
Emilie Dordet-Frisoni
- Innovations Thérapeutiques et Résistances (InTheRes)
Présentation
Chargé de recherche INRAE UMR 1436 INTHERES INRA/ENVT, Toulouse
Microbiologiste spécialisée dans les transferts horizontaux de gènes et leur rôle dans l’adaptation hôte-pathogène et la résistance aux antibiotique Mes recherches sur les mycoplasmes pathogènes de ruminants ont porté sur l’identification des facteurs génétiques impliqués dans la virulence, la spécificité d’hôte et la colonisation. J’ai contribué à élucider les mécanismes de transfert horizontal de gènes et à comprendre leur impact sur l’évolution et l’adaptation de ces pathogènes minimaux.
Actuellement, je m'intéresse à la dynamique des génomes de staphylocoques, en particulier Staphylococcus aureus, et à l'impact des éléments génétiques mobiles dans la diffusion et l'émergence de la résistance aux antibiotiques. Je combine génomique comparative, transcriptomique, microbiologie classique et modèles organotypiques innovants pour analyser les interactions complexes entre staphylocoques et leur environnement.Mon objectif est d’identifier les mécanismes génétiques et environnementaux favorisant la dissémination des gènes de résistance et de développer des stratégies innovantes pour limiter leur propagation.
ADRESSE : INTHERES, École Nationale Vétérinaire de Toulouse 23 chemin des Capelles 31300 Toulouse, France
FORMATION
- Doctorat en Sciences des Aliments, spécialité Microbiologie – 2007 (Université Blaise Pascal, Clermont-Ferrand)
- Master 2 en Nutrition et Sciences des Aliments, spécialité Sciences des Aliments – 2003 (Université Blaise Pascal, Clermont-Ferrand)
- Licence en Biologie Cellulaire et Physiologie-Microbiologie – 2000 (Université Paul Sabatier, Toulouse III)
PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Publications : 30 articles dont 29 listés au Web of science Nombre total de citations (sans auto-citations) : >360
**PROJETS FINANCÉS **
- ATBR-SOL PR-EST, ANSES (2025-2028, 200k€), WP leader, coordinatrice M. Barret (ESAT, INPT, Toulouse) « Déterminants de sélection ou d’atténuation de l’AnTiBioRésistance lors du retour au SOL de produits résiduaires organiques. »
- STABLY ANR PRME (2024-2027, 348.5k€), coodinatrice « Stabilité des plasmides porteurs de résistance aux antibiotiques de Staphylococcus aureus dans divers environnements, décryptage du secret de leur persistance ».
- HOSP_ATB PR-EST, ANSES (2022-2025, 200k€), WP leader, coordinatrice D.. Bibbal «Etude de l'impact d’eaux usées hospitalières sur la dissémination de résistance aux antibiotiques dans les eaux usées ».
- StaRec BQR ENVT (2022-2023, 10k€), coordinatrice, « Construction d’un « Staphylocoque enregistreur » pour l’étude de la dynamique des flux de gènes bactériens. »
- StaRec PG AAP SA INRAE (2022-2023, 10k€), coordinatrice « Le « Staphylocoque enregistreur » un outil innovant pour l’étude de la dynamique des flux de gènes bactériens. «
- ANIMEX BQR ENVT (2020-2022, 12 k€), WP leader, coordinateur A. Lion, IHAP Toulouse « Cultures organotypiques : une approche innovante pour l'étude des interactions hôtes-agents pathogènes. »
- MYCOTROP BQR ENVT (2016-2018, 10 k€), coordinatrice, « Tropisme tissulaire des mycoplasmes de ruminants : à la recherche de facteurs chromosomiques impliqués dans la dissémination et la colonisation. »
- MYHOTE JC DEPARTEMENT SA (2016-2018, 10 k€), coordinatrice « Facteurs impliqués dans la spécificité d’hôte et la colonisation chez les mycoplasmes de ruminants : apport de la génomique comparative ».
ACTIVITES D’ENSEIGNEMENT
2017-2024 Master 2 Microbiologie Moléculaire, Université de Toulouse III – Enseignant vacataire 2014-2015 Professeure agrégée remplaçante (400h/an) 2008-2010 Responsable d’enseignement Université de Lausanne (80h/an) effectif 60 étudiants 2003-2006 Monitorat Polytech’Clermont, Université Blaise Pascal, Clermont II. (96h/an) effectif 100 étudiants
AUTRES RESPONSABILITES
- Membre élue du Conseil Scientifique du département de Santé Animale INRAE (depuis 2025)
- Membre élue du Conseil de Gestion du département de Santé Animale INRAE (2021-2024)
- Organisation d’évènements scientifiques : Journées Scientifiques ENVT (2024-2025), SA (2018), 19èmenuit européenne des chercheurs Toulouse (2023)
- Responsable de l’animation scientifique unités INTHERES, IHAP (depuis 2018)
- Membre du conseil scientifique de l’école doctorale BSB Toulouse (2018-2020)
- Membre du comité scientifique de la structure fédérative de recherche B2S (Biologie et Biotechnologie pour la Santé) de Toulouse (depuis 2021)
- Direction de thèse (2), Encadrement de thèse (6), de Master (14), de personnel en CDD (4)
Domaines de recherche
Compétences
Publications
Publications
Mobile genetic elements in Staphylococcus aureus, vectors of antibiotic resistanceESKAPE-2025, SCIREASE PVT LTD, Feb 2025, On-line event, United States
Communication dans un congrès
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Dynamics of Bacterial Genomes and Evolution "Between Chance and Necessity"...Séminaire interne Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), conférence invitée, Maria-Halima LAABERKI, Nov 2024, Lyon, France
Communication dans un congrès
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Association between Mobilome and Resistome in Staphylococcus aureus: Uncovering Hidden Reservoirs of Antibiotic ResistanceMicrobes SFM, Société Française de Microbiologie, Oct 2024, Lille, France
Communication dans un congrès
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Les éléments génétiques mobiles chez Staphylococcus aureus : vecteurs de l’antibiorésistanceSysmic Centre de biologie integrative, conférence invitée, Ambre Jousselin, Dec 2023, TOULOUSE, France
Communication dans un congrès
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Les éléments génétiques mobiles chez Staphylococcus aureus : vecteurs de l’antibiorésistanceColloque Staphosium, Nov 2023, Lyon, France
Communication dans un congrès
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Mobile genetic elements in Staphylococcus aureus : vectors of antibiotic resistanceStaphosium, Société Française de Microbiologie-GT Staph, Nov 2023, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-04734779
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RIG-I/MDA5 activation upon Influenza D virus infection impairs the pro-inflammatory and antibacterial response triggered during secondary Mycoplasma bovis superinfection18th Negative Strand Virus, Jun 2022, Braga, Portugal
Communication dans un congrès
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Mycoplasma conjugative chromosomal transfer: Influence of the antibiotic on the extent of genome mosaicismMICROBES 15ème congrès national de la SFM, Société française de la microbiologie (SFM), Sep 2019, Paris, France
Communication dans un congrès
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In mycoplasma, horizontal chromosomal transfer could accelerate the emergence of antimicrobial resistance22th Congress of the International Organization for Mycoplasmology (IOM), IOM, Jul 2018, Portsmouth, New Hampshire, United States
Communication dans un congrès
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The myth of codon optimisation: Higher exogenous protein expression in U. parvum, M. agalactiae, and M. capricolum when the lowest frequency codons were sporadically introduced22th Congress of the International Organization for Mycoplasmology (IOM 2018), IOM, Jul 2018, Portsmouth, United States
Communication dans un congrès
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Horizontal distributive transfers and the extraordinary plasticity of the mycoplasma genome22th Congress of the International Organization for Mycoplasmology (IOM), IOM, Jul 2018, Portsmouth, New Hampshire, United States
Communication dans un congrès
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Mutualisation de l’information génétique chez les mycoplasmes : une stratégie « open source » pour des génomes minimaux7ème Colloque international francophone de Microbiologie animale (CIFMA), Mar 2017, Liège, Belgique
Communication dans un congrès
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Functional genomics of the Mycoplasma agalactiae Integrative Conjugative Element (ICEA)21th Congress of the International Organization for Mycoplasmology (IOM), Jul 2016, Brisbane, Australia
Communication dans un congrès
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Large chromosomal replacements occur in vitro within and among ruminant mycoplasmas via an unconventional mechanism involving conjugation and homologous recombinationIOM 2014 - 20. Congress of the International Organization for Mycoplasmology, Jun 2014, Blumenau, Brazil
Communication dans un congrès
hal-02796081
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Wide dispersal and diversity of integrative conjugative elements within ruminant MycoplasmasIOM 2014 – 20th Congress of the International Organization for Mycoplasmology, Jun 2014, Blumenau, Brazil
Communication dans un congrès
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Evolutionary history of contagious bovine pleuropneumonia using Next generation sequencing of <em>Mycoplasma mycoides</em> subsp.<em> mycoides</em> “small colonyIOM 2014 - 20. Congress of the International Organization for Mycoplasmology, Jun 2014, Blumenau, Brazil
Communication dans un congrès
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L’entrée en formation ou en emploi : des transitions identitaires difficiles pour les publics 16-25, un défi d’accompagnement « à la réflexivité » pour les professionnel-le-sJournée départementale des Missions Locales du Val de Marne "Comment penser l’orientation dans une société en mutation ? Enjeux, pratiques & perspectives", Jun 2013, L'Haÿ-les-Roses, France
Communication dans un congrès
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Genetic diversity of S.aureus in asymptomatic carriers, and nasal metagenome analysis in carriers and non carriers15th Symposium International sur les Staphylocoques et Infections Staphylococciques (ISSSI), Aug 2012, Lyon, France
Communication dans un congrès
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Changing paradigm on the evolution of Mycoplasmas by exploring their pan-genome.112th General meeting of American society for Microbiology (ASM), Jun 2012, San Franscisco, United States
Communication dans un congrès
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Transposon-mediated gene-delivery to Ureaplasma parvum: development of a powerful tool for tracking infection and for functional genomic studies19th Congress of the International Organization for Mycoplasmology (IOM), Jul 2012, Toulouse, France
Communication dans un congrès
hal-02933401
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Plasmid Diversity in Ruminant Mycoplasmas19th Congress of the International Organization for Mycoplasmology (IOM), Jul 2012, Toulouse, France
Communication dans un congrès
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The mycoplasma evolutive romance: a tale of DNA attraction19th Congress of the International Organization for Mycoplasmology (IOM), Jul 2012, Toulouse, France
Communication dans un congrès
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A nano-love story for kilobase exchanges…Mycoplasma European Congress (Veterinary Laboratories Agency), Jun 2011, Weybridge, United Kingdom
Communication dans un congrès
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Colony spreading on semi-solid surfaces in Staphylococcus xylosusFoodMicro, 21st International ICFMH Symposium, Evolving Microbial Food Quality and Safety, Sep 2008, Aberdeen, United Kingdom
Communication dans un congrès
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Les multiples facettes de Staphylococcus xylosus7ème Congrès de la Société Française de Microbiologie (SFM), May 2007, Nantes, France
Communication dans un congrès
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Interactions entre Staphylococcus xylosus et Lactobacillus sakei dans une matrice «saucisson» modèleColloque SFM « Interactions bactériennes dans les environnements agroalimentaires: apport des nouvelles approches », Nov 2006, Paris, France
Communication dans un congrès
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The different facets of Staphylococcus xylosus, a bacterium commonly used as meat starter2th International Symposium on Lactic Acid Bacteria, Nov 2006, San Miguel de Tucuman, Argentina
Communication dans un congrès
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Formation de biofilms par les Staphylocoques: étude de Staphylococcus xylosus C2aJournée des Microbiologistes d’Auvergne, Apr 2005, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès
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Carte physique et génétique de Staphylococcus xylosus C2a: En route pour le séquençage du génome complet !Journée des Microbiologistes d’Auvergne, Apr 2005, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès
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L'aminotransférase à chaîne latérale ramifiée de Staphylococcus carnosus responsable de la première étape du catabolisme de la leucine en composés d'arôme de salaison.6ème Congrès de la Société Française de Microbiologie (SFM), May 2004, Bordeaux, France
Communication dans un congrès
hal-02933237
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The genetics of microbial startersHandbook of Fermented Meat and Poultry, 2ème ed., Wiley-Blackwell, 528 p., 2015, 978-1-118-525269-1. ⟨10.1002/9781118522653.ch19⟩
Chapitre d'ouvrage
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Genetics of microbial startersHandbook of Fermented Meat and Poultry, Blackwell Publishing, 2007, 978-0-8138-1477-3
Chapitre d'ouvrage
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Staphylococcus xylosus : cartographie du génome et diversité génétiqueBiochimie, Biologie Moléculaire. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II; Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I, 2007. Français. ⟨NNT : 2007CLF21760⟩
Thèse
tel-00718141
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Génomes en mouvement : comment les bactéries s’adaptent, survivent et évoluentSciences du Vivant [q-bio]. Université Paul sabatier Toulouse 3, 2023
HDR
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