Didier Boichard

287
Documents

Publications

Publications

Image document

Functional impact of splicing variants in the elaboration of complex traits in cattle

Mathieu Charles , Nicolas Gaiani , Marie-Pierre Sanchez , Mekki Boussaha , Chris Hozé et al.
Nature Communications, 2025, 16 (1), pp.3893. ⟨10.1038/s41467-025-58970-5⟩
Article dans une revue hal-05050421 v1
Image document

A bovine model of rhizomelic chondrodysplasia punctata caused by a deep intronic splicing variant in the GNPAT gene

Arnaud Boulling , Julien Corbeau , Cécile Grohs , Anne Barbat , Jérémy Mortier et al.
Genetics Selection Evolution, 2025, 57 (1), pp.23. ⟨10.1186/s12711-025-00969-z⟩
Article dans une revue hal-05075769 v1
Image document

Erosion of estimated genomic breeding values with generations is due to long distance associations between markers and QTL

Didier Boichard , Sébastien Fritz , Pascal Croiseau , Vincent Ducrocq , Thierry Tribout et al.
Genetics Selection Evolution, 2025, 57 (1), pp.14. ⟨10.1186/s12711-025-00963-5⟩
Article dans une revue hal-05000911 v1
Image document

Sequence-based GWAS reveals genes and variants associated with predicted methane emissions in French dairy cows

Solène Fresco , Marie-Pierre Sanchez , Didier Boichard , Sébastien Fritz , Pauline Martin
Genetics Selection Evolution, 2025, 57 (1), pp.32. ⟨10.1186/s12711-025-00977-z⟩
Article dans une revue hal-05120211 v1
Image document

Short communication: Correlation of methane production, intensity, and yield with residual feed intake throughout lactation in Holstein cows

Solène Fresco , Didier Boichard , Rachel Lefebvre , Sarah Barbey , M. Gaborit et al.
Animal, 2024, 18 (3), pp.101110. ⟨10.1016/j.animal.2024.101110⟩
Article dans une revue hal-04623769 v1

Genetic parameters, GWAS and selection perspective on gestation length in 16 French cattle breeds

Jeanlin Jourdain , Aurélien Capitan , Romain Saintilan , Chris Hozé , Corentin Fouéré et al.
Journal of Dairy Science, 2024, ⟨10.3168/jds.2024-24736⟩
Article dans une revue hal-04722582 v1
Image document

Genetic parameters for methane production, intensity, and yield predicted from milk mid-infrared spectra throughout lactation in Holstein dairy cows

S. Fresco , D. Boichard , S. Fritz , P. Martin
Journal of Dairy Science, 2024, 107 (12), pp.11311-11323. ⟨10.3168/jds.2024-25231⟩
Article dans une revue hal-04885713 v1
Image document

Quelles génétiques pour les systèmes d’élevages certifiés en agriculture biologique ?

Laurianne Canario , Nicolas Bédère , Marc Vandeputte , Didier Boichard , Jérôme Raoul et al.
INRAE Productions Animales, 2024, 37 (2), pp.8177. ⟨10.20870/productions-animales.2024.37.2.8177⟩
Article dans une revue hal-04703177 v1
Image document

Investigating the impact of paternal age, paternal heat stress, and estimation of non-genetic paternal variance on dairy cow phenotype

Corentin Fouéré , Chris Hozé , Florian Besnard , Mekki Boussaha , Didier Boichard et al.
Genetics Selection Evolution, 2024, 56 (1), pp.46. ⟨10.1186/s12711-024-00918-2⟩
Article dans une revue hal-04621354 v1
Image document

Expected values for the accuracy of predicted breeding values accounting for genetic differences between reference and target populations

Beatriz C. D. Cuyabano , Didier Boichard , Cedric Gondro
Genetics Selection Evolution, 2024, 56 (1), pp.15. ⟨10.1186/s12711-024-00876-9⟩
Article dans une revue hal-04487620 v1
Image document

Utilisation de la semence sexée en production bovine

Didier Boichard , Sandra Dominique , Marie Bérodier , Sébastien Fritz , Luc Delaby et al.
INRAE Productions Animales, 2024, 37 (4), pp.8320. ⟨10.20870/productions-animales.2024.37.4.8320⟩
Article dans une revue hal-04850550 v1
Image document

Massive detection of cryptic recessive genetic defects in dairy cattle mining millions of life histories

Florian Besnard , Ana Guintard , Cécile Grohs , Laurence Guzylack-Piriou , Margarita Cano et al.
Genome Biology, 2024, 25 (1), pp.248. ⟨10.1186/s13059-024-03384-7⟩
Article dans une revue hal-04714371 v1
Image document

Genetic parameters, genome-wide association study, and selection perspective on gestation length in 16 French cattle breeds

Jeanlin Jourdain , Aurélien Capitan , Romain Saintilan , Chris Hozé , Corentin Fouéré et al.
Journal of Dairy Science, 2024, 107 (10), pp.8157-8169. ⟨10.3168/jds.2023-24632⟩
Article dans une revue hal-04842563 v1
Image document

Long-lasting effects of in utero heat stress on subsequent performances of heifers and primiparous cows

A. Vinet , C. Fouéré , B.C.D. Cuyabano , S. Mattalia , R. Vallée et al.
Journal of Dairy Science, 2024, 107 (12), pp.11065-11077. ⟨10.3168/jds.2024-25168⟩
Article dans une revue hal-04885784 v1
Image document

Combining short-term breath measurements to develop methane prediction equations from cow milk mid-infrared spectra

Solène Fresco , A. Vanlierde , Didier Boichard , Rachel Lefebvre , M. Gaborit et al.
Animal, 2024, 18 (7), pp.101200. ⟨10.1016/j.animal.2024.101200⟩
Article dans une revue hal-04623789 v1
Image document

A recurrent de novo missense mutation in COL1A1 causes osteogenesis imperfecta type II and preterm delivery in Normande cattle

Julien Corbeau , Cécile Grohs , Jeanlin Jourdain , Mekki Boussaha , Florian Besnard et al.
Genetics Selection Evolution, 2024, 56 (1), pp.39. ⟨10.1186/s12711-024-00909-3⟩
Article dans une revue hal-04581779 v1
Image document

Effect of temperature-humidity index on the evolution of trade-offs between fertility and production in dairy cattle

Aurélie Vinet , Sophie Mattalia , Roxane Vallée , Christine Bertrand , Anne Barbat et al.
Genetics Selection Evolution, 2024, 56 (1), pp.23. ⟨10.1186/s12711-024-00889-4⟩
Article dans une revue hal-04531071 v1
Image document

A large population study to assess the magnitude of prenatal programming in dairy cattle

C Fouéré , M P Sanchez , M Boussaha , S Fritz , A Vinet et al.
Journal of Dairy Science, 2024, 107, pp.5913-5923. ⟨10.3168/jds.2023-24051⟩
Article dans une revue hal-04569709 v2
Image document

Meta-analysis of six dairy cattle breeds reveals biologically relevant candidate genes for mastitis resistance

Zexi Cai , Terhi Iso-Touru , Marie-Pierre Sanchez , Naveen Kadri , Aniek C Bouwman et al.
Genetics Selection Evolution, 2024, 56 (1), pp.54. ⟨10.1186/s12711-024-00920-8⟩
Article dans une revue hal-04648082 v1
Image document

Genetic relationships between weight loss in early lactation and daily milk production throughout the lactation in Holstein cows

T. Tribout , S. Minéry , R. Vallée , S. Saille , D. Saunier et al.
Journal of Dairy Science, 2023, 106, pp.4799-4812. ⟨10.3168/jds.2022-22813⟩
Article dans une revue hal-04092080 v1
Image document

X-linked genes influence various complex traits in dairy cattle

Marie-Pierre Sanchez , Clémentine Escouflaire , Aurélia Baur , Fiona Bottin , Chris Hozé et al.
BMC Genomics, 2023, 24 (1), pp.338. ⟨10.1186/s12864-023-09438-7⟩
Article dans une revue hal-04135678 v1
Image document

Comparison of methane production, intensity, and yield throughout lactation in Holstein cows

S Fresco , D Boichard , S Fritz , R Lefebvre , S Barbey et al.
Journal of Dairy Science, 2023, 106 (6), pp.4147-4157. ⟨10.3168/jds.2022-22855⟩
Article dans une revue hal-04083019 v1
Image document

The Bovine Pangenome Consortium: democratizing production and accessibility of genome assemblies for global cattle breeds and other bovine species

Timothy P L Smith , Derek M Bickhart , Didier Boichard , Amanda J Chamberlain , Appolinaire Djikeng et al.
Genome Biology, 2023, 24 (1), pp.139. ⟨10.1186/s13059-023-02975-0⟩
Article dans une revue hal-04136901 v1
Image document

Large-scale detection and characterization of interchromosomal rearrangements in normozoospermic bulls using massive genotype and phenotype data sets

Jeanlin Jourdain , Harmonie Barasc , Thomas Faraut , Anne Calgaro , Nathalie Bonnet et al.
Genome Research, 2023, 33 (6), pp.957-971. ⟨10.1101/gr.277787.123⟩
Article dans une revue hal-04170739 v1
Image document

Association between body condition genomic values and feed intake, milk production, and body weight in French Holstein cows

Rachel Lefebvre , Philippe Faverdin , S. Barbey , J. Jurquet , Thierry Tribout et al.
Journal of Dairy Science, 2023, 106 (1), pp.381-391. ⟨10.3168/jds.2022-22194⟩
Article dans une revue hal-03876258 v1
Image document

Detailed analysis of mortality rates in the female progeny of 1,001 Holstein bulls allows the discovery of new dominant genetic defects

Florian Besnard , H Leclerc , Mekki Boussaha , Cécile Grohs , N Jewell et al.
Journal of Dairy Science, 2023, 106 (1), pp.439-451. ⟨10.3168/jds.2022-22365⟩
Article dans une revue hal-03844760 v1
Image document

Estimation of genotype by temperature-humidity index interactions on milk production and udder health traits in Montbeliarde cows

Aurélie Vinet , Sophie Mattalia , Roxane Vallée , Christine Bertrand , Beatriz Cuyabano et al.
Genetics Selection Evolution, 2023, 55 (1), pp.4. ⟨10.1186/s12711-023-00779-1⟩
Article dans une revue hal-03950525 v1
Image document

Sequence-based GWAS meta-analyses for beef production traits

Marie-Pierre Sanchez , Thierry Tribout , Naveen Kadri , Praveen Chitneedi , Steffen Maak et al.
Genetics Selection Evolution, 2023, 55 (1), pp.70. ⟨10.1186/s12711-023-00848-5⟩
Article dans une revue hal-04248281 v1
Image document

Integrin alpha 6 homozygous splice-site mutation causes a new form of junctional epidermolysis bullosa in Charolais cattle

Mekki Boussaha , Arnaud Boulling , Valérie Wolgust , Lorraine Bourgeois-Brunel , Pauline Michot et al.
Genetics Selection Evolution, 2023, 55 (1), pp.40. ⟨10.1186/s12711-023-00814-1⟩
Article dans une revue hal-04125597 v1
Image document

Invited review: Good practices in genome-wide association studies to identify candidate sequence variants in dairy cattle

Goutam Sahana , Z. Cai , M.P. Sanchez , A.C. Bouwman , D. Boichard
Journal of Dairy Science, 2023, 106, ⟨10.3168/jds.2022-22694⟩
Article dans une revue hal-04135625 v1
Image document

A Bos taurus sequencing methods benchmark for assembly, haplotyping, and variant calling

Camille Eché , Carole Iampietro , Clément Birbes , Andreea Dréau , Claire Kuchly et al.
Scientific Data , 2023, 10 (1), pp.369. ⟨10.1038/s41597-023-02249-1⟩
Article dans une revue (data paper) hal-04122201 v1
Image document

Mutation of the MYH3 gene causes recessive cleft palate in Limousine cattle

Anne Vaiman , Sébastien Fritz , Christian Beauvallet , Mekki Boussaha , Cécile Grohs et al.
Genetics Selection Evolution, 2022, 54 (1), pp.71. ⟨10.1186/s12711-022-00762-2⟩
Article dans une revue hal-03839198 v1
Image document

New insights into the genetic resistance to paratuberculosis in Holstein cattle via single-step genomic evaluation

Marie-Pierre Sanchez , Thierry Tribout , Sébastien Fritz , Raphaël Guatteo , Arnaud Delafosse et al.
Genetics Selection Evolution, 2022, 54 (1), pp.67. ⟨10.1186/s12711-022-00757-z⟩
Article dans une revue hal-03816238 v1

Genome-wide association study with imputed whole-genome sequence variants including large deletions for female fertility in 3 Nordic dairy cattle breeds

Md Mesbah-Uddin , Bernt Guldbrandtsen , Aurélien Capitan , Mogens Sandø Lund , Didier Boichard et al.
Journal of Dairy Science, 2022, 105 (2), pp.1298-1313. ⟨10.3168/jds.2021-20655⟩
Article dans une revue hal-03533717 v1
Image document

Standardized Whole Blood Assay and Bead-Based Cytokine Profiling Reveal Commonalities and Diversity of the Response to Bacteria and TLR Ligands in Cattle

Jérémy Lesueur , Sarah Walachowski , S. Barbey , Nathan Cebron , Rachel Lefebvre et al.
Frontiers in Immunology, 2022, 13, pp.871780. ⟨10.3389/fimmu.2022.871780⟩
Article dans une revue hal-03704013 v1
Image document

Opportunities for genomic selection of cheese-making traits in Montbéliarde cows

M.P. Sanchez , T. Tribout , S. Fritz , V. Wolf , C. Laithier et al.
Journal of Dairy Science, 2022, ⟨10.3168/jds.2021-21558⟩
Article dans une revue hal-03655719 v1
Image document

Predicting male fertility from the sperm methylome: application to 120 bulls with hundreds of artificial insemination records

Valentin Costes , Aurélie Chaulot-Talmon , Eli Sellem , Jean-Philippe Perrier , Anne Aubert-Frambourg et al.
Clinical Epigenetics, 2022, 14 (1), pp.54. ⟨10.1186/s13148-022-01275-x⟩
Article dans une revue hal-03654993 v1

Exploring simultaneous perturbation profiles in milk yield and body weight reveals a diversity of animal responses and new opportunities to identify resilience proxies

Ahmed Ben Abdelkrim , Thierry Tribout , Olivier Martin , D. Boichard , Vincent Ducrocq et al.
Journal of Dairy Science, 2021, 104 (1), pp.459-470. ⟨10.3168/jds.2020-18537⟩
Article dans une revue hal-03093297 v1

A missense mutation in the FZD7 gene is associated with dilution of the red areas of the coat in Montbéliarde cattle

S. Floriot , A. Duchesne , C. Grohs , C. Hozé , M.C. Deloche et al.
Animal Genetics, 2021, 52 (3), pp.351-355. ⟨10.1111/age.13055⟩
Article dans une revue hal-04478130 v1
Image document

Influence of production, reproduction, morphology, and health traits on true and functional longevity in French Holstein cows

Roberta Rostellato , J. Promp , H. Leclerc , S. Mattalia , Nicolas N.C. Friggens et al.
Journal of Dairy Science, 2021, 104 (12), pp.12664-12678. ⟨10.3168/jds.2020-19974⟩
Article dans une revue hal-03528049 v1
Image document

In silico identification of variations in microRNAs with a potential impact on dairy traits using whole ruminant genome SNP datasets

Céline Bourdon , Mekki Boussaha , Philippe Bardou , Marie-Pierre Sanchez , Sandrine Le Guillou et al.
Scientific Reports, 2021, 11, ⟨10.1038/s41598-021-98639-9⟩
Article dans une revue hal-03371440 v1

Improved dairy cattle mating plans at herd level using genomic information

M. Bérodier , P. Berg , T. Meuwissen , D. Boichard , M. Brochard et al.
Animal, 2021, 15 (1), pp.100016. ⟨10.1016/j.animal.2020.100016⟩
Article dans une revue hal-03093304 v1

Genome-wide association study for age at puberty and resumption of cyclicity in a crossbred dairy cattle population

Rachel Lefebvre , Helene Larroque , S. Barbey , Y. Gallard , J.J. J Colleau et al.
Journal of Dairy Science, 2021, 104 (5), pp.5794 - 5804. ⟨10.3168/jds.2020-18228⟩
Article dans une revue hal-03204539 v1
Image document

Sequence-based GWAS and post-GWAS analyses reveal a key role of SLC37A1, ANKH, and regulatory regions on bovine milk mineral content

Marie-Pierre Sanchez , Dominique Rocha , Mathieu Charles , Mekki Boussaha , Chris Hozé et al.
Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-87078-1⟩
Article dans une revue hal-03191450 v1
Image document

imputation for sequencing variants preselected to a customized low-density chip

Aoxing Liu , Mogens Sandø Lund , Didier Boichard , Xiaowei Mao , Emre Karaman et al.
Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.9524. ⟨10.1038/s41598-020-66523-7⟩
Article dans une revue hal-02969666 v1
Image document

Weighted single-step genomic best linear unbiased prediction integrating variants selected from sequencing data by association and bioinformatics analyses

Aoxing Liu , Mogens Sandø Lund , Didier Boichard , Emre Karaman , Bernt Guldbrandtsen et al.
Genetics Selection Evolution, 2020, 52 (1), pp.48. ⟨10.1186/s12711-020-00568-0⟩
Article dans une revue hal-02969616 v1
Image document

Identification of the ABCC4, IER3, and CBFA2T2 candidate genes for resistance to paratuberculosis from sequence-based GWAS in Holstein and Normande dairy cattle

Marie-Pierre Sanchez , Raphaël Guatteo , Aurore Davergne , Judikael Saout , Cécile Grohs et al.
Genetics Selection Evolution, 2020, 52 (1), pp.14. ⟨10.1186/s12711-020-00535-9⟩
Article dans une revue hal-02514814 v1
Image document

Improvement of genomic prediction by integrating additional single nucleotide polymorphisms selected from imputed whole genome sequencing data.

Aoxing Liu , Mogens Sandø Lund , Didier Boichard , Emre Karaman , Sebastien Fritz et al.
Heredity, 2020, 124 (1), pp.37-49. ⟨10.1038/s41437-019-0246-7⟩
Article dans une revue hal-02627427 v1
Image document

FROM’MIR : Développer des outils de prédiction et de conseil pour maîtriser la fromageabilité des laits destinés à la fabrication des fromages traditionnels franc-comtois

Cécile Laithier , Valerie Wolf , Mickael Brochard , Marie-Pierre Sanchez , Nicolas Gaudilliere et al.
Innovations Agronomiques, 2020, 79, pp.227-244. ⟨10.15454/q8rx-az02⟩
Article dans une revue hal-02457192 v1

Frequencies of milk protein variants and haplotypes estimated from genotypes of more than 1 million bulls and cows of 12 French cattle breeds

Marie-Pierre Sanchez , S. Fritz , C. Patry , A. Delacroix-Buchet , D. Boichard
Journal of Dairy Science, 2020, 103 (10), pp.9124-9141. ⟨10.3168/jds.2020-18492⟩
Article dans une revue hal-02969677 v1

Genetic architecture of individual variation in recombination rate on the X chromosome in cattle

Junjie Zhang , Naveen Kumar Kadri , Erik Mullaart , Richard Spelman , Sébastien Fritz et al.
Heredity, 2020, 125 (5), pp.304-316. ⟨10.1038/s41437-020-0341-9⟩
Article dans une revue hal-03155457 v1
Image document

Confirmed effects of candidate variants for milk production, udder health, and udder morphology in dairy cattle

Thierry Tribout , Pascal Croiseau , Rachel Lefebvre , Anne Barbat , Mekki Boussaha et al.
Genetics Selection Evolution, 2020, 52 (1), ⟨10.1186/s12711-020-00575-1⟩
Article dans une revue hal-03155461 v1

Short communication: a splice site mutation in CENPU is associated with recessive embryonic lethality in Holstein cattle.

Chris Hoze , Clémentine Escoulflaire , Mohammad Elias Mesbah Uddin , Anne Barbat , Mekki Boussaha et al.
Journal of Dairy Science, 2020, 103 (1), pp.607-612. ⟨10.3168/jds.2019-17056⟩
Article dans une revue hal-02625089 v1
Image document

Meta-analysis for milk fat and protein percentage using imputed sequence variant genotypes in 94,321 cattle from eight cattle breeds

Irene van den Berg , Ruidong Xiang , Janez Jenko , Hubert Pausch , Mekki Boussaha et al.
Genetics Selection Evolution, 2020, 52 (1), pp.37. ⟨10.1186/s12711-020-00556-4⟩
Article dans une revue hal-02897829 v1
Image document

La génétique animale à l‘INRA

Pierre P. Sellier , Didier Boichard , Etienne Verrier
Histoire de la recherche contemporaine : la revue du Comité pour l’histoire du CNRS , 2019, VIII (1), pp.86-97. ⟨10.4000/hrc.3222⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-02618378 v1
Image document

GSE's 50th anniversary: where do we go from now?

Didier Boichard , Hélène Hayes , Jacobus Dekkers , - Julius van Der Werf
Genetics Selection Evolution, 2019, 51, pp.1-3. ⟨10.1186/s12711-019-0504-4⟩
Article dans une revue hal-02628229 v1

Joint imputation of whole-genome sequence variants and large chromosomal deletions in cattle.

M.Mesbah Uddin , Bernt Guldbrandtsen , Mogens Sand Lund , Didier Boichard , Goutam Sahana
Journal of Dairy Science, 2019, 102 (12), pp.11193-11206. ⟨10.3168/jds.2019-16946⟩
Article dans une revue hal-02621886 v1

Use of sexed semen and female genotyping affects genetic and economic outcomes of Montbéliarde dairy herds depending on the farming system considered.

Marie Bérodier , Mickael Brochard , Didier Boichard , Charlotte Dezetter , Nathalie Bareille et al.
Journal of Dairy Science, 2019, 102 (11), pp.10073-10087. ⟨10.3168/jds.2018-16041⟩
Article dans une revue hal-02628334 v1
Image document

Sequence-based GWAS, network and pathway analyses reveal genes co-associated with milk cheese-making properties and milk composition in Montbéliarde cows

Marie-Pierre Sanchez , Yuliaxis Ramayo-Caldas , Valérie Wolf , Cécile Laithier , Mohammed El Jabri et al.
Genetics Selection Evolution, 2019, 51 (1), pp.34. ⟨10.1186/s12711-019-0473-7⟩
Article dans une revue hal-02176238 v1
Image document

Le croisement entre races bovines laitières : intérêts et limites pour des ateliers en race pure Prim’Holstein ?

Charlotte Dezetter , Didier Boichard , Nathalie Bareille , Bénédicte Grimard , Pascale Le Mezec et al.
INRA Productions Animales, 2019, 32 (3), pp.359-378. ⟨10.20870/productions-animales.2019.32.3.2575⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-02625070 v1

Comparison of Bayesian and partial least squares regression methods for mid-infrared prediction of cheese-making properties in Montbéliarde cows

M. El Jabri , Marie-Pierre Sanchez , P. Trossat , C. Laithier , V. Wolf et al.
Journal of Dairy Science, 2019, 102 (8), pp.6943-6958. ⟨10.3168/jds.2019-16320⟩
Article dans une revue hal-02619829 v1
Image document

Sequence-based GWAS, network and pathway analyses reveal genes co-associated with milk cheese-making properties and milk composition in Montbéliarde cows

Marie-Pierre Sanchez , Yuliaxis Ramayo-Caldas , Valérie Wolf , Cécile Laithier , Mohammed El Jabri et al.
Genetics Selection Evolution, 2019, ⟨10.1186/s12711-019-0473-7⟩
Article dans une revue hal-03162144 v1
Image document

Longitudinal study of Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis fecal shedding patterns and concurrent serological patterns in naturally infected dairy cattle

Nora Navarro-Gonzalez , Christine Fourichon , Philippe Blanquefort , Arnaud Delafosse , Alain Joly et al.
Journal of Dairy Science, 2019, 102 (10), pp.9117-9137. ⟨10.3168/jds.2018-15897⟩
Article dans une revue hal-02623346 v1
Image document

Analyse génétique de la « fromageabilité » du lait de vache prédite par spectrométrie dans le moyen infrarouge en race Montbéliarde

Marie-Pierre Sanchez , Valérie Wolf , Cécile Laithier , Mohammed El Jabri , Eric Beuvier et al.
INRA Productions Animales, 2019, 32 (3), pp.379-398. ⟨10.20870/productions-animales.2019.32.3.2950⟩
Article dans une revue hal-02618893 v1

A missense mutation (p.Tyr452Cys) in the CAD gene compromises reproductive success in French Normande cattle

M. Mesbah-Uddin , Chris Hoze , Pauline Michot , Anne Barbat , Rachel Lefebvre et al.
Journal of Dairy Science, 2019, 102 (7), pp.6340-6356. ⟨10.3168/jds.2018-16100⟩
Article dans une revue hal-02620263 v1
Image document

Genome-wide mapping of large deletions and their population-genetic properties in dairy cattle

Md Mesbah Uddin , Bernt Guldbrandtsen , Terhi Iso-Touru , Johanna Vilkki , Dirk-Jan de Koning et al.
DNA Research, 2018, 25 (1), pp.49-59. ⟨10.1093/dnares/dsx037⟩
Article dans une revue hal-02621609 v1
Image document

A meta-analysis including pre-selected sequence variants associated with seven traits in three French dairy cattle populations

Andrew G. Marete , Bernt Guldbrandtsen , Mogens S. Lund , Sebastien Fritz , Goutam Sahana et al.
Frontiers in Genetics, 2018, 9, pp.522. ⟨10.3389/fgene.2018.00522⟩
Article dans une revue hal-02625793 v1

Genetic parameters for cheese-making properties and milk composition predicted from mid-infrared spectra in a large data set of Montbéliarde cows

Marie-Pierre Sanchez , M El Jabri , S Minéry , V Wolf , E Beuvier et al.
Journal of Dairy Science, 2018, 101 (11), pp.10048-10061. ⟨10.3168/jds.2018-14878⟩
Article dans une revue hal-02626138 v1

Meta-analysis of genome-wide association studies for cattle stature identifies common genes that regulate body size in mammals

Aniek C. Bouwman , Hans D. Daetwyler , Amanda J. Chamberlain , Carla Hurtado Ponce , Mehdi Sargolzaei et al.
Nature Genetics, 2018, 50 (3), pp.362-367. ⟨10.1038/s41588-018-0056-5⟩
Article dans une revue hal-02628780 v1

Genome-wide association study for milking speed in French Holstein cows.

Andrew Marete , Goutam Sahana , Sebastien Fritz , Rachel Lefebvre , Anne Barbat et al.
Journal of Dairy Science, 2018, 101 (7), pp.6205-6219. ⟨10.3168/jds.2017-14067⟩
Article dans une revue hal-02623282 v1

Short communication: Confirmation of candidate causative variants on milk composition and cheesemaking properties in Montbéliarde cows

Marie-Pierre Sanchez , V Wolf , M. El Jabri , Eric Beuvier , Odile Rolet-Répécaud et al.
Journal of Dairy Science, 2018, 101 (11), pp.10076-10081. ⟨10.3168/jds.2018-14986⟩
Article dans une revue hal-02623400 v1

Genetic parameters of milk production traits in response to a short once-daily milking period in crossbred Holstein × Normande dairy cows

Clémentine Charton , Jocelyne Guinard-Flament , Rachel Lefebvre , Sarah Barbey , Yves Gallard et al.
Journal of Dairy Science, 2018, 101 (3), pp.2235-2247. ⟨10.3168/jds.2017-13173⟩
Article dans une revue hal-02622344 v1

Invited review: Low milk somatic cell count and susceptibility to mastitis

Pascal Rainard , Gilles Foucras , Didier Boichard , Rachel Rupp
Journal of Dairy Science, 2018, 101 (8), pp.6703-6714. ⟨10.3168/jds.2018-14593⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-02626573 v1
Image document

La sélection dans l’espèce bovine et ses perspectives

Didier Boichard , Sophie Mattalia , Sebastien Fritz
Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2018, 170 (5), pp.215-221
Article dans une revue (article de synthèse) hal-02617862 v1
Image document

A system-based analysis of the genetic determinism of udder conformation and health phenotypes across three French dairy cattle breeds

Andrew Marete , Mogens Sandø Lund , Didier Boichard , Yuliaxis Ramayo Caldas
PLoS ONE, 2018, 13 (7), pp.1-17. ⟨10.1371/journal.pone.0199931⟩
Article dans une revue hal-02626366 v1
Image document

Progressive ataxia of Charolais cattle highlights a role of KIF1C in sustainable myelination

Amandine Duchesne , Anne Vaiman , Magali Frah , Sandrine Floriot , Sabrina Legoueix et al.
PLoS Genetics, 2018, 14 (8), pp.1-25. ⟨10.1371/journal.pgen.1007550⟩
Article dans une revue hal-02624522 v1
Image document

A multi-scale analysis of bull sperm methylome revealed both species peculiarities and conserved tissue-specific features

Jean-Philippe Perrier , Eli Sellem , Audrey Prézelin , Maxime Gasselin , Luc Jouneau et al.
BMC Genomics, 2018, 19 (1), pp.404. ⟨10.1186/s12864-018-4764-0⟩
Article dans une revue hal-01975403 v1

An initiator codon mutation in SDE2 causes recessive embryonic lethality in Holstein cattle

Sebastien Fritz , Chris Hoze , Emmanuelle Rebours , Anne Barbat , Méline Bizard et al.
Journal of Dairy Science, 2018, 101 (7), pp.6220-6231. ⟨10.3168/jds.2017-14119⟩
Article dans une revue hal-02623515 v1
Image document

Faibles concentrations cellulaires du lait et sensibilité aux mammites des ruminants laitiers

Pascal Rainard , Gilles Foucras , Didier Boichard , Rachel Rupp
INRA Productions Animales, 2018, 31 (4), pp.365-376. ⟨10.20870/productions-animales.2018.31.4.2393⟩
Article dans une revue hal-02621013 v1
Image document

Bovine and murine models highlight novel roles for SLC25A46 in mitochondrial dynamics and metabolism, with implications for human and animal health

Amandine Duchesne , Anne Vaiman , Johan Castille , Christian Beauvallet , Pauline Gaignard et al.
PLoS Genetics, 2017, 13 (4), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pgen.1006597⟩
Article dans une revue hal-01605182 v1
Image document

Within-breed and multi-breed GWAS on imputed whole-genome sequence variants reveal candidate mutations affecting milk protein composition in dairy cattle

Marie-Pierre Sanchez , Armelle Govignon-Gion , Pascal Croiseau , Sébastien Fritz , Chris Hozé et al.
Genetics Selection Evolution, 2017, 49 (1), pp.68. ⟨10.1186/s12711-017-0344-z⟩
Article dans une revue hal-01589691 v1

A missense mutation in PFAS (phosphoribosylformylglycinamidine synthase) is likely causal for embryonic lethality associated with the MH1 haplotype in Montbéliarde dairy cattle

Pauline Michot , Sebastien Fritz , Anne Barbat , Mekki Boussaha , Marie-Christine Deloche et al.
Journal of Dairy Science, 2017, 100 (10), pp.8176-8187. ⟨10.3168/jds.2017-12579⟩
Article dans une revue hal-02619062 v1
Image document

Identification of copy number variation in French dairy and beef breeds using next-generation sequencing

Rabia Letaief , Emmanuelle Rebours , Cécile Grohs , Cédric Meersseman , Sébastien Fritz et al.
Genetics Selection Evolution, 2017, 49 (1), pp.77. ⟨10.1186/s12711-017-0352-z⟩
Article dans une revue hal-01622967 v1

Genetic and nongenetic factors contributing to differences in αS-casein phosphorylation isoforms and other major milk proteins

Zih-Hua Fang , H. Bovenhuis , Agnès Delacroix-Buchet , Guy Miranda , Didier Boichard et al.
Journal of Dairy Science, 2017, 100 (7), pp.5564-5577. ⟨10.3168/jds.2016-12338⟩
Article dans une revue hal-01608323 v1

Short Communication : Genetic parameters for milk protein composition predicted using mid-infrared spectroscopy in the French Montbéliarde, Normande, and Holstein dairy cattle breeds

Marie-Pierre Sanchez , M. Ferrand , M. Gelé , D. Pourchet , Guy Miranda et al.
Journal of Dairy Science, 2017, 100 (8), pp.6371-6375. ⟨10.3168/jds.2017-12663⟩
Article dans une revue hal-01607785 v1
Image document

Rapid discovery of de novo deleterious mutations in cattle enhances the value of livestock as model species

Emmanuelle Bourneuf , P. Otz , H. Pausch , V. Jagannathan , Pauline Michot et al.
Scientific Reports, 2017, 7 (1), pp.11466. ⟨10.1038/s41598-017-11523-3⟩
Article dans une revue hal-01608270 v1
Image document

Using sequence variants in linkage disequilibrium with causative mutations to improve across breed prediction in dairy cattle: a simulation study

Irene van den Berg , Didier Boichard , Bernt Guldbrandtsen , Mogens S Lund
G3, 2016, 6 (8), pp.2553-2561. ⟨10.1534/g3.116.027730⟩
Article dans une revue hal-02630862 v1
Image document

A reverse genetic approach identifies an ancestral frameshift mutation in RP1 causing recessive progressive retinal degeneration in European cattle breeds

Pauline Michot , Sabine Chahory , Andrew Marete , Cécile Grohs , Dimitri Dagios et al.
Genetics Selection Evolution, 2016, 48 (1), pp.56. ⟨10.1186/s12711-016-0232-y⟩
Article dans une revue hal-01479315 v1
Image document

Coding and noncoding variants in <em>HFM1, MLH3, MSH4, MSH5, RNF212,</em> and <em>RNF212B</em> affect recombination rate in cattle

Naveen Kumar Kadri , Chad Harland , Pierre Faux , Nadine Cambisano , Latifa Karim et al.
Genome Research, 2016, 26 (10), pp.1323-1332. ⟨10.1101/gr.204214.116⟩
Article dans une revue hal-02637972 v1

Identification and characterization of copy number variations in cattle

Rabia Letaief , Diane Esquerre , Johanna Barbieri , Cécile Grohs , Sebastien Fritz et al.
Journal of Animal Science, 2016, 94, pp.183-183. ⟨10.2527/jas2016.94supplement4183a⟩
Article dans une revue hal-01605684 v1
Image document

Les anomalies génétiques chez les espèces d’élevage - Avant-propos

Didier Boichard , Aurélien Capitan , Coralie Danchin-Burge , Cécile Grohs
INRAE Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.293-296. ⟨10.20870/productions-animales.2016.29.5.2995⟩
Article dans une revue hal-04045143 v1
Image document

Sequence variants selected from a multi-breed GWAS can improve the reliability of genomic predictions in dairy cattle

Irene van den Berg , Didier Boichard , Mogens S. Lund
Genetics Selection Evolution, 2016, 48 (1), pp.83. ⟨10.1186/s12711-016-0259-0⟩
Article dans une revue hal-01479248 v1
Image document

Du phénotype à la mutation causale : le cas des anomalies récessives bovines

Amandine Duchesne , Cécile Grohs , Pauline Michot , Maud Bertaud , Didier Boichard et al.
INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.319-328
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01608800 v1
Image document

Genomic selection in domestic animals: Principles, applications and perspectives

Didier Boichard , Vincent Ducrocq , Pascal Croiseau , Sebastien S. Fritz
Comptes Rendus Biologies, 2016, 339 (7-8), pp.274-277. ⟨10.1016/j.crvi.2016.04.007⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-02641310 v1
Image document

Construction of a large collection of small genome variations in French dairy and beef breeds using whole-genome sequences

Mekki Boussaha , Pauline Michot , Rabia Letaief , Chris Hozé , Sébastien Fritz et al.
Genetics Selection Evolution, 2016, 48 (1), pp.87. ⟨10.1186/s12711-016-0268-z⟩
Article dans une revue hal-01479216 v1

Whole-genome scan to detect quantitative trait loci associated with milk protein composition in 3 French dairy cattle breeds

Marie-Pierre Sanchez , Armelle Gion , M. Ferrand , M. Gelé , D. Pourchet et al.
Journal of Dairy Science, 2016, 99 (10), pp.8203-8215. ⟨10.3168/jds.2016-11437⟩
Article dans une revue hal-01533901 v1
Image document

Prise en compte des anomalies génétiques en sélection : le cas des bovins

Didier Boichard , Cécile Grohs , Pauline Michot , Coralie Danchin-Burge , Aurelien Capitan et al.
INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.351-358
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01602349 v1
Image document

Les anomalies génétiques : définition, origine, transmission et évolution, mode d’action

Didier Boichard , Cécile Grohs , Coralie Danchin-Burge , Aurelien Capitan
INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.297-306
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01602233 v1
Image document

Anticiper l'émergence d'anomalies génétiques grâce aux données génomiques

Sebastien Fritz , Pauline Michot , Chris Hoze , Cécile Grohs , Anne Barbat et al.
INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.339-350
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01602234 v1
Image document

Dossier : Anomalies génétiques - Avant-propos

Didier Boichard , Aurelien Capitan , Coralie Danchin-Burge , Cécile Grohs
INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.293-295
Article dans une revue hal-01533956 v1

Comparing power and precision of within-breed and multibreed genome-wide association studies of production traits using whole-genome sequence data for 5 French and Danish dairy cattle breeds

Irene van den Berg , Didier Boichard , Mogens Sandø Lund
Journal of Dairy Science, 2016, 99 (11), pp.8932-8945. ⟨10.3168/jds.2016-11073⟩
Article dans une revue hal-01533908 v1
Image document

L’Observatoire National des Anomalies Bovines, son action et ses résultats pour une aide efficace à la gestion des anomalies génétiques

Cécile Grohs , Amandine Duchesne , Sandrine Floriot , Marie-Christine Deloche , Didier Boichard et al.
INRA Productions Animales, 2016, 29 (5), pp.307-318
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01602238 v1

Inbreeding and crossbreeding parameters for production and fertility traits in Holstein, Montbéliarde, and Normande cows

C. Dezetter , Helene Leclerc , Sophie Mattalia-Elie , Anne Barbat , Didier Boichard et al.
Journal of Dairy Science, 2015, 98 (7), pp.4904-4913. ⟨10.3168/jds.2014-8386⟩
Article dans une revue hal-01194131 v1
Image document

Simulation des potentialités de la sélection génomique chez les bovins laitiers

J Jacques J. J. Colleau , Sebastien S. Fritz , François Guillaume , Aurélia A. Baur , D. Dupassieux et al.
INRA Productions Animales, 2015, 28 (3), pp.251-258
Article dans une revue hal-02629942 v1
Image document

C-Nap1 mutation affects centriole cohesion and is associated with a Seckel-like syndrome in cattle

Sandrine Floriot , Christine Vesque , Sabrina Rodriguez , Florence Bourgain-Guglielmetti , Anthi Karaiskou et al.
Nature Communications, 2015, 6, pp.1-9. ⟨10.1038/ncomms7894⟩
Article dans une revue hal-01194104 v1
Image document

Genetic tools to improve reproduction traits in dairy cattle

Aurelien Capitan , Pauline Michot , Aurélia Baur , Romain Saintilan , Chris Hoze et al.
Reproduction, Fertility and Development, 2015, 27 (1), pp.14-21. ⟨10.1071/RD14379⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01194016 v1
Image document

Whole-genome sequencing identifies a homozygous deletion encompassing exons 17 to 23 of the [i]integrin beta 4[/i] gene in a Charolais calf with junctional epidermolysis bullosa

Pauline Michot , Oscar Fantini , Régis Braque , Aurélie Allais-Bonnet , Romain Saintilan et al.
Genetics Selection Evolution, 2015, 47 (1), pp.1-7. ⟨10.1186/s12711-015-0110-z⟩
Article dans une revue hal-01194111 v1
Image document

Sélection génomique chez les bovins laitiers : les raisons de son succès

Didier Boichard
Sélectionneur Français, 2015, 66, pp.11-20
Article dans une revue (article de synthèse) hal-02633329 v1

Quantitative trait loci markers derived from whole genome sequence data increases the reliability of genomic prediction

R.F. Brøndum , G. Su , L. Janss , G. Sahana , B. Guldbrandtsen et al.
Journal of Dairy Science, 2015, 98 (6), pp.4107-4116. ⟨10.3168/jds.2014-9005⟩
Article dans une revue hal-01194114 v1

GRAIN: a computer program to calculate ancestral and partial inbreeding coefficients using a gene dropping approach

R. Baumung , J. Farkas , Didier Boichard , G. Mészáros , J. Sölkner et al.
Journal of Animal Breeding and Genetics, 2015, 132 (2), pp.100-108. ⟨10.1111/jbg.12145⟩
Article dans une revue istex hal-01194087 v1
Image document

Genome-wide study of structural variants in bovine Holstein, Montbéliarde and Normande dairy breeds

Mekki Boussaha , Diane Esquerre , Johanna Barbieri , Anis Djari , Alain Pinton et al.
PLoS ONE, 2015, 10 (8), pp.1-21. ⟨10.1371/journal.pone.0135931⟩
Article dans une revue hal-01194172 v1
Image document

Genetics Selection Evolution reviewer acknowledgement 2014

Didier Boichard , Jack Dekkers , Hélène Hayes , Julius van Der Werf
Genetics Selection Evolution, 2015, 47 (1), pp.73. ⟨10.1186/s12711-015-0147-z⟩
Article dans une revue hal-01341308 v1

Sustainable dairy cattle selection in the genomic era

Didier Boichard , Vincent Ducrocq , Sebastien Fritz
Journal of Animal Breeding and Genetics, 2015, 132 (2), pp.135-143. ⟨10.1111/jbg.12150⟩
Article dans une revue (article de synthèse) istex hal-01194086 v1
Image document

Genetics Selection Evolution reviewer acknowledgement 2013

Didier Boichard , Jack Cm Dekkers , Hélène Hayes
Genetics Selection Evolution, 2014, 46 (1), pp.1. ⟨10.1186/1297-9686-46-1⟩
Article dans une revue hal-01341220 v1

Identification of the putative ancestral allele of bovine single-nucleotide polymorphisms.

Dominique Rocha , Coline Billerey , Franck Samson , Didier Boichard , Mekki Boussaha
Journal of Animal Breeding and Genetics, 2014, 131 (6), pp.483-486. ⟨10.1111/jbg.12095⟩
Article dans une revue istex hal-01193845 v1
Image document

Déterminisme génétique de la composition en acides gras et protéines du lait des ruminants et potentialités de sélection

Didier Boichard , Armelle Gion , Helene Larroque , Cyrielle Maroteau , Isabelle Palhiere et al.
INRA Productions Animales, 2014, 27 (4), pp.283-298
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01194000 v1

Efficiency of multi-breed genomic selection for dairy cattle breeds with different sizes of reference population

C. Hozé , Sébastien Fritz , Florence Phocas , Didier Boichard , Vincent Ducrocq et al.
Journal of Dairy Science, 2014, 97 (6), pp.3918-3929. ⟨10.3168/jds.2013-7761⟩
Article dans une revue hal-01193830 v1
Image document

Optimalait : Gestion des ressources génétiques et alimentaires pour la maîtrise de la composition en acides gras du lait

Marine Gele , Philippe Brunschwig , Didier Boichard , Armelle Govignon-Gion , Gilles Lagriffoul et al.
Innovations Agronomiques, 2014, 34, pp.189-206. ⟨10.17180/a3yv-2650⟩
Article dans une revue hal-04525055 v1

Quel futur pour l'amélioration génétique chez les espèces domestiques ?

Didier Boichard
Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2014, 167 (2), pp.103-108
Article dans une revue hal-01193941 v1
Image document

Dossier "PhénoFinlait : Phénotypage et génotypage pour la compréhension et la maîtrise de la composition fine du lait" - Avant propos

Mickaël Brochard , Koenraad Duhem , Didier Boichard
INRA Productions Animales, 2014, 27 (4), pp.251-254
Article dans une revue hal-01194060 v1
Image document

Concordance analysis for QTL detection in dairy cattle: a case study of leg morphology

Irene van den Berg , Sébastien Fritz , Sabrina Rodriguez , Dominique Rocha , Mekki Boussaha et al.
Genetics Selection Evolution, 2014, 46 (1), pp.1-14. ⟨10.1186/1297-9686-46-31⟩
Article dans une revue hal-01193829 v1
Image document

Implications organisationnelles de la sélection génomique chez les bovins et ovins laitiers en France : analyses et accompagnement

Julie Labatut , Jean-Michel Astruc , Francis Barillet , Didier Boichard , Vincent Ducrocq et al.
INRA Productions Animales, 2014, 27 (4), pp.303-316
Article dans une revue hal-01193850 v1

Whole-genome sequencing of 234 bulls facilitates mapping of monogenic and complex traits in cattle

Hans D Daetwyler , Aurelien Capitan , Hubert Pausch , Paul Stothard , Rianne van Binsbergen et al.
Nature Genetics, 2014, 46 (8), pp.858-865. ⟨10.1038/ng.3034⟩
Article dans une revue hal-01193853 v1
Image document

Detection of haplotypes associated with prenatal death in dairy cattle and identification of deleterious mutations in GART, SHBG and SLC37A2

Sebastien S. Fritz , Aurelien A. Capitan , Anis Djari , Sabrina S. Rodriguez , Anne Barbat et al.
PLoS ONE, 2013, 8, online (6), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0065550⟩
Article dans une revue hal-01000118 v1
Image document

La sélection pour des vaches et une production laitière plus durables : acquis de la génétique et opportunités offertes par la sélection génomique

Mickael M. Brochard , Didier Boichard , Vincent Ducrocq , Sébastien S. Fritz
INRA Productions Animales, 2013, 26 (2), pp.145-156
Article dans une revue hal-01000791 v1
Image document

Novel insights into the bovine polled phenotype and horn ontogenesis in Bovidae

Aurélie Allais-Bonnet , Cécile Grohs , Ivica I. Medugorac , Stefan S. Krebs , Anis Djari et al.
PLoS ONE, 2013, 8, online (5), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0063512⟩
Article dans une revue hal-01000794 v1
Image document

QTL fine mapping with Bayesian C(π): a simulation study

Irene van den Berg van den Berg , Sébastien S. Fritz , Didier Boichard
Genetics Selection Evolution, 2013, 45 (june), Non paginé. ⟨10.1186/1297-9686-45-19⟩
Article dans une revue hal-01000784 v1

La sélection génomique, une opportunité pour améliorer la santé des animaux d'élevage

Didier Boichard
Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2013, 166 (1), pp.25-31
Article dans une revue hal-01001353 v1
Image document

High-density marker imputation accuracy in sixteen French cattle breeds

Chris Hoze Hozé , Marie-Noëlle M.-N. Fouilloux , Eric Venot , François F. Guillaume , Romain R. Dassonneville et al.
Genetics Selection Evolution, 2013, 45 (1), pp.1-11. ⟨10.1186/1297-9686-45-33⟩
Article dans une revue hal-01001056 v1
Image document

A 3.7 Mb deletion encompassing ZEB2 causes a novel polled and multisystemic syndrome in the progeny of a somatic mosaic bull

Aurelien Capitan , Aurélie Allais-Bonnet , Alain Pinton , Brigitte Marquant-Le Guienne , Daniel Le Bourhis et al.
PLoS ONE, 2012, 7, online (11), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0049084⟩
Article dans une revue hal-01019835 v1

Genomic selection in French dairy cattle

Didier Boichard , Francois F. Guillaume , A. A. Baur , Pascal Croiseau , Marie-Noëlle M.-N. Rossignol et al.
Animal Production Science, 2012, 52 (3), pp.115-120. ⟨10.1071/AN11119⟩
Article dans une revue hal-01000202 v1
Image document

New phenotypes for new breeding goals in dairy cattle

Didier Boichard , Mickael Brochard
Animal, 2012, 6 (4), pp.544-550. ⟨10.1017/S1751731112000018⟩
Article dans une revue hal-01019802 v1
Image document

Design of a bovine low-density SNP array optimized for imputation

Didier Boichard , Hoyoung Chung , Romain Dassonneville , Xavier David , Andre Eggen et al.
PLoS ONE, 2012, 7, online (3), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0034130⟩
Article dans une revue hal-01019774 v1
Image document

Fine mapping of copy number variations on two cattle genome assemblies using high density SNP array

Yali Hou , Derek M Bickhart , Miranda L Hvinden , Congjun Li , Jiuzhou Song et al.
BMC Genomics, 2012, 13, online (august), Non paginé. ⟨10.1186/1471-2164-13-376⟩
Article dans une revue hal-01019852 v1

Association studies in QTL regions linked to bovine trypanotolerance in a West African crossbred population

G.K. Dayo , Mathieu Gautier , D. Berthier , Jean Paul Poivey , I. Sidibe et al.
Animal Genetics, 2012, 43 (2), pp.123-132. ⟨10.1111/j.1365-2052.2011.02227.x⟩
Article dans une revue istex hal-01019326 v1
Image document

Inclusion of cow records in genomic evaluations and impact on bias due to preferential treatment

Romain R. Dassonneville , Aurelia A. Baur , Sebastien S. Fritz , Didier Boichard , Vincent Ducrocq
Genetics Selection Evolution, 2012, 44, online (december), Non paginé. ⟨10.1186/1297-9686-44-40⟩
Article dans une revue hal-01000386 v1

Short communication: Imputation performances of 3 low-density marker panels in beef and dairy cattle

Romain Dassonneville , S. Fritz , Vincent Ducrocq , Didier Boichard
Journal of Dairy Science, 2012, 95 (7), pp.4136 - 4140. ⟨10.3168/jds.2011-5133⟩
Article dans une revue hal-01003420 v1

LDSO : A progroam to simulate pedigrees and molecular information under various evolutionary forces

Florence F. Ytournel , Simon S. Teyssedre , Dana D. Roldan , M. M. Erbe , H. H. Simianer et al.
Journal of Animal Breeding and Genetics, 2012, 129 (5), pp.417-421. ⟨10.1111/j.1439-0388.2011.00986.x⟩
Article dans une revue istex hal-01000612 v1
Image document

Utilisation de la sélection génomique chez les bovins laitiers

Francois F. Guillaume , Didier Boichard , Vincent Ducrocq , Sébastien S. Fritz
INRA Productions Animales, 2011, 24 (4), pp.363-368
Article dans une revue hal-01000227 v1
Image document

Fine tuning genomic evaluations in dairy cattle through SNP pre-selection with the Elastic-Net algorithm

Pascal Croiseau , Andres Legarra , François F. Guillaume , Sébastien S. Fritz , Aurélia A. Baur et al.
Genetics Research, 2011, 93 (6), pp.409-417. ⟨10.1017/S0016672311000358⟩
Article dans une revue hal-01000269 v1

Évolution des objectifs et des méthodes de sélection des bovins laitiers

Etienne Verrier , Pascale Le Mezec , Didier Boichard , Sophie Mattalia
Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2010, 163 (1), pp.73-78
Article dans une revue hal-01193376 v1
Image document

Female fertility in French dairy breeds: current situation and strategies for improvement

Anne Barbat , Pascale Le Mézec , Vincent Ducrocq , Sophie Mattalia , Sébastien Fritz et al.
Journal of Reproduction and Development, 2010, 56, pp.S15-S21. ⟨10.1262/jrd.1056S15⟩
Article dans une revue hal-01193597 v1

La sélection des ruminants laitiers pour des numérations cellulaires faibles et les conséquences sur leur sensibilité aux mammites

Rachel Rupp , Jean-Michel Astruc , Sébastien Fritz , Anne Barbat , Didier Boichard
Bulletin des G.T.V., 2010, 54 (Juin), pp.53-60
Article dans une revue hal-01193564 v1

Abord des anomalies génétiques bovines

Didier Boichard , Sandrine Floriot , Carine Capel , Amandine Duchesne
International Economics, 2010, 311 (décembre), pp.66-69
Article dans une revue hal-01193633 v1
Image document

Genetics Selection Evolution: news for the period January 2009 - May 2010 and editorial announcements

Hélène Hayes , Didier Boichard
Genetics Selection Evolution, 2010, 42, online (may), Non paginé. ⟨10.1186/1297-9686-42-15⟩
Article dans une revue hal-01193680 v1
Image document

De la génétique à la génomique

Jean Pierre Bidanel , Didier Boichard , Claude C. Chevalet
Productions Animales, 2008, 21 (1), pp.15-32. ⟨10.20870/productions-animales.2008.21.1.3372⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-02655255 v1
Image document

Estimation by simulation of the efficiency of the French marker-assisted selection program in dairy cattle (Open Access publication)

François Guillaume , Sébastien Fritz , Didier Boichard , Tom Druet
Genetics Selection Evolution, 2008, 40 (1), pp.91-102
Article dans une revue hal-00894611 v1
Image document

Correlations of marker-assisted breeding values with progeny-test breeding values for eight hundred ninety-nine French Holstein bulls

François Guillaume , Sébastien Fritz , Didier Boichard , Tom T. Druet
Journal of Dairy Science, 2008, 91 (6), pp.2520-2522. ⟨10.3168/jds.2007-0829⟩
Article dans une revue hal-02653309 v1
Image document

Comment affiner la localisation d'un QTL ?

Florence F. Ytournel , Hélène Gilbert , Didier Boichard
Productions Animales, 2008, 21 (2), pp.147-158
Article dans une revue hal-02665716 v1
Image document

Functional and positional genomics in beef cattle : current programs and potential progress

Jean-François Hocquette , Didier Boichard , Isabelle Cassar-Malek , Elisabeth Laville , Gilles G. Renand et al.
Sciences des aliments = Food science : an international journal of food science and technology, 2008, 28 (4-5), pp.335-350. ⟨10.3166/sda.28.335-350⟩
Article dans une revue istex hal-02663499 v1
Image document

Estimation by simulation of the efficiency of the French marker assisted selection program in dairy cattle

François Guillaume , Sébastien Fritz , Didier Boichard , Tom T. Druet
Genetics Selection Evolution, 2008, 40, pp.91-102
Article dans une revue hal-02655027 v1

Fine mapping of quantitative trait loci affecting female fertility in dairy cattle on BTA03 using a dense single-nucleotide polymorphism map

Tom T. Druet , Sébastien Fritz , Mekki Boussaha , Slim Ben-Jemaa , François Guillaume et al.
Genetics, 2008, 178, pp.2228-2235
Article dans une revue hal-02663723 v1
Image document

Vingt ans de recherche et d’innovation en productions animales à l’INRA

Bernard Charley , Philippe Chemineau , Didier Boichard , Jean-Marc Meynard , Gilles Aumont et al.
Productions Animales, 2008, 21 (1), pp.11-14
Article dans une revue (article de synthèse) hal-02659218 v1
Image document

The extent of linkage disequilibrium in a large cattle population of western Africa and its consequences for association studies

S. Thevenon , G. Dayo , S. Sylla , I. Sidibe , D. Berthier et al.
Animal Genetics, 2007, 38, pp.277
Article dans une revue hal-02656325 v1
Image document

Characterization of the DGAT1 K232A and variable number of tandem repeat polymorphisms in French dairy cattle.

Mathieu M. Gautier , Aurelien A. Capitan , Sebastien S. Fritz , Andre A. Eggen , Didier Boichard et al.
Journal of Dairy Science, 2007, 90, pp.2980-2988
Article dans une revue hal-02654424 v1

Refinement of two female fertility QTL using alternative phenotypes in French Holstein dairy cattle

François Guillaume , Mathieu M. Gautier , Slim Ben Jemaa , Sébastien Fritz , Andre A. Eggen et al.
Animal Genetics, 2007, 38, pp.72-74
Article dans une revue hal-02659988 v1
Image document

Extent of linkage disequilibrium in a large cattle population of Western Africa and consequences for association studies.

S. Thevenon , Guiguigbaza-Kossigan Dayo , S. Sylla , Issa Sidibé , Daphné Berthier et al.
Animal Genetics, 2007, 38, pp.277-286
Article dans une revue hal-02655973 v1
Image document

Characterization of the K232A and VNTR polymorphisms in the DGAT1 gene in French dairy cattle.

Mathieu M. Gautier , Aurelien A. Capitan , Sébastien Fritz , Andre A. Eggen , Didier Boichard et al.
Journal of Dairy Science, 2007, 90, pp.2980
Article dans une revue hal-02654039 v1
Image document

Genetic and haplotypic structure in 14 European and African cattle breeds

Mathieu M. Gautier , Thomas Faraut , Katayoun Moazami-Goudarzi , Vincent Navratil , Mario Foglio et al.
Genetics, 2007, 177, pp.1059-1070
Article dans une revue hal-02660515 v1
Image document

Fine mapping and physical characterization of two linked Quantitative Trait Loci affecting milk fat yield in dairy cattle on BTA26.

Mathieu M. Gautier , R. Roy Barcelona , Sebastien S. Fritz , Cécile Grohs , Tom T. Druet et al.
Genetics, 2006, 172, pp.425-436
Article dans une revue hal-02653456 v1
Image document

Estimation of genetic parameters for quantitative trait loci for dairy traits in the French Holstein population.

Tom T. Druet , Sebastien S. Fritz , Didier Boichard , J Jacques J. J. Colleau
Journal of Dairy Science, 2006, 89, pp.4070-4076
Article dans une revue hal-02653661 v1
Image document

Multiple quantitative trait loci mapping with cofactors and application of alternative variants of the false discovery rate in a enlarged granddauhgter design.

J. Bennewitz , N. Reinsch , V. Guiard , Sebastien S. Fritz , H. Thomsen et al.
Genetics, 2004, 168, pp.1019-1027
Article dans une revue hal-02673110 v1

Management practices from questionnaire surveys in herds with very low somatic cell score through a national mastitis program in France

Jacques Barnouin , Michelle Chassagne , Serge Bazin , Didier Boichard
Journal of Dairy Science, 2004, 87 (11), pp.3989-3999
Article dans une revue hal-02678170 v1
Image document

A first generation bovine BAC-based physical map

Laurent Schibler , Anne Roig , Marie-Françoise Mahé , Jean-Claude Save , Mathieu Gautier et al.
Genetics Selection Evolution, 2004, 36 (1), pp.105-122. ⟨10.1051/gse:2003054⟩
Article dans une revue hal-00894477 v1
Image document

A first generation bovine BAC-based physical map.

Laurent L. Schibler , Anne Roig , M Francois Mahe , J.C. Save , Mathieu M. Gautier et al.
Genetics Selection Evolution, 2004, 36, pp.105-122
Article dans une revue hal-02676457 v1

L'amélioration génétique des caprins. Caractères laitiers et de morphologie

Virginie Clément , Agnès Piacere , Eduardo Manfredi , B. Lamaix , Patrice Martin et al.
Elevage et Insémination, 2003, 313, pp.3-11
Article dans une revue hal-02682937 v1

Un projet d'épidémiosurveillance pour les anomalies héréditaires bovines

Alain Ducos , Andre A. Eggen , Roland Darré , Didier Boichard
Bulletin des G.T.V., 2003, 18, pp.41-45
Article dans une revue hal-02679289 v1

Identifier les anomalies héréditaires des bovins et comprendre leurs mécanismes de transmission

Alain Ducos , Andre A. Eggen , Roland Darré , Didier Boichard
Bulletin des G.T.V., 2003, 18, pp.31-38
Article dans une revue hal-02675432 v1

Comment accéder aux informations sur les anomalies héréditaires bovines

Alain Ducos , Andre A. Eggen , Roland Darré , Didier Boichard
Bulletin des G.T.V., 2003, 18, pp.39-40
Article dans une revue hal-02675440 v1
Image document

Genetics of resistance to mastitis in dairy cattle

Rachel Rupp , Didier Boichard
Veterinary Research, 2003, 34, pp.671-688
Article dans une revue hal-02673095 v1
Image document

Detection of genes influencing economic traits in three French dairy cattle breeds

Didier Boichard , Cécile Grohs , Florence Bourgeois , Frédérique Cerqueira , Rémi Faugeras et al.
Genetics Selection Evolution, 2003, 35 (1), pp.77-101. ⟨10.1051/gse:2002037⟩
Article dans une revue hal-00894436 v1
Image document

Combined analysis of data from two granddaughter designs: a simple strategy for QTL confirmation and increasing experimental power in dairy cattle.

J. Bennewitz , N. Reinsch , Cécile Grohs , Hubert H. Levéziel , A. Malafosse et al.
Genetics Selection Evolution, 2003, 35, pp.319-338
Article dans une revue hal-01211860 v1

Modeling lactation curves and estimation of genetic parameters to first lactation test-day records of French Holstein cows

T. Druet , Florence Jaffrezic , Didier Boichard , Vincent Ducrocq
Journal of Dairy Science, 2003, 86 (7), pp.2480-2490
Article dans une revue hal-02671393 v1
Image document

Combined analysis of data from two granddaughter designs: A simple strategy for QTL confirmation and increasing experimental power in dairy cattle

Jörn Bennewitz , Norbert Reinsch , Cécile Grohs , Hubert Levéziel , Alain Malafosse et al.
Genetics Selection Evolution, 2003, 35 (3), pp.319-338. ⟨10.1051/gse:2003011⟩
Article dans une revue hal-00894449 v1
Image document

Genetics of resistance to mastitis in dairy cattle

Rachel Rupp , Didier Boichard
Veterinary Research, 2003, 34 (5), pp.671-688. ⟨10.1051/vetres:2003020⟩
Article dans une revue hal-00902761 v1

Résultats de recherche : Priorité au traitement intramammaire

Emilie Gay , Severine Bord , Didier Boichard , Jacques Barnouin
Cahiers de l'Abstract Elevage, 2003, 3, pp.3
Article dans une revue hal-02669927 v1
Image document

Use of maternal information for QTL detection in a (grand)daughter design

Marc Bolard , Didier Boichard
Genetics Selection Evolution, 2002, 34 (3), pp.335-352. ⟨10.1051/gse:2002011⟩
Article dans une revue hal-00894415 v1
Image document

Use of maternal information for QTL detection in a (grand)daughter design.

M. Bolard , Didier Boichard
Genetics Selection Evolution, 2002, 34, pp.335-352
Article dans une revue hal-02673230 v1

Comment améliorer la résistance génétique aux mammites chez les bovins laitiers en France par la sélection

Rachel Rupp , Didier Boichard
Bulletin des G.T.V., 2001, 12, pp.47-51
Article dans une revue hal-02675059 v1

Evaluation génétique assistée par marqueurs.

Didier Boichard
Elevage et Insémination, 2001, n° 304, pp.13-22
Article dans une revue hal-02669357 v1

Bilan démographique et analyse de la variabilité génétique des principales races bovines laitières françaises

Sophie Moureaux , Didier Boichard , Etienne Verrier
Elevage et Insémination, 2001, 301, pp.10-21
Article dans une revue hal-02674691 v1

Implementation of an approximate multitrait BLUP evaluation to combine production traits and functional traits into a total merit index.

Vincent Ducrocq , Didier Boichard , Anne Barbat , Helene H. Larroque
Journal of Animal Science, 2001, suppl. 1, pp.25
Article dans une revue hal-02671555 v1
Image document

Numérations cellulaires du lait et mammites cliniques : relations phénotypique et génétique chez les vaches Prim'Holstein

Rachel Rupp , Didier Boichard
Productions Animales, 2001, 14 (3), pp.193-200
Article dans une revue hal-02678110 v1
Image document

A new reciprocal translocation in a subfertile bull (chromosome abnormality, semen quality)

A. Ducos , Paul Dumont , A. Seguela , Alain Pinton , Helene Berland et al.
Genetics Selection Evolution, 2000, 32 (6), pp.589-598
Article dans une revue hal-02690352 v1
Image document

La recherche de QTL à l'aide de marqueurs : résultats chez les bovins laitiers

Didier Boichard , Cécile Grohs , F. Cerqueira , Remy Faugeras , André Neau et al.
Productions Animales, 2000, HS 2000, pp.217-222
Article dans une revue hal-02685086 v1
Image document

A new reciprocal translocation in a subfertile bull

Alain Ducos , Pascal Dumont , Anne Séguéla , Alain Pinton , Hélène Berland et al.
Genetics Selection Evolution, 2000, 32 (6), pp.589-598. ⟨10.1051/gse:2000139⟩
Article dans une revue hal-00894358 v1

Relationship of early first lactation somatic cell count with risk of subsequent first clinical mastitis

Rachel Rupp , Didier Boichard
Livestock Production Science, 2000, 62, pp.169-180
Article dans une revue hal-02696242 v1

Relationship between milk somatic-cell counts in the first lactation and clinical mastitis occurrence in the second lactation of French Holstein cows

Rachel Rupp , F. Beaudeau , Didier Boichard
Preventive Veterinary Medicine, 2000, 46, pp.99-111
Article dans une revue hal-02694093 v1

Accounting for variance heterogeneity in French dairy cattle genetic evaluation

Christèle Robert-Granié , Bernard B. Bonaiti , Didier Boichard , Anne Barbat
Livestock Production Science, 1999, 60, pp.343-357
Article dans une revue hal-02693330 v1

Alternative models for QTL detection in livestock. III. Heteroskedastic model and models corresponding to several distributions of the QTL effect

Bruno B. Goffinet , Pascale P. Le Roy , Didier Boichard , Jean Michel J. M. Elsen , Brigitte B. Mangin
Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (4), pp.341-350
Article dans une revue hal-00490216 v1
Image document

Alternative models for QTL detection in livestock. II. Likelihood approximations and sire marker genotype estimations

B. Mangin , B. Goffinet , P. Le Roy , D. Boichard , J.M. Elsen
Genetics Selection Evolution, 1999, 31, pp.225-237
Article dans une revue hal-00199757 v1

Alternative models for QTL detection in livestock. III. Heteroskedastic model and models corresponding to several distributions of the QTL effect

Bruno B. Goffinet , Pascale P. Le Roy , Didier Boichard , Jean Michel J. M. Elsen , Brigitte B. Mangin
Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (4), pp.341-350
Article dans une revue hal-00490655 v1

Alternative models for QTL detection in livestock. II. Likelihood approximations and sire marker genotype estimations

Brigitte B. Mangin , Bruno B. Goffinet , Pascale P. Le Roy , Didier Boichard , Jean Michel J. M. Elsen
Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (3), pp.225-237
Article dans une revue hal-00490171 v1
Image document

Alternative models for QTL detection in livestock. III. Heteroskedastic model and models corresponding to several distributions of the QTL effect

Bruno B. Goffinet , Pascale P. Le Roy , Didier Boichard , Jean Michel J. M. Elsen , Brigitte B. Mangin
Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (4), pp.341-350
Article dans une revue hal-02693457 v1

Alternative models for QTL detection in livestock. II. Likelihood approximations and sire marker genotype estimations

Brigitte B. Mangin , Bruno B. Goffinet , Pascale P. Le Roy , Didier Boichard , Jean Michel J. M. Elsen
Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (3), pp.225-237
Article dans une revue hal-00489715 v1

Alternative models for QTL detection in livestock. I. General introduction

Jean Michel J. M. Elsen , Brigitte B. Mangin , Bruno B. Goffinet , Didier Boichard , Pascale P. Le Roy
Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (3), pp.213-224
Article dans une revue hal-00490374 v1
Image document

Analyse de la connexion en population bovine Holstein française

Eric Hanocq , Didier Boichard
Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (2), pp.163-176
Article dans une revue hal-02697272 v1

Alternative models for QTL detection in livestock. III. Heteroskedastic model and models corresponding to several distributions of the QTL effect

Bruno B. Goffinet , Pascale P. Le Roy , Didier Boichard , Jean Michel J. M. Elsen , Brigitte B. Mangin
Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (4), pp.341-350
Article dans une revue hal-00489773 v1

Alternative models for QTL detection in livestock. II. Likelihood approximations and sire marker genotype estimations

Brigitte B. Mangin , Bruno B. Goffinet , Pascale P. Le Roy , Didier Boichard , Jean Michel J. M. Elsen
Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (3), pp.225-237
Article dans une revue hal-00490616 v1

Genetic parameters for clinical mastitis, somatic cell score, production, udder type traits, and milking ease in first lactation Holsteins

Rachel Rupp , Didier Boichard
Journal of Dairy Science, 1999, 82, pp.2198-2204
Article dans une revue hal-02684246 v1
Image document

Alternative models for QTL detection in livestock. III. Heteroskedastic model and models corresponding to several distributions of the QTL effect

B. Goffinet , P. Le Roy , D. Boichard , J.M. Elsen , B. Mangin
Genetics Selection Evolution, 1999, 31, pp.341-350
Article dans une revue hal-00199755 v1
Image document

Analyse de la connexion en population bovine Holstein française

E. Hanocq , D. Boichard
Genetics Selection Evolution, 1999, 31, pp.163-176
Article dans une revue hal-00199745 v1
Image document

Alternative models for QTL detection in livestock. I. General introduction

J.M Elsen , B. Mangin , B. Goffinet , D. Boichard , P. Le Roy
Genetics Selection Evolution, 1999, 31, pp.213-224
Article dans une revue hal-00198289 v1
Image document

Alternative models for QTL detection in livestock. I. General introduction

Jean Michel J. M. Elsen , Brigitte B. Mangin , Bruno B. Goffinet , Didier Boichard , Pascale P. Le Roy
Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (3), pp.213-224
Article dans une revue hal-02691740 v1

Alternative models for QTL detection in livestock. I. General introduction

Jean Michel J. M. Elsen , Brigitte B. Mangin , Bruno B. Goffinet , Didier Boichard , Pascale P. Le Roy
Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (3), pp.213-224
Article dans une revue hal-00489909 v1
Image document

Alternative models for QTL detection in livestock. I. General introduction

J.M. Elsen , B. Mangin , B. Goffinet , D. Boichard , P. Le Roy
Genetics Selection Evolution, 1999, 31, pp.213-224
Article dans une revue hal-00199719 v1
Image document

Alternative models for QTL detection in livestock. II. Likelihood approximations and sire marker genotype estimations

Brigitte B. Mangin , Bruno B. Goffinet , Pascale P. Le Roy , Didier Boichard , Jean Michel J. M. Elsen
Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (3), pp.225-237
Article dans une revue hal-02689378 v1
Image document

Connectedness in the French Holstein cattle population

Eric Hanocq , Didier Boichard
Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (2), pp.163-176
Article dans une revue hal-00894260 v1

Alternative models for QTL detection in livestock. I. General introduction

Jean Michel J. M. Elsen , Brigitte B. Mangin , Bruno B. Goffinet , Didier Boichard , Pascale P. Le Roy
Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (3), pp.213-224
Article dans une revue hal-00490772 v1

Mapping quantitative trait loci for milk production and health of dairy cattle in a large Outbred pedigree

Q. Zhang , Didier Boichard , I. Hoeschele , C. Ernst , Andre A. Eggen et al.
Genetics, 1998, 149, pp.1959-1973
Article dans une revue hal-02689501 v1

Exclusion of bovine chromosome 20 as candidate region for spinal muscular atrophy (SMA)

Andre A. Eggen , M. Pfister-Genskow , Didier Boichard , R. Fries , M.D. Bishop
Animal Genetics, 1998, 29, 1 p
Article dans une revue hal-02692447 v1
Image document

Utilisation des marqueurs moléculaires en génétique animale

Didier Boichard , Pascale P. Le Roy , Hubert Levéziel , Jean Michel J. M. Elsen
Productions Animales, 1998, 11 (1), pp.67-80
Article dans une revue hal-02697433 v1
Image document

The value of using probabilities of gene origin to measure genetic variability in a population

D Boichard , L Maignel , E Verrier
Genetics Selection Evolution, 1997, 29 (1), pp.5-23
Article dans une revue hal-00894153 v1
Image document

Intérêt des probabilités d'origine de gène pour mesurer la variabilité génétique d'une population

Didier Boichard , L. Maignel , Etienne Verrier
Genetics Selection Evolution, 1997, 29 (1), pp.5-23
Article dans une revue hal-02696781 v1
Image document

A simulation study of the effect of connectedness on genetic trend

Eric Hanocq , Didier Boichard , Jean Louis J. L. Foulley
Genetics Selection Evolution, 1996, 28 (1), pp.67-82
Article dans une revue hal-02683792 v1
Image document

A simulation study of the effect of connectedness on genetic trend

E Hanocq , D Boichard , Jl Foulley
Genetics Selection Evolution, 1996, 28 (1), pp.67-82
Article dans une revue hal-00894121 v1
Image document

Analyse généalogique des races bovines laitières françaises

Didier Boichard , L. Maignel , Etienne Verrier
Productions Animales, 1996, 9 (5), pp.323-335
Article dans une revue hal-02698548 v1

Three methods to validate the estimation of genetic trend for dairy cattle

Didier Boichard , Bernard B. Bonaiti , Anne Barbat , Sophie Mattalia
Journal of Dairy Science, 1995, 78, pp.431-437
Article dans une revue hal-02700376 v1

Analyse génétique du taux de conception en population Holstein

Didier Boichard , Eduardo Manfredi
Elevage et Insémination, 1995, 269, pp.1-11
Article dans une revue hal-02705616 v1

L'anomalie BLAD chez les bovins Holstein

Didier Boichard , Yves Amigues
INRA Mensuel, 1995, 84-85, pp.3-4
Article dans une revue hal-02701936 v1

Comparaison de 2 méthodes de précorrection des lactations courtes pour l'évaluation des reproducteurs laitiers

Anne Barbat , Bernard B. Bonaiti , Didier Boichard
Annales de zootechnie, 1995, 44, pp.161-172
Article dans une revue hal-02710463 v1

Restricted maximum likelihood estimates of genetic parameters of adult male and female Rhode Island Red chickens divergently selected for residual feed consumption

Michèle Tixier-Boichard , Didier Boichard , Eildert Groeneveld , André A. Bordas
Poultry Science, 1995, 74, pp.1245-1252
Article dans une revue hal-02702861 v1
Image document

Comparaison de 2 méthodes de précorrection des lactations courtes pour l'évaluation des reproducteurs laitiers

A Barbat , B Bonaïti , D Boichard
Annales de zootechnie, 1995, 44 (2), pp.161-172
Article dans une revue hal-00889175 v1

Genetic analysis of conception rate in french Holstein cattle

Didier Boichard , Eduardo Manfredi
Acta Agriculturae Scandinavica, Section A - Animal Science, 1994, 44, pp.138-145
Article dans une revue hal-02714612 v1
Image document

Méthodes mathématiques pour l'étude des gènes contrôlant des caractères quantitatifs

B Goffinet , J Beckmann , D Boichard , M Causse , A Charcosset et al.
Genetics Selection Evolution, 1994, 26 (Suppl1), pp.9s-20s
Article dans une revue hal-00894051 v1
Image document

Methodes mathematiques pour l'etude des genes controlant des caracteres quantitatifs

Bruno B. Goffinet , Jacques Beckmann , Didier Boichard , Mathilde M. Causse , Alain A. Charcosset et al.
Genetics Selection Evolution, 1994, 26 (suppl. 1), pp.9s-20s
Article dans une revue hal-02712662 v1
Image document

Effet du croisement Holstein sur les caractères laitiers en population Pie Noir

Didier Boichard , Bernard B. Bonaiti , Anne Barbat
Productions Animales, 1993, 6 (1), pp.25-30
Article dans une revue hal-02713979 v1

Problems arising with genetic trend estimation in dairy cattle

Bernard B. Bonaiti , Didier Boichard , Anne Barbat , Sophie Mattalia
Bulletin - International Bull Evaluation Service, 1993, 8, 8 p
Article dans une revue hal-02700050 v1
Image document

Multivariate restricted maximum likelihood estimation of genetic parameters for growth, carcass and meat quality traits in French Large White and French Landrace pigs

Alain Ducos , Jean Pierre Bidanel , Vincent Ducrocq , Didier Boichard , Eildert Groeneveld
Genetics Selection Evolution, 1993, 25 (5), pp.475-493. ⟨10.1051/gse:19930506⟩
Article dans une revue hal-02700795 v1
Image document

Multivariate restricted maximum likelihood estimation of genetic parameters for growth, carcass and meat quality traits in French Large White and French Landrace pigs

A Ducos , Jean Pierre Bidanel , Vincent Ducrocq , D Boichard , E Groeneveld
Genetics Selection Evolution, 1993, 25 (5), pp.475-493
Article dans une revue hal-00894010 v1
Image document

Effet du croisement Holstein sur les caractères laitiers en population Pie Noir

D. Boichard , B. Bonaïti , Anne Barbat
Productions Animales, 1993, 6 (1), pp.25-30
Article dans une revue hal-00896039 v1

Effect of Holstein crossbreeding in the french black and white cattle population

Didier Boichard , Bernard B. Bonaiti , Anne Barbat
Journal of Dairy Science, 1993, 76 (4), pp.1157-1162
Article dans une revue hal-02700307 v1

Approximate accuracy of genetic evaluation under a single-trait animal model

Didier Boichard , A.J. Lee
Journal of Dairy Science, 1992, 75 (3), pp.868-877
Article dans une revue hal-02708078 v1
Image document

A criterion for measuring the degree of connectedness in linear models of genetic evaluation

Jean Louis J. L. Foulley , Eric Hanocq , Didier Boichard
Genetics Selection Evolution, 1992, 24 (4), pp.315-330
Article dans une revue hal-02712848 v1
Image document

Apports actuels et futurs des marqueurs génétiques dans l’amélioration des populations animales. Sélection assistée par marqueurs

Claude Chevalet , Didier Boichard
Productions Animales, 1992, 1992, pp.291-294
Article dans une revue hal-02701758 v1
Image document

Le modèle sous-jacent à l'évaluation des valeurs génétiques

D. Boichard , B. Bonaïti , Anne Barbat , Michèle Briend
Productions Animales, 1992, hs (hs), pp.185-195
Article dans une revue hal-00896015 v1

Use of an animal model for genetic evaluation of the Lacaune dairy sheep

Francis F. Barillet , Didier Boichard , Anne Barbat , J.M. Astruc , Bernard B. Bonaiti
Livestock Production Science, 1992, 31, pp.287-299
Article dans une revue hal-02700845 v1
Image document

Approximate restricted maximum likelihood and approximate prediction error variance of the Mendelian sampling effect

Didier Boichard , L.R. Schaeffer , A.J. Lee
Genetics Selection Evolution, 1992, 24 (4), pp.331-343
Article dans une revue hal-02712132 v1

Genetics of growth, feed intake, and milk yield in Holstein cattle

A.J. Lee , D.A. Boichard , A.J. Mcallister , C.Y. Lin , K. Nadarajah et al.
Journal of Dairy Science, 1992, 75, pp.3145-3154
Article dans une revue hal-02707412 v1

Apres IF2 : une nouvelle methode pour evaluer la genetique des caprins laitiers

Didier Boichard , Eduardo Manfredi , Agnès Piacere , J.P. Sigwald , Bernard B. Bonaiti
La chèvre, 1992, 192, pp.16-19
Article dans une revue hal-02715173 v1
Image document

Sélection assistée par marqueurs

C. Chevalet , D. Boichard
Productions Animales, 1992, hs (hs), pp.291-294
Article dans une revue hal-00896034 v1
Image document

Utilisation des marqueurs pour localiser les gènes responsables de la variabilité des caractères quantitatifs (QTL)

C. Chevalet , D. Boichard
Productions Animales, 1992, hs (hs), pp.287-290
Article dans une revue hal-00896033 v1
Image document

A criterion for measuring the degree of connectedness in linear models of genetic evaluation

Jl Foulley , E Hanocq , D Boichard
Genetics Selection Evolution, 1992, 24 (4), pp.315-330
Article dans une revue hal-00893960 v1
Image document

Approximate restricted maximum likelihood and approximate prediction error variance of the Mendelian sampling effect

D Boichard , Lr Schaeffer , Aj Lee
Genetics Selection Evolution, 1992, 24 (4), pp.331-343
Article dans une revue hal-00893961 v1
Image document

L'évaluation des reproducteurs. Le modèle sous-jacent à l'estimation des valeurs génétiques

Didier Boichard , Bernard B. Bonaiti , Anne Barbat , Michèle Briend
Productions Animales, 1992, 1992, pp.185-195
Article dans une revue hal-02713922 v1
Image document

Apports actuels et futurs des marqueurs génétiques dans l’amélioration des populations animales. Utilisation de marqueurs pour localiser les gènes responsables de la variabilité des caractères quantitatifs

Claude Chevalet , Didier Boichard
Productions Animales, 1992, 1992, pp.287-290
Article dans une revue hal-02702146 v1

Etude des possibilites d'allegement du controle laitier officiel chez les caprins

N. Bouloc , Francis F. Barillet , Didier Boichard , J.P. Sigwald , G. Bridoux
Annales de zootechnie, 1991, 40, pp.125-139
Article dans une revue hal-02713772 v1

Approximate prediction error variance of breeding values under an animal model

Didier Boichard , A.J. Lee
Journal of Animal Science, 1991, 69, pp.188
Article dans une revue hal-02701193 v1
Image document

Étude des possibilités d'allègement du contrôle laitier officiel chez les caprins

N Bouloc , F Barillet , D Boichard , Jp Sigwald , G Bridoux
Annales de zootechnie, 1991, 40 (2), pp.125-139
Article dans une revue hal-00888741 v1

Approximate error variance of the mendelian sampling effect

Didier Boichard , L.R. Schaeffer , A.J. Lee
Journal of Dairy Science, 1991, 74, pp.160
Article dans une revue hal-02702526 v1

Classification of lactation curves in goat

N. Bouloc , Didier Boichard
Journal of Dairy Science, 1991, 74, pp.230
Article dans une revue hal-02706388 v1

A pseudo absorption strategy for solving animal model equations for large data files

Vincent Ducrocq , Didier Boichard , Bernard B. Bonaiti , Anne Barbat , Marie-Madeleine Briend
Journal of Dairy Science, 1990, 73, pp.1945-1955
Article dans une revue hal-02711251 v1

Estimation of the economic value of conception rate in dairy cattle

Didier Boichard
Livestock Production Science, 1990, 24, pp.187-204
Article dans une revue hal-02700811 v1
Image document

La méthode française d'évaluation génétique des reproducteurs laitiers

B. Bonaiti , D. Boichard , E. Verrier , Vincent Ducrocq , A. Barbat et al.
Productions Animales, 1990, 3 (2), pp.83-92
Article dans une revue hal-00895891 v1
Image document

La méthode française d'évaluation génétique des reproducteurs laitiers

Bernard B. Bonaiti , Didier Boichard , E. Verrier , Vincent Ducrocq , Anne Barbat et al.
Productions Animales, 1990, 3 (2), pp.83-92
Article dans une revue hal-02701222 v1
Image document

Paramètres génétiques des caractères de production laitière en première lactation dans les races caprines Alpine et Saanen.

Didier Boichard , N. Bouloc , G. Ricordeau , Agnès Piacere , Francis F. Barillet
Genetics Selection Evolution, 1989, 21 (2), pp.205-215
Article dans une revue hal-02726674 v1
Image document

Genetic parameters for first lactation dairy traits in the Alpine and Saanen goat breeds

D. Boichard , N. Bouloc , G. Ricordeau , A. Piacere , F. Barillet
Genetics Selection Evolution, 1989, 21 (2), pp.205-215
Article dans une revue hal-00893797 v1
Image document

Impact économique d'une mauvaise fertilité chez la vache laitière

D. Boichard
Productions Animales, 1988, 1 (4), pp.245-252
Article dans une revue hal-00895838 v1
Image document

Impact économique d'une mauvaise fertilité chez la vache laitière

Didier Boichard
Productions Animales, 1988, 1 (4), pp.245-252
Article dans une revue hal-02719181 v1

Studies on dairy production of milking ewes I. - Estimates of genetic parameters for total milk composition and yield

Francis F. Barillet , Didier Boichard
Genetics Selection Evolution, 1987, 19 (4), pp.459-474
Article dans une revue hal-00487150 v1

Studies on dairy production of milking ewes I. - Estimates of genetic parameters for total milk composition and yield

Francis F. Barillet , Didier Boichard
Genetics Selection Evolution, 1987, 19 (4), pp.459-474
Article dans une revue hal-00490732 v1

Studies on dairy production of milking ewes I. - Estimates of genetic parameters for total milk composition and yield

Francis F. Barillet , Didier Boichard
Genetics Selection Evolution, 1987, 19 (4), pp.459-474
Article dans une revue hal-00487467 v1

Etude des facteurs de variation des parametres de croissance des agneaux de race barbarine

Gley Khaldi , Didier Boichard , L. Tchamitchian , . Inra
Annales de l'Institut National de la Recherche Agronomique de Tunisie, 1987, 60 (5), pp.5-18
Article dans une revue hal-02720645 v1

Studies on dairy production of milking ewes I. - Estimates of genetic parameters for total milk composition and yield

Francis F. Barillet , Didier Boichard
Genetics Selection Evolution, 1987, 19 (4), pp.459-474
Article dans une revue hal-00489871 v1

Genetic parameters for first lactation dairy traits in Friesian, Montbéliarde and Normande breeds

Didier Boichard , Bernard B. Bonaiti
Genetics Selection Evolution, 1987, 19 (3), pp.337-350
Article dans une revue hal-00490574 v1
Image document

Studies on dairy production of milking ewes I. - Estimates of genetic parameters for total milk composition and yield

Francis F. Barillet , Didier Boichard
Genetics Selection Evolution, 1987, 19 (4), pp.459-474
Article dans une revue hal-02718045 v1
Image document

Paramètres génétiques des caractères de production laitière en première lactation dans les races bovines Frisonne, Montbéliarde et Normande

Didier Boichard , Bernard B. Bonaiti
Genetics Selection Evolution, 1987, 19 (3), pp.337-350
Article dans une revue hal-02720500 v1
Image document

Studies on dairy production of milking ewes I. - Estimates of genetic parameters for total milk composition and yield

F. Barillet , D. Boichard
Génétique sélection évolution, 1987, 19 (4), pp.459-474
Article dans une revue hal-00893737 v1
Image document

Genetic parameters for first lactation dairy traits in Friesian, Montbéliarde and Normande breeds

D. Boichard , B. Bonaïti
Génétique sélection évolution, 1987, 19 (3), pp.337-350
Article dans une revue hal-00893728 v1

Studies on dairy production of milking ewes I. - Estimates of genetic parameters for total milk composition and yield

Francis F. Barillet , Didier Boichard
Genetics Selection Evolution, 1987, 19 (4), pp.459-474
Article dans une revue hal-00490307 v1

Relation entre production et fertilité chez la vache laitière.

Didier Boichard
Elevage et Insémination, 1986, 213, pp.15-23
Article dans une revue hal-02725667 v1

Amélioration génétique de la composition du lait des brebis, des chèvres et des vaches

Francis F. Barillet , Bernard B. Bonaiti , Didier Boichard
Lait, 1986
Article dans une revue hal-02717193 v1
Image document

Génétique des animaux d'élevage

Gisèle Alexandre , Jean Pierre Bidanel , Didier Boichard , Coralie Danchin-Burge , Alain Ducos et al.
Etienne Verrier; Denis Milan; Claire Rogel-Gaillard. Quae, pp.288, 2020, Savoir faire, 978-2-7592-3099-0
Ouvrages hal-04751553 v1

Relationship between milk somatic cell counts in the first lactation and clinical mastitis occurrence in the second lactation of French Holstein cows

Rachel Rupp , F. Beaudeau , Henri H. Seegers , Didier Boichard
4 p., 2000
Ouvrages hal-02840164 v1

Approximate multitrait BLUP evaluation to combine functional traits information

J Jacques J. J. Colleau , Vincent Ducrocq , Didier Boichard , Helene H. Larroque
7 p., 1999
Ouvrages hal-02839886 v1

Prise en compte des hétérogénéités de variance dans l'évaluation génétique bovine laitière française

Didier Boichard , Christèle Robert-Granié , Anne Barbat , Bernard B. Bonaiti , . Institut de L'Elevage
INRA Editions, 15 p., 1999
Ouvrages hal-02835321 v1

Génétique de la reproduction et des qualités maternelles chez les ruminants

Loys L. Bodin , Jean Michel J. M. Elsen , Eric Hanocq , Dominique Francois , Daniel Lajous et al.
20 p., 1998
Ouvrages hal-02841823 v1

Logiciel d'analyse de généalogies adapté à de grandes populations

Didier Boichard
12 p., 1997
Ouvrages hal-02834589 v1

Programme DF-REML : description et notice d'utilisation

Didier Boichard
16 p., 1994
Ouvrages hal-02844350 v1

Projet Le Pin 5 : detection de genes majeurs pour la qualite du lait a l'aide de marqueurs moleculaires

J Jacques J. J. Colleau , Didier Boichard
8 p., 1993
Ouvrages hal-02846300 v1

Nouvelles modalités de diffusion de la génétique (chapitre 12)

D Boichard
Claire Rogel-Gaillard, Denis Milan et Etienne Verrier. Génétique des animaux d'élevage. Diversité et adaptation dans un monde changeant, Edition Quae, 2020
Chapitre d'ouvrage hal-03155463 v1
Image document

Development of dairy breeding programmes

Didier Boichard
Advances in breeding of dairy cattle, 72, Burleigh Dodds Science Publishing, 2019, Burleigh Dodds Series in Agricultural Science, 978 1 78676 296 2 PDF: 978-1-78676-299-3 ePub: 978-1-78676-298-6. ⟨10.19103/AS.2019.0058.28⟩
Chapitre d'ouvrage hal-02788520 v1
Image document

Quel futur pour l’amélioration génétique chez les espèces animales domestiques ?

Didier Boichard , Pascal Croiseau , Sebastien Fritz , Vincent Ducrocq
Potentiels de la science pour l’avenir de l’agriculture, de l’alimentation et de l’environnement, Académie d'Agriculture, 2014
Chapitre d'ouvrage hal-01193805 v1

La révolution génomique animale : La sélection chez les animaux d’élevage - Partie 1. Du phénotype au polymorphisme

Didier Boichard , Christel Marie-Etancelin , Mickaël Brochard , François Guillaume , Sophie Mattalia et al.
La révolution génomique animale : La sélection chez les animaux d’élevage, France Agricole, 2011, 978-2-85557-181-2
Chapitre d'ouvrage hal-01193669 v1

La détection des QTL chez les bovins laitiers, premiers résultats de l'expérience réalisée sur le domaine expérimental animal du Pin-au-Haras.

Helene H. Larroque , Yves Y. Gallard , Didier Boichard , J Jacques J. J. Colleau
Brochure Technique Prairiales Normandie, Le Pin, 2004, Inconnu
Chapitre d'ouvrage hal-02828982 v1