Frédéric DE LAMOTTE

Frédéric de Lamotte - Data Scientist Référent Données Stratégique - Département Biologie et Amélioration des Plantes. INRAE
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  • Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
  • Institut Français de Bioinformatique (IFB-core)
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FAIR-Checker: supporting digital resource findability and reuse with Knowledge Graphs and Semantic Web standards

Alban Gaignard , Thomas Rosnet , Frédéric de Lamotte , Vincent Lefort , Marie-Dominique Devignes
Journal of Biomedical Semantics, 2023, 14 (1), pp.7. ⟨10.1186/s13326-023-00289-5⟩
Article dans une revue hal-04148181 v1
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RapGreen, an interactive software and web package to explore and analyze phylogenetic trees

Jean-François Dufayard , Stéphanie Bocs , Valentin Guignon , Delphine Larivière , Alexandra Louis et al.
NAR Genomics and Bioinformatics, 2021, 3 (3), 6 p. ⟨10.1093/nargab/lqab088⟩
Article dans une revue hal-03541670 v1
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Comprehensive classification of the plant non-specific lipid transfer protein superfamily towards its Sequence -Structure -Function analysis

Cécile Fleury , Jérôme Gracy , Marie-Françoise Gautier , Jean-Luc Pons , Jean-François Dufayard et al.
PeerJ, 2019, 7, pp.e7504. ⟨10.7287/peerj.preprints.27687v1⟩
Article dans une revue hal-02112505 v1
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Comprehensive classification of the plant non-specific lipid transfer protein superfamily towards its sequence–structure–function analysis

Cécile Fleury , Jérôme Gracy , Marie-Françoise Gautier , Jean-Luc Pons , Jean-François Dufayard et al.
PeerJ, 2019, 7, pp.e7504. ⟨10.7717/peerj.7504⟩
Article dans une revue hal-02266388 v1
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The South Green portal: a comprehensive resource for tropical and Mediterranean crop genomics

Valentin Guignon , Yann Hueber , Mathieu Rouard , Stéphanie Bocs , David Couvin et al.
Current Plant Biology, 2016, 7-8, pp.6-9. ⟨10.1016/j.cpb.2016.12.002⟩
Article dans une revue hal-02631148 v1

Positional cloning of the rice male sterility gene ms-IR36, widely used in the inter-crossing phase of recurrent selection schemes

Julien Frouin , Denis Filloux , James Taillebois , Cecile Grenier , Fabienne Montes et al.
Molecular Breeding, 2014, 33 (3), pp.555-567. ⟨10.1007/s11032-013-9972-3⟩
Article dans une revue hal-02635292 v1

Lipid transfer proteins in coffee: isolation of Coffea orthologs, Coffea arabica homeologs, expression during coffee fruit development and promoter analysis in transgenic tobacco plants

Michelle G. Cotta , Leila M. G. Barros , Juliana D. de Almeida , Frédéric F. de Lamotte , Eder A. Barbosa et al.
Plant Molecular Biology, 2014, 85 (1-2), pp.11 - 31. ⟨10.1007/s11103-013-0166-5⟩
Article dans une revue hal-01268596 v1
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Clever generation of rich SPARQL queries from annotated relational schema: application to Semantic Web Service creation for biological databases

Julien Wollbrett , Pierre Larmande , Frédéric F. de Lamotte , Manuel Ruiz
BMC Bioinformatics, 2013, 14, ⟨10.1186/1471-2105-14-126⟩
Article dans une revue hal-01268129 v1

Insight into the biology, genetics and evolution of the Centella asiatica polyploid complex in Madagascar

Soaharin'Ny Ony Raoseta Rakotondralambo , Marguerite Rodier-Goud , Ronan Rivallan , Alexandra Lussert , Pascal Danthu et al.
Industrial Crops and Products, 2013, 47, pp.118 - 125. ⟨10.1016/j.indcrop.2013.02.022⟩
Article dans une revue istex hal-01268112 v1

Characterization of a cassiicolin-encoding gene from Corynespora cassiicola, pathogen of rubber tree (Hevea brasiliensis)

Marine M. Deon , Yanice Y. Bourré , Stéphanie S. Gimenez , Angélique A. Berger , Daniel D. Bieysse et al.
Plant Science, 2012, 185, pp.227-237. ⟨10.1016/j.plantsci.2011.10.017⟩
Article dans une revue istex hal-00964742 v1

Single-chain variable fragments antibody specific to Corynespora cassiicola toxin, cassiicolin, reduces necrotic lesion formation in Hevea brasiliensis

Elumalai Sunderasan , Rusni A. Kadir , Valérie V. Pujade-Renaud , Frédéric de Lamotte , Hoong Yeet Yeang et al.
Journal of General Plant Pathology, 2009, 15 (1), pp.19-26. ⟨10.1007/s10327-008-0137-x⟩
Article dans une revue istex hal-02668957 v1

11. International Symposium on BioChromatography and Nanoseparation preface

Frédéric F. de Lamotte
Journal of Chromatography B - Analytical Technologies in the Biomedical and Life Sciences, 2009, 877 (24), pp.2419-2419. ⟨10.1016/j.jchromb.2009.01.029⟩
Article dans une revue istex hal-02657183 v1

Purification and characterization of cassiicolin, the toxin produced by Corynespora cassiicola, causal agent of the leaf fall disease of rubber tree

Frédéric de Lamotte , Marie-Pierre Duviau , Christine Sanier , Robert Thai , Joël Poncet et al.
Journal of Chromatography B - Analytical Technologies in the Biomedical and Life Sciences, 2007, 849 (1-2), pp.357-362. ⟨10.1016/j.jchromb.2006.10.051⟩
Article dans une revue istex hal-02668494 v1

Structural analysis of cassiicolin, a host-selective protein toxin from Corynespora cassiicola

Philippe Barthe , Valérie Pujade-Renaud , Frédéric Breton , Daniel Gargani , Robert Thai et al.
Journal of Molecular Biology, 2007, 367 (1), pp.89-101. ⟨10.1016/j.jmb.2006.11.086⟩
Article dans une revue istex hal-02665937 v1

Structural Analysis of Cassiicolin, a Host-selective Protein Toxin from Corynespora cassiicola

Philippe Barthe , Valérie Pujade-Renaud , Frédéric Breton , Daniel Gargani , Robert Thai et al.
Journal of Molecular Biology, 2007, 367 (1), pp.89-101. ⟨10.1016/j.jmb.2006.11.086⟩
Article dans une revue istex hal-03472322 v1

Biotinylation of glycan chains in beta2 glycoprotein I induces dimerization of the molecule and its detection by the human autoimmune anti-cardiolipin antibody EY2C9

Arnaud Dupuy d'Angeac , Ilias Stefas , Hubert Graafland , Frédéric de Lamotte , Marcel Rucheton et al.
Biochemical Journal, 2006, 393 (1), pp.117-127. ⟨10.1042/BJ20050932⟩
Article dans une revue hal-02659024 v1

The thioredoxin h system: potential applications

Philippe Joudrier , Marie Francoise M. F. Gautier , Frédéric de Lamotte , Karoly Kobrehel
Biotechnology Advances, 2005, 23 (1), pp.81-85. ⟨10.1016/j.biotechadv.2004.09.003⟩
Article dans une revue istex hal-02683364 v1

Structure of a liganded type 2 non-specific lipid-transfer protein from wheat and the molecular basis of lipid binding

F. Hoh , J.L. Pons , M.F. Gautier , Frédéric de Lamotte , C. Dumas
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2005, 61, pp.397-406
Article dans une revue hal-02674377 v1

Structure of a liganded type 2 non-specific lipid-transfer protein from wheat and the molecular basis of lipid binding

François Hoh , Jean-Luc Pons , Marie-Françoise Gautier , Frédéric de Lamotte , Christian Dumas
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2005, 61 (4), pp.397-406. ⟨10.1107/S0907444905000417⟩
Article dans une revue istex hal-02359483 v1

Single step purification of a series of wheat recombinant proteins with expanded bed absorption chromatography

Frédéric de Lamotte
Journal of Chromatography B - Analytical Technologies in the Biomedical and Life Sciences, 2005, 818, pp.29-33
Article dans une revue hal-02676488 v1
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The thioredoxin h system: potential applications

P. Joudrier , M.F. Gautier , F. de Lamotte , K. Kobrehel
Biotechnology Advances, 2004, 23 (1), pp.81-85. ⟨10.1016/j.biotechadv.2004.09.003⟩
Article dans une revue (article de synthèse) istex hal-03321200 v1

Effect of pH on the oxidation-reduction properties of thioredoxins

A.T. Setterdahl , P.T. Chivers , M. Hirasawa , S.D. Lemaire , E. Keryer et al.
Biochemistry, 2003, 42, pp.14877-14884. ⟨10.1021/bi0302088⟩
Article dans une revue istex hal-02676480 v1
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Refined solution structure of a liganded type 2 wheat nonspecific lipid transfer protein

Jean-Luc Pons , Frédéric de Lamotte , Marie Francoise M. F. Gautier , Marc-André Delsuc
Journal of Biological Chemistry, 2003, 278 (16), pp.14249-14256. ⟨10.1074/jbc.M211683200⟩
Article dans une revue hal-02675602 v1

NMR monitoring of accumulation and folding of 15N-labeled protein overexpressed in Pichia pastoris

Frédéric de Lamotte , Hélène Boze , C. Blanchard , C. Klein , Gabrielle Moulin et al.
Protein Expression and Purification, 2001, 22, pp.318-324
Article dans une revue hal-02681588 v1

Protein dynamics studies on wheat type 2 lipid transfer protein

Frédéric de Lamotte , F. Vagner , J.L. Pons , M.F. Gautier , C. Roumestand et al.
Comptes rendus de l’Académie des sciences. Série IIc, Chimie, 2001, 4, pp.839-843
Article dans une revue hal-02674275 v1

Glutathione Reductase in Wheat Grain. 1. Isolation and Characterization

Frédéric de Lamotte , Nicolas Vianey-Liaud , Marie-Pierre Duviau , Károly Kobrehel
Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2000, 48 (10), pp.4978-4983. ⟨10.1021/jf0003808⟩
Article dans une revue istex hal-03321203 v1

Glutathione reductase in wheat grain. 1. Isolation and characterization

Frédéric de Lamotte , N. Vianey-Liaud , M.P. Duviau , Karoly Kobrehel
Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2000, 48, pp.4978-4983
Article dans une revue hal-02698329 v1

Single step purification of a wheat 9kDa lipid transfer protein secreted by Pichia pastoris

Frédéric de Lamotte , C. Klein , N. Issaly , M.F. Gautier , Hélène Boze
Biotechnology Techniques, 1999, 13, pp.351-354
Article dans une revue hal-02694660 v1

Characterization of wheat thioredoxin h cDNA and production of an active Triticum aestivum protein in Escherichia coli

Marie-Françoise Gautier , Valerie Lullien Pellerin , Frédéric F. de Lamotte , Anne-Laure Guirao , Philippe Joudrier
European Journal of Biochemistry, 1998, 252 (2), pp.314-324. ⟨10.1046/j.1432-1327.1998.2520314.x⟩
Article dans une revue hal-02692932 v1

High-level secretion of a wheat lipid transfer protein in Pichia pastoris

C. Klein , Frédéric F. de Lamotte , F. Gautier , Gabrielle Moulin , Hélène Boze et al.
Protein Expression and Purification, 1998, 13, pp.73-82
Article dans une revue hal-02692748 v1

Apports potentiels de la transgénèse pour l'amélioration de la qualité des blés

Philippe Joudrier , Remi Alary , Valerie Lullien Pellerin , Frédéric de Lamotte , Karoly Kobrehel et al.
Industries des Céréales, 1998, 106, pp.10-14
Article dans une revue hal-02695368 v1

Structural anf functional roles of a conserved proline residue in the alpha2 helix of Escherichia coli thioredoxin

Frédéric F. de Lamotte , Clotilde Pruvost , P. Minard , M.A. Delsuc , M. Miginiac-Maslow et al.
Protein Engineering, 1997, 10 (12), pp.1425-1432
Article dans une revue hal-02689362 v1

Structural and functional roles of a conserved proline residue in the alpha2 helix of Escherichia coli thioredoxin

Frédéric F. de Lamotte , Clotilde Pruvost , P. Minard , M.A. Delsuc , M. Miginiac-Maslow et al.
Protein Engineering, 1997, 10 (12), pp.1425-1432
Article dans une revue hal-02692166 v1

Structural and functional roles of a conserved proline residue in the alpha2 helix of Escherichia coli thioredoxin.

Frédéric F. de Lamotte , Christian Pruvost , Philippe Minard , Marc-André Delsuc , Myroslawa Miginiac-Maslow et al.
Protein Engineering, 1997, 10 (12), pp.1425-32. ⟨10.1093/protein/10.12.1425⟩
Article dans une revue hal-00788517 v1

Diversité du gène de cassiicoline en lien avec le pouvoir pathogène de C. cassiicola et mise en oeuvre d'un test toxinique pour la sélection d'individus tolérants chez Hevea brasiliensis.

Marine Deon , Dinh Minh Tran , Boris B. Fumanal , Stéphanie Gimenez , Daniel D. Bieysse et al.
10. Rencontres de Phytopathologie - Journées Jean Chevaugeon, Societe Francaise de Phytopathologie (SFP). FRA., 2014
Communication dans un congrès hal-02793856 v1

MS-DMind: Multi scale data “minding” for molecular process related to biotic and abiotic stresses: pilot study with the nsLTP superfamily of proteins

Manuel Ruiz , Cécile Fleury , Frédéric F. de Lamotte , Marie Francoise Gautier , François Dufayard et al.
Colloque Plant Genomics 2012, Apr 2012, Pont-Royal en Provence, France
Communication dans un congrès hal-01267785 v1

Structure-based classification of the plant non-specific lipid transfer protein superfamily towards its functional characterization

Cécile Fleury , Marie Francoise M. F. Gautier , Jean-François Dufayard , Franck Molina , Manuel Ruiz et al.
ECCB 2011, Jul 2011, Vienna, Austria
Communication dans un congrès hal-02745958 v1

Structure-based classification of the plant non-specific lipid transfer protein superfamily towards its functional characterization

Cécile Fleury , Marie Francoise M. F. Gautier , Jean-François Dufayard , Franck Molina , Manuel Ruiz et al.
ISMB 2011, Jul 2011, Vienna, Austria
Communication dans un congrès hal-02746029 v1

Rôle de l’amidon synthase IV chez le riz

Sophie Charton , Julien Serret , Nathalie N. Geneix , Brigitte B. Bouchet , Marie Francoise M. F. Gautier et al.
Colloque Graines 2011, Oct 2011, Nantes, France
Communication dans un congrès hal-02747010 v1

Structure-based classification of the plant non-specific lipid transfer protein superfamily towards its functional characterization

Cécile Fleury , Marie Francoise M. F. Gautier , Franck Molina , Manuel Ruiz , Frédéric F. de Lamotte
JOBIM 2011, Jun 2011, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02748623 v1

Towards a multi-scale and formalized representation of protein sequence-structure-function relationships : the nsLTP family as a case of study

Cécile Fleury , Marie Francoise M. F. Gautier , Pierre Larmande , Sabine Pérès , Frédéric F. de Lamotte et al.
JOBIM2010, Sep 2010, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02753839 v1

Towards a multi-scale and formalized representation of protein sequence-structure-function relationships : the nsLTP family as a case of study

Cécile Fleury , Marie Francoise M. F. Gautier , Pierre Larmande , Sabine Pérès , Frédéric F. de Lamotte et al.
Séminaire Génomique Végétale, Mar 2010, Pont-Royal en Provence, France
Communication dans un congrès hal-02752562 v1

Towards a multi-scale and formalized representation of protein sequence-structure-function relationships : the nsLTP family as a case of study

Cécile Fleury , Marie Francoise M. F. Gautier , Pierre Larmande , Sabine Pérès , Frédéric F. de Lamotte et al.
18. Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), Jul 2010, Boston, United States
Communication dans un congrès hal-02753301 v1

11. International Symposium on BioChromatography and Nanoseparation preface

Frédéric F. de Lamotte
11. International Symposium on BioChromatography and Nanoseparation preface, Oct 2008, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02820189 v1

Comparative analysis of cassiicolin structure and production in four strains of Corynespora cassiicola

Valérie Pujade-Renaud , Y. Bourre , Frédéric F. de Lamotte , Joël Poncet , Daniel Bieysse
International Natural Rubber Conference and Annual Meetings IRRDB, Oct 2008, Kuala Lumpur, Malaysia. n.p
Communication dans un congrès hal-01189588 v1

Détermination structurale de la cassiicoline, la toxine glycosylée de Corynespora cassiicola

Philippe Barthe , Valérie Pujade-Renaud , Marie-Pierre Duviau , Frédéric F. de Lamotte , Christian Roumestand
Congrès du GERM (Groupe d’Étude de Résonance Magnétique), Mar 2007, Alénya, France. n.p
Communication dans un congrès hal-01189598 v1

Fungal phytotoxins; story-case of cassiicolin, a new proteinaceous host-selective toxin from Corynespora cassiicola

Valérie Pujade-Renaud , Frédéric F. de Lamotte , Philippe Barthe , Christian Roumestand
Brazilian Phytopathological Society Meeting, Aug 2007, Paranà, Brazil. n.p
Communication dans un congrès hal-01189575 v1

Molecular studies of genes involved in quality and drought tolerance: development of probes

Philippe Joudrier , Valerie Lullien Pellerin , Frédéric de Lamotte , Remi Alary , M. Labhilili et al.
SEWANA (South Europe, West Asia and North Africa) Durum Research Network, Mar 1995, Aleppo, Syria. pp.287-295
Communication dans un congrès hal-02842467 v1

Structural Studies on Wheat Thioredoxin h

Frédéric F. de Lamotte , C Pruvost , Valerie Lullien Pellerin , Marie-Françoise Gautier , Philippe Joudrier et al.
Conference on plant proteins from European crops. Food and non-food application, Nov 1996, Nantes, France. pp.5257, ⟨10.1007/978-3-662-03720-1_9⟩
Communication dans un congrès hal-03745394 v1

Etude des gènes impliqués dans la qualité technologique des blés

Philippe Joudrier , Valerie Lullien Pellerin , F. de La Motte , Karoly Kobrehel , Remi Alary et al.
Séminaire Agrogène, Feb 1995, Melun, France
Communication dans un congrès hal-02775426 v1

Molecular studies of cysteine-rich proteins from wheat

M.F. Gautier , Valerie Lullien Pellerin , W. Dieryck , Frédéric de Lamotte , T. Ihorai et al.
International Meeting, Sep 1994, Viterbo, Italy
Communication dans un congrès hal-02773738 v1
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Orchestrating data flows throughout their whole life cycle

Konogan Bourhy , Laurent Bouri , Christophe Bruley , Olivier Collin , Frédéric De Lamotte et al.
JOBIM 2024 - Journées ouvertes en biologie, informatique, et mathématiques, Jun 2024, Toulouse, France. , 2024
Poster de conférence hal-04618277 v1
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Orchestrating data flows throughout their whole life cycle

Frédéric de Lamotte , Laurent Bouri , Konogan Bourhy , Christophe Bruley , Olivier Collin et al.
JOBIM2024 : Journées Ouvertes en Biologie, Informatique, et Mathématiques - 2024, Jun 2024, Toulouse, France. 2024
Poster de conférence hal-04665629 v1
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PCSC - Portail Calcul Stockage Cloud

Pierre Adenot , Estelle Ancelet , Sophie Aubin , David Benaben , Damien Berry et al.
JCAD 2021 - Journées Calcul Données, Dec 2021, Dijon, France.
Poster de conférence hal-03507793 v1

CompPhy v2 : une plate-forme collaborative pour visualiser et comparer des phylogénies

Floréal Cabanettes , Marc Chakiachvili , Vincent Lefort , Jean-François Dufayard , Frédéric F. de Lamotte et al.
JOBIM: Journées ouvertes de biologie informatique et mathématiques, Jun 2016, Lyon, France. , 437 p., 2016, JOBIM 2016
Poster de conférence hal-01594479 v1

South Green bioinformatics platform: Update 2015

A. Armero , Franc-Christophe Baurens , Stephanie Bocs , A. Breil , Frédéric F. de Lamotte et al.
3. Plant Genomics Congress, May 2015, Londres, United Kingdom. Global Engage, 2015, Plant Genomics Congress
Poster de conférence hal-02739966 v1
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Étude des relations structure - fonction des protéines végétales

Frédéric de Lamotte
Biochimie [q-bio.BM]. Université Montpellier II - Sciences et Techniques du Languedoc, 2006
HDR tel-00375496 v1