Erwan Quéméré

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Publications

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Eco‐evolutionary responses of a cold‐water fish (Salmo trutta) to the combined effects of an emerging pathogen and temperature

Eloïse Duval , Simon Blanchet , Lisa Jacquin , Charlotte Veyssière , Géraldine Loot et al.

Functional Ecology, 2025, 39 (8), pp.2096 - 2110. ⟨10.1111/1365-2435.70105⟩

Article dans une revue hal-05311467v1

Inter-laboratory ring test for environmental DNA extraction protocols: implications for marine megafauna detection using three novel qPCR assays

Lauren Kelly Rodriguez , Lorenzo de Bonis , Jack Mckee , James Mckenna , Teddy Urvois et al.

Metabarcoding and Metagenomics, 2025, 9, ⟨10.3897/mbmg.9.128235⟩

Article dans une revue hal-05095865v1
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Peut-on utiliser l’ADN environnemental pour le suivi quantitatif des populations de poissons migrateurs ?

Erwan Quéméré , Zoé Raphalen , Anne-Laure Besnard , Marine Vautier , Natacha Nikolic

Sciences Eaux & Territoires, 2025, 47, pp.8475. ⟨10.20870/Revue-SET.2025.47.8475⟩

Article dans une revue hal-05311443v1

When does a parasite become a disease? eDNA unravels complex host-pathogen dynamics across environmental stress gradients in wild salmonid populations

Eloïse Duval , Simon Blanchet , Erwan Quéméré , Lisa Jacquin , Charlotte Veyssière et al.

Science of the Total Environment, 2024, 946, pp.174367. ⟨10.1016/j.scitotenv.2024.174367⟩

Article dans une revue hal-04768071v1
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Spatial Patterns of Neutral and Functional Genetic Variations along Dendritic Networks of Riverscape in Brown Trout Populations

Laurine Gouthier , Eloïse Duval , Simon Blanchet , Géraldine Loot , Charlotte Veyssière et al.

Diversity, 2023, 15 (6), pp.784. ⟨10.3390/d15060784⟩

Article dans une revue hal-04180873v1

Highly Variable Densities and a Decline in Critically Endangered Golden-Crowned Sifaka (Propithecus tattersalli) Abundance from 2008–2018

Brandon Semel , Sarah Karpanty , Meredith Semel , Dean Stauffer , Erwan Quéméré et al.

International Journal of Primatology, 2023, 44, pp.94-115. ⟨10.1007/s10764-022-00314-x⟩

Article dans une revue hal-03837068v1
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Brucellosis in Alpine ibex: 10 years of research and expert assessments

Sébastien Lambert , Anne Thébault , Stéphane Anselme-Martin , Clément Calenge , Charlotte Dunoyer et al.

Médecine/Sciences, 2023, 39 (10), pp.722-731. ⟨10.1051/medsci/2023132⟩

Article dans une revue anses-04276841v1

A multifaceted index of population health to detect risk-prone populations and underlying stressors in wildlife

Eloïse Duval , Erwan Quéméré , Géraldine Loot , Lisa Jacquin , Charlotte Veyssière et al.

Biological Conservation, 2022, 274, pp.109706. ⟨10.1016/j.biocon.2022.109706⟩

Article dans une revue hal-03837981v1
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Quantifying heritability and estimating evolutionary potential in the wild when individuals that share genes also share environments

Laura Gervais , Nicolas Morellet , Ingrid David , Mark Hewison , Denis Réale et al.

Journal of Animal Ecology, 2022, 91 (6), pp.1239-1250. ⟨10.1111/1365-2656.13677⟩

Article dans une revue hal-03600994v1
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Maternal effects shape offspring physiological condition but do not senesce in a wild mammal

Louise Cheynel , Emmanuelle Gilot-Fromont , Benjamin Rey , Erwan Quéméré , François Débias et al.

Journal of Evolutionary Biology, 2021, 34 (4), pp.661-670. ⟨10.1111/jeb.13768⟩

Article dans une revue hal-03223446v1

Pathogen‐mediated selection favours the maintenance of innate immunity gene polymorphism in a widespread wild ungulate

Erwan Quéméré , Pauline Hessenauer , Maxime Galan , Marie Fernandez , Joël Merlet et al.

Journal of Evolutionary Biology, 2021, 34 (7), pp.1156-1166. ⟨10.1111/jeb.13876⟩

Article dans une revue hal-03261570v1

Urine DNA (uDNA) as a non‐lethal method for endoparasite biomonitoring

Eloïse Duval , Simon Blanchet , Lisa Jacquin , Charlotte Veyssière , Armand Lautraite et al.

Environmental DNA, 2021, 3 (5), pp.1035-1045. ⟨10.1002/edn3.228⟩

Article dans une revue hal-03334982v1
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Unraveling the dietary diversity of Neotropical top predators using scat DNA metabarcoding: A case study on the elusive Giant Otter

Erwan Quéméré , Marie Aucourd , Valérie Troispoux , Sébastien Brosse , Jérôme Murienne et al.

Environmental DNA, 2021, 3 (5), pp.889-900. ⟨10.1002/edn3.195⟩

Article dans une revue hal-03217686v1
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Pedigree‐free quantitative genetic approach provides evidence for heritability of movement tactics in wild roe deer

Laura Gervais , A.J. Mark Hewison , Nicolas Morellet , Maria Bernard , Joel Merlet et al.

Journal of Evolutionary Biology, 2020, ⟨10.1111/jeb.13594⟩

Article dans une revue hal-02622271v1
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Genetic consequences of social structure in the golden-crowned sifaka

Bárbara Parreira , Erwan Quéméré , Cécile Vanpé , Inês Carvalho , Lounès Chikhi

Heredity, 2020, 125 (5), pp.328-339. ⟨10.1038/s41437-020-0345-5⟩

Article dans une revue hal-03026878v1
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Demography and adaptation promoting evolutionary transitions in a mammalian genus that diversified during the Pleistocene

Menno Jong , Zhipeng Li , Yanli Qin , Erwan Quéméré , Karis Baker et al.

Molecular Ecology, In press, 00, ⟨10.1111/mec.15450⟩

Article dans une revue hal-02907179v1
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Genetic epidemiology of the Alpine ibex reservoir of persistent and virulent brucellosis outbreak

Erwan Quéméré , Sophie Rossi , Elodie Petit , Pascal Marchand , Joel Merlet et al.

Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.1-10. ⟨10.1038/s41598-020-61299-2⟩

Article dans une revue hal-02627770v1
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Old females rarely mate with old males in roe deer, <i>Capreolus capreolus</i>

Cécile Vanpé , Jean-Michel Gaillard , A. Hewison , Erwan Quéméré , Petter Kjellander et al.

Biological Journal of the Linnean Society, 2019, 128 (3), pp.515-525. ⟨10.1093/biolinnean/blz110⟩

Article dans une revue hal-02390022v1
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Brucella melitensis Rev.1 vaccination generates a higher shedding risk of the vaccine strain in Alpine ibex (Capra ibex) compared to the domestic goat (Capra hircus)

Claire Ponsart , Mickaël Riou , Yann Locatelli , Isabelle Jacques , Alain Fadeau et al.

Veterinary Research, 2019, 50 (1), 13 p. ⟨10.1186/s13567-019-0717-0⟩

Article dans une revue hal-02388531v1
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RAD‐sequencing for estimating genomic relatedness matrix‐based heritability in the wild: A case study in roe deer

Laura Gervais , Charles Perrier , Maria Bernard , Joel Merlet , Josephine Pemberton et al.

Molecular Ecology Resources, 2019, 19 (5), pp.1205-1217. ⟨10.1111/1755-0998.13031⟩

Article dans une revue hal-02349032v1
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Between-population differences in the genetic and maternal components of body mass in roe deer

Erwan Quéméré , J. M. Gaillard , Maxime Galan , Cécile Vanpé , Ingrid David et al.

BMC Evolutionary Biology, 2018, 18, ⟨10.1186/s12862-018-1154-9⟩

Article dans une revue hal-02626208v1

Bouquetins du Bargy et infection brucellique : que nous révèle la génétique ?

Erwan Quéméré , Sophie Rossi , Yvette Game , Elodie Petit , Maxime Galan et al.

Epidémiologie et Santé Animale, 2018, 74, pp.17-24

Article dans une revue hal-02618249v1

Vaccination anti-brucellique du bouquetin des Alpes (Capra ibex), une option pour l'assainissement du massif du Bargy ? Résultats d'une première expérimentation visant à comparer le niveau d'innocuité du vaccin REV.1 conjonctival chez le bouquetin des Alpes et la chèvre domestique (C. hircus)

Claire Ponsart , Bruno Garin-Bastuji , Mickaël Riou , Yann Locatelli , Alain Fadeau et al.

Epidémiologie et Santé Animale, 2018, 74, pp.25-42

Article dans une revue hal-02620515v1

Climate change and human colonization triggered habitat loss and fragmentation in Madagascar

Jordi Salmona , Rasmus Heller , Erwan Quéméré , Lounès Chikhi

Molecular Ecology, 2017, 26 (19), pp.5203-5222. ⟨10.1111/mec.14173⟩

Article dans une revue hal-02619381v1

Seascape and its effect on migratory life-history strategy influences gene flow among coastal brown trout (Salmo trutta) populations in the English Channel

Erwan Quéméré , Jean-Luc Baglinière , Jean-Marc Roussel , Guillaume Evanno , Philip Mcginnity et al.

Journal of Biogeography, 2016, 43 (3), pp.498-509. ⟨10.1111/jbi.12632⟩

Article dans une revue istex hal-01453890v1

Immune gene variability influences roe deer natal dispersal

Cécile Vanpé , Lucie Debeffe , Maxime Galan , A. J Mark Hewison , Jean-Michel Gaillard et al.

Oikos, 2016, 125 (12), pp.1790-1801. ⟨10.1111/oik.02904⟩

Article dans une revue istex hal-01595001v1

Reduced microsatellite heterozygosity does not affect natal dispersal in three contrasting roe deer populations

Cécile Vanpé , Lucie Debeffe , A. J. Mark Hewison , Erwan Quéméré , Jean-François Lemaître et al.

Oecologia, 2015, 177 (3), pp.631-643. ⟨10.1007/s00442-014-3139-8⟩

Article dans une revue hal-02919940v1

Immunogenetic heterogeneity in a widespread ungulate: the European roe deer (Capreolus capreolus)

E. Quemere , M. Galan , J. F. Cosson , F. Klein , S. Aulagnier et al.

Molecular Ecology, 2015, 24 (15), pp.3873-87. ⟨10.1111/mec.13292⟩

Article dans une revue istex hal-02018985v1

An improved PCR-based method for faster sex determination in brown trout [i](Salmo trutta)[/i] and Atlantic salmon [i](Salmo salar)[/i]

Erwan Quéméré , Charles Perrier , Anne-Laure Besnard , Guillaume Evanno , Jean-Luc Baglinière et al.

Conservation Genetics Resources, 2014, 6, pp.825-827. ⟨10.1007/s12686-014-0259-8⟩

Article dans une revue hal-01205112v1
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Pyrenean ptarmigans decline under climatic and human influences through the Holocene.

N. Bech , C. M. Barbu , E. Quéméré , C. Novoa , Jean-François Allienne et al.

Heredity, 2013, 111 (5), pp.402-409. ⟨10.1038/hdy.2013.62⟩

Article dans une revue hal-00843921v1
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A DNA Metabarcoding Study of a Primate Dietary Diversity and Plasticity across Its Entire Fragmented Range

E. Quemere , F. Hibert , C. Miquel , E. Lhuillier , E. Rasolondraibe et al.

PLoS ONE, 2013, 8 (3), pp.e58971. ⟨10.1371/journal.pone.0058971⟩

Article dans une revue hal-02281859v1

The demographic history of populations experiencing asymmetric gene flow: combining simulated and empirical data

I. Paz-Vinas , Erwan Quéméré , L. Chikhi , Géraldine Loot , Simon Blanchet

Molecular Ecology, 2013, 22 (12), pp.3279 - 3291. ⟨10.1111/mec.12321⟩

Article dans une revue hal-02650228v1

Genetic data suggest a natural prehuman origin of open habitats in northern Madagascar and question the deforestation narrative in this region

Erwan Quéméré , Xavier Amelot , Julie Pierson , Brigitte Crouau-Roy , Lounès Chikhi

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2012, 109 (32), pp.13028 - 13033. ⟨10.1073/pnas.1200153109⟩

Article dans une revue hal-02650919v1

Landscape genetics of an endangered primate species within its entire fragmented range

E. Quéméré , B. Crouau-Roy , C. Rabarivola , E.E.Jr. Louis , L. Chikhi

Molecular Ecology, 2010, 19, pp.1606-1621

Article dans une revue hal-00596059v1

Non invasive conservation genetics of the critically endangered golden-crowned sifaka (Propithecus tattersalli) : high diversity and significant genetic differentiation over a small range

E. Quéméré , E. Louis , A. Ribéron , L. Chikhi , B. Crouau-Roy

Conservation Genetics, 2010, 11, pp.675-687

Article dans une revue hal-00596007v1

Spatial variation in density and total size estimates in fragmented primate populations : the golden-crowned sifaka (Propithecus tattersalli)

E. Quéméré , J. Champeau , A. Besolo , E. Rasolondraibe , C. Rabarivola et al.

American Journal of Primatology, 2010, 72, pp.72-80

Article dans une revue hal-00596067v1

Non-invasive conservation genetics of the critically endangered golden-crowned sifaka (P. tattersalli) : high diversity and significant genetic differentiation over a small range.

Erwan Quéméré , Ed. Louis , Alexandre Ribéron , Lounès Chikhi , Brigitte Crouau-Roy

Conservation Genetics, 2009, pp.0. ⟨10.1007/S10592-009-9837-9⟩

Article dans une revue istex hal-00429367v1

Diving deep into kelp forest food webs using dietary DNA metabarcoding

Bonnie Bailet , Jean-Charles Leclerc , Thibaut de Bettignies , Pascal Provost , Martial Laurans et al.

AquaEcomics 2025: Exploring Aquatic Ecology through Omics, INRAE CAARTEL; Université Savoie Mont-Blanc, Mar 2025, Evian-Les-Bains, France

Communication dans un congrès hal-05311887v1

Feline ecology in French Guiana: a Participatory Sciences and molecular non-invasive approach

Niklas Tysklind , Stéphanie Barthe , Valérie Troispoux , Maxime Galan , Erwan Guichoux et al.

Labex CEBA annual meeting 2024, LabEx CEBA, Oct 2024, Cayenne, French Guiana

Communication dans un congrès hal-04736342v1

A toolbox to assess the spatio-temporal dynamics of Atlantic salmon recolonization after dam removal on the Sélune River (Normandy, France)

Emilien Lasne , François Martignac , Erwan Quéméré , Zoé Raphalen , Alan Bazin et al.

Free Flow Conference, Apr 2024, Groningen, Netherlands

Communication dans un congrès hal-05209171v1

Diving deep into kelp forest food webs using dietary DNA metabarcoding

Erwan Quéméré , Bonnie Bailet , Thibaut de Bettignies , Pascal Provost , Turpin Yannis et al.

SFE2, International Congress in Ecology and Evolution, Nov 2024, Lyon, France

Communication dans un congrès hal-05312241v1

A toolbox to assess the spatio-temporal dynamics of Atlantic salmon recolonization after dam removal on the Sélune River (Normandy, France)

Emilien Lasne , François Martignac , Erwan Quéméré , Zoé Raphalen , Morgan Druet et al.

15th International Symposium on Ecohydraulics and Fish Passage, May 2024, Quebec, Canada

Communication dans un congrès hal-05209192v1

Comparison of Rev.1 live vaccine innocuousness between Alpine ibex (<em>Capra ibex</em>) and domestic goats (<em>Capra hircus</em>): an unexpected strong species effect

Claire Ponsart , Mickaël Riou , Yann Locatelli , Alain Fadeau , M. Jay et al.

13. European Wildlife Disease Association Conference (EWDA), Aug 2018, Larissa, Greece

Communication dans un congrès hal-02735131v1

Analyse génétique et immunogénétique de la population de bouquetins (Capra ibex) du massif du Bargy en lien avec l’infection brucellique

Erwan Quéméré , Sophie Rossi , Yvette Game , Élodie Petit , Maxime Galan et al.

Journée AEEMA, May 2018, Maisons-Alfort, France

Communication dans un congrès hal-04682130v1

Vaccination anti-brucellique du bouquetin des Alpes (<em>Capra ibex</em>), une option pour l'assainissement du massif du Bargy ? Résultats d'une première expérimentation visant à comparer le niveau d'innocuité du vaccin REV.1 conjonctival chez le bouquetin des Alpes et la chèvre domestique (<em>C. hircus</em>)

Claire Ponsart , Bruno Garin-Bastuji , Mickaël Riou , Yann Locatelli , Alain Fadeau et al.

Journées de l'AEEMA 2018, Association pour l'Etude de l'Epidémiologie des Maladies Animales (AEEMA). FRA., May 2018, Maisons-Alfort, France

Communication dans un congrès hal-02787527v1

Ecologie trophique de l’écrevisse de Louisiane Procambarus clarkia et de ses prédateurs potentiels dans le marais de Brière

Jean-Marc Roussel , Jean-Marc Paillisson , Julien Cucherousset , Nicolas Poulet , Jean-Patrice Damien et al.

2ème édition des Rencontres Rennaises ‘Invasions Biologiques’, UMR CNRS 6553 ECOBIO, Nov 2013, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-01102895v1
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Diving deep into kelp forest food webs using dietary DNA metabarcoding

Bonnie Bailet , Jean‐charles Leclerc , Thibaut de Bettignies , Pascal Provost , Yannis Turpin et al.

14th International Temperate Reefs Symposium, Jul 2025, Brest, France.

Poster de conférence hal-05149858v1

Enhancing neotropical fish monitoring using dietary DNA of detrivorous natural samplers

Baptiste Bonnet , Céline Condachou , Gilles Lassalle , Anne-Laure Besnard , Jean-Marc Roussel et al.

ID-ADN : L'ADN pour identifier et suivre la biodiversité : avancées, méthodes et données pour la recherche, les collections et les politiques publiques, Nov 2025, Paris, France

Poster de conférence hal-05311964v1

New knowledge acquired from the French Alpine ibex (<i>Capra ibex</i>), a singular wild reservoir of <i>Brucella infection</i>

Claire Ponsart , Guillaume Girault , P. Marchand , S. Lambert , Erwan Quéméré et al.

72th annual brucellosis Research Conference, 2019, Chicago, United States. Congrès international (poster)

Poster de conférence hal-04952455v1

Innocuité du vaccin anti-brucellique Rev.1 chez le bouquetin des Alpes

Mickaël Riou , Claire Ponsart , Yann Locatelli , Alain Fadeau , Marine Jaÿ et al.

14. Congrès national de la Société Française de Microbiologie (SFM), Oct 2018, Paris, France. , 2018

Poster de conférence hal-02738256v1
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Coupler isotopes stables et métabarcoding alimentaire pour l’analyse des réseaux trophiques

S. Launey , Erwan Quéméré , Anne Tréguier , Jean-Marc Paillisson , A.L. Besnard et al.

2ème Colloque de Génomique Environnementale, Nov 2013, Rennes, France. , 2013

Poster de conférence hal-01103963v1