François Lecointe

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Duplication-rich Felixounavirus genomes encode GlaF, a Gp2.5-like annealase defining a new family of phage recombinases

François Lecointe

15th International Conference. Phages | 2025. Bacteriophage in Medicine, Food and Biotechnology, Sep 2025, Oxford, United Kingdom

Communication dans un congrès hal-05247372v1

Genome-scale engineering of Bacillus subtilis yields emergent phenotypes and allows to revisit concepts of minimal genomes

Matthieu Jules , Etienne Dervyn , Anne-Gaëlle Planson , Kosei Tanaka , Victor Chubukov et al.

Bioengineering and Synthetic Biology, Nov 2022, Gif-sur-Yvette | Île-de-France, France

Communication dans un congrès hal-05123414v1

Prophage taming by the adherent-invasive Escherichia coli LF82 upon macrophage infection

Pauline Misson , Emma Bruder , Jeffrey Cornuault , Marianne De Paepe , Gaelle Demarre et al.

PHAGES in Paris. 7th symposium of the french PHAGE network, Oct 2022, Paris, France

Communication dans un congrès hal-04299558v1

Comportement des prophages de la souche d’Escherichia coli adhérentes invasives LF82 à l’intérieur des macrophages

François Lecointe , Pauline Misson , Emma Bruder , Jeffrey K. Cornuault , Marianne De Paepe et al.

89eme édition du congrès de l’Acfas, ACFAS, May 2022, Visioconférence, Canada

Communication dans un congrès hal-04299974v1

Characterization of E. coli LF82 prophages and study of their impact on the macrophage-induced persistence of their host

Pauline Misson , Jeffrey Cornuault , Olivier Son , Gaelle Demarre , Marianne De Paepe et al.

PHAGES in Grenoble. Fifth symposium of the French PHAGE network, Oct 2019, Grenoble (38000), France

Communication dans un congrès hal-04298658v1

Sak4 of phage HK620 is a RecA remote homolog with single-strand annealing activity stimulated by its cognate SSB protein

Geoffrey Hutinet , Arthur Besle , Olivier Son , Elisabeth Moncaut , Stephen Mc Govern et al.

12. French 3R Meeting, May 2017, Presqu'île de Giens, France

Communication dans un congrès hal-02786602v1

Double strand break repair triggers genome plasticity in Streptomyces

Grégory Hoff , Claire Bertrand , Emilie Piotrowski , Stephen T Mcgovern , François Lecointe et al.

International Symposium on the Biology of Actinomycetes, May 2017, Jeju, South Korea

Communication dans un congrès hal-01655226v1

Sak4 of phage HK620 is a RecA paralog with single-strand annealing activity stimulated by its cognate SSB protein

Geoffrey Hutinet , Arthur Besle , Olivier Son , Elisabeth Moncaut , Stephen Mc Govern et al.

Phages on MARSeille, Nov 2016, marseilles, France

Communication dans un congrès hal-02798891v1

Mécanismes de réparation des cassures double brin de l’ADN par le système NHEJ chez B subtilis

François Lecointe

Atelier satellite du Colloque annuel 2015 des utilisateurs de SOLEIL : "INRA-SOLEIL: l’Approche Synchrotron en Agriculture, Alimentation et Environnement"., Jan 2015, Gif sur Yvette, France

Communication dans un congrès hal-01536584v1

Characterization of the non homologous end joining (NHEJ) mechanism in <em>B. subtilis</em>

François Lecointe

Mini-symposium Micalis, 2012, Jouy-en-Josas, France

Communication dans un congrès hal-02805380v1

ChIP-chip: Novel targets of CcpA and role of CcpA during the carbon source media shift

François Lecointe

3. BaSysBio Spring Meeting, 2010, Bruxelles, Belgium

Communication dans un congrès hal-02814642v1

Utilisation du SPA-Tag chez <em>Bacillus subtilis</em> : identification d'une plateforme d'interaction dans l'usine réplicative bactérienne

François Lecointe

Journée thématique du réseau MassProt'INRA "Interactome et spectrométrie de masse", Jun 2008, Jouy-en-Josas, France

Communication dans un congrès hal-02814658v1

Etude d’enzymes de modification de nucléotides des ARNt et de leurs fonctions dans le métabolisme cellulaire chez S. cerevisiae

François Lecointe

RNA Club, 2002, Gif-sur-Yvette, France

Communication dans un congrès hal-02825166v1

T7 DNA polymerase treatment improves quantitative sequencing of both double-stranded and single-stranded DNA viruses

Maud Billaud , Ilias Theodorou , Quentin Lamy-Besnier , Shiraz Shah , François Lecointe et al.

Peer Community Journal, 2024, 4, pp.e63. ⟨10.24072/pcjournal.437⟩

Article dans une revue hal-04662155v1
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Prophage induction can facilitate the in vitro dispersal of multicellular Streptomyces structures

Hoda Jaffal , Mounia Kortebi , Pauline Misson , Paulo Tavares , Malika Ouldali et al.

PLoS Biology, 2024, 22 (7), pp.e3002725. ⟨10.1371/journal.pbio.3002725⟩

Article dans une revue hal-04679306v1
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Phage production is blocked in the adherent-invasive Escherichia coli LF82 upon macrophage infection

Pauline Misson , Emma Bruder , Jeffrey Cornuault , Marianne de Paepe , Pierre Nicolas et al.

PLoS Pathogens, 2023, 19 (2), pp.e1011127. ⟨10.1371/journal.ppat.1011127⟩

Article dans une revue hal-04017385v1
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Greedy reduction of Bacillus subtilis genome yields emergent phenotypes of high resistance to a DNA damaging agent and low evolvability

Etienne Dervyn , Anne-Gaëlle Planson , Kosei Tanaka , Victor Chubukov , Cyprien Guérin et al.

Nucleic Acids Research, 2023, 51 (6), pp.2974-2992. ⟨10.1093/nar/gkad145⟩

Article dans une revue hal-04094194v1
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Bacterial NHEJ: A never ending story

Claire Bertrand , Annabelle Thibessard , Claude Bruand , François Lecointe , Pierre Leblond

Molecular Microbiology, 2019, 11, pp.1139-1151. ⟨10.1111/mmi.14218⟩

Article dans une revue hal-02044826v1
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Sak4 of Phage HK620 Is a RecA Remote Homolog With Single-Strand Annealing Activity Stimulated by Its Cognate SSB Protein

Geoffrey Hutinet , Arthur Besle , Olivier Son , Stephen Mcgovern , Raphaël Guérois et al.

Frontiers in Microbiology, 2018, 9, pp.743. ⟨10.3389/fmicb.2018.00743⟩

Article dans une revue hal-02179070v1
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Multiple and Variable NHEJ-Like Genes Are Involved in Resistance to DNA Damage in Streptomyces ambofaciens

Grégory Hoff , Claire Bertrand , Lingli Zhang , Emilie Piotrowski , Ludovic Chipot et al.

Frontiers in Microbiology, 2016, 7, pp.1901. ⟨10.3389/fmicb.2016.01901⟩

Article dans une revue hal-01521993v1
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C-terminal region of bacterial Ku controls DNA bridging, DNA threading and recruitment of DNA ligase D for double strand breaks repair.

Stephen Mcgovern , Sonia Baconnais , Pierre Roblin , Pierre Nicolas , Pascal Drevet et al.

Nucleic Acids Research, 2016, 44 (10), pp.4785-4806. ⟨10.1093/nar/gkw149⟩

Article dans une revue hal-01457533v1

Condition-dependent transcriptome reveals high-level regulatory architecture in Bacillus subtilis

Pierre P. Nicolas , Ulrike U. Mäder , Etienne Dervyn , Tatiana Rochat , Aurelie A. Leduc et al.

Science, 2012, 335 (6072), pp.1103-1106. ⟨10.1126/science.1206848⟩

Article dans une revue hal-01000245v1
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Global Network Reorganization During Dynamic Adaptations of Bacillus subtilis Metabolism

Joerg Martin Buescher , Wolfram Liebermeister , Matthieu Jules , Markus Uhr , Jan Muntel et al.

Science, 2012, 335 (6072), pp. 1099-1103. ⟨10.1126/science.1206871⟩

Article dans une revue hal-03968015v1

The dynamic protein partnership of RNA polymerase in Bacillus subtilis

Olivier O. Delumeau , François Lecointe , Jan J. Muntel , Alain A. Guillot , Eric Guédon et al.

Proteomics, 2011, 11 (15), pp.2992 - 3001. ⟨10.1002/pmic.201000790⟩

Article dans une revue istex hal-01000647v1

The dynamic protein partnership of RNA polymerase in Bacillus subtilis

Olivier Delumeau , François Lecointe , Jan Muntel , Alain Guillot , Eric Guédon et al.

Proteomics, 2011, 11 (15), pp. 2992-3001. ⟨10.1002/pmic.201000790⟩

Article dans une revue istex hal-03761115v1
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The C-Terminal Domain of the Bacterial SSB Protein Acts as a DNA Maintenance Hub at Active Chromosome Replication Forks

Audrey Costes , François Lecointe , Stephen Mc Govern , Sophie Quevillon-Cheruel , Patrice P. Polard

PLoS Genetics, 2010, 6 (12), pp.e1001238. ⟨10.1371/journal.pgen.1001238⟩

Article dans une revue hal-02667913v1
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The family X DNA polymerase from <em>Deinococcus radiodurans</em> adopts a non-standard extended conformation

Nicolas Leulliot , Lionel Cladière , François Lecointe , Dominique Durand , Ulrich Hübscher et al.

Journal of Biological Chemistry, 2009, 284 (18), pp.11992-11999. ⟨10.1074/jbc.M809342200⟩

Article dans une revue hal-02668856v1

Crystal structure of an intact type II DNA topoisomerase: insights into DNA transfer mechanisms.

Marc Graille , Lionel Cladière , Denys Durand , François Lecointe , Danièle Gadelle et al.

Structure / Struct Fold Des; Structure (Camb ), 2008, 16 (3), pp.360-70. ⟨10.1016/j.str.2007.12.020⟩

Article dans une revue hal-00286306v1

Anticipating chromosomal replication fork arrest: SSB targets repair DNA helicases to active forks

François Lecointe , Céline Sérèna , Marion Velten , Audrey Costes , Stephen Mcgovern et al.

EMBO Journal, 2007, 26 (19), pp.4239-4251. ⟨10.1038/sj.emboj.7601848⟩

Article dans une revue hal-02667023v1

Limited concentration of RecA delays DNA double-strand break repair in <em>Deinococcus radiodurans</em> R1

Edmond Jolivet , François Lecointe , Geneviève Coste , Katsuya Satoh , Issay Narumi et al.

Molecular Microbiology, 2006, 59 (1), pp.338-349. ⟨10.1111/j.1365-2958.2005.04946.x⟩

Article dans une revue hal-02666652v1

Deciphering the molecular bases of Mycobacterium tuberculosis binding to the lectin DC-SIGN reveals an underestimated complexity.

Sylvain Pitarque , Jean-Louis Herrmann , Jean-Luc Duteyrat , Mary Jackson , Graham R Stewart et al.

Biochemical Journal, 2005, 392 (Pt 3), pp.615-24. ⟨10.1042/BJ20050709⟩

Article dans une revue pasteur-01372648v1

Involvement of an X family DNA polymerase in double-stranded break repair in the radioresistant organism <em>Deinococcus radiodurans</em>

François Lecointe , Igor V. Shevelev , Adriana Bailone , Suzanne Sommer , Ulrich Hübscher

Molecular Microbiology, 2004, 53 (6), pp.1721-1730. ⟨10.1111/j.1365-2958.2004.04233.x⟩

Article dans une revue hal-02683264v1

Vectors for regulated gene expression in the radioresistant bacterium <em>Deinococcus radiodurans</em>

François Lecointe , Geneviève Coste , Suzanne Sommer , Adriana Bailone

Gene, 2004, 336 (1), pp.25-35. ⟨10.1016/j.gene.2004.04.006⟩

Article dans une revue istex hal-02678164v1

Trm7p catalyses the formation of two 2'-<em>O</em>-methylriboses in yeast tRNA anticodon loop

Lionel Pintard , François Lecointe , Janusz M. Bujnicki , Claire Bonnerot , Henri Grosjean et al.

EMBO Journal, 2002, 21 (7), pp.1811-1820. ⟨10.1093/emboj/21.7.1811⟩

Article dans une revue hal-02683263v1
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Lack of pseudouridine 38/39 in the anticodon arm of yeast cytoplasmic tRNA decreases <em>in vivo</em> recoding efficiency

François Lecointe , Olivier Namy , Isabelle Hatin , George Simos , Jean-Pierre Rousset et al.

Journal of Biological Chemistry, 2002, 277 (34), pp.30445-30453. ⟨10.1074/jbc.M203456200⟩

Article dans une revue hal-02682958v1
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Pus1p-dependent tRNA pseudouridinylation becomes essential when tRNA biogenesis is compromised in yeast

Helge Grosshans , François Lecointe , Henri Grosjean , Ed Hurt , George Simos

Journal of Biological Chemistry, 2001, 276 (49), pp.46333-46339. ⟨10.1074/jbc.M107141200⟩

Article dans une revue hal-02683267v1
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Characterization of yeast protein Deg1 as pseudouridine synthase (Pus3) catalyzing the formation of Ψ38 and Ψ39 in tRNA anticodon loop

François Lecointe , George Simos , Anke Sauer , Eduard C. Hurt , Yuri Motorin et al.

Journal of Biological Chemistry, 1998, 273 (3), pp.1316-1323. ⟨10.1074/jbc.273.3.1316⟩

Article dans une revue hal-02699150v1
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Phage production is blocked in the adherent-invasive Escherichia coli LF82 upon macrophage infection

Pauline Misson , Emma Bruder , Jeffrey K. Cornuault , Marianne De Paepe , Pierre Nicolas et al.

Viruses Of Microbes 2023, Jul 2023, Tbilisi, Georgia

Poster de conférence hal-04160179v1
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Greedy reduction of Bacillus subtilis genome yields emergent phenotypes

Etienne Dervyn , Anne-Gaëlle Planson , Kosei Tanaka , Victor Chubukov , Cyprien Guérin et al.

BACELL2023, Nov 2023, Kobe, Japan.

Poster de conférence hal-04316425v1

Characterization of phagic recombination proteins and their impact on E. coli LF82 pathogenicity

Pauline Misson , Emma Bruder , Jeffrey Cornuault , Olivier Son , Alice Eon-Bertho et al.

PHAGES in Roscoff. Sixth symposium of the French PHAGE Network, Oct 2021, Roscoff (FR), France

Poster de conférence hal-04298707v1

ATP-Dependent Formation Of Sak4 Filaments: A First Step Towards The Single Strand Annealing

Olivier Son , Sonia Baconnais , Marie-Agnès Petit , Eric Le Cam , François Lecointe

Phages in Grenoble, 2019, Grenoble, France

Poster de conférence hal-03319650v1
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Impact of prophages from Escherichia coli LF82 on its macrophage-induced persistence

Pauline Misson , Jeffrey Cornuault , Gaelle Demarre , Olivier Son , Marianne De Paepe et al.

13th 3R meeting. Replication, Repair, Recombination, From molecular mechanisms to clinical applications, May 2019, Giens (Var), France

Poster de conférence hal-04298375v1

Role of ATP in the single strand annealing activity of the "RecA core only" Sak4 of phage HK620

Olivier Son , Sonia Baconnais , Marie-Agnès Petit , Eric Le Cam , François Lecointe

13. French 3R Meeting, May 2019, Giens, France. , 2019

Poster de conférence hal-02734012v1
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Sak4 of phage HK620 is an SSB-stimulated annealase that is involved in the lytic development of the phage

Geoffrey Hutinet , Arthur Besle , Olivier Son , Stephen Mcgovern , Raphaël Guérois et al.

3. Symposium of the French Phage Network, Nov 2017, Gif-sur-Yvette, France. , 54 p., 2017, 3rd Symposium of the French Phage Network: Phages-sur-Yvette

Poster de conférence hal-02735072v1

Characterization of the non homologous end joining (NHEJ) mechanism in <em>B. subtilis</em>: the dual role of the C-terminal part of Ku

Stephen Mc Govern , Sonia Baconnais , Pierre Roblin , Pierre P. Nicolas , Pascal Drevet et al.

11. Colloque des 3R, May 2015, Presqu'ile de Giens, France. , 2015

Poster de conférence hal-02743874v1

Caractérisation du mécanisme de recollement d'extrémités non homologues (NHEJ) chez <em>Bacillus subtilis</em>

Stephen Mc Govern , Héloïse Simonson , Pascal Drevet , Pierre Roblin , Jean-Baptiste Charbonnier et al.

10. Colloque des 3R : Réplication, Recombinaison et Réparation, May 2013, Presqu'île de Giens, France. , 2013

Poster de conférence hal-02809102v1

New DNA binding sites for CcpA, the major regulator of the carbon catabolite response in <em>Bacillus subtilis</em>

Nathalie N. Pigeonneau , François Lecointe , Pierre Nicolas , Philippe Noirot

Systems Biology of Microorganisms, Mar 2010, Paris, France. , 2010

Poster de conférence hal-02815793v1

The dynamic protein partnership of RNA polymerase in <em>Bacillus subtilis</em>

Olivier Delumeau , François Lecointe , Alain Guillot , Veronique Monnet , Patrice P. Polard et al.

Systems Biology of Microorganisms, Mar 2010, Paris, France. , 2010

Poster de conférence hal-02822191v1

SSB : coordinateur des mécanismes de réparation des fourches de réplication ?

François Lecointe , Audrey Costes , Stephen Mcgovern , Sophie Cheruel , Patrice P. Polard

5. Journées des Microbiologistes de l'INRA 2010 (JMI 2010), May 2010, Poitiers, France. , 196 p., 2010, Journées des Microbiologistes de l'INRA 2010 - Futuroscope 5-7 mai 2010

Poster de conférence hal-02754366v1

SSB : coordinateur des mécanismes de réparation des fourches de réplication ?

François Lecointe , Audrey Costes , Stephen Mc Govern , Sophie Cheruel , Patrice P. Polard

8. Colloque des 3R : Réplication, Recombinaison et Réparation, May 2009, Presqu'île de Giens, France. 2009

Poster de conférence hal-02823127v1

Un rôle général de SSB dans la surveillance des fourches de réplication chez les bactéries

François Lecointe , Céline Sérèna , Marion Velten , Stephen Mc Govern , Audrey Costes et al.

7. Colloque des 3R : Réplication, Recombinaison et Réparation, May 2007, Presqu'île de Giens, France. 2007

Poster de conférence hal-02817628v1

Mécanismes de radiorésistance chez Deinococcus radiodurans

François Lecointe , Adriana Bailone , Suzanne Sommer

5. Colloque des 3R : Réplication, Recombinaison et Réparation, Jun 2003, Presqu’île de Giens, France. 2003

Poster de conférence hal-02831658v1

Purification et caractérisation biochimique de l'ARNt: pseudouridine 38/39 synthétase (Pus3p) de S. cerevisiae

François Lecointe , Yuri Motorin , Henri Grosjean

3. Congrès SifrARN, 2000, Toulouse, France. , 2000

Poster de conférence hal-02841208v1

La protéine Deg1 de S. cerevisiae est une pseudouridine synthétase catalysant la formation de Psi38 et Psi39 dans la boucle anticodon des ARNt

François Lecointe , Yuri Motorin , Henri Grosjean

7. Rencontre de l’Ecole Doctorale B2M, 1999, Paris, France. 1999

Poster de conférence hal-02841844v1
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Etude de machines moléculaires impliquées dans la dynamique des génomes bactériens et phagiques

François Lecointe

Génomique, Transcriptomique et Protéomique [q-bio.GN]. Université Paris Saclay, 2021

HDR tel-03320109v1

Nonhomologous End-Joining in Bacteria

Annabelle Thibessard , Claire Bertrand , Edward J Bartlett , Aidan J Doherty , Claude Bruand et al.

Joseph Jez. Encyclopedia of Biological Chemistry 3rd Edition,, 4, Elsevier, 2021, 9780128194607

Chapitre d'ouvrage hal-03319644v1

Translational recoding and RNA modifications

Olivier Namy , François Lecointe , Henri Grosjean , Jean-Pierre Rousset

Fine-Tuning of RNA Functions by Modification and Editing, 12, Springer Verlag, 442 p., 2005, Topics in Current Genetics, 978-3-540-24495-0 978-3-540-31454-7. ⟨10.1007/b106847⟩

Chapitre d'ouvrage hal-02831702v1