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LJ
Luc Jouneau
Analyses bio-informatiques et statistiques de données haut débit
240
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Current affiliations
Researcher identifiers
luc-jouneau
-
0000-0002-5094-7302
- IdRef : 253132681
Presentation
**Ingénieur de Recherches INRA - Centre de Jouy-en-Josas**
----------------------------------------------------------
**Unités :**
- **Biologie de la Reproduction, Environnement, Epigénétique et Développement (BREED)**
- **Virologie et Immunologie Moléculaires (VIM)**
**Données analysées :**
- Transcriptome : RNA-Seq, microarray
- Méthylome : RRBS, WGBS
- ChIP-Seq : Modification des marques d'histone, Liaison des facteurs de transcription
**Types d'analyses statistiques :**
- Analyse descriptive : Classification hiérarchique, Analyse en composantes principales, Analyse en composantes indépendantes
- Analyse différentielle : limma, DESeq2, EdgeR
- Intégration de données : mixOmics
**Domaines biologiques étudiés :**
- Biologie du développement et de la reproduction
- Immunologie, Vaccinologie
Publications
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The Transcription Factor DMRT1 Regulates Germ Cell Differentiation and Meiosis in the Rabbit Fetal Ovary2nd European Symposium on Sex Determination in Vertebrates, Oct 2022, Presqu'île de Giens, France
Conference papers
hal-03799156v1
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Les cellules souches germinales et leur épigénétique chez l'embryon de pouletJournée d'animation scientifique Stem PHASE 2022, Jun 2022, Rennes, France
Conference papers
hal-03808130v1
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Effets d’un régime maternel hypergras sur le transcriptome ovocytaire et embryonnaireSociété Francophone du Diabète, May 2022, Nice, France
Conference papers
hal-03808248v1
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DMRT1 is Required For Sex Determination in Rabbits2nd European Symposium on Sex Determination in Vertebrates, Oct 2022, Presqu'île de Giens, France
Conference papers
hal-03798961v1
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Effects of F0 maternal diesel engine exhaust exposure during gestation on F1 and F2 offspring phenotypeESRI, Mar 2022, Paris, France
Conference papers
hal-03643599v1
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Nursing in the periconceptional period alters placental gene expression and subsequent foal growth18th European Placenta Group IFPA meeting, European Placenta Group, Nov 2022, Jouy en Josas, France
Conference papers
hal-03903205v1
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A Journey Through Ovarian Cells Differenciation in Rabbits: From Genetic to Epigenetic mechanisms.The XXIX International Symposium Molecular and Physiological Aspects of Regulatory Processes, Oct 2022, Cracovie, Poland
Conference papers
hal-03799180v1
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Effect of sex on gene expression in equine blastocysts.10th International Symposium on Equine Embryo Transfer and technology, University of Pisa, Jun 2022, Pise, Italy
Conference papers
hal-03716812v1
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Identification de régions du génome et de gènes candidats associés au niveau de réponse immune innée de veaux Holstein26èmes rencontres recherche ruminants, Idele-Inrae, Dec 2022, Paris, France. pp.187-190
Conference papers
hal-04033238v1
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Impact d’un environnement diabétique sur le développement embryonnaire précoceSociété Francophone du Diabète, Mar 2021, Strasbourg, France
Conference papers
hal-03808066v1
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Dynamique de l’épigénome des cellules germinales femelles lors de l’initiation de la méiose dans l’ovaire fœtal de lapin : Analyse des modifications post-traductionnelles des histones par CUT&RUNEpiPHASE 6ème journée d'animation scientifique autour de l'épigénétique, Jun 2021, Lyon, France
Conference papers
hal-03284634v1
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142 Nulliparity alters gene expression in inner cell mass and trophoblast of equine blastocysts in old mares47TH ANNUAL CONFERENCE OF THE IETS, Jan 2021, online, United States. pp.179, ⟨10.1071/RDv33n2Ab142⟩
Conference papers
hal-03153864v1
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APPRENTISSAGE AUTOMATIQUE ET EPIGENETIQUE : PREDICTION DE LA FERTILITE DES TAUREAUX A PARTIR DU METHYLOME SPERMATIQUEEpiPHASE 6ème journée d'animation scientifique autour de l'épigénétique, 2021, Lyon, France
Conference papers
hal-03364090v1
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Sources de variation de la méthylation de l'ADN chez la truite arc-en-ciel : effets combinés de la température et du patrimoine génétique6ème journée d'animation scientifique autour de l'épigénétique (épiPHASE), Jun 2021, Zoom, France. pp.1031-1052, ⟨10.1080/15592294.2020.1834924⟩
Conference papers
hal-03779185v1
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Caractérisation des trajectoires de différenciation des cellules germinales au cours de la différenciation de l'ovaire fœtal chez le lapinEpiPHASE 6ème journée d'animation scientifique autour de l'épigénétique, Jun 2021, Lyon, France
Conference papers
hal-03284642v1
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Exposition maternelle aux nanoparticules métalliques (Au-pvp, Ag, CeO2) par instillation: effets sur la fonction placentaire et le phénotype fœtal.SF-DOHaD, Nov 2021, Jouy-en-Josas, France
Conference papers
hal-03483311v1
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Effets de l'exposition aux nanoparticules d'or par inhalation sur la fonction placentaire et le phénotype de la descendanceGFP-Groupe de la Francophonie Placentaire, Sep 2021, Nantes, France
Conference papers
hal-03341279v1
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Impact d’un environnement (pré)-diabétique sur le développement embryonnaire précoceSF-DOHAD, Nov 2021, Jouy-en-Josas, France
Conference papers
hal-03808220v1
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Epigenetic programming of the rabbit preimplantation embryo in a diabetic contextDomestic Animal DOHaD and Epigenetics meeting, Oct 2021, Quebec, Canada
Conference papers
hal-03808207v1
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Prediction of bull fertility based on the sperm methylomeEAAP Annual Meeting 2021, 2021, Davos, Switzerland
Conference papers
hal-03364124v1
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Topaz1 suppression disrupts the expression of testicular long non-coding RNAs during murine spermatogenesis21st European Testis Workshop, May 2021, Virtual edition, Spain
Conference papers
hal-03298411v1
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Contributions maternelles et zygotiques à la reprogrammation des enhancers chez les embryons bovins pré-implantoiresEpiPHASE 6ème journée d'animation scientifique autour de l'épigénétique, Jun 2021, Lyon, France
Conference papers
hal-03284649v1
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IMPACT OF TEMPERATURE REGIME DURING EMBRYONIC DEVELOPMENT ON GENOMEWIDE PATTERNS OF DNA METHYLATION IN LIVER SAMPLES OF JUVENILE RAINBOW TROUTAquaculture Europe 2021, Oct 2021, Funchal (Madeira), Portugal
Conference papers
hal-03778951v1
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Mares’ age affects embryo ICM and trophoblast RNA-seq transcriptome at about D8International Symposium on Equine Embryo Transfer, Jul 2020, Pisa, Italy. pp.103031, ⟨10.1016/j.jevs.2020.103031⟩
Conference papers
hal-03029288v1
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Proteomic, metabolomic and fatty acid composition in lactating and non-lactating mares’ uterine fluids46th IETS conference, Jan 2020, New York, United States. ⟨10.1071/RDv32n2abs⟩
Conference papers
hal-02454910v1
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Genetic and non-genetic factors determine DNA methylation patterns in bull sperm70. Annual meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), European Federation of Animal Science (EAAP). INT., Aug 2019, Gant, Belgium. 116p
Conference papers
hal-02736384v1
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Dynamic CpG methylation delineates subregions within super-enhancers selectively decommissioned at the exit from naïve pluripotency3rd Annual Meeting, French Society for Stem Cell Research. Corbeil-Essonne, FRA., Nov 2019, Lyon, France
Conference papers
hal-02460141v1
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Effect of maternal obesity and preconceptional weight loss on foeto-placental growth and offspring health in mice: expression of epigenetic modifiers at the interface with metabolismEpigenetic Inheritance Symposium 2019, University of Zurich [Zurich] (UZH). CHE., Aug 2019, Zurich, Switzerland
Conference papers
hal-02291473v1
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Effets de l’exposition maternelle aux nanoparticules d’or par ingestion, pendant la gestation, sur le développement foeto-placentaire et la fonction placentaire, dans un modèle lapin.7. Rencontre du Groupe de la Francophonie Placentaire 2019, Groupe de la francophonie Placentaire (GfP). FRA., Mar 2019, Paris, France. 36 p
Conference papers
hal-02734084v1
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Automatisation de la préparation de librairies RRBS : un recul de 2 ans sur 388 librairies et 2 espèces5. Journée d'Animation Scientifique du réseau épiPhase, Jun 2019, Toulouse, France. 35 p
Conference papers
hal-02734801v1
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Effects of maternal au-np exposure by inhalation on foeto-placental development and placental function, in a rabbit modelIPTC, Sep 2019, Salzburg, Austria
Conference papers
hal-02733978v1
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Effects of aging on epigenetics of immune cells in dairy cattle70. Annual meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), European Federation of Animal Science (EAAP). INT., Aug 2019, Gant, Belgium. 116p
Conference papers
hal-02734929v1
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|
Le statut métabolique maternal préconceptionnel influence le métabolisme hépatique des descendants mâles4. Congrès de la SF-Dohad, Société Francophone-DOHaD. FRA., Nov 2018, Grenoble, France. pp.120
Conference papers
hal-02736388v1
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|
Bull sperm sncRNAs: A new source for potential fertility biomarkers?International Bull Fertility Conference, British Society of Animal Science (BSAS). GBR., May 2018, Westport, Ireland
Conference papers
hal-02734297v1
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A descriptive analysis of bull sperm methylome using reduced representation bisulphite sequencing (RRBS).International Bull Fertility Conference, British Society of Animal Science (BSAS). GBR., May 2018, Westport, Ireland
Conference papers
hal-02736565v1
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Big data pour les données épigénétiques: illustration par des données pan-génomiques de méthylation de l’ADNColloque Adebiotech, EPIGEN, L'épigénétique dans la réponse du vivant aux facteurs environnementaux, Adebiotech. FRA., Mar 2018, Romainville, France. pp.48
Conference papers
hal-02737135v1
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Placental function at term is altered in broodmares fed with cereals from mid gestationIETS, International Embryo Transfer Society (IETS). USA., Jan 2018, Bangkok, Thailand. pp.250, ⟨10.1071/RDv30n1Ab65⟩
Conference papers
hal-02734074v1
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Le "patrimoine épigénétique" des spermatozoïdes bovins : variations physiologiques et pathologiques du méthylome spermatique4. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, May 2018, Nouzilly, France
Conference papers
hal-02734129v1
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Aged endometrium displays perturbations of inflammation-related molecular pathways compared with fertile endometrium in the bovine speciesFertility 2018, The Association of clinical Embryologists (ACE), British Fertility Society (BFS) and Society for Reproduction and Fertility (SRF)., Jan 2018, Liverpool, United Kingdom. pp.124
Conference papers
hal-02736515v1
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Analyses des conséquences du vieillissement sur la physiologie de l’endomètre à l’aide d’un modèle bovin de génome nucléaire fixéJournées d'Animation Scientifique du Département PHASE-INRA, Apr 2018, Rennes, France
Conference papers
hal-02733987v1
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Effets de l’exposition maternelle aux nanoparticules d’or par ingestion pendant la gestation, sur le développement foeto-placentaire et la fonction placentaire, dans un modèle lapin4. Congrès de la SF-Dohad, Société Francophone-DOHaD. FRA., Nov 2018, Grenoble, France. pp.120
Conference papers
hal-02734001v1
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Les petits ARN non codants du spermatozoïde bovin, de potentiels biomarqueurs de la fertilité mâle ?3. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, May 2017, Jouy-en-Josas, France. 1p
Conference papers
hal-01608764v1
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Signatures épigénétiques associées à l’état physiologique, nutritionnel et pathologique chez la vache laitière en postpartum3. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, May 2017, Jouy-en-Josas, France. 1 p
Conference papers
hal-01605492v1
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Maternal exposure to diluted diesel engine exhaust alters placental function of the first and second generation in rabbit model35. Congrès de la Société Française de Toxicologie Génétique "Conséquences pour l'homme et l'environnement des effets génotoxiques et épigénétiques transgénérationnels", Société Française de Toxicologie Génétique. FRA., Oct 2017, Marseille, France
Conference papers
hal-02735196v1
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RRBS-toolkit3. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, May 2017, Jouy-en-Josas, France. 1 p
Conference papers
hal-01604387v1
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In vitro exposure to environmental relevant dose of bisphenol A does not influence the rabbit blastocyst transcriptome33.Annual Meeting of the European Society of Human Reproduction (ESHRE), European Society of Human Reproduction and Embryology (ESHRE). BEL., Jul 2017, Genève, Switzerland. pp.548
Conference papers
hal-02735241v1
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Effects of preconceptional maternal weight trajectories on offspring health3. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, May 2017, Jouy-en-Josas, France. 1 p
Conference papers
hal-01605219v1
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Identification de nouveaux biomarqueurs de la fertilité mâle dans le méthylome de la semence bovine: une analyse par RRBS3. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, May 2017, Jouy-en-Josas, France. 1 p
Conference papers
hal-01605221v1
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Une analyse multi-échelle révèle l’hypométhylation massive, tissu-spécifique et espèce-spécifique de l’ADN spermatique bovin3. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, May 2017, Jouy-en-Josas, France. 1 p
Conference papers
hal-01605215v1
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Maternal obesity and preconceptional weight loss: high sensitivity of epigenetic regulators gene expression in relation to fetal growth and long-lasting effect in mice3. congrès de la SF-DOHaD, Société Francophone-DOHaD. FRA., Dec 2016, Paris, France. 84 p
Conference papers
hal-02741277v1
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Reproductive effects of gestational exposure to diesel exhaust in a rabbit model18. International Congress on Animal Reproduction (ICAR), International Organisation on Animal Reproduction. FRA., Jun 2016, Tours, France. 676 p
Conference papers
hal-02740895v1
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Disparate developmental patterns of immune responses to bacterial and viral infections in fish2. International Conférence of Fish and Shellfish Immunology, Jun 2016, Portland, Maine, United States. pp.92
Conference papers
hal-02742427v1
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Mémoire épigénétique des trajectoires pondérales maternelles préconceptionnelles au cours du développement chez la souris2. Réunion d'Animation épiPHASE, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Mar 2016, Saint-Pée-sur-Nivelle, France
Conference papers
hal-02797201v1
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Reproductive effects of gestational exposure to diesel exhaust in a rabbit model3. congrès de la SF-DOHaD, Société Francophone pour la Recherche et l'Education sur les Origines Développementales, Environnementales et Epigénétiques de la Santé et des Maladies (SF-DOHAD). FRA., Dec 2016, Paris, France. 84 p
Conference papers
hal-02743432v1
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Bull spermatozoa methylation landscape displays breed-specific features revealed by RRBS analysisLivestock Genomics Meeting 2016, European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI). GBR., Sep 2016, Cambridge, United Kingdom. 45 Diapositives
Conference papers
hal-02797604v1
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A new bioinformatics pipeline for livestock RRBS analysisLivestock Genomics Meeting 2016, European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI). GBR., Sep 2016, Cambridge, United Kingdom. 1 p
Conference papers
hal-01603594v1
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An aberrant age of liver DNA methylation is associated with cloning-induced pathologiesConférence Jacques Monod, DNA methylation and demethylation, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS). FRA., Nov 2015, Roscoff, France
Conference papers
hal-02797595v1
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Genetic cascade of sex determination in goats7. International Symposium on the Biology Vertebrate Sex Determination, The Endocrine Society. USA., Apr 2015, Kona, Hawaii, United States
Conference papers
hal-02741278v1
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Comparison of transcriptome profiles from endometrial caruncles and peripheral blood mononuclear cells reveal common and tissue-specific biological processes regulated at implantation in sheep41. Annual Conference IETS, International Embryo Transfer Society (IETS). USA., Jan 2015, Versailles, France. ⟨10.1071/RDv27n1Ab118⟩
Conference papers
hal-02743865v1
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Epigenetics of bovine semen: tools to analyse DNA methylation66. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), European Association for Animal Production (EAAP). ITA., Aug 2015, Varsovie, Poland
Conference papers
hal-02741190v1
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Conséquences tardives de perturbations épigénétiques précoces : exemple des clones bovins1. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UAR Département Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (0558)., Jun 2015, Paris, France
Conference papers
hal-01197642v1
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Genome-wide analysis of DNA methylation in clones and nonclones of two different breeds: Holstein and Japanese black41. Annual Conference IETS, International Embryo Transfer Society (IETS). USA., Jan 2015, Versailles, France. ⟨10.1071/RDv27n1Ab19⟩
Conference papers
hal-02741067v1
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Maternal preconceptional weight loss: impact on fetoplacental development and on epigenetic machinery genes expression6. Latin American Symposium on Maternal-Fetal Interaction and Placenta / 5. Latin American Symposium on Reproductive Immunology, Latin American Society for Maternal Fetal Interaction and Placenta (SLIMP). ARG., Apr 2015, Mar Del Plata, Argentina
Conference papers
hal-02741183v1
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Obésité et perte de poids maternelles : programmation épigénétique dans le placenta et effets sur le phénotype des descendants adultes4. Rencontre du Groupe de la Francophonie Placentaire "Le placenta dans tous ses états", Hôpitaux Universitaires de Genève (HUG). CHE., Jun 2015, Genève, Suisse
Conference papers
hal-02797274v1
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Impact on epigenetic machinery genes expression and on foeto-placental development of preconceptional maternal weight loss2. Colloque de la SF-DOHaD, Origine Développementale de la santé et des maladies et épigénétique, Société Francophone pour la Recherche et l'Education sur les Origines Développementales, Environnementales et Epigénétiques de la Santé et des Maladies (SF-DOHAD). FRA., Nov 2014, Nantes, France. 57 p
Conference papers
hal-02741132v1
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Lung neonatal responses to respiratory syncytial virus reveal deficiencies in dendritic cells and type I interferon in a mouse model of airway enhanced disease8. Word Immune Regulation Meeting, Mar 2014, Davos, Switzerland
Conference papers
hal-02740120v1
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DMRT1 turns on testicular differentiation during XX sex-reversal in the goat18. European Testis Workshop, May 2014, Elsinore, Denmark. 1 p
Conference papers
hal-01193822v1
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Cloning disrupts the methylation signatures associated to age in cattleConférence Jacques Monod Méthylation et déméthylation de l'ADN, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS). FRA., Sep 2013, Roscoff, France
Conference papers
hal-01019185v1
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Analyse à grande échelle des ARN non codants longs exprimés au cours de la différenciation gonadi |