Eve Afonso

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Publications

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Defining biodiversity data

Eric Garnier , Dominique Pelletier , Philip Roche , Rodolphe Rougerie , Eve Afonso et al.

Trends in Ecology & Evolution, 2025, 40 (8), pp.731-735. ⟨10.1016/j.tree.2025.06.004⟩

Article dans une revue hal-05230422v1
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Evaluating trace elements as a conservation concern for Eurasian lynx (Lynx lynx) in Switzerland

Laurie Bedouet , Marie-Pierre Ryser-Degiorgis , Stéphanie Borel , Caroline Amiot , Eve Afonso et al.

Ecotoxicology and Environmental Safety, 2025, 298, pp.118300. ⟨10.1016/j.ecoenv.2025.118300⟩

Article dans une revue hal-05068062v1
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Assessing the role of individual foxes in environmental contamination with Echinococcus multilocularis through faecal samples

Abdou Malik da Silva , Eve Afonso , Francis Raoul , Patrick Giraudoux , Marina Mergey et al.

International Journal for Parasitology, 2024, 54 (7), pp.321-332. ⟨10.1016/j.ijpara.2024.03.003⟩

Article dans une revue hal-04603452v1
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Conservation du Rhinopithèque de Biet (Rhinopithecus bieti) et tourisme animalier : quels enjeux ?

Patrick Giraudoux , Ève Afonso , Céline Clauzel , Cécile Callou , Li Li

Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, 2024, epub, pp.1-16. ⟨10.3406/bavf.024.71106⟩

Article dans une revue hal-04757966v2
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Pervasive exposure of wild small mammals to legacy and currently used pesticide mixtures in arable landscapes

Clémentine Fritsch , Brice Appenzeller , Louisiane Burkart , Michael Coeurdassier , Renaud Scheifler et al.

Scientific Reports, 2022, 12, pp.1-23. ⟨10.1038/s41598-022-19959-y⟩

Article dans une revue hal-04193413v1
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Feeding sites promoting wildlife-related tourism might highly expose the endangered Yunnan snub-nosed monkey (Rhinopithecus bieti) to parasite transmission

Eve Afonso , Rong Fu , Amaël Dupaix , Anne-Claude Goydadin , Zhonghua Yu et al.

Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.15817. ⟨10.1038/s41598-021-95166-5⟩

Article dans une revue hal-03358485v1

Creating small food-habituated groups might alter genetic diversity in the endangered Yunnan snub-nosed monkey

Eve Afonso , Rong Fu , Amaël Dupaix , Anne-Claude Goydadin , Zhonghua Yu et al.

Global Ecology and Conservation, 2021, 26, pp.e01422. ⟨10.1016/j.gecco.2020.e01422⟩

Article dans une revue hal-03174983v1
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Prevalence of hematozoan parasites in Red Kite nestlings from France

Michael Coeurdassier , Nicolas Bassin , Thibaut Powolny , Christophe Morin , Eve Afonso

Wilson journal of ornithology, 2021, 162 (2), pp.521-527. ⟨10.1007/s10336-020-01838-w⟩

Article dans une revue hal-03278548v1
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Behavioural responses of breeding arctic sandpipers to ground-surface temperature and primary productivity

Nicolas Meyer , Loïc Bollache , Matthias Galipaud , Jérôme Moreau , François-Xavier Dechaume-Moncharmont et al.

Science of the Total Environment, 2021, 755 (2), pp.142485. ⟨10.1016/j.scitotenv.2020.142485⟩

Article dans une revue hal-02986001v1

Nest attentiveness drives nest predation in arctic sandpipers

Nicolas Meyer , Loïc Bollache , François‐xavier Dechaume‐moncharmont , Jérôme Moreau , Eve Afonso et al.

Oikos, 2020, 129 (10), pp.1481-1492. ⟨10.1111/oik.07311⟩

Article dans une revue hal-02961741v1
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Numerical response of predators to large variations of grassland vole abundance and long‐term community changes

Patrick Giraudoux , Aurélien Levret , Eve Afonso , Michael Coeurdassier , Geoffroy Couval

Ecology and Evolution, 2020, 10 (24), pp.14221-14246. ⟨10.1002/ece3.7020⟩

Article dans une revue hal-03011763v1
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Spatio-temporal trends in richness and persistence of bacterial communities in decline-phase water vole populations

Petra Villette , Eve Afonso , Geoffroy Couval , Aurélien Levret , Maxime Galan et al.

Scientific Reports, 2020, 10, pp.9506. ⟨10.1038/s41598-020-66107-5⟩

Article dans une revue hal-02876769v1
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Suivi à long-terme de la réponse numérique des prédateurs aux grandes variations d’abondance de campagnols prairiaux dans le Val d’Usiers, Massif du Jura

Patrick Giraudoux , Aurélien Levret , Eve Afonso , Michael Coeurdassier , Geoffroy Couval

Bourgogne-Franche-Comté Nature, 2020, 32, pp.151-168

Article dans une revue hal-04454453v1
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Long-term retrospective assessment of a transmission hotspot for human alveolar echinococcosis in mid-west China

Patrick Giraudoux , Yumin Zhao , Eve Afonso , Hongbin Yan , Jenny Knapp et al.

PLoS Neglected Tropical Diseases, 2019, 13 (8), ⟨10.1371/journal.pntd.0007701⟩

Article dans une revue hal-02276636v1
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Are gastrointestinal parasites associated with the cyclic population dynamics of their arctic lemming hosts?

Olivier Gilg , Loïc Bollache , Eve Afonso , Glenn Yannic , Niels Martin Schmidt et al.

International Journal for Parasitology: Parasites and Wildlife, 2019, 10, pp.6-12. ⟨10.1016/j.ijppaw.2019.06.011⟩

Article dans une revue hal-02281730v1

Spatial and temporal distribution of Yunnan snub-nosed monkey, Rhinopithecus bieti, indices

Rong Fu , Li Li , Zhonghua Yu , Eve Afonso , Patrick Giraudoux

Mammalia, 2019, 83 (2), pp.103-109. ⟨10.1515/mammalia-2017-0168⟩

Article dans une revue hal-02521009v1

Molecular detection of Anaplasma phagocytophilum DNA in the lesser horseshoe bat (Rhinolophus hipposideros) guano

E. Afonso , A.-C. Goydadin

Epidemiology and Infection, 2018, 146 (10), pp.1253 - 1258. ⟨10.1017/S0950268818001279⟩

Article dans une revue hal-01863009v1
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EWET: Data collection and interface for the genetic analysis of Echinococcus multilocularis based on EmsB microsatellite

Jenny Knapp , Sylvie Damy , Jonathan Brillaud , Jean-Daniel Tissot , Jérémy Navion et al.

PLoS ONE, 2017, 12 (10), pp.e0183849. ⟨10.1371/journal.pone.0183849⟩

Article dans une revue hal-01667697v1

Investigating Hybridization between the Two Sibling Bat Species Myotis myotis and M. blythii from Guano in a Natural Mixed Maternity Colony.

Eve Afonso , Anne-Claude Goydadin , Patrick Giraudoux , Gilles Farny

PLoS ONE, 2017, 12 (2), pp.e0170534

Article dans une revue hal-01492347v1
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Consequences of organ choice in describing bacterial pathogen assemblages in a rodent population

Petra Villette , Eve Afonso , Geoffroy Couval , Aurélien Levret , Maxime Galan et al.

Epidemiology and Infection, 2017, 145 (14), pp.3070 - 3075. ⟨10.1017/S0950268817001893⟩

Article dans une revue hal-01665928v1
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Is the lesser horseshoe bat (Rhinolophus hipposideros) exposed to causes that may have contributed to its decline? A non-invasive approach

Eve Afonso , Pierline Tournant , Jean-Christophe Foltête , Patrick Giraudoux , Pierre-Emmanuel Baurand et al.

Global Ecology and Conservation, 2016, 8, pp.123-137. ⟨10.1016/j.gecco.2016.09.002⟩

Article dans une revue hal-01368326v1

Echinococcus multilocularis in Kyrgyzstan: similarity in the Asian EmsB genotypic profiles from village populations of Eastern mole voles (Ellobius tancrei) and dogs in the Alay valley.

E Afonso , J Knapp , N Tête , G Umhang , D Rieffel et al.

Journal of Helminthology, 2015, pp.1-7

Article dans une revue hal-01175795v1

Blood parameters as biomarkers of cadmium and lead exposure and effects in wild wood mice (Apodemus sylvaticus) living along a pollution gradient

Nicolas Tête , Eve Afonso , Ghada Bouguerra , Renaud Scheifler

Chemosphere, 2015, 138, pp.940 - 946. ⟨10.1016/j.chemosphere.2014.12.031⟩

Article dans une revue hal-01377059v1

First amplification of Eimeria hessei DNA from the lesser horseshoe bat (Rhinolophus hipposideros) and its phylogenetic relationships with Eimeria species from other bats and rodents

Eve Afonso , Pierre-Emmanuel Baurand , Pierline Tournant , Nicolas Capelli

Experimental Parasitology, 2014, 139, pp.58-62. ⟨10.1016/j.exppara.2014.02.013⟩

Article dans une revue istex hal-01115204v1

Hair as a noninvasive tool for risk assessment: do the concentrations of cadmium and lead in the hair of wood mice (Apodemus sylvaticus) reflect internal concentrations?

Nicolas Tête , Eve Afonso , Nadia Crini , Séverine Drouhot , Anne-Sophie Prudent et al.

Ecotoxicology and Environmental Safety, 2014, 108, pp.233-41. ⟨10.1016/j.ecoenv.2014.07.010⟩

Article dans une revue istex hal-01115160v1
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Can Body Condition and Somatic Indices be Used to Evaluate Metal-Induced Stress in Wild Small Mammals?

Nicolas Tête , Clémentine Fritsch , Eve Afonso , Michael Coeurdassier , Jean-Claude Lambert et al.

PLoS ONE, 2013, 8 (6), pp.e66399. ⟨10.1371/journal.pone.0066399⟩

Article dans une revue hal-00925928v1

Transmission ecosystems of Echinococcus multilocularis in China and Central Asia.

Patrick Giraudoux , Francis Raoul , Eve Afonso , Iskender Ziadinov , Yurong Yang et al.

Parasitology, 2013, 140 (13), pp.1-12. ⟨10.1017/S0031182013000644⟩

Article dans une revue hal-00831986v1

Evaluating the effect of habitat connectivity on the distribution of the lesser horseshoe bat using landscape graphs

Pierline Tournant , Eve Afonso , Sébastien Roué , Patrick Giraudoux , Jean-Christophe Foltête

Biological Conservation, 2013, 164, pp.39-49. ⟨10.1016/j.biocon.2013.04.013⟩

Article dans une revue istex hal-00815304v1

Environmental determinants of spatial and temporal variations in the transmission of Toxoplasma gondii in its definitive hosts.

Eve Afonso , Estelle Germain , Marie-Lazarine Poulle , Sandrine Ruette , Sébastien Devillard et al.

International Journal for Parasitology: Parasites and Wildlife, 2013, 2, pp.278-85. ⟨10.1016/j.ijppaw.2013.09.006⟩

Article dans une revue hal-00972560v1

La génétique au service de l'étude des espèces : y a-t'il des échanges entre les colonies de petits rhinolophes en Franche-Comté ?

Pierline Tournant , Eve Afonso , Sébastien Roué , Patrick Giraudoux , Jean-Christophe Foltête

L'Azuré, 2011, 12, pp.6-7

Article dans une revue hal-00815481v1

Development of a sensitive method for Toxoplasma gondii oocyst extraction in soil.

Maud Lélu , Emmanuelle Gilot-Fromont , Dominique Aubert , Agnès Richaume , Eve Afonso et al.

Veterinary Parasitology, 2011, 183 (1-2), pp.59-67. ⟨10.1016/j.vetpar.2011.06.018⟩

Article dans une revue istex hal-00672164v1

Local meteorological conditions, dynamics of seroconversion to Toxoplasma gondii in cats ( Felis catus) and oocyst burden in a rural environment.

Eve Afonso , P. Thulliez , Emmanuelle Gilot-Fromont

Epidemiology and Infection, 2010, 138, pp.1105-1113. ⟨10.1017/S0950268809991270⟩

Article dans une revue hal-00443531v1

Seroprevalence and factors associated with Toxoplasma gondii infection in wild boar ( Sus scrofa) in a Mediterranean island.

Céline Richomme , Eve Afonso , V. Tolon , Christian Ducrot , Lénaig Halos et al.

Epidemiology and Infection, 2010, 138 (9), pp.1257-1266. ⟨10.1017/S0950268810000117⟩

Article dans une revue hal-00451029v1

Prevalence of <i>Toxoplasma Gondii</i> in small mammals from the ardennes region France

Eve Afonso , M.-L. Poulle , M. Lemoine , I. Villena , D. Aubert et al.

Folia Parasitologica, 2007, 54, pp.313-314

Article dans une revue hal-00434741v1

Transmission of <i>Toxoplasma gondii</i> in an urban population of domestic cats (<i>Felis catus</i>)

Eve Afonso , P. Thulliez , Emmanuelle Gilot-Fromont

International Journal for Parasitology, 2006, 36, pp.1373-1382

Article dans une revue hal-00428041v1

Retrospective assessment of the global decline of European bats (1940s-2010s)

Eve Afonso , Alexandra Michiels , Anne-Lyse Moreau , Anne-Claude Goydadin , Sylvie Damy et al.

International Conference on Ecological Sciences, Ecology and Evolution : New perspectives and societal challenges, Nov 2022, Metz, France

Poster de conférence hal-04986342v1
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Metabarcoding of Bacterial Pathogens in a Rodent Pest: Which Organ?

P. Villette , Eve Afonso , G Couval , A Levret , M. Galan et al.

SMBE 2016: Society for Molecular Biology and Evolution Annual Meeting, Jul 2016, Gold Coast, Australia

Poster de conférence hal-01870929v1

Spatial variability of biological and chemical contaminants in nurseries of lesser horseshoe bat : preliminary results in Franche-Comté (Eastern France)

Eve Afonso , Pierline Tournant , Renaud Scheifler , Francis Raoul , Patrick Giraudoux

The 60th Annual International Conference of the Wildlife Disease Association, Aug 2011, Québec, Canada. 2011

Poster de conférence hal-00815878v1

Caractérisation de la structure génétique spatiale des populations de petits rhinolophes en Franche-Comté

Pierline Tournant , Eve Afonso , Sébastien Roué , Patrick Giraudoux , Jean-Christophe Foltête

5èmes Rencontres Chiroptères Grand Est, Mar 2011, Lorentzen, France. http://pierlinetournant.blogspot.fr/p/communications.html, 2011

Poster de conférence hal-00815858v1

Caractérisation de la connectivité des habitats et distribution du petit rhinolophe en Franche-Comté

Pierline Tournant , Eve Afonso , Sébastien Roué , Patrick Giraudoux , Jean-Christophe Foltête

Colloque nationale d'écologie scientifique, Sep 2010, Montpellier, France. 2010

Poster de conférence hal-00815861v1

Conservation du Rhinopithèque de Biet

Eve Afonso , Cécile Callou , Céline Clauzel , Patrick Giraudoux , Li Li

Patrick Giraudoux. Socio-écosystèmes. L'indiscipline comme exigence du terrain, ISTE éditions, pp.225-258, 2022, 9781789480528

Chapitre d'ouvrage hal-03512103v1

Estimer l'impact des grandes infrastructures de transport sur la distribution des espèces : proposition et test d'un protocole méthodologique

Jean-Christophe Foltête , Xavier Girardet , Céline Clauzel , Pierline Tournant , Gilles Vuidel et al.

Luginbühl Yves. Infrastructures de transport terrestres, écosystèmes et paysages, des liaisons dangereuses, La documentation française, pp.201-218, 2013

Chapitre d'ouvrage hal-00875870v1
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The Life Cycle of <i>Toxoplasma gondii</i> in the Natural Environment

Emmanuelle Gilot-Fromont , Maud Lélu , Marie-Laure Dardé , Céline Richomme , D. Aubert et al.

Olgica Djurković Djaković. Toxoplasmosis - Recent Advances, InTech, pp.3-36, 2012, 978-953-51-0746-0. ⟨10.5772/48233⟩

Chapitre d'ouvrage hal-00820888v1

Retrospective assessment of the global decline of European bats (1940s-2010s)

Alexandra Michiels , Anne-Lyse Moreau , Anne-Claude Goydadin , Renaud Scheifler , Isabelle Jouffroy-Bapicot et al.

Historical Ecology for the Future International conference, INRA, May 2021, Metz, France

Communication dans un congrès hal-04986394v1

Parental Investment in Nest Attentiveness Reduces Nest Predation in Arctic Sandpipers

Nicolas Meyers , Olivier Gilg , Eve Afonso , Jérôme Moreau , Loïc Bollache

14th Ecology And Behaviour Conference, May 2019, Toulouse, France

Communication dans un congrès hal-02961723v1
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Bacterial Parasite Communities of the Fossorial Water Vole Arvicola terrestris During a Period of High Abundance: Richness and Similarity in a Dynamic World

Petra Villette , Eve Afonso , Geoffroy Couval , Aurélien Levret , Jean-François Cosson et al.

Rodents 2018: 6th International Conference of Rodent Biology and Management & 16th Rodens et Spatium, Sep 2018, Potsdam, Germany

Communication dans un congrès hal-01870903v1

27 year monitoring of an alveolar echinococcosis hotspot in south-Gansu

Patrick Giraudoux , Eve Afonso , Jenny Knapp , Wangzhong Jia , Hongbin Yan et al.

XXVII World Congress of Echinococcosis, Oct 2017, Algiers, Algeria

Communication dans un congrès hal-01614425v1

Non-invasive genetic tools to study wildlife populations

Eve Afonso , Renaud Scheifler , Jean-Christophe Foltête , A.-C. Goydadin , Li Li et al.

Research and methods in ecohealth and conservation, GDRI Ecosystem Health and Environmental Disease Ecology, Nov 2016, Kunming, China

Communication dans un congrès hal-01367363v1

27 year monitoring of an alveolar echinococcosis hotspot in south-Gansu

Patrick Giraudoux , Eve Afonso , Jenny Knapp , Wangzhong Jia , Hongbin Yan et al.

Research and methods in ecohealth and conservation, GDRI Ecosystem Health and Environmental Disease Ecology, Nov 2016, Kunming, China

Communication dans un congrès hal-01363734v1

New approaches to description and modeling of trophic interactions: reliable allies to study trophically-transmitted parasites?

Francis Raoul , Antoine Perasso , Virgile Baudrot , Benoit Valot , Eve Afonso et al.

Research and methods in ecohealth and conservation, GDRI Ecosystem Health and Environmental Disease Ecology, Nov 2016, Kunming, China

Communication dans un congrès hal-01367367v1

Transmission ecosystems of Echinococcus multilocularis in Eurasia, with particular reference to the Alay Valley

Patrick Giraudoux , Eve Afonso , Carole Bodin , Jenny Knapp , Francis Raoul et al.

Research Workshop: Echinococcosis in Kyrgyzstan and the Region, Nov 2014, Bishkek, Kyrgyzstan

Communication dans un congrès hal-01086211v1

Caractérisation de la structure génétique des colonies de reproduction du petit rhinolophe en Franche-Comté

Pierline Tournant , Eve Afonso , Sébastien Roué , Patrick Giraudoux , Jean-Christophe Foltête

XVIIIème Forum des Jeunes chercheurs, Sep 2012, Besançon, France

Communication dans un congrès hal-00815494v1

Spatial approach of Echinococcus multilocularis transmission ecology in continental Asia

Patrick Giraudoux , F. Raoul , Eve Afonso , Iskender Ziadinov , Yurong Yang et al.

International Symposium for Cestode Zoonosis Control, Oct 2012, Shanghai, China

Communication dans un congrès hal-00724870v1

La fragmentation du paysage peut elle expliquer le déclin du petit rhinolophe ? Utilisation de la théorie des graphes pour caractériser la connectivité de ses habitats

Pierline Tournant , Eve Afonso , Sébastien Roué , Patrick Giraudoux , Jean-Christophe Foltête

XVIIème Forum des Jeunes chercheurs, Jun 2011, Dijon, France

Communication dans un congrès hal-00815619v1

Assessing habitat connectivity of the lesser horseshoe bat using graph theory to explain its distribution

Pierline Tournant , Eve Afonso , Sébastien Roué , Patrick Giraudoux , Jean-Christophe Foltête

VIth European Congress of Mammalogy, Jul 2011, Paris, France

Communication dans un congrès hal-00610755v1

Caractérisation de la connectivité des habitats du petit rhinolophe en Franche-Comté

Pierline Tournant , Eve Afonso , Sébastien Roué , Patrick Giraudoux , Jean-Christophe Foltête

Dixième rencontres de Théo Quant, Feb 2011, Besançon, France

Communication dans un congrès hal-00815625v1
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Graphab 2

Jean-Christophe Foltête , Eve Afonso , Céline Clauzel , Xavier Girardet , Patrick Giraudoux et al.

[Rapport de recherche] ThéMA, UMR 6049; Chrono-Environnement, UMR 6249; MSHE Ledoux, USR 3124. 2015, 96 p

Rapport (rapport de recherche) hal-03106236v1

Paysage et biodiversité en Franche-Comté. Les chauves-souris peuvent-elles se maintenir durablement ? Exemple du petit rhinolophe

Jean-Christophe Foltête , Eve Afonso , Renaud Scheifler

[Rapport de recherche] Conseil Régional de Franche-Comté. 2013, pp.25

Rapport (rapport de recherche) hal-00864413v1

RHINO-URB. Impact de différents modèles de croissance urbaine sur la connectivité écologique et la dispersion génétique des populations, test sur le petit rhinolophe en Franche-Comté

Jean-Christophe Foltête , Eve Afonso , Cécile Tannier

[Rapport de recherche] Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité. 2013, pp.6

Rapport (rapport de recherche) hal-00864414v1
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Graphab

Jean-Christophe Foltête , Eve Afonso , Céline Clauzel , Xavier Girardet , Patrick Giraudoux et al.

[Rapport de recherche] N° 0001653 – 10/2008, MSHE Ledoux, USR 3124; ThéMA, UMR 6049; Chrono-Environnement, UMR 6249. 2011, 62 p

Rapport (rapport de recherche) hal-03105989v1
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ETUDE DE LA DYNAMIQUE DE LA TRANSMISSION DE TOXOPLASMA GONDII DANS DES MILIEUX CONTRASTES

Eve Afonso

Ecologie, Environnement. Université de Reims - Champagne Ardenne, 2007. Français. ⟨NNT : ⟩

Thèse tel-00371738v1