Florence Phocas

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Affiliation actuelle
  • Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI)

Présentation

Florence Phocas is an INRAE senior scientist in quantitative genetics, belonging to the Animal Genetics and Integrative Biology unit located at Jouy-en-Josas (France). All her activity is focused on research on genetic architecture of complex traits and on design of sustainable breeding schemes. After 25 years of work on beef cattle breeding schemes, she is currently working on the development of breeding schemes for fishes and insects, in particular rainbow trout and bees. Since 2021, she is co-leading the GUPPIE team working on fish and insect genetics.

Domaines de recherche

Génétique

Compétences

Génétique quantitative Génomique Statistiques Zootechnie

Publications

Publications

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How partial phenotyping to reduce generation intervals can help to increase annual genetic gain in selected honeybee populations

Tristan Kistler , Evert W Brascamp , Benjamin Basso , Florence Phocas , Piter Bijma
Article dans une revue hal-05080309 v1
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In-depth investigation of genome to refine QTL positions for spontaneous sex-reversal in XX rainbow trout

Audrey Dehaullon , Clémence Fraslin , Anastasia Bestin , Charles Poncet , Yann Guiguen et al.
PLoS ONE, 2025, 20 (5), pp.e0313464. ⟨10.1371/journal.pone.0313464⟩
Article dans une revue hal-05060447 v1
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Sequence‐Based Multi Ancestry Association Study Reveals the Polygenic Architecture of Varroa destructor Resistance in the Honeybee Apis mellifera

Sonia Eynard , Fanny Mondet , Benjamin Basso , Olivier Bouchez , Yves Le Conte et al.
Molecular Ecology, 2025, 34 (3), ⟨10.1111/mec.17637⟩
Article dans une revue hal-04866824 v1
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Screening for links between behaviour and acute hyperthermia and hypoxia resistance in rainbow trout using isogenic lines

Henri Lagarde , Delphine Lallias , Florence Phocas , Lionel Goardon , Marjorie Bideau et al.
Peer Community Journal, 2025, 5, pp.e46. ⟨10.24072/pcjournal.555⟩
Article dans une revue hal-05057569 v1
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APIS: an updated parentage assignment software managing triploids induced from diploid parents

Julien Roche , Ronan Griot , François Allal , Mathieu Besson , Pierrick Haffray et al.
Article dans une revue hal-04649084 v1
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GenoTriplo: A SNP genotype calling method for triploids

Julien Roche , Mathieu Besson , François Allal , Pierrick Haffray , Pierre Patrice et al.
PLoS Computational Biology, 2024, 20 (9), pp.e1012483. ⟨10.1371/journal.pcbi.1012483⟩
Article dans une revue hal-04754946 v1
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Uncertainty in the mating strategy of honeybees causes bias and unreliability in the estimates of genetic parameters

Tristan Kistler , Evert W Brascamp , Benjamin Basso , Piter Bijma , Florence Phocas
Genetics Selection Evolution, 2024, 56 (1), pp.30. ⟨10.1186/s12711-024-00898-3⟩
Article dans une revue hal-04550282 v1
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Genome-wide detection of positive and balancing signatures of selection shared by four domesticated rainbow trout populations (Oncorhynchus mykiss)

Katy Paul , Gwendal Restoux , Florence Phocas
Genetics Selection Evolution, 2024, 56, ⟨10.1186/s12711-024-00884-9⟩
Article dans une revue hal-04474238 v1
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Assessing the environmental impacts of conventional and organic scenarios of rainbow trout farming in France

Simon Pouil , Mathieu Besson , Florence Phocas , Joël Aubin
Journal of Cleaner Production, 2024, 456, pp.142296. ⟨10.1016/j.jclepro.2024.142296⟩
Article dans une revue hal-04639960 v1
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Genetic parameters, trends, and inbreeding in a honeybee breeding program for royal jelly production and behavioral traits

Benjamin Basso , Tristan Kistler , Florence Phocas
Apidologie, 2024, 55 (1), pp.11. ⟨10.1007/s13592-023-01055-3⟩
Article dans une revue hal-04405508 v1
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Heritability and correlations for honey yield, handling ease, brood quantity, and traits related to resilience in a French honeybee population

Tristan Kistler , Coline Kouchner , Evert W Brascamp , Charlène Dumas , Fanny Mondet et al.
Apidologie, 2024, 55 (4), pp.52. ⟨10.1007/s13592-024-01088-2⟩
Article dans une revue hal-04649085 v1
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Isogenic lines of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) as a tool to assess how growth and feeding behaviour are correlated to feed efficiency in fish

Simon Pouil , Thierry Kerneis , Edwige Quillet , Laurent Labbé , Delphine Lallias et al.
Aquaculture, 2023, 577, pp.739904. ⟨10.1016/j.aquaculture.2023.739904⟩
Article dans une revue hal-04172992 v1
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An Overview of Selection Concepts Applied to Honey Bees

Matthieu Guichard , Florence Phocas , Markus Neuditschko , Benjamin B. Basso , Benjamin Dainat
Bee World, 2023, pp.1-7. ⟨10.1080/0005772X.2022.2147702⟩
Article dans une revue hal-03944407 v1

Potential of genomic selection for growth, meat content and colour traits in mixed-family breeding designs for the Pacific oyster <em>Crassostrea gigas</em>

Antoine Jourdan , Romain Morvezen , Florian Enez , Pierrick Haffray , Adeline Lange et al.
Aquaculture, 2023, 576, pp.739878. ⟨10.1016/j.aquaculture.2023.739878⟩
Article dans une revue hal-04158060 v1
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Maternal and genetic effects on embryonic survival from fertilization to swim up stage and reproductive success in a farmed rainbow trout line

K. Paul , P. Pélissier , Lionel Goardon , Nicolas Dechamp , J. Danon et al.
Aquaculture Reports, 2023, 29, pp.101523. ⟨10.1016/j.aqrep.2023.101523⟩
Article dans une revue hal-04012991 v1
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Are resistances to acute hyperthermia or hypoxia stress similar and consistent between early and late ages in rainbow trout using isogenic lines?

H. Lagarde , Florence Phocas , Simon Pouil , Lionel Goardon , M. Bideau et al.
Aquaculture, 2023, 562, pp.738800. ⟨10.1016/j.aquaculture.2022.738800⟩
Article dans une revue hal-03778854 v1
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Genetic architecture of acute hyperthermia resistance in juvenile rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) and genetic correlations with production traits

Henri Lagarde , Delphine Lallias , Pierre Patrice , Audrey Dehaullon , Martin Prchal et al.
Genetics Selection Evolution, 2023, 55 (1), pp.39. ⟨10.1186/s12711-023-00811-4⟩
Article dans une revue hal-04125895 v1
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Whole‐genome sequencing identifies interferon-induced protein IFI6/IFI27-like as a strong candidate gene for VNN resistance in European sea bass

Emilie Delpuech , Marc Vandeputte , Romain Morvezen , Anastasia Bestin , Mathieu Besson et al.
Genetics Selection Evolution, 2023, 55, pp.30. ⟨10.1186/s12711-023-00805-2⟩
Article dans une revue hal-04116035 v1
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Genome-wide association study and genomic prediction of tolerance to acute hypoxia in rainbow trout

M Prchal , Jonathan D’ambrosio , Henri Lagarde , Delphine Lallias , P Patrice et al.
Aquaculture, 2022, 565, pp.739068. ⟨10.1016/j.aquaculture.2022.739068⟩
Article dans une revue hal-03944462 v1
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Development of a High-Density 665 K SNP Array for Rainbow Trout Genome-Wide Genotyping

Maria Bernard , Audrey Dehaullon , Guangtu Gao , Katy Paul , Henri Lagarde et al.
Frontiers in Genetics, 2022, 13, ⟨10.3389/fgene.2022.941340⟩
Article dans une revue hal-03725675 v1
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Genetic architecture and genomic selection of fatty acid composition predicted by Raman spectroscopy in rainbow trout

Carole Blay , Pierrick Haffray , Jonathan D’ambrosio , Enora Prado , Nicolas Dechamp et al.
BMC Genomics, 2021, 22 (1), pp.788. ⟨10.1186/s12864-021-08062-7⟩
Article dans une revue hal-03432316 v1
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A simulation study of a honeybee breeding scheme accounting for polyandry, direct and maternal effects on colony performance

Tristan Kistler , Benjamin B. Basso , Florence Phocas
Genetics Selection Evolution, 2021, 53 (71), 16 p. ⟨10.1186/s12711-021-00665-8⟩
Article dans une revue hal-03339391 v1
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Optimization of Genomic Selection to Improve Disease Resistance in Two Marine Fishes, the European Sea Bass (Dicentrarchus labrax) and the Gilthead Sea Bream (Sparus aurata)

Ronan Griot , François Allal , Florence Phocas , Sophie Brard-Fudulea , Romain Morvezen et al.
Frontiers in Genetics, 2021, 12, pp.665920. ⟨10.3389/fgene.2021.665920⟩
Article dans une revue hal-03360561 v1
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Identification of quantitative trait loci associated with calmness and gentleness in honey bees using whole‐genome sequences

Matthieu Guichard , Benjamin Dainat , Sonia Eynard , Alain Vignal , Bertrand Servin et al.
Animal Genetics, 2021, pp.13070. ⟨10.1111/age.13070⟩
Article dans une revue hal-03252574 v1
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Temporal and region‐specific variations in genome‐wide inbreeding effects on female size and reproduction traits of rainbow trout

Katy Paul , Jonathan d'Ambrosio , Florence Phocas
Evolutionary Applications, 2021, ⟨10.1111/eva.13308⟩
Article dans une revue hal-03533061 v1
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Genome-wide association studies for resistance to viral nervous necrosis in three populations of European sea bass (Dicentrarchus labrax) using a novel 57k SNP array DlabChip

Ronan Griot , François Allal , Florence Phocas , Sophie Brard-Fudulea , Romain Morvezen et al.
Aquaculture, 2021, 530, pp.735930. ⟨10.1016/j.aquaculture.2020.735930⟩
Article dans une revue hal-03544239 v1
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Genetic parameters and genome-wide association studies of quality traits characterised using imaging technologies in Rainbow trout, Oncorhynchus mykiss

Carole Blay , Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Jonathan D’ambrosio , Nicolas Dechamp et al.
Frontiers in Genetics, 2021, 12, pp.1-17. ⟨10.3389/fgene.2021.639223⟩
Article dans une revue hal-03154333 v1

Genetic determinism of spontaneous masculinisation in XX female rainbow trout: new insights using medium throughput genotyping and whole-genome sequencing

Clémence Fraslin , Florence Phocas , Anastasia Bestin , Mathieu Charles , Maria Bernard et al.
Scientific Reports, 2020, 10, pp.1-13. ⟨10.1038/s41598-020-74757-8⟩
Article dans une revue hal-02988446 v1

Genetic architecture and genomic selection of female reproduction traits in rainbow trout

J. D’ambrosio , Romain Morvezen , S. Brard-Fudulea , Anastasia Bestin , A. Acin Perez et al.
BMC Genomics, 2020, 21 (1), pp.1-14. ⟨10.1186/s12864-020-06955-7⟩
Article dans une revue hal-02938176 v1

Rainbow trout resistance to bacterial cold water disease: two new quantitative trait loci identified after a natural disease outbreak on a French farm

Clémence Fraslin , S. Brard‐fudulea , Jonathan d'Ambrosio , Anastasia Bestin , Mathieu Charles et al.
Animal Genetics, 2019, 50 (3), pp.293-297. ⟨10.1111/age.12777⟩
Article dans une revue hal-02166481 v1

APIS: An auto-adaptive parentage inference software that tolerates missing parents

Ronan Griot , Francois Allal , Sophie Brard-Fudulea , Romain Morvezen , Pierrick Haffray et al.
Molecular Ecology Resources, 2019, pp.1-12. ⟨10.1111/1755-0998.13103⟩
Article dans une revue hal-02434174 v1
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Quelles performances pour les animaux de demain ? Objectifs et méthodes de sélection

Pascale Le Roy , Alain Ducos , Florence Phocas
INRA Productions Animales, 2019, 32 (2), pp.233-246. ⟨10.20870/productions-animales.2019.32.2.2466⟩
Article dans une revue hal-02620617 v1
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Genome-wide estimates of genetic diversity, inbreeding and effective size of experimental and commercial rainbow trout lines undergoing selective breeding

Jonathan D’ambrosio , Florence Phocas , Pierrick Haffray , Anastasia Bestin , Sophie Brard-Fudulea et al.
Genetics Selection Evolution, 2019, 51 (1), pp.26. ⟨10.1186/s12711-019-0468-4⟩
Article dans une revue hal-02151750 v1
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Genetic analysis of calf health in Charolais beef cattle

Aurélie Vinet , Helene Leclerc , F Marquis , Florence Phocas
Journal of Animal Science, 2018, 96 (4), pp.1246-1258. ⟨10.1093/jas/sky043⟩
Article dans une revue hal-02627212 v1
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Quels programmes d'amélioration génétique des animaux pour des systèmes d'élevage agro-écologiques ?

Florence Phocas , Catherine Belloc , Joël Bidanel , Luc Delaby , Jean-Yves Dourmad et al.
INRA Productions Animales, 2017, 30 (1), pp.31-46. ⟨10.20870/productions-animales.2017.30.1.2232⟩
Article dans une revue hal-01608756 v1

Breeding beef cattle for an extended productive life: evaluation of selection criteria in the Retinta breed as example

R. Morales , Florence Phocas , M. Solé , S. Demyda-Peyrás , A. Menendez-Buxadera et al.
Livestock Science, 2017, 204, pp.115-121. ⟨10.1016/j.livsci.2017.08.014⟩
Article dans une revue hal-02622525 v1
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Review: Towards the agroecological management of ruminants, pigs and poultry through the development of sustainable breeding programmes. II. Breeding strategies

Florence Phocas , Catherine Belloc , Joël Bidanel , Luc Delaby , Jean-Yves Dourmad et al.
Animal, 2016, 10 (11), pp.1760-1769. ⟨10.1017/S1751731116001051⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01533886 v1
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Review: Towards the agroecological management of ruminants, pigs and poultry through the development of sustainable breeding programmes: I-selection goals and criteria

Florence Phocas , Catherine Belloc , Joël Bidanel , Luc Delaby , Jean-Yves Dourmad et al.
Animal, 2016, 10 (11), pp.1749-1759. ⟨10.1017/S1751731116000926⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01533895 v1
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Construction of a large collection of small genome variations in French dairy and beef breeds using whole-genome sequences

Mekki Boussaha , Pauline Michot , Rabia Letaief , Chris Hozé , Sébastien Fritz et al.
Genetics Selection Evolution, 2016, 48 (1), pp.87. ⟨10.1186/s12711-016-0268-z⟩
Article dans une revue hal-01479216 v1
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Insights into the genetic variation of maternal behavior and suckling performance of continental beef cows

Alexis Michenet , Romain Saintilan , Eric Venot , Florence Phocas
Genetics Selection Evolution, 2016, 48 (1), pp.45. ⟨10.1186/s12711-016-0223-z⟩
Article dans une revue hal-01341379 v1
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Detection of quantitative trait loci for maternal traits using high-density genotypes of Blonde d’Aquitaine beef cattle

Alexis Michenet , Marine Barbat , Romain Saintilan , Eric Venot , Florence Phocas
BMC Genetics, 2016, 17 (1), pp.1-13. ⟨10.1186/s12863-016-0397-y⟩
Article dans une revue hal-02635606 v1
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Inbreeding impact on litter size and survival in selected canine breeds

Grégoire Leroy , Florence Phocas , Benoit Hedan , Etienne Verrier , Xavier X Rognon
The Internet Journal of Veterinary Medicine, 2015, 203 (1), pp.74-78. ⟨10.1016/j.tvjl.2014.11.008⟩
Article dans une revue hal-01122782 v1
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Le phénotypage de l’efficacité alimentaire et de ses composantes, une nécessité pour accroître l’efficience des productions animales

Florence Phocas , Jacques Agabriel , Mathilde Dupont-Nivet , Inge Geurden , Françoise Médale et al.
INRA Productions Animales, 2014, 27 (3), pp.235-248
Article dans une revue hal-01193938 v1

Efficiency of multi-breed genomic selection for dairy cattle breeds with different sizes of reference population

C. Hozé , Sébastien Fritz , Florence Phocas , Didier Boichard , Vincent Ducrocq et al.
Journal of Dairy Science, 2014, 97 (6), pp.3918-3929. ⟨10.3168/jds.2013-7761⟩
Article dans une revue hal-01193830 v1
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Intégrer la caractérisation du microbiote digestif dans le phénotypage de l’animal de rente : vers un nouvel outil de maîtrise de la santé en élevage ?

Fanny Calenge , Cécile Martin , Nathalie Le Floc'H , Florence Phocas , Diego Morgavi et al.
INRA Productions Animales, 2014, 27 (3), pp.209-222
Article dans une revue hal-01193937 v1
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Genomic prediction in French Charolais beef cattle using high-density single nucleotide polymorphism markers1

M. Gunia , R. Saintilan , E. Venot , C. Hozé , M. Fouilloux et al.
Journal of Animal Science, 2014, 92 (8), pp.3258-3269. ⟨10.2527/jas2013-7478⟩
Article dans une revue hal-03161724 v1
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Des animaux plus robustes : un enjeu majeur pour le développement durable des productions animales nécessitant l'essor du phénotypage fin et à haut débit

Florence Phocas , Julien Bobe , Loys Bodin , Bernard Charley , Jean-Yves Dourmad et al.
INRA Productions Animales, 2014, 27 (3), pp.181-194. ⟨10.20870/productions-animales.2014.27.3.3066⟩
Article dans une revue hal-01173636 v1
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Dossier " Phénotypage des animaux d'élevage

Jean-Louis Peyraud , Florence Phocas
INRA Productions Animales, 2014, 27 (3), pp.179-180
Article dans une revue hal-01193940 v1
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Génétique de l’adaptation comportementale des animaux aux conditions d’élevage : le cas des productions bovines, porcines, avicoles et aquacoles

Laurianne L. Canario , Sandrine Grasteau , Mathilde Dupont-Nivet , Florence Phocas
INRA Productions Animales, 2013, 26 (1), pp.35-50
Article dans une revue hal-01193846 v1
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Novel insights into the bovine polled phenotype and horn ontogenesis in Bovidae

Aurélie Allais-Bonnet , Cécile Grohs , Ivica I. Medugorac , Stefan S. Krebs , Anis Djari et al.
PLoS ONE, 2013, 8, online (5), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0063512⟩
Article dans une revue hal-01000794 v1
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Simulated selection responses for breeding programs including resistance and resilience to parasites in Creole goats

Mélanie Gunia , Florence Phocas , Jean-Luc Gourdine , P. P. Bijma , Nathalie Mandonnet
Journal of Animal Science, 2013, 91 (2), pp.572-581. ⟨10.2527/jas.2011-5071⟩
Article dans une revue hal-01000064 v1
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Economic values of body weight, reproduction and parasite resistance traits for a Creole goat breeding goal

Mélanie Gunia , Nathalie Mandonnet , Rémy R. Arquet , Gisèle Alexandre , Jean-Luc Gourdine et al.
Animal, 2013, 7 (1), pp.22-33. ⟨10.1017/S1751731112001413⟩
Article dans une revue hal-01000063 v1
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High-density marker imputation accuracy in sixteen French cattle breeds

Chris Hoze Hozé , Marie-Noëlle M.-N. Fouilloux , Eric Venot , François F. Guillaume , Romain R. Dassonneville et al.
Genetics Selection Evolution, 2013, 45 (1), pp.1-11. ⟨10.1186/1297-9686-45-33⟩
Article dans une revue hal-01001056 v1

Regulation of anti-Müllerian hormone production in domestic animals

Danielle Monniaux , Laurence Drouilhet , Charlène Rico , Anthony Estienne , Peggy Jarrier-Gaillard et al.
Reproduction, Fertility and Development, 2013, 25 (1), pp.1-16. ⟨10.1071/RD12270⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01129676 v1
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Genetics of behavioural adaptation of livestock to farming conditions.

Laurianne L. Canario , Sandrine Mignon-Grasteau , Mathilde Dupont-Nivet , Florence Phocas
Animal, 2013, 7 (3), pp.357-377. ⟨10.1017/S1751731112001978⟩
Article dans une revue hal-01019444 v1
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Economic aspects of implementing genomic evaluations in a pig sire line breding scheme

Thierry Tribout , Catherine Larzul , Florence Phocas
Genetics Selection Evolution, 2013, 45, pp.1-16. ⟨10.1186/1297-9686-45-40⟩
Article dans une revue hal-01004238 v1
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Efficiency of genomic selection in a purebred pig male line

Thierry Tribout , Catherine Larzul , Florence Phocas
Journal of Animal Science, 2012, 90 (12), pp.4164-4176. ⟨10.2527/jas.2012-5107⟩
Article dans une revue hal-01001279 v1

Genetic control of multiple births in low ovulating mammalian species

Aurélie Vinet , Laurence Drouilhet , Loys Bodin , Philippe Mulsant , Stéphane Fabre et al.
Mammalian Genome, 2012, 23 (11-12), pp.727-740. ⟨10.1007/s00335-012-9412-4⟩
Article dans une revue istex hal-01019827 v1
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Genetic parameters for body weight, reproduction, and parasite resistance traits in the Creole goat

Mélanie Gunia , Florence Phocas , Rémy R. Arquet , Gisèle Alexandre , Nathalie Mandonnet
Journal of Animal Science, 2011, 89 (11), pp.3443-3451. ⟨10.2527/jas.2011-3872⟩
Article dans une revue hal-01000143 v1
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Attentes en matière d'élevage des acteurs de la sélection animale, des filières de l'agroalimentaire et des associations

A.C. A. Dockès , P. P. Magdelaine , D. D. Daridan , A. A. Guillaumin , Martin M. Rémondet et al.
INRA Productions Animales, 2011, 24 (4), pp.285-296
Article dans une revue hal-01000250 v1
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L'optimisation des programmes de sélection

Florence Phocas
INRA Productions Animales, 2011, 24 (4), pp.341-356
Article dans une revue hal-01001177 v1
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A definition of unknown parent groups based on bull usage patterns across herds

Alban A. Bouquet , Gilles G. Renand , Florence Phocas
Animal, 2011, 5 (3), pp.337-346. ⟨10.1017/S1751731110002144⟩
Article dans une revue hal-01000889 v1
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Genetic structure of the European Charolais and Limousin cattle metapopulations using pedigree analyses

Alban A. Bouquet , Eric Venot , Denis Laloë , F. F. Forabosco , A. A. Fogh et al.
Journal of Animal Science, 2011, 89 (6), pp.1719-1730. ⟨10.2527/jas.2010-3469⟩
Article dans une revue hal-01000450 v1
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Assessment of different on-farm measures of beef cattle temperament for use in genetic evaluation

H. Benhajali , Xavier Boivin , Jean Sapa , Patricia Pellegrini , P. Boulesteix et al.
Journal of Animal Science, 2010, 88 (11), pp.3529-3537. ⟨10.2527/jas.2010-3132⟩
Article dans une revue hal-01193395 v1
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Genetic parameters of litter size in Creole goat and their implication for a breeding programme including adaptation traits

Mélanie Gunia , Nathalie Mandonnet , Gisèle Alexandre , Michel Naves , Florence Phocas
Advances in Animal Biosciences, 2010, 1 (2), pp.402-403. ⟨10.1017/S2040470010000300⟩
Article dans une revue hal-01193769 v1
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La réduction des rejets avicoles et porcins par la sélection

Sandrine Grasteau , Magalie Bourblanc , Bernard Carré , Jean-Yves Dourmad , Hélène Gilbert et al.
INRA Productions Animales, 2010, 23 (5), pp.415-426
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01193612 v1

Genetic parameters for growth, muscularity, feed efficiency and carcass traits of young beef bulls

Alban Bouquet , Marie-Noelle Fouilloux , Gilles Renand , Florence Phocas
Livestock Science, 2010, 129 (1-3), pp.38-48. ⟨10.1016/j.livsci.2009.12.010⟩
Article dans une revue istex hal-01193365 v1
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Contribution of research to a breeding programme for Creole goat in Guadeloupe

Mélanie Gunia , Nathalie Mandonnet , Gisèle Alexandre , Michel Naves , Florence Phocas
Advances in Animal Biosciences, 2010, 1 (2), pp.401-402. ⟨10.1017/S2040470010000294⟩
Article dans une revue hal-01193768 v1
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Evolution de la diversité génétique des populations françaises de bovins allaitants spécialisés de 1979 à 2008

Alban Bouquet , Gilles Renand , Florence Phocas
INRA Productions Animales, 2009, 22 (4), pp.317-330
Article dans une revue hal-01193450 v1
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Genetic analysis of breeding traits in a Charolais cattle population segregating an inactive myostatin allele

Florence Phocas
Journal of Animal Science, 2009, 87 (6), pp.1865-1871. ⟨10.2527/jas.2008-1426⟩
Article dans une revue hal-01193425 v1

Genetic correlations between temperament and breeding traits in Limousin heifers

Florence Phocas , Xavier Boivin , Jean Sapa , Gilbert Trillat , Alain Boissy et al.
Animal Science, 2006, 82 (6), pp.805-811. ⟨10.1017/ASC200696⟩
Article dans une revue hal-02661838 v1
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Investigation of three strategies for an international genetic evaluation of beef cattle weaning weight.

Florence Phocas , K. Donoghue , H.U. Graser
Genetics Selection Evolution, 2005, 37 (4), pp.361-380
Article dans une revue hal-02679243 v1
Image document

Investigation of three strategies for an international genetic evaluation of beef cattle weaning weight

Florence Phocas , Kath Donoghue , Non Renseigné
Genetics Selection Evolution, 2005, 37 (4), pp.361-380
Article dans une revue hal-00894518 v1
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Should genetic groups be fitted in BLUP evaluation? Practical answer for the French AI beef sire evaluation

Florence Phocas , Denis Laloë
Genetics Selection Evolution, 2004, 36 (3), pp.325-345. ⟨10.1051/gse:2004004⟩
Article dans une revue hal-00894310 v1

Genetic parameters for birth and weaning traits in French specialized beef cattle breeds

Florence Phocas , Denis Laloë
Livestock Production Science, 2004, 89, pp.121-128
Article dans une revue hal-02679885 v1

Genetic parameters for growth, reproductive performance, calving ease and suckling performance in beef cattle heifers.

Florence Phocas , Jean Sapa
Animal Science, 2004, 79, pp.41-48
Article dans une revue hal-02681778 v1
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Should genetic groups be fitted in BLUP evaluation? Practical answer for the French AI beef sire evaluation

Florence Phocas , Denis Laloë
Genetics Selection Evolution, 2004, 36, pp.325-345
Article dans une revue hal-02672093 v1

A proposal of criteria of robustness analysis in genetic evaluation

Denis Laloë , Florence Phocas
Livestock Production Science, 2003, 80, pp.241-256
Article dans une revue hal-02673521 v1

Evaluation models and genetics parameters for calving difficulty in beef cattle

Florence Phocas , Denis Laloë
Journal of Animal Science, 2003, 81, pp.933-938
Article dans une revue hal-02674814 v1

Developing a breeding objective for a French purebred beef cattle selection programme

Florence Phocas , C. Bloch , P. Chapelle , F. Bécherel , Gilles G. Renand et al.
Livestock Production Science, 1998, 57, pp.49-65
Article dans une revue hal-02686167 v1
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Modélisation déterministe et optimisation d'un schéma de sélection séquentiel : Exemple d'un schéma "volaille de chair

Hervé Chapuis , Vincent Ducrocq , Florence Phocas , Y. Delabrosse
Genetics Selection Evolution, 1997, 29 (4), pp.327-356
Article dans une revue hal-02686755 v1
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Modelling and optimizing of sequential selection schemes: a poultry breeding application

Hervé Chapuis , Vincent Ducrocq , Florence Phocas , Y Delabrosse
Genetics Selection Evolution, 1997, 29 (4), pp.327-356
Article dans une revue hal-00894172 v1
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Considerations on measures of precision and connectedness in mixed linear models of genetic evaluation

D Laloë , Florence Phocas , F Ménissier
Genetics Selection Evolution, 1996, 28 (4), pp.359-378
Article dans une revue hal-00894141 v1

Genetic steady-state under BLUP selection for an infinite and homogeneous population with discrete generations

Florence Phocas , J Jacques J. J. Colleau
TAG Theoretical and Applied Genetics, 1996, 93, pp.287-294
Article dans une revue hal-02684663 v1
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Considerations on measures of precision and connectedness in mixed linear models of genetic evaluation

Denis Laloë , Florence Phocas , François Ménissier
Genetics Selection Evolution, 1996, 28 (4), pp.359-378
Article dans une revue hal-02684734 v1
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Prédiction de l'efficacité d'un schéma de sélection français sur la croissance en race bovine allaitante. II. Prédiction du progrès génétique asymptotique dans une population hétérogène

Florence Phocas , J Jacques J. J. Colleau , François Ménissier
Genetics Selection Evolution, 1995, 27 (2), pp.171-188
Article dans une revue hal-02700547 v1
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Expected efficiency of selection for growth in a French beef cattle breeding scheme. I. Multistage selection of bulls used in artificial insemination

Florence Phocas , J Jacques J. J. Colleau , François Ménissier
Genetics Selection Evolution, 1995, 27 (2), pp.149-170
Article dans une revue hal-02702858 v1
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Expected efficiency of selection for growth in a French beef cattle breeding scheme. I. Multistage selection of bulls used in artificial insemination

Florence Phocas , Jj Colleau , F Ménissier
Genetics Selection Evolution, 1995, 27 (2), pp.149-170
Article dans une revue hal-00894086 v1
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Expected efficiency of selection for growth in a French beef cattle breeding scheme II. Prediction of asymptotic genetic gain in a heterogeneous population

Florence Phocas , Jj Colleau , F Ménissier
Genetics Selection Evolution, 1995, 27 (2), pp.171-188
Article dans une revue hal-00894087 v1
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Approximating selection differentials and variances for correlated selection indices

Florence Phocas , Jj Colleau
Genetics Selection Evolution, 1995, 27 (6), pp.551-565
Article dans une revue hal-00894116 v1
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Approximations empiriques des différentielles de sélection et des variances pour des indices de sélection corrélés.

Florence Phocas , J Jacques J. J. Colleau
Genetics Selection Evolution, 1995, 27 (6), pp.551-565
Article dans une revue hal-02701173 v1

A mechanistic model to simulate the long term regulation of th dairy cow nutrition

Daniel Sauvant , Florence Phocas
Journal of Dairy Science, 1992, 75, n.p
Article dans une revue hal-02701380 v1
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Genetic architecture of resistance to viral hemorrhagic septicemia in rainbow trout

Valentin Thomas , Bertrand Collet , Pierre Boudinot , Delphine Lallias , Florence Phocas
XV International Symposium on Genetics in Aquaculture (ISGA XV), May 2025, Cadiz, Spain. pp.1
Communication dans un congrès hal-05228185 v1
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A DETERMINISTIC COMPARTMENTAL MODEL FOR FLAVOBACTERIOSIS CONTROL IN RAINBOW TROUT FARMING: FROM EPIDEMIOLOGICAL INSIGHTS TO MANAGEMENT AND GENETIC SELECTION STRATEGIES

Auguste Caen , Florence Phocas
Aquaculture Europe 2025, European Aquaculture Society (EAS), Sep 2025, Valence (Espagne), Spain
Communication dans un congrès hal-05246160 v1
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HIGH-DENSITY GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDY IN TWO COHORTS OF RAINBOW TROUT IDENTIFIES CANDIDATE GENES FOR RESISTANCE TO INFECTIOUS PANCREATIC NECROSIS

Jonathan D’ambrosio , Yoannah François , Thierry Morin , Sébastien Courant , Nicolas Picchi et al.
International Symposium on Genetics in Aquaculture (ISGA XV), May 2025, Cadiz, Spain
Communication dans un congrès hal-05103203 v1
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A NOVEL TOOL TO ASSIGN POLYPLOID STURGEONS (Acipenser baerii, Acipenser gueldenstaedtii) FOR CONSERVATION OR SELECTIVE BREEDING PURPOSES

Valentin Thomas , Anastasia Bestin , Florence Phocas , Bastien Debeuf , Pierrick Haffray et al.
International Symposium on Genetics in Aquaculture (ISGA XV), May 2025, Cadiz, France
Communication dans un congrès hal-05156471 v1
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Signatures of selection in two lines of rainbow trout selected for their divergent fat content

Simon Pouil , Audrey Dehaullon , Lionel Goardon , Thierry Kerneis , Gwendal Restoux et al.
15th International Symposium on Genetics in Aquaculture (ISGA), May 2025, Cadix, Spain
Communication dans un congrès hal-05105763 v1

Genetic parameters for red muscle development measured using artificial intelligence and genetic correlations with growth and processing traits in rainbow trout (oncorhynchus mykiss)

Florian Enez , Audrey Dehaullon , Jérôme Doerflinger , Boudjema Imarazene , Guylaine Collewet et al.
AQUA2024, European Aquaculture Society (EAS) and the World Aquaculture Society, Aug 2024, Copenhagen, Denmark
Communication dans un congrès hal-04721326 v1
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Un nouvel outil pour la sélection génétique de deux espèces d'esturgeons polyploïdes (Acipenser baerii et Acipenser gueldenstaedtii) : un panel de marqueurs SNPs pour la reconstitution du pedigree

Valentin Thomas , Anastasia Bestin , Florence Phocas , Bastien Debeuf , Pierrick Haffray et al.
Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2024, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-05223905 v1
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Analyse génétique des performances de production et de résistance à l'hypoxie chez des truites arc-en-ciel diploïdes et triploïdes

Julien Roche , Pierre Patrice , Alexandre Desgranges , Pierrick Haffray , Florence Phocas
Journées de la Recherche Filière Piscicole, ITAVI, Jul 2024, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-05103165 v1
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Fourteen candidate genes governing spontaneous sex-reversal in xx-rainbow trout

Florence Phocas , Audrey Dehaullon , Clémence Fraslin , Anastasia Bestin , Yann Guiguen et al.
EAS, Aug 2024, Copenhague, Denmark
Communication dans un congrès hal-04755014 v1

Links between gills genes expressions during moderate heat stress and resistance to acute hyperthermia using rainbow trout isogenic lines

Henri Lagarde , Delphine Lallias , Mickaël Marchand , Florence Phocas , Lionel Goardon et al.
EAAP, Aug 2024, Florence, Italy
Communication dans un congrès hal-04698564 v1
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2014-2024 : MISE EN PLACE ET EVOLUTION DE LA SÉLECTION GÉNOMIQUE DANS LA FILIÈRE AQUACOLE FRANÇAISE

Jonathan D’ambrosio , Romain Morvezen , Florence Phocas , François Allal , Marc Vandeputte et al.
Journées de la Recherche Filière Piscicole, ITAVI, Jul 2024, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04796774 v1
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OPTIMIZING HONEYBEE BREEDING SCHEMES: REDUCING THE GENERATION INTERVAL OF DAMS TO ONE YEAR WITH PARTIAL PHENOTYPING

Tristan Kistler , E.W. Brascamp , Benjamin Basso , Florence Phocas , Piter Bijma
EurBee 10th Congress of Apidology, Sep 2024, Tallinn, Estonia
Communication dans un congrès hal-04754999 v1
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Analyse génétique des performances de production et de résistance à l'hypoxie chez des truites arc-en-ciel diploïdes et triploïdes

Julien Roche , Pierre Patrice , Alexandre Desgranges , Pierrick Haffray , Florence Phocas
Journées de la Recherche Filière Piscicole, ITAVI, Jul 2024, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04755046 v1

Définir des objectifs de sélection communs, exemple d'une méthode mise en œuvre auprès de collectifs d'apiculteurs

Anne Lauvie , Benjamin B. Basso , Coline Kouchner , Florence Phocas
Séminaire "Sélection participative animale et végétale", INRAE, Jun 2024, Petit-Bourg, Guadeloupe
Communication dans un congrès hal-04912400 v1
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Identification de variants génétiques améliorant les performances de production et de découpe chez la truite arc-en-ciel de grande taille par séquençage de génomes entiers

Valentin Thomas , Florian Enez , Audrey Dehaullon , Pierrick Haffray , Boudjema Imarazene et al.
Journées de la Recherche Filière Piscicole, ITAVI, Jul 2024, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-05103175 v1
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ACCOUNTING FOR A MIXTURE OF DIPLOID AND TRIPLOID FISH IN GENETIC EVALUATION

Julien Roche , Pierre Patrice , Alexandre Desgranges , Pierrick Haffray , Florence Phocas
EAS 2024, Aug 2024, Copenhague, Denmark
Communication dans un congrès hal-04755026 v1

Réponses attendues dans un programme de sélection visant à limiter les impacts environnementaux en pisciculture

Simon Pouil , Joël Aubin , Florence Phocas
8èmes Journées de la Recherche Piscicole, Jul 2024, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-05109345 v1

Régions de génome associées à la résistance à la flavobactériose chez deux populations françaises de truite arc-en-ciel

Simon Pouil , Dimitri Rigaudeau , Tatiana Rochat , Bo-Hyung Lee , Emilien Segret et al.
8èmes Journées de la Recherche Piscicole, Jul 2024, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-05109333 v1
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GENETIC PARAMETERS FOR RED MUSCLE DEVELOPMENT AND GENETIC CORRELATIONS WITH GROWTH AND PROCESSING TRAITS IN RAINBOW TROUT (Oncorhynchus mykiss)

Florian Enez , Audrey Dehaullon , Jérôme Doerflinger , Boudjema Imarazene , Jérôme Bugeon et al.
Aquaculture Europe 2024, EAS, Aug 2024, Copenhagen, Denmark
Communication dans un congrès hal-05103188 v1
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Relationship between behaviour traits and resistances to acute hyperthermia and hypoxia in rainbow trout

Henri Lagarde , Delphine Lallias , Florence Phocas , Lionel Goardon , M Bideau et al.
European Aquaculture Society, European Aquaculture Society, Sep 2023, Vienne (Autriche), France
Communication dans un congrès hal-04449088 v1

Genetic analysis of production and behavioural traits of French honeybees

Tristan Kistler , Coline Kouchner , C. Dumas , R. Dupain , A. Vignal et al.
Book of Abstracts of the 74. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, INRAE, Aug 2023, Lyon, France. pp.621
Communication dans un congrès hal-04208656 v1
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Quantitative trait loci for resistance to Flavobacterium psychrophilum identified using high-density genotyping in rainbow trout French selected lines

Simon Pouil , Dimitri Rigaudeau , Tatiana Rochat , Bo-Hyung Lee , Emilien Segret et al.
Aquaculture Europe, Sep 2023, Vienna, Austria
Communication dans un congrès hal-04745285 v1

Phenomic selection, an alternative to genomic selection in animal breeding?

Faten Jaouahdou , Florian Enez , Christophe Eklouh-Molinier , Jérôme Doerflinger , Guylaine Collewet et al.
Workshop spectroscopie et microscopie du milieu marin, Feb 2023, Brest, France
Communication dans un congrès hal-04185933 v1
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Expected selection responses in breeding plans aiming to limit environmental impacts of trout farming

Simon Pouil , Joël Aubin , Florence Phocas
74th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, INRAE, Aug 2023, Lyon, France. pp.171
Communication dans un congrès hal-04197301 v1
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CASDAR ABEILLE : Première estimation de paramètres et de valeurs génétiques chez l'abeille avec l'abeille ligérienne 6 ème Journées Techniques Inter-Filières SYSAAF -11 et 12 octobre, Rennes

Jonathan D’ambrosio , Benjamin B. Basso , Florence Phocas , Pierrick Haffray
Journées Techniques Interfilières du SYSAAF, Oct 2023, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04386716 v1
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GENOME WIDE ASSOCIATION STUDIES OF PRODUCTION TRAITS IN RAINBOW TROUT USING WHOLE GENOME SEQUENCING

Valentin Thomas , Florian Enez , Pierrick Haffray , Boudjema Imarazene , Mathilde Dupont-Nivet et al.
Aquaculture Europe 2023, Sep 2023, Vienne, Austria
Communication dans un congrès hal-04386683 v1
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Paramètres génétiques associés au muscle rouge, correlations avec les caractères de découpe et effet du croisement entre souches

Florian Enez , Florence Phocas
Journées Techniques Interfilières du SYSAAF, Oct 2022, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04386546 v1

Gérer des systèmes d’élevage basés sur la diversité intra-spécifique : comment et avec quels effets?

Marie-Angélina Magne , Anne Lauvie , Florence Phocas
Séminaire inter-département ACT-AgroEcosystem - Les systèmes agricoles diversifiés: état des lieux et persectives de recherche, May 2023, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-04198507 v1

Maîtrise du développement du muscle rouge chez la truite arc en ciel (Oncorhynchus mykiss)

Lucas Génevé , Aline Perquis , Jérôme Bugeon , Lionel Goardon , François Guyvarc'H et al.
6èmes Journées Techniques Interfilières SYSAAF, SYSAAF, Oct 2023, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04240183 v1
Image document

AN R-BASED PIPELINE FOR GENOTYPE CALLING AND PARENTAGE ASSIGNMENT OF TRIPLOID OFFSPRING TO THEIR DIPLOID PARENTS

Mathieu Besson , Julien Roche , Pierre Patrice , Pierrick Haffray , François Allal et al.
Aquaculture Europe 2023, Sep 2023, Vienne, Austria
Communication dans un congrès hal-04385840 v1
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Genetic analysis of royal jelly production and behaviour traits of honeybees

B Basso , T Kistler , T Gerez , Florence Phocas
World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Jul 2022, Rotterdam, France. ⟨10.3920/978-90-8686-940-4_619⟩
Communication dans un congrès hal-04013032 v1

IFI6, an interferon alpha induced protein, identified by whole genome sequencing as involved in Viral Nervous Necrosis resistance in European sea bass (Dicentrarchus labrax)

Emilie Delpuech , Marc Vandeputte , Romain Morvezen , Anastasia Bestin , Mathieu Besson et al.
International Symposium on Genetics in Aquaculture XIV, Nov 2022, Puerto Varas, Chile
Communication dans un congrès hal-04185918 v1

GENOME WIDE ASSOCIATION STUDY ON VARROA RESISTANCE TRAITS IN FRENCH HONEYBEE POPULATIONS

Sonia E. Eynard , Alain Vignal , Benjamin B. Basso , Olivier Bouchez , Tabatha Bulach et al.
9th European Congress of Apidology, Sep 2022, Belgrade, Serbia
Communication dans un congrès hal-03855289 v1

Fine mapping for Viral Nervous Necrosis resistance in European sea bass (Dicentrarchus labrax) identified by whole genome sequencing

Emilie Delpuech , Marc Vandeputte , Florence Phocas , Anastasia Bestin , Mathieu Besson et al.
Aquaculture Europe 2022, Sep 2022, Rimini, Italy
Communication dans un congrès hal-04185721 v1
Image document

Phénomix : Estimation de l'héritabilité de spectres Raman et premiers résultats d'évaluation phénomique chez la truite

Florence Phocas , Pierrick Haffray , Florian Enez , Francois Allal , Pierre Boudry et al.
Journées Techniques Interfilières du SYSAAF, Oct 2022, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04386542 v1
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DETECTING SIGNATURES OF SELECTION BETWEEN THREE FRENCH DOMESTICATED AND ONE NORTH-AMERICAN POPULATION OF RAINBOW TROUT

Katy Paul , Gwendal Restoux , Florence Phocas
Genomics in Aquaculture, May 2022, Grenade, Spain
Communication dans un congrès hal-03779064 v1
Image document

Assessment of uncertainty in direct and maternal genetic parameters estimates for honeybee colony phenotypes

T Kistler , E W Brascamp , B Basso , P Bijma , Florence Phocas
World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Jul 2022, Rotterdam, Netherlands. ⟨10.3920/978-90-8686-940-4_625⟩
Communication dans un congrès hal-04013024 v1
Image document

Genetic parameters and genome-wide association study of resistance to acute hyperthermia in rainbow trout

Henri Lagarde , Delphine Lallias , Pierre Patrice , Martin Prchal , Yoannah François et al.
World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Jul 2022, Rotterdam, Netherlands
Communication dans un congrès hal-03779084 v1
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Implementation of genomic selection on production and quality traits and linkage disequilibrium in Crassostrea gigas

Antoine Jourdan , Pierre Boudry , Florian Enez , Pierrick Haffray , F Chenier et al.
12. World congress on genetics applied to livestock production (WCGALP), Jul 2022, Rotterdam, Netherlands. ⟨10.3920/978-90-8686-940-4_567⟩
Communication dans un congrès hal-04013016 v1
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UNE SÉLECTION SUR LA PERFORMANCE TRIPLOÏDES EST-ELLE NÉCESSAIRE EN TRUTTICULTURE ?

Pierre Patrice , Yoannah François , Alexandre Desgranges , Gaëtan Labbé , Pierrick Haffray et al.
7emes Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2022, Paris, France
Communication dans un congrès hal-04386701 v1
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A new 665k SNP array used for detecting signatures of positive selection in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

Florence Phocas , Katy Paul , Audrey Dehaullon , Maria Bernard , Gwendal Restoux et al.
International Symposium on Genetics in Aquaculture, Nov 2022, Puerto Varas, Chile
Communication dans un congrès hal-03778981 v1

Phenomic selection, an alternative to genomic selection in animal breeding?

Faten Jaouahdou , Florian Enez , Christophe Eklouh-Molinier , Jérôme Doerflinger , Guylaine Collewet et al.
14. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Nov 2022, Puerto Varas, Chile
Communication dans un congrès hal-04185835 v1
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Principes de la sélection de groupe pour une application chez les insectes

Florence Phocas
Journées Techniques Interfilières du SYSAAF, Oct 2022, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04386712 v1

Statistics for an accurate genome wide association study on Varroa resistance trait in a French honeybee

Sonia E Eynard , Alain Vignal , Benjamin B. Basso , Olivier Bouchez , Tabatha Bulach et al.
9 Congress of Apidology (EurBee), Sep 2022, Berlgrade, Serbia
Communication dans un congrès hal-05208134 v1
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Plans de sélection multi-caractères pour l'abeille domestique : conception & efficacité

Florence Phocas
Journées Techniques Interfilières du SYSAAF, Oct 2022, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04386721 v1

Statistics for an accurate genome wide association study on Varroa resistance trait in a French honeybee

Sonia E Eynard , A. Vignal , Yves Agez , Benjamin B. Basso , Olivier Bouchez et al.
World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Jul 2022, Rotterdam, Netherlands
Communication dans un congrès hal-03859236 v1

Cartographie fine de la résistance à la nécrose nerveuse virale chez le bar identifiée par séquençage du génome entier

Emilie Delpuech , Marc Vandeputte , Florence Phocas , Yoannah François , Anastasia Bestin et al.
7èmes Journées Recherche Filière Piscicole, Jul 2022, Paris, France
Communication dans un congrès hal-04185459 v1
Image document

WHOLE GENOME SEQUENCING TO REFINE THE DETECTION OF QTL FOR VIRAL NERVOUS NECROSIS IN EUROPEAN SEA BASS (DICENTRARCHUS LABRAX)

Emilie Delpuech , Marc Vandeputte , Florence Phocas , Anastasia Bestin , Mathieu Besson et al.
6th symposium on Genomics in Aquaculture Symposium, May 2022, Grenade, Spain
Communication dans un congrès hal-04116026 v1

Statistical models for the genetic characterisation of honeybee colonies from whole genome pool sequencing data.

Sonia E Eynard , Alain Vignal , Christina Sann , Fanny Mondet , Benjamin B. Basso et al.
PopGroup 54, Jan 2021, Online, France
Communication dans un congrès hal-04473366 v1
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OLD AND RECENT INBREEDING EFFECTS ON FEMALE SIZE AND REPRODUCTION TRAITS IN A RAINBOW TROUT SELECTED LINE

Katy Paul , Jonathan D’ambrosio , Florence Phocas
Genomics in Aquaculture, May 2021, online, France
Communication dans un congrès hal-03779072 v1
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Genetic determinism of spontaneous masculinisation in XX-female rainbow trout (O. mykiss)

Florence Phocas , Edwige Quillet , Yann Guiguen , Anastasia Bestin , Clémence Fraslin
6th international symposium on Genomics In Aquaculture, May 2021, On line Conference, France
Communication dans un congrès hal-04386528 v1
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Genome-wide association study of hypoxia stress tolerance in rainbow trout

Martin Prchal , Delphine Lallias , Henri Lagarde , Jonathan D’ambrosio , Pierre Patrice et al.
Aquaculture Europe 2021, Oct 2021, Funchal (Madeira), Portugal
Communication dans un congrès hal-03778912 v1

Lignées isogéniques de truite arc-en-ciel : modèle pour étudier la résistance à la SHV

Delphine Lallias , Valentin Thomas , Florence Phocas , Edwige Quillet , Pierre Boudinot
Journées techniques du SYSAAF, SYSAAF, Oct 2021, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04256390 v1
Image document

Relationship between early or late resistance to acute temperature or hypoxia stresses in six rainbow trout isogenic lines

Henri Lagarde , Martin Prchal , Simon Pouil , Lionel Goardon , Marjorie Bideau et al.
Aquaculture Europe 2021, Oct 2021, Funchal (Madeira), Portugal
Communication dans un congrès hal-03778876 v1

Genome wide association studies revealed one strong effect QTL for viral nervous necrosis resistance in European sea bass (Dicentrarchus labrax)

Ronan Griot , François Allal , Florence Phocas , Sophie Brard-Fudulea , Romain Morvezen et al.
Aquaculture Europe 2020, Apr 2021, Cork, Ireland
Communication dans un congrès hal-03198222 v1
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MOLECULAR INBREEDING AND GENETIC LOAD FOR FEMALE REPRODUCTION TRAITS IN A RAINBOW TROUT SELECTED LINE

Katy Paul , Jonathan D’ambrosio , Florence Phocas
Aquaculture in Europe, Apr 2021, en ligne, France
Communication dans un congrès hal-03779048 v1
Image document

Intérêt et optimisation de la sélection génomique chez la truite arc-en-ciel

Jonathan D’ambrosio , Mathilde Dupont-Nivet , Florence Phocas
Journées Techniques Interfilières du SYSAAF, Dec 2020, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04386533 v1
Image document

Vers l’assignation et l’indexation génétique entre et chez les polyploïdes

Florence Phocas , Florian Enez
Journées Techniques Interfilières du SYSAAF, Dec 2020, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04386606 v1

Characterisation of the genotype of honey bee colonies from pool sequences

Sonia Eynard , Christina Sann , Fanny Mondet , Benjamin Basso , Kamila Canale-Tabet et al.
46. APIMONDIA - International Apicultural Congress, Sep 2019, Montreal, Canada
Communication dans un congrès hal-02789560 v1

GWAS reveals several genomic regions governing spontaneous XX-maleness in rainbow trout

Clémence Fraslin , Anastasia Bestin , Nicolas Dechamp , Jonathan d'Ambrosio , Francine Krieg et al.
Aquaculture Europe 2019, European Aquaculture Society (EAS). BEL., Oct 2019, Berlin, Germany
Communication dans un congrès hal-02317177 v1
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Factors of variation of genomic selection accuracy for female reproduction traits with a constant reference population size of rainbow trouts

Jonathan d'Ambrosio , Romain Morvezen , S. Brard-Fudulea , Anastasia Bestin , Pierrick Haffray et al.
Gordon Research Conference - Quantitative genetics and genomics, Feb 2019, Lucca, Italy
Communication dans un congrès hal-02788345 v1

BeeStrong : towards a genomic tool for the selection of varroa resistant honey bees

Christina Sann , Yannick Poquet , Benjamin B. Basso , Sonia Eynard , Bertrand Servin et al.
46. APIMONDIA - International Apicultural Congress, Sep 2019, Montreal, Canada
Communication dans un congrès hal-02788639 v1
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Estimation de la diversité génétique entre et intra lignées françaises de truite arc-en-ciel

Florence Phocas
6. Journées de la Recherche Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2019, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02734889 v1

Masculinisation spontanée chez la truite arc-en-ciel : de nouvelles régions du génome identifiées

Clémence Fraslin , Anastasia Bestin , Nicolas Dechamp , Francine Krieg , Elodie Belmonte et al.
6. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2019, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02182569 v1
Image document

Development of genomic predictions for female reproduction traits in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

Jonathan d'Ambrosio , Romain Morvezen , S. Brard-Fudulea , Anastasia Bestin , Pierrick Haffray et al.
Gordon Research conference - Quantitative genetics and genomics, Feb 2019, Lucca, Italy
Communication dans un congrès hal-02787972 v1
Image document

Genetic analysis of royal jelly production and behavioural traits in Apis mellifera

Florence Phocas , Marjorie Vidal , Benjamin Basso , Charlotte Le Bihan
EurBee, Sep 2018, Ghent, Belgium
Communication dans un congrès hal-03161732 v1

Increase in the accuracy of selection for suckling performance in beef cows with a single-step, multiple-trait genomic evaluation model

Alexis Michenet , Romain Saintilan , Eric Venot , Denis Boichon , Florence Phocas
11. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Massey University. NZL., Feb 2018, Auckland, New Zealand
Communication dans un congrès hal-02733972 v1

BeeStrong: towards a genomic tool for the selection of Varroa resistant honey bees

Christina Sann , Yannick Poquet , Benjamin Basso , Fanny Mondet , Sonia Eynard et al.
8. Congress of Apidology (EurBee 8), Sep 2018, Ghent, Belgium
Communication dans un congrès hal-02786490 v1
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Heterogeneity of genetic diversity throughout the genome in rainbow trout populations

Jonathan d'Ambrosio , Florence Phocas , Pierrick Haffray , Edwige Quillet , Anastasia Bestin et al.
International symposium of Genetics in Aquaculture, International Association for Genetics in Aquaculture (IAGA). INT., Jul 2018, Cairns, Australia
Communication dans un congrès hal-02735029 v1
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Genetic analysis of calf vitality, survival and disease resistance in Charolais beef cattle

Aurélie Vinet , Helene Leclerc , F. Marquis , Florence Phocas
11. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Feb 2018, Auckland, New Zealand
Communication dans un congrès hal-02736367 v1
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Genetic evaluation for stillbirth in French beef cattle breeds

Rachel Lefebvre , Hélène Leclerc , Florence Phocas , Vincent Ducrocq , Didier Boichard et al.
2018 Interbull Annual Meeting, Feb 2018, Auckland, New Zealand
Communication dans un congrès hal-02737233 v1

Genomic estimates of diversity between and within french rainbow trout populations

J. d'Ambrosio , Florence Phocas , Pierrick Haffray , Edwige Quillet , Anastasia Bestin et al.
Aqua 2018 - World Aquaculture Society Meeting, Aug 2018, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02193895 v1
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Genetic parameters of royal jelly production and behavioural traits of honey bees

Florence Phocas , C. Le Bihan , B. Basso
68. Annual Meeting of the European Associationfor Animal Production (EAAP), Aug 2017, Tallinn, Estonia
Communication dans un congrès hal-02736436 v1
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Efficiency of different BLUP indexes accounting for polyandry in bee genetic evaluation

Bastien Gravellier , Florence Phocas
68. Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), Aug 2017, Tallinn, Estonia
Communication dans un congrès hal-02736780 v1
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Mise en place d’une évaluation génomique en races Abondance, Tarentaise et Vosgienne

Marie-Pierre Sanchez , David Jonas , Aurélia Baur , Vincent Ducrocq , Chris Hoze et al.
23. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2016, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01602322 v1

Outils et leviers pour favoriser le développement d'une génétique adaptée aux enjeux de l'agro-écologie pour les élevages de ruminants

Mickael Brochard , Luc Delaby , Bertrand Dumont , Pauline Ezanno , Gilles Foucras et al.
23. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2016, Paris, France. 376 p
Communication dans un congrès hal-02743958 v1
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Towards the identification of gene candiates for maternal effects on weaning weight in six beef cattle breeds

Florence Phocas , Marine Barbat , Mekki Boussaha , Dominique Rocha
24. Plant and Animal Genome Conference (PAG), Jan 2016, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-02739811 v1
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Mortalité des veaux : analyse phénotypique et étude de la composante génétique

Helene Leclerc , Rachel Lefebvre , Michel Douguet , Florence Phocas , Sophie Mattalia-Elie
23. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2016, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01608259 v1
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French genomic experience: genomics for all ruminant species

Eric Venot , Anne Barbat , Didier Boichard , Pascal Croiseau , Vincent Ducrocq et al.
2016 Interbull Meeting, Oct 2016, Puerto Varas, Chile
Communication dans un congrès hal-02743221 v1

Overview of beef cattle national genomic evaluation in France

Romain Saintilan , Thierry Tribout , Marine Barbat , Marie-Noelle Fouilloux , Eric Venot et al.
66. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2015, Varsovie, Poland. 577 p
Communication dans un congrès hal-01536479 v1
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Mise en place d’évaluations génomiques nationales dans les populations bovines allaitantes françaises Charolaise, Limousine et Blonde d’Aquitaine

Thierry Tribout , Marine Barbat , Romain Saintilan , Marie-Noelle M.-N. Fouilloux , Eric Venot et al.
22. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2015, Paris, France. 409 p
Communication dans un congrès hal-02743442 v1
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Mise en place d’une évaluation nationale du comportement des bovins allaitants à partir de données recueillies en ferme

Eric Venot , Jean Guerrier , Philippe Lajudie , V. Dufour , Olivier Leudet et al.
22. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2015, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02744229 v1
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Extension to haplotypes of genomic evaluation algorithms

Pascal Croiseau , Marie-Noelle Fouilloux , David Jonas , Sebastien Fritz , Aurélia Baur et al.
10. World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2014, Vancouver, Canada
Communication dans un congrès hal-01193907 v1
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Genomic evaluation using combined reference populations from Montbéliarde and French Simmental breeds

Chris Hoze , Sebastien Fritz , Florence Phocas , Didier Boichard , Vincent Ducrocq et al.
10. World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2014, Vancouver, Canada
Communication dans un congrès hal-01193909 v1
Image document

Mise en place d’évaluations génomiques dans les races bovines laitières à effectifs limités en France

Chris Hoze , Sebastien Fritz , Aurélia Baur , Florence Phocas , Didier Boichard et al.
21. Rencontres Recherches Ruminants, Dec 2014, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01194024 v1
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Genome-wide scan for reproductive traits of beef heifers using high density SNP panels

Alexis Michenet , Eric Venot , Romain Saintilan , Florence Phocas
10. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Aug 2014, Vancouver, Canada
Communication dans un congrès hal-01731142 v1

International efforts in livestock phenotyping

Jean-François Hocquette , Florence Phocas , Jean-Louis Peyraud
Livestock Phenomics, Sep 2014, Armidale, Australia. 55 p
Communication dans un congrès hal-01194001 v1
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Is there interest in implementing genomic evaluations in a pig male line nucleus? A simulation study

Thierry Tribout , Catherine Larzul , Florence Phocas
64th Annual Meeting European Association for Animal Production (EAAP), Aug 2013, Nantes, France
Communication dans un congrès hal-01019604 v1
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New french genetic evaluations of fertility and productive life of beef cows

Eric Venot , Maria-Del-Pilar Schneider , Serge Miller , Mathilde Aignel , Marine Barbat et al.
Congres Interbull, Aug 2013, Nantes, France. pp.1-6
Communication dans un congrès hal-01189870 v1
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Etude, par simulations, de l’intérêt d’une sélection génomique dans une population porcine de type mâle

Thierry Tribout , Catherine Larzul , Jean Pierre Bidanel , Florence Phocas
45. Journées Recherche Porcine, Feb 2013, Paris, France
Communication dans un congrès hal-00939818 v2

Inbreeding effects on litter size and longevity in dogs

G. Leroy , B. Hedan , Xavier X Rognon , Florence Phocas , Etienne E. Verrier et al.
64th Annual Meeting European Association for Animal Production (EAAP), Aug 2013, Nantes France
Communication dans un congrès hal-01562186 v1

État actuel et perspectives d'évolution des objectifs de sélection chez les ruminants

Florence Phocas , Mickaël Brochard , Helene Larroque , Gilles Laggrifoul , Julie Labatut et al.
20. Rencontres Recherches Ruminants (3R), Dec 2013, Paris, France. 4 p
Communication dans un congrès hal-01019593 v1
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Genomic selection in a purebred pig breeding scheme: a simulation study

Thierry Tribout , Catherine Larzul , Florence Phocas
4th International Conference on Quantitive Genetics (ICQG), Jun 2012, Edinburgh, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-01231275 v1
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From the 50K chip to the HD: Imputation efficiency in 9 French dairy cattle breeds

Chris Hoze Hoze , Marie-Noëlle Fouilloux , Eric Venot , François Guillaume , Romain Dassonneville et al.
EAAP, Aug 2012, Bratislava, Slovakia. pp.308
Communication dans un congrès hal-02748900 v1
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La sélection génomique : principe et perspectives d'utilisation pour l'amélioration des populations porcines

Thierry Tribout , Jean Pierre Bidanel , Florence Phocas , Sandrine S. Schwob , Francois F. Guillaume et al.
43. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2011, Paris, France. pp.13-25
Communication dans un congrès hal-01000507 v1

Consequences of selection for digestibility on feeding activity and excretion

Sandrine Grasteau , Odile Lafeuille , Jean-Yves Dourmad , Sandrine Hillion , D. Bastianelli et al.
13. European Poultry Conference (EPC 2010), Aug 2010, Tours, France
Communication dans un congrès hal-01193610 v1
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Genome-wide scan for bovine ovulation rate using a dense SNP Map

Aurélie Vinet , Jean-Luc Touze , Olivier Hestault , Christian Bellayer , Mekki Boussaha et al.
9. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany
Communication dans un congrès hal-01193688 v1

Genetic parameters of resistance and growth traits for a breeding programme in Creole goats

Mélanie Gunia , Florence Phocas , Claudia de La Chevrotiere , Jean-Christophe Bambou , Nathalie Mandonnet
9th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 2010, Leipzig, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02812449 v1

What about fish feelings? An inquiry about how fish farmers and researchers approach fish welfare

Patricia Pellegrini , Mathilde Dupont-Nivet , Florence Phocas , Edwige Quillet , Patrick Prunet et al.
11. EASA Biennial Conference, European Association of Social Anthropologists (EASA). GBR., Aug 2010, Maynooth, Ireland
Communication dans un congrès hal-01193639 v1

Genetic relationships between temperament traits of Limousine calves

H. Benhajali , Florence Phocas , Patricia Pellegrini , Jean Sapa , Xavier Boivin
Mediterranean Regional Meeting of the International Society for Applied Ethology, May 2009, Cervia, Italy
Communication dans un congrès hal-01193528 v1

Genetic relationships across four criteria of Limousin calf temperament in restrained or unrestrained conditions

Haifa Ben Haj Ali , Xavier Boivin , Jean Sapa , Patricia Pellegrini , P. Lajudie et al.
60. Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), 2427 August 2009, Aug 2009, Barcelona, Spain
Communication dans un congrès hal-01193343 v1

On-farm assessment and genetic improvement of calf temperament.

H. Benhajali , Florence Phocas , Patricia Pellegrini , Jean Sapa , P. Boulesteix et al.
43rd Congress of the International Society for Applied Ethology, 6-10 July 2009, Jul 2009, Cairns, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02814747 v1

Docility in beef cattle breeding: how scientists and breeders match their view?

Patricia Pellegrini , Haifa Benhajali , Xavier Boivin , Jean Sapa , Florence Phocas
Knowing Animals, Mar 2009, Florence, Italy
Communication dans un congrès hal-01193534 v1

Genetic structure of the European Limousin metapopulation using pedigree analyses.

Alban A. Bouquet , Gilles G. Renand , Florence Phocas
Inconnu, Aug 2009, Barcelona
Communication dans un congrès hal-02753391 v1

Évaluation génétique en ferme de la docilité chez les bovins de race limousine

Haïfa Benhajali , Florence Phocas , Jean Sapa , Patricia Pellegrini , Philippe Lajudie et al.
3. Journées d’Animation Scientifique du Département de Physiologie Animale et Systèmes d’Elevage, Oct 2009, Tours, France
Communication dans un congrès hal-01193469 v1

Genetic structure of the French Blonde d'Aquitaine, Charolais and Limousin beef cattle populations.

Alban A. Bouquet , Marie-Noelle M.-N. Fouilloux , Gilles G. Renand , Florence Phocas
60th Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), 2427 August 2009, 2009, Barcelona
Communication dans un congrès hal-02754659 v1

Quel critère de sélection en ferme pour améliorer la docilité des veaux Limousins ?

H. Benhajali , Xavier Boivin , Jean Sapa , Patricia Pellegrini , P. Lajudie et al.
16èmes Rencontres Recherches Ruminants, Dec 2009, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01193412 v1

Genetic relationships between temperament traits of Limousine calves

Haifa Benhajali , Florence Phocas , Patricia Pellegrini , Jean Sapa , Xavier Boivin
XXXI International Ethological Conference, Aug 2009, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-01193577 v1

Approche multidisciplinaire du bien-être des poissons : anthropologie, génétique, physiologie et éthologie

Patricia Pellegrini , Edwige Quillet , Patrick Prunet , Marie-Laure Bégout , Aurélien Tocqueville et al.
4. Rencontres de l'Ichtyologie en France, Mar 2009, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01193536 v1

Breeding goals for sustainable animal breeding: views and expectations of stakeholders from the production chains and the general public.

A.C Dockes , P Magdelaine , D Daridan , A. Tocqueville , Martin Rémondet et al.
60th Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), 2427 August 2009, 2009, Barcelona
Communication dans un congrès hal-02753673 v1

A gene flow strategy for defining unknown parents groups in beef cattle genetic evaluations

Alban A. Bouquet , Gilles G. Renand , Florence Phocas
59th Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), August 2427, 2008, Vilnius
Communication dans un congrès hal-02753788 v1

Définition des groupes de parents inconnus pour les évaluations génétiques des bovins allaitants.

Alban A. Bouquet , Gilles G. Renand , Florence Phocas
15èmes Rencontres Recherches Ruminants, Dec 2008, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02750695 v1

COSADD: a multidisciplinary research program for sustainable breeding goals and selection criteria.

Florence Phocas , A.C. Dockes , Mathilde Dupont-Nivet , Hélène Gilbert , Sandrine Grasteau et al.
59th Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), August 2427, 2008, Vilnius, France
Communication dans un congrès hal-01713743 v1

Critères et objectifs de sélection animale pour un développement durable.

Florence Phocas
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau
Communication dans un congrès hal-02751697 v1

EurSafe2007 - Sustainable Food Production and Ethics.

Xavier Boivin , S. Waiblinger , A. Brule , N. L'Hotellier , Florence Phocas et al.
7th Congress of the European Society for Agriculture and Food Ethics September 1315 2007 - Vienna, 2007, Austria
Communication dans un congrès hal-02752685 v1

Considering the farmer-animal relationship in the development of sustainable husbandry systems for cattle production

Xavier Boivin , Susanne Waiblinger , A. Brule , N. L'Hotellier , Florence Phocas et al.
7. Congress of the European Society for Agricultural and Food Ethics (EurSAFE 2007), Sep 2007, Vienne, Austria
Communication dans un congrès hal-02752133 v1

Fertility in beef cows.

Florence Phocas
58th Annual Meeting of the European Association for Animal Production, 2007, Dublin
Communication dans un congrès hal-02752537 v1

Discrete VS continuous time survival analysis of productive life of Charolais cows.

Florence Phocas , Vincent Ducrocq
8th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Belo Horizonte, 2006, Brazil, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02817494 v1

Paramètres génétiques du comportement et relations avec les performances zootechniques en race limousine

Jean Sapa , Xavier Boivin , Florence Phocas
13. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2006, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02755891 v1

Genetic relationships between measures of temperament in Australian and French Limousin cattle.

K.A. Donoghue , Jean Sapa , Florence Phocas
8th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Belo Horizonte, 2006, Brazil, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02817796 v1

Genetic parameters between sexes for temperament traits in Limousin cattle.

Jean Sapa , K.A. Donoghue , Florence Phocas
8th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Belo Horizonte, 2006, Brazil, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02821918 v1

Genetic variability of reproductive traits in Charolais cows.

Florence Phocas , Aurélie Vinet , Gilles G. Renand
7th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, 2002, Montpellier, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02825184 v1

Influence du poids de carcasse et de la conformation dans l'élaboration du prix du kilo de carcasse des bovins Charolais.

Jean Devun , Nadine Ferre , L. Chopard , Olivier Guillaume , P. Holleville et al.
7. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2000, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02771665 v1

Importance économique des qualités d'élevage dans les objectifs de sélection des races rustiques Aubrac, Gasconne et Salers

V. Dodelin , Florence Phocas , A. Havy , Gilles G. Renand
5. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 1998, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02767059 v1

Results from a bio-economic model for French beef cattle breeding objectives

Florence Phocas , Gilles G. Renand , François Ménissier
6. World congress on genetics applied to livestock production, Jan 1998, Armidale, Australia
Communication dans un congrès hal-02765106 v1

Prise en compte des besoins des filières viande dans l'orientation de la race bovine Limousine

P. Boulesteix , L. Journaux , Florence Phocas , H. Chapelle , François Ménissier et al.
5. Rencontres, Dec 1998, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02768490 v1

Etude de modalités d'utilisation des stations publiques de contrôle de performances porcines en France

L. Maignel , Florence Phocas , Jean Pierre Bidanel
Journées de la Recherche Porcine en France, INRA - ITP, Feb 1997, Paris, France. pp.343-352
Communication dans un congrès hal-02684727 v1

Etude de modalités d'utilisation des stations publiques de contrôle de performances porcines en France

L. Maignel , Florence Phocas , Jean Pierre Bidanel
29. Journées de la Recherche Porcine en France, Feb 1997, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02837435 v1

Détermination des objectifs de sélection chez les ruminants allaitants: situation actuelle et perspectives d'évolution

Florence Phocas , Eric Hanocq , Jacques J. Bouix , Gilles G. Renand , Jean Paul J. P. Poivey et al.
4. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 1997, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02767000 v1

Efficiency of alternative beef cattle breding schemes for beef crossing

Florence Phocas , J Jacques J. J. Colleau , François Ménissier
46. Annual meeting of the EAAP, Sep 1995, Prague, Czech Republic
Communication dans un congrès hal-02765156 v1

Sélection des bovins allaitants et enjeux pour la recherche

François Ménissier , Florence Phocas , Gilles G. Renand
Commission des recherches bovines de l'INRA : "Quelle recherche pour quel élevage compte tenu de la situation de la filière bovine ?", Nov 1996, Theix, France
Communication dans un congrès hal-02765114 v1

Introducing secondary traits in moets for dairy cattle

J Jacques J. J. Colleau , Florence Phocas
46. Annual meeting of the European Association for Animal Production, Sep 1995, Prague, Czech Republic
Communication dans un congrès hal-02772923 v1

Introduction des caractères secondaires dans les programmes de sélection intensifs chez les bovins laitiers

J Jacques J. J. Colleau , Florence Phocas
Rencontres recherches ruminants, Dec 1994, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02772683 v1

Efficacité génétique d'un noyau de sélection à objectif de croisement industriel, en races bovines allaitantes

Florence Phocas , J Jacques J. J. Colleau , François Ménissier
1. Rencontres recherches ruminants, Dec 1994, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02772867 v1

A mechanistic model to simulate the long term regulation of th dairy cow nutrition

Daniel Sauvant , Florence Phocas
87. Annual Meeting, American dairy science association, Jun 1992, Columbus, United States
Communication dans un congrès hal-02844642 v1
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Rainbow trout isogenic lines, a powerful biological model to study the interactions between genetics, epigenetics and environment

Delphine Lallias , Audrey Dehaullon , Michaël Marchand , Simon Pouil , Florence Phocas et al.
Quantitative Genetics and Genomics Gordon Research Conference, Feb 2025, Lucca (Barga), Italy
Poster de conférence hal-05105708 v1
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Importance of genetic diversity and cooperation between genotypes (CoBreeding Project): Performance of different rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) genotypes reared individually or in combinations

Simon Pouil , Delphine Lallias , Mathilde Dupont-Nivet , Florence Phocas
Quantitative Genetics and Genomics Gordon Research Conference, Feb 2025, Lucca (Barga), Italy
Poster de conférence hal-05105736 v1
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Genetic architecture of resistance to VHSv in rainbow trout

Valentin Thomas , Delphine Lallias , Bertrand Collet , Pierre Boudinot , Florence Phocas
Quantitative Genetics and Genomics Gordon Research Conference, Feb 2025, Lucca, Italy
Poster de conférence hal-05227847 v1
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Assessing the environmental impacts of conventional and organic scenarios of rainbow trout farming in France

Simon Pouil , Mathieu Besson , Florence Phocas , Joël Aubin
14. LCA Food International Conference, Sep 2024, Barcelone, Spain
Poster de conférence hal-04745288 v1
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Etude d'effets potentiels de croisements entre lignées et réponse à la sélection sur des caractères de découpe chez la truite arc-en-ciel

Florian Enez , Jérôme Doerflinger , Boudjema Imarazene , Jérôme Bugeon , Jean-Charles Gabillard et al.
Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2024, Rennes, France
Poster de conférence hal-05156951 v1
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Testing fat content or feeding behaviour as indirect selection criteria for feed efficiency using trout isogenic lines

Simon Pouil , Thierry Kerneis , Edwige Quillet , Delphine Lallias , Laurent Labbé et al.
World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Jul 2022, Rotterdam, Netherlands.
Poster de conférence hal-03778994 v1
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Indirect criteria to improve feed efficiency in rainbow trout: Links with biochemistry and immune activity

Simon Pouil , Fany Blanc , Thierry Kerneis , Floriane Colon , Mathilde Dupont-Nivet et al.
International Symposium on Genetics in Aquaculture, Nov 2022, Puerto Varas, Chile.
Poster de conférence hal-03779103 v1
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Confirmation de deux QTLs d’importance pour la résistance à la NPI dans une lignée commerciale de truite française

Jonathan D’ambrosio , Pierre Patrice , Yoannah François , Thierry Morin , Joëlle Cabon et al.
7emes Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2022, Paris, France
Poster de conférence hal-04386355 v1
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Improving resistance to acute hyperthermia by genomic selection to adapt rainbow trout lines to climate change

Henri Lagarde , Delphine Lallias , Pierre Patrice , Martin Prchal , Yoannah François et al.
International Symposium on Genetics in Aquaculture, Nov 2022, Puerto Varas, Chile.
Poster de conférence hal-03778988 v1
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IS SELECTION ON TRIPLOID INDIVIDUALS PERFORMANCES USEFUL IN RAINBOW TROUT (ONCORHYNCHUS MYKISS) BREEDING PROGRAMS?

Pierre Patrice , Yoannah François , Alexandre Desgranges , G. Labbé , Pierrick Haffray et al.
International Symposium on Genetics In Aquaculture 2022, Nov 2022, Puerta Varas, Chile.
Poster de conférence hal-04178952 v1

SWEEPSTAKES REPRODUCTIVE SUCCESS FROM FERTILIZATION TO HATCHING IN A DOMESTICATED LINE OF ONCORHYNCHUS MYKISS

Katy Paul , Pablo Pelissier , Lionel Goardon , Nicolas Dechamp , Mathilde Dupont-Nivet et al.
Aquaculture Europe 2021, Oct 2021, Funchal (Madeira), Portugal.
Poster de conférence hal-04177994 v1
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GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDY OF INFECTIOUS PANCREATIC NECROSIS IN TWO SUCCESSIVE GENERATIONS OF RAINBOW TROUT

Jonathan D’ambrosio , Pierre Patrice , Yoannah François , Thierry Morin , Joëlle Cabon et al.
Aquaculture Europe 2021, Oct 2021, Madeira, Spain
Poster de conférence hal-04385905 v1

Estimation de la diversité génétique entre et intra lignées françaises de truite arc en ciel

Jonathan d'Ambrosio , Florence Phocas , Pierrick Haffray , Edwige Quillet , Anastasia Bestin et al.
6. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2019, Paris, France. , 2019, Journées de la Recherche Filière Piscicole
Poster de conférence hal-02264930 v1

QTLs linked to survival and growth of rainbow trout fed a 100% plant-based diet in rainbow trout since the first meal

Nicolas Dechamp , Jonathan d'Ambrosio , Frédéric Terrier , Frédéric Cachelou , Anastasia Bestin et al.
Aquaculture Europe 2019, Oct 2019, Berlin, Germany. , 1672 p., 2019, Our future: growing from water
Poster de conférence hal-02317174 v1
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Factors of variation of genomic selection accuracy for female reproduction traits with a constant reference population size of rainbow trouts

Jonathan D’ambrosio , Romain Morvezen , Sophie Brard-Fudulea , Anastasia Bestin , Pierrick Haffray et al.
Gordon Research Conference on Quantitative Genetics and Genomics, Feb 2019, Lucca (Barga), France
Poster de conférence hal-04386586 v1
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Development of genomic predictions for female reproduction traits in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

Jonathan D’ambrosio , Romain Morvezen , Sophie Brard-Fudulea , Anastasia Bestin , Pierrick Haffray et al.
Gordon Research Conference on Quantitative Genetics and Genomics, Feb 2019, Lucca (Barga), Italy
Poster de conférence hal-04386578 v1

Déterminisme génétique et sélection génomique des caractères de reproduction femelle chez la truite arc-en-ciel

J. d'Ambrosio , Romain Morvezen , A. Perez , S. Brard-Fudulea , Anastasia Bestin et al.
6. Journées de la Recherche Piscicole, Jul 2019, Paris, France. , 2019
Poster de conférence hal-02193908 v1
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RAINBOW TROUT RESISTANCE TO Flavobacterium psychrophilum: A GENOME WIDE ASSOCIATION STUDY IN A FRENCH POPULATION AFTER A NATURAL DISEASE OUTBREAK

Clémence Fraslin , S. Brard-Fudulea , Jonathan d'Ambrosio , Anastasia Bestin , Mathieu Charles et al.
AQUA 2018, Aug 2018, Montpellier, France. , 2018, AQUA 2018
Poster de conférence hal-01865605 v1
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Selective breeding to reduce the ecological footprint of aquaculture

Marc Vandeputte , Mathieu Besson , François Allal , Florence Phocas , Edwige Quillet
Aquaculture Europe 2017, Oct 2017, Dubrovnik, Croatia.
Poster de conférence hal-03156701 v1
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Candidate genes for milk production traits in Limousin beef cattle

Alexis Michenet , Marine Barbat , Romain Saintilan , Eric Venot , Florence Phocas
24. Plant and Animal Genome Conference (PAG XXIV), Jan 2016, San Diego, United States. , 2016
Poster de conférence hal-02741791 v1

Implementation of genomic selection in three French regional dairy cattle breeds

Marie-Pierre Sanchez , David Jonas , Aurélia Baur , Vincent Ducrocq , Chris Hoze et al.
67. Annual meeting of the European Federation of Animal Science EAAP 2016, Aug 2016, Belfast, United Kingdom. 2016, Book of Abstract of the 67th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science
Poster de conférence hal-01531682 v1
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Genetic parameters for stillbirth in French beef cattle breeds

Rachel Lefebvre , Helene Leclerc , Florence Phocas , Sophie Mattalia
66. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2015, Warsaw, Poland. Wageningen Academic Publishers, Annual Meeting of the European Association for Animal Production, 21, 2015, Book of abstracts of the 66th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science
Poster de conférence hal-02739319 v1

Accuracy of genomic prediction in French Charolais cattle population using high-density chip

Thierry Tribout , Mélanie Gunia , R; Saintilan , Eric Venot , Marie-Noelle Fouilloux et al.
10. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Aug 2014, Vancouver, Canada. American Society of Animal Science, 2014, 10th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production
Poster de conférence hal-01194078 v1

Genetic architecture of birth and weaning traits in Charolais beef cattle

R. Saintilan , Marie-Noëlle Fouilloux , Aurelien Capitan , Bertrand Servin , Thierry Tribout et al.
10. World Congress of Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2014, Vancouver, Canada. American Society of Animal Science, 2014, 10th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production
Poster de conférence hal-01194101 v1

Accounting for population structure and haplotype diversity in whole genome scans for selection signatures

Simon S. Boitard , Bertrand Servin , Claude C. Chevalet , Maria Inès M. I. Fariello Rico , Florence Phocas et al.
10. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Aug 2014, Vancouver, Canada. American Society of Animal Science / American Dairy Science Association, 108 p, 2014, 10th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP)
Poster de conférence hal-02740609 v1

Genetic control of ovulation rate in Maine-Anjou cattle

Aurélie Vinet , Jean-Luc Touze , Jean Sapa , Loys L. Bodin , Stéphane Fabre et al.
10. World Congress of Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Aug 2014, Vancouver, Canada. American Society of Animal Science, 2014, Proceedings, 10th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP)
Poster de conférence hal-02742579 v1

Genomic-wide scan of ovulation rates in beef heifers and cows

Aurélie Vinet , Jean-Luc Touze , François Guillaume , Jean Sapa , Florence Phocas
64. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, Aug 2013, Nantes, France. Wageningen Academic, Annual Meeting of the European Association for Animal Production, 19, 660 p., 2013, EAAP Book Abstracts
Poster de conférence hal-01190478 v1
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Relation entre puberté et croissance de la génisse charolaise

Emilie Cobo , Aurélie Vinet , Jean Sapa , Yves Gallard , Nicolas Desramé et al.
20. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2013, Paris, France. INRA - Institut de l'élevage, Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, 20, 2013, Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants
Poster de conférence hal-01194079 v1

Robustness of an experimental design.

V. Dodelin , Florence Phocas , Denis Laloë
51st Annual Meeting of the European Association for Animal Production, Commission on Animal Genetics, 2000, Inconnu, 4 p., 2000
Poster de conférence hal-02842103 v1
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High-density genome-wide association study points out major candidate genes for resistance to infectious pancreatic necrosis in rainbow trout

Jonathan D’ambrosio , Yoannah François , Thierry Morin , Sébastien Courant , Alexandre Desgranges et al.
2025
Pré-publication, Document de travail hal-05156973 v1
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In-depth investigation of genome to refine QTL positions for spontaneous sex-reversal in XX rainbow

Audrey Dehaullon , Clémence Fraslin , Anastasia Bestin , Charles Poncet , Yann Guiguen et al.
2024
Pré-publication, Document de travail hal-04796738 v1
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How partial phenotyping to reduce generation intervals can help to increase annual genetic gain in selected honeybee populations

Tristan Kistler , Evert W Brascamp , Benjamin Basso , Florence Phocas , Piter Bijma
2024
Pré-publication, Document de travail hal-04796731 v1
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Sequence-based genome-wide association studies reveal the polygenic architecture of Varroa destructor resistance in Western honey bees Apis mellifera

Sonia Eynard , Fanny Mondet , Benjamin Basso , Olivier Bouchez , Tabatha Bulach et al.
2024
Pré-publication, Document de travail hal-04493727 v1
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Assessing the environmental impacts of conventional and organic scenarios of rainbow trout farming in France

Simon Pouil , Mathieu Besson , Florence Phocas , Joël Aubin
2023
Pré-publication, Document de travail hal-04216357 v1
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Uncertainty in the mating strategy causes bias and inaccuracy in estimates of genetic parameters in honeybees

Tristan Kistler , Evert W Brascamp , Benjamin Basso , Piter Bijma , Florence Phocas
2023
Pré-publication, Document de travail hal-04217731 v1
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Genome-wide detection of positive and balancing selection signatures shared by four domesticated rainbow trout populations (<i>Oncorhynchus mykiss)</i>

K Paul , G Restoux , Florence Phocas
2023
Pré-publication, Document de travail hal-04217772 v1
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Genetic determinism of spontaneous masculinisation in XX female rainbow trout: new insights using medium throughput genotyping and whole-genome sequencing

Clémence Fraslin , Florence Phocas , Anastasia Bestin , Mathieu Charles , Maria Bernard et al.
2020
Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-03026383 v1
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Genotyping, the Usefulness of Imputation to Increase SNP Density, and Imputation Methods and Tools

Florence Phocas
Genomic Prediction of Complex Traits, 2467, Springer US, pp.113-138, 2022, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-0716-2205-6_4⟩
Chapitre d'ouvrage hal-03944422 v1
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La définition des objectifs de sélection

Florence Phocas
Génétique des Animaux d’élevage – Diversité et adaptation dans un monde changeant, Quae, pp.55-70, 2020
Chapitre d'ouvrage hal-04116022 v1

Modéliser les interactions du vivant, en lien avec les milieux et les contextes socio-économiques

Chantal Gascuel , Francoise Lescourret , Herve Monod , Lionel Roques , David Bohan et al.
Caquet, Thierry Gascuel, Chantal Tixier-Boichard, Michèle Coordination éditoriale. L’agroécologie : des recherches pour la transition des filières et des territoires. Collection Matière à débattre et décider, Collection Matière à débattre et décider (5), Éditions Quæ, pp.71-80, 2020, 978-2-7592-3129-4
Chapitre d'ouvrage hal-02929956 v1
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La définition des objectifs de sélection

Florence Phocas
Génétique des Animaux d’élevage. Diversité et adaptation dans un monde changeant., Quae, 2020
Chapitre d'ouvrage hal-03153836 v1
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Amélioration génétique des bovins allaitants : de la théorie à l'application

Florence Phocas
Sciences du Vivant [q-bio]. Institut National Polytechnique de Toulouse (INP Toulouse), 2008
HDR tel-04035609 v1
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Modélisation et Optimisation de programmes de sélection sur la croissance en races bovines allaitantes

Florence Phocas
Sciences du Vivant [q-bio]. Institut National Agronomique Paris Grignon (INAPG), 1995. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse tel-04035601 v1

Optimization of AI bulls'selection in stations in a French beef cattle breed

Florence Phocas , J Jacques J. J. Colleau , François Ménissier
44. Annual meeting, Aug 1993, Aarhus, Denmark. European association for animal production, n.p., 1993
Proceedings/Recueil des communications hal-02845882 v1