Accéder directement au contenu

Frédéric DE LAMOTTE

Frédéric de Lamotte - Data Scientist Référent Données Stratégique - Département Biologie et Amélioration des Plantes. INRAE
28%
Libre accès
64
Documents
Affiliations actuelles
  • 577435
  • 1002426
Identifiants chercheurs
  • IdHAL frederic-de-lamotte
  • ORCID 0000-0003-4234-1172
  • Google Scholar : https://scholar.google.fr/citations?user=BG5fH8QAAAAJ&hl=fr
Contact

Présentation


Compétences

bioinformatique bioinformatics Research Data Management FAIR DATA

Publications

Image document

FAIR-Checker: supporting digital resource findability and reuse with Knowledge Graphs and Semantic Web standards

Alban Gaignard , Thomas Rosnet , Frédéric de Lamotte , Vincent Lefort , Marie-Dominique Devignes
Journal of Biomedical Semantics, 2023, 14 (1), pp.7. ⟨10.1186/s13326-023-00289-5⟩
Article dans une revue hal-04148181v1
Image document

RapGreen, an interactive software and web package to explore and analyze phylogenetic trees

Jean-François Dufayard , Stéphanie Bocs , Valentin Guignon , Delphine Larivière , Alexandra Louis
NAR Genomics and Bioinformatics, 2021, 3 (3), 6 p. ⟨10.1093/nargab/lqab088⟩
Article dans une revue hal-03541670v1
Image document

Comprehensive classification of the plant non-specific lipid transfer protein superfamily towards its sequence–structure–function analysis

Cécile Fleury , Jérôme Gracy , Marie-Françoise Gautier , Jean-Luc Pons , Jean-François Dufayard
PeerJ, 2019, 7, pp.e7504. ⟨10.7717/peerj.7504⟩
Article dans une revue hal-02266388v1
Image document

Comprehensive classification of the plant non-specific lipid transfer protein superfamily towards its Sequence -Structure -Function analysis

Cécile Fleury , Jérôme Gracy , Marie-Françoise Gautier , Jean-Luc Pons , Jean-François Dufayard
PeerJ, 2019, 7, pp.e7504. ⟨10.7287/peerj.preprints.27687v1⟩
Article dans une revue hal-02112505v1
Image document

The South Green portal: a comprehensive resource for tropical and Mediterranean crop genomics

Valentin Guignon , Yann Hueber , Mathieu Rouard , Stéphanie Bocs , David Couvin
Current Plant Biology, 2016, 7-8, pp.6-9. ⟨10.1016/j.cpb.2016.12.002⟩
Article dans une revue hal-02631148v1

Positional cloning of the rice male sterility gene ms-IR36, widely used in the inter-crossing phase of recurrent selection schemes

Julien Frouin , Denis Filloux , James Taillebois , Cecile Grenier , Fabienne Montes
Molecular Breeding, 2014, 33 (3), pp.555-567. ⟨10.1007/s11032-013-9972-3⟩
Article dans une revue hal-02635292v1

Lipid transfer proteins in coffee: isolation of Coffea orthologs, Coffea arabica homeologs, expression during coffee fruit development and promoter analysis in transgenic tobacco plants

Michelle G. Cotta , Leila M. G. Barros , Juliana D. de Almeida , Frédéric F. de Lamotte , Eder A. Barbosa
Plant Molecular Biology, 2014, 85 (1-2), pp.11 - 31. ⟨10.1007/s11103-013-0166-5⟩
Article dans une revue hal-01268596v1
Image document

Clever generation of rich SPARQL queries from annotated relational schema: application to Semantic Web Service creation for biological databases

Julien Wollbrett , Pierre Larmande , Frédéric F. de Lamotte , Manuel Ruiz
BMC Bioinformatics, 2013, 14, ⟨10.1186/1471-2105-14-126⟩
Article dans une revue hal-01268129v1

Insight into the biology, genetics and evolution of the Centella asiatica polyploid complex in Madagascar

Soaharin'Ny Ony Raoseta Rakotondralambo , Marguerite Rodier-Goud , Ronan Rivallan , Alexandra Lussert , Pascal Danthu
Industrial Crops and Products, 2013, 47, pp.118 - 125. ⟨10.1016/j.indcrop.2013.02.022⟩
Article dans une revue hal-01268112v1

Characterization of a cassiicolin-encoding gene from Corynespora cassiicola, pathogen of rubber tree (Hevea brasiliensis)

Marine M. Deon , Yanice Y. Bourré , Stéphanie S. Gimenez , Angélique A. Berger , Daniel D. Bieysse
Plant Science, 2012, 185, pp.227-237. ⟨10.1016/j.plantsci.2011.10.017⟩
Article dans une revue hal-00964742v1

11. International Symposium on BioChromatography and Nanoseparation preface

Frédéric F. de Lamotte
Journal of Chromatography B - Analytical Technologies in the Biomedical and Life Sciences, 2009, 877 (24), pp.2419-2419. ⟨10.1016/j.jchromb.2009.01.029⟩
Article dans une revue hal-02657183v1

Single-chain variable fragments antibody specific to Corynespora cassiicola toxin, cassiicolin, reduces necrotic lesion formation in Hevea brasiliensis

Elumalai Sunderasan , Rusni A. Kadir , Valérie V. Pujade-Renaud , Frédéric de Lamotte , Hoong Yeet Yeang
Journal of General Plant Pathology, 2009, 15 (1), pp.19-26. ⟨10.1007/s10327-008-0137-x⟩
Article dans une revue hal-02668957v1

Structural analysis of cassiicolin, a host-selective protein toxin from Corynespora cassiicola

Philippe Barthe , Valérie Pujade-Renaud , Frédéric Breton , Daniel Gargani , Robert Thai
Journal of Molecular Biology, 2007, 367 (1), pp.89-101. ⟨10.1016/j.jmb.2006.11.086⟩
Article dans une revue hal-02665937v1

Purification and characterization of cassiicolin, the toxin produced by Corynespora cassiicola, causal agent of the leaf fall disease of rubber tree

Frédéric de Lamotte , Marie-Pierre Duviau , Christine Sanier , Robert Thai , Joël Poncet
Journal of Chromatography B - Analytical Technologies in the Biomedical and Life Sciences, 2007, 849 (1-2), pp.357-362. ⟨10.1016/j.jchromb.2006.10.051⟩
Article dans une revue hal-02668494v1

Structural Analysis of Cassiicolin, a Host-selective Protein Toxin from Corynespora cassiicola

Philippe Barthe , Valérie Pujade-Renaud , Frédéric Breton , Daniel Gargani , Robert Thai
Journal of Molecular Biology, 2007, 367 (1), pp.89-101. ⟨10.1016/j.jmb.2006.11.086⟩
Article dans une revue hal-03472322v1

Biotinylation of glycan chains in beta2 glycoprotein I induces dimerization of the molecule and its detection by the human autoimmune anti-cardiolipin antibody EY2C9

Arnaud Dupuy d'Angeac , Ilias Stefas , Hubert Graafland , Frédéric de Lamotte , Marcel Rucheton
Biochemical Journal, 2006, 393 (1), pp.117-127. ⟨10.1042/BJ20050932⟩
Article dans une revue hal-02659024v1

Structure of a liganded type 2 non-specific lipid-transfer protein from wheat and the molecular basis of lipid binding

F. Hoh , J.L. Pons , M.F. Gautier , Frédéric de Lamotte , C. Dumas
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2005, 61, pp.397-406
Article dans une revue hal-02674377v1

The thioredoxin h system: potential applications

Philippe Joudrier , Marie Francoise M. F. Gautier , Frédéric de Lamotte , Karoly Kobrehel
Biotechnology Advances, 2005, 23 (1), pp.81-85. ⟨10.1016/j.biotechadv.2004.09.003⟩
Article dans une revue hal-02683364v1

Single step purification of a series of wheat recombinant proteins with expanded bed absorption chromatography

Frédéric de Lamotte
Journal of Chromatography B - Analytical Technologies in the Biomedical and Life Sciences, 2005, 818, pp.29-33
Article dans une revue hal-02676488v1

Structure of a liganded type 2 non-specific lipid-transfer protein from wheat and the molecular basis of lipid binding

François Hoh , Jean-Luc Pons , Marie-Françoise Gautier , Frédéric de Lamotte , Christian Dumas
Acta crystallographica Section D : Structural biology [1993-..], 2005, 61 (4), pp.397-406. ⟨10.1107/S0907444905000417⟩
Article dans une revue hal-02359483v1
Image document

The thioredoxin h system: potential applications

P. Joudrier , M.F. Gautier , F. de Lamotte , K. Kobrehel
Biotechnology Advances, 2004, 23 (1), pp.81-85. ⟨10.1016/j.biotechadv.2004.09.003⟩
Article dans une revue hal-03321200v1

Effect of pH on the oxidation-reduction properties of thioredoxins

A.T. Setterdahl , P.T. Chivers , M. Hirasawa , S.D. Lemaire , E. Keryer
Biochemistry, 2003, 42, pp.14877-14884. ⟨10.1021/bi0302088⟩
Article dans une revue hal-02676480v1
Image document

Refined solution structure of a liganded type 2 wheat nonspecific lipid transfer protein

Jean-Luc Pons , Frédéric de Lamotte , Marie Francoise M. F. Gautier , Marc-André Delsuc
Journal of Biological Chemistry, 2003, 278 (16), pp.14249-14256. ⟨10.1074/jbc.M211683200⟩
Article dans une revue hal-02675602v1

NMR monitoring of accumulation and folding of 15N-labeled protein overexpressed in Pichia pastoris

Frédéric de Lamotte , Hélène Boze , C. Blanchard , C. Klein , Gabrielle Moulin
Protein Expression and Purification, 2001, 22, pp.318-324
Article dans une revue hal-02681588v1

Protein dynamics studies on wheat type 2 lipid transfer protein

Frédéric de Lamotte , F. Vagner , J.L. Pons , M.F. Gautier , C. Roumestand
Comptes rendus de l’Académie des sciences. Série IIc, Chimie, 2001, 4, pp.839-843
Article dans une revue hal-02674275v1

Glutathione Reductase in Wheat Grain. 1. Isolation and Characterization

Frédéric de Lamotte , Nicolas Vianey-Liaud , Marie-Pierre Duviau , Károly Kobrehel
Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2000, 48 (10), pp.4978-4983. ⟨10.1021/jf0003808⟩
Article dans une revue hal-03321203v1

Glutathione reductase in wheat grain. 1. Isolation and characterization

Frédéric de Lamotte , N. Vianey-Liaud , M.P. Duviau , Karoly Kobrehel
Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2000, 48, pp.4978-4983
Article dans une revue hal-02698329v1

Single step purification of a wheat 9kDa lipid transfer protein secreted by Pichia pastoris

Frédéric de Lamotte , C. Klein , N. Issaly , M.F. Gautier , Hélène Boze
Biotechnology Techniques, 1999, 13, pp.351-354
Article dans une revue hal-02694660v1

Characterization of wheat thioredoxin h cDNA and production of an active Triticum aestivum protein in Escherichia coli

Marie-Françoise Gautier , Valerie Lullien Pellerin , Frédéric F. de Lamotte , Anne-Laure Guirao , Philippe Joudrier
European Journal of Biochemistry, 1998, 252 (2), pp.314-324. ⟨10.1046/j.1432-1327.1998.2520314.x⟩
Article dans une revue hal-02692932v1

High-level secretion of a wheat lipid transfer protein in Pichia pastoris

C. Klein , Frédéric F. de Lamotte , F. Gautier , Gabrielle Moulin , Hélène Boze
Protein Expression and Purification, 1998, 13, pp.73-82
Article dans une revue hal-02692748v1

Apports potentiels de la transgénèse pour l'amélioration de la qualité des blés

Philippe Joudrier , Remi Alary , Valerie Lullien Pellerin , Frédéric de Lamotte , Karoly Kobrehel
Industries des Céréales, 1998, 106, pp.10-14
Article dans une revue hal-02695368v1

Structural anf functional roles of a conserved proline residue in the alpha2 helix of Escherichia coli thioredoxin

Frédéric F. de Lamotte , Clotilde Pruvost , P. Minard , M.A. Delsuc , M. Miginiac-Maslow
Protein Engineering, 1997, 10 (12), pp.1425-1432
Article dans une revue hal-02689362v1

Structural and functional roles of a conserved proline residue in the alpha2 helix of Escherichia coli thioredoxin.

Frédéric F. de Lamotte , Christian Pruvost , Philippe Minard , Marc-André Delsuc , Myroslawa Miginiac-Maslow
Protein Engineering, 1997, 10 (12), pp.1425-32. ⟨10.1093/protein/10.12.1425⟩
Article dans une revue hal-00788517v1

Structural and functional roles of a conserved proline residue in the alpha2 helix of Escherichia coli thioredoxin

Frédéric F. de Lamotte , Clotilde Pruvost , P. Minard , M.A. Delsuc , M. Miginiac-Maslow
Protein Engineering, 1997, 10 (12), pp.1425-1432
Article dans une revue hal-02692166v1

Diversité du gène de cassiicoline en lien avec le pouvoir pathogène de C. cassiicola et mise en oeuvre d'un test toxinique pour la sélection d'individus tolérants chez Hevea brasiliensis.

Marine Deon , Dinh Minh Tran , Boris B. Fumanal , Stéphanie Gimenez , Daniel D. Bieysse
10. Rencontres de Phytopathologie - Journées Jean Chevaugeon, Societe Francaise de Phytopathologie (SFP). FRA., 2014
Communication dans un congrès hal-02793856v1

MS-DMind: Multi scale data “minding” for molecular process related to biotic and abiotic stresses: pilot study with the nsLTP superfamily of proteins

Manuel Ruiz , Cécile Fleury , Frédéric F. de Lamotte , Marie Francoise Gautier , François Dufayard
Colloque Plant Genomics 2012, Apr 2012, Pont-Royal en Provence, France
Communication dans un congrès hal-01267785v1

Structure-based classification of the plant non-specific lipid transfer protein superfamily towards its functional characterization

Cécile Fleury , Marie Francoise M. F. Gautier , Franck Molina , Manuel Ruiz , Frédéric F. de Lamotte
JOBIM 2011, Jun 2011, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02748623v1

Rôle de l’amidon synthase IV chez le riz

Sophie Charton , Julien Serret , Nathalie N. Geneix , Brigitte B. Bouchet , Marie Francoise M. F. Gautier
Colloque Graines 2011, Oct 2011, Nantes, France
Communication dans un congrès hal-02747010v1

Structure-based classification of the plant non-specific lipid transfer protein superfamily towards its functional characterization

Cécile Fleury , Marie Francoise M. F. Gautier , Jean-François Dufayard , Franck Molina , Manuel Ruiz
ISMB 2011, Jul 2011, Vienna, Austria
Communication dans un congrès hal-02746029v1

Structure-based classification of the plant non-specific lipid transfer protein superfamily towards its functional characterization

Cécile Fleury , Marie Francoise M. F. Gautier , Jean-François Dufayard , Franck Molina , Manuel Ruiz
ECCB 2011, Jul 2011, Vienna, Austria
Communication dans un congrès hal-02745958v1

Towards a multi-scale and formalized representation of protein sequence-structure-function relationships : the nsLTP family as a case of study

Cécile Fleury , Marie Francoise M. F. Gautier , Pierre Larmande , Sabine Pérès , Frédéric F. de Lamotte
JOBIM2010, Sep 2010, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02753839v1

Towards a multi-scale and formalized representation of protein sequence-structure-function relationships : the nsLTP family as a case of study

Cécile Fleury , Marie Francoise M. F. Gautier , Pierre Larmande , Sabine Pérès , Frédéric F. de Lamotte
Séminaire Génomique Végétale, Mar 2010, Pont-Royal en Provence, France
Communication dans un congrès hal-02752562v1

Towards a multi-scale and formalized representation of protein sequence-structure-function relationships : the nsLTP family as a case of study

Cécile Fleury , Marie Francoise M. F. Gautier , Pierre Larmande , Sabine Pérès , Frédéric F. de Lamotte
18. Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), Jul 2010, Boston, United States
Communication dans un congrès hal-02753301v1

11. International Symposium on BioChromatography and Nanoseparation preface

Frédéric F. de Lamotte
11. International Symposium on BioChromatography and Nanoseparation preface, Oct 2008, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02820189v1

Comparative analysis of cassiicolin structure and production in four strains of Corynespora cassiicola

Valérie Pujade-Renaud , Y. Bourre , Frédéric F. de Lamotte , Joël Poncet , Daniel Bieysse
International Natural Rubber Conference and Annual Meetings IRRDB, Oct 2008, Kuala Lumpur, Malaysia. n.p
Communication dans un congrès hal-01189588v1

Détermination structurale de la cassiicoline, la toxine glycosylée de Corynespora cassiicola

Philippe Barthe , Valérie Pujade-Renaud , Marie-Pierre Duviau , Frédéric F. de Lamotte , Christian Roumestand
Congrès du GERM (Groupe d’Étude de Résonance Magnétique), Mar 2007, Alénya, France. n.p
Communication dans un congrès hal-01189598v1

Fungal phytotoxins; story-case of cassiicolin, a new proteinaceous host-selective toxin from Corynespora cassiicola

Valérie Pujade-Renaud , Frédéric F. de Lamotte , Philippe Barthe , Christian Roumestand
Brazilian Phytopathological Society Meeting, Aug 2007, Paranà, Brazil. n.p
Communication dans un congrès hal-01189575v1

Structural Studies on Wheat Thioredoxin h

Frédéric F. de Lamotte , C Pruvost , Valerie Lullien Pellerin , Marie-Françoise Gautier , Philippe Joudrier
Conference on plant proteins from European crops. Food and non-food application, Nov 1996, Nantes, France. pp.5257, ⟨10.1007/978-3-662-03720-1_9⟩
Communication dans un congrès hal-03745394v1

Etude des gènes impliqués dans la qualité technologique des blés

Philippe Joudrier , Valerie Lullien Pellerin , F. de La Motte , Karoly Kobrehel , Remi Alary
Séminaire Agrogène, Feb 1995, Melun, France
Communication dans un congrès hal-02775426v1

Molecular studies of genes involved in quality and drought tolerance: development of probes

Philippe Joudrier , Valerie Lullien Pellerin , Frédéric de Lamotte , Remi Alary , M. Labhilili
SEWANA (South Europe, West Asia and North Africa) Durum Research Network, Mar 1995, Aleppo, Syria. pp.287-295
Communication dans un congrès hal-02842467v1

Molecular studies of cysteine-rich proteins from wheat

M.F. Gautier , Valerie Lullien Pellerin , W. Dieryck , Frédéric de Lamotte , T. Ihorai
International Meeting, Sep 1994, Viterbo, Italy
Communication dans un congrès hal-02773738v1
Image document

PCSC - Portail Calcul Stockage Cloud

Pierre Adenot , Estelle Ancelet , Sophie Aubin , David Benaben , Damien Berry
JCAD 2021 - Journées Calcul Données, Dec 2021, Dijon, France.
Poster de conférence hal-03507793v1

CompPhy v2 : une plate-forme collaborative pour visualiser et comparer des phylogénies

Floréal Cabanettes , Marc Chakiachvili , Vincent Lefort , Jean-François Dufayard , Frédéric F. de Lamotte
JOBIM: Journées ouvertes de biologie informatique et mathématiques, Jun 2016, Lyon, France. , 437 p., 2016, JOBIM 2016
Poster de conférence hal-01594479v1

South Green bioinformatics platform: Update 2015

A. Armero , Franc-Christophe Baurens , Stephanie Bocs , A. Breil , Frédéric F. de Lamotte
3. Plant Genomics Congress, May 2015, Londres, United Kingdom. Global Engage, 2015, Plant Genomics Congress
Poster de conférence hal-02739966v1
Image document

Étude des relations structure - fonction des protéines végétales

Frédéric de Lamotte
Biochimie [q-bio.BM]. Université Montpellier II - Sciences et Techniques du Languedoc, 2006
HDR tel-00375496v1