. Mangin , Bruno B. Goffinet , Pascale P. Le Roy , Didier Boichard , Jean Michel J. M. Elsen

Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (3), pp.225-237

Article dans une revue hal-02689378v1

Alternative models for QTL detection in livestock. III. Heteroskedastic model and models corresponding to several distributions of the QTL effect

Bruno B. Goffinet , Pascale P. Le Roy , Didier Boichard , Jean Michel J. M. Elsen , Brigitte B. Mangin

Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (4), pp.341-350

Article dans une revue hal-00490655v1

Alternative models for QTL detection in livestock. II. Likelihood approximations and sire marker genotype estimations

Brigitte B. Mangin , Bruno B. Goffinet , Pascale P. Le Roy , Didier Boichard , Jean Michel J. M. Elsen

Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (3), pp.225-237

Article dans une revue hal-00490171v1

Alternative models for QTL detection in livestock. II. Likelihood approximations and sire marker genotype estimations

B. Mangin , B. Goffinet , P. Le Roy , D. Boichard , J.M. Elsen

Genetics Selection Evolution, 1999, 31, pp.225-237

Article dans une revue hal-00199757v1

Alternative models for QTL detection in livestock. III. Heteroskedastic model and models corresponding to several distributions of the QTL effect

Bruno B. Goffinet , Pascale P. Le Roy , Didier Boichard , Jean Michel J. M. Elsen , Brigitte B. Mangin

Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (4), pp.341-350

Article dans une revue hal-02693457v1

Alternative models for QTL detection in livestock. II. Likelihood approximations and sire marker genotype estimations

Brigitte B. Mangin , Bruno B. Goffinet , Pascale P. Le Roy , Didier Boichard , Jean Michel J. M. Elsen

Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (3), pp.225-237

Article dans une revue hal-00489715v1

Alternative models for QTL detection in livestock. I. General introduction

Jean Michel J. M. Elsen , Brigitte B. Mangin , Bruno B. Goffinet , Didier Boichard , Pascale P. Le Roy

Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (3), pp.213-224

Article dans une revue hal-00490374v1

Alternative models for QTL detection in livestock. III. Heteroskedastic model and models corresponding to several distributions of the QTL effect

Bruno B. Goffinet , Pascale P. Le Roy , Didier Boichard , Jean Michel J. M. Elsen , Brigitte B. Mangin

Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (4), pp.341-350

Article dans une revue hal-00489773v1

Analyse de la connexion en population bovine Holstein française

Eric Hanocq , Didier Boichard

Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (2), pp.163-176

Article dans une revue hal-02697272v1

Alternative models for QTL detection in livestock. III. Heteroskedastic model and models corresponding to several distributions of the QTL effect

Bruno B. Goffinet , Pascale P. Le Roy , Didier Boichard , Jean Michel J. M. Elsen , Brigitte B. Mangin

Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (4), pp.341-350

Article dans une revue hal-00490216v1

Accounting for variance heterogeneity in French dairy cattle genetic evaluation

Christèle Robert-Granié , Bernard B. Bonaiti , Didier Boichard , Anne Barbat

Livestock Production Science, 1999, 60, pp.343-357

Article dans une revue hal-02693330v1

Alternative models for QTL detection in livestock. II. Likelihood approximations and sire marker genotype estimations

Brigitte B. Mangin , Bruno B. Goffinet , Pascale P. Le Roy , Didier Boichard , Jean Michel J. M. Elsen

Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (3), pp.225-237

Article dans une revue hal-00490616v1

Genetic parameters for clinical mastitis, somatic cell score, production, udder type traits, and milking ease in first lactation Holsteins

Rachel Rupp , Didier Boichard

Journal of Dairy Science, 1999, 82, pp.2198-2204

Article dans une revue hal-02684246v1

Alternative models for QTL detection in livestock. III. Heteroskedastic model and models corresponding to several distributions of the QTL effect

B. Goffinet , P. Le Roy , D. Boichard , J.M. Elsen , B. Mangin

Genetics Selection Evolution, 1999, 31, pp.341-350

Article dans une revue hal-00199755v1

Analyse de la connexion en population bovine Holstein française

E. Hanocq , D. Boichard

Genetics Selection Evolution, 1999, 31, pp.163-176

Article dans une revue hal-00199745v1

Alternative models for QTL detection in livestock. I. General introduction

Jean Michel J. M. Elsen , Brigitte B. Mangin , Bruno B. Goffinet , Didier Boichard , Pascale P. Le Roy

Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (3), pp.213-224

Article dans une revue hal-02691740v1

Alternative models for QTL detection in livestock. I. General introduction

J.M Elsen , B. Mangin , B. Goffinet , D. Boichard , P. Le Roy

Genetics Selection Evolution, 1999, 31, pp.213-224

Article dans une revue hal-00198289v1

Alternative models for QTL detection in livestock. I. General introduction

Jean Michel J. M. Elsen , Brigitte B. Mangin , Bruno B. Goffinet , Didier Boichard , Pascale P. Le Roy

Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (3), pp.213-224

Article dans une revue hal-00489909v1

Utilisation des marqueurs moléculaires en génétique animale

Didier Boichard , Pascale P. Le Roy , Hubert Levéziel , Jean Michel J. M. Elsen

Productions Animales, 1998, 11 (1), pp.67-80

Article dans une revue hal-02697433v1

Exclusion of bovine chromosome 20 as candidate region for spinal muscular atrophy (SMA)

Andre A. Eggen , M. Pfister-Genskow , Didier Boichard , R. Fries , M.D. Bishop

Animal Genetics, 1998, 29, 1 p

Article dans une revue hal-02692447v1

Mapping quantitative trait loci for milk production and health of dairy cattle in a large Outbred pedigree

Q. Zhang , Didier Boichard , I. Hoeschele , C. Ernst , Andre A. Eggen et al.

Genetics, 1998, 149, pp.1959-1973

Article dans une revue hal-02689501v1

The value of using probabilities of gene origin to measure genetic variability in a population

D Boichard , L Maignel , E Verrier

Genetics Selection Evolution, 1997, 29 (1), pp.5-23

Article dans une revue hal-00894153v1

Intérêt des probabilités d'origine de gène pour mesurer la variabilité génétique d'une population

Didier Boichard , L. Maignel , Etienne Verrier

Genetics Selection Evolution, 1997, 29 (1), pp.5-23

Article dans une revue hal-02696781v1

Analyse généalogique des races bovines laitières françaises

Didier Boichard , L. Maignel , Etienne Verrier

Productions Animales, 1996, 9 (5), pp.323-335

Article dans une revue hal-02698548v1

A simulation study of the effect of connectedness on genetic trend

Eric Hanocq , Didier Boichard , Jean Louis J. L. Foulley

Genetics Selection Evolution, 1996, 28 (1), pp.67-82

Article dans une revue hal-02683792v1

A simulation study of the effect of connectedness on genetic trend

E Hanocq , D Boichard , Jl Foulley

Genetics Selection Evolution, 1996, 28 (1), pp.67-82

Article dans une revue hal-00894121v1

Comparaison de 2 méthodes de précorrection des lactations courtes pour l'évaluation des reproducteurs laitiers

A Barbat , B Bonaïti , D Boichard

Annales de zootechnie, 1995, 44 (2), pp.161-172

Article dans une revue hal-00889175v1

Three methods to validate the estimation of genetic trend for dairy cattle

Didier Boichard , Bernard B. Bonaiti , Anne Barbat , Sophie Mattalia

Journal of Dairy Science, 1995, 78, pp.431-437

Article dans une revue hal-02700376v1

Analyse génétique du taux de conception en population Holstein

Didier Boichard , Eduardo Manfredi

Elevage et Insémination, 1995, 269, pp.1-11

Article dans une revue hal-02705616v1

L'anomalie BLAD chez les bovins Holstein

Didier Boichard , Yves Amigues

INRA Mensuel, 1995, 84-85, pp.3-4

Article dans une revue hal-02701936v1

Comparaison de 2 méthodes de précorrection des lactations courtes pour l'évaluation des reproducteurs laitiers

Anne Barbat , Bernard B. Bonaiti , Didier Boichard

Annales de zootechnie, 1995, 44, pp.161-172

Article dans une revue hal-02710463v1

Restricted maximum likelihood estimates of genetic parameters of adult male and female Rhode Island Red chickens divergently selected for residual feed consumption

Michèle Tixier-Boichard , Didier Boichard , Eildert Groeneveld , André A. Bordas

Poultry Science, 1995, 74, pp.1245-1252

Article dans une revue hal-02702861v1

Methodes mathematiques pour l'etude des genes controlant des caracteres quantitatifs

Bruno B. Goffinet , Jacques Beckmann , Didier Boichard , Mathilde M. Causse , Alain A. Charcosset et al.

Genetics Selection Evolution, 1994, 26 (suppl. 1), pp.9s-20s

Article dans une revue hal-02712662v1

Genetic analysis of conception rate in french Holstein cattle

Didier Boichard , Eduardo Manfredi

Acta Agriculturae Scandinavica, Section A - Animal Science, 1994, 44, pp.138-145

Article dans une revue hal-02714612v1

Méthodes mathématiques pour l'étude des gènes contrôlant des caractères quantitatifs

B Goffinet , J Beckmann , D Boichard , M Causse , A Charcosset et al.

Genetics Selection Evolution, 1994, 26 (Suppl1), pp.9s-20s

Article dans une revue hal-00894051v1

Effet du croisement Holstein sur les caractères laitiers en population Pie Noir

D. Boichard , B. Bonaïti , Anne Barbat

Productions Animales, 1993, 6 (1), pp.25-30

Article dans une revue hal-00896039v1

Effect of Holstein crossbreeding in the french black and white cattle population

Didier Boichard , Bernard B. Bonaiti , Anne Barbat

Journal of Dairy Science, 1993, 76 (4), pp.1157-1162

Article dans une revue hal-02700307v1

Effet du croisement Holstein sur les caractères laitiers en population Pie Noir

Didier Boichard , Bernard B. Bonaiti , Anne Barbat

Productions Animales, 1993, 6 (1), pp.25-30

Article dans une revue hal-02713979v1

Problems arising with genetic trend estimation in dairy cattle

Bernard B. Bonaiti , Didier Boichard , Anne Barbat , Sophie Mattalia

Bulletin - International Bull Evaluation Service, 1993, 8, 8 p

Article dans une revue hal-02700050v1

Multivariate restricted maximum likelihood estimation of genetic parameters for growth, carcass and meat quality traits in French Large White and French Landrace pigs

Alain Ducos , Jean Pierre Bidanel , Vincent Ducrocq , Didier Boichard , Eildert Groeneveld

Genetics Selection Evolution, 1993, 25 (5), pp.475-493. ⟨10.1051/gse:19930506⟩

Article dans une revue hal-02700795v1

Multivariate restricted maximum likelihood estimation of genetic parameters for growth, carcass and meat quality traits in French Large White and French Landrace pigs

A Ducos , Jean Pierre Bidanel , Vincent Ducrocq , D Boichard , E Groeneveld

Genetics Selection Evolution, 1993, 25 (5), pp.475-493

Article dans une revue hal-00894010v1

Sélection assistée par marqueurs

C. Chevalet , D. Boichard

Productions Animales, 1992, hs (hs), pp.291-294

Article dans une revue hal-00896034v1

A criterion for measuring the degree of connectedness in linear models of genetic evaluation

Jl Foulley , E Hanocq , D Boichard

Genetics Selection Evolution, 1992, 24 (4), pp.315-330

Article dans une revue hal-00893960v1

Approximate restricted maximum likelihood and approximate prediction error variance of the Mendelian sampling effect

D Boichard , Lr Schaeffer , Aj Lee

Genetics Selection Evolution, 1992, 24 (4), pp.331-343

Article dans une revue hal-00893961v1

Utilisation des marqueurs pour localiser les gènes responsables de la variabilité des caractères quantitatifs (QTL)

C. Chevalet , D. Boichard

Productions Animales, 1992, hs (hs), pp.287-290

Article dans une revue hal-00896033v1

L'évaluation des reproducteurs. Le modèle sous-jacent à l'estimation des valeurs génétiques

Didier Boichard , Bernard B. Bonaiti , Anne Barbat , Michèle Briend

Productions Animales, 1992, 1992, pp.185-195

Article dans une revue hal-02713922v1

Apports actuels et futurs des marqueurs génétiques dans l’amélioration des populations animales. Utilisation de marqueurs pour localiser les gènes responsables de la variabilité des caractères quantitatifs

Claude Chevalet , Didier Boichard

Productions Animales, 1992, 1992, pp.287-290

Article dans une revue hal-02702146v1

Approximate accuracy of genetic evaluation under a single-trait animal model

Didier Boichard , A.J. Lee

Journal of Dairy Science, 1992, 75 (3), pp.868-877

Article dans une revue hal-02708078v1

A criterion for measuring the degree of connectedness in linear models of genetic evaluation

Jean Louis J. L. Foulley , Eric Hanocq , Didier Boichard

Genetics Selection Evolution, 1992, 24 (4), pp.315-330

Article dans une revue hal-02712848v1

Apports actuels et futurs des marqueurs génétiques dans l’amélioration des populations animales. Sélection assistée par marqueurs

Claude Chevalet , Didier Boichard

Productions Animales, 1992, 1992, pp.291-294

Article dans une revue hal-02701758v1

Le modèle sous-jacent à l'évaluation des valeurs génétiques

D. Boichard , B. Bonaïti , Anne Barbat , Michèle Briend

Productions Animales, 1992, hs (hs), pp.185-195

Article dans une revue hal-00896015v1

Use of an animal model for genetic evaluation of the Lacaune dairy sheep

Francis F. Barillet , Didier Boichard , Anne Barbat , J.M. Astruc , Bernard B. Bonaiti

Livestock Production Science, 1992, 31, pp.287-299

Article dans une revue hal-02700845v1

Genetics of growth, feed intake, and milk yield in Holstein cattle

A.J. Lee , D.A. Boichard , A.J. Mcallister , C.Y. Lin , K. Nadarajah et al.

Journal of Dairy Science, 1992, 75, pp.3145-3154

Article dans une revue hal-02707412v1

Approximate restricted maximum likelihood and approximate prediction error variance of the Mendelian sampling effect

Didier Boichard , L.R. Schaeffer , A.J. Lee

Genetics Selection Evolution, 1992, 24 (4), pp.331-343

Article dans une revue hal-02712132v1

Apres IF2 : une nouvelle methode pour evaluer la genetique des caprins laitiers

Didier Boichard , Eduardo Manfredi , Agnès Piacere , J.P. Sigwald , Bernard B. Bonaiti

La chèvre, 1992, 192, pp.16-19

Article dans une revue hal-02715173v1

Classification of lactation curves in goat

N. Bouloc , Didier Boichard

Journal of Dairy Science, 1991, 74, pp.230

Article dans une revue hal-02706388v1

Etude des possibilites d'allegement du controle laitier officiel chez les caprins

N. Bouloc , Francis F. Barillet , Didier Boichard , J.P. Sigwald , G. Bridoux

Annales de zootechnie, 1991, 40, pp.125-139

Article dans une revue hal-02713772v1

Approximate prediction error variance of breeding values under an animal model

Didier Boichard , A.J. Lee

Journal of Animal Science, 1991, 69, pp.188

Article dans une revue hal-02701193v1

Étude des possibilités d'allègement du contrôle laitier officiel chez les caprins

N Bouloc , F Barillet , D Boichard , Jp Sigwald , G Bridoux

Annales de zootechnie, 1991, 40 (2), pp.125-139

Article dans une revue hal-00888741v1

Approximate error variance of the mendelian sampling effect

Didier Boichard , L.R. Schaeffer , A.J. Lee

Journal of Dairy Science, 1991, 74, pp.160

Article dans une revue hal-02702526v1

A pseudo absorption strategy for solving animal model equations for large data files

Vincent Ducrocq , Didier Boichard , Bernard B. Bonaiti , Anne Barbat , Marie-Madeleine Briend

Journal of Dairy Science, 1990, 73, pp.1945-1955

Article dans une revue hal-02711251v1

Estimation of the economic value of conception rate in dairy cattle

Didier Boichard

Livestock Production Science, 1990, 24, pp.187-204

Article dans une revue hal-02700811v1

La méthode française d'évaluation génétique des reproducteurs laitiers

B. Bonaiti , D. Boichard , E. Verrier , Vincent Ducrocq , A. Barbat et al.

Productions Animales, 1990, 3 (2), pp.83-92

Article dans une revue hal-00895891v1

La méthode française d'évaluation génétique des reproducteurs laitiers

Bernard B. Bonaiti , Didier Boichard , E. Verrier , Vincent Ducrocq , Anne Barbat et al.

Productions Animales, 1990, 3 (2), pp.83-92

Article dans une revue hal-02701222v1

Paramètres génétiques des caractères de production laitière en première lactation dans les races caprines Alpine et Saanen.

Didier Boichard , N. Bouloc , G. Ricordeau , Agnès Piacere , Francis F. Barillet

Genetics Selection Evolution, 1989, 21 (2), pp.205-215

Article dans une revue hal-02726674v1

Genetic parameters for first lactation dairy traits in the Alpine and Saanen goat breeds

D. Boichard , N. Bouloc , G. Ricordeau , A. Piacere , F. Barillet

Genetics Selection Evolution, 1989, 21 (2), pp.205-215

Article dans une revue hal-00893797v1

Impact économique d'une mauvaise fertilité chez la vache laitière

D. Boichard

Productions Animales, 1988, 1 (4), pp.245-252

Article dans une revue hal-00895838v1

Impact économique d'une mauvaise fertilité chez la vache laitière

Didier Boichard

Productions Animales, 1988, 1 (4), pp.245-252

Article dans une revue hal-02719181v1

Studies on dairy production of milking ewes I. - Estimates of genetic parameters for total milk composition and yield

Francis F. Barillet , Didier Boichard

Genetics Selection Evolution, 1987, 19 (4), pp.459-474

Article dans une revue hal-00490307v1

Studies on dairy production of milking ewes I. - Estimates of genetic parameters for total milk composition and yield

Francis F. Barillet , Didier Boichard

Genetics Selection Evolution, 1987, 19 (4), pp.459-474

Article dans une revue hal-00487467v1

Etude des facteurs de variation des parametres de croissance des agneaux de race barbarine

Gley Khaldi , Didier Boichard , L. Tchamitchian , . Inra

Annales de l'Institut National de la Recherche Agronomique de Tunisie, 1987, 60 (5), pp.5-18

Article dans une revue hal-02720645v1

Studies on dairy production of milking ewes I. - Estimates of genetic parameters for total milk composition and yield

Francis F. Barillet , Didier Boichard

Genetics Selection Evolution, 1987, 19 (4), pp.459-474

Article dans une revue hal-00489871v1

Genetic parameters for first lactation dairy traits in Friesian, Montbéliarde and Normande breeds

Didier Boichard , Bernard B. Bonaiti

Genetics Selection Evolution, 1987, 19 (3), pp.337-350

Article dans une revue hal-00490574v1

Studies on dairy production of milking ewes I. - Estimates of genetic parameters for total milk composition and yield

Francis F. Barillet , Didier Boichard

Genetics Selection Evolution, 1987, 19 (4), pp.459-474

Article dans une revue hal-02718045v1

Studies on dairy production of milking ewes I. - Estimates of genetic parameters for total milk composition and yield

Francis F. Barillet , Didier Boichard

Genetics Selection Evolution, 1987, 19 (4), pp.459-474

Article dans une revue hal-00487150v1

Studies on dairy production of milking ewes I. - Estimates of genetic parameters for total milk composition and yield

Francis F. Barillet , Didier Boichard

Genetics Selection Evolution, 1987, 19 (4), pp.459-474

Article dans une revue hal-00490732v1

Studies on dairy production of milking ewes I. - Estimates of genetic parameters for total milk composition and yield

F. Barillet , D. Boichard

Génétique sélection évolution, 1987, 19 (4), pp.459-474

Article dans une revue hal-00893737v1

Paramètres génétiques des caractères de production laitière en première lactation dans les races bovines Frisonne, Montbéliarde et Normande

Didier Boichard , Bernard B. Bonaiti

Genetics Selection Evolution, 1987, 19 (3), pp.337-350

Article dans une revue hal-02720500v1

Genetic parameters for first lactation dairy traits in Friesian, Montbéliarde and Normande breeds

D. Boichard , B. Bonaïti

Génétique sélection évolution, 1987, 19 (3), pp.337-350

Article dans une revue hal-00893728v1

Relation entre production et fertilité chez la vache laitière.

Didier Boichard

Elevage et Insémination, 1986, 213, pp.15-23

Article dans une revue hal-02725667v1

Amélioration génétique de la composition du lait des brebis, des chèvres et des vaches

Francis F. Barillet , Bernard B. Bonaiti , Didier Boichard

Lait, 1986

Article dans une revue hal-02717193v1

Le domaine Expérimental de Bourges - 40 ans de Recherche

Dominique Francois , Didier Boichard , Bernard B. Bibé , Claude Lefevre , Jean-Pierre Hamonou et al.

INRA Mensuel : les Dossiers, 119, 36 p., 2004

N°spécial de revue/special issue hal-03338354v1

Génétique des animaux d'élevage

Gisèle Alexandre , Jean Pierre Bidanel , Didier Boichard , Coralie Danchin-Burge , Alain Ducos et al.

Etienne Verrier; Denis Milan; Claire Rogel-Gaillard. Quae, pp.288, 2020, Savoir faire, 978-2-7592-3099-0

Ouvrages hal-04751553v1

Relationship between milk somatic cell counts in the first lactation and clinical mastitis occurrence in the second lactation of French Holstein cows

Rachel Rupp , F. Beaudeau , Henri H. Seegers , Didier Boichard

4 p., 2000

Ouvrages hal-02840164v1

Approximate multitrait BLUP evaluation to combine functional traits information

J Jacques J. J. Colleau , Vincent Ducrocq , Didier Boichard , Helene H. Larroque

7 p., 1999

Ouvrages hal-02839886v1

Prise en compte des hétérogénéités de variance dans l'évaluation génétique bovine laitière française

Didier Boichard , Christèle Robert-Granié , Anne Barbat , Bernard B. Bonaiti , . Institut de L'Elevage

INRA Editions, 15 p., 1999

Ouvrages hal-02835321v1

Génétique de la reproduction et des qualités maternelles chez les ruminants

Loys L. Bodin , Jean Michel J. M. Elsen , Eric Hanocq , Dominique Francois , Daniel Lajous et al.

20 p., 1998

Ouvrages hal-02841823v1

Logiciel d'analyse de généalogies adapté à de grandes populations

Didier Boichard

12 p., 1997

Ouvrages hal-02834589v1

Programme DF-REML : description et notice d'utilisation

Didier Boichard

16 p., 1994

Ouvrages hal-02844350v1

Projet Le Pin 5 : detection de genes majeurs pour la qualite du lait a l'aide de marqueurs moleculaires

J Jacques J. J. Colleau , Didier Boichard

8 p., 1993

Ouvrages hal-02846300v1

Advances in understanding, detection and management of genetic defects in dairy cattle

Didier Boichard , Aurélien Capitan

DB Berry. Optimising breeding of dairy cows: Leveraging genetics for more sustainable production, Burleigh Dodds Science Publishing Limited, 2026, Burleigh Dodds Series in Agricultural Science, 9781835455265. ⟨10.19103/AS.2026.0173.12⟩

Chapitre d'ouvrage hal-05659524v1

Nouvelles modalités de diffusion de la génétique (chapitre 12)

D Boichard

Claire Rogel-Gaillard, Denis Milan et Etienne Verrier. Génétique des animaux d'élevage. Diversité et adaptation dans un monde changeant, Edition Quae, 2020

Chapitre d'ouvrage hal-03155463v1

Development of dairy breeding programmes

Didier Boichard

Advances in breeding of dairy cattle, 72, Burleigh Dodds Science Publishing, 2019, Burleigh Dodds Series in Agricultural Science, 978 1 78676 296 2 PDF: 978-1-78676-299-3 ePub: 978-1-78676-298-6. ⟨10.19103/AS.2019.0058.28⟩

Chapitre d'ouvrage hal-02788520v1

Quel futur pour l’amélioration génétique chez les espèces animales domestiques ?

Didier Boichard , Pascal Croiseau , Sebastien Fritz , Vincent Ducrocq

Potentiels de la science pour l’avenir de l’agriculture, de l’alimentation et de l’environnement, Académie d'Agriculture, 2014

Chapitre d'ouvrage hal-01193805v1

La révolution génomique animale : La sélection chez les animaux d’élevage - Partie 1. Du phénotype au polymorphisme

Didier Boichard , Christel Marie-Etancelin , Mickaël Brochard , François Guillaume , Sophie Mattalia et al.

La révolution génomique animale : La sélection chez les animaux d’élevage, France Agricole, 2011, 978-2-85557-181-2

Chapitre d'ouvrage hal-01193669v1

La détection des QTL chez les bovins laitiers, premiers résultats de l'expérience réalisée sur le domaine expérimental animal du Pin-au-Haras.

Helene H. Larroque , Yves Y. Gallard , Didier Boichard , J Jacques J. J. Colleau

Brochure Technique Prairiales Normandie, Le Pin, 2004, Inconnu

Chapitre d'ouvrage hal-02828982v1

La sélection génomique chez la vache laitière

Didier Boichard

2023

Article de blog scientifique hal-04162876v1

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