Julie Demars

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Pig and quail CpG methylation datasets from short and long read sequencing technologies

Paul Terzian , Céline Vandecasteele , Joanna Lledo , Rémy-Félix Serre , Jules Sabban et al.
Scientific Data , 2025, 12 (1), pp.556. ⟨10.1038/s41597-025-04769-4⟩
Article dans une revue hal-05039144 v1
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Detection of DNA methylation signatures through the lens of genomic imprinting

Jean-Noël Hubert , Nathalie Iannuccelli , Cédric Cabau , Eva Jacomet , Yvon Billon et al.
Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.1694. ⟨10.1038/s41598-024-52114-3⟩
Article dans une revue hal-04453257 v1
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Divergent selection for feed efficiency in pigs altered the duodenum transcriptomic response to feed intake and its DNA methylation profiles

Guillaume Devailly , Katia Feve , Safia Saci , Julien Sarry , Sophie Valière et al.
Physiological Genomics, 2024, ⟨10.1152/physiolgenomics.00123.2023⟩
Article dans une revue hal-04528954 v1
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Cost-efficient assignment panel for ducks. Setup of a cost-efficient assignment panel for duck populations

Hervé Chapuis , Sophie Brard-Fudulea , Azélie Hazard , Alain Vignal , Julie Demars et al.
Peer Community Journal, 2024, 4, pp.e92. ⟨10.24072/pcjournal.475⟩
Article dans une revue hal-04542880 v4
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Epigenetics, genes and the environment: what importance for breeding practices and selection methods in poultry?

Vincent Coustham , Charlotte Andrieux , Chloé Cerutti , Anne Collin , Ingrid David et al.
INRAE Productions Animales, 2023, 36 (4), pp.7384. ⟨10.20870/productions-animales.2023.36.4.7384⟩
Article dans une revue hal-04356432 v1
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GENOME WIDE ASSOCIATION STUDY FOR GROWTH AND FEED EFFICIENCY TRAITS IN RABBITS

Hervé Garreau , Yann Labrune , Hervé Chapuis , Julien Ruesche , Juliette Riquet et al.
World Rabbit Science, 2023, 31 (3), pp.163-169. ⟨10.4995/wrs.2023.18215⟩
Article dans une revue hal-04214840 v1

Genomic Imprinting in the New Omics Era: A Model for Systems-Level Approaches

Jean-Noël Hubert , Julie Demars
Frontiers in Genetics, 2022, 13, 9p. ⟨10.3389/fgene.2022.838534⟩
Article dans une revue hal-03665714 v1
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Rabbit targeted genomic sequences after heterologous hybridization using human exome

Nathalie Iannuccelli , Julien Sarry , Yvon Billon , Patrick Aymard , Virginie Helies et al.
BMC Research Notes, 2022, 15 (1), 3 p. ⟨10.1186/s13104-022-06162-5⟩
Article dans une revue hal-03770192 v1
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From the comparative study of a circRNA originating from an mammalian ATXN2L intron to understanding the genesis of intron lariat-derived circRNAs

Annie Robic , Chloé Cerutti , Julie Demars , Christa Kühn
Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms , 2022, 1865 (4), 15 p. ⟨10.1016/j.bbagrm.2022.194815⟩
Article dans une revue hal-03664418 v2
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A genome-wide epistatic network underlies the molecular architecture of continuous color variation of body extremities

Julie Demars , Yann Labrune , Nathalie Iannuccelli , Alice Deshayes , Sophie Leroux et al.
Genomics, 2022, 114 (3), 13 p. ⟨10.1016/j.ygeno.2022.110361⟩
Article dans une revue hal-03665709 v1

Genome analysis in local breeds: A case study on Olkuska sheep

A. Sobieraj-Kmiecik , W. Drobik-Czwarno , M. Wojciechowska , Julie Demars , Loys Bodin et al.
Livestock Science, 2020, 231, Non paginé. ⟨10.1016/j.livsci.2019.103880⟩
Article dans une revue hal-02624726 v1
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In-Depth Analysis Reveals Production of Circular RNAs from Non-Coding Sequences

Annie Robic , Julie Demars , Christa Kühn
Cells, 2020, 9 (8), pp.1806. ⟨10.3390/cells9081806⟩
Article dans une revue hal-03135529 v1
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Intergenerational Transmission of Characters Through Genetics, Epigenetics, Microbiota, and Learning in Livestock

Ingrid David , Laurianne L. Canario , Sylvie Combes , Julie Demars
Frontiers in Genetics, 2019, 10, Non paginé. ⟨10.3389/fgene.2019.01058⟩
Article dans une revue hal-02620369 v1
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New Insights into the Melanophilin (MLPH) Gene Affecting Coat Color Dilution in Rabbits

Julie Demars , Nathalie Iannuccelli , Valerio Joe Utzeri , Gerard Auvinet , Juliette Riquet et al.
Genes, 2018, 9 (9), pp.1-12. ⟨10.3390/genes9090430⟩
Article dans une revue hal-02621428 v1
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Genome-Wide Identification of the Mutation Underlying Fleece Variation and Discriminating Ancestral Hairy Species from Modern Woolly Sheep

Julie Demars , Margarita Cano , Laurence Drouilhet , Florence Plisson-Petit , Philippe Bardou et al.
Molecular Biology and Evolution, 2017, 34 (7), pp.1722-1729. ⟨10.1093/molbev/msx114⟩
Article dans une revue hal-01608205 v1

Genetic variants within the second intron of the KCNQ1 gene effect CTCF binding and confer a risk of Beckwith-Wiedemann syndrome upon maternal transmission

Julie Demars , Mansur Ennuri Shmela , Abdul Waheed Khan , Kai Syin Lee , Salah Azzi et al.
Journal of Medical Genetics, 2014, 51 (8), pp.502-511. ⟨10.1136/jmedgenet-2014-102368⟩
Article dans une revue hal-02640231 v1
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Metabolic and histochemical characteristics of fat and muscle tissues in homozygous or heterozygous pigs for the body composition QTL located on chromosome 7

Julie Demars , Juliette Riquet , Marie-Pierre Sanchez , Yvon Billon , Jean-François Hocquette et al.
Physiological Genomics, 2007, 30 (3), pp.232-241. ⟨10.1152/physiolgenomics.00270.2006⟩
Article dans une revue hal-02662501 v1

GENOMIC REGIONS ASSOCIATED WITH THE COMPOSITION OF THE RABBIT CAECAL MICROBIOTA

Hervé Garreau , Quentin Le Graverand , Yann Labrune , Patrick Aymard , Hervé Chapuis et al.
13th World Rabbit Congress, World Rabbit Science Association, Oct 2024, Tarragona, Spain
Communication dans un congrès hal-04795894 v1

Feed efficiency correlates with the transcriptomic response to feed intake in the pig duodenum

Guillaume Devailly , Katia Feve , S. Saci , Julien Sarry , Sophie Valière et al.
Book of Abstracts of the 74. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, INRAE, Aug 2023, Lyon, France. pp.232
Communication dans un congrès hal-04197555 v1
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ANALYSE GENOMIQUE DE LA COMPOSITION DU MICROBIOTE CAECAL DU LAPIN

Quentin Le Graverand , Yann Labrune , Patrick Aymard , Hervé Chapuis , Julie Demars et al.
Journées de la Recherche Cunicole, ITAVI; INRAE, Mar 2023, Le Mans (72000), France. pp.146-150
Communication dans un congrès hal-04646187 v1

Genotyping a thousand animals using low coverage sequencing and imputation

Cervin Guyomar , Denis Milan , Christophe Klopp , Cécile Donnadieu , Bertrand Servin et al.
Genotoul biostat bioinfo day, Genotoul, Nov 2023, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-04669286 v1

Epigenetic biomarkers for environmental enrichment and parity in pregnant sows

Mariana Mescouto Lopes , Aurélie Chaulot-Talmon , Anne Aubert-Frambourg , Hélène Kiefer , C. Gerard et al.
74. Annual meeting of the european federation of animal science (EAAP), EAAP, Aug 2023, Lyon, France. pp.233
Communication dans un congrès hal-04197579 v1
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Utilisation de la transmissibilité en sélection, utopie ou réalité?

Ingrid David , Laurianne Canario , Sylvie Combes , Julie Demars , Hervé Garreau et al.
Journées scientifiques du département de génétique animale, INRAE, département GA, 2022, Bordeaaux, France
Communication dans un congrès hal-04574488 v1

Avancées et perspectives ouvertes en épigénétique animale grâce à SeqOccIn.

Frédérique Pitel , Céline Vandecasteele , Julie Demars
Colloque INRAE Genomics 2022, May 2022, Orléans, France
Communication dans un congrès hal-04129124 v1
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Epigenetics as a mediator of genome x environment interactions

Frederique Pitel , Ingrid David , Julie Demars , Sandrine Mignon-Grasteau , Sandrine Lagarrigue et al.
26. World's Poultry Congress (WPC), Aug 2022, Paris, France. pp.199-212
Communication dans un congrès hal-03797557 v1

Targeting the pig imprintome

Jean-Noël Hubert , Nathalie Iannuccelli , Cédric Cabau , Rémy-Félix Serre , Céline Vandecasteele et al.
Advances in Genome Biology and Technology Agriculture (AGBT-Ag), Apr 2022, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-04099166 v1
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L’épigénétique à l’interface entre l’environnement et l'ADN : quelle importance pour les pratiques d’élevage et les méthodes de sélection ?

Vincent Coustham , Charlotte Andrieux , Anne Collin , Ingrid David , Julie Demars et al.
14. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, ITAVI; INRAE; ANSES; WVPA; WPSA; CTCPA, Mar 2022, Tours, France. pp.628-629, ⟨10.1016/j.anscip.2022.05.028⟩
Communication dans un congrès hal-03616157 v1
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The lariat-derived circRNA from ATXN2L: an outstanding circRNA in pigs

Annie Robic , Thomas Faraut , Chloé Cerutti , Julie Demars , Christa Kühn
EMBO | EMBL Symposium: The Non-Coding Genome, Oct 2021, virtual, Germany
Communication dans un congrès hal-03445759 v1

Heterologous hybridization using the human exome - a molecular tool to target and identify major genes

Nathalie Iannuccelli , Cédric Cabau , Julien Sarry , Olivier Bouchez , Yvon Billon et al.
World Rabbit Congress, Nov 2021, Nantes, France
Communication dans un congrès hal-03404641 v1

Deciphering the molecular architecture of the coat colour variability in a European rabbit population

Julie Demars , Yann Labrune , Nathalie Iannuccelli , Patrick Aymard , Florence Benitez et al.
World Rabbit Congress, Nov 2021, Nantes, France
Communication dans un congrès hal-03404632 v1

New perspective on intergenerational transmission of characters

Ingrid David , Amir Aliakbari , Laurianne L. Canario , Sylvie Combes , Julie Demars et al.
EAAP 2020, Dec 2020, Porto, Portugal
Communication dans un congrès hal-03162765 v1

Both Oligogenic Determinism And Epistatic Interactions Account For The Molecular Architecture Of Coat Colour Variability

Julie Demars , Yann Labrune , Nathalie Iannuccelli , Patrick Aymard , Florence Benitez et al.
EMBO | EMBL Symposium: Systems Genetics: From Genomes to Complex Traits, Sep 2019, Heidelberg, Germany
Communication dans un congrès hal-03550450 v1

The analysis of sheep and goat genomes reveals new biological mechanisms explaining the variation of Mendelian and complex phenotypes

Gwenola Tosser-Klopp , Julie Demars , Laurence Drouilhet , Stéphane Fabre , Thomas Faraut et al.
Séminaire mensuel (CRAG), Nov 2018, Barcelone, Spain
Communication dans un congrès hal-02785242 v1
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Phasing haplotypes in rabbit using long reads technology

Julie Demars
Journées Plateforme GetPlage, Nov 2017, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02784960 v1

Comprendre pour contrôler les facteurs génétiques et non génétiques de la transmission des caractères maternels

Ingrid David , Laurianne L. Canario , Julie Demars , Sylvie Combes
17. Journées de la Recherche Cunicole, Nov 2017, Le Mans, France. 205 p
Communication dans un congrès hal-02734511 v1
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EIF2S2 Retroposition into IRF2BP2 Underlies Fleece Variation in Sheep through the Formation of a Long Endogenous Double-Stranded RNA

Julie Demars , Margarita Cano , Laurence Drouilhet , Stéphane Fabre , Bertrand Servin et al.
Plant and Animal Genomes Conference, Jan 2017, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-02785197 v1
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The MLPH expression is decreased in rabbits owning a dilution of coat colour

Julie Demars , Nathalie Iannuccelli , Valerio Joe Utzeri , Luca Fontanesi , Daniel Allain
11. World Rabbit Congress, Jun 2016, Qingdao, China. 417 p
Communication dans un congrès hal-02741723 v1

Major Genes Influencing Prolificacy in Sheep: A Source of Basic Knowledge of Ovarian Function and a Tool for Genetic Improvement

Stéphane Fabre , Julie Demars , Laurence Drouilhet , Camille Mansanet , Gwenola Tosser-Klopp et al.
International Plant & Animal Genome XXIII conference, Jan 2015, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-01603783 v1

Des QTL aux gènes de résistance au portage de salmonelles chez le poulet

Fanny Calenge , Frédéric Lecerf , N. Sellier , P. Velge , P. Fravalo et al.
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau (FR), France
Communication dans un congrès hal-00729117 v1
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TAPS for Multimodal Epigenomic Profiling in Livestock A Comparison with ONT, WGBS, and EM-Seq

Céline Vandecasteele , Julie Demars , Sophie Leroux , Nathalie Iannuccelli , Carole Iampietro et al.
Plant and animal genome conference 32, Jan 2025, San Diego (California), United States. 2025
Poster de conférence hal-04911060 v1
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Combination of capture Methyl-seq technology and molecular tool to highlight imprinted loci

Mathilde Perret , Jean-Noël Hubert , Nathalie Iannuccelli , Juliette Riquet , Julie Demars
Environmental and Agronomical Genomics Symposium, Feb 2024, Toulouse, France
Poster de conférence hal-04608736 v1
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Prioritize Regulating Variants in a Quantitative Trait Locus (QTL)

Noémien Maillard , Juliette Riquet , Katia Feve , Raphaël Mourad , Julie Demars
Journée Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jun 2024, Toulouse, France
Poster de conférence hal-04611835 v1
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Targeting the pig imprintome with EM-seq

Jean-Noël Hubert , Nathalie Iannuccelli , Mathilde Perret , Cédric Cabau , Eva Jacomet et al.
2024 Environnemental and Agronomical Genomics Symposium, Feb 2024, Toulouse, France.
Poster de conférence hal-04668372 v1
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Benchmarking of sequencing technologies for CpG methylation detection: applications to quail and pig

Céline Vandecasteele , Paul Terzian , Joanna Lledo , Rémy-Félix Serre , Jules Sabban et al.
London Calling 2024, May 2024, London, France
Poster de conférence hal-04638952 v1
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Combination of capture Methyl-seq technology and molecular tool to highlight imprinted loci

Mathilde Perret , Jean-Noël Hubert , Nathalie Iannuccelli , Juliette Riquet , Julie Demars
Advances in Genome Biology and Technology - Agricultural, Apr 2024, Phoenix (AZ), United States
Poster de conférence hal-04608739 v1
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Cross-species use of neural networks to improve pig genome annotation -a proof of concept

Noémien Maillard , Juliette Riquet , Katia Feve , Julie Demars , Raphaël Mourad
Environmental and Agronomical Genomics, Feb 2024, Toulouse, France
Poster de conférence hal-04438536 v1
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Genomic imprinting in livestock species -Challenges of long reads sequencing from ONT

Julie Demars , Jean-Noël Hubert , Nathalie Iannuccelli , Sophie Leroux , Céline Vandecasteele et al.
Advances in Genome Biology and Technology (AGBT), Apr 2024, Phoenix (AZ), United States. 2024
Poster de conférence hal-04566188 v1
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Volume reduction and automation of DNAprep libraries for low pass sequencing

Marcuzzo Camille , Cervin Guyomar , Amandine Suin , Adrien Castinel , Carole Iampietro et al.
Assemblée générale France Génomique, Jun 2023, Paris, France
Poster de conférence hal-04590691 v1
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Characterization of the imprinting status of porcine loci , preliminary results

Mathilde Perret , Jean-Noël Hubert , Nathalie Iannuccelli , Juliette Riquet , Julie Demars
Séminaire des doctorants du département de Génétique Animale, May 2023, Sète, France
Poster de conférence hal-04197807 v1
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A bioinformatics pipeline to detect imprinting from methyl-seq trio data

Jean-Noël Hubert , Mathilde Perret , Nathalie Iannuccelli , Eva Jacomet , Cédric Cabau et al.
Genomic Imprinting - from Biology to Disease, Mar 2023, Hinxton, United Kingdom
Poster de conférence hal-04198079 v1

Vers une carte de l'imprintome porcin

Jean-Noël Hubert , Nathalie Iannuccelli , Cédric Cabau , Rémy-Félix Serre , Céline Vandecasteele et al.
Journées Scientifiques du Département de Génétique Animale, Sep 2022, Bordeaux, France
Poster de conférence hal-04099355 v1
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Comment se passer des cages individuelles en sélection expérimentale avicole : exemple du canard

Hervé Chapuis , Julie Demars , Hélène Gilbert , Sophie Brard‐fudulea , Marc Teissier et al.
Journées Scientifiques Département Génétique Animale 2022, 2022, Bordeaux, France
Poster de conférence hal-04163579 v1
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The importance of annotations (reference genome and parent gene) for the study of circRNAs

Annie Robic , Thomas Faraut , Chloé Cerutti , Julie Demars , Christa Kühn
ISAG 2021- virtual conference of the International Society for Animal Genetics, Jul 2021, virtual, South Africa.
Poster de conférence hal-03445792 v1

Les gènes de coloration et leurs interactions, le modèle lapin Himalayan

Julie Demars
Journées Scientifiques du Département Génétique Animale - La Génétique Animale et les Interactions, Oct 2018, Dienné, France. 2018
Poster de conférence hal-02784957 v1

Impact du rationnement alimentaire sur le phénotype Himalayan

Julie Demars
2. Réunion d'Animation épiPHASE, Mar 2016, Saint-Pée-sur-Nivelle, France. 2016
Poster de conférence hal-02792529 v1
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Validation of QTL affecting resistance to nematodes in Sheep identified in a Back-Cross design in a pure breed population

Carole Moreno-Romieux , Philippe P. Jacquiet , Frédéric F. Bouvier , Jacques J. Cortet , Alexandra Blanchard-Letort et al.
10. World Congress of Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Aug 2014, Vancouver, Canada. American Society of Animal Science, 2014, Proceedings 10th World Congress of Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP)
Poster de conférence hal-02741411 v1

Chapitre 5. Empreinte génomique parentale chez les animaux d’élevage

Julie Demars , Catherine Labbé , Frédérique Pitel
Hélène Jammes; Pierre Boudry; Stéphane Maury. Épigénétique. Mécanismes moléculaires, biologie du développement et réponses à l’environnement, Éditions Quae, 2024, Synthèses, 9782759237708. ⟨10.35690/978-2-7592-3770-8⟩
Chapitre d'ouvrage hal-04797295 v1
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Molecular architecture of agronomical traits in sheep

Julie Demars , Laurence Drouilhet , Stéphane Fabre , Gwenola Tosser-Klopp
École thématique. Cours européen pour étudiants et éleveurs « Genetics and genomics in livestock », Beni-Mellal - INRA-M, Morocco. 2020
Cours hal-04803932 v1