Nadia Goué

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Affiliations actuelles
  • Université Clermont Auvergne (UCA)
  • Mésocentre Clermont Auvergne
  • Plateforme Auvergne Bioinformatique (AuBi)
  • Institut Français de Bioinformatique (IFB-core)

Présentation

Domaines de recherche

Informatique [cs] Biochimie, Biologie Moléculaire Biologie cellulaire Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]

Publications

Publications

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The Galaxy platform for accessible, reproducible, and collaborative data analyses: 2024 update

Linelle Ann L Abueg , Enis Afgan , Olivier Allart , Ahmed Awan , Wendi Bacon et al.
Nucleic Acids Research, 2024, 52 (W1), pp.W83-W94. ⟨10.1093/nar/gkae410⟩
Article dans une revue hal-04645009 v1
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Galaxy Training: A powerful framework for teaching!

Saskia Hiltemann , Helena Rasche , Simon Gladman , Hans-Rudolf Hotz , Delphine Larivière et al.
PLoS Computational Biology, 2023, 19 (1), pp.e1010752. ⟨10.1371/journal.pcbi.1010752⟩
Article dans une revue hal-04069041 v1
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Tracing the ancestry of modern bread wheats

Caroline Pont , Thibault Leroy , Michael Seidel , Alessandro Tondelli , Wandrille Duchemin et al.
Nature Genetics, 2019, 51 (5), pp.905-911. ⟨10.1038/s41588-019-0393-z⟩
Article dans une revue hal-02154676 v1
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Identification of novel transcription factors regulating secondary cell wall formation in Arabidopsis

Hua Cassan-Wang , Nadia Goue , Mohammed N Saidi , Sylvain Legay , Pierre Sivadon et al.
Frontiers in Plant Science, 2013, 4, pp.189. ⟨10.3389/fpls.2013.00189⟩
Article dans une revue hal-04723619 v1
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Secondary cell wall characterization in a BY-2 inductive system

Nadia Goué , Jenny Mortimer , Yoshimi Nakano , Zhinong Zhang , Morgane Josserand et al.
Plant Cell, Tissue and Organ Culture, 2013, 115 (2), pp.223-232. ⟨10.1007/s11240-013-0354-7⟩
Article dans une revue hal-04723556 v1
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QTL for floral stem lignin content and degradabililty in three recombinant inbred line (RIL) progenies of Arabidopsis thaliana and search for candidate genes involved in cell wall biosynthesis and degradability.

Hélène Chavigneau , Nadia Goué , Sabrina Delaunay , Audrey Courtial , Lise Jouanin et al.
Open Journal of Genetics, 2012, 2 (01), pp.7-30. ⟨10.4236/ojgen.2012.21002⟩
Article dans une revue hal-04770794 v1

QTL for floral stem lignin content and degradabililty in three recombinant inbred line (RIL) progenies of Arabidopsis thaliana and search for candidate genes involved in cell wall biosynthesis and degradability.

Hélène Chavigneau , Nadia Goue , Sabrina Delaunay , Audrey Courtial , Lise Jouanin et al.
Open Journal of Genetics, 2012, 2, pp.7-30
Article dans une revue hal-01204165 v1
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Microdissection to Isolate Vascular Cambium Cells in Poplar

Nadia Goue , Nathalie Boizot , Michel Vallance , Elisabeth Magel , Philippe Label
Silva Fennica, 2012, 46 (1), pp.5 - 16
Article dans une revue hal-01268376 v1

Microgenomic analysis reveals cell type-specific gene expression patterns between ray and fusiform initials within the cambial meristem of Populus

Nadia Goué , Marie-Claude Lesage Descauses , Ewa J. Mellerowicz , Elisabeth Magel , Philippe Label et al.
New Phytologist, 2008, 180 (1), pp.45-56. ⟨10.1111/j.1469-8137.2008.02556.x⟩
Article dans une revue hal-02666497 v1

Physiologie et génomique de la formation du bois

Jean-Charles Leplé , Annabelle Dejardin , Françoise F. Laurans , Gilles G. Pilate , Nadia Goué et al.
Biofutur, 2004, 247, pp.43-48
Article dans une revue hal-02679521 v1

CDKA orthologue isolation and its expression during cambial activity in hybrid walnut (Juglans nigra X Juglans regia)

Nadia Goué , Gregory Montiel , Isabelle Levert , Muriel Gaudet , Christian Jay-Allemand et al.
Trees - Structure and Function, 2003, 17 (4), pp.316-324. ⟨10.1007/s00468-002-0241-z⟩
Article dans une revue istex hal-02678804 v1

WORKSHOP - Data storage and curation - Biology and Health Community (OMERO)

Sophie Desset , Nadia Goué , Francis Ogereau
Printemps de la donnée, Université Clermont Auvergne, May 2025, Clermont Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-05095849 v1

ATELIER - Dépôt et curation de données - Communauté Biologie et Santé (plateforme de bioanalyses Galaxy)

Cléa Siguret , Bérénice Batut , Nadia Goué
Printemps de la donnée 2025, Université Clermont-Auvergne, May 2025, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-05095680 v1
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PRESENTATION - Discovering and best practices for research data in the context of open science - part 2

Nadia Goué , Francis Ogereau
Printemps de la donnée UCA, Université Clermont Auvergne, Jun 2025, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-05095927 v1
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PRESENTATION - Discovering and best practices for research data in the context of open science

Nadia Goué , Francis Ogereau
Printemps de la donnée, Université Clermont Auvergne, May 2025, Clermont - Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-05095887 v1
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FAIRing Research Data to Live

Nadia Goué
Journée "Cycle de vie des données en biologie", Apr 2024, Sophia Antipolis (06), France
Communication dans un congrès hal-04529741 v1
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Combiner analyses statistiques intégratives et prédiction bioinformatique du sécrétome et du surfacéome pour comprendre le dialogue inter-organes

Jérémy Tournayre , Alyssa Imbert , Emile Mardoc , James Broadbent , Keren Byrne et al.
Journées d'Animation Scientifique et 20 ans du département PHASE, Nov 2024, Poitiers, France
Communication dans un congrès hal-04873121 v1

ABRomics : Une plateforme basée sur Galaxy pour la recherche sur la résistance aux antibiotiques et la santé publique

Cléa Siguret , Bérénice Batut , Raphaël Tackx , Julie Lao , Amanda Dieuaide et al.
Journée d’animation annuelle de la plateforme AuBi 2024, Plateforme Auvergne Bioinformatique (AuBi), Dec 2024, Aubière / Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-05084079 v1

ABRomics: An integrated multi-omics platform for antibiotic resistance research and public health

Julie Lao , Pierre Marin , Romain Dallet , Fabien Mareuil , Alix De Toisy et al.
18ème congrès national de la SFM: MICROBES 2023, Société Français de Microbiologie, Oct 2023, Le couvant des Jacobins, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04369101 v1
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Talkmine, a workflow for the prediction of the interactions between secretome and surfaceome in the dialogue between cellular types

Manon Connault , Jérémy Tournayre , Céline Boby , Muriel Bonnet , Nadia Goué
JOBIM, Jul 2021, Paris - (Congrès virtuel), France
Communication dans un congrès hal-03332116 v1
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Déterminismes biophysiques et moléculaires de la vulnérabilité à l'embolie chez le peuplier

Nadia N. Goue , Eric Badel , Tete Severien T. S. Barigah , Hervé H. Cochard
GDR 3544 " Sciences du Bois ", Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS). LMGC, Montpellier, FRA., Nov 2012, Montpellier, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-00964756 v1

First insight into micro-genomics of cambial activity per cell type in poplar

Nadia Goué , Björn Sundberg , Ewa Mellerowicz , Marie-Claude Lesage Descauses , Philippe Label
Population genetics and genomics of forest trees : from gene function to evolutionary dynamics and conservation; A joint conference of IUFRO working groups 2.04.01 (population, ecological and conservation genetics) and 2.04.10 (genomics), and COST Action E-28 (genosilva : european forest genomics network), Oct 2006, Madrid, Spain
Communication dans un congrès hal-02755673 v1

Exploration of gene expression per cell type in the cambium of poplar

Nadia Goué , Björn Sundberg , Ewa Mellerowicz , Marie-Claude Lesage Descauses , Philippe Label
European project Alfa-GEMA and COST-E28 WG1 joint meeting, Oct 2005, Orléans, France. n.p
Communication dans un congrès hal-02829592 v1
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FAIRing Research Data to Live @AuBi Platform

Francis Ogereau , Mateo Hiriart , Pierre Marin , Bérénice Batut , Cléa Siguret et al.
JOBIM, Jun 2024, Toulouse (FR), France
Poster de conférence hal-04643973 v1
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Orchestrating data flows throughout their whole life cycle

Konogan Bourhy , Laurent Bouri , Christophe Bruley , Olivier Collin , Frédéric De Lamotte et al.
JOBIM 2024 - Journées ouvertes en biologie, informatique, et mathématiques, Jun 2024, Toulouse, France. , 2024
Poster de conférence hal-04618277 v1
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MetaboCloud : A catalog of microservices hosted on a Cloud infrastructure and addressing issues linked to FAIR principles and open science

Faustine Souc , Thomas Bellembois , Nils Paulhe , Érina Point , Antoine Mahul et al.
JOBIM2024 : Journées Ouvertes en Biologie, Informatique, et Mathématiques - 2024, Jun 2024, Toulouse, France
Poster de conférence hal-04632161 v1
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Services deployed on the IFB National Network of Computing Resources (NNCR)

David Benaben , Christophe Blanchet , Matéo Boudet , Guillaume Brysbaert , Anthony Bretaudeau et al.
JOBIM 2024 - Journées ouvertes en biologie, informatique, et mathématiques, Jun 2024, Toulouse, France. , 2024
Poster de conférence hal-04618059 v1
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The ABRomics platform — a One Health Antimicrobial resistance analysis service

Julie Lao , Raphael Tackx , Pierre Marin , Amanda Dieuaide , Thomas Mignon et al.
Journées Ouvertes en Biologie, Informatique, et Mathématiques - 2024, Jun 2024, Toulouse, France
Poster de conférence hal-04618645 v1
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ABRomics: A Galaxy-based one health antimicrobial resistance platform

Pierre Marin , Bérénice Batut , Kenzo-Hugo Hillion , Clea Siguret , Raphael Tackx et al.
GCC 2024 - Galaxy Community Conference 2024, Jun 2024, Brno, Czech Republic. , ⟨10.7490/f1000research.1119762.1⟩
Poster de conférence hal-04619528 v1
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Orchestrating data flows throughout their whole life cycle

Frédéric de Lamotte , Laurent Bouri , Konogan Bourhy , Christophe Bruley , Olivier Collin et al.
JOBIM2024 : Journées Ouvertes en Biologie, Informatique, et Mathématiques - 2024, Jun 2024, Toulouse, France. 2024
Poster de conférence hal-04665629 v1
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ABRomics: An integrated multi-omics platform for antibiotic resistance research and public health

Julie Lao , Pierre Marin , Romain Dallet , Fabien Mareuil , Alix De Toisy et al.
9ème symposium sur la résistance aux antimicrobiens chez les animaux et dans l'environnement (ARAE 2023), Jul 2023, Vinci International Convention Centre, Tours, France
Poster de conférence hal-04369175 v1
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ABRomics: An integrated multi-omics platform for antibiotic resistance research and public health

Julie Lao , Pierre Marin , Romain Dallet , Fabien Mareuil , Alix De Thoisy et al.
Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM ) 2023, Jun 2023, Plouzané, France
Poster de conférence hal-04369161 v1
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ABRomics - an open access online platform on antimicrobial resistance to store, integrate, analyze and share multi-omics data

Julie Lao , Pierre Marin , Romain Dallet , Fabien Mareuil , Alix De Toisy et al.
FEMS 2023 European Congress of Microbiology, Jul 2023, Congress Center Hamburg Hamburg, Germany, Germany
Poster de conférence hal-04369134 v1
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Supports for imaging projects toward Open Science at AuBi platform

Mateo Hiriart , David Grimbichler , Laurent Bouri , Pierre Pouchin , Sophie Desset et al.
JOBIM, Jul 2022, Rennes, France
Poster de conférence hal-03716079 v1
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ABRomics - a digital platform on antimicrobial resistance to store, integrate, analyze and share multi-omics data

Pierre Marin , Julie Lao , Kenzo-Hugo Hillion , Aurélien Birer , Nadia Goué et al.
JOURNÉES OUVERTES EN BIOLOGIE, INFORMATIQUE ET MATHÉMATIQUES ( JOBIM ) 2022, Jul 2022, Rennes, France. Actes JOBIM 2022
Poster de conférence hal-04369049 v1
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Creation of an integrated molecular dynamics workflow on the Galaxy platform : Characterization of aquaporin pores

Agnès-Elisabeth Petit , Jean-Stéphane Venisse , Philippe Label , Nadia Goué
JOBIM, Jul 2022, Rennes, France.
Poster de conférence hal-03716631 v1
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Talkmine, a workflow for the prediction of the interactions between secretome and surfaceome in the dialogue between cellular types

Manon Connault , Jérémy Tournayre , Céline Boby , Muriel Bonnet , Nadia Goue
JOBIM, Jul 2021, Paris - (Congrès virtuel), France
Poster de conférence hal-03332138 v2
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Auvergne Bioinformatics platform at UCA Mesocentre

Nadia Goué , David Grimbichler , Pierre Peyret , Antoine Mahul
JOBIM, Jun 2020, Montpellier, France
Poster de conférence hal-04166998 v1
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A Newly Opened Galaxy Platform at Clermont Auvergne University

Nadia Goué , David Grimbichler , Pierre Peyret , Antoine Mahul
Galaxy Community Conference, Jul 2019, Freiburg, Germany
Poster de conférence hal-04166976 v1
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AuBi platform for biologists and bioinformaticians at UCA Mesocentre

Nadia Goué , David Grimbichler , Pierre Peyret , Antoine Mahul
JOBIM2018, Jul 2018, Marseille, France
Poster de conférence hal-04166992 v1
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Biophysical and molecular determinants of vulnerability to cavitation in young poplars

Eric Badel , Nadia Goue , Hervé Cochard , Tete Severien Barigah , Stéphane Herbette
International Symposium on Wood Structure in Plant Biology and Ecology, Apr 2013, Naples, Italy. 2013
Poster de conférence hal-01190307 v1

Gene expression in ray and fusiform cambial cells of hybrid poplar

Nadia Goué , Elisabeth Magel , Philippe Label , Björn Sundberg
Tree Biotechnology 2003, Jun 2003, Umea, France. 1 p., 2003
Poster de conférence hal-02831369 v1

Contribution to the SAGE tag analysis by constitution of a potential-SAGE-tag database for poplar improving tag identification uniqueness

Farid Ghazali , Nadia Goué , Philippe Label
Tree Biotechnology 2003, Jun 2003, Umea, France. 1 p., 2003
Poster de conférence hal-02829733 v1