Karine Tuphile

– Design des ARN guides par l’utilisation d’interfaces de design dédiées – Vectorisation des ARN guides (clonage par approches combinatoires des technologies Golden Gate et Gateway®) -Clonage moléculaire par approche de la technologie Gibson Assembly® amélioré – Transgénèse végétale et criblage des évènements d’édition (PRIMA-CE) – Analyse des évènements d’édition par l’utilisation d’outils bio-informatiques dédiés
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Documents

Présentation

Service CRISPR du Laboratoire de Biogénèse membranaire

Le service d’édition du génome s’inscrit dans l’accompagnement des équipes de recherche du laboratoire et contribue au développement d’approches de génétique inverse permettant l’édition multigénique par multiplexage d’ARN guides et la régulation fine des évènements d’édition par l’utilisation de systèmes inductibles ou constitutifs, ubiquitaires ou types cellulaires spécifiques.

Focalisé sur la plante modèle Arabidopsis thaliana, le service propose une activité de conseil, de formation ou de prise en charge complète des projets d’édition en déployant la technologie CRISPR-Cas9 au service de la caractérisation de gènes d’intérêt.

Domaines de recherche

Sciences du Vivant [q-bio]

Publications

Publications

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Phosphoinositides containing stearic acid are required for interaction between Rho GTPases and the exocyst to control the late steps of polarized exocytosis

Patricia Laquel , Eric Testet , Karine Tuphile , Christophe Cullin , Laetitia Fouillen et al.
Traffic, 2022, 23 (2), pp.120-136. ⟨10.1111/tra.12829⟩
Article dans une revue hal-03563439 v1
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Plastidic Δ6 Fatty-Acid Desaturases with Distinctive Substrate Specificity Regulate the Pool of C18-PUFAs in the Ancestral Picoalga Ostreococcus tauri

Charlotte Degraeve-Guilbault , Rodrigo Enrique Gomez , Cécile Lemoigne , Nattiwong Pankansem , Soizic Morin et al.
Plant Physiology, 2020, 184 (1), pp.82-96. ⟨10.1104/pp.20.00281⟩
Article dans une revue hal-02973890 v1
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Arabidopsis LDIP protein locates at a confined area within the lipid droplet surface and favors lipid droplet formation

Denis Coulon , Lysiane Brocard , Karine Tuphile , Claire Bréhélin
Article dans une revue hal-03022855 v1
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Proteomic Analysis of Lipid Droplets from Arabidopsis Aging Leaves Brings New Insight into Their Biogenesis and Functions

Lysiane Brocard , Françoise Immel , Denis Coulon , Nicolas Esnay , Karine Tuphile et al.
Frontiers in Plant Science, 2017, 8, ⟨10.3389/fpls.2017.00894⟩
Article dans une revue hal-02346772 v1

Requirement of Phosphoinositides Containing Stearic Acid To Control Cell Polarity

François Doignon , Patricia Laquel , Eric Testet , Karine Tuphile , Laetitia Fouillen et al.
Molecular and Cellular Biology, 2016, 36 (5), pp.765-80. ⟨10.1128/MCB.00843-15⟩
Article dans une revue hal-03560139 v1

Caspase-dependent Proteolysis of Human Ribonucleotide Reductase Small Subunits R2 and p53R2 during Apoptosis

Ali Tebbi , Olivier Guittet , Karine Tuphile , Aimeric Cabrié , Michel Lepoivre
Journal of Biological Chemistry, 2015, 290 (22), pp.14077--14090. ⟨10.1074/jbc.M115.649640⟩
Article dans une revue hal-02400368 v1

Protein kinase Darkener of apricot and its substrate EF1γ regulate organelle transport along microtubules

Anna Serpinskaya , Karine Tuphile , Leonard Rabinow , Vladimir Gelfand
Journal of Cell Science, 2013, ⟨10.1242/jcs.123885⟩
Article dans une revue hal-05266586 v1

Cyclodipeptide synthases are a family of tRNA-dependent peptide bond–forming enzymes

Muriel Gondry , Ludovic Sauguet , Pascal Belin , Robert Thai , Rachel Amouroux et al.
Nature Chemical Biology, 2009, 5 (6), pp.414-420. ⟨10.1038/nchembio.175⟩
Article dans une revue cea-02000100 v1

Impact of Aeration and Heme-Activated Respiration on Lactococcus lactis Gene Expression: Identification of a Heme-Responsive Operon

Martin Bastian Pedersen , Christel Garrigues , Karine Tuphile , Célia Brun , Karin Vido et al.
Journal of Bacteriology, 2008, 190 (14), pp.4903-4911. ⟨10.1128/jb.00447-08⟩
Article dans une revue hal-05266581 v1

Organization of the biosynthetic gene cluster for the macrolide antibiotic spiramycin in Streptomyces ambofaciens.

Fatma Karray , Emmanuelle Darbon , Nathalie Oestreicher , Hélène Dominguez , Karine Tuphile et al.
Microbiology, 2007, 153 (Pt 12), pp.4111-22. ⟨10.1099/mic.0.2007/009746-0⟩
Article dans une revue hal-00194476 v1

Excisable Cassettes: New Tools for Functional Analysis of Streptomyces Genomes

Alain Raynal , Fatma Karray , Karine Tuphile , Emmanuelle Darbon-Rongère , Jean-Luc Pernodet
Applied and Environmental Microbiology, 2006, 72 (7), pp.4839-4844. ⟨10.1128/AEM.00167-06⟩
Article dans une revue hal-05266553 v1

Phylogenetic Analysis of Polyketide Synthase I Domains from Soil Metagenomic Libraries Allows Selection of Promising Clones

Aurélien Ginolhac , Cyrille Jarrin , Benjamin Gillet , Patrick Robe , Timothy Vogel et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2004, 70 (9), pp.5522-5527. ⟨10.1128/AEM.70.9.5522-5527.2004⟩
Article dans une revue hal-05266576 v1

Structure of the chromosomal insertion site for pSAM2: functional analysis in Escherichia coli

Alain Raynal , Karine Tuphile , Claude Gerbaud , Tatjana Luther , Michel Guérineau et al.
Molecular Microbiology, 2002, 28 (2), pp.333-342. ⟨10.1046/j.1365-2958.1998.00799.x⟩
Article dans une revue hal-05266573 v1

Characterization of the attP site of the integrative element pSAM2 from Streptomyces ambofaciens

Alain Raynal , Annick Friedmann , Karine Tuphile , Michel Guerineau , Jean-Luc Pernodet
Microbiology, 2002, 148 (1), pp.61-67. ⟨10.1099/00221287-148-1-61⟩
Article dans une revue hal-05266589 v1