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François ALLAL

François Allal - Ifremer - MARBEC
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Documents

Présentation

Chargé de recherche à l’Ifremer en génétique et génomique aquacole depuis 2013, jeparticipe à l’ambition de participer de relever le défi de l’amélioration de la durabilité de la pisciculture grâce notamment à la sélection génomique. Une grande part de mes travaux de recherche concerne l’intégration des outils de la génomique moléculaire et de la génomique quantitative pour l’amélioration des caractères de durabilité tels que la résistance aux maladies, l’efficacité alimentaire, les rendements productifs, ou les interactions génotype x environnement, mais aussi le déterminisme du sexe, ou les traits de personnalité chez le bar européen (Dicentrarchus labrax).

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Publications

Larval survival in European seabass (Dicentrarchus labrax) is shaped by the natural thermal regime of their population of origin and the level of introgression of Atlantic and Mediterranean genomes

Damien Crestel , Alain Vergnet , Emilie Delpuech , Maeva Leitwein , Frédéric Clota et al.

Aquaculture, 2026, 615, pp.743605. ⟨10.1016/j.aquaculture.2025.743605⟩

Article dans une revue hal-05462716v1
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Patterns of inter-populational and inter-individual variation in tolerance of sublethal progressive hypoxia and warming in the European seabass Dicentrarchus labrax

Julie J. H. Nati , Charles Rodde , Felipe R. Blasco , Germain Salou , Alain Vergnet et al.

Frontiers in Fish Science, 2025, 3, pp.1542342. ⟨10.3389/frish.2025.1542342⟩

Article dans une revue hal-05208066v1

Reduced fitness associated with introgression within the Western Mediterranean admixed population of European seabass

Maeva Leitwein , Bruno Ernande , Marc Vandeputte , Frédéric Clota , François Allal

Evolution - International Journal of Organic Evolution, In press, ⟨10.1093/evolut/qpaf079⟩

Article dans une revue hal-05241932v1
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Do European Seabass Larvae Grow Better in Their Natural Temperature Regime?

Damien Crestel , Alain Vergnet , Frédéric Clota , Marie-Odile Blanc , Théo Navarro et al.

Evolutionary Applications, 2025, 18 (2), pp.e70083. ⟨10.1111/eva.70083⟩

Article dans une revue hal-05028547v1
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Multigenerational temperature effects on paternal epigenetic inheritance in European sea bass

Nuria Sanchez Baizan , Francois Allal , Marc Vandeputte , Francesc Piferrer

Epigenetics and Chromatin, 2025, 18 (1), 66 (21p.). ⟨10.1186/s13072-025-00630-5⟩

Article dans une revue hal-05375152v1

Corrigendum to “Genomic selection for individual feed efficiency in the European seabass: Response to selection on efficiency, commercial traits and sex” [Aquaculture Volume 595, Part 2, 30 January 2025, 741682].

François Allal , Mathieu Besson , Emilie Delpuech , Chloé Barrier-Loiseau , Alain Vergnet et al.

Aquaculture, 2025, 605, pp.742499. ⟨10.1016/j.aquaculture.2025.742499⟩

Article dans une revue hal-05051395v1

Genomic selection for individual feed efficiency in the European seabass: Response to selection on efficiency, commercial traits and sex

François Allal , Mathieu Besson , Emilie Delpuech , Chloé Barrier-Loiseau , Alain Vergnet et al.

Aquaculture, 2025, 595, pp.741682. ⟨10.1016/j.aquaculture.2024.741682⟩

Article dans une revue hal-04754459v1
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Evidence that tolerance of acute warming declines with increasing body mass within fish species

Theo Navarro , Davide Thambithurai , Emma Duquenne-Delobel , Damien Crestel , Francois Allal et al.

Journal of Experimental Biology, 2025, 228 (17), pp.jeb250612. ⟨10.1242/jeb.250612⟩

Article dans une revue hal-05375139v1

Genetic selection and novel feeds containing single cell protein as a substitute for fishmeal in European sea bass: Effects on growth, fatty acid profile and E-sensing analysis of fillets

F. Moroni , M. Carvalho , A. R. Di Rosa , S. Torrecillas , R. Fontanillas et al.

Aquaculture Reports, 2024, 35, pp.102021. ⟨10.1016/j.aqrep.2024.102021⟩

Article dans une revue hal-04531681v1
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APIS: an updated parentage assignment software managing triploids induced from diploid parents

Julien Roche , Ronan Griot , François Allal , Mathieu Besson , Pierrick Haffray et al. Article dans une revue hal-04649084v1

The fate of a polygenic phenotype within the genomic landscapes of introgression in the European seabass hybrid zone

Maeva Leitwein , G Durif , E Delpuech , P Gagnaire , B Ernande et al.

Molecular Biology and Evolution, 2024, 41 (9), pp.msae194. ⟨10.1093/molbev/msae194⟩

Article dans une revue hal-04705605v1
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Nutritional innovations in superior European sea bass (Dicentrarchus labrax) genotypes: Implications on fish performance and feed utilization

D. Montero , M. Carvalho , G. Terova , R. Fontanillas , A. Serradell et al.

Aquaculture, 2023, 572, pp.739486. ⟨10.1016/j.aquaculture.2023.739486⟩

Article dans une revue hal-04094069v1
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Genetically superior European sea bass (Dicentrarchus labrax) and nutritional innovations: Effects of functional feeds on fish immune response, disease resistance, and gut microbiota

Simona Rimoldi , Daniel Montero , Silvia Torrecillas , Antonio Serradell , Felix Acosta et al.

Aquaculture Reports, 2023, 33, pp.101747. ⟨10.1016/j.aqrep.2023.101747⟩

Article dans une revue hal-04224778v1
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Changes in transcriptomic and behavioural traits in activity and ventilation rates associated with divergent individual feed efficiency in gilthead sea bream (Sparus aurata)

Josep Calduch-Giner , Enrique Rosell-Moll , Mathieu Besson , Alain Vergnet , Jean-Sébastien Bruant et al.

Aquaculture Reports, 2023, 29, pp.101476. ⟨10.1016/j.aqrep.2023.101476⟩

Article dans une revue hal-03948385v1
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Genotype x nutrition interactions in European sea bass (Dicentrarchus labrax): Effects on gut health and intestinal microbiota

S. Torrecillas , S. Rimoldi , D. Montero , A. Serradell , F. Acosta et al.

Aquaculture, 2023, 574, pp.739639. ⟨10.1016/j.aquaculture.2023.739639⟩

Article dans une revue hal-04094082v1

Potential of genomic selection for growth, meat content and colour traits in mixed-family breeding designs for the Pacific oyster <em>Crassostrea gigas</em>

Antoine Jourdan , Romain Morvezen , Florian Enez , Pierrick Haffray , Adeline Lange et al.

Aquaculture, 2023, 576, pp.739878. ⟨10.1016/j.aquaculture.2023.739878⟩

Article dans une revue hal-04158060v1
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In a marine teleost, the significance of oxygen supply for acute thermal tolerance depends upon the context and the endpoint used

Julie Nati , Felipe Blasco , Charles Rodde , Alain Vergnet , François Allal et al.

Journal of Experimental Biology, 2023, 226 (11), pp.jeb245210. ⟨10.1242/jeb.245210⟩

Article dans une revue hal-04100080v1
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Whole‐genome sequencing identifies interferon-induced protein IFI6/IFI27-like as a strong candidate gene for VNN resistance in European sea bass

Emilie Delpuech , Marc Vandeputte , Romain Morvezen , Anastasia Bestin , Mathieu Besson et al.

Genetics Selection Evolution, 2023, 55, pp.30. ⟨10.1186/s12711-023-00805-2⟩

Article dans une revue hal-04116035v1
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Functional Additives in a Selected European Sea Bass (Dicentrarchus labrax) Genotype: Effects on the Stress Response and Gill Antioxidant Response to Hydrogen Peroxide (H2O2) Treatment

Antonio Serradell , Daniel Montero , Genciana Terova , Simona Rimoldi , Alex Makol et al.

Animals, 2023, 13 (14), 2265 (20p.). ⟨10.3390/ani13142265⟩

Article dans une revue hal-04204113v1
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Potential for genomic selection on feed efficiency in gilthead sea bream (Sparus aurata), based on individual feed conversion ratio, carcass and lipid traits

Mathieu Besson , Nicky Rombout , Germain Salou , Alain Vergnet , Sophie Cariou et al.

Aquaculture Reports, 2022, 24, ⟨10.1016/j.aqrep.2022.101132⟩

Article dans une revue hal-03679214v1
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Natural cortisol production is not linked to the sexual fate of European sea bass

Alexander Goikoetxea , Arianna Servili , Camille Houdelet , Olivier Mouchel , Sophie Hermet et al.

Fish Physiology and Biochemistry, 2022, 48 (4), pp.1117-1135. ⟨10.1007/s10695-022-01104-1⟩

Article dans une revue hal-03773801v1
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Current status and potential of genomic selection to improve selective breeding in the main aquaculture species of International Council for the Exploration of the Sea (ICES) member countries

Pierre Boudry , François Allal , Muhammad L. Aslam , Luca Bargelloni , Tim P. Bean et al.

Aquaculture Reports, 2021, 20, pp.100700. ⟨10.1016/j.aqrep.2021.100700⟩

Article dans une revue hal-03411084v1
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Development and testing of a combined species SNP array for the European seabass (Dicentrarchus labrax) and gilthead seabream (Sparus aurata)

C. Peñaloza , T. Manousaki , R. Franch , A. Tsakogiannis , A. K. Sonesson et al.

Genomics, 2021, 113 (4), pp.2096--2107. ⟨10.1016/j.ygeno.2021.04.038⟩

Article dans une revue hal-03415631v1
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Optimization of Genomic Selection to Improve Disease Resistance in Two Marine Fishes, the European Sea Bass (Dicentrarchus labrax) and the Gilthead Sea Bream (Sparus aurata)

Ronan Griot , François Allal , Florence Phocas , Sophie Brard-Fudulea , Romain Morvezen et al.

Frontiers in Genetics, 2021, 12, pp.665920. ⟨10.3389/fgene.2021.665920⟩

Article dans une revue hal-03360561v1
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Different survival of three populations of European sea bass (Dicentrarchus labrax) following challenge with two variants of nervous necrosis virus (NNV)

Sofie Barsøe , François Allal , Alain Vergnet , Marc Vandeputte , Niels Jørgen Olesen et al.

Aquaculture Reports, 2021, 19, pp.100621. ⟨10.1016/j.aqrep.2021.100621⟩

Article dans une revue hal-03150815v1
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Parental selection for growth and early-life low stocking density increase the female-to-male ratio in European sea bass

Benjamin Geffroy , Manuel Gesto , Frédéric Clota , Johan Aerts , Maria J. Darias et al.

Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-93116-9⟩

Article dans une revue hal-03360565v1
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Case report of osteomyelitis of the mandible in osteopetrosis and management considerations

Sarah Allal , Valentin Rabuel , Charline Gengler , Catherine Douchet , Francois Allal et al.

International Journal of Surgery Case Reports, 2021, 81, pp.105813. ⟨10.1016/j.ijscr.2021.105813⟩

Article dans une revue hal-03404273v1
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Unraveling the genotype by environment interaction in a thermosensitive fish with a polygenic sex determination system

Benjamin Geffroy , Mathieu Besson , Núria Sánchez-Baizán , Frédéric Clota , Alexander Goikoetxea et al.

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2021, 118 (50), pp.e2112660118. ⟨10.1073/pnas.2112660118⟩

Article dans une revue hal-03485506v1
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Sex dimorphism in European sea bass (Dicentrarchus labrax L.): New insights into sex-related growth patterns during very early life stages

Sara Faggion , Marc Vandeputte , Alain Vergnet , Frédéric Clota , Marie-Odile Blanc et al.

PLoS ONE, 2021, 16 (4), pp.e0239791. ⟨10.1371/journal.pone.0239791⟩

Article dans une revue hal-03206637v1
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An investigation of links between metabolic rate and feed efficiency in European sea bass Dicentrarchus labrax

Charles Rodde , Hugues de Verdal , Marc Vandeputte , François Allal , Julie Nati et al.

Journal of Animal Science, 2021, 99 (6), pp.1-9. ⟨10.1093/jas/skab152⟩

Article dans une revue hal-03360566v1
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Genome-wide association studies for resistance to viral nervous necrosis in three populations of European sea bass (Dicentrarchus labrax) using a novel 57k SNP array DlabChip

Ronan Griot , François Allal , Florence Phocas , Sophie Brard-Fudulea , Romain Morvezen et al.

Aquaculture, 2021, 530, pp.735930. ⟨10.1016/j.aquaculture.2020.735930⟩

Article dans une revue hal-03544239v1
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Population, Temperature and Feeding Rate Effects on Individual Feed Efficiency in European Sea Bass (Dicentrarchus labrax)

Charles Rodde , Marc Vandeputte , François Allal , Mathieu Besson , Frédéric Clota et al.

Frontiers in Marine Science, 2020, 7, ⟨10.3389/fmars.2020.578976⟩

Article dans une revue hal-03150873v1
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The contribution of ancient admixture to reproductive isolation between European sea bass lineages

Maud Duranton , François Allal , Sophie Valière , Olivier Bouchez , François Bonhomme et al.

Evolution Letters, 2020, 4 (3), pp.226-242. ⟨10.1002/evl3.169⟩

Article dans une revue hal-03065745v1
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Contribution of a bioenergetics model to investigate the growth and survival of European seabass in the Bay of Biscay - English Channel area

Chloe Dambrine , Martin Huret , Mathieu Woillez , Laure Pecquerie , Francois Allal et al.

Ecological Modelling, 2020, 423, pp.109007. ⟨10.1016/j.ecolmodel.2020.109007⟩

Article dans une revue hal-02921206v1
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Variations in isotope incorporation rates and trophic discrimination factors of carbon and nitrogen stable isotopes in scales from three European sea bass (Dicentrarchus labrax) populations

Charles Rodde , Hugues de Verdal , Sébastien Lefebvre , Christophe Menniti , Marc Vandeputte et al.

Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 2020, 533, pp.151468. ⟨10.1016/j.jembe.2020.151468⟩

Article dans une revue hal-03097301v1
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How to genetically increase fillet yield in fish: Relevant genetic parameters and methods to predict genetic gain

Marc Vandeputte , Clémence Fraslin , Pierrick Haffray , Anastasia Bestin , François Allal et al.

Aquaculture, 2020, 519, pp.734877. ⟨10.1016/j.aquaculture.2019.734877⟩

Article dans une revue hal-03150887v1
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Evaluation of a European sea bass (Dicentrarchus labrax L.) post-larval tagging method with ultra-small RFID tags

Sara Faggion , Pierre Sanchez , Marc Vandeputte , Frédéric Clota , Alain Vergnet et al.

Aquaculture, 2020, 520, pp.734945. ⟨10.1016/j.aquaculture.2020.734945⟩

Article dans une revue hal-03150884v1
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First evidence of realized selection response on fillet yield in Rainbow trout Oncorhynchus mykiss, Using Sib selection or based on correlated ultrasound measurements

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Anastasia Bestin , Alexandre Desgranges , Jean-Michel Allamellou et al.

Frontiers in Genetics, 2019, 10, pp.1-13. ⟨10.3389/fgene.2019.01225⟩

Article dans une revue hal-02627462v1
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Combining Individual Phenotypes of Feed Intake With Genomic Data to Improve Feed Efficiency in Sea Bass

Mathieu Besson , François Allal , Béatrice Chatain , Alain Vergnet , Frédéric Clota et al.

Frontiers in Genetics, 2019, 10, pp.1-14. ⟨10.3389/fgene.2019.00219⟩

Article dans une revue hal-02403255v1

APIS: An auto-adaptive parentage inference software that tolerates missing parents

Ronan Griot , Francois Allal , Sophie Brard-Fudulea , Romain Morvezen , Pierrick Haffray et al.

Molecular Ecology Resources, 2019, pp.1-12. ⟨10.1111/1755-0998.13103⟩

Article dans une revue hal-02434174v1
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The European sea bass: a key marine fish model in the wild and in aquaculture

Marc Vandeputte , P.-A. Gagnaire , F. Allal

Animal Genetics, 2019, 50 (3), pp.195-206. ⟨10.1111/age.12779⟩

Article dans une revue hal-02395941v1

Population-specific variations of the genetic architecture of sex determination in wild European sea bass Dicentrarchus labrax L.

Sara Faggion , Marc Vandeputte , Béatrice Chatain , Pierre-Alexandre Gagnaire , François Allal

Heredity, 2019, 122 (5), pp.612-621. ⟨10.1038/s41437-018-0157-z⟩

Article dans une revue hal-02395931v1
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The origin and remolding of genomic islands of differentiation in the European sea bass

Maud Duranton , François Allal , Christelle Fraïsse , Nicolas Bierne , François Bonhomme et al.

Nature Communications, 2018, 9 (1), ⟨10.1038/s41467-018-04963-6⟩

Article dans une revue hal-01825457v1

Dynamic epimarks in sex-related genes predict gonad phenotype in the European sea bass, a fish with mixed genetic and environmental sex determination

Dafni Anastasiadi , Marc Vandeputte , Nuria Sanchez-Baizan , Francois Allal , Francesc Piferrer

Epigenetics, 2018, 13 (9), pp.988-1011. ⟨10.1080/15592294.2018.1529504⟩

Article dans une revue hal-01994184v1
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Genome-wide association and genomic prediction of resistance to viral nervous necrosis in European sea bass (Dicentrarchus labrax) using RAD sequencing

Christos Palaiokostas , Sophie Cariou , Anastasia Bestin , Jean-Sebastien Bruant , Pierrick Haffray et al.

Genetics Selection Evolution, 2018, 50 (1), pp.1-11. ⟨10.1186/s12711-018-0401-2⟩

Article dans une revue hal-01826622v1

Estimates of genetic variability and inbreeding in experimentally selected populations of European sea bass

J.E.J. Hillen , I. Coscia , Marc Vandeputte , K. Herten , B. Hellemans et al.

Aquaculture, 2017, 479, pp.742-749. ⟨10.1016/j.aquaculture.2017.07.012⟩

Article dans une revue hal-01583182v1

Investigation of morphological predictors of fillet and carcass yield in European sea bass (Dicentrarchus labrax) for application in selective breeding

Marc Vandeputte , Antonio Puledda , Anne Sophie Tyran , Anastasia Bestin , Céline Coulombet et al.

Aquaculture, 2017, 470, pp.40-49. ⟨10.1016/j.aquaculture.2016.12.014⟩

Article dans une revue hal-01595276v1

Improving feed efficiency in fish using selective breeding: a review

Hugues de Verdal , Hans Komen , Edwige Quillet , Béatrice Chatain , François Allal et al.

Reviews in Aquaculture, 2017, 10 (4), pp.1-19. ⟨10.1111/raq.12202⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-01602277v1
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Viral encephalopathy and retinopathy in aquaculture: a review

Q.K. Doan , Marc Vandeputte , B. Chatain , Thierry Morin , F. Allal

Journal of Fish Diseases, 2017, 40 (5), pp.717-742. ⟨10.1111/jfd.12541⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-01533903v1
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Heritability of boldness and hypoxia avoidance in European seabass, Dicentrarchus labrax

Sebastien Ferrari , Khaled Horri , François Allal , Alain Vergnet , David Benhaim et al.

PLoS ONE, 2016, 11 (12), pp.1-16. ⟨10.1371/journal.pone.0168506⟩

Article dans une revue hal-01602254v1

How could fully scaled carps appear in natural waters in Madagascar?

Jean-Noël Hubert , François Allal , Caroline Hervet , Monique Ravakarivelo , Zsigmond Jeney et al.

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2016, 283 (1837), pp.1-8. ⟨10.1098/rspb.2016.0945⟩

Article dans une revue hal-01924181v1

Past climate changes explain the phylogeography of Vitellaria paradoxa over Africa

François Allal , H. Sanou , L. Millet , A. Vaillant , L. Camus-Kulandaivelu et al.

Heredity, 2011, 107 (2), pp.174-186. ⟨10.1038/hdy.2011.112⟩

Article dans une revue hal-02642275v1

Realized response to genomic selection for feed effficiency in European seabass

François Allal , Mathieu Besson , Emilie Delpuech , Chloé Barrier-Loiseau , Alain Vergnet et al.

XVth International Symposium on Genetics in Aquaculture, May 2025, Cadiz, Spain

Communication dans un congrès hal-05513598v1

Local adaptation and genomic admixture shape thermal resilience in European seabass larvae

François Allal , Damien Crestel , Alain Vergnet , Frédéric Clota , Marie-Odile Blanc et al.

XVth International Symposium on Genetics in Aquaculture, May 2025, Cadiz, Spain

Communication dans un congrès hal-05513575v1

Carbon and nitrogen stable isotopes : is it a good proxy of individual feed efficiency in seabass (Dicentrarchus labrax) ?

Sarah Nahon , Gatien Debailleul , François Allal , Marc Vandeputte , Alain Vergnet

AQUA 2024, Aug 2024, Copenhagen, Denmark

Communication dans un congrès hal-05513538v1

Genetics of thermal adaptation in wild populations of European seabass (Dicentrarchus labrax)

Damien Crestel , Alain Vergnet , Frédéric Clota , François Ruelle , Théo Navarro et al.

AQUA 2024, Aug 2024, Copenhague, Denmark

Communication dans un congrès hal-05513258v1

Enhancing genomic selection efficiency for viral nervous necrosis resistance in European seabass (Dicentrarchus labrax)

Emilie Delpuech , François Allal , Mathieu Besson , Aline Bajek , Joseph Brunier et al.

AQUA 2024, Aug 2024, Copenhague, Denmark

Communication dans un congrès hal-05513550v1

Impacts of Heatwaves and Hypoxia on European seabass Dicentrarchus labrax Reared in Three Thermal Regimes

Théo Navarro , Damien Crestel , Alain Vergnet , Martin Debatis , Amy-Jo Randalls et al.

Society for Experimental Biology annual conference, Jul 2024, Pragues, République tchèque

Communication dans un congrès hal-04732617v1

Genetic and epigenetic regulation of growth in three distant populations of European seabass

Núria Sánchez-Baizán , Damien Crestel , Alain Vergnet , David J. Mckenzie , Marc Vandeputte et al.

AQUA 2024, Aug 2024, Copenaghen, Denmark

Communication dans un congrès hal-05513288v1
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2014-2024 : MISE EN PLACE ET EVOLUTION DE LA SÉLECTION GÉNOMIQUE DANS LA FILIÈRE AQUACOLE FRANÇAISE

Jonathan D’ambrosio , Romain Morvezen , Florence Phocas , François Allal , Marc Vandeputte et al.

Journées de la Recherche Filière Piscicole, ITAVI, Jul 2024, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-04796774v1

Genetic bases of thermal adaptation for growth in three populations of European seabass (Dicentrarchus labrax)

Damien Crestel , Alain Vergnet , Frédéric Clota , Marie-Odile Blanc , Stéphane Lallement et al.

XVth International Symposium on Genetics in Aquaculture, May 2024, Cadiz, Spain

Communication dans un congrès hal-05513590v1

Avantages et inconvénient de l'amélioration génétique de l'efficacité alimentaire chez le bar : implications pour la teneur en lipides

Mathieu Besson , Marc Vandeputte , Maud Duranton , Germain Salou , Alain Vergnet et al.

8èmes Journées Recherche Piscicole, Jul 2024, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-05462891v1

Using Swimming Respirometry to Investigate the Thermal Physiology of European Seabass Populations

Théo Navarro , Tallulah Bailey , Damien Crestel , Alain Vergnet , Aurelien Lledo et al.

American Fisheries Society annual congress, Sep 2024, Honololu, United States

Communication dans un congrès hal-04732751v1

Comment améliorer l’efficacité de la sélection génomique pour la résistance à la nodavirose chez le bar ?

Emilie Delpuech , François Allal , Mathieu Besson , Joseph Brunier , Aline Bajek et al.

8èmes Journées Recherche Piscicole, Jul 2024, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-05462867v1

The role of epigenomics into conservation: Case studies on the European sea bass

Núria Sánchez-Baizán , Silvia Beato , Marc Vandeputte , François Allal , Francesc Piferrer

Conservation genomics, Jun 2024, Paris, France

Communication dans un congrès hal-05462861v1

High-performance impact on Cryoplankton-fed seabass.

Kostas Tzakris , Marie-Odile Blanc , Justin Caruana-Audard , Frédéric Clota , François Allal et al.

Larvi 2024, Sep 2024, Ghent, Belgium

Communication dans un congrès hal-05513555v1

Génétique de l’adaptation à la température des populations de bar Européen (Dicentrarchus labrax)

Damien Crestel , Alain Vergnet , Frédéric Clota , François Ruelle , Théo Navarro et al.

8èmes Journées Recherche Piscicole, Jul 2024, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-05462887v1

Benefits and drawbacks of genetically selecting more efficient sea bass: implications for lipid traits

Mathieu Besson , Marc Vandeputte , Maud Duranton , Germain Salou , Alain Vergnet et al.

AQUA 2024, Aug 2024, Copenhague, Denmark

Communication dans un congrès hal-05513341v1

Sélection génomique pour l’efficacité alimentaire chez le bar : réponses observées sur l’indice de consommation et d’autres caractères d’intérêt

François Allal , Mathieu Besson , Emilie Delpuech , Chloé Barrier-Loiseau , Alain Vergnet et al.

8èmes Journées Recherche Filière Piscicole, Jul 2024, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-05513360v1

Larval growth and differential survival in three natural populations of European seabass (Dicentrarchus labrax) exposed to four thermal regimes

Damien Crestel , Alain Vergnet , Frédéric Clota , Marie-Odile Blanc , Stéphane Lallement et al.

Aquaculture Europe 2023, Sep 2023, Wien, Austria

Communication dans un congrès hal-04185974v1

Phenomic selection, an alternative to genomic selection in animal breeding?

Faten Jaouahdou , Florian Enez , Christophe Eklouh-Molinier , Jérôme Doerflinger , Guylaine Collewet et al.

Workshop spectroscopie et microscopie du milieu marin, Feb 2023, Brest, France

Communication dans un congrès hal-04185933v1

Genotype by environment interaction explain sex determination in the European Seabass

Benjamin Geffroy , Mathieu Besson , Núria Sánchez-Baizán , Frédéric Clota , Alexander Goikoetxea et al.

12th International Symposium on Reproductive Physiology of Fish, May 2023, Hersonisos - Crète, Greece

Communication dans un congrès hal-04185947v1
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AN R-BASED PIPELINE FOR GENOTYPE CALLING AND PARENTAGE ASSIGNMENT OF TRIPLOID OFFSPRING TO THEIR DIPLOID PARENTS

Mathieu Besson , Julien Roche , Pierre Patrice , Pierrick Haffray , François Allal et al.

Aquaculture Europe 2023, Sep 2023, Vienne, Austria

Communication dans un congrès hal-04385840v1

Trans-generational validation of candidate DNA variants for resistance to Viral Nervous Necrosis and Vibrio harveyi in European seabass (Dicentrarchus labrax)

Emilie Delpuech , François Allal , Mathieu Besson , Joseph Brunier , Aline Bajek et al.

Aquaculture Europe 2023, European Aquaculture Society, Sep 2023, Vienna, Austria

Communication dans un congrès hal-05462852v1

IFI6, an interferon alpha induced protein, identified by whole genome sequencing as involved in Viral Nervous Necrosis resistance in European sea bass (Dicentrarchus labrax)

Emilie Delpuech , Marc Vandeputte , Romain Morvezen , Anastasia Bestin , Mathieu Besson et al.

International Symposium on Genetics in Aquaculture XIV, Nov 2022, Puerto Varas, Chile

Communication dans un congrès hal-04185918v1

Development of epigenetic biomarkers for the European seabass (Dicentrarchus labrax)

Núria Sánchez-Baizán , J Denkena , François Allal , Maria Colome-Tatche , Marc Vandeputte et al.

6th Symposium on Genomics in Aquaculture, May 2022, Grenade, Spain

Communication dans un congrès hal-04185380v1
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Can we combine genetics and a two-step temperature control to move towards monosex European seabass Dicentrarchus labrax?

Marc Vandeputte , Frédéric Clota , Alain Vergnet , Marie-Odile Blanc , Stéphane Lallement et al.

Aquaculture Europe 2022, Sep 2022, Rimini, Italy

Communication dans un congrès hal-04185712v1

Can genomics improve the selection efficiency of sea bream (Sparus aurata) candidates reared in sanitary protected RAS when GxE exist with the production environment in open-sea cages?

Anastasia Bestin , Jonathan D’ambrosio , Mathieu Besson , F Massieu , Alain Vergnet et al.

XIV. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Nov 2022, Puerto Varas, Chile

Communication dans un congrès hal-04185868v1

Germ stem cell grafting in european sea bass: a practical approach

Alain Vergnet , Marc Vandeputte , Jean-Jacques Lareyre , François Allal

Aquaculture Europe 2022, Sep 2022, Rimini, Italy

Communication dans un congrès hal-03911893v1

Fine mapping for Viral Nervous Necrosis resistance in European sea bass (Dicentrarchus labrax) identified by whole genome sequencing

Emilie Delpuech , Marc Vandeputte , Florence Phocas , Anastasia Bestin , Mathieu Besson et al.

Aquaculture Europe 2022, Sep 2022, Rimini, Italy

Communication dans un congrès hal-04185721v1
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Phénomix : Estimation de l'héritabilité de spectres Raman et premiers résultats d'évaluation phénomique chez la truite

Florence Phocas , Pierrick Haffray , Florian Enez , Francois Allal , Pierre Boudry et al.

Journées Techniques Interfilières du SYSAAF, Oct 2022, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-04386542v1

Réduction du coût de la sélection génomique par utilisation de panels à plus faible densité de marqueurs chez le bar et la daurade

Jonathan D’ambrosio , Mathieu Besson , Anastasia Bestin , Jean-Sébastien Bruant , Aline Bajek et al.

7. Journées de la Recherche Piscicole, Jul 2022, Paris, France

Communication dans un congrès anses-03889117v1

Using genome-wide ancestry pattern in European sea bass to assess phenotypic variation and ensure sustainable aquaculture

Maeva Leitwein , Ghislain Durif , Pierre-Alexandre Gagnaire , Alain Vergnet , Frédéric Clota et al.

6th Symposium on Genomics in Aquaculture, May 2022, Grenade, Spain

Communication dans un congrès hal-04185352v1

Improving feed efficiency in fish: let’s get down to business

François Allal , Mathieu Besson , Alain Vergnet , David J Mckenzie , Frédéric Clota et al.

Aquaculture Europe 2022, Sep 2022, Rimini, Italy

Communication dans un congrès hal-04185734v1

Les hautes températures en phase juvénile favorisent la croissance et la différenciation femelle du bar (Dicentrarchus labrax L.)

Frédéric Clota , Benjamin Geffroy , Alain Vergnet , Marie-Odile Blanc , François Ruelle et al.

7émes Journées Recherche Filière Piscicole, Jul 2022, Paris, France

Communication dans un congrès hal-04185410v1

Phenomic selection, an alternative to genomic selection in animal breeding?

Faten Jaouahdou , Florian Enez , Christophe Eklouh-Molinier , Jérôme Doerflinger , Guylaine Collewet et al.

14. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Nov 2022, Puerto Varas, Chile

Communication dans un congrès hal-04185835v1

Combined genomic approaches to unravel sex determination in the European seabass

François Allal , Mathieu Besson , Núria Sánchez-Baizán , Frédéric Clota , Alexander Goikoetxea et al.

6. Symposium on Genomics in Aquaculture, May 2022, Grenade, Spain

Communication dans un congrès hal-04185371v1

Cartographie fine de la résistance à la nécrose nerveuse virale chez le bar identifiée par séquençage du génome entier

Emilie Delpuech , Marc Vandeputte , Florence Phocas , Yoannah François , Anastasia Bestin et al.

7èmes Journées Recherche Filière Piscicole, Jul 2022, Paris, France

Communication dans un congrès hal-04185459v1
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WHOLE GENOME SEQUENCING TO REFINE THE DETECTION OF QTL FOR VIRAL NERVOUS NECROSIS IN EUROPEAN SEA BASS (DICENTRARCHUS LABRAX)

Emilie Delpuech , Marc Vandeputte , Florence Phocas , Anastasia Bestin , Mathieu Besson et al.

6th symposium on Genomics in Aquaculture Symposium, May 2022, Grenade, Spain

Communication dans un congrès hal-04116026v1

Sex dimorphism in European sea bass (Dicentrarchus labrax L.) : new insights into sex-related growth patterns during very early life stages

Sara Faggion , Marc Vandeputte , Alain Vergnet , Frédéric Clota , Marie‐odile Blanc et al.

Aquaculture Europe 2020 online, Apr 2021, Cork, Ireland

Communication dans un congrès hal-03187478v1

Phenotypic and genomic correlations between feed efficiency and metabolic traits in European sea bass

Mathieu Besson , David J Mckenzie , Julie J.H Nati , Salou Germain , Alain Vergnet et al.

Aquaculture Europe 2021, Oct 2021, Funchal, Portugal

Communication dans un congrès hal-03360559v1

Genetic correlations between processing traits and individual feed efficiency in a gilthead sea bream (Sparus aurata) commercial line

Anastasia Bestin , Mathieu Besson , Alain Vergnet , François Allal , Frédéric Clota et al.

Aquaculture Europe 2021, Oct 2021, Funchal, Portugal

Communication dans un congrès hal-03360548v1

Late high temperature promotes fast growth and female differentiation in European sea bass Dicentrarchus labrax, while early photoperiod has no effect on either trait

Frédéric Clota , Benjamin Geffroy , Alain Vergnet , Marie-Odile Blanc , Stéphane Lallement et al.

Aquaculture Europe 2021, Oct 2021, Funchal, Portugal

Communication dans un congrès hal-03360551v1

Genomically assisted reconstruction of the ancestral Dicentrarchus labrax L. Mediterranean lineage

Sara Faggion , Duranton Maud , Pierre-Alexandre Gagnaire , Marc Vandeputte , François Allal

Aquaculture Europe 2021, Oct 2021, Funchal, Portugal

Communication dans un congrès hal-03360557v1

Genome wide association studies revealed one strong effect QTL for viral nervous necrosis resistance in European sea bass (Dicentrarchus labrax)

Ronan Griot , François Allal , Florence Phocas , Sophie Brard-Fudulea , Romain Morvezen et al.

Aquaculture Europe 2020, Apr 2021, Cork, Ireland

Communication dans un congrès hal-03198222v1

Genomic prediction and genotype-by-temperature interaction of sex tendency in European sea bass.

François Allal , Mathieu Besson , Bastien Sadoul , François Ruelle , Pegart Mako et al.

Aquaculture Europe 2021, Oct 2021, Funchal, Portugal

Communication dans un congrès hal-03360554v1

Multigenerational epigenetic inheritance of masculinizing temperatures in the European sea bass

Nuria Sanchez-Baizan , Marc Vandeputte , François Allal , Francesc Piferrer

6th International Symposium Genomics in Aquaculture, Sep 2020, Granada, Spain

Communication dans un congrès hal-03187504v1

Genomically assisted reconstruction of the ancestral Dicentrarchus labrax Mediterranean lineage

Sara Faggion , Maud Duranton , Pierre-Alexandre Gagnaire , Marc Vandeputte , François Allal

6th International Symposium Genomics in Aquaculture, Sep 2020, Granada, Spain

Communication dans un congrès hal-03187502v1

How to genetically increase fillet yield in fish: relevant genetic parameters and methods for the estimation of genetic gain

Marc Vandeputte , Clémence Fraslin , Pierrick Haffray , Anastasia Bestin , François Allal et al.

Aquaculture Europe 2019, Oct 2019, Berlin, Germany

Communication dans un congrès hal-03187446v1

Epigenetic inheritance and integration of masculinizing temperatures of the European sea bass (Dicentrarchus labrax)

Nuria Sanchez-Baizan , Dafni Anastasiadi , Marc Vandeputte , François Allal , Francesc Piferrer

Epigenetic inheritance Symposium, Aug 2019, Zurich, Switzerland

Communication dans un congrès hal-03187444v1

Réponse à la sélection sur le rendement de filet chez la truite arc-en-ciel

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Anastasia Bestin , Alexandre Desgranges , Jean-Michel Allamelou et al.

6. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2019, Paris, France

Communication dans un congrès hal-02734410v1

Accounting for genetic variability in fitness-related traits using a Dynamic Energy Budget model, an example on European Seabass

Mathieu Besson , Marc Vandeputte , François Allal , Patrick Prunet , Marie-Laure Bégout et al.

6. International Symposium and Thematic School on ‘Dynamic energy Budget theory for metabolic organization’ (DEB2019), Apr 2019, Brest, France. pp.47

Communication dans un congrès hal-03187437v1

Améliorer l'efficacité alimentaire des poissons en utilisant une nouvelle méthode de phénotypage en aquarium individuel

Mathieu Besson , François Allal , Alain Vergnet , Frédéric Clota , Sophie Cariou et al.

6. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2019, Paris, France

Communication dans un congrès hal-02264927v1

Interaction génotype x aliment: que sait-on, où va-t-on ?

Marc Vandeputte , Pierrick Haffray , Anastasia Bestin , François Allal , Mathilde Dupont-Nivet

Journée du SFAM, Mar 2019, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-03187439v1

Intégration de caractères de résistance à cinq pathologies dans les schémas de sélection commerciale de truite, bar et daurade

Anastasia Bestin , Yoannah François , Thierry Morin , Mathilde Dupont-Nivet , Marc Vandeputte et al.

6. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2019, Paris, France

Communication dans un congrès hal-02264929v1

Genetic parameters of resistance to gastroenteritis (rtge) and rainbow trout fry syndrome (rtfs) in rainbow trout oncorhynchus mykiss and their genetic correlations with production traits

Pierrick Haffray , Anastasia Bestin , Florian Enez , Sébastien Courant , Daniel Guemene et al.

World Aquaculture 2018, Aug 2018, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-02738108v1

APIS: A new auto-adaptive parentage inference software tolerant to missing parents

Ronan Griot , François Allal , Sophie Brard-Fudulea , Sophie S. Cariou , Pierrick Haffray et al.

13th International Symposium Genetics in Aquaculture, Jul 2018, Cairns, Australia

Communication dans un congrès hal-03187121v1

Breeding for disease resistance in farmed fish in the era of high-throughput sequencing

Christos Palaiokostas , Martin Kocour , Tomáš Veselý , Sophie Cariou , Anastasia Bestin et al.

11th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Feb 2018, Auckland, New Zealand

Communication dans un congrès hal-03156780v1

Des puces pour prédire l’avenir…

François Allal , Ronan Griot , Pierre-Alexandre Gagnaire , Romain Morvezen , Sophie Brard et al.

Journées du SFAM (Syndicat Français de l'Aquaculture Marine et Nouvelle), Mar 2018, Montpelllier, France

Communication dans un congrès hal-03156824v1

Successful realized selection response for fillet yield in rainbow trout Oncorhynchus mykiss

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Anastasia Bestin , Alexandre Desgranges , Sébastien Courant et al.

World Aquaculture 2018, European Aquaculture Society (EAS)., Aug 2019, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-02264916v1

Genome-wide association study and genomic evaluations for resistance to Viral Nervous Necrosis in wild populations of European seabass Dicentrarchus labrax

François Allal , Quoc Khanh Doan , Béatrice Chatain , Alain Vergnet , Pierrick Haffray et al.

AQUA 2018, Aug 2018, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-03187164v1

Population-specific variations of the genetic architecture of sex determination in wild European sea bass Dicentrarchus labrax L.

Sara Faggion , Marc Vandeputte , Béatrice Chatain , Pierre-Alexandre Gagnaire , François Allal

AQUA 2018, Aug 2018, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-03187154v1

Selective breeding on tolerance to fasting improves feed conversion ratio of sea bass

Mathieu Besson , François Allal , Béatrice Chatain , Alain Vergnet , Frédéric Clota et al.

AQUA 2018, Aug 2018, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-03187434v1

Estimation of genetic parameters of feed conversion ratio based on individual phenotypes in sea bass

Mathieu Besson , François Allal , Béatrice Chatain , Alain Vergnet , Frédéric Clota et al.

11th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Feb 2018, Auckland, New Zealand

Communication dans un congrès hal-03156802v1
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A first demonstration of realized selection response for fillet yield in fish, in rainbow trout oncorhynchus mykiss

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Anastasia Bestin , Alexandre Desgranges , Sebastien Courant et al.

13. International Symposium for Genetics in Aquaculture (ISGA XIII), Jul 2018, Cairns, Australia

Communication dans un congrès hal-02264933v1

Heritabilities of resistance to VNN and vibriosis and genetic correlations with production traits and processing yields in two selected commercial lines of the European sea bass Dicentrarchus labrax

Romain Morvezen , Anastasia Bestin , Anne-Sophie Tiriau , Laurane Pallandre , Joelle Cabon et al.

13th International Symposium Genetics in Aquaculture, Jul 2018, Cairns, Australia

Communication dans un congrès hal-03187102v1

Genetic improvement of feed conversion ratio in sea bass : new approach based on individual phenotypes and genomic info

Mathieu Besson , François Allal , Béatrice Chatain , Alain Vergnet , Frédéric Clota et al.

Genetics and Breeding in Aquaculture: North meets South, May 2018, Bergen, Norway

Communication dans un congrès hal-03156894v1

Sélection du bar pour l’efficacité alimentaire: on y arrive

Mathieu Besson , Francois Allal , Béatrice Chatain , Alain Vergnet , Frédéric Clota et al.

Journée du SFAM, Mar 2018, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-03156814v1

Implementing successful aquaculture breeding programs: the keys to success in France

Marc Vandeputte , François Allal , Mathilde Dupont-Nivet , Pierrick Haffray

XVI congreso nacional de acuicultura - Journée Franco Espagnole, Oct 2017, Saragosse, Spain

Communication dans un congrès hal-02734602v1

Héritabilité de la résistance à la nécrose nerveuse virale de populations sauvages de Bar/Loup (Dicentrarchus labrax)

François Allal , Quoc Khanh Doan , Béatrice Chatain , Alain Vergnet , Gilles Breuil et al.

Journées techniques du Sysaaf, Dec 2017, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-03156758v1
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Peut-on sélectionner sur le rendement de filet chez les poissons ? (et chez le bar en particulier)

Marc Vandeputte , Clémence Fraslin , Jérôme Bugeon , François Allal , Antonio Puledda et al.

Journée du SFAMN (Syndicat Français de l'Aquaculture Marine et Nouvelle), Mar 2017, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-03155369v1
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Heritability of coping styles in farmed European sea bass

François Allal , Sebastien Ferrari , Khaled Horri , Marie-Odile Vidal , François Ruelle et al.

12. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Jun 2015, Santiago de Compostela, Spain. pp.1

Communication dans un congrès hal-02736002v1

Genetic variation of resistance to Viral Nervous Necrosis in wild populations of the European sea bass (Dicentrarchus labrax)

François Allal , Quoc Khanh Doan , Béatrice Chatain , Pierrick Haffray , Alain Vergnet et al.

XVI Congreso nacional de Aquaculture, Oct 2017, Zaragoza, Spain. ⟨10.1016/j.aquaculture.2017.05.011⟩

Communication dans un congrès hal-03155395v1

Genetic variation of resistance to Viral Nervous Necrosis and genetic correlations with production traits in wild populations of the European sea bass (Dicentrarchus labrax)

Quoc Khanh Doan , Marc Vandeputte , Béatrice Chatain , Pierrick Haffray , Alain Vergnet et al.

Aquaculture Europe 2017, Oct 2017, Dubrovnik, Croatia

Communication dans un congrès hal-03156682v1

GENESEA : développement de la sélection génomique chez le bar et la daurade

François Allal , Ronan Griot , Pierre-Alexandre Gagnaire , Christophe Klopp , Aline Bajek et al.

Journées Techniques du Sysaaf, Dec 2017, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-03156734v1

Sélectionner sur l’efficacité alimentaire : une nouvelle approche chez le bar

Mathieu Besson , François Allal , Béatrice Chatain , Alain Vergnet , Frédéric Clota et al.

Journées Techniques du Sysaaf, Dec 2017, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-03156749v1
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Does early growth play a role in the sex determination of european seabass dicentrarchus labrax?

Marc Vandeputte , Khaled Horri , François Allal , Sebastien Ferrari , Marie-Odile Vidal et al.

12th International Symposium on Genetics in Aquaculture (ISGA), Jun 2015, Santiago de Compostela, Spain. pp.1

Communication dans un congrès hal-02735070v1

La sélection génomique chez les poissons marins, pour quoi faire ?

François Allal , Pierrick Haffray , Marc Vandeputte

Journée du SFAMN (Syndicat Français de l'Aquaculture Marine et Nouvelle), Mar 2017, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-03155373v1

Heritability of boldness and hypoxia avoidance in European seabass, Dicentrarchus labrax

François Allal , Sebastien Ferrari , Khaled Horri , Alain Vergnet , David Benhaïm et al.

Aquaculture Europe 2017, Oct 2017, Dubrovnik, Croatia

Communication dans un congrès hal-03156670v1

Efficacité d’une sélection pour la résistance au jeûne

François Allal , Marc Vandeputte , Alain Vergnet , Frédéric Clota , Mathieu Besson et al.

Journées Techniques du Sysaaf, Dec 2017, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-03156744v1

Prédicteurs morphologiques du rendement chez le bar: projet BAR3

Marc Vandeputte , Antonio Puledda , Anne Sophie Tyran , Anastasia Bestin , Céline Coulombet et al.

Journée Technique Piscicole du Sysaaf, Feb 2016, Paris, France

Communication dans un congrès hal-02800398v1

Résistance génétique à l'entérite chez la truite ? Interaction avec la flavobactériose et les caractères de production

Anne-Sophie Tyran , Alexandre Desgranges , Anastasia Bestin , Florian Enez , François Allal et al.

5. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2016, Paris, France

Communication dans un congrès hal-02743196v1

Utilisation d'imagerie et d'ultrasons pour l'amélioration du rendement en chair par sélection génétique de la daurade

Dofungo Ouatarra , Anastasia Bestin , Pierrick Haffray , Florian Enez , Sophie Cariou et al.

5. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2016, Paris, France. pp.30

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Résistance au nodavirus chez le bar sauvage

François Allal , Quoc Khanh Doan , Béatrice Chatain , Alain Vergnet , Marc Vandeputte

Journée du SFAM (Syndicat Français de l'Aquaculture Marine et Nouvelle), Mar 2016, La Grande Motte, France

Communication dans un congrès hal-02796959v1

Investigation of genetic resistance to Viral Nervous Necrosis in European sea bass (Dicentrarchus labrax) using RAD sequencing

Christos Palaiokostas , Sophie Cariou , Anastasia Bestin , Jean-Sébastien Bruant , Pierrick Haffray et al.

Aquaculture Europe 2016, Sep 2016, Edinburgh, United Kingdom

Communication dans un congrès hal-03155244v1

Résistance à la nodavirose des populations naturelles de bar

François Allal , Khanh Doan Q. , Alain Vergnet , Béatrice Chatain , Gilles Breuil et al.

5e journées de la Recherche Filière piscicole, Jul 2016, paris, France

Communication dans un congrès hal-02795243v1

Genetic parameters of indirect predictors of gutted and fillet yields in the gilthead sea bream Sparus aurata in using 2D camera, 3D digitizer and ultrasound technologies

Pierrick Haffray , Dofungo Ouatarra , Sophie Cariou , Jean-Sébastien Bruant , Frederic Ventre et al.

Aquaculture Europe 2016, Sep 2016, Edinburgh, United Kingdom. 1146 p

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Efficacité alimentaire individuelle chez le bar

Sebastien Ferrari , Alain Vergnet , François Allal , Frédéric Clota , Béatrice Chatain et al.

Journée Technique Piscicole du Sysaaf, Feb 2016, Paris, France

Communication dans un congrès hal-02798942v1

Combining VITASSIGN and COLONY for pedigree reconstruction in a case of factorial mating with missing parental genotypes

François Allal , Q.K. Doan , Béatrice Chatain , Alain Vergnet , Marc Vandeputte

Aquaculture 2015: Cutting edge science in Aquaculture, Aug 2015, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-01535334v1
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Combining VITASSIGN and COLONY : an efficient practical procedure for parental assignment with missing parents

Quoc Khanh Doan , Marc Vandeputte , Béatrice Chatain , Alain Vergnet , François Allal

ISGA XII, Jun 2015, Santiago de Compostela, Spain

Communication dans un congrès hal-01535335v1

La personnalité du bar… un caractère héritable

François Allal , Sébastien Ferrari , Khaled Horri , Béatrice Chatain , Marc Vandeputte

Journée du SFAM (Syndicat Français de l'Aquaculture Marine et Nouvelle), Mar 2015, La Grande Motte, France

Communication dans un congrès hal-01535337v1

The phenotypic and genetic links between early individual growth and sex determination in European sea bass

Marc Vandeputte , Khaled Horri , François Allal , Sebastien Ferrari , Marie-Odile Vidal et al.

Aquaculture Europe 2015, Oct 2015, Rotterdam, Netherlands

Communication dans un congrès hal-01536551v1

Selective breeding for resistance to Viral Nervous Necrosis disease: prospective procedure for sustainable development in aquaculture

Khanh Doan Quoc , Marc Vandeputte , Béatrice Chatain , Thierry Morin , François Allal

Sustainable Fisheries Development Workshop, Nov 2015, Taïwan, Taiwan

Communication dans un congrès hal-02795348v1

Combining VITASSIGN and COLONY for pedigree reconstruction in a case of factorial mating with missing parental genotypes

François Allal , Quoc Khanh Doan , Beatrice Chatain , Alain Vergnet , Marc Vandeputte

Aquaculture Europe 2015, Oct 2015, Rotterdam, Netherlands

Communication dans un congrès hal-01535332v1
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Developing an AI-powered phenotyping platform for individual feed intake detection in group condition of European sabass (Dicentrarchus labrax)

Abdul Hawil Abas , François Allal , Alain Vergnet , Frédéric Clota , Franck Morell et al.

XVth International Symposium on Genetics in Aquaculture, May 2025, Cadiz, Spain

Poster de conférence hal-05513563v1
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Adaptation à la température des populations de bar européen (Dicentrarchus labrax) : Effets sur la survie au stade larvaire

Damien Crestel , Alain Vergnet , Frédéric Clota , Marie-Odile Blanc , Stéphane Lallement et al.

8èmes Journées Recherche Piscicole, Jul 2024, Rennes, France

Poster de conférence hal-05462881v1
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Remplacement des Artemia par des nauplii congelées de balanes dans l'alimentation larvaire du bar

Kostas Tzakris , Marie-Odile Blanc , Justin Caruana-Audard , Frédéric Clota , François Allal et al.

8èmes Journées Recherche Piscicole, Jul 2024, Rennes, France

Poster de conférence hal-05462903v1

Peut-on utiliser les isotopes stables du carbone et de l’azote pour prédire l’efficacité alimentaire chez le bar (Dicentrarchus labrax) ?

Gatien Debailleul , Sarah Nahon , François Allal , Marc Vandeputte , Alain Vergnet

8èmes Journées Recherche Piscicole, Jul 2024, Rennes, France

Poster de conférence hal-05462896v1
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Successful replacement of Artemia by cryopreserved barnacle nauplii in European seabass larval rearing

Kostas Tzakris , Marie-Odile Blanc , Justin Caruana-Audard , Frédéric Clota , François Allal et al.

Aquaculture Europe 2023, Sep 2023, Vienna, Austria

Poster de conférence hal-05462818v1

Etude de la croissance larvaire chez trois populations naturelles de bar (Dicentrarchus labrax) soumises à quatre régimes thermiques

Damien Crestel , Alain Vergnet , Marie-Odile Blanc , Stéphane Lallement , Frédéric Clota et al.

7èmes Journées recherche Filière Piscicole, Jul 2022, Paris, France

Poster de conférence hal-04185425v1

Efficiency of genomic selection by imputation in sea bass and sea bream to improve processing traits and resistance to Viral Nervous Necrosis

Jonathan D’ambrosio , Anastasia Bestin , Mathieu Besson , Romain Morvezen , Aline Bajek et al.

XIV. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Nov 2022, Puerto Varas, Chile

Poster de conférence hal-04185895v1

Phenotypic characterization of the three main natural populations of seabass (Dicentrarchus labrax) on growth and quality traits performances

Alain Vergnet , Frédéric Clota , Edoh Denis , François Ruelle , Marie-Odile Blanc et al.

Aquaculture Europe 2021, Oct 2021, Funchal, Portugal.

Poster de conférence hal-03360553v1

Individual feed intake and body weight gain relationship according to genetic origin and rearing temperature in European sea bass Dicentrarchus labrax

Charles Rodde , Marc Vandeputte , François Allal , Mathieu Besson , Alain Vergnet et al.

Aquaculture Europe 2019, Oct 2019, Berlin, Germany.

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Aquakultor: le premier jeu de simulation en aquaculture

François Allal , Mathieu Besson , - Tomagamestudio

6. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2019, Paris, France. 2019

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Accurate genomic prediction of phenotypic sex within European sea bass families : a unique tool to understand and control sex ratio variations in a species with polygenic sex determination

Marc Vandeputte , François Allal , Dafni Anastasiadi , Alexandre Vasilescu , Benjamin Geffroy et al.

AQUA 2018, Aug 2018, Montpellier, France.

Poster de conférence hal-03187169v1

Development and characterization of a 57K Single Nucleotide Polymorphism array for European sea bass

François Allal , Maud Duranton , Romain Morvezen , Sophie Brard-Fudulea , Charles Poncet et al.

AQUA 2018, Aug 2018, Montpellier, France

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Selective breeding to reduce the ecological footprint of aquaculture

Marc Vandeputte , Mathieu Besson , François Allal , Florence Phocas , Edwige Quillet

Aquaculture Europe 2017, Oct 2017, Dubrovnik, Croatia.

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A medium-throughput method to phenotype fish for individual feed efficiency

Mathieu Besson , François Allal , Béatrice Chatain , Alain Vergnet , Frédéric Clota et al.

Aquaculture Europe 2017, Oct 2017, Dubrovnik, Croatia.

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Sexe et croissance précoce chez le bar : des liens très étroits

Marc Vandeputte , Khaled Horri , François Allal , Sebastien Ferrari , Marie-Odile Vidal et al.

5. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2016, Paris, France. 2016

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Mesurer l’efficacité alimentaire individuelle chez le bar ?

Sebastien Ferrari , Alain Vergnet , Frédéric Clota , Béatrice Chatain , François Allal et al.

5emes Journées Recherche Filière Piscicole, Jul 2016, Paris, France.

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Genomic Selection in AquacultureAquaculture Species

François Allal , Nguyen Hong Nguyen

Ahmadi; Nourollah and Bartholomé; Jérôme. Complex Trait Prediction: Methods and Protocols, Springer US, pp.469--491, 2022, Methods in Molecular Biology, 978-1-07-162205-6. ⟨10.1007/978-1-0716-2205-6_17⟩

Chapitre d'ouvrage hal-03679217v1