Nathalie Vialaneix
Présentation
Publications
Publications
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Inférence post hoc pour l'analyse différentielle de données Hi-C56e Journées de Statistique de la SFdS (JdS 2025), Société Française de Statistique, Jun 2025, Marseille, France. pp.446 |
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phoenics : une nouvelle approche statistique pour l'analyse différentielle longitudinale de voies métaboliques56. Journées de Statistique de la SFdS (JdS 2025), Société Française de Statistique, Jun 2025, Marseille, France. pp.463 |
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Analyse de la spécificité des associations génétiques dans les études multi-populationJournées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France |
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Réseaux de gènes : inférence, évaluation, utilisation et au-delàJournées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France |
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Analyse différentielle longitudinale des voies métaboliques56. Journées de Statistique de la SFdS (JdS 2025), Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France |
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La transcriptomique en cellule unique révèle les processus de maturation induits dans chaque type de cellule épithéliale intestinale lors de l'introduction de l'alimentation solideCECED 2024, Club des Cellules Epithéliales Digestives, Mar 2024, Montpellier, France. pp.P12 |
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Utilisation de la NMF supervisée intégrative pour l'étude d'altérations de la peauJournées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France |
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Procédure de test hiérarchique pour l'analyse différentielle de données Hi-CJournées de statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France |
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Extension de la NMF supervisée pour l'intégration de données omiquesJournée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Nov 2023, Toulouse, France |
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Modélisation de données métabolomiques longitudinales par voies métaboliques54. Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, Jul 2023, Bruxelles, Belgique |
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Extension de la NMF supervisée pour l'intégration de données omiquesJournée de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, Jul 2023, Bruxelles, Belgium |
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ASTERICS: A Simple Tool for the ExploRation and Integration of omiCS dataJournée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Nov 2023, Toulouse, France. ⟨10.57745/TCKSTD⟩ |
ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS dataLes Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), Inria; INRAE, Jul 2022, Rennes, France |
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Sélection d'intervalles pour des prédicteurs fonctionnels à partir de forêts aléatoiresJournées de Statistique de la SFdS, Jun 2022, Lyon, France |
Multi-omics data integration methods: kernel and other machine learning approachesMachine Learning for Life Sciences, Key Initiative MUSE, Université de Montpellier, Nov 2022, Montpellier, France |
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CRAN Task Views para Guiar a usuaries de paquetes de RLatinR, Oct 2022, Online, Francia |
Plasmatic and ruminal metabolomes of lambs divergently selected on residual feed intakeEAAP – European Federation of Animal Science 2021, Aug 2021, Davos, Switzerland |
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ASICS: identification and quantification of metabolites in complex 1H NMR spectraEuropean RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France |
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Analyse différentielle de données Hi-C via la classification ascendante hiérarchique sous contrainte de contiguïtéJDS2020 : 52èmes Journées de Statistique de la Société Française de Statistique (SFdS), Société Française de Statistique, May 2020, Nice, France. pp.655-660 |
Chromatin accessibility conservation across four livestock speciesConference of the International Society for Animal Genetics (ISAG 2019), Jul 2019, Llieda, Spain |
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Classification ascendante hiérarchique, contrainte d'ordre : conditions d'applicabilité, interprétabilité des dendrogrammes51èmes Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2019, Nancy, France |
Organisation nucléaire et expression génique lors du développement chez le porc5. Journée d'Animation Scientifique du réseau épiPhase, Jun 2019, Toulouse, France. 35 p |
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Unsupervised variable selection for kernel methods in systems biologyJournée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Oct 2019, Toulouse, France |
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ASICS : identifier et quantifier des métabolites à partir d'un spectre RMN 1H51. Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique (SFdS). FRA., Jun 2019, Nancy, France |
Multi-level conservation of chromosome conformation across livestock species reveals evolutionary links between genome structure and functionConference of the International Society for Animal Genetics (ISAG 2019), Jul 2019, Lleida, Spain |
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Functional annotation of livestock genomes: chromatin structure and regulation of gene expressionASAS/ASDS Midwest Joint Meeting, Mar 2019, Omaha, United States. ⟨10.1093/jas/skz122.028⟩ |
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Random forests for big dataData Science, Statistics & Visualization (DSSV) 2018, Jul 2018, Vienne, Austria |
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ASICS : un package R pour l'identification et la quantification de métabolites dans un spectre RMN 1H7ème Rencontres R, Jul 2018, Rennes, France |
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Multiple hot-deck imputation for network inference from RNA sequencing dataEuropean Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece |
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Using ASICS to quantify metabolites in 1D 1H NMR spectra: an application to perinatal survival in pigsJournée des Plateformes BioInfo et BioStat du Génotoul, Jan 2018, Toulouse, France |
An innovative method of gene co expression network inference reveals significant biological processes involved in fetal porcine muscle development23rd International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics, Jun 2018, Saint Petersburg, Russia. pp.2 |
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RNAseqNet : un package pour l'inférence de réseaux à partir de données RNA-seq7ème Rencontres R, Jul 2018, Rennes, France |
Adjacency-constrained hierarchical clustering of a band similarity matrix with application to genomicsJournée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Dec 2018, Toulouse, France |
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Learning from (dis)similarity dataEuropean R Users Meeting (eRum 2018), May 2019, Budapest, Hungary. 70 p |
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Accelerating stochastic kernel SOMXXVth European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning, Apr 2017, Bruges, Belgium. 6 p |
Progesterone and betahydroxybutyrate in line measurements for a better description and understanding of Holstein cows fertility in field conditions8th European Conference on Precision Livestock Farming (EC-PLF), Sep 2017, Nantes, France. 7 p |
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Random forests for big data10th International Conference of the ERCIM WG on Computational and Methodological Statistics, Dec 2017, Londres, United Kingdom |
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Characterization of 3D genomic interactions in fetal pig muscle36. International Society for Animal Genetics Conference (ISAG), Jul 2017, Dublin, Ireland. pp.43 |
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Stochastic Self-Organizing Map variants with the R package SOMbrero12th International Workshop on Self-Organizing Maps and Learning Vector Quantization, Clustering and Data Visualization (WSOM), Jun 2017, Nancy, France. 7 p., ⟨10.1109/WSOM.2017.8020014⟩ |
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Accelerating stochastic kernel SOMXXVth European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning, Apr 2017, Bruges, Belgium. pp.269-274 |
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Unsupervised multiple kernel learning to integrate various metagenomic sources4ème colloque de Génomique Environnementale, Sep 2017, Marseille, France |
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Theoretical and applied aspects of the self-organizing mapsWSOM 2016, Jan 2016, Houston, United States. pp.3-26, ⟨10.1007/978-3-319-28518-4_1⟩ |
Using SOMbrero for clustering and visualizing complex data9th International Conference of the ERCIM WG on Computational and Methodological Statistics, Dec 2016, Séville, Spain |
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Integrating Tara oceans data sets using multiple kernels15th European Conference on Computational Biology (ECCB 2016), Workshop "Recent Computational Advances in Metagenomics (RCAM)", Sep 2016, The Hague, Netherlands. pp.3 |
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Sparse online self-organizing maps for large relational dataWSOM 2016, Jan 2016, Houston, United States. pp.27-37, ⟨10.1007/978-3-319-28518-4_6⟩ |
3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes in pig fetal cells22. International Colloquim on Animal Cytogenetics and Genomics (ICACG), Jul 2016, Toulouse, France. 116 p |
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Multiway-SIR for longitudinal multi-table data integration22nd International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT), Aug 2016, Oviedo, Spain. pp.1 |
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Interval sparsity for functional inverse regression2016 CRoNoS Summer Course, 22nd International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT), Aug 2016, Oviedo, Spain |
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3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes35. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2016, Salt Lake City, United States |
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Outils pour l'analyse et la simulation de données RNA-seqCinquièmes Rencontres R 2016, Jun 2016, Toulouse, France. 2 p |
Random forests for big dataJournées de Statistique de Rennes (JSTAR), Oct 2016, Rennes, France |
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Aggregating Self-Organizing Maps with Topology PreservationWSOM 2016, Jan 2016, Houston, United States. pp.27-37, ⟨10.1007/978-3-319-28518-4_2⟩ |
Using SOMbrero for clustering and visualizing complex dataCMStatistics, Dec 2016, Séville, Spain |
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Parcimonie par intervalle pour la régression inverse par tranche fonctionnelle48e Journées de Statistique de la SFdS, May 2016, Montpellier, France. pp.6 |
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Interpretable sparse sliced inverse regression for functional dataWorkshop Learning with Functional Data, Oct 2016, Lille, France |
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Outils pour chercher de l'information sur R et se formerCinquièmes Rencontres R 2016, Jun 2016, Toulouse, France |
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Imputation de données manquantes pour l'inférence de r éseau à partir de données RNA-seq48e Journées de la Société Française de Statistique, May 2016, Montpellier, France |
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Random forests and big data47ème Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, Jun 2015, Lille, France |
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Enseigner la statistique pour l'analyse de mégadonnées47ème Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique (SFdS). FRA., Jun 2015, Lille, France |
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Enseigner la statistique pour l'analyse de mégadonnées47èmes Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2015, Lille, France |
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Classification et visualisation de graphes avec SOMbreroQuatrièmes Rencontres R, Jun 2015, Grenoble, France. pp.2 |
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Multiple dissimilarity SOM for clustering and visualizing graphs with node and edge attributesInternational Conference on Machine Learning, Workshop FEAST, Jul 2015, Lille, France. 1p |
What is a MOOC?15th Annual Conference of ENBIS, Sep 2015, Prague, Czech Republic |
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Classification et visualisation de graphes avec SOMbreroQuatrièmes Rencontres R, Jun 2015, Grenoble, France |
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Data analysis of social simulations outputs: Interpreting the dispersion of variables15th International Workshop on Multi-Agent-Based Simulation (MBAS 2014 @ AAMAS), May 2014, Paris, France. pp.133-150, ⟨10.1007/978-3-319-14627-0_10⟩ |
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Self-organizing maps for clustering and visualization of bipartite graphs46e Journées de la Société Française de Statistique, Jun 2014, Rennes, France. pp.109 |
Adipose tissue signatures related to weight changes in response to calorie restriction and subsequent weight maintenance using lipidome and gene profiling network analysisBioinformatics/Biostatistics regional workshop, Jun 2014, Toulouse, France. 2 p |
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J'ai testé pour vous... un MOOCJournées de Statistique de la SFdS, Jun 2014, Rennes, France. pp.90 |
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Bagged kernel SOM10th International Workshop, WSOM 2014, Hochschule Esslingen University of Applied Sciences. DEU., Jul 2014, Mittweida, Germany. pp.45-54, ⟨10.1007/978-3-319-07695-9⟩ |
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Self-Organizing Maps for clustering and visualization of bipartite graphs46e Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2014, Rennes, France. pp.109 |
Inferring networks from multiple samples with consensus LASSOENBIS Spring Meeting, Apr 2014, Paris, France |
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Reconstruction quality of a biological network when its constituting elements are partially observedSeventeenth International Conference on Artificial Intelligence and Statistics (AI & Statistics 2014), Apr 2014, Reykjavik, Iceland. pp.L014 |
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SOMbrero: an R package for numeric and non-numeric self-organizing mapsWSOM 2014, Jul 2014, Mittweida, Germany. ⟨10.1007/978-3-319-07695-9_21⟩ |
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Genetics systems of stress responses in pigsBioinformatics/Biostatistics regional workshop, Jun 2014, Toulouse, France |
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SOMbrero: an R package for numeric and non-numeric Self-Organizing Maps10th International Workshop, WSOM 2014, Jul 2014, Mittweida, Germany. pp.219-228 |
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Blood transcriptome response to LPS in pigs65. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2014, Copenhague, Denmark. pp.274 |
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J'ai testé pour vous... un MOOC46e Journées de la Société Française de Statistique, Société Française de Statistique (SFdS). FRA., Jun 2014, Rennes, France |
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Data Analysis of Social Simulations Outputs - Focus on variables dispersionWorkshop on Multi-Agent-Based Simulation, May 2014, Paris, France. Paper session 3, paper 2 |
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Multiple kernel self-organizing maps21. European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning (ESANN 2013), Apr 2013, Bruges, Belgium |
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sexy-rgtk: a package for programming RGtk2 GUI in a user-friendly manner2èmes Rencontres R, Jun 2013, Lyon, France. pp.103-104 |
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SOMbrero : Cartes auto-organisatrices stochastiques pour l'intégration de données décrites par des tableaux de dissimilarités2èmes Rencontres R, Jun 2013, Lyon, France. pp.99-100 |
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Carte auto-organisatrice pour graphes étiquetés.Atelier Fouilles de Grands Graphes (FGG) - EGC'2013, Jan 2013, Toulouse, France. pp.Article numéro 4 |
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Which dissimilarity is to be used when extracting typologies in sequence analysis? A comparative studyInternational Workshop on Artificial Neural Networks, Jun 2013, Puerto de la Cruz, Tenerife, Spain |
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Multiple kernel self-organizing mapsEuropean Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning, Apr 2013, Bruges, Belgium. pp.83 |
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On-line relational SOM for dissimilarity dataWSOM 2012, Dec 2012, Santiago, Chile. pp.13-22 |
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Consensus LASSO : inférence conjointe de réseaux de gènes dans des conditions expérimentales multiples45èmes Journées de Statistique de la SFdS, May 2013, Toulouse, France |
Carte auto-organisatrice pour graphes étiquetésAtelier Fouilles de Grands Graphes - EGC, Jan 2013, Toulouse, France |
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Classification non supervisée d'un graphe de co-expression avec des méta-données pour la détection de micro-ARNsMARAMI (Modèles et l'Analyse des Réseaux : Approches Mathématiques et Informatiques) 2013, Oct 2013, Saint-Étienne, France. pp.SI-1 |
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Which dissimilarity is to be used when extracting typologies in sequence analysis? A comparative studyIWANN 2013, Jun 2013, Puerto de la Cruz, Tenerife, Spain. session 12-1A, paper 2 |
Exploration relationnelle d'un corpus d'actes notariés médiévauxColloque Configuration(s), Jun 2012, Paris, France |
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Comparison of network inference packages and methods for multiple network inference1ères Rencontres R, Jul 2012, Bordeaux, France. pp.93-94 |
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Analyse de données pour des graphes étiquetés44èmes Journées de Statistique, May 2012, Bruxelles, Belgique. pp.196 |
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Comparison of network inference packages and methods for multiple network inference1ères Rencontres R, Jul 2012, Bordeaux, France |
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Genetic and phenotypic fine characterizations of French porcine reference populationsISAG, Jul 2012, Cairns, Australia. pp.1 |
Exploration of a Large Database of French Charters with Social Network MethodsInternational Medieval Congress (IMC 2011), Jul 2011, Leeds, United Kingdom |
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L'analyse d'un réseau de co-expression génique met en valeur des groupes fonctionnels homogènes et des gènes importants relatifs a un phénotype d'intérêtJournées de la Société Française de Statistique, May 2011, Tunis, Tunisie. pp.172 |
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Diversité et biologie intégrative : des pistes à explorer pour combler le gap entre diversité génétique et diversité phénotypiqueCOLLOQUE FRB : Les Ressources Génétiques (RG) face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociétaux, Sep 2011, Montpellier, France |
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Sensitivity of the process-based model DNDC on microbiological parametersNitrogen and Global Change - Key findings & Future challenges, Apr 2011, Edinburgh, United Kingdom. pp.S10 |
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The structure of a gene network reveals 7 biological sub-graphs underlying eQTLs in pigWorld Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany. pp.0147 |
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Classification and regression based on derivatives : a consistency resultII Simposio sobre Modelamiento Estadístico, Dec 2010, Valparaiso, Chile |
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A comparison of three learning methods to predict N2O fluxes and N leachingModèles et Apprentissage en Sciences Humaines et Sociales, Jun 2010, Lille, France. pp.57-66 |
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Analysis of the influence of a network on the values of its nodes : the use of spatial indexes.Modèles et l′Analyse des Réseaux : Approches Mathématiques et Informatique, Oct 2010, Toulouse, France. pp.Session 1 - 1 |
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A functional density-based nonparametric approach for statistical calibration15th Iberoamerican Congress on Pattern Recognition (CIARP 2010), Nov 2010, Sao Paulo, Brazil. pp.450-457, ⟨10.1007/978-3-642-16687-7_60⟩ |
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Phenotypic prediction based on metabolomic data : lasso vs Bolasso, primary data vs wavelet transformationWorld Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany. pp.3-55 |
Are gene networks always meaningful?European Animal Disease Genomics Network of Excellence for Animal Health and Food Safety (EADGENE Days 2009), Oct 2009, Paris, France |
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Méthode de classification organisée pour la recherche de communautés dans les réseaux sociaux41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France |
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Recherche et représentation de communautés dans des grands graphesVeille Stratégique Scientifique & Technologique, Mar 2009, Nancy, France. Recherche et représentation de communautés dans des grands graphes |
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Topologically Ordered Graph Clustering via Deterministic AnnealingEuropean Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2009, Bruges, Belgium. pp.529-534 |
Are gene networks always meaningful ?EADGENE Genomics for Animal Health: Outlook for the Future, Oct 2009, Paris, France |
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Consistency of Derivative Based Functional Classifiers on Sampled DataESANN 2008, 16th European Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2008, Bruges, Belgium. pp.445-450 |
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Mining a medieval social network by kernel SOM and related methodsMASHS 2008 (Modèles et Apprentissages en Sciences Humaines et Sociales), Jun 2008, Créteil, France |
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A comparison between dissimilarity SOM and kernel SOM for clustering the vertices of a graphWSOM'07 - Workshop on Self-Organizing Maps, Sep 2007, Bielefeld, Germany. pp.WeP-1 |
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Clustering a medieval social network by SOM using a kernel based distance measureEuropean Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2007, Bruges, Belgium. pp.31-36 |
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Sur l'analyse de réseaux de sociabilité de la société paysanne médiévaleComputational Methods for Modelling and learning in Social and Human Sciences (MASHS), May 2007, Brest, France. pp.3b-3 |
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SVM fonctionnels par interpolation splineJournée de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2006, Clamart (FR), France |
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Integrating Remote Sensing, GIS and Prediction Models to Monitor the Deforestation and Erosion in Peten Reserve, GuatemalaIAMG'2006 Annual Conference on Quantitative Geology from Multiple Sources, Sep 2006, Liège, Belgium. pp.Integrating Remote Sensing, GIS and Prediction Models to Monitor the Deforestation and Erosion in Pe |
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Support Vector Machine For Functional Data ClassificationXIIIth European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning (ESANN 2005), Apr 2005, Bruges, Belgium. pp.467-472 |
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Classification in Hilbert Spaces with Support Vector MachinesXIth International Symposium on Applied Stochastic Models and Data Analysis (ASMDA 2005), May 2005, Brest, France. pp.635-642 |
A comprehensive review and benchmark of differential analysis tools for Hi-C dataISMB/ECCB, Jul 2025, Liverpool, United Kingdom |
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The Genotoul-Bioinfo platformJOBIM2025, Jul 2025, Bordeaux, France |
P13-31 Characterization of human isogenic epithelial cell lines as a relevant tool to study colon carcinogenesis and interaction between genes and environment58th Congress of the European Societies of Toxicology (EUROTOX 2024), Sep 2024, Copenhague, Denmark. 399, pp.S222-S223, 2024, ⟨10.1016/j.toxlet.2024.07.547⟩ |
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Characterization of the endometrial metabolome in late gestationInternational Conference on Pig Reproduction 2023, Jun 2023, Ghent, Belgium |
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Transcriptome of the feto-maternal interface in pigs in late gestation: part1fetal placentaJoint International Congress on Animal Science (EEAP 2023), Aug 2023, Lyon, France. pp.37.20 |
Neonatal metabolic profiling shows relationships between metabolites and biometric phenotypes related to piglet maturity at birth11. International Conference on Pig Reproduction (ICPR), Jun 2023, Ghent, Belgium. 90 (7), p. 732, n°49, 2023 |
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1H-NMR metabolomic study of Large White and Meishan pigs in late gestation: part 2 - sow endometriumJoint International Congress on Animal Science (EEAP 2023), Aug 2023, Lyon, France. pp.37.22 |
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Transcriptome of the feto-maternal interface in pigs in late gestation: part2 - sow endometriumJoint International Congress on Animal Science (EEAP 2023), Aug 2023, Lyon, France. pp.37.21 |
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ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS dataJournée Régional Bioinfo/Biostat, Dec 2022, Toulouse, France |
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Identification par une approche de métabolomique des voies métaboliques associées à la fragilité dans une cohorte de personnes âgéesJournées Francophones de Nutrition (JFN 2022), Nov 2022, Toulouse, France |
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ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS dataECCB: 21st European Conference on Computational Biology, Sep 2022, Sitges, Spain. , 2022, ⟨10.7490/f1000research.1119290.1⟩ |
Leçons apprises de l' évaluation des méthodes d'inférence de réseau de gènes chez Bacillus subtilisJournée Régionale Bioinfo/Biostat, Dec 2022, Toulouse, France. |
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Characterization of human isogenic epithelial cell lines as a relevant tool to study colon carcinogenesis and interaction between genes and environmentSociety of Toxicology Annual Meeting (SOT 2022), Mar 2022, San Diego, United States. , 3579, pp.P204 |
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Characterization of human isogenic epithelial cell lines as a relevant tool to study colon carcinogenesis and interaction between genes and environmentCongrès Annuel de la Société Française de Biochimie et Biologie Moléculaire, Jul 2021, Paris, France |
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Étude de la maturité des porcelets en fin de gestation par une approche métabolomique multifluide52. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2020, Paris, France. IFIP - Institut du Porc, Journées de la Recherche Porcine en France, pp.411-412, 2020, 52èmes journées de la recherche porcine |
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Joint automatic metabolite identification and quantification of a set of 1H NMR spectraMetabolomics 2020, Oct 2020, Online, France |
Study of fetal pig maturity in relation with neonatal survival using a multi-fluids metabolomic approach15. Annual Conference of the Metabolomics Society (Metabolomics 2019), Jun 2019, La Haye, Netherlands. , 2019 |
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Classification ascendante hiérarchique, contrainte d'ordre : conditions d'applicabilité, interprétabilité des dendrogrammesConférence sur l'Apprentissage Automatique (CAp 2019), Jul 2019, Toulouse, France. , 2019 |
ASICS: identification and quantification of metabolites in complex 1D 1H NMR spectra15th Annual Conference of the Metabolomics Society (Metabolomics 2019), Jun 2019, La Haye, Netherlands. , 2019 |
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ASICS : un package R pour l'identification et la quantification de métabolites dans un spectre RMN 1HJournée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Oct 2019, Toulouse, France. 2019 |
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Adjacency-constrained hierarchical clustering of a band similarity matrix with application to genomicsStatistical Methods for Post-Genomic Data (SMPGD), Jan 2019, Barcelona, Spain. 2019 |
ASICS: a new R package for identification and quantification of metabolites in complex 1H NMR spectrauseR! 2019, Jul 2019, Toulouse, France. , 2019 |
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ASICS: a new R package for identification and quantification of metabolites in complex 1D 1H NMR spectraEuropean Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece. , 2018 |
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Integrative analyses of chromosome conformation, chromatin accessibility and gene expression in human and livestock genomesEuropean Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece. , 2018 |
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Developpement de biomarqueurs sanguins pour évaluer la sensibilité des porcs à la chaleurJournées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2018), Apr 2018, Rennes, France. , 2018, Journées d’animation scientifiques du département Phase - Recueil des résumés |
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Integrative and differential analysis of transcriptomes and chromatin accessibility regions reveals regulatory mechanisms involved in pig immune and metabolic functions36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book |
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Characterization of 3D genomic interactions in fetal pig muscle36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book |
Reprise de cyclicité post partum et performances de reproduction chez la vache laitière Prim'Holstein en FranceJournées Nationales des GTV 2017, May 2017, Reims, France. , 7 p., 2017, Recueil des Journées Nationales des GTV 2017 |
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Profiling the landscape of transcription, chromatin accessibility and chromosome conformation of cattle, pig, chicken and goat genomes [FAANG pilot project]36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book |
Time course of the response to ACTH in pig: biological and transcriptomic study35. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2016, Salt Lake City, United States. ASAS - American Society of Animal Science, 94 (S4), 2016, 35th Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG) |
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Estimating nitrous oxide fluxes from agricultural soils at European scale using a crop generic meta-model19th Nitrogen Workshop, Jun 2016, Skara, Sweden. , 2016 |
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Multiway SIR for biological data integrationStatistical Methods for Post Genomic Data, Feb 2016, Lille, France. , 2016 |
3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes in pig fetal cellsConference on Genome Architecture in Space and Time, Jun 2016, Trieste, Italy. 2016 |
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Reconstruction quality of a biological network when its constituting elements are partially observed17th International Conference on Artificial Intelligence and Statistics - AI & Statistics 2014, Apr 2014, Reykjavik, Iceland. , pp.1, 2014, AISTATS 2014 Talks and Papers |
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Comprendre l'organisation spatiale de l'ADN à l'aide de la statistiqueMartina Knoop, Stéphane Blanc, Mokrane Bouzeghoub. L’Interdisciplinarité, CNRS Editions, pp.178-182, 2023 |
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Des noyaux pour les omiquesIntégration de Données Biologiques, 2022 |
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Kernel and dissimilarity methods for exploratory analysis in a social contextAdvances in Contemporary Statistics and Econometrics. Festschrift in Honor of Christine Thomas-Agnan, 2021 |
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Apprentissage connexionnisteApprentissage Statistique et Données Massives, Editions Technip, pp.536, 2018, 9782710811824 |
Large-Scale Measurement of mRNA Degradation in Escherichia coli: To Delay or Not to DelayHigh-density sequencing applications in microbial molecular genetics, 612, ELSEVIER ACADEMIC PRESS INC, pp.47-66, 2018, Methods in Enzymology, 978-0-12-815993-4. ⟨10.1016/bs.mie.2018.07.003⟩ |
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Méthodes pour l’apprentissage de données massivesApprentissage Statistique et Données Massives, Editions Technip, pp.536, 2018, 9782710811824 |
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Depicting gene co-expression networks underlying eQTLsHaja N. Kadarmideen. Systems Biology in Animal Production and Health vol 2, 2, Springer International Publishing, pp.1-31, 2016, 978-3-319-43330-1. ⟨10.1007/978-3-319-43332-5_1⟩ |
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Tropical deforestation modelling : a comparative analysis of different predictive approaches. The case study of Peten, Guatemala.Modelling Environmental Dynamics, Springer, pp.77-108, 2008, ⟨10.1007/978-3-540-68498-5_3⟩ |
Recent advances in the use of SVM for functional data classificationSophie Dabo-Niang, Frédéric Ferraty. Functional and operatorial statistics, Physica-Verlag/Springer, pp.273-280, 2008, Contrib. Statist., ⟨10.1007/978-3-7908-2062-1_41⟩ |
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Prospective modelling of environmental dynamics. A methodological comparison applied to mountain land cover changesModelling Environmental Dynamics, Springer, pp.141-168, 2008, ⟨10.1007/978-3-540-68498-5_5⟩ |
Note de lecture : " Régression avec R " (P.-A. Cornillon et E. Matzner-Løber, 2011)2013, pp.87-89 |
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Éditorial du numéro spécial RNTI - MASHS 2011/2012 : Modèles et Apprentissage en Sciences Humaines et Sociales2013 |
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Note de lecture : " Méthodes de Monte-Carlo avec R " (Chr. P. Robert et G. Casella, 2011)2012, pp.113-114 |
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Livestock genome annotation: transcriptome and chromatin structure profiling in cattle, goat, chicken and pig2018 |
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Statistique et Big Data Analytics; Volumétrie, L'Attaque des Clones2014 |
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Plan de gestion des données CO-LOcATION Version FinaleINRAE - UMR GenPhySE. 2025 |
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Note de consultation : ``Analyse des données multidimensionnelles'' (MOOC, F. Husson et al., 2015)[0] 2015, pp.6 |
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Adaptation to heat in pig production : the genetic pathway[Contract] ANR-12-ADAP-0015, INRA. 2012, pp.43 |
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Contributions à l'analyse de données non vectoriellesStatistiques [math.ST]. Université de Toulouse, 2014 |
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Contributions à l’analyse de données non vectoriellesApplications [stat.AP]. Université Toulouse 1 Capitole (UT1 Capitole), 2014 |