Jerome Bugeon

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Publications

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Gut physiology of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) is influenced more by short-term fasting followed by refeeding than by feeding fishmeal-free diets

Laura Frohn , Diogo Peixoto , Frédéric Terrier , Benjamin Costas , Jérôme Bugeon et al.
Fish Physiology and Biochemistry, 2024, 50 (3), pp.1281-1303. ⟨10.1007/s10695-024-01339-0⟩
Article dans une revue hal-04643254 v1
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Seven generations of selection for muscle fat content greatly affect rainbow trout flesh quality and muscle fiber size

Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon , Lionel Goardon , Thierry Kerneis , Laurent Labbé et al.
Aquaculture Reports, 2024, 38, pp.102343. ⟨10.1016/j.aqrep.2024.102343⟩
Article dans une revue hal-04721970 v1
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Mature adipocytes inhibit differentiation of myogenic cells but stimulate proliferation of fibro-adipogenic precursors derived from trout muscle in vitro

Valentine Goffette , Nathalie Sabin , Jérôme Bugeon , Sabrina Jagot , Isabelle Hue et al.
Scientific Reports, 2024, 14, pp.16422. ⟨10.1038/s41598-024-67152-0⟩
Article dans une revue hal-04716827 v1
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Looking for a needle in a haystack: de novo phenotypic target identification reveals Hippo pathway-mediated miR-202 regulation of egg production

Sarah JANATI IDRISSI , Mariana Roza de Abreu , Cervin Guyomar , Fernanda de Mello , Thuy Thao Vi Nguyen et al.
Nucleic Acids Research, 2024, 52 (2), pp.738-754. ⟨10.1093/nar/gkad1154⟩
Article dans une revue hal-04501492 v1
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New alternative ingredients and genetic selection are the next game changers in rainbow trout nutrition: a metabolomics appraisal

Simon Roques , Catherine Deborde , Sandrine Skiba-Cassy , Françoise Médale , Mathilde Dupont-Nivet et al.
Scientific Reports, 2023, 13, pp.19634. ⟨10.1038/s41598-023-46809-2⟩
Article dans une revue hal-04305424 v1

Potential of genomic selection for growth, meat content and colour traits in mixed-family breeding designs for the Pacific oyster <em>Crassostrea gigas</em>

Antoine Jourdan , Romain Morvezen , Florian Enez , Pierrick Haffray , Adeline Lange et al.
Aquaculture, 2023, 576, pp.739878. ⟨10.1016/j.aquaculture.2023.739878⟩
Article dans une revue hal-04158060 v1

An end-to-end pipeline based on open source deep learning tools for reliable analysis of complex 3D images of ovaries

Manon Lesage , Manon Thomas , Thierry Pécot , Tu-Ky Ly , Nathalie Hinfray et al.
Development (Cambridge, England), 2023, 150 (7), pp.dev201185. ⟨10.1242/dev.201185⟩
Article dans une revue hal-04062159 v1
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Prediction of fatty acids composition in the rainbow trout Oncorhynchus mykiss by using Raman micro-spectroscopy

E. Prado , Christophe Eklouh-Molinier , Florian Enez , David Causeur , C. Blay et al.
Analytica Chimica Acta, 2022, 1191, ⟨10.1016/j.aca.2021.339212⟩
Article dans une revue hal-03445774 v1
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Gene expression profiling of trout muscle during flesh quality recovery following spawning

Yéléhi Diane Ahongo , Aurélie Le Cam , Jérôme Montfort , Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre et al.
BMC Genomics, 2022, 23 (1), pp.9. ⟨10.1186/s12864-021-08228-3⟩
Article dans une revue hal-03519475 v1
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Genetic parameters and genome-wide association studies of quality traits characterised using imaging technologies in Rainbow trout, Oncorhynchus mykiss

Carole Blay , Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Jonathan D’ambrosio , Nicolas Dechamp et al.
Frontiers in Genetics, 2021, 12, pp.1-17. ⟨10.3389/fgene.2021.639223⟩
Article dans une revue hal-03154333 v1

Loss of light colour preference after chronic embryonic stress in rainbow trout fry: a novel and potential indicator of fish welfare?

Violaine Colson , Vitor Hugo Bessa Ferreira , Ana Carolina Luchiari , Claudiane Valotaire , Frédéric Borel et al.
Applied Animal Behaviour Science, 2021, 239, pp.105335. ⟨10.1016/j.applanim.2021.105335⟩
Article dans une revue hal-03207748 v1
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Genetic architecture and genomic selection of fatty acid composition predicted by Raman spectroscopy in rainbow trout

Carole Blay , Pierrick Haffray , Jonathan D’ambrosio , Enora Prado , Nicolas Dechamp et al.
BMC Genomics, 2021, 22 (1), pp.788. ⟨10.1186/s12864-021-08062-7⟩
Article dans une revue hal-03432316 v1
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Flesh quality recovery in female rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) after spawning

Yéléhi Diane Ahongo , Thierry Kerneis , Lionel Goardon , Laurent Labbé , Jérôme Bugeon et al.
Aquaculture, 2021, 536, pp.1-12. ⟨10.1016/j.aquaculture.2020.736290⟩
Article dans une revue hal-03199614 v1

VisEgg: a robust phenotyping tool to assess rainbow trout egg features and viability

Emilie Cardona , Jérôme Bugeon , Emilien Segret , Julien Bobe
Fish Physiology and Biochemistry, 2021, 47 (3), pp.671-679. ⟨10.1007/s10695-020-00844-2⟩
Article dans une revue hal-03020814 v1
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Morphological predictors of slaughter yields using 3D digitizer and their use in a common carp breeding program

Martin Prchal , Martin Kocour , Marc Vandeputte , Antti Kause , Alain Vergnet et al.
Aquaculture, 2020, 520, pp.1-9. ⟨10.1016/j.aquaculture.2020.734993⟩
Article dans une revue hal-02627292 v1
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Genetic relationship between koi herpesvirus disease resistance and production traits inferred from sibling performance in Amur mirror carp

Jinfeng Zhao , Martin Prchal , Christos Palaiokostas , Ross D. Houston , Antti Kause et al.
Aquaculture, 2020, 520, pp.1-6. ⟨10.1016/j.aquaculture.2020.734986⟩
Article dans une revue hal-02627286 v1

C-ECi: a CUBIC-ECi combined clearing method for three-dimensional follicular content analysis in the fish ovary

Manon Lesage , Manon Thomas , Jérôme Bugeon , Adèle Branthonne , Stéphanie Gay et al.
Biology of Reproduction, 2020, 103 (5), pp.1099-1109. ⟨10.1093/biolre/ioaa142⟩
Article dans une revue hal-02935099 v1
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First evidence of realized selection response on fillet yield in Rainbow trout Oncorhynchus mykiss, Using Sib selection or based on correlated ultrasound measurements

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Anastasia Bestin , Alexandre Desgranges , Jean-Michel Allamellou et al.
Frontiers in Genetics, 2019, 10, pp.1-13. ⟨10.3389/fgene.2019.01225⟩
Article dans une revue hal-02627462 v1

Positive impact of moderate food restriction on reproductive success of the rainbow trout Oncorhynchus mykiss

Emilie Cardona , Jérôme Bugeon , François Guivarc'H , Lionel Goardon , Stéphane Panserat et al.
Aquaculture, 2019, 502, pp.280-288. ⟨10.1016/j.aquaculture.2018.12.057⟩
Article dans une revue hal-01974617 v1

Naa15 knockdown enhances c2c12 myoblast fusion and induces defects in zebrafish myotome morphogenesis

Olivier Monestier , Aurélie Landemaine , Jérôme Bugeon , Pierre-Yves Rescan , Jean-Charles Gabillard
Comparative Biochemistry and Physiology - Part B: Biochemistry and Molecular Biology, 2019, 228, pp.61-67. ⟨10.1016/j.cbpb.2018.11.005⟩
Article dans une revue hal-01961391 v1
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MiR-202 controls female fecundity by regulating medaka oogenesis

Stéphanie Gay , Jérôme Bugeon , Amine Bouchareb , Laure Henry , Clara Delahaye et al.
PLoS Genetics, 2018, 14 (9), pp.1-26. ⟨10.1371/journal.pgen.1007593⟩
Article dans une revue hal-01871468 v1
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Un outil au service de la standardisation des bases de données: les ontologies ATOL/EOL

Marie-Christine Meunier-Salaün , Jérôme Bugeon , Alice Fatet , Isabelle Hue , Catherine Hurtaud et al.
Cahier des Techniques de l'INRA, 2018, 93, 7 p
Article dans une revue hal-02626650 v1
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Histological, transcriptomic and in vitro analysis reveal an intrinsic activated state of myogenic precursors in hyperplasic muscle of trout

Sabrina Jagot , Nathalie Sabin , Aurélie Le Cam , Jérôme Bugeon , Pierre-Yves Rescan et al.
BMC Genomics, 2018, 19 (1), pp.1-11. ⟨10.1186/s12864-018-5248-y⟩
Article dans une revue hal-01958288 v1
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The genetics of overwintering performance in two-year old common carp and its relation to performance until market size

Martin Prchal , Antti Kause , Marc Vandeputte , David Gela , Jean-Michel Allamellou et al.
PLoS ONE, 2018, 13 (5), pp.1-1. ⟨10.1371/journal.pone.0191624⟩
Article dans une revue hal-01810425 v1
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Potential for genetic improvement of the main slaughter yields in Common Carp with in vivo morphological predictors

Martin Prchal , Jérôme Bugeon , Marc Vandeputte , Antti Kause , Alain Vergnet et al.
Frontiers in Genetics, 2018, 9, pp.1-13. ⟨10.3389/fgene.2018.00283⟩
Article dans une revue hal-02625209 v1

Accuracy of BLUP breeding values in a factorial mating design with mixed families and marker-based parentage assignment in rainbow trout Oncorhynchus mykiss

Pierrick Haffray , Florian Enez , Jérôme Bugeon , Hervé Chapuis , Mathilde Dupont-Nivet et al.
Aquaculture, 2018, 490, pp.350-354. ⟨10.1016/j.aquaculture.2018.03.003⟩
Article dans une revue hal-01764389 v1

Investigation of morphological predictors of fillet and carcass yield in European sea bass (Dicentrarchus labrax) for application in selective breeding

Marc Vandeputte , Antonio Puledda , Anne Sophie Tyran , Anastasia Bestin , Céline Coulombet et al.
Aquaculture, 2017, 470, pp.40-49. ⟨10.1016/j.aquaculture.2016.12.014⟩
Article dans une revue hal-01595276 v1
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How muscle structure and composition influence meat and flesh quality

Anne Listrat , Bénédicte Lebret , Isabelle Louveau , Thierry Astruc , Muriel Bonnet et al.
The Scientific World Journal, 2016, 2016 (3182746), pp.1-14. ⟨10.1155/2016/3182746⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01285897 v1

Selection for stress responsiveness and slaughter stress affect flesh quality in pan-size rainbow trout, Oncorhynchus mykiss

Florence Lefèvre , Isabelle Cos , Tom G. Pottinger , Jérôme Bugeon
Aquaculture, 2016, 464, pp.654-664. ⟨10.1016/j.aquaculture.2016.07.039⟩
Article dans une revue hal-01351897 v1
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Comment la structure et la composition du muscle déterminent la qualité des viandes ou chairs ?

Anne Listrat , Bénédicte Lebret , Isabelle Louveau , Thierry Astruc , Muriel Bonnet et al.
INRA Productions Animales, 2015, 28 (2), pp.125-136. ⟨10.20870/productions-animales.2015.28.2.3020⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01211001 v2

Selection for muscle fat content and triploidy affect flesh quality in pan-size rainbow trout, [i]Oncorhynchus mykiss[/i]

Florence Lefèvre , Mireille Cardinal , Jérôme Bugeon , Laurent Labbé , Françoise Médale et al.
Aquaculture, 2015, 448, pp.569-577. ⟨10.1016/j.aquaculture.2015.06.029⟩
Article dans une revue hal-01194133 v1
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Quelles exigences de qualités pour les poissons d'élevage et issus de la pêche ?

Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon
INRA Productions Animales, 2015, 28 (2), pp.119-124. ⟨10.20870/productions-animales.2015.28.2.3019⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01225260 v2

Melanin-based coloration of sneaker male Atlantic salmon is linked to viability and emergence timing of their offspring

Lucas Marie-Orleach , Jean-Marc Roussel , Jérôme Bugeon , Julien Tremblay , Dominique D. Ombredane et al.
Biological Journal of the Linnean Society, 2014, 111 (1), pp.126-135. ⟨10.1111/bij.12187⟩
Article dans une revue hal-02364738 v1
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Conception d'un système innovant de production de truites en eau recirculée

Laurent Labbé , Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon , Alexis Fostier , M. Jamin et al.
INRA Productions Animales, 2014, 27 (2), pp.135-146. ⟨10.20870/productions-animales.2014.27.2.3061⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01205090 v1
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Un langage de référence pour le phénotypage des animaux d’élevage : l’ontologie ATOL

Pierre-Yves Le Bail , Jérôme Bugeon , Olivier Dameron , Alice Fatet , Wiktoria Golik et al.
INRA Productions Animales, 2014, 27 (3), pp.195-208. ⟨10.20870/productions-animales.2014.27.3.3067⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-01129862 v1

Myostatin induces atrophy of trout myotubes through inhibiting the TORC1 signaling and promoting ubiquitin-proteasome and autophagy-lysosome degradative pathways

Iban Seiliez , Gemael Cedrick Taty Taty , Jérôme Bugeon , Karine Dias , Nathalie Sabin et al.
General and Comparative Endocrinology, 2013, 186, pp.9-15. ⟨10.1016/j.ygcen.2013.02.008⟩
Article dans une revue istex hal-01205067 v1
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Le TMA comme outil de mise au point des conditions de marquages immunohistologiques. Application à l’étude de la croissance musculaire de la truite arc-en-ciel

Jérôme Bugeon , Parfait Evouna Mengue , Claude Sevellec , Chantal Cauty
Revue Française d'Histotechnologie, 2013, 26 (1), pp.49-53
Article dans une revue hal-02643896 v1

Rapid quantification of muscle fat content and subcutaneous adipose tissue in fish using MRI

Guylaine Collewet , Jérôme Bugeon , Jérôme Idier , Stéphane Quellec , Benjamin Quittet et al.
Food Chemistry, 2013, 138 (2-3), pp.2008-2015. ⟨10.1016/j.foodchem.2012.09.131⟩
Article dans une revue istex hal-00945541 v1

Genetic parameters of in-vivo prediction of carcass, head and fillet yields by internal ultrasound and 2D external imagery in large rainbow trout

Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Quentin Rivard , Benjamin Quittet , Sophie Puyo et al.
Aquaculture, 2013, 410-411, pp.236-244. ⟨10.1016/j.aquaculture.2013.06.016⟩
Article dans une revue hal-00877146 v1
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Characteristics and metabolism of different adipose tissues in fish

Claudine Weil , Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon
Reviews in Fish Biology and Fisheries, 2013, 23, pp.157-173. ⟨10.1007/s11160-012-9288-0⟩
Article dans une revue istex hal-01205056 v1

Negative genetic correlations between production traits and head or bony tissues in large all-female rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Cédric Pincent , Hervé Chapuis , Emmanuel Mazeiraud et al.
Aquaculture, 2012, 368-369, pp.145-152. ⟨10.1016/j.aquaculture.2012.09.023⟩
Article dans une revue hal-01000352 v1

Qualité de la chair de truites arc-en-ciel à bas ou haut rendement en filet

Jérôme Bugeon
Aquafilia, 2011, 42, pp.20
Article dans une revue hal-02642853 v1

Flesh quality in large rainbow trout with high or low fillet yield

Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre , Mireille Cardinal , Ayhan Uyanik , Armel Davenel et al.
Journal of Muscle Foods, 2010, 21 (4), pp.702-721. ⟨10.1111/j.1745-4573.2010.00214.x⟩
Article dans une revue hal-01205020 v1

Differentially expressed proteins in rainbow trout adipocytes isolated from visceral and subcutaneous tissues

Claudine Weil , Nathalie Sabin , Jérôme Bugeon , Gilles Paboeuf , Florence Lefèvre
Comparative Biochemistry and Physiology - Part D: Genomics and Proteomics, 2009, 4 (3), pp.235-241. ⟨10.1016/j.cbd.2009.05.002⟩
Article dans une revue istex hal-02668616 v1

Rearing oxygen level and slaughter stress effects on rainbow trout flesh quality

Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon , Benoît Aupérin , Joël Aubin
Aquaculture, 2008, 284, pp.81-89. ⟨10.1016/j.aquaculture.2008.07.017⟩
Article dans une revue istex hal-02668597 v1

Biological basis of fish quality

Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon
Sciences des aliments = Food science : an international journal of food science and technology, 2008, 28 (4-5), pp.365-377. ⟨10.3166/sda.28.365-377⟩
Article dans une revue istex hal-02658473 v1

Effect of selection for muscle lipid content on body shape, fat deposition and dressing yields in rainbow trout

Edwige Quillet , Jérôme Bugeon , Sandrine Le Guillou , A. Davenel , G. Collewet et al.
Aquaculture, 2007, 272 (Suppl. 1), pp.S3003-. ⟨10.1016/j.aquaculture.2007.07.168⟩
Article dans une revue istex hal-02590378 v1

Moderate hypoxia or hyperoxia affect fillet yield and the proportion of red muscle in rainbow trout

Florence Lefèvre , Joël Aubin , Wilfried Louis , Laurent Labbé , Jérôme Bugeon
Cybium : Revue Internationale d’Ichtyologie, 2007, 31 (2), pp.237-243. ⟨10.26028/cybium/2007-312-018⟩
Article dans une revue hal-02661526 v1

Effet du jeûne et de la réalimentation sur la texture de la chair de truite fario élevée en mer

Jérôme Bugeon
Aquafilia, 2006, 13, pp.21
Article dans une revue hal-02654128 v1

Effet de l'exercice sur la texture des filets de truite Fario en croissance

Jérôme Bugeon
Aquafilia, 2004, 5, pp.14
Article dans une revue hal-02679745 v1

Correlated changes in skeletal muscle connective tissue and flesh texture during starvation and re-feeding in brown trout (Salmo trutta) reared in seawater

Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre , Benoit Fauconneau
Journal of the Science of Food and Agriculture, 2004, 84 (11), pp.1433-1441. ⟨10.1002/jsfa.1837⟩
Article dans une revue istex hal-02672247 v1

Fillet texture and muscle structure in brown trout (Salmo trutta) subjected to long-term exercise

Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre , Benoit Fauconneau
Aquaculture Research, 2003, 34 (14), pp.1287-1295. ⟨10.1046/j.1365-2109.2003.00938.x⟩
Article dans une revue istex hal-02672350 v1

Caractérisation histologique du tissu conjonctif intramusculaire de truite.

Jérôme Bugeon , E. Veiseth , Richard Taylor , Florence Lefèvre , Benoit Fauconneau
Revue Française d'Histotechnologie, 1999, 12 (1), pp.71-80
Article dans une revue hal-02697882 v1

Genetic parameter estimation of growth and quality traits in the Oso Farming population of Madagascar tiger shrimp Penaeus monodon

Romain Morvezen , Nolwenn Guillerm , Anastasia Bestin , Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon et al.
AQUA 2024, Aug 2024, Copenhagen, Denmark
Communication dans un congrès hal-04724394 v1

Genetic parameters for red muscle development measured using artificial intelligence and genetic correlations with growth and processing traits in rainbow trout (oncorhynchus mykiss)

Florian Enez , Audrey Dehaullon , Jérôme Doerflinger , Boudjema Imarazene , Guylaine Collewet et al.
AQUA2024, European Aquaculture Society (EAS) and the World Aquaculture Society, Aug 2024, Copenhagen, Denmark
Communication dans un congrès hal-04721326 v1

Do rainbow trout adipocytes influence muscle cell growth in vitro ?

Valentine Goffette , Nathalie Sabin , Jérôme Bugeon , Sabrina Jagot , Isabelle Hue et al.
31.  Conference of the European Society for Comparative Endocrinologists, Sep 2024, Ancona (IT), Italy
Communication dans un congrès hal-04721291 v1

Caractérisation histologique de la croissance musculaire des poissons

Jérôme Bugeon , Adèle Branthonne , Jean-Charles Gabillard , Florence Lefèvre
37. Congrès AFH, Association Française d'Histologie, Jun 2024, Saint Malo, France
Communication dans un congrès hal-04721324 v1

Investigating adipose-muscle tissue communication through a model of fat and lean rainbow trout lines

Valentine Goffette , Nathalie Sabin , Jérôme Bugeon , Sabrina Jagot , Isabelle Hue et al.
31.  Conference of the European Society for Comparative Endocrinologists, Sep 2024, Ancona, Italy
Communication dans un congrès hal-04721307 v1

Estimation des paramètres génétiques de la croissance et de la qualité dans la population d'Oso Farming de la crevette tigrée de Madagascar Penaeus monodon

Romain Morvezen , Nolwenn Guillerm , Anastasia Bestin , Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon et al.
8. Journées de la Recherche Piscicole, Jul 2024, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04724100 v1

Impact de la durée de mise au froid des œillés de truite arc-en-ciel

Delphine Lallias , E. Harté , Mickaël Marchand , Simon Pouil , Tina Terrenne et al.
8èmes Journées de la Recherche Piscicole, Jul 2024, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04722110 v1
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Quantitative analysis of asynchronous oogenesis dynamics in fish: Application of a modern 3D analysis approach to an old problem

Manon Lesage , Mak Sully , Jérôme Bugeon , Manon Thomas , Stéphanie Gay et al.
12. International Symposium on Reproductive Physiology of Fish (ISRPF), May 2023, Chersonissos, Greece
Communication dans un congrès hal-04187726 v1

Phenomic selection, an alternative to genomic selection in animal breeding?

Faten Jaouahdou , Florian Enez , Christophe Eklouh-Molinier , Jérôme Doerflinger , Guylaine Collewet et al.
Workshop spectroscopie et microscopie du milieu marin, Feb 2023, Brest, France
Communication dans un congrès hal-04185933 v1

Maîtrise du développement du muscle rouge chez la truite arc en ciel (Oncorhynchus mykiss)

Lucas Génevé , Aline Perquis , Jérôme Bugeon , Lionel Goardon , François Guyvarc'H et al.
6èmes Journées Techniques Interfilières SYSAAF, SYSAAF, Oct 2023, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04240183 v1

Impact de la durée de mise au froid des œillés de truite arc-en-ciel (Projet FEAMP EpiCOOL)

Jérôme Bugeon , Lucie Marandel , Simon Pouil , Elodie Harte , Michaël Marchand et al.
Journées techniques du SYSAAF, SYSAAF, Oct 2023, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04256478 v1

Dynamique des cellules satellites Pax7+ chez la truite arc en ciel

Cécile Ralliere , Sabrina Jagot , Nathalie Sabin , Jérôme Bugeon , Jean-Charles Gabillard
StemPHASE, Jun 2022, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-03776041 v1

FEAMP Qualipostov : Optimisation des qualités de grande truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) après ovulation

Florence Lefèvre , Thierry Kerneis , Lionel Goardon , Yéléhi Diane Ahongo , Guillaume Brit et al.
Journée PEIMA (Pisciculture Expérimentale INRA des Monts d'Arrée), INRAE-PEIMA, Nov 2022, Sizun, France
Communication dans un congrès hal-04726217 v1
Image document

Mise en application d'algorithmes open-source de Deep-Learning pour l'analyse d'images 3D d'ovaires de Médaka

Manon Lesage , Jérôme Bugeon , Manon Thomas , Thierry Pécot , Violette Thermes
11. Journées Scientifiques et Techniques du Réseau des Microscopistes INRAE, Nov 2022, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04046034 v1

A comprehensive 3D approach to unravel follicular growth dynamics that governs fecundity in medaka fish (Oryzias latipes)

Manon Lesage , Jérôme Bugeon , Manon Thomas , Stéphanie Gay , Thierry Pécot et al.
14. International Congress on the Biology of Fish, Jun 2022, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-03764407 v1

Restauration post-ponte des qualités chez la truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) : synthèse des résultats du projet Feamp QualiPostOv

Thierry Kerneis , Jérôme Bugeon , Lionel Goardon , Yéléhi Diane Ahongo , Guillaume Brit et al.
7. Journées de la Recherche Piscicole, Jul 2022, Paris, France
Communication dans un congrès hal-04296533 v1

Post larval red muscle growth in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

Lucas Génevé , Jérôme Bugeon , Jean-Charles Gabillard
14. International Congress on the Biology of Fish (ICBF), Jun 2022, Montepellier, France
Communication dans un congrès hal-03776022 v1

Effet d’un prébiotique en supplémentation d’un aliment végétal ou commercial sur les qualités des produits chez la truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss)

Doriane Combot , Jérôme Bugeon , Thierry Kerneis , Lionel Goardon , Laurent Labbé et al.
Journée PEIMA (Pisciculture Expérimentale INRAE des Monts d'Arrée), INRAE-PEIMA, Nov 2022, Sizun, France
Communication dans un congrès hal-04726176 v1
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Implementation of genomic selection on production and quality traits and linkage disequilibrium in Crassostrea gigas

Antoine Jourdan , Pierre Boudry , Florian Enez , Pierrick Haffray , F Chenier et al.
12. World congress on genetics applied to livestock production (WCGALP), Jul 2022, Rotterdam, Netherlands. ⟨10.3920/978-90-8686-940-4_567⟩
Communication dans un congrès hal-04013016 v1

Phenomic selection, an alternative to genomic selection in animal breeding?

Faten Jaouahdou , Florian Enez , Christophe Eklouh-Molinier , Jérôme Doerflinger , Guylaine Collewet et al.
International Symposium on Genetics in Aquaculture XIV, Nov 2022, Puerto Varas, Chile
Communication dans un congrès hal-04185835 v1

Croissance du muscle rouge et relation avec la capacité de nage chez la truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss)

Lucas Génevé , Jérôme Bugeon , François Guyvarc'H , Lionel Goardon , Laurent Labbé et al.
7. Journées de la Recherche Piscicole, ITAVI, Jul 2022, Paris, France
Communication dans un congrès hal-03776035 v1

FEAMP Qualipostov : Optimisation des qualités de grande truite arc en ciel (Oncorhynchus mykiss) après ovulation

Thierry Kerneis , Jérôme Bugeon , Lionel Goardon , Yéléhi Diane Ahongo , Guillaume Brit et al.
Journée PEIMA, Nov 2022, Sizun, France
Communication dans un congrès hal-04298568 v1
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Caractérisation des tissus adipeux chez la truite arc-en-ciel par imagerie 3D

Isabelle Hue , Adèle Branthonne , Manon Lesage , Morgane Chesnais , Violette Thermes et al.
11. Journées Scientifiques et Techniques du Réseau des Microscopistes de l'INRAE, Nov 2022, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04187040 v1

Using 3D imaging to study ovarian development in Medaka

Manon Lesage , Manon Thomas , Jérôme Bugeon , Adèle Branthonne , Violette Thermes
12. Journées Scientifiques et Techniques du Rµi, Nov 2022, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-03892521 v1
Image document

Utilisation d’outils d’intelligence artificielle pour la segmentation d’images 3D d’ovaire de poisson

Manon Lesage , Jérôme Bugeon , Manon Thomas , Violette Thermes
17. Colloque de la Société Française de Microscopies, Jul 2021, Reims, France
Communication dans un congrès hal-03299572 v1

Les ontologies et leurs applications

Jérôme Bugeon , Catherine Hurtaud , Pierre-Yves Le Bail , Linh-Chi Nguyen , Marie-Christine Meunier-Salaün et al.
Séminaire à l'UMR1348 PEGASE Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage, Sep 2020, Saint-Gilles, France
Communication dans un congrès hal-03198080 v1

Comment mesurer la composition corporelle des animaux avec des méthodes non invasives ?

Jérôme Bugeon , Guylaine Collewet , Philippe Faverdin , Pascal Froment , Yannick Le Cozler et al.
Séminaire Défis Scientifiques du Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage, Nov 2019, Rennes, France. pp.71
Communication dans un congrès hal-02737513 v1

Flesh quality recovery in female rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) after egg production

Yéléhi Diane Ahongo , Thierry Kerneis , Lionel Goardon , Laurent Labbé , Jérôme Bugeon et al.
Aquaculture Europe 2019, European Aquaculture Society (EAS). BEL., Oct 2019, Berlin, Germany
Communication dans un congrès hal-02284506 v1

The relationship between koi herpesvirus disease resistance and other production traits inferred from sibling performance in amur mirror carp

Jinfeng Zhao , Martin Prchal , Christos Palaiokostas , Ross D. Houston , Antti Kause et al.
Aquaculture Europe 2019, European Aquaculture Society (EAS). BEL., Oct 2019, Berlin, Germany
Communication dans un congrès hal-02317166 v1

Réponse à la sélection sur le rendement de filet chez la truite arc-en-ciel

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Anastasia Bestin , Alexandre Desgranges , Jean-Michel Allamelou et al.
6. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2019, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02734410 v1

Morphological predictors of slaughter yields using 3D digitizer and their utilization in common carp breeding program

Martin Prchal , Jérôme Bugeon , Marc Vandeputte , A. Kause , Alain Vergnet et al.
Aquaculture Europe 2019, European Aquaculture Society (EAS). BEL., Oct 2019, Berlin, Germany
Communication dans un congrès hal-02317178 v1

Impact positif d’une restriction alimentaire modérée sur les performances de reproduction de la truite arc en ciel Oncorhynchus mykiss

Emilie Cardona , Jérôme Bugeon , François Guivarc'H , Lionel Goardon , Stéphane Panserat et al.
6. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2019, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02182571 v1

Restauration de la qualité de la chair chez la truite arc-en-ciel femelle (Oncorhynchus mykiss) après la production d’œufs

Yéléhi Diane Ahongo , Thierry Kerneis , Lionel Goardon , Laurent Labbé , Jérôme Bugeon et al.
6. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2019, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02184246 v1
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Restauration de la qualité de la chair chez la truite arc-en-ciel femelle (Oncorhynchus mykiss) après la production d'oeufs

Yéléhi Diane Ahongo , Thierry Kerneis , Lionel Goardon , Laurent Labbé , Jérôme Bugeon et al.
Journées Scientifiques de Ecole Doctorale Ecologie Géosciences Agronomie Alimentation (ED EGAAL), Université Bretagne Loire (COMUE) (UBL). FRA., Jul 2019, Rennes, France. pp.91
Communication dans un congrès hal-02187455 v1

VisEgg: an automatic phenotyping tool to assess rainbow trout unfertilized egg viability

Emilie Cardona , Jérôme Bugeon , Emilien Segret , Julien Bobe
7. International Workshop on the Biology of Fish Gametes, Sep 2019, Rennes, France. pp.68-68
Communication dans un congrès hal-02282238 v1
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Histological, transcriptomic and in vitro analysis reveals an intrinsic activated state of myogenic precursors in hyperplastic muscle of trout

Sabrina Jagot , Nathalie Sabin , Aurélie Le Cam , Jérôme Bugeon , Pierre-Yves Rescan et al.
5. International Symposium on Genomics in Aquaculture, Mar 2018, Albufeira, Portugal. 62 p
Communication dans un congrès hal-02738246 v1

L'analyse histologique, transcriptomique et in vitro révèlent un état activé des précurseurs myogéniques du muscle hyperplasique de la truite

Sabrina Jagot , Nathalie Sabin , Aurélie Le Cam , Jérôme Bugeon , Pierre-Yves Rescan et al.
Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2018), Apr 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-01769295 v1

Successful realized selection response for fillet yield in rainbow trout Oncorhynchus mykiss

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Anastasia Bestin , Alexandre Desgranges , Sébastien Courant et al.
World Aquaculture 2018, European Aquaculture Society (EAS)., Aug 2019, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02264916 v1

Potential for genetic improvement of the main slaughter yields in common carp with in vivo morphological predictors

Martin Prchal , Jérôme Bugeon , Marc Vandeputte , Antti Kause , Alain Vergnet et al.
World Aquaculture 2018, European Aquaculture Society (EAS)., Aug 2018, Montpellier, France. 848 p
Communication dans un congrès hal-02012648 v1

Mixed-family estimation of genetic parameters of growth, morphologic, immune and behavioral traits in the european abalone Haliotis tuberculata

S. Lachambre , Sabine Roussel , S. Huchette , K. Chenevert , Christophe Lambert et al.
World Aquaculture 2018, European Aquaculture Society (EAS)., Aug 2018, Montpellier, France. pp.111
Communication dans un congrès hal-02011386 v1
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A first demonstration of realized selection response for fillet yield in fish, in rainbow trout oncorhynchus mykiss

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Anastasia Bestin , Alexandre Desgranges , Sebastien Courant et al.
13. International Symposium for Genetics in Aquaculture (ISGA XIII), Jul 2018, Cairns, Australia
Communication dans un congrès hal-02264933 v1

Modélisation de la croissance de la truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) en élevage

Jérôme Bugeon , Fabrice Mahé
Journée Mathématiques et Agronomie, Agence Lebesgue., Nov 2018, Saint-Gilles, France
Communication dans un congrès hal-02787517 v1

Mir-202 knock-out in medaka drastically impairs female fertility

Stéphanie Gay , Jérôme Bugeon , Amine Bouchareb , Laure Henry , Julien Bobe et al.
2. Journées scientifiques GDR 3606 REPRO : ReproSciences 2017, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS). FRA., Apr 2017, Tours, France
Communication dans un congrès hal-01594638 v1
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Peut-on sélectionner sur le rendement de filet chez les poissons ? (et chez le bar en particulier)

Marc Vandeputte , Clémence Fraslin , Jérôme Bugeon , François Allal , Antonio Puledda et al.
Journée du SFAMN (Syndicat Français de l'Aquaculture Marine et Nouvelle), Mar 2017, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-03155369 v1

Visegg, pour le phénotypage haut-débit des caractères de qualité des ovocytes et des œufs

Jérôme Bugeon
27. Journées techniques de la section aquacole du SYSAAF, Dec 2017, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-02789810 v1

MiR-202 knock-out in medaka drastically impairs female fertility

Stéphanie Gay , Jérôme Bugeon , Amine Bouchareb , Laure Henry , Julien Bobe et al.
10. European Zebrafish Meeting, Jul 2017, Budapest, Hungary
Communication dans un congrès hal-01603044 v1
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The INRA team « Growth and Flesh Quality » : From study of muscle tissues to flesh quality determinisms in fish

Jérôme Bugeon , Jean-Charles Gabillard , Sabrina Jagot , Véronique Lebret , Florence Lefèvre et al.
Importance of prenatal nutrition and environment on birth weight, muscle growth, health and survival of the neonate, Teagasc Agriculture and Food Development Authority (Teagasc). IRL., May 2017, Cork, Ireland
Communication dans un congrès hal-01607717 v1

Prédicteurs morphologiques du rendement chez le bar: projet BAR3

Marc Vandeputte , Antonio Puledda , Anne Sophie Tyran , Anastasia Bestin , Céline Coulombet et al.
Journée Technique Piscicole du Sysaaf, Feb 2016, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02800398 v1

Résistance génétique à l'entérite chez la truite ? Interaction avec la flavobactériose et les caractères de production

Anne-Sophie Tyran , Alexandre Desgranges , Anastasia Bestin , Florian Enez , François Allal et al.
5. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2016, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02743196 v1

Utilisation d'imagerie et d'ultrasons pour l'amélioration du rendement en chair par sélection génétique de la daurade

Dofungo Ouatarra , Anastasia Bestin , Pierrick Haffray , Florian Enez , Sophie Cariou et al.
5. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2016, Paris, France. pp.30
Communication dans un congrès hal-02741919 v1

Qualité de la chair des lignées de truite arc-en-ciel après sept générations de sélection sur la teneur en lipides musculaires

Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon , Lionel Goardon , Thierry Kerneis , Laurent Labbé et al.
16. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Nov 2016, Paris, France. 191 p
Communication dans un congrès hal-02742966 v1

Genetic parameters of indirect predictors of gutted and fillet yields in the gilthead sea bream Sparus aurata in using 2D camera, 3D digitizer and ultrasound technologies

Pierrick Haffray , Dofungo Ouatarra , Sophie Cariou , Jean-Sébastien Bruant , Frederic Ventre et al.
Aquaculture Europe 2016, Sep 2016, Edinburgh, United Kingdom. 1146 p
Communication dans un congrès hal-02741462 v1

Qualité de la chair des lignées de truite arc-en-ciel après sept générations de sélection sur la teneur en lipides musculaires

Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon , Lionel Goardon , Thierry Kerneis , Laurent Labbé et al.
Viandes et Produits Carnés, 2016, Paris, FRA, Région indéterminée. pp.37-38
Communication dans un congrès hal-02139701 v1

De la truite fumée à la PEIMA : les caractéristiques initiales du poisson impactent-elles la qualité du produit transformé

Florence Lefèvre , François Guyvarc'H , Thierry Kerneis , Véronique Lebret , Jérôme Bugeon et al.
Journée PEIMA (Pisciculture Expérimentale INRA des Monts d'Arrée), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UE Pisciculture Expérimentale INRA des Monts d'Arrée (0937)., Jan 2015, Sizun, France
Communication dans un congrès hal-02798625 v1
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Can selective breeding for growth or fillet yield decrease environmental impact of fish farming? a gilthead sea bream (Sparus aurata) case study

Pierrick Haffray , Ivonne Acosta Alba , Sophie Cariou , J.S. Bruant , Jérôme Bugeon et al.
12. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Jun 2015, Santiago de Compostela, Spain
Communication dans un congrès hal-01194132 v1

Les lignées isogéniques : un modèle d'étude des déterminants de la qualité chez la truite arc-en-ciel

Florence Lefèvre , Thierry Kerneis , Mathilde Dupont-Nivet , Adeline Jouquan , Véronique Lebret et al.
Journée PEIMA (Pisciculture Expérimentale INRA des Monts d'Arrée), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UE Pisciculture Expérimentale INRA des Monts d'Arrée (0937)., Jan 2015, Sizun, France
Communication dans un congrès hal-01194069 v1

Les lignées isogéniques : un modèle d'étude de la qualité chez la truite arc-en-ciel

Florence Lefèvre , Thierry Kerneis , Mathilde Dupont-Nivet , Adeline Jouquan , Véronique Lebret et al.
15. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). FRA., Nov 2014, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-01193990 v1
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Qualité des produits de truites de grande taille élevées en circuit recirculé ou ouvert : conséquences d'un stress à l'abattage

Florence Lefèvre , Matthieu Gaumé , Laurent Labbé , Violaine Colson , Claudiane Valotaire et al.
4. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2014, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02743793 v1

Reprint of: Genetic parameters of in-vivo prediction of carcass, head and fillet yields by internal ultrasound and 2D external imagery in large rainbow trout [i](Oncorhynchus mykiss)[/i]

Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Quentin Rivard , Benjamin Quittet , Sophie Puyo et al.
11. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Jun 2012, Auburn, United States. ⟨10.1016/j.aquaculture.2014.01.016⟩
Communication dans un congrès hal-01193810 v1
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Typologie des phénotypes nutritionnels chez les poissons d'élevage : constitution d'une base de méta-données

Benoit Fauconneau , Fabrice Teletchea , Mathieu Andro , Claudine Mader , Pierre-Yves Le Bail et al.
4. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2014, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02743777 v1
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Les ontologies ATOL et EOL, des outils en appui aux nouveaux challenges en production porcine

Marie-Christine Meunier-Salaün , Jérôme Bugeon , Olivier Dameron , Alice Fatet , Isabelle Hue et al.
46. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2014, Paris, France. pp.281-285
Communication dans un congrès hal-01019239 v1
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ATOL and EOL ontologies, steps towards embryonic phenotypes shared worldwide?

Isabelle Hue , Jérôme Bugeon , Olivier Dameron , Alice Fatet , Catherine Hurtaud et al.
4. Mammalian Embryo Genomics Meeting, Université Laval. CAN., Oct 2013, Hilton Quebec City, Canada. 102 p., ⟨10.1016/j.anireprosci.2014.06.013⟩
Communication dans un congrès hal-01205091 v1

Myostatin induces atrophy of trout myotubes through inhibiting the TORC1 signaling and promoting ubiquitin-proteasome and autophagy-lysosome degradative pathways

Iban Seiliez , Gemael Cedrick Taty Taty , Jérôme Bugeon , Karine Dias , Nathalie Sabin et al.
17. International Congress of Comparative Endocrinology, Jul 2013, Barcelone, Spain
Communication dans un congrès hal-02745613 v1

EOL: a new ontology for livestock system and rearing conditions

Léa Joret , Jérôme Bugeon , Joël Aubin , J.P. Blancheton , Mélynda Hassouna et al.
64. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2013, Nantes, France. 660 p
Communication dans un congrès hal-02745982 v1

Ontology dedicated to livestock traits: growth and meat products quality as an example

Jérôme Bugeon , Elisabeth Baéza , Jean-Paul Brun , Isabelle Cassar-Malek , Arnaud Chatonnet et al.
15. European Symposium on the Quality of Eggs and Egg Products. 21. European Symposium on the Quality of Poultry Meat, Università degli studi di Milano [Milano]. Milan, ITA., Sep 2013, Bergamo, Italy
Communication dans un congrès hal-01190568 v1

Genetic parameters of lipids heterogeneity estimated by direct (MRI) or indirect (artificial vision, Fat Meter) technologies in the fillet of large rainbow trout

Pierrick Haffray , Antoine Chevrel , Benjamin Quittet , F. Cachelou , G. Collewet et al.
Aquaculture conference, Oct 2013, Gran Canaria, Spain
Communication dans un congrès hal-02598817 v1

ATOL: une ontologie pour le phénotypage des animaux d'élevage

Jean Vernet , Jérôme Bugeon , Olivier Dameron , Alice Fatet , Isabelle Hue et al.
Les Colloques de l'Académie d'Agriculture de France, Nov 2010, Paris, France. 75 p
Communication dans un congrès hal-02750374 v1

Definition of common standards, protocols and ontology

Pierre-Yves Le Bail , Jérôme Bugeon , Léa Joret
AquaExcel Annual Meeting 2013, European Commission., Apr 2013, Bruxelles, Belgium
Communication dans un congrès hal-02805609 v1

Definition of common standards, protocols and ontology

Pierre-Yves Le Bail , Jérôme Bugeon , Léa Joret
AquaExcel Annual Meeting 2012, European Commission., Feb 2012, Las Palmas, Spain
Communication dans un congrès hal-02805232 v1

Origine des matières premières de l'aliment : conséquences sur la qualité des chairs de truite et de bar

Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon , Mathilde Dupont-Nivet , Françoise Médale , Laurent Labbé et al.
14. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Institut de l'Elevage (IDELE). FRA., Nov 2012, Caen, France
Communication dans un congrès hal-01190249 v1

FILD'OR : Amélioration des programmes de sélection sur la croissance et la qualité chez la daurade

Pierrick Haffray , Edwige Quillet , Cédric C. Pincent , E. E. Servan , Sophie S. Cariou et al.
Journées du SFAM, Mar 2012, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-01000630 v1

Selecting for processing yields: genetic parameters of non lethal indirect criteria in rainbow trout Oncorhynchus mykiss

Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Quentin Rivard , Benjamin Quittet , Marc Vandeputte et al.
11. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Auburn University. USA., Jun 2012, Auburn, United States. pp.37
Communication dans un congrès hal-01019822 v1

Environmental consequences of genetic improvement by selective breeding: a gilthead sea bream aquaculture case study

Joël Aubin , Ivonne I. Acosta Alba , Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Marc Vandeputte
8. International Conference on LCA in the Agri-Food Sector, Oct 2012, Saint-Malo, France. pp.694
Communication dans un congrès hal-01000950 v1

Atol: Animal Trait Ontology for Livestock. Atol: Où en sommes-nous ?

Pierre-Yves Le Bail , Jérôme Bugeon , Olivier Dameron , Alice Fatet , Catherine Hurtaud et al.
4. Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2012), Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Jan 2012, Rennes, France. 30 diapositives
Communication dans un congrès hal-01210637 v1

Heart morphology and malformations genetic parameters in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), genetic correlations with production traits

Benjamin Quittet , Pierrick Haffray , Hervé H. Chapuis , Paul P. Rault , Emmanuel E. Mazeiraud et al.
11. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Auburn University. USA., Jun 2012, Auburn, United States. pp.24
Communication dans un congrès hal-01001225 v1
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ATOL: The Multi-species Livestock Trait Ontology

Wiktoria Golik , Olivier Dameron , Jérôme Bugeon , Alice Fatet , Isabelle Hue et al.
6. Research Conference, MTSR, Nov 2012, Cadiz, Spain. pp.289-300, ⟨10.1007/978-3-642-35233-1_28⟩
Communication dans un congrès hal-01191279 v1

Fild'Or : Bases génétiques pour l'amélioration de la qualité de la daurade royale d'élevage Sparus aurata

Pierrick Haffray , Benjamin Quittet , Cédric Pincent , Elodie Servan , Sophie Cariou et al.
3. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01191204 v1

Genetic parameters of rainbow trout flesh texture

Mathilde Dupont-Nivet , Jérôme Bugeon , Richard Le Boucher , Gilles Paboeuf , Jean Michel Allamellou et al.
Aqua 2012, European Aquaculture Society (EAS). BEL., Sep 2012, Prague, Czech Republic
Communication dans un congrès hal-02745494 v1

Caractéristiques musculaires et texture de la chair de truite : intérêt de la comparaison de phénotypes extrêmes

Florence Lefèvre , Gilles G. Paboeuf , Jérôme Montfort , Aurélie Le Cam , Laurent Labbé et al.
3. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France. pp.87
Communication dans un congrès hal-01000611 v1

Caractéristiques musculaires de truites triées sur la texture de leur chair

Florence Lefèvre , Gilles G. Paboeuf , Jérôme Montfort , Aurélie Le Cam , Laurent Labbé et al.
14. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Institut de l'Elevage (IDELE). FRA., Nov 2012, Caen, France. pp.179-180
Communication dans un congrès hal-01000746 v1

Un pilote de production de truite en eau recirculée adapté au système de production intensif français

Matthieu Gaumé , Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre , Violaine Colson , Laurent Labbé
3. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02745735 v1
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Atol : une ontologie dédiée aux traits des animaux d'élevage, un exemple sur le thème de la croissance et de la qualité de la viande

Jérôme Bugeon , Elisabeth Baéza , Jean-Paul J.-P. Brun , Isabelle Cassar-Malek , Arnaud Chatonnet et al.
14. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Nov 2012, Caen, France. pp.151-152
Communication dans un congrès hal-01001254 v1

Qualitytruite" : l'IRM comme méthode de quantification rapide du gras intramusculaire et du tissu adipeux sous cutané des darnes de truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss)

Guylaine G. Collewet , Jérôme Bugeon , Jérôme J. Idier , Stéphane S. Quellec , Benjamin Quittet et al.
3. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France. pp.83
Communication dans un congrès hal-01000325 v1

Remplacement des matières premières de l'aliment : conséquences sur la qualité de la chair de truite et de bar

Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon , Mathilde Dupont-Nivet , Françoise Médale , Laurent Labbé et al.
3. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01191201 v1

Quelles conséquences environnementales des objectifs de sélection génétique des poissons : le cas de la daurade. Programme Fild'Or

Joël Aubin , Ivonne Acosta Alba , Sophie Cariou , Benjamin Quittet , Pierrick Haffray et al.
3. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France. pp.97
Communication dans un congrès hal-01019438 v1

Comment sélectionner pour la qualité ? Quelles évolutions ?

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Mathilde Dupont-Nivet , H. H. Chavanne , Pierrick Haffray et al.
Rencontres de l'aquaculture, May 2011, Le Touquet, France. 14 p
Communication dans un congrès hal-01001157 v1

Projet Aquaexcel-ATOL

Pierre-Yves Le Bail , Jérôme Bugeon , Léa Joret
Aquaexcel kickoff meeting, Apr 2011, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02805009 v1

ATOL : une ontologie pour le phénotypage des animaux d'élevage

Jean Vernet , Jérôme Bugeon , Olivier Dameron , Alice Fatet , Isabelle Hue et al.
Colloque international "La génomique bovine. Contribution de la génomique à l'avenir de l'élevage bovin", Oct 2011, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-01019432 v1

Quelles méthodes pour évaluer la qualité des poissons?

Jérôme Bugeon
Les Rencontres de l'Aquaculture, May 2011, Le Touquet, France
Communication dans un congrès hal-02806363 v1
Image document

ATOL - Animal Trait Ontology for Livestock : une ontologie des caractères phénotypables sur les animaux de rente

Alice Fatet , Catherine Hurtaud , Jérôme Bugeon , Olivier Dameron , Isabelle Hue et al.
18. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2011, Paris, France. pp.355
Communication dans un congrès hal-01019376 v1

ATOL: A new ontology for livestock

Catherine Hurtaud , Jérôme Bugeon , Olivier Dameron , Alice Fatet , Isabelle Hue et al.
ICAR 2011: "New technologies and new challenges for breeding and herd management", Jun 2011, Bourg-en-Bresse, France
Communication dans un congrès hal-01189518 v1

Sélection génétique sur la réponse au stress et stress à l'abattage: conséquences sur le protéome musculaire et lien avec la qualité de la chair chez la truite arc-en-ciel

Florence Lefèvre , Gilles Paboeuf , T.G. Pottinger , Jérôme Bugeon
13. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Oct 2010, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-02755659 v1

Colour image analysis as a possible tool to quantify carcass and flesh quality in a rainbow trout selective breeding program

Jérôme Bugeon , Georges Choubert , Cédric Pincent , Béatrice Chatain , Vincent Petit et al.
Digital imaging in fisheries biology, Sep 2010, Písek, Czech Republic
Communication dans un congrès hal-01193650 v1

Processing quality of selected fish: quasi-absence of correlated responses to selection for growth in the brown trout [i]Salmo trutta[/i] and in the sea bass [i]Dicentrarchus labrax[/i]

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Mathilde Dupont-Nivet , H. Chavanne , Pierrick Haffray et al.
Aquaculture Europe 09, Aug 2009, Trondheim, Norway
Communication dans un congrès hal-01193574 v1

Qualitytruite" : Élaboration d'une méthode de sélection sur les rendements de découpe et la qualité de la chair combinant sélection massale et familiale

Pierrick Haffray , Cédric Pincent , Hervé Chapuis , Vincent Petit , Jérôme Bugeon et al.
2. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2009, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01193466 v1

La texture de la chair des poissons d'élevage : bases biologiques et facteurs de variation

Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre
Journée de recherche de la Confédération des Industries de Traitement des Produits des Pêches Maritimes (CITPPM), 2009, France. n.p
Communication dans un congrès hal-02813910 v1

Conséquences d'une sélection génétique sur la réponse au stress et du stress à l'abattage sur la qualité de la chair de la truite arc-en-ciel

Florence Lefèvre , Isabelle Cos , Tom Pottinger , Jérôme Bugeon
2. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2009, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02752367 v1

Genetic parameters for growth and flesh quality traits in large freshwater-reared rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) groups, mass selected or not for growth

Pierrick Haffray , Cédric Pincent , Hervé Chapuis , Vincent Petit , Jérôme Bugeon et al.
10. International Symposium on Genetics in Aquaculture (IAGA), Jun 2009, Bangkok, Thailand
Communication dans un congrès hal-01193550 v1

Pas de modification de qualité technologique chez les poissons sélectionnés pour la croissance : exemples de la truite fario et du bar

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Mathilde Dupont-Nivet , H. Chavanne , Pierrick Haffray et al.
2. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2009, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01193498 v1

Amélioration de la sélection individuelle par indexation sur collatéraux: application aux critères de qualité.

Pierrick Haffray , Mathilde Dupont-Nivet , Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Cédric Pincent et al.
Congrès du SFAMN Syndicat Français de l'Aquaculture Marine et Nouvelle, Mar 2009, Montpellier, France. n.p
Communication dans un congrès hal-01193566 v1

Rendements de découpe et qualité de la chair chez trois espèces de salmonidés : la truite arc-en-ciel, la truite fario et le saumon atlantique

Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre , Armel Davenel , Pierrick Haffray
12. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Oct 2008, Tours, France
Communication dans un congrès hal-02757185 v1
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Déterminisme biologique de la qualité des poissons

Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon
12. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Oct 2008, Tours, France
Communication dans un congrès hal-02752892 v1

Flesh quality in rainbow trout with high or low fillet yield

Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre , Mireille Cardinal , Ayhan Uyanik , Armel Davenel et al.
Cost Action 925. Possible new technologies to estimate the muscle fiber number for use in animal production, Sep 2007, Viborg, Denmark
Communication dans un congrès hal-02758272 v1

Sélection génétique sur la réponse au stress et stress à l'abattage: conséquences sur la qualité de la chair chez la truite arc-en-ciel

Florence Lefèvre , Isabelle Cos , T.G. Pottinger , Jérôme Bugeon
12. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Oct 2008, Tours, France
Communication dans un congrès hal-02755667 v1

Muscle characteristics and flesh quality in HR and LR strains with or without slaughter stress

Florence Lefèvre , Isabelle Cos , Jérôme Bugeon , T.G. Pottinger
AQUAFIRST. Final meeting, Mar 2008, Padova, Italy. n.p
Communication dans un congrès hal-02821050 v1

Selection for muscle lipid content in rainbow trout: consequences on fillet quality

Florence Lefèvre , M. Cardinal , Jérôme Bugeon , Laurent Labbé , Françoise Médale et al.
9. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Jun 2006, Montpellier, France. ⟨10.1016/j.aquaculture.2007.07.121⟩
Communication dans un congrès istex hal-01193488 v1

Effet de la sélection pour la teneur en lipides musculaires sur la répartition des lipides corporels et les rendements de transformation chez la truite Arc-En-Ciel

Edwige Quillet , Jérôme Bugeon , Sandrine Le Guillou , A. Davenel , G. Collewet et al.
1ères journées de la recherche filière piscicole, Paris, 3-4 juillet 2007, 2007, Paris, France. pp.1
Communication dans un congrès hal-02590375 v1

Effect of selection for muscle lipid content on body shape, fat deposition and dressing yields in rainbow trout

Edwige Quillet , Jérôme Bugeon , Sandrine Le Guillou , A. Davenel , G. Collewet et al.
9. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Jun 2006, Montpellier, France. ⟨10.1016/j.aquaculture.2007.07.168⟩
Communication dans un congrès istex hal-02757666 v1

Characterization of lipid distribution in rainbow trout by magnetic resonance, colour vision and histology imaging techniques

Armel Davenel , Jérôme Bugeon , Guylène Collewet , Edwige Quillet , Françoise Médale
2. International Symposium on Energy & Protein Metabolism & Nutrition, Sep 2007, Vichy, France
Communication dans un congrès hal-02752860 v1

Optimisation du système aquacole par expérimentation multifactorielle : effet des facteurs environnementaux sur les performances chez le bar

Jean-Noel Gardeur , Jérôme Bugeon , Mireille Cardinal , Geneviève Corraze , Nicolas Le Bayon et al.
1. Journées de la recherche filière piscicole, Jul 2007, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02756097 v1

Sélection pour la teneur en lipides musculaires et triploïdie : impact sur la qualité de la chair de truite arc-en-ciel

Florence Lefèvre , Mireille Cardinal , Jérôme Bugeon , Laurent Labbé , Françoise Médale et al.
1. Journées de la recherche filière piscicole, Jul 2007, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02756218 v1

Rendements au filetage et qualité de la chair chez trois espèces de salmonidés : le saumon atlantique, la truite arc-en-ciel et la truite fario

Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre , Ayhan Uyanik , Laurent Labbé , Armel Davenel et al.
1. Journées de la recherche filière piscicole, Jul 2007, Paris, France. pp.1
Communication dans un congrès hal-02758383 v1

Déterminisme morphologique du rendement en filets chez la truite arc-en-ciel

Jérôme Bugeon , Ayhan Uyanik , Florence Lefèvre , Pierrick Haffray
1. Journées de la recherche filière piscicole, Jul 2007, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02750996 v1

Truitafilet: Effets de la sélection croissance sur la qualité de la truite commune.

Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Laurent Labbé , Pierrick Haffray
Journée Technique Piscicole du Sysaaf, Oct 2006, Paris, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02823901 v1

Prosper+/Qualitytruite : Evaluation et amélioration de la procédure de sélection PROSPER: optimisation des méthodes actuelles et introduction d'indexations sur collatéraux sur des critères de qualité.

Pierrick Haffray , H. Chapuis , M. Jegaden , V. Petit , J. Doerflinger et al.
Journée Technique Piscicole du Sysaaf, Oct 2006, Paris, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02823838 v1

Effect of early nutrition on fat storage and quality criteria in 600g rainbow trout selected for muscle fat content

Françoise Médale , Jérôme Bugeon , N. Richard , Laurent Labbé , Geneviève Corraze et al.
XII International Symposium on Fish Nutrition & Feeding, Biarritz, May 28-June 1, 2006, 2006, pp.1
Communication dans un congrès hal-02588825 v1

Amélioration des rendements au filetage et au parage en pisciculture

Jérôme Bugeon , Marc Vandeputte , Mireille Cardinal , Florence Lefèvre , Ayhan Uyanik et al.
Journée technique du SYSAAF (Syndicat des Sélectionneurs Avicoles Aquacoles Français), Oct 2006, Paris, France. n.p
Communication dans un congrès hal-02823010 v1

Modélisation du rayonnement hyperfréquence du fish fat meter dans un tissu biologique multicouche

Sylvie Clerjon , Jérôme Bugeon
9. Journées de caractérisation microondes et matériaux, Mar 2006, Saint Etienne, France
Communication dans un congrès hal-02750894 v1

Impact du niveau d'oxygénation de l'eau sur la croissance, la morphologie et la qualité des carcasses chez la truite arc-en-ciel Oncorhynchus mykiss

Florence Lefèvre , Joël Aubin , Wilfried Louis , Laurent Labbé , Jérôme Bugeon
RIF 2006, Mar 2006, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02755668 v1

Effect of early nutrition on fat storage and quality criteria in 600G rainbow trout selected for muscle fat content

Françoise Médale , Jérôme Bugeon , Laurent Labbé , Geneviève Corraze , A. Davenel et al.
12. International Symposium Fish Nutrition and Feeding, May 2006, Biarritz, France
Communication dans un congrès hal-02755248 v1

Effect of selection for muscle lipid content on fat deposition, dressing yields and body shape in rainbow trout

Edwige Quillet , Jérôme Bugeon , Sandrine Le Guillou , A. Davenel , G. Collewet et al.
9th International Symposium for Genetics in Aquaculture, Montpellier, 25-30 June 2006, 2006, pp.1
Communication dans un congrès hal-02588820 v1
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Proteomic and morphological characterization of isolated rainbow trout adipocytes originating from various fat tissues

Claudine Weil , Nathalie Sabin , Jérôme Bugeon , Gilles Paboeuf , Florence Lefèvre
Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique, Oct 2006, Saint Malo, France. 49 p
Communication dans un congrès hal-02753790 v1

Impact de la teneur en lipides musculaires et de la triploïdie sur la texture de la chair de truite arc-en-ciel : intérêt de lignées divergentes selectionnées

Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon , M. Cardinal , Laurent Labbé , Françoise Médale et al.
11. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Oct 2006, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-02753799 v1

Qualité de la chair chez des truites (Oncorhynchus mykiss) à haut et bas rendements en filet

Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre , M. Cardinal , Ayhan Uyanik , A. Davenel et al.
11. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Oct 2006, Clermont-Ferrand, France. pp.203-204
Communication dans un congrès hal-02751156 v1

Étude de la réponse à la sélection sur la teneur en lipides intramusculaires.

Edwige Quillet , Jérôme Bugeon
17èmes Journées Techniques du SYSAAF, 2005, Rennes, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02830319 v1

Effets du jeûne et de la réalimentation sur les caractéristiques du tissu musculaire de truite arc-en-ciel

Florence Lefèvre , Gilles Paboeuf , Jérôme Bugeon
10. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Oct 2004, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-02759567 v1

Impact du niveau d'oxygène pendant la croissance sur la structure du muscle et la texture de la chair de truite (Oncorhynchus mykiss) ?

Jérôme Bugeon , Joël Aubin , Gilles Paboeuf , Florence Lefèvre
10. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Oct 2004, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-01460816 v1
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Distinct dynamics of muscle stem cells associated with the hyperplasia decline in trout

Sabrina Jagot , Nathalie Sabin , Candice Babarit , Jérôme Bugeon , Cécile Ralliere et al.
French Society for Stem Cell Research, Jan 2024, Paris, France
Poster de conférence hal-04496483 v1
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Distinct dynamics of muscle stem cells associated with the hyperplasia decline in trout

Sabrina Jagot , Nathalie Sabin , Candice Babarit , Jérôme Bugeon , Cécile Ralliere et al.
International Society for Stem Cell Research, Dec 2023, Vienne, Austria
Poster de conférence hal-04496456 v1
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Utilisation de l'imagerie en 3D pour caractériser l'organisation des tissus adipeux chez la truite arc-en-ciel

Adèle Branthonne , Manon Thomas , Violette Thermes , Isabelle Hue , Jérôme Bugeon
Mettez un peu de piquant dans vos recherches, Jun 2023, Dijon, France
Poster de conférence hal-04288888 v1

Monitoring the Oogenesis Dynamics in the Medaka Ovary Using a Quantitative 3D Image Analysis Approach

Manon Lesage , Mak Sully , Manon Thomas , Stéphanie Gay , Thierry Pécot et al.
12. European Zebrafish Meeting, Jul 2023, Krakow, Poland
Poster de conférence hal-04187761 v1
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Impact des étapes pré-abattage sur les caractéristiques des filets chez la truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss)

Lionel Goardon , Thierry Kerneis , Jérôme Bugeon , Morgane Chesnais , Guillaume Brit et al.
7. Journées de la Recherche Piscicole, Jul 2022, Paris, France
Poster de conférence hal-04298122 v1
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Evolution des qualités après la ponte chez la truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) en élevage biologique et conventionnel, comparaison avec des truites triploïdes sur deux années successives

Guillaume Brit , Lionel Goardon , Jean-Marc Coupé , Thierry Kerneis , Jérôme Bugeon et al.
7. Journées de la Recherche Piscicole, Jul 2022, Paris, France
Poster de conférence hal-04298385 v1
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Effet du taux de rationnement des femelles avant la ponte sur la qualité post-ponte des produits chez la truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss)

Morgane Chesnais , Jérôme Bugeon , Lionel Goardon , Thierry Kerneis , Jean-Marc Coupé et al.
7. Journées de la Recherche Piscicole, Jul 2022, Paris, France
Poster de conférence hal-04298207 v1
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Impact du niveau d'adiposité des femelles sur la qualité post-ponte des produits chez la truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) modèle des lignées grasses et maigres

Lionel Goardon , Jérôme Bugeon , Thierry Kerneis , Véronique Lebret , Florian Geslin et al.
7. Journées de la Recherche Piscicole, Jul 2022, Paris, France
Poster de conférence hal-04298067 v1
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Effet d'un prébiotique en supplémentation d'un aliment végétal ou commercial sur les qualités des produits chez la truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss)

Doriane Combot , Jérôme Bugeon , Thierry Kerneis , Lionel Goardon , Laurent Labbé et al.
7. Journées de la Recherche Piscicole, Jul 2022, Paris, France
Poster de conférence hal-04298169 v1
Image document

Impact de la durée de stockage au froid des oeufs embryonnés de truite arc-en-ciel

Elodie Harte , Michael Marchand , Tina Terrenne , Lionel Goardon , Laurent Labbé et al.
7. journée d'animation scientifique autour de l'épigénétique (épiPHASE), Jun 2022, Rennes, France. 2022
Poster de conférence hal-03779238 v1
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Effet de la date de ponte et de la durée du jeune au moment de la ponte sur la qualité post-ponte des produits chez la truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss)

Jérôme Bugeon , Thierry Kerneis , Lionel Goardon , Morgane Chesnais , Jean-Marc Coupé et al.
7. Journées de la Recherche Piscicole, Jul 2022, Paris, France
Poster de conférence hal-04298327 v1

Interest of artificial intelligence to predict fillet yield in rainbow trout

Jonathan D’ambrosio , Tarek Chalioui , Jean Ruche , Alexandre Desgranges , Marc Vandeputte et al.
XIV. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Nov 2022, Puerto Varas, Chile
Poster de conférence hal-04185903 v1
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Caractérisation des pontes des lignées expérimentales automnales et printanières de la Pisciculture Expérimentale INRAE des Monts d'Arrée (PEIMA)

Jérôme Bugeon , Florian Geslin , Lionel Goardon , Thierry Kerneis , Jean-Marc Coupé et al.
7. Journées de la Recherche Piscicole, Jul 2022, Paris, France
Poster de conférence hal-04298270 v1

An image analysis pipeline for molluscs shells phenotyping: Development and validation on the pacific oyster Crassostrea gigas

Antoine Jourdan , Jérôme Bugeon , Jean-Baptiste Lamy , Florian Enez , Lionel Dégremont et al.
Aquaculture Europe 2021, Oct 2021, Funchal, Madeira, Portugal
Poster de conférence hal-03525958 v1

Développement d'une nouvelle méthode pour l'analyse 3D de la dynamique ovarienne chez le poisson : Transparisation, microscopie, analyse d'image et modélisation

Manon Thomas , Stéphanie Gay , Jérôme Bugeon , Marie Haghebaert , Fabrice Mahé et al.
Séminaire Défis Scientifiques du Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage, Nov 2019, Rennes, France. 85 p., 2019, Recueil des résumés
Poster de conférence hal-02735123 v1

Evolution de la qualité de truites arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) apres la ponte : effet de l’élevage biologique versus conventionnel et comparaison avec des truites triploïdes

Guillaume Brit , Jérôme Bugeon , Lionel Goardon , Thierry Kerneis , Jean Ruche et al.
6. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2019, Paris, France. , 2019
Poster de conférence hal-02184260 v1
Image document

Utilisation de l’Eci pour la transparisation chez le poisson : exemples d’applications pour l’imagerie 3D

Adèle Branthonne , Manon Thomas , Jérôme Bugeon , Jean-Charles Gabillard , Manon Lesage et al.
32. Congrès de l'Association Française d'Histotechnologie, Jun 2019, Strasbourg, France. , 2019
Poster de conférence hal-02786189 v1

NINAQUA : nouveaux ingrédients pour de nouveaux aliments aquacoles – effets sur la qualité des truites au stade portion

Guillaume Brit , Jérôme Bugeon , Lionel Goardon , Thierry Kerneis , Erwan Caudal et al.
6. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2019, Paris, France. , 2019
Poster de conférence hal-02184265 v1

Optimisation de la qualité de la chair de grande truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) après ovulation - projet QualiPostOv

Guillaume Brit , Yéléhi Diane Ahongo , Jérôme Bugeon , Lionel Goardon , Thierry Kerneis et al.
6. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2019, Paris, France. , 2019
Poster de conférence hal-02184249 v1

Unusual egg quality phenotype in the Aspe Valley: a case study in rainbow trout

Emilien Segret , Frédéric Cachelou , Emilie Cardona , Jérôme Bugeon , Sandrine Skiba-Cassy et al.
7. International Workshop on the Biology of Fish Gametes, Sep 2019, Rennes, France. , pp.160-161, 2019
Poster de conférence hal-02282255 v1

Genetic parameters for growth and colour traits in Pacific blue shrimp Litopenaeus stylirostris in a mixed family design with SNP parentage assignement in New-Caledonia

Florian Enez , Bénédicte Lorgeoux , Mahunon H , Jérôme Bugeon , Marc Vandeputte et al.
11. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Feb 2018, Auckland, New Zealand
Poster de conférence hal-03156790 v1
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MiR-202 regulates female fecundity by controlling early follicle development in medaka ovary

Stéphanie Gay , Jérôme Bugeon , Amine Bouchareb , Laure Henry , Clara Delahaye et al.
11. International Symposium on Reproductive Physiology of Fish, Jun 2018, Manaus, Brazil. 251 p., 2018, New frontiers in reproductive diversity in a changing environment
Poster de conférence hal-02437626 v1

miR-202, un microARN clé pour le succès reproducteur des femelles chez le poisson médaka

Stéphanie Gay , Jérôme Bugeon , Amine Bouchareb , Laure Henry , Jérôme Montfort et al.
Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2018), Apr 2018, Rennes, France. , 2018, Journées d’animation scientifiques du département Phase - Recueil des résumés
Poster de conférence hal-01771815 v1

Effect of food restriction on reproductive performances and egg quality in the trout Oncorhynchus mykiss

Emilie Cardona , Jérôme Bugeon , Violette Thermes , Violaine Colson , Sandrine Skiba et al.
6. International Workshop on the Biology of Fish Gametes, Sep 2017, Vodnany, Czech Republic. University of South Bohemia in Ceske Budejovice ; Faculty of Fisheries and Protection of Waters, 1st, 156 p., 2017, 6. International Workshop on the Biology of Fish Gametes
Poster de conférence hal-01595634 v1

VISEGG : un système de comptage et mesure automatisé des oeufs de truite par analyse d'image

Jérôme Bugeon , Jérôme Doerflinger , Chloé Bertin , Vincent Petit , Florian Enez et al.
5. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2016, Paris, France. , Journées de la Recherche Filière Piscicole, pp.45, 2016, JRFP 2016
Poster de conférence hal-02743289 v1

Stratégie de développement de biomarqueurs de texture de la chair de truite arc-en-ciel

Véronique Lebret , Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre
16. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Nov 2016, Paris, France. ADIV, Viandes et Produits Carnés, 191 p., 2016, JSMTV 2016
Poster de conférence hal-02742990 v1

Stratégie de développement de biomarqueurs de texture de la chair chez la truite arc-en-ciel

Véronique Lebret , Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre
5. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2016, Paris, France. , Journées de la Recherche Filière Piscicole, pp.61, 2016, JRFP 2016
Poster de conférence hal-02740688 v1
Image document

Identification of a new gene involved in muscle morphogenesis in vertebrates

Aurélie Landemaine , Olivier Monestier , Jérôme Bugeon , Pierre-Yves Rescan , Jean-Charles Gabillard
5. International Congress of Myology, Mar 2016, Lyon, France. , 2016, Myology 2016
Poster de conférence hal-02740912 v1

Déterminisme génétique de la texture de la chair de truite arc-en-ciel : intérêt de l'utilisation de lignées isogéniques

Florence Lefèvre , Thierry Kerneis , Mathilde Dupont-Nivet , Adeline Jouquan , Véronique Lebret et al.
Journées d’Animation des Crédits Incitatifs du Département de Physiologie Animale et Systèmes d’Elevage (JACI Phase 2016), Apr 2016, Tours, France. , 115 p., 2016, Crédits incitatifs financés entre 2011 et 2014
Poster de conférence hal-02741290 v1

Seven generations of divergent selection for muscle lipid content in rainbow trout: main impacts on lipid distribution and metabolism

Stéphane Panserat , Jérôme Bugeon , Elisabeth Plagnes- Juan , Laurence L. Larroquet , Anne Surget et al.
Aquaculture Europe 2016, Sep 2016, Edinburgh, United Kingdom. , 1146 p., 2016, AE2016 "Food for Thought"
Poster de conférence hal-02740952 v1

Equipe Croissance et Qualité de la Chair des Poissons de l'Unité INRA-LPGP de Rennes

Jérôme Bugeon , Jean-Charles Gabillard , Véronique Lebret , Florence Lefèvre , Cécile Ralliere et al.
5. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2016, Paris, France. , Journées de la Recherche Filière Piscicole, pp.62, 2016, JRFP 2016
Poster de conférence hal-02742924 v1

Qualité de la chair des lignées de truite arc-en-ciel après sept générations de sélection sur la teneur en lipides musculaires

Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon , Lionel Goardon , Laurent Labbé , Edwige Quillet
5. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2016, Paris, France. , Journées de la Recherche Filière Piscicole, pp.31, 2016, JRFP 2016
Poster de conférence hal-02741781 v1

Identification of two new genes involved in muscle morphogenesis in vertebrates

Aurélie Landemaine , Jérôme Bugeon , Pierre-Yves Rescan , Jean-Charles Gabillard
Conférence Jacques Monod, Construction, réparation et évolution des tissus, Sep 2015, Roscoff, France. 2015
Poster de conférence hal-02796500 v1
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Identification of two new genes involved in myocyte fusion in vertebrates

Aurélie Landemaine , Jérôme Bugeon , Pierre-Yves Rescan , Jean-Charles Gabillard
9. European Zebrafish Meeting, Jun 2015, Oslo, Norway. , 2015, Zebrafish 2015
Poster de conférence hal-02742363 v1
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Variabilité génétique de la qualité chez la truite arc-en-ciel : intérêt de l'étude de lignées isogéniques

Florence Lefèvre , Thierry Kerneis , Mathilde Dupont-Nivet , Véronique Lebret , Laurent Labbé et al.
4. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2014, Paris, France. ITAVI, 2014, JRFP 2014
Poster de conférence hal-01193841 v1
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ATOL et EOL : deux référentiels dans le domaine du phénotypage et des conditions d'élevage des poissons

Jérôme Bugeon , Léa Joret , Joël Aubin , Violaine Colson , Florence Le Gac et al.
4. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2014, Paris, France. ITAVI, 2014, JRFP 2014
Poster de conférence hal-01193842 v1

Le TMA comme outil de caractérisation de la croissance musculaire de truite

Jérôme Bugeon , Parfait Evouna Mengue , Claude Sevellec , Chantal Cauty
26. Congrès de l'Association Française d'Histotechnologie, Jun 2013, Rennes, France. 2013, La Bretagne à la pointe de l'histotechnologie
Poster de conférence hal-02745534 v1

Equipe croissance et qualité de la chair des poissons

Jérôme Bugeon , Xavier Cousin , Jean-Charles Gabillard , Véronique Lebret , Florence Lefèvre et al.
3. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France. , 2012, 3èmes Journées de la Recherche Filière Piscicole
Poster de conférence hal-02749598 v1

Influence de l'élevage en circuit recirculé sur le comportement et la qualité de la chair chez la truite

Florence Lefèvre , Violaine Colson , Jérôme Bugeon , Matthieu Gaumé , Claudiane Valotaire et al.
3. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France. , 2012, 3èmes Journées de la Recherche Filière Piscicole
Poster de conférence hal-02745137 v1
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Quantification of intramuscular fat and subcutaneous adipose tissue in rainbow trout using MRI and vision

G. Collewet , Jérôme Bugeon , J. Idier , S. Quellec , Benjamin Quittet et al.
1. Annual Conference on Carcass Evaluation, Meat Quality, Software and Traceability, Sep 2012, Dublin, Ireland. 2012, First annual Conference on Carcass Evaluation, Meat Quality, Software and Traceability
Poster de conférence hal-02600018 v1

Colour image analysis as a possible tool to quantify carcass and flesh quality in a rainbow trout selective breeding program

Jérôme Bugeon
1. Annual Conference on Body and Carcass Evaluation, Meat Quality, Software and Traceability, Sep 2012, Ashtown, Dublin, Ireland. 2012, FAIM I: First Annual Conference on Body and Carcass Evaluation, Meat Quality, Software and Traceability
Poster de conférence hal-02744714 v1

ATOL: an ontology for livestock

Marie-Christine Meunier-Salaün , Jérôme Bugeon , Olivier Dameron , Alice Fatet , Isabelle Hue et al.
63. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2012, Bratislava, Slovakia. Academic Publishers, Annual Meeting of the European Association for Animal Production, 18, 476 p., 2012, Annual Meeting of the European Association for Animal Production
Poster de conférence hal-01210638 v1

Qualité de la chair chez des truites (Oncorhynchus mykiss) à haut et bas rendements en filet

Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre , M. Cardinal , Ayhan Uyanik , A. Davenel et al.
2. Journées d'Animation Scientifique du Département PHASE, Oct 2007, Tours, France. 2007, 2èmes Journées d'Animation Scientifique du Département PHASE
Poster de conférence hal-02590376 v1

La sélection sur la teneur en lipides musculaires et la triploïdie affectent la texture du muscle de truite arc-en-ciel.

Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon , M. Cardinal , Laurent Labbé , Françoise Médale et al.
Journées des Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Oct 2006, Clermont-Ferrand, France. pp.Inconnu, 2006
Poster de conférence hal-02824907 v1

Caractérisation de lignées divergentes de truite arc-en-ciel sur la teneur en lipides intramusculaires : morphologie, structure du muscle et texture de la chair au stade portion.

Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre , Joël Aubin , Edwige Quillet , Benoit Fauconneau
Premières journées d'animation scientifique du Département PHASE, Mar 2005, Tours, pp.Inconnu, 2005
Poster de conférence hal-02826061 v1

Les exigences de qualité et de durabilité

Joël Aubin , Jérôme Bugeon , Benoit Fauconneau , Florence Lefèvre
La truite arc-en-ciel. De la biologie à l'élevage, Editions Quae, 2010, Synthèses, 978-2-7592-0875-3
Chapitre d'ouvrage hal-01205010 v1

Croissance squelettique et musculaire

Hélène Alami-Durante , Jérôme Bugeon , Marie-Hélène Deschamps , Jean-Charles Gabillard , Florence Lefèvre et al.
La truite arc-en-ciel. De la biologie à l'élevage, Editions Quae, 2010, Synthèses, 978-2-7592-0875-3
Chapitre d'ouvrage hal-01205000 v1

La croissance musculaire

Hélène Alami-Durante , Jérôme Bugeon , Jean-Charles Gabillard , Florence Lefèvre , Pierre-Yves Rescan et al.
La truite arc-en-ciel. De la biologie à l'élevage, Editions Quae, 2010, Synthèses (INRA), 978-2-7592-0875-3
Chapitre d'ouvrage hal-01205029 v1
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Organoleptic qualities of rainbow trout fed with new ingredients added to a plant-based diet

Florence Lefèvre , Mireille Cardinal , Thierry Kerneis , Guillaume Brit , Lionel Goardon et al.
2024
Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-04729810 v1

Mature adipocytes inhibit differentiation of myogenic cells but stimulate proliferation of fibro-adipogenic precursors derived from trout muscle in vitro

Valentine Goffette , Nathalie Sabin , Jérôme Bugeon , Sabrina Jagot , Isabelle Hue et al.
2024
Pré-publication, Document de travail hal-04718013 v1
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An end-to-end pipeline based on open source deep learning tools for reliable analysis of complex 3D images of Medaka ovaries

Manon Lesage , Jérôme Bugeon , Manon Thomas , Thierry Pécot , Violette Thermes
2022
Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-03759490 v1
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VisEgg: A robust phenotyping tool to assess rainbow trout egg features and viability

Emilie Cardona , Jérôme Bugeon , Emilien Segret , Julien Bobe
2020
Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-03048531 v1
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C-Eci: A Cubic-Eci combined clearing method for 3D follicular content analysis In the ovary

Manon Lesage , Manon Thomas , Jérôme Bugeon , Adèle Branthonne , Stéphanie Gay et al.
2020
Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-02790859 v1
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MicroRNA-202 (miR-202) controls female fecundity by regulating medaka oogenesis

Stéphanie Gay , Jérôme Bugeon , Amine Bouchareb , Laure Henry , Jérôme Montfort et al.
2018
Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-02790703 v1
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Naa15 knockdown enhances c2c12 myoblast fusion and induces defects in zebrafish myotome morphogenesis

Olivier Monestier , Aurélie Landemaine , Jérôme Bugeon , Pierre-Yves Rescan , Jean-Charles Gabillard
2018
Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-03047127 v1
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Histological, transcriptomic and in vitro analysis reveal an intrinsic activated state of myogenic precursors in hyperplasic muscle of trout

Sabrina Jagot , Nathalie Sabin , Aurélie Le Cam , Jérôme Bugeon , Pierre-Yves Rescan et al.
2018
Pré-publication, Document de travail (preprint/prepublication) hal-03023034 v1
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Rapport final Projet Feamp QualiPostOv "Optimisation de la qualité de la chair de grande truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) après ovulation

Florence Lefèvre , Valentin Brunet , Jérôme Bugeon , Thierry Kerneis , Pierre-Yves Rescan
INRAE - LPGP. 2022
Rapport (rapport contrat/projet) hal-04724453 v1
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La qualité des aliments d'origine animale selon les conditions de production et de transformation. Rapport de l'Expertise scientifique collective

Sophie Prache , Véronique Santé-Lhoutellier , Camille Adamiec , Thierry Astruc , Elisabeth Baéza et al.
[0] INRAE. 2020, 1023 p
Rapport (rapport d’expertise collective) hal-02986866 v1

Deliverable report 3.3: Fish-ontologic base (phenotyping/environment) and measure technical base

Pierre-Yves Le Bail , Léa Joret , Jérôme Bugeon
[Contract] 2013
Rapport (rapport contrat/projet) hal-02803799 v1

FILD'OR - Bases génétiques et écologiques pour l'amélioration de la qualité de la daurade royale d'élevage Sparus aurata

Pierrick Haffray , Benjamin Quittet , Cédric Pincent , Elodie Servan , Sophie Cariou et al.
[Rapport de recherche] SIVAL NL: 2009-1227 & FEP n°33073-2009, FranceAgriMer. 2012, 67 p
Rapport (rapport de recherche) hal-01193691 v1

QualityTruite 2. Optimisation des nouveaux programmes de sélection généalogique de type Prosper+ sur les rendements de découpe et la qualité de la chair

Pierrick Haffray , Hervé Chapuis , Benjamin Quittet , Cédric Pincent , Frédéric Cachelou et al.
[Contrat] 083/08/C & 30900/2009, FranceAgriMer. 2011, 115 p
Rapport (rapport contrat/projet) hal-01193646 v1

QualityTruite. Introduction d'une évaluation généalogique qualitative en sélection de type PROSPER

Pierrick Haffray , Hervé Chapuis , Bernard Coudurier , Cédric Pincent , Vincent Petit et al.
[Contrat] Ofimer n°037/05/C & Ifop n° 206/2005, 2007
Rapport (rapport contrat/projet) hal-02823607 v1

MULTIBAR : Etude par une approche multifactorielle des effets des facteurs environnementaux sur les performances zootechniques et la qualité de la chair du bar

Vincent Buchet , Jérôme Bugeon , Mireille Cardinal , Geneviève Corraze , Jean-Noel Gardeur et al.
[Rapport Technique] Action Incitative IFREMER-INRA 2004, 2007
Rapport (rapport technique) hal-02821573 v1

Amélioration des rendements au filetage et au parage en pisciculture "TRUITAFILET

Jérôme Bugeon , Marc Vandeputte , Mireille Cardinal , Florence Lefèvre , Ayhan Uyanik et al.
[Rapport de recherche] Rapport final de la convention OFIMER 076/04/C, Office National Interprofessionnel des Produits de la Mer et de l’Aquaculture (France). 2006, 105 p
Rapport (rapport de recherche) hal-02823952 v1