MARIE PAILLOUX

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Publications

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Omics data reveal putative regulators of einkorn grain protein composition under sulfur deficiency

Titouan Bonnot , Pierre Martre , Victor Hatte , Mireille Dardevet , Philippe Leroy et al.
Plant Physiology, 2020, 183 (2), pp.501-516. ⟨10.1104/pp.19.00842⟩
Article dans une revue hal-02553742 v1
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Grain subproteome responses to nitrogen and sulfur supply in diploid wheat Triticum monococcum ssp. monococcum

Titouan Bonnot , Emmanuelle Bancel , David Alvarez , Marlène Davanture , Julie Boudet et al.
The Plant Journal, 2017, 91 (5), pp.894-910. ⟨10.1111/tpj.13615⟩
Article dans une revue hal-01602778 v1
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RQL: A Query Language for Rule Discovery in Databases

Brice Chardin , Emmanuel Coquery , Marie Pailloux , Jean-Marc Petit
Theoretical Computer Science, 2017, 658, pp.357-374. ⟨10.1016/j.tcs.2016.11.004⟩
Article dans une revue hal-01395083 v1
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RulNet: A Web-Oriented Platform for Regulatory Network Inference, Application to Wheat –Omics Data

Jonathan Vincent , Pierre Martre , Benjamin Gouriou , Catherine Ravel , Zhanwu Dai et al.
PLoS ONE, 2015, 10 (5), pp.20. ⟨10.1371/journal.pone.0127127⟩
Article dans une revue hal-01260267 v1

Transcriptional and metabolic alternations rebalance wheat grain storage protein accumulation under variable nitrogen and sulfur supply

Zhanwu Dai , Anne A. Plessis , Jonathan Vincent , Nathalie N. Duchateau , Alicia Besson et al.
The Plant Journal, 2015, 83 (2), pp.326-343. ⟨10.1111/tpj.12881⟩
Article dans une revue hal-02042399 v1
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dbWFA: a web-based database for functional annotation of Triticum aestivum transcripts

Jonathan J. Vincent , Zhanwu Z. Dai , Catherine Ravel , Frédéric Choulet , Saïd S. Mouzeyar et al.
Database - The journal of Biological Databases and Curation, 2013, 2013, 12 p. ⟨10.1093/database/bat014⟩
Article dans une revue hal-00964169 v1
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DroPNet: a web portal for integrated analysis of Drosophila protein-protein interaction networks

Y. Renaud , A. Baillif , J.-B. Perez , M. Agier , E. Mephu Nguifo et al.
Nucleic Acids Research, 2012, 40 (W1), pp.W134-W139. ⟨10.1093/nar/gks434⟩
Article dans une revue hal-01918526 v1

Unifying Framework for Rule Semantics: Application to Gene Expression Data

Marie Agier , Jean-Marc Petit , Einoshin Suzuki
Fundamenta Informaticae Journal - Special issue on Intelligent Information Systems, 2007, 4, 78, pp.543-559
Article dans une revue hal-01501476 v1
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Différents types de règles pour la reconstruction de réseaux de gènes à partir de données d'expression

Marie Agier
Revue I3 - Information Interaction Intelligence, 2007
Article dans une revue hal-01980612 v1
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Une Approche d'Extraction de Motifs Graduels (Fermés) Fréquents Sous Contrainte de la Temporalité

Jerry Lonlac , Yannick Miras , Aude Beauger , Marie Pailloux , Jean-Luc Peiry et al.
conférence Extraction et Gestion des Connaissances (EGC), Jan 2017, Grenoble, France
Communication dans un congrès hal-02103661 v1
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RQL : un langage " à la SQL " pour découvrir des règles à partir des données

Brice Chardin , Emmanuel Coquery , Marie Pailloux , Jean-Marc Petit
Acte de la conférence BDA 2014 : Gestion de Données – Principes, Technologies et Applications, Collet, Christine and Bobineau, Christophe and Jouanot, Fabrice, Oct 2014, Autrans - Grenoble, France. pp.33--37
Communication dans un congrès hal-01147451 v2
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RQL: An SQL-like Query Language for Discovering Meaningful Rules

Brice Chardin , Emmanuel Coquery , Marie Pailloux , Jean-Marc Petit
ICDM 2014, Dec 2014, Shenzhen, China. pp.1203-1206, ⟨10.1109/ICDMW.2014.50⟩
Communication dans un congrès hal-01301091 v1
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Query Rewriting for Rule Mining in Databases

Brice Chardin , Emmanuel Coquery , Benjamin Gouriou , Marie Pailloux , Jean-Marc Petit
Languages for Data Mining and Machine Learning Workshop (LML 2013) during the European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases, Sep 2013, Prague, Czech Republic. pp.35-48
Communication dans un congrès hal-01339257 v1
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On Armstrong-compliant Logical Query Languages

Marie Agier , Christine Froidevaux , Jean-Marc Petit , Yoan Renaud , Jef Wijsen
4th International Workshop on Logic in Databases, (EDBT/ICDT '10 joint conference), George H. L. Fletcher and Slawek Staworko, 2011, Uppsala, Sweden. pp.33-40
Communication dans un congrès hal-00649604 v1

A New and Useful Syntactic Restriction on Rule Semantics for Tabular Datasets

Marie Agier , Jean-Marc Petit
5th International Conference Formal Concept Analysis (ICFCA'07), Feb 2007, Clermont-Ferrand, France. pp.39-58
Communication dans un congrès hal-01591005 v1

A New and Useful Syntactic Restriction on Rule Semantics for Tabular Data

Marie Agier , Jean-Marc Petit
Bases de données avancées (BDA'05), Oct 2005, Saint Malo, France, France
Communication dans un congrès hal-01590949 v1

Towards ad-hoc rule semantics for gene expression data

Marie Agier , Jean-Marc Petit , E. Suzuki
15th International Symposium on Foundations of Intelligent Systems (ISMIS 2005), May 2005, Saratoga Springs, United States. pp.494-503
Communication dans un congrès hal-00108713 v1

Notion de sémantiques bien-formées pour les règles

Marie Agier , Jean-Marc Petit
EGC 2005, Jan 2005, Paris, France. pp.19-30
Communication dans un congrès hal-01590954 v1

Stratégies de reconstruction de génomes microbiens à partir de métagenomes

Kevin Gravouil , Corentin Hochart , Bérénice Batut , Clémence Defois , Cyrielle Gasc et al.
JOBIM 2016 - Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Jun 2016, Lyon, France
Poster de conférence hal-04763072 v1

Un outil pour la visualisation de relations entre gènes

Marie Agier , Jean-Marc Petit
EGC'07, démonstration de logiciel, Jan 2007, Namur, Belgique. pp.186-187, 2007
Poster de conférence hal-01590964 v1
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De l'analyse de données d'expression à la reconstruction de réseau de gènes

Marie Agier
Bio-informatique [q-bio.QM]. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2006. Français. ⟨NNT : 2006CLF21707⟩
Thèse tel-00717382 v1