CV HAL - Pascal Le Bourgeois

Redefining the bacteriophage mv4 site‐specific recombination system and the sequence specificity of its attB and core‐ attP sites

Kevin Debatisse , Pierre Lopez , Maryse Poli , Philippe Rousseau , Manuel Campos et al.

Molecular Microbiology, 2024, 121 (6), pp.1200-1216. ⟨10.1111/mmi.15275⟩

Article dans une revue hal-04666060v1

From genome to phenotype: An integrative approach to evaluate the biodiversity of Lactococcus lactis

Valérie Laroute , Hélène Tormo , Christel Couderc , Muriel Mercier-Bonin , Pascal Le Bourgeois et al.

Microorganisms, 2017, 5 (2), 17 p. ⟨10.3390/microorganisms5020027⟩

Article dans une revue hal-01605117v1

Complete Genome Sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis A12, a Strain Isolated from Wheat Sourdough

Maeva Guellerin , Delphine Passerini , Catherine Fontagné-Faucher , Hervé Robert , Valérie Gabriel et al.

Genome Announcements, 2016, 4 (5), pp.2 P. ⟨10.1128/genomeA.00692-16⟩

Article dans une revue hal-01578250v1

Functional characterization of a gene locus from an uncultured gut Bacteroides conferring xylo-oligosaccharides utilization to Escherichia coli

Alexandra Tauzin , Elisabeth Laville , Yao Xiao , Sébastien Nouaille , Pascal Le Bourgeois et al.

Molecular Microbiology, 2016, 102 (4), pp.579 - 592. ⟨10.1111/mmi.13480⟩

Article dans une revue hal-01886420v1

PFGE protocols for Lactococcus species

Pascal Le Bourgeois , Delphine Passerini , Michèle Coddeville , Maéva Guellerin , Marie-Line Daveran-Mingot et al.

Methods in Molecular Biology, 2015, Methods in Molecular Biology, 1301, pp.213-224. ⟨10.1007/978-1-4939-2599-5_17⟩

Article dans une revue hal-04690794v1

Genome Sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis LD61.

Hélène Falentin , Delphine Naquin , Valentin Loux , Frédérique Barloy-Hubler , Pascal Loubière et al.

Genome Announcements, 2014, 2 (1), pp.1. ⟨10.1128/genomeA.01176-13⟩

Article dans une revue hal-01019560v1

Bacteriophage mv4 Site-Specific Recombination: the Central Role of the P2 mv4 Int-Binding Site

Michèle Coddeville , Jean-François Spinella , Pauline Cassart , Guillaume Girault , Marie-Line Daveran-Mingot et al.

Journal of Virology, 2014, 88 (3), pp.1839-1842. ⟨10.1128/JVI.02735-13⟩

Article dans une revue hal-04690801v1

Bacteriophage mv4 site-specific recombination: the central role of the P2 mv4Int-binding site.

M. Coddeville , Spinella J. , Cassart P. , Girault G. , M.L. Daveran-Mingot et al.

Journal of Virology, 2014, 88, pp.1839-1842

Article dans une revue hal-01117436v1

Genome Sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis LD61.

Hélène Falentin , Naquin D. , Loux V. , Barloy-Hubler F. , Loubière P. et al.

Genome Announcements, 2014, pp.e01176-13

Article dans une revue hal-01117613v1

The Carbohydrate Metabolism Signature of Lactococcus lactis Strain A12 Reveals Its Sourdough Ecosystem Origin

Delphine Passerini , Michele Coddeville , Pascal Le Bourgeois , Pascal Loubière , Paul Ritzenthaler et al.

Applied and Environmental Microbiology, 2013, 79 (19), pp.5844 - 5852. ⟨10.1128/AEM.01560-13⟩

Article dans une revue hal-01268295v1

Genotypic and Phenotypic Analysis of Dairy Lactococcus lactis Biodiversity in Milk: Volatile Organic Compounds as Discriminating Markers

Amandine Dhaisne , Maeva Guellerin , Valérie Laroute , Sandrine Laguerre-Gheusi , Muriel Bousquet et al.

Applied and Environmental Microbiology, 2013, 79 (15), pp.4643 - 4652. ⟨10.1128/AEM.01018-13⟩

Article dans une revue hal-01268081v1

New insights into Lactococcus lactis diacetyl- and acetoin-producing strains isolated from diverse origins

Delphine Passerini , Valérie Laroute , Michele Coddeville , Pascal Le Bourgeois , Pascal Loubière et al.

International Journal of Food Microbiology, 2013, 160 (3), pp.329 - 336. ⟨10.1016/j.iffoodmicro.2012.10.023⟩

Article dans une revue hal-01268218v1

The Carbohydrate Metabolism Signature of Lactococcus lactis Strain A12 Reveals Its Sourdough Ecosystem Origin

Delphine Passerini , Michèle Coddeville , Pascal Le Bourgeois , Pascal Loubière , Paul Ritzenthaler et al.

Applied and Environmental Microbiology, 2013, 79 (19), pp.5844-5852. ⟨10.1128/AEM.01560-13⟩

Article dans une revue hal-04690804v1

Co-evolution of segregation guide DNA motifs and the FtsK translocase in bacteria: identification of the atypical Lactococcus lactis KOPS mot

S. Nolivos , F. Touzain , C. Pages , M. Coddeville , P. Philippe Rousseau et al.

Nucleic Acids Research, 2012, 40, pp.5535-5545

Article dans une revue hal-00787677v1

Co-evolution of segregation guide DNA motifs and the FtsK translocase in bacteria: identification of the atypical Lactococcus lactis KOPS motif

Sophie Nolivos , Fabrice Touzain , Carine Pages , Michele Coddeville , Philippe Rousseau et al.

Nucleic Acids Research, 2012, 40 (12), pp.5535 - 5545. ⟨10.1093/nar/gks171⟩

Article dans une revue hal-01003421v1

Genes but not genomes reveal bacterial domestication of lactococcus lactis.

D. Passerini , C. Beltramo , M. Coddeville , Y. Quentin , P. Ritzenthaler et al.

PLoS ONE, 2010, 5 (12), pp.e15306. ⟨10.1371/journal.pone.0015306⟩

Article dans une revue hal-00557926v1

Are two better than one? Analysis of an FtsK/Xer recombination system that uses a single recombinase.

S. Nolivos , C. Pages , P. Philippe Rousseau , P. Lebourgeois , F. Cornet

Nucleic Acids Research, 2010, 38 ((19)), pp.6477-89

Article dans une revue hal-00557893v1

The Unconventional Xer Recombination Machinery of Streptococci/Lactococci.

P. Le Bourgeois , M. Bugarel , N. Campo , Daveran-Mingot M.L. , J. Labonte et al.

PLoS Genetics, 2007, 3, pp.e117

Article dans une revue hal-00180535v1

Cartographie génomique de quelques souches de laboratoire de Lactococcus lactis

P Le Bourgeois , M Lautier , M Mata , P Ritzenthaler

Le Lait, 1993, 73 (2), pp.163-174

Article dans une revue hal-00929324v1

The phage mv4 recombination system: towards a reprogrammable tool for bacterial genome engineering ?

Kevin Debatisse , Muriel Cocaign‐Bousquet , Pascal Le Bourgeois

Biosynsys 2022, Sep 2022, Paris, France

Communication dans un congrès hal-04752633v1

Reprogrammation de la spécificité de recombinaison de l'intégrase d'un bactériophage : un nouvel outil pour l'ingénierie des génomes ?

Kevin Debatisse , Muriel Cocaign‐Bousquet , Pascal Le Bourgeois

Microbioccitanie, Jul 2022, Toulouse, France

Communication dans un congrès hal-04752631v1

Caractérisation d’un site d’intégration de bactériophage tempéré par utilisation de banques randomisées et séquençage NGS

Kevin Debatisse , Muriel Cocaign‐Bousquet , Pascal Le Bourgeois

23e colloque du Club des Bactéries Lactiques, Jun 2022, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-04752623v1

Le système de recombinaison phagique mv4Int/attP : vers un outil reprogrammable d’ingénierie des génomes bactériens ?

Kevin Debatisse , Muriel Cocaign‐Bousquet , Pascal Le Bourgeois

17e conférence de la SFM, Société Française de Microbiologie, Oct 2022, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-04752638v1

Prediction of KOPS motifs involved in segregating of bacterial chromosomes in Lactocoques / Streptocoques

Fabrice Touzain , Sophie Nolivos , Sophie Schbath , Meriem El Karoui , François Cornet et al.

18th annual international conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), Jul 2010, Boston, United States. pp.1

Communication dans un congrès hal-01204256v1

Transcriptional and Functional analysis of polysaccharide utilization loci reveals novel mechanisms of carbohydrate foraging by uncultivated gut bacteria

A. Tauzin , E. Laville , S. Heux , Sébastien Nouaille , P. Le Bourgeois et al.

Carbohydrate Bioengineering Meeting, May 2015, Espoo, Finland

Poster de conférence hal-04204504v1

Chromosome Dimer Resolution by Site-Specific Recombination.

P. Le Bourgeois , F. Cornet

Brenner's Encyclopedia of Genetics, Stanley Maloy and Kelly Hughes - Academic Press, pp.551-554, 2013

Chapitre d'ouvrage hal-00947563v1

Physical maps of L. lactis subsp. lactis IL1403 and L. lactis subsp. cremoris MG1363 chromosomes

Pascal Le Bourgeois , Marie-Line Daveran-Mingot , Paul Ritzenthaler

F.J. de Bruijn; J.R. Lupski; G.M. Weinstock. Bacterial Genomes: Physical Structure and Analysis, Chapman & Hall, pp.669-672, 1998, 978-1461563709

Chapitre d'ouvrage hal-04754249v1

Combined physical and genetic maps of Lactococcus lactis subsp. lactis IL1403 and Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 chromosomes

Pascal Le Bourgeois , Martine Lautier , Loïc van den Berghe , Guillaume Serin , Hafed Nedjari et al.

Dev. Biol. Stand, 85, pp.597-603, 1995

Chapitre d'ouvrage hal-04754240v1

Méthodes d'identification des bactéries lactiques

M.C. Curk , J.M. Boeufgras , Bernard Decaris , F. Gavani , K. Kersters et al.

Bactéries lactiques. Aspects fondamentaux et technologiques, Lorica pp. 141-168, 1994

Chapitre d'ouvrage hal-01667240v1

Recombinaison régiospécifique dérivée d'attp mv4 et son utilisation pour l'intégration d'une séquence d'intérêt

Pascal Le Bourgeois , Kevin Debatisse , Muriel Cocaign‐Bousquet

France, Patent n° : WO2023237453A1. 2023

Brevet hal-04752601v1

Evolution des génomes bactériens : application à <i>Lactococcus lactis</i>

Pascal Le Bourgeois

Sciences du Vivant [q-bio]. Université Toulouse 3 - Paul Sabatier, 2011

HDR tel-04276882v1

Pascal Le Bourgeois

Domaines de recherche

Publications

Publications

Redefining the bacteriophage mv4 site‐specific recombination system and the sequence specificity of its attB and core‐ attP sites

From genome to phenotype: An integrative approach to evaluate the biodiversity of Lactococcus lactis

Complete Genome Sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis A12, a Strain Isolated from Wheat Sourdough

Functional characterization of a gene locus from an uncultured gut Bacteroides conferring xylo-oligosaccharides utilization to Escherichia coli

PFGE protocols for Lactococcus species

Genome Sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis LD61.

Bacteriophage mv4 Site-Specific Recombination: the Central Role of the P2 mv4 Int-Binding Site

Bacteriophage mv4 site-specific recombination: the central role of the P2 mv4Int-binding site.

Genome Sequence of Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis LD61.

The Carbohydrate Metabolism Signature of Lactococcus lactis Strain A12 Reveals Its Sourdough Ecosystem Origin

Genotypic and Phenotypic Analysis of Dairy Lactococcus lactis Biodiversity in Milk: Volatile Organic Compounds as Discriminating Markers

New insights into Lactococcus lactis diacetyl- and acetoin-producing strains isolated from diverse origins

The Carbohydrate Metabolism Signature of Lactococcus lactis Strain A12 Reveals Its Sourdough Ecosystem Origin

Co-evolution of segregation guide DNA motifs and the FtsK translocase in bacteria: identification of the atypical Lactococcus lactis KOPS mot

Co-evolution of segregation guide DNA motifs and the FtsK translocase in bacteria: identification of the atypical Lactococcus lactis KOPS motif

Genes but not genomes reveal bacterial domestication of lactococcus lactis.

Are two better than one? Analysis of an FtsK/Xer recombination system that uses a single recombinase.

The Unconventional Xer Recombination Machinery of Streptococci/Lactococci.

Cartographie génomique de quelques souches de laboratoire de Lactococcus lactis

The phage mv4 recombination system: towards a reprogrammable tool for bacterial genome engineering ?

Reprogrammation de la spécificité de recombinaison de l'intégrase d'un bactériophage : un nouvel outil pour l'ingénierie des génomes ?

Caractérisation d’un site d’intégration de bactériophage tempéré par utilisation de banques randomisées et séquençage NGS

Le système de recombinaison phagique mv4Int/attP : vers un outil reprogrammable d’ingénierie des génomes bactériens ?

Prediction of KOPS motifs involved in segregating of bacterial chromosomes in Lactocoques / Streptocoques

Transcriptional and Functional analysis of polysaccharide utilization loci reveals novel mechanisms of carbohydrate foraging by uncultivated gut bacteria

Chromosome Dimer Resolution by Site-Specific Recombination.

Physical maps of L. lactis subsp. lactis IL1403 and L. lactis subsp. cremoris MG1363 chromosomes

Combined physical and genetic maps of Lactococcus lactis subsp. lactis IL1403 and Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363 chromosomes

Méthodes d'identification des bactéries lactiques

Recombinaison régiospécifique dérivée d'attp mv4 et son utilisation pour l'intégration d'une séquence d'intérêt

Evolution des génomes bactériens : application à <i>Lactococcus lactis</i>