Fabrice Touzain
- Laboratoire de Ploufragan-Plouzané-Niort [ANSES]
- Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)
- Virologie Porcine, Innovation et Génomique (VIRPIG)
Présentation
Chercheur à l'ANSES, ma théamtique d'intérêt initiale était la prédiction des motifs ADN d'intérêt biologique (sites de fixation de facteurs de transcription ou motifs KOPS chez les bactéries, origines de réplications de la levure, etc...). Je travaille actuellement à l'analyse de données de séquençage haut débit, principalement en lien avec les bactéries et virus, et récemment sur la thématique de détection des OGM, les pangénomes et la définition d'espèce.
Compétences
Publications
Publications
WGS in microbiology: how far can interpretation go regarding data quality issues?Microbes 2025, Sep 2025, Bordeaux, France |
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Orbivirus : situation épidémiologique exceptionnelle en France en 2023, intérêt du séquençage de génomes viraux dans un contexte épizootiqueXXVIes Journées francophones de virologie, Société Française de Virologie, Apr 2024, Bruxelles, Belgique |
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Amélioration des capacités de surveillance en virologie : Séquençage de génomes viraux d’intérêt vétérinaireJournées scientifiques et doctorales de l'Anses (JSDA), Anses, Oct 2022, Maisons-Alfort, France |
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Evolution of 14 Bluetongue and 3 epizootic hemorrhagic disease virus serotypes in French Guiana from 2011 to 202014th Annual Meeting EPIZONE, May 2022, Barcelone (ES), Spain |
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Development of a multi-locus sequence typing scheme for Cryptosporidium parvum15th International Congress of Parasitology (ICOPA), Oct 2022, Copenhagen, Denmark |
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A large-scale comparative genomics study of human and ruminant strains of Cryptosporidium parvum from Europe15th International Congress of Parasitology (ICOPA), Oct 2022, Copenhagen, Denmark |
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Interactomic high-throughput mapping for bluetongue virus in its natural hosts to identify new factors of pathogenicity and interspecies transmission11th Annual Meeting EPIZONE, Sep 2017, Paris ( France), France |
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Fine-tuning motif detection among ChIP on Chip DNA fragmentsJournées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM)", Jun 2011, Paris, France. pp.1 |
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Prediction of KOPS motifs involved in segregating of bacterial chromosomes in Lactocoques / Streptocoques18th annual international conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), Jul 2010, Boston, United States. pp.1 |
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SIGffRid : Programme de recherche des sites de fixation des facteurs de transcription par approche comparativeJournées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques - JOBIM'05, Guy Perrière, Alain Guénoche et Christophe Geourjon, Jul 2005, Lyon, France. pp.417-425 |
Identification of Transcription Factor Binding Sites in Streptomyces coelicolor A3(2) by Phylogenetic ComparisonEuropean Conference for Computer Biology - ECCB'2003, 2003, Paris, France |
Augmentation de la prévalence de Staphylococcus aureus résistant à la méticilline dans les élevages de porcs en France55èmes Journées de la Recherche Porcine, Jan 2023, Paris, France. , 55, pp.421-422, 2023 |
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Projet QUANTALL : QUANTification haut débit d’ALLèles liés à la résistance des bioagresseurs aux produits de protection des plantesJournées Scientifiques et Doctorales de l'ANSES (JSDA) 2022, Oct 2022, Maisons-Alfort, France |
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Detection of unknown genetically modified organisms (GMO) by statistical analysis of high throughput sequencing dataJOBIM 2019, Jul 2019, Nantes, France. , 2019 |
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Easy and rapid in silico serotyping of Salmonella using WGS data : development of a workflowSociété Française de Microbiologie (SFM), Mar 2015, Paris, France |
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FouDanGA : Fouille de données pour l'annotation de génomes d'actinomycètes[Rapport de recherche] 2005 |
Recherche des sites de régulation de la transcription chez Streptomyces Coelicolor A3(2)[Stage] A03-R-319 || touzain03b, 2003, 42 p |
Recherche des sites de régulation de la transcription dans des génomes bactériensInformatique [cs]. Université Henri Poincaré - Nancy 1, 2007. Français. ⟨NNT : 2007NAN10097⟩ |