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Nathalie Vialaneix

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Publications

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A comprehensive review and benchmark of differential analysis tools for Hi-C data

Elise Jorge , Sylvain Foissac , Pierre Neuvial , Matthias Zytnicki , Nathalie Vialaneix
Briefings in Bioinformatics, 2025, 26 (2), ⟨10.1093/bib/bbaf074⟩
Article dans une revue hal-04989132 v1

Phoenics: a novel statistical approach for longitudinal metabolomic pathway analysis

Camille Guilmineau , Marie Tremblay-Franco , Nathalie Vialaneix , Rémi Servien
BMC Bioinformatics, 2025, 26 (1), pp.105. ⟨10.1186/s12859-025-06118-z⟩
Article dans une revue hal-05037118 v1

NMFProfiler: a multi-omics integration method for samples stratified in groups

Aurélie Mercadié , Éléonore Gravier , Gwendal Josse , Isabelle Fournier , Cécile Viodé et al.
Bioinformatics, 2025, 41 (2), pp.btaf066. ⟨10.1093/bioinformatics/btaf066⟩
Article dans une revue hal-04992913 v1
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RNA-seq data of pig placenta and endometrium during late gestation

Sarah Maman-Haddad , Laure Gress , Amandine Suin , Nathalie Vialaneix , Agnès Bonnet
Data in Brief, 2024, 57, pp.111178. ⟨10.1016/j.dib.2024.111178⟩
Article dans une revue hal-04831303 v1
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A random forest approach for interval selection in functional regression

Rémi Servien , Nathalie Vialaneix
Statistical Analysis and Data Mining, 2024, 17 (4), pp.e11705. ⟨10.1002/sam.11705⟩
Article dans une revue hal-04663826 v1

Should we really use graph neural networks for transcriptomic prediction?

Céline Brouard , Raphaël Mourad , Nathalie Vialaneix
Briefings in Bioinformatics, 2024, 25 (2), pp. bbae027. ⟨10.1093/bib/bbae027⟩
Article dans une revue hal-04459067 v1
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BEST4 + cells in the intestinal epithelium

Tania Malonga , Nathalie Vialaneix , Martin Beaumont
American Journal of Physiology - Cell Physiology, 2024, 326 (5), pp.C1345-C1352. ⟨10.1152/ajpcell.00042.2024⟩
Article dans une revue hal-04572846 v1
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A two-sample tree-based test for hierarchically organized genomic signals

Pierre Neuvial , Nathanaël Randriamihamison , Marie Chavent , Sylvain Foissac , Nathalie Vialaneix
Journal of the Royal Statistical Society: Series C Applied Statistics, 2024, pp.qlae011. ⟨10.1093/jrsssc/qlae011⟩
Article dans une revue hal-04516167 v1
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Plasma 1H-NMR metabolic and amino acid profiles of newborn piglets from two lines divergently selected for residual feed intake

Laurence Liaubet , Camille Guilmineau , Gaëlle Lefort , Yvon Billon , Sébastien Reigner et al.
Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.7127. ⟨10.1038/s41598-023-34279-5⟩
Article dans une revue hal-04091374 v1
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ASTERICS: A Simple Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

Élise Maigné , Céline Noirot , Julien Henry , Yaa Adu Kesewaah , Ludovic Badin et al.
BMC Bioinformatics, 2023, 24 (1), pp.391. ⟨10.1186/s12859-023-05504-9⟩
Article dans une revue hal-04248315 v1
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Feature selection for kernel methods in systems biology

Celine Brouard , Jérôme J. Mariette , Rémi Flamary , Nathalie Vialaneix
NAR Genomics and Bioinformatics, 2022, 4 (1), ⟨10.1093/nargab/lqac014⟩
Article dans une revue hal-03601435 v1
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Network analyses reveal negative link between changes in adipose tissue GDF15 and BMI during dietary-induced weight loss

Alyssa Imbert , Nathalie Vialaneix , Julien Marquis , Julie Vion , Aline Charpagne et al.
Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism, 2022, 107 (1), pp.e130-e142. ⟨10.1210/clinem/dgab621⟩
Article dans une revue hal-03540946 v1
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R-miss-tastic: a unified platform for missing values methods and workflows

Imke Mayer , Aude Sportisse , Nicholas Tierney , Nathalie Vialaneix , Julie Josse
The R Journal, 2022, 14 (2), pp.244-266. ⟨10.32614/RJ-2022-040⟩
Article dans une revue hal-02879337 v3
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Applicability and interpretability of Ward's hierarchical agglomerative clustering with or without contiguity constraints

Nathanaël Randriamihamison , Nathalie Vialaneix , Pierre Neuvial
Journal of Classification, 2021, 38, pp.363-389. ⟨10.1007/s00357-020-09377-y⟩
Article dans une revue (article de synthèse) hal-02294847 v2
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Major reorganization of chromosome conformation during muscle development in pig

Maria Marti-Marimon , Nathalie Vialaneix , Yvette Lahbib Mansais , Matthias Zytnicki , Sylvie Camut et al.
Frontiers in Genetics, 2021, 12, pp.19 P. ⟨10.3389/fgene.2021.748239⟩
Article dans une revue hal-03367056 v1
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Joint automatic metabolite identification and quantification of a set of 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Nathalie Marty-Gasset , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix et al.
Analytical Chemistry, 2021, 93 (5), pp.2861-2870. ⟨10.1021/acs.analchem.0c04232⟩
Article dans une revue hal-03224485 v1
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The maturity in fetal pigs using a multi-fluid metabolomic approach

Gaëlle Lefort , Rémi Servien , Hélène Quesnel , Yvon Billon , Laurianne L. Canario et al.
Scientific Reports, 2020, 10, pp.19912. ⟨10.1038/s41598-020-76709-8⟩
Article dans une revue hal-03034560 v1
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ASICS: an R package for a whole analysis workflow of 1D 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Patrick Tardivel , Marie-Christine Pere et al.
Bioinformatics, 2019, 35 (21), pp.4356-4363. ⟨10.1093/bioinformatics/btz248⟩
Article dans une revue hal-02626125 v1
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Multi-species annotation of transcriptome and chromatin structure in domesticated animals

Sylvain Foissac , Sarah Djebali , Kylie Munyard , Nathalie Vialaneix , Andrea Rau et al.
BMC Biology, 2019, 17 (1), 25 p. ⟨10.1186/s12915-019-0726-5⟩
Article dans une revue hal-02437599 v1

Reprise atypique de la cyclicité ovarienne chez la vache laitière : une forte association avec la cétose

Sylvie S. Chastant-Maillard , Claire Saby , Wenting Zhang , René Fournier , Rémi Servien et al.
Le Point vétérinaire, 2019, 393
Article dans une revue hal-02617694 v1
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Interpretable sparse SIR for functional data

Victor Picheny , Rémi Servien , Nathalie Vialaneix
Statistics and Computing, 2019, 29 (2), pp.255 - 267. ⟨10.1007/s11222-018-9806-6⟩
Article dans une revue hal-02618466 v1
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Adjacency-constrained hierarchical clustering of a band similarity matrix with application to Genomics

Christophe Ambroise , Alia Dehman , Pierre Neuvial , Guillem Rigaill , Nathalie Vialaneix
Algorithms for Molecular Biology, 2019, 14, pp.22. ⟨10.1186/s13015-019-0157-4⟩
Article dans une revue hal-02006331 v2
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A new approach of gene co-expression network inference reveals significant biological processes involved in porcine muscle development in late gestation

Maria Marti-Marimon , Nathalie Vialaneix , Valentin Voillet , Martine Bouissou-Matet , Yvette Lahbib Mansais et al.
Scientific Reports, 2018, 8, ⟨10.1038/s41598-018-28173-8⟩
Article dans une revue hal-02622725 v1

Cutting edge bioinformatics and biostatistics approaches are bringing precision medicine and nutrition to a new era

Sanjeena Dang , Nathalie Vialaneix
Lifestyle Genomics, 2018, 11 (2), pp.73-76. ⟨10.1159/000494131⟩
Article dans une revue hal-02624369 v1
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Unsupervised multiple kernel learning for heterogeneous data integration

Jérôme J. Mariette , Nathalie Vialaneix
Bioinformatics, 2018, 34 (6), pp.1009-1015. ⟨10.1093/bioinformatics/btx682⟩
Article dans une revue hal-01738461 v1
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Décrire, prendre en compte, imputer et évaluer les valeurs manquantes dans les études statistiques : une revue des approches existantes

Alyssa Imbert , Nathalie Vialaneix
Journal de la Société Française de Statistique, 2018, 159 (2), pp.1-55
Article dans une revue (article de synthèse) hal-02618033 v1
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Self-Organizing Maps, theory and applications

Marie Cottrell , Madalina Olteanu , Fabrice Rossi , Nathalie N. Villa-Vialaneix
Revista de Investigacion Operacional, 2018, 39 (1), pp.1-22
Article dans une revue hal-01796059 v1
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Multiple hot-deck imputation for network inference from RNA sequencing data

Alyssa Imbert , Armand Valsesia , Caroline Le Gall , Claudia Armenise , Gregory Lefebvre et al.
Bioinformatics, 2018, 34 (10), pp.1726 - 1732. ⟨10.1093/bioinformatics/btx819⟩
Article dans une revue hal-01794575 v1
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(NMR)-N-1H-Based metabolomic profiling method to develop plasma biomarkers for sensitivity to chronic heat stress in growing pigs

Samir Dou , Nathalie Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Yvon Billon , Mario Giorgi et al.
PLoS ONE, 2017, 12 (11), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0188469⟩
Article dans une revue hal-02626025 v1
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Random Forests for Big Data

Robin Genuer , Jean-Michel Poggi , Christine Tuleau-Malot , Nathalie Vialaneix
Big Data Research, 2017, 9, pp.28-46. ⟨10.1016/j.bdr.2017.07.003⟩
Article dans une revue hal-01233923 v2
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Efficient interpretable variants of online SOM for large dissimilarity data

Jérôme J. Mariette , Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
Neurocomputing, 2017, 225, pp.31-48. ⟨10.1016/j.neucom.2016.11.014⟩
Article dans une revue hal-01465340 v1
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Time course study of the response to LPS targeting the pig immune gene networks

Elena Terenina , Valérie Sautron , Caroline Ydier , Darya Bazovkina , Amélie Sevin-Pujol et al.
BMC Genomics, 2017, 18, ⟨10.1186/s12864-017-4363-5⟩
Article dans une revue hal-02627295 v1

Molecular biomarkers for weight control in obese individuals subjected to a multiphase dietary intervention

Jennifer Bolton , Emilie Montastier , Jérôme Carayol , Sophie Bonnel , Lucile Mir et al.
Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism, 2017, 102 (8), pp.2751-2761. ⟨10.1210/jc.2016-3997⟩
Article dans une revue hal-01608397 v1
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On combining wavelets expansion and sparse linear models for Regression on metabolomic data and biomarker selection

Nathalie Vialaneix , Noslen Hernández , Alain Paris , Céline Domange , Nathalie Priymenko et al.
Communications in Statistics - Simulation and Computation, 2016, 45 (1), pp.282-298. ⟨10.1080/03610918.2013.862273⟩
Article dans une revue hal-01270963 v1
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Analyse statistique des profils et de l’activité des participants d’un MOOC

Avner Bar-Hen , Hubert Javaux , Nathalie N. Villa-Vialaneix
Revue internationale des technologies en pédagogie universitaire, 2016, 12 (1-2), pp.11-22
Article dans une revue hal-02630053 v1
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On-line relational and multiple relational SOM

Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
Neurocomputing, 2015, 147, pp.15-30. ⟨10.1016/j.neucom.2013.11.047⟩
Article dans une revue hal-01063831 v1
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Time course of the response to ACTH in pig: biological and transcriptomic study

Valérie Sautron , Elena Terenina , Laure Gress , Yannick Lippi , Yvon Billon et al.
BMC Genomics, 2015, 16 (961), pp.PMC4650497. ⟨10.1186/s12864-015-2118-8⟩
Article dans une revue hal-01271063 v1
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Analyse statistique des profils et de l’activité des participants d’un MOOC

Avner Bar-Hen , Hubert Javaux , Nathalie Vialaneix
Revue internationale des technologies en pédagogie universitaire, 2015, 12 (1-2), pp.11-22
Article dans une revue hal-01270885 v1
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Using SOMbrero for clustering and visualizing graphs

Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
Journal de la Société Française de Statistique, 2015, 156 (3), pp.95-119
Article dans une revue hal-01232672 v1
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Beyond multidimensional data in model visualization: High-dimensional and complex nonnumeric data

Nathalie Vialaneix , Anne Ruiz-Gazen
Statistical Analysis and Data Mining, 2015, 8 (4), pp.232-239. ⟨10.1002/sam.11274⟩
Article dans une revue hal-01182932 v1
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System Model Network for Adipose Tissue Signatures Related to Weight Changes in Response to Calorie Restriction and Subsequent Weight Maintenance

Emilie Montastier , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Sylvie Caspar-Bauguil , Petr Hlavaty , Eva Tvrzicka et al.
PLoS Computational Biology, 2015, 11 (1), pp.e1004047. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004047⟩
Article dans une revue inserm-02150615 v1
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A non parametric approach for calibration with functional data

Noslen Hernández , Rolando Biscay , Nathalie Vialaneix , Isneri Talavera
Statistica Sinica, 2015, 22 (4), pp.1547-1566. ⟨10.5705/ss.2013.242⟩
Article dans une revue hal-01199287 v1

Statistical Analysis of the profiles and of the activity of participants of MOOC

Avner Bar-Hen , Hubert Javaux , Nathalie N. Villa-Vialaneix
Revue internationale des technologies en pédagogie universitaire, 2015, 12 (1-2), pp.11-22. ⟨10.18162/ritpu-2015-v12n12-03⟩
Article dans une revue hal-02636153 v1

Inferring networks from multiple samples with consensus LASSO

Nathalie N. Villa-Vialaneix , Matthieu Vignes , Nathalie Viguerie , Magali San Cristobal
Quality technology & quantitative management, 2014, 11 (1), pp.39-60
Article dans une revue hal-02641674 v1
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Statistical exploratory analysis of agent-based simulations in a social context

Nathalie Villa-Vialaneix , Christophe Sibertin-Blanc , Pascal Roggero
Case Studies in Business, Industry and Government Statistics, 2014, 5 (2), pp.132-149
Article dans une revue hal-02629776 v2
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Exploration of a large database of French notarial acts with social network methods

Fabrice Rossi , Nathalie Vialaneix , Florent Hautefeuille
Digital Medievalist, 2014, 9, pp.2013
Article dans une revue hal-01053673 v1
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Le metabolome, un moyen pour trouver de nouveaux biomarqueurs ?

Magali San Cristobal , Marie-Pierre Sanchez , Marie‐josé Mercat , Florian Rohart , Laurence Liaubet et al.
La revue française de la recherche en viandes et produits carnés, 2014, Février, pp.1-5
Article dans une revue hal-01222422 v1
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Inferring networks from multiple samples with Consensus LASSO

Nathalie Villa-Vialaneix , Matthieu Vignes , Nathalie Viguerie , Magali San Cristobal
Quality technology & quantitative management, 2014, 11 (1), pp.39-60
Article dans une revue hal-00971458 v1

Exploration of a large database of French notarial acts with social network methods

Fabrice Rossi , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Florent Hautefeuille
Digital Medievalist, 2013, 9
Article dans une revue hal-02648351 v1
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The Structure of a Gene Co-Expression Network Reveals Biological Functions Underlying eQTLs

Nathalie Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Thibault Laurent , Pierre Cherel , Adrien Gamot et al.
PLoS ONE, 2013, pp.e60045
Article dans une revue hal-00817655 v1

Spatial correlation in bipartite networks

Nathalie Villa-Vialaneix , Bertrand Jouve , Fabrice Rossi , Florent Hautefeuille
Revue des Nouvelles Technologies de l'Information, 2013, pp.97-110
Article dans une revue hal-00761081 v1
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J'ai testé pour vous... un MOOC

Nathalie Villa-Vialaneix
Statistique et Enseignement, 2013, 4 (2), pp.3-17
Article dans une revue hal-00940787 v1
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The Structure of a Gene Co-Expression Network Reveals Biological Functions Underlying eQTLs

Nathalie N. Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Thibault Laurent , Pierre Cherel , Adrien Gamot et al.
PLoS ONE, 2013, 8, online (4), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0060045⟩
Article dans une revue hal-02646005 v1
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Determinants of human adipose tissue gene expression: impact of diet, sex, metabolic status, and cis genetic regulation.

Nathalie Viguerie , Emilie Montastier , Jean-José Maoret , Balbine Roussel , Marion Combes et al.
PLoS Genetics, 2012, 8 (9), pp.e1002959. ⟨10.1371/journal.pgen.1002959⟩
Article dans une revue hal-00757837 v1
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A comparison of eight metamodeling techniques for the simulation of N2O fluxes and N leaching from corn crops

Nathalie Villa-Vialaneix , Marco Follador , Marco Ratto , Adrian Leip
Environmental Modelling and Software, 2012, 34, pp.51-66. ⟨10.1016/j.envsoft.2011.05.003⟩
Article dans une revue hal-00654753 v1

Phenotypic prediction based on metabolomic data on the growing pig from three main European breeds.

F. Rohart , Alain Paris , Béatrice Laurent , Cécile Canlet , Jerome Molina et al.
Journal of Animal Science, 2012, 90 (13), epub ahead of print. ⟨10.2527/jas.2012-5338⟩
Article dans une revue hal-00757827 v1
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Neural Networks for Complex Data

Marie Cottrell , Madalina Olteanu , Fabrice Rossi , Joseph Rynkiewicz , Nathalie Villa-Vialaneix
KI - Künstliche Intelligenz, 2012, 26 (4), pp.373-380. ⟨10.1007/s13218-012-0207-2⟩
Article dans une revue hal-00744929 v1
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Représentation d'un grand réseau à partir d'une classification hiérarchique de ses sommets

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix
Journal de la Société Française de Statistique, 2011, 152 (3), pp.34-65
Article dans une revue hal-00651577 v1
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Recherche et représentation de communautés dans un grand graphe. Une approche combinée

Nathalie Villa-Vialaneix , Taoufiq Dkaki , Sébastien Gadat , Jean-Michel Inglebert , Quoc-Dinh Truong
Document numérique - Revue des sciences et technologies de l'information. Série Document numérique, 2011, 14 (1), pp.59-80. ⟨10.3166/dn.14.1.59-80⟩
Article dans une revue hal-00590612 v1
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Consistency of functional learning methods based on derivatives

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix
Pattern Recognition Letters, 2011, 32 (8), pp.1197-1209. ⟨10.1016/j.patrec.2011.03.001⟩
Article dans une revue hal-00589738 v1
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Using spatial indexes for labeled network analysis

Thibault Laurent , Nathalie Villa-Vialaneix
Revue I3 - Information Interaction Intelligence, 2011, 11 (1), pp.1
Article dans une revue hal-00654754 v1
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A Simulation Study of Functional Density-Based Inverse Regression

Noslen Hernández , Rolando Biscay , Nathalie Villa-Vialaneix , Isneri Talavera
Revista Investigacion Operacional, 2011, 32 (2), pp.146-159
Article dans une revue hal-00654751 v1
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What is a good (gene) network?

Nathalie Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Magali San Cristobal
Journal of Animal Breeding and Genetics, 2011, 128 (1), pp.1-2. ⟨10.1111/j.1439-0388.2010.00916.x⟩
Article dans une revue hal-00658814 v1

Optimizing an Organized Modularity Measure for Topographic Graph Clustering: a Deterministic Annealing Approach

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix
Neurocomputing, 2010, 73 (7-9), pp.Pages 1142-1163. ⟨10.1016/j.neucom.2009.11.023⟩
Article dans une revue hal-00515892 v1
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Batch kernel SOM and related Laplacian methods for social network analysis

Romain Boulet , Bertrand Jouve , Fabrice Rossi , Nathalie Villa
Neurocomputing, 2008, 71 (7-9), pp.1257-1273. ⟨10.1016/j.neucom.2007.12.026⟩
Article dans une revue hal-00202339 v1
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Storms prediction : Logistic regression vs random forest for unbalanced data

Anne Ruiz-Gazen , Nathalie Villa
Case Studies in Business, Industry and Government Statistics, 2007, 1 (2), pp.91-101
Article dans une revue hal-00270176 v1
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Various Approaches for Predicting Land Cover in Mountain Areas

Nathalie Villa , Martin Paegelow , Maria T. Camacho Olmedo , Laurence Cornez , Frédéric Ferraty et al.
Communications in Statistics - Simulation and Computation, 2007, 36 (1), pp.73-86. ⟨10.1080/03610910601096379⟩
Article dans une revue hal-00144147 v1
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Support vector machine for functional data classification

Fabrice Rossi , Nathalie Villa
Neurocomputing, 2006, 69 (7-9), pp.730-742. ⟨10.1016/j.neucom.2005.12.010⟩
Article dans une revue hal-00144141 v1
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Un résultat de consistance pour des SVM fonctionnels par interpolation spline

Nathalie Villa , Fabrice Rossi
Comptes rendus de l'Académie des sciences. Série I, Mathématique, 2006, 343 (8), pp.555-560. ⟨10.1016/j.crma.2006.09.025⟩
Article dans une revue hal-00144142 v1
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Multilayer Perceptron with Functional Inputs: an Inverse Regression Approach

Louis Ferré , Nathalie Villa
Scandinavian Journal of Statistics, 2006, 33 (4), pp.807-823. ⟨10.1111/j.1467-9469.2006.00496.x⟩
Article dans une revue hal-00144144 v1
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Discrimination de courbes par régression inverse fonctionnelle

Louis Ferré , Nathalie Villa
Revue de Statistique Appliquée, 2005, LIII (1), pp.39-57
Article dans une revue hal-00144140 v1
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Modélisations prospectives de l'occupation du sol. Le cas d'une montagne méditerranéenne

Martin Paegelow , Nathalie Villa , Laurence Cornez , Frédéric Ferraty , Louis Ferré et al.
Cybergeo : Revue européenne de géographie / European journal of geography, 2004, 295, 15 p
Article dans une revue hal-00144134 v2
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Modélisation prospective de l’occupation du sol. Le cas d’une montagne méditerrannéenne.

Martin Paegelow , Nathalie Villa , Laurence Cornez , Frédéric Ferraty , Louis Ferré et al.
Cybergeo : Revue européenne de géographie / European journal of geography, 2004, 295, 21 p. en ligne
Article dans une revue hal-03160711 v1
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Analyse de la spécificité des associations génétiques dans les études multi-population

Jeong Hwan Ko , Andrea Rau , Nathalie Vialaneix
Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France
Communication dans un congrès hal-04593233 v1
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Réseaux de gènes : inférence, évaluation, utilisation et au-delà

Nathalie Vialaneix
Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France
Communication dans un congrès hal-04593166 v1
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Analyse différentielle longitudinale des voies métaboliques

Camille Guilmineau , Rémi Servien , Marie Tremblay-Franco , Nathalie Vialaneix
55e Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France
Communication dans un congrès hal-04595237 v1
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La transcriptomique en cellule unique révèle les processus de maturation induits dans chaque type de cellule épithéliale intestinale lors de l'introduction de l'alimentation solide

Tania Malonga , Christelle Knudsen , Emeline Lhuillier , Patrick Aymard , Elodie Riant et al.
CECED 2024, Club des Cellules Epithéliales Digestives, Mar 2024, Montpellier, France. pp.P12
Communication dans un congrès hal-04527178 v1
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Utilisation de la NMF supervisée intégrative pour l'étude d'altérations de la peau

Aurélie Mercadié , Eleonore Gravier , Gwendal Josse , Nathalie Vialaneix , Celine Brouard
Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France
Communication dans un congrès hal-04595238 v1
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Procédure de test hiérarchique pour l'analyse différentielle de données Hi-C

Élise Jorge , Pierre Neuvial , Nathalie Vialaneix , Sylvain Foissac
Journées de statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France
Communication dans un congrès hal-04593207 v1
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Extension de la NMF supervisée pour l'intégration de données omiques

Aurélie Mercadié , Eleonore Gravier , Gwendal Josse , Nathalie Vialaneix , Celine Brouard
Journée de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, Jul 2023, Bruxelles, Belgium
Communication dans un congrès hal-04154752 v1
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Modélisation de données métabolomiques longitudinales par voies métaboliques

Camille Guilmineau , Marie Tremblay-Franco , Nathalie Vialaneix , Rémi Servien
Journées de statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, Jul 2023, Bruxelles (BE), Belgique
Communication dans un congrès hal-04154758 v1
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ASTERICS: A Simple Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

Élise Maigné , Céline Noirot , Julien Henry , Yaa Adu Kesewaah , Sébastien D Éjean et al.
Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Nov 2023, Toulouse, France. ⟨10.57745/TCKSTD⟩
Communication dans un congrès hal-04746181 v1
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Extension de la NMF supervisée pour l'intégration de données omiques

Aurélie Mercadié , Eléonore Gravier , Gwendal Josse , Nathalie Vialaneix , Celine Brouard
Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Nov 2023, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-04746164 v1

ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

Élise Maigné , Céline Noirot , Jérôme Mariette , Yaa Adu Kesewaah , Sébastien Déjean et al.
Les Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), Inria; INRAE, Jul 2022, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-03697843 v1

Multi-omics data integration methods: kernel and other machine learning approaches

Nathalie Vialaneix
Machine Learning for Life Sciences, Key Initiative MUSE, Université de Montpellier, Nov 2022, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-03856931 v1
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Sélection d'intervalles pour des prédicteurs fonctionnels à partir de forêts aléatoires

Rémi Servien , Nathalie Vialaneix
Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2022, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-03697845 v1
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CRAN Task Views para Guiar a usuaries de paquetes de R

Rocío Joo , Nathalie Vialaneix , Roger Bivand , Dirk Eddelbuettel , David Meyer et al.
LatinR, Oct 2022, online, Francia
Communication dans un congrès hal-03809780 v1

Plasmatic and ruminal metabolomes of lambs divergently selected on residual feed intake

Florian Touitou , Flavie Tortereau , Nathalie Marty-Gasset , Nathalie Vialaneix , Gaëlle Lefort et al.
EAAP – European Federation of Animal Science 2021, Aug 2021, Davos, Switzerland
Communication dans un congrès hal-03547250 v1
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Analyse différentielle de données Hi-C via la Classification Ascendante Hiérarchique sous Contrainte de Contiguïté

Nathanaël Randriamihamison , Marie Chavent , Sylvain Foissac , Nathalie Vialaneix , Pierre Neuvial
52èmes Journées de Statistiques de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2020, Nice, France. pp.655-660
Communication dans un congrès hal-02892664 v1
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ASICS: identification and quantification of metabolites in complex 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Nathalie Villa , Rémi Servien
European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02737383 v1

Chromatin accessibility conservation across four livestock species

Sarah Djebali Quelen , Sylvain Foissac , Nathalie Vialaneix , Kylie Munyard , Andrea Rau et al.
Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG 2019), Jul 2019, Llieda, Spain
Communication dans un congrès hal-02788732 v1
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Classification ascendante hiérarchique, contrainte d'ordre : conditions d'applicabilité, interprétabilité des dendrogrammes

Nathanaël Randriamihamison , Pierre Neuvial , Nathalie Vialaneix
51èmes Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2019, Nancy, France
Communication dans un congrès hal-02734011 v1

Organisation nucléaire et expression génique lors du développement chez le porc

Yvette Lahbib Mansais , Maria Marti-Marimon , Nathalie Vialaneix , Sylvain Foissac , Martine Bouissou-Matet et al.
5. Journée d'Animation Scientifique du réseau épiPhase, Jun 2019, Toulouse, France. 35 p
Communication dans un congrès hal-02736301 v1
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Unsupervised variable selection for kernel methods in systems biology

Jérôme J. Mariette , Celine Brouard , Remi Flamary , Nathalie Vialaneix
Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Oct 2019, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02787253 v1
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ASICS : identifier et quantifier des métabolites à partir d'un spectre RMN 1H

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix , Rémi Servien
51. Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique (SFdS). FRA., Jun 2019, Nancy, France
Communication dans un congrès hal-02737497 v1

Multi-level conservation of chromosome conformation across livestock species reveals evolutionary links between genome structure and function

Sylvain Foissac , Sarah Djebali Quelen , Nathalie Vialaneix , Matthias Zytnicki , Andrea Rau et al.
Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG 2019), Jul 2019, Lleida, Spain
Communication dans un congrès hal-02788476 v1

Functional annotation of livestock genomes: chromatin structure and regulation of gene expression

Sylvain Foissac , Sarah Djebali , Kylie Munyard , Nathalie Vialaneix , Andrea Rau et al.
ASAS/ASDS Midwest Joint Meeting, Mar 2019, Omaha, United States. ⟨10.1093/jas/skz122.028⟩
Communication dans un congrès hal-02735898 v1
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Random forests for big data

Robin Genuer , Jean-Michel Poggi , Christine Tuleau-Malot , Nathalie Villa-Vialaneix
Data Science, Statistics & Visualization (DSSV) 2018, Jul 2018, Vienne, Austria
Communication dans un congrès hal-02787208 v1
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ASICS : un package R pour l'identification et la quantification de métabolites dans un spectre RMN 1H

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Nathalie Villa-Vialaneix , Rémi Servien
7ème Rencontres R, Jul 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-02791362 v1
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Using ASICS to quantify metabolites in 1D 1H NMR spectra: an application to perinatal survival in pigs

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Patrick Tardivel , Cécile Canlet , Marie Tremblay-Franco et al.
Journée des Plateformes BioInfo et BioStat du Génotoul, Jan 2018, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02788399 v1
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Multiple hot-deck imputation for network inference from RNA sequencing data

Alyssa Imbert , Armand Valsesia , Claudia Armenise , Gregory Lefebvre , Pierre-Antoine Gourraud et al.
European Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece
Communication dans un congrès hal-02788524 v1
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RNAseqNet : un package pour l'inférence de réseaux à partir de données RNA-seq

Alyssa Imbert , Nathalie Villa-Vialaneix
7ème Rencontres R, Jul 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-02791466 v1

An innovative method of gene co expression network inference reveals significant biological processes involved in fetal porcine muscle development

Maria Marti-Marimon , Nathalie Villa-Vialaneix , Valentin Voillet , Martine Yerle-Bouissou , Laurence Liaubet et al.
23rd International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics, Jun 2018, Saint Petersburg, Russia. pp.2
Communication dans un congrès hal-02734342 v1
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Learning from (dis)similarity data

Nathalie Vialaneix
European R Users Meeting (eRum 2018), May 2019, Budapest, Hungary. 70 p
Communication dans un congrès hal-02785273 v1

Adjacency-constrained hierarchical clustering of a band similarity matrix with application to genomics

Christophe Ambroise , Alia Dehman , Michel Koskas , Pierre Neuvial , Guillem Rigaill et al.
Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Dec 2018, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02788245 v1
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Accelerating stochastic kernel SOM

Jérôme J. Mariette , Fabrice Rossi , Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix
XXVth European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning, Apr 2017, Bruges, Belgium. 6 p
Communication dans un congrès hal-02734663 v1

Progesterone and betahydroxybutyrate in line measurements for a better description and understanding of Holstein cows fertility in field conditions

Claire Saby , Wenting Zhang , René Fournier , Rémi Servien , Nathalie Villa-Vialaneix et al.
8th European Conference on Precision Livestock Farming (EC-PLF), Sep 2017, Nantes, France. 7 p
Communication dans un congrès hal-01607267 v1

Random forests for big data

Robin Genuer , Jean-Michel Poggi , Christine Tuleau-Malot , Nathalie Villa-Vialaneix
10th International Conference of the ERCIM WG on Computational and Methodological Statistics, Dec 2017, Londres, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-02785199 v1
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Characterization of 3D genomic interactions in fetal pig muscle

Maria Eugenia Marti Marimon , Hervé Acloque , Matthias Zytnicki , David Robelin , Sarah Djebali Quelen et al.
36. International Society for Animal Genetics Conference (ISAG), Jul 2017, Dublin, Ireland. pp.43
Communication dans un congrès hal-02868765 v1
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Stochastic Self-Organizing Map variants with the R package SOMbrero

Nathalie Villa-Vialaneix
12th International Workshop on Self-Organizing Maps and Learning Vector Quantization, Clustering and Data Visualization (WSOM), Jun 2017, Nancy, France. 7 p., ⟨10.1109/WSOM.2017.8020014⟩
Communication dans un congrès hal-01605663 v1
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Unsupervised multiple kernel learning to integrate various metagenomic sources

Jérôme J. Mariette , Nathalie Villa-Vialaneix
4ème colloque de Génomique Environnementale, Sep 2017, Marseille, France
Communication dans un congrès hal-01604708 v1
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Accelerating stochastic kernel SOM

Jérôme J. Mariette , Fabrice Rossi , Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
XXVth European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning, Apr 2017, Bruges, Belgium. pp.269-274
Communication dans un congrès hal-01516660 v1

Using SOMbrero for clustering and visualizing complex data

Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix
9th International Conference of the ERCIM WG on Computational and Methodological Statistics, Dec 2016, Séville, Spain
Communication dans un congrès hal-01604379 v1

3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes

Yvette Lahbib Mansais , Maria Marti-Marimon , Valentin Voillet , Harmonie Barasc , Florence Mompart et al.
35. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2016, Salt Lake City, United States
Communication dans un congrès hal-02742818 v1

Random forests for big data

Nathalie N. Villa-Vialaneix , Robin Genuer , Jean-Michel Poggi , Christine Tuleau-Malot
Journées de Statistique de Rennes (JSTAR), Oct 2016, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-02796431 v1

Interval sparsity for functional inverse regression

Rémi Servien , Victor Picheny , Nathalie N. Villa-Vialaneix
2016 CRoNoS Summer Course, 22nd International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT), Aug 2016, Oviedo, Spain
Communication dans un congrès hal-02799603 v1
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Aggregating Self-Organizing Maps with Topology Preservation

Jérôme J. Mariette , Nathalie Vialaneix
WSOM 2016, Jan 2016, Houston, TX, United States. pp.27-37, ⟨10.1007/978-3-319-28518-4_2⟩
Communication dans un congrès hal-01270640 v1
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Outils pour l'analyse et la simulation de données RNA-seq

Alyssa Imbert , Nathalie N. Villa-Vialaneix
Cinquièmes Rencontres R 2016, Jun 2016, Toulouse, France. 2 p
Communication dans un congrès hal-02739876 v1

3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes in pig fetal cells

Yvette Lahbib Mansais , Maria Marti-Marimon , Valentin Voillet , Harmonie Barasc , Florence Mompart et al.
22. International Colloquim on Animal Cytogenetics and Genomics (ICACG), Jul 2016, Toulouse, France. 116 p
Communication dans un congrès hal-02743243 v1
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Sparse online self-organizing maps for large relational data

Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
WSOM 2016, Jan 2016, Houston, TX, United States. pp.27-37, ⟨10.1007/978-3-319-28518-4_6⟩
Communication dans un congrès hal-01270710 v1
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Integrating Tara oceans data sets using multiple kernels

Jérôme J. Mariette , Helene H. Chiapello , Nathalie N. Villa-Vialaneix
15th European Conference on Computational Biology (ECCB 2016), Workshop "Recent Computational Advances in Metagenomics (RCAM)", Sep 2016, The Hague, Netherlands. pp.3
Communication dans un congrès hal-02792439 v1

Multiway-SIR for longitudinal multi-table data integration

Valérie Sautron , Marie Chavent , Nathalie Viguerie , Nathalie N. Villa-Vialaneix
22nd International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT), Aug 2016, Oviedo, Spain. pp.1
Communication dans un congrès hal-02796270 v1

Using SOMbrero for clustering and visualizing complex data

Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
CMStatistics, Dec 2016, Seville, Spain
Communication dans un congrès hal-01519707 v1
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Parcimonie par intervalle pour la régression inverse par tranche fonctionnelle

Victor Picheny , Rémi Servien , Nathalie Vialaneix
48e Journées de Statistique de la SFdS, May 2016, Montpellier, France. pp.6
Communication dans un congrès hal-01325538 v1
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Imputation de données manquantes pour l'inférence de r éseau à partir de données RNA-seq

Alyssa Imbert , Caroline Le Gall , Claudia Armenise , Gregory Lefebvre , Jorg Hager et al.
48e Journées de la Société Française de Statistique, May 2016, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-01325523 v1
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Outils pour chercher de l'information sur R et se former

Nathalie N. Villa-Vialaneix , Christophe Bontemps , Sébastien Dejean
Cinquièmes Rencontres R 2016, Jun 2016, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02743654 v1
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Outils pour chercher de l'information sur R et se former

Nathalie Vialaneix , Christophe Bontemps , Sébastien Dejean
Rencontres R 2016, Jun 2016, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-01352178 v1
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Interpretable sparse sliced inverse regression for functional data

Victor Picheny , Rémi Servien , Nathalie N. Villa-Vialaneix
Workshop Learning with Functional Data, Oct 2016, Lille, France
Communication dans un congrès hal-02799481 v1
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Theoretical and applied aspects of the self-organizing maps

Marie Cottrell , Madalina Olteanu , Fabrice Rossi , Nathalie Vialaneix
WSOM 2016, Jan 2016, Houston, TX, United States. pp.3-26, ⟨10.1007/978-3-319-28518-4_1⟩
Communication dans un congrès hal-01270701 v1
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Enseigner la statistique pour l'analyse de mégadonnées

Philippe Besse , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Anne Ruiz-Gazen
47ème Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique (SFdS). FRA., Jun 2015, Lille, France
Communication dans un congrès hal-02742204 v1
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Enseigner la statistique pour l'analyse de mégadonnées

Philippe Besse , Nathalie Villa-Vialaneix , Anne Ruiz-Gazen
47èmes Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2015, Lille, France
Communication dans un congrès hal-01160638 v1
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Classification et visualisation de graphes avec SOMbrero

Madalina Olteanu , Nathalie N. Villa-Vialaneix
Quatrièmes Rencontres R, Jun 2015, Grenoble, France. pp.2
Communication dans un congrès hal-02795287 v1
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Multiple dissimilarity SOM for clustering and visualizing graphs with node and edge attributes

Nathalie Vialaneix , Madalina Olteanu
International Conference on Machine Learning, Workshop FEAST, Jul 2015, Lille, France. 1p
Communication dans un congrès hal-01175731 v1

What is a MOOC?

Nathalie N. Villa-Vialaneix
15th Annual Conference of ENBIS, Sep 2015, Prague, Czech Republic
Communication dans un congrès hal-02792063 v1
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Classification et visualisation de graphes avec SOMbrero

Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix
Quatrièmes Rencontres R, Jun 2015, Grenoble, France
Communication dans un congrès hal-01171557 v1
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Random forests and big data

Robin Genuer , Jean-Michel Poggi , Christine Tuleau-Malot , Nathalie Villa-Vialaneix
47ème Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, Jun 2015, Lille, France
Communication dans un congrès hal-01160643 v1

Adipose tissue signatures related to weight changes in response to calorie restriction and subsequent weight maintenance using lipidome and gene profiling network analysis

Emilie Montastier , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Ignacio González , Sylvie Caspar-Bauguil , Wim H.M. Saris et al.
Bioinformatics/Biostatistics regional workshop, Jun 2014, Toulouse, France. 2 p
Communication dans un congrès hal-02797111 v1
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Self-organizing maps for clustering and visualization of bipartite graphs

Madalina Olteanu , Nathalie N. Villa-Vialaneix
46e Journées de la Société Française de Statistique, Jun 2014, Rennes, France. pp.109
Communication dans un congrès hal-02739820 v1
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J'ai testé pour vous... un MOOC

Nathalie Vialaneix
Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2014, Rennes, France. pp.90
Communication dans un congrès hal-01001759 v1

Inferring networks from multiple samples with consensus LASSO

Nathalie Vialaneix , Matthieu Vignes , Nathalie Viguerie , Magali San Cristobal
ENBIS Spring Meeting, Apr 2014, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02793667 v1
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Self-Organizing Maps for clustering and visualization of bipartite graphs

Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
46e Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2014, Rennes, France. pp.109
Communication dans un congrès hal-01001991 v1
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Bagged kernel SOM

Jérôme J. Mariette , Madalina Olteanu , Julien Boelaert , Nathalie Vialaneix
10th International Workshop, WSOM 2014, Hochschule Esslingen University of Applied Sciences. DEU., Jul 2014, Mittweida, Germany. pp.45-54, ⟨10.1007/978-3-319-07695-9⟩
Communication dans un congrès hal-01018374 v1
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Reconstruction quality of a biological network when its constituting elements are partially observed

Victor Picheny , Jimmy Vandel , Matthieu Vignes , Nathalie Villa-Vialaneix
Seventeenth International Conference on Artificial Intelligence and Statistics (AI & Statistics 2014), Apr 2014, Reykjavik, Iceland. pp.L014
Communication dans un congrès hal-00982758 v1

SOMbrero: an R package for numeric and non-numeric self-organizing maps

Julien Boelaert , Laura Bendhaiba , Madalina Olteanu , Nathalie N. Villa-Vialaneix
WSOM 2014, Jul 2014, Mittweida, Germany. ⟨10.1007/978-3-319-07695-9_21⟩
Communication dans un congrès hal-02743631 v1
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Genetics systems of stress responses in pigs

Valérie Sautron , Elena Mormede Terenina , Pierre Mormède , Nathalie N. Villa-Vialaneix
Bioinformatics/Biostatistics regional workshop, Jun 2014, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02793146 v1
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SOMbrero: an R package for numeric and non-numeric Self-Organizing Maps

Julien Boelaert , Laura Bendhaiba , Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
10th International Workshop, WSOM 2014, Jul 2014, Mittweida, Germany. pp.219-228
Communication dans un congrès hal-01018732 v1
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Blood transcriptome response to LPS in pigs

Elodie Merlot , Armelle Prunier , Marie Damon , Florence Vignoles , Nathalie Villa-Vialaneix et al.
65. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2014, Copenhague, Denmark. pp.274
Communication dans un congrès hal-01210717 v1
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J'ai testé pour vous... un MOOC

Nathalie N. Villa-Vialaneix
46e Journées de la Société Française de Statistique, Société Française de Statistique (SFdS). FRA., Jun 2014, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-02740506 v1
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Data Analysis of Social Simulations Outputs - Focus on variables dispersion

Christophe Sibertin-Blanc , Nathalie Vialaneix
Workshop on Multi-Agent-Based Simulation, May 2014, Paris, France. Paper session 3, paper 2
Communication dans un congrès hal-00990219 v1
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Data analysis of social simulations outputs: Interpreting the dispersion of variables

Christophe Sibertin-Blanc , Nathalie Vialaneix
15th International Workshop on Multi-Agent-Based Simulation (MBAS 2014 @ AAMAS), May 2014, Paris, France. pp.133-150, ⟨10.1007/978-3-319-14627-0_10⟩
Communication dans un congrès hal-01270802 v1
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SOMbrero : Cartes auto-organisatrices stochastiques pour l'intégration de données décrites par des tableaux de dissimilarités

Laura Bendhaiba , Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix
2èmes Rencontres R, Jun 2013, Lyon, France. pp.99-100
Communication dans un congrès hal-00850514 v1
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sexy-rgtk: a package for programming RGtk2 GUI in a user-friendly manner

Damien Leroux , Nathalie Villa-Vialaneix
2èmes Rencontres R, Jun 2013, Lyon, France. pp.103-104
Communication dans un congrès hal-00850516 v1
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Which dissimilarity is to be used when extracting typologies in sequence analysis? A comparative study

Sébastien Massoni , Madalina Olteanu , Nathalie N. Villa-Vialaneix
International Workshop on Artificial Neural Networks, Jun 2013, Puerto de la Cruz, Tenerife, Spain
Communication dans un congrès hal-02806089 v1
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Multiple kernel self-organizing maps

Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix , Christine Cierco-Ayrolles
European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning, Apr 2013, Bruges, Belgium. pp.83
Communication dans un congrès hal-00817920 v1
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Carte auto-organisatrice pour graphes étiquetés.

Nathalie Villa-Vialaneix , Madalina Olteanu , Christine Cierco-Ayrolles
Atelier Fouilles de Grands Graphes (FGG) - EGC'2013, Jan 2013, Toulouse, France. pp.Article numéro 4
Communication dans un congrès hal-00783860 v1
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On-line relational SOM for dissimilarity data

Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix , Marie Cottrell
WSOM 2012, Dec 2012, Santiago, Chile. pp.13-22
Communication dans un congrès hal-00768948 v1
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Consensus LASSO : inférence conjointe de réseaux de gènes dans des conditions expérimentales multiples

Nathalie Villa-Vialaneix , Magali San Cristobal
45èmes Journées de Statistique de la SFdS, May 2013, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-00829157 v1

Carte auto-organisatrice pour graphes étiquetés

Nathalie N. Villa-Vialaneix , Madalina Olteanu , Christine Cierco-Ayrolles
Atelier Fouilles de Grands Graphes - EGC, Jan 2013, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02807496 v1
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Which dissimilarity is to be used when extracting typologies in sequence analysis? A comparative study

Sébastien Massoni , Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix
IWANN 2013, Jun 2013, Puerto de la Cruz, Tenerife, Spain. session 12-1A, paper 2
Communication dans un congrès hal-00854302 v1
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Classification non supervisée d'un graphe de co-expression avec des méta-données pour la détection de micro-ARNs

Florian Brunet , Jérôme J. Mariette , Christine Cierco-Ayrolles , Christine Gaspin , Philippe Bardou et al.
MARAMI (Modèles et l'Analyse des Réseaux : Approches Mathématiques et Informatiques) 2013, Oct 2013, Saint-Étienne, France. pp.SI-1
Communication dans un congrès hal-00877561 v1
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Multiple kernel self-organizing maps

Madalina Olteanu , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Christine Cierco-Ayrolles
21. European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning (ESANN 2013), Apr 2013, Bruges, Belgium
Communication dans un congrès hal-02747111 v1
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Comparison of network inference packages and methods for multiple network inference

Nathalie Villa-Vialaneix , Nicolas A. Edwards , Laurence Liaubet , Nathalie Viguerie , Magali San Cristobal
1ères Rencontres R, Jul 2012, Bordeaux, France. pp.93-94
Communication dans un congrès hal-00714444 v1

Exploration relationnelle d'un corpus d'actes notariés médiévaux

Nathalie Villa-Vialaneix , Fabrice Rossi , Florent Hautefeuille
Colloque Configuration(s), Jun 2012, Paris, France
Communication dans un congrès hal-00721403 v1
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Comparison of network inference packages and methods for multiple network inference

Nathalie Villa-Vialaneix , Nicolas A. Edwards , Laurence Liaubet , Nathalie Viguerie , Magali San Cristobal
1ères Rencontres R, Jul 2012, Bordeaux, France
Communication dans un congrès hal-00717549 v1
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Analyse de données pour des graphes étiquetés

Thibault Laurent , Nathalie Villa-Vialaneix
44èmes Journées de Statistique, May 2012, Bruxelles, Belgique. pp.196
Communication dans un congrès hal-00707779 v1
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Genetic and phenotypic fine characterizations of French porcine reference populations

Magali San Cristobal , Simon Boitard , Maria Inès Fariello Rico , Hélène Gilbert , Laurence Liaubet et al.
ISAG, Jul 2012, Cairns, Australia. pp.1
Communication dans un congrès hal-01019125 v1

Exploration of a Large Database of French Charters with Social Network Methods

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix , Florent Hautefeuille
International Medieval Congress (IMC 2011), Jul 2011, Leeds, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-00668229 v1
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L'analyse d'un réseau de co-expression génique met en valeur des groupes fonctionnels homogènes et des gènes importants relatifs a un phénotype d'intérêt

Nathalie Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Thibault Laurent , Adrien Gamot , Pierre Cherel et al.
Journées de la Société Française de Statistique, May 2011, Tunis, Tunisie. pp.172
Communication dans un congrès hal-00666613 v1
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Diversité et biologie intégrative : des pistes à explorer pour combler le gap entre diversité génétique et diversité phénotypique

Magali San Cristobal , Simon S. Boitard , Marcel M. Bouffaud , Cécile Canlet , Leonor L. Chaltiel et al.
COLLOQUE FRB : Les Ressources Génétiques (RG) face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociétaux, Sep 2011, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-01000087 v1
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Sensitivity of the process-based model DNDC on microbiological parameters

Adrian Leip , Marco Follador , Stefano Tarantola , Mirko Busto , Nathalie Villa-Vialaneix
Nitrogen and Global Change - Key findings & Future challenges, Apr 2011, Edinburgh, United Kingdom. pp.S10
Communication dans un congrès hal-00674167 v1
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Classification and regression based on derivatives : a consistency result

Nathalie Villa-Vialaneix , Fabrice Rossi
II Simposio sobre Modelamiento Estadístico, Dec 2010, Valparaiso, Chile
Communication dans un congrès hal-00668212 v1
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A comparison of three learning methods to predict N2O fluxes and N leaching

Nathalie Villa-Vialaneix , Marco Follador , Adrian Leip
Modèles et Apprentissage en Sciences Humaines et Sociales, Jun 2010, Lille, France. pp.57-66
Communication dans un congrès hal-00491583 v1
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Analysis of the influence of a network on the values of its nodes : the use of spatial indexes.

Thibault Laurent , Nathalie Villa-Vialaneix
Modèles et l′Analyse des Réseaux : Approches Mathématiques et Informatique, Oct 2010, Toulouse, France. pp.Session 1 - 1
Communication dans un congrès hal-00668202 v1
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A functional density-based nonparametric approach for statistical calibration

Noslen Hernández , Rolando Biscay , Nathalie Villa-Vialaneix , Isneri Talavera
15th Iberoamerican Congress on Pattern Recognition (CIARP 2010), Nov 2010, Sao Paulo, Brazil. pp.450-457, ⟨10.1007/978-3-642-16687-7_60⟩
Communication dans un congrès hal-00658811 v1
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Phenotypic prediction based on metabolomic data : lasso vs Bolasso, primary data vs wavelet transformation

Florian Rohart , Nathalie Villa-Vialaneix , Alain Paris , Cécile Canlet , J. Molina et al.
World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany. pp.3-55
Communication dans un congrès hal-00658819 v1
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The structure of a gene network reveals 7 biological sub-graphs underlying eQTLs in pig

Laurence Liaubet , Nathalie Villa-Vialaneix , Adrien Gamot , Fabrice Rossi , Pierre Cherel et al.
World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany. pp.0147
Communication dans un congrès hal-00666597 v1
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Recherche et représentation de communautés dans des grands graphes

Nathalie Villa , Taoufiq Dkaki , Sébastien Gadat , Jean-Michel Inglebert , Quoc-Dinh Truong
Veille Stratégique Scientifique & Technologique, Mar 2009, Nancy, France. Recherche et représentation de communautés dans des grands graphes
Communication dans un congrès hal-00371956 v1
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Topologically Ordered Graph Clustering via Deterministic Annealing

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix
European Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2009, Bruges, Belgium. pp.529-534
Communication dans un congrès hal-00666602 v1

Are gene networks always meaningful ?

Adrien Gamot , Nathalie Villa , Laurence Liaubet , F. Rossi , Gwenola Tosser-Klopp et al.
EADGENE Genomics for Animal Health: Outlook for the Future, Oct 2009, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02816128 v1
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Méthode de classification organisée pour la recherche de communautés dans les réseaux sociaux

Nathalie Villa , Fabrice Rossi
41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France
Communication dans un congrès inria-00386797 v1

Are gene networks always meaningful?

Adrien Gamot , Nathalie Villa , Laurence Liaubet , Fabrice Rossi , Gwenola Tosser-Klopp et al.
European Animal Disease Genomics Network of Excellence for Animal Health and Food Safety (EADGENE Days 2009), Oct 2009, Paris, France
Communication dans un congrès hal-00668239 v1
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Mining a medieval social network by kernel SOM and related methods

Nathalie Villa , Fabrice Rossi , Quoc-Dinh Truong
MASHS 2008 (Modèles et Apprentissages en Sciences Humaines et Sociales), Jun 2008, Créteil, France
Communication dans un congrès hal-00278196 v1
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Consistency of Derivative Based Functional Classifiers on Sampled Data

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix
ESANN 2008, 16th European Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2008, Bruges, Belgium. pp.445-450
Communication dans un congrès hal-00666609 v1
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A comparison between dissimilarity SOM and kernel SOM for clustering the vertices of a graph

Nathalie Villa-Vialaneix , Fabrice Rossi
WSOM'07 - Workshop on Self-Organizing Maps, Sep 2007, Bielefeld, Germany. pp.WeP-1
Communication dans un congrès hal-00674189 v1
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Sur l'analyse de réseaux de sociabilité de la société paysanne médiévale

Romain Boulet , Florent Hautefeuille , Bertrand Jouve , Pascale Kuntz , Bleuenn Le Goffic et al.
Computational Methods for Modelling and learning in Social and Human Sciences (MASHS), May 2007, Brest, France. pp.3b-3
Communication dans un congrès hal-00674238 v1
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Clustering a medieval social network by SOM using a kernel based distance measure

Nathalie Villa , Romain Boulet
European Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2007, Bruges, Belgium. pp.31-36
Communication dans un congrès hal-00145117 v1
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SVM fonctionnels par interpolation spline

Nathalie Villa , Fabrice Rossi
Journée de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2006, Clamart (FR), France
Communication dans un congrès hal-04176653 v1
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Integrating Remote Sensing, GIS and Prediction Models to Monitor the Deforestation and Erosion in Peten Reserve, Guatemala

Roberto Bruno , Marco Follador , Martin Paegelow , Fernanda Renno , Nathalie Villa
IAMG'2006 Annual Conference on Quantitative Geology from Multiple Sources, Sep 2006, Liège, Belgium. pp.Integrating Remote Sensing, GIS and Prediction Models to Monitor the Deforestation and Erosion in Pe
Communication dans un congrès hal-00372648 v1
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Support Vector Machine For Functional Data Classification

Nathalie Villa , Fabrice Rossi
XIIIth European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning (ESANN 2005), Apr 2005, Bruges, Belgium. pp.467-472
Communication dans un congrès hal-04176766 v1
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Classification in Hilbert Spaces with Support Vector Machines

Fabrice Rossi , Nathalie Villa
XIth International Symposium on Applied Stochastic Models and Data Analysis (ASMDA 2005), May 2005, Brest, France. pp.635-642
Communication dans un congrès hal-04176760 v1

P13-31 Characterization of human isogenic epithelial cell lines as a relevant tool to study colon carcinogenesis and interaction between genes and environment

Arnaud Tête , L. Arnaud , H. Le Mentec , N. Poupin , I. Gallais et al.
58th Congress of the European Societies of Toxicology (EUROTOX 2024), Sep 2024, Copenhagen, Denmark. 399, pp.S222-S223, 2024, ⟨10.1016/j.toxlet.2024.07.547⟩
Poster de conférence hal-04690388 v1

Neonatal metabolic profiling shows relationships between metabolites and biometric phenotypes related to piglet maturity at birth

Laurence Liaubet , Gaëlle Lefort , Yvon Billon , Sébastien Reigner , Jean Bailly et al.
11th International Conference on Pig Reproduction (ICPR), Jun 2023, Ghent, Belgium. 90 (7), p. 732, n°49, 2023
Poster de conférence hal-04121651 v1

1H-NMR metabolomic study of Large White and Meishan pigs in late gestation: part 2 - sow endometrium

Alyssa Imbert , Nassim Duprat , Nathalie Marty-Gasset , Laure Gress , Cécile Canlet et al.
Joint International Congress on Animal Science (EEAP 2023), Aug 2023, Lyon, France. pp.37.22
Poster de conférence hal-04193451 v1
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Transcriptome of the feto-maternal interface in pigs in late gestation: part2 - sow endometrium

Agnès Bonnet , Sarah Maman , Laure Gress , Amandine Suin , Sabrina Legoueix et al.
Joint International Congress on Animal Science (EEAP 2023), Aug 2023, Lyon, France. pp.37.21
Poster de conférence hal-04193444 v1
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Transcriptome of the feto-maternal interface in pigs in late gestation: part1fetal placenta

Agnès Bonnet , Sarah Maman , Laure Gress , Amandine Suin , Céline Bravo et al.
Joint International Congress on Animal Science (EEAP 2023), Aug 2023, Lyon, France. pp.37.20
Poster de conférence hal-04193423 v1
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Characterization of the endometrial metabolome in late gestation

Alyssa Imbert , Nathalie Marty-Gasset , Laure Gress , Cecile Bonnefont , Nathalie Vialaneix et al.
International Conference on Pig Reproduction 2023, Jun 2023, Gent, Belgium
Poster de conférence hal-04126140 v1
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ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

Élise Maigné , Céline Noirot , Jérôme J. Mariette , Yaa Adu Kesewaah , Sébastien Dejean et al.
ECCB: 21st European Conference on Computational Biology, Sep 2022, Sitges, Spain. , 2022, ⟨10.7490/f1000research.1119290.1⟩
Poster de conférence hal-03890660 v1
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Identification par une approche de métabolomique des voies métaboliques associées à la fragilité dans une cohorte de personnes âgées

Céline Bougel , Rémi Servien , Nathalie Vialaneix , Cécile Canlet , Laurent Debrauwer et al.
Journées Francophones de la Nutrition, Nov 2022, Toulouse, France
Poster de conférence hal-03856941 v1

Leçons apprises de l' évaluation des méthodes d'inférence de réseau de gènes chez Bacillus subtilis

Léa Grima , Celine Brouard , Simon De Givry , Anne Goelzer , Élise Maigné et al.
Journée Régionale Bioinfo/Biostat, Dec 2022, Toulouse, France.
Poster de conférence hal-03882985 v1

Characterization of human isogenic epithelial cell lines as a relevant tool to study colon carcinogenesis and interaction between genes and environment

Arnaud Tête , Liana C. Arnaud , Hélène Le Mentec , Isabelle Gallais , Nathalie Poupin et al.
Society of Toxicology Annual Meeting (SOT 2022), Mar 2022, San Diego, United States. , 3579, pp.P204
Poster de conférence hal-03637792 v1
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ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

Élise Maigné , Céline Noirot , Jérôme J. Mariette , Yaa Adu Kesewaah , Sébastien Dejean et al.
Journée Régional Bioinfo/Biostat, Dec 2022, Toulouse, France
Poster de conférence hal-03882998 v1
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Characterization of human isogenic epithelial cell lines as a relevant tool to study colon carcinogenesis and interaction between genes and environment

Arnaud Tête , Liana C. Arnaud , Hélène Le Mentec , Isabelle Gallais , Noémie Tournadre et al.
Congrès Annuel de la Société Française de Biochimie et Biologie Moléculaire, Jul 2021, Paris, France
Poster de conférence hal-03279912 v1
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Joint automatic metabolite identification and quantification of a set of 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Nathalie Marty-Gasset , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix et al.
Metabolomics 2020, Oct 2020, online, France
Poster de conférence hal-02984360 v1
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Étude de la maturité des porcelets en fin de gestation par une approche métabolomique multifluide

Gaëlle Lefort , Nathalie Vialaneix , Hélène Quesnel , Marie-Christine Pere , Yvon Billon et al.
52. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2020, Paris, France. IFIP - Institut du Porc, Journées de la Recherche Porcine en France, pp.411-412, 2020, 52èmes journées de la recherche porcine
Poster de conférence hal-02479994 v1

ASICS: identification and quantification of metabolites in complex 1D 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Hélène Quesnel , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix et al.
15th Annual Conference of the Metabolomics Society (Metabolomics 2019), Jun 2019, La Haye, Netherlands. , 2019
Poster de conférence hal-02790207 v1
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Adjacency-constrained hierarchical clustering of a band similarity matrix with application to genomics

Christophe Ambroise , Alia Dehman , Pierre Neuvial , Guillem Rigaill , Nathalie Vialaneix
Statistical Methods for Post Genomic Data (SMPGD 2019), Jan 2019, Barcelona, Spain. 2019
Poster de conférence hal-02790995 v1
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ASICS : un package R pour l'identification et la quantification de métabolites dans un spectre RMN 1H

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix , Rémi Servien
Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Oct 2019, Toulouse, France. 2019
Poster de conférence hal-02788670 v1

ASICS: a new R package for identification and quantification of metabolites in complex 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Hélène Quesnel , Nathalie Vialaneix et al.
useR! 2019, Jul 2019, Toulouse, France. , 2019
Poster de conférence hal-02788659 v1

Study of fetal pig maturity in relation with neonatal survival using a multi-fluids metabolomic approach

Gaëlle Lefort , Nathalie Vialaneix , Hélène Quesnel , Marie-Christine Pere , Nathalie Iannuccelli et al.
15. Annual Conference of the Metabolomics Society (Metabolomics 2019), Jun 2019, La Haye, Netherlands. , 2019
Poster de conférence hal-02791588 v1
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Classification ascendante hiérarchique, contrainte d'ordre : conditions d'applicabilité, interprétabilité des dendrogrammes

Nathanaël Randriamihamison , Pierre Neuvial , Nathalie Vialaneix
Conférence sur l'Apprentissage Automatique (CAp 2019), Jul 2019, Toulouse, France. , 2019
Poster de conférence hal-02786174 v1

Integrative analyses of chromosome conformation, chromatin accessibility and gene expression in human and livestock genomes

Camille Mestre , Sarah Djebali Quelen , Thomas Faraut , Nathalie Vialaneix , Andrea Rau et al.
European Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece. , 2018
Poster de conférence hal-02784857 v1

Developpement de biomarqueurs sanguins pour évaluer la sensibilité des porcs à la chaleur

Samir Dou , Nathalie Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Hélène Gilbert , Jean-Luc Gourdine et al.
Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2018), Apr 2018, Rennes, France. , 2018, Journées d’animation scientifiques du département Phase - Recueil des résumés
Poster de conférence hal-02736216 v1

ASICS: a new R package for identification and quantification of metabolites in complex 1D 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix , Rémi Servien
European Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece. , 2018
Poster de conférence hal-02789726 v1

Integrative and differential analysis of transcriptomes and chromatin accessibility regions reveals regulatory mechanisms involved in pig immune and metabolic functions

Sarah Djebali Quelen , Kylie Munyard , Nathalie Villa-Vialaneix , Cédric Cabau , Andrea Rau et al.
36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book
Poster de conférence hal-01603033 v1
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Characterization of 3D genomic interactions in fetal pig muscle

Maria Marti-Marimon , Hervé Acloque , Matthias Zytnicki , Sarah Djebali Quelen , Nathalie Villa-Vialaneix et al.
36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book
Poster de conférence hal-01608046 v1
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Profiling the landscape of transcription, chromatin accessibility and chromosome conformation of cattle, pig, chicken and goat genomes [FAANG pilot project]

Sylvain Foissac , Sarah Djebali Quelen , Hervé Acloque , Philippe Bardou , Fany Blanc et al.
36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book
Poster de conférence hal-01608449 v1

Reprise de cyclicité post partum et performances de reproduction chez la vache laitière Prim'Holstein en France

Claire Saby , Wenting Zhang , René Fournier , Rémi Servien , Nathalie Villa-Vialaneix et al.
Journées Nationales des GTV 2017, May 2017, Reims, France. , 7 p., 2017, Recueil des Journées Nationales des GTV 2017
Poster de conférence hal-01607513 v1
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Multiway SIR for biological data integration

Valérie Sautron , Marie Chavent , Nathalie Viguerie , Nathalie N. Villa-Vialaneix
Statistical Methods for Post Genomic Data, Feb 2016, Lille, France. , 2016
Poster de conférence hal-02791870 v1

Estimating nitrous oxide fluxes from agricultural soils at European scale using a crop generic meta-model

Lily Paniagua , Adrian Leip , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Wim de Vries
19th Nitrogen Workshop, Jun 2016, Skara, Sweden. , 2016
Poster de conférence hal-02796798 v1

3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes in pig fetal cells

Yvette Lahbib Mansais , Maria Marti-Marimon , Valentin Voillet , Harmonie Barasc , Florence Mompart et al.
Conference on Genome Architecture in Space and Time, Jun 2016, Trieste, Italy. 2016
Poster de conférence hal-02794242 v1

Time course of the response to ACTH in pig: biological and transcriptomic study

Valérie Sautron , Elena Mormede Terenina , Laure Gress , Yannick Lippi , Yvon Billon et al.
35. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2016, Salt Lake City, United States. ASAS - American Society of Animal Science, 94 (S4), 2016, 35th Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG)
Poster de conférence hal-02740976 v1
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Reconstruction quality of a biological network when its constituting elements are partially observed

Victor Picheny , Jimmy Vandel , Matthieu Vignes , Nathalie N. Villa-Vialaneix
17th International Conference on Artificial Intelligence and Statistics - AI & Statistics 2014, Apr 2014, Reykjavik, Iceland. , pp.1, 2014, AISTATS 2014 Talks and Papers
Poster de conférence hal-02739296 v1
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Comprendre l'organisation spatiale de l'ADN à l'aide de la statistique

Pierre Neuvial , Sylvain Foissac , Nathalie Vialaneix
Martina Knoop, Stéphane Blanc, Mokrane Bouzeghoub. L’Interdisciplinarité, CNRS Editions, pp.178-182, 2023
Chapitre d'ouvrage hal-03930070 v1
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Des noyaux pour les omiques

Jérôme J. Mariette , Nathalie Vialaneix
Intégration de Données Biologiques, 2022
Chapitre d'ouvrage hal-03809784 v1
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Kernel and dissimilarity methods for exploratory analysis in a social context

Jérôme J. Mariette , Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix
Advances in Contemporary Statistics and Econometrics. Festschrift in Honor of Christine Thomas-Agnan, 2021
Chapitre d'ouvrage hal-03279887 v1
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Apprentissage connexionniste

Nathalie Villa-Vialaneix , Stéphane Canu
Apprentissage Statistique et Données Massives, Editions Technip, pp.536, 2018, 9782710811824
Chapitre d'ouvrage hal-01849298 v1

Large-Scale Measurement of mRNA Degradation in Escherichia coli: To Delay or Not to Delay

Sandrine Laguerre , Ignacio González , Sébastien Nouaille , Annick Moisan , Nathalie Villa-Vialaneix et al.
High-density sequencing applications in microbial molecular genetics, 612, ELSEVIER ACADEMIC PRESS INC, pp.47-66, 2018, Methods in Enzymology, 978-0-12-815993-4. ⟨10.1016/bs.mie.2018.07.003⟩
Chapitre d'ouvrage hal-02107623 v1
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Méthodes pour l’apprentissage de données massives

Nathalie Villa-Vialaneix , Fabrice Rossi
Apprentissage Statistique et Données Massives, Editions Technip, pp.536, 2018, 9782710811824
Chapitre d'ouvrage hal-01849297 v1
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Depicting gene co-expression networks underlying eQTLs

Nathalie Vialaneix , Laurence Liaubet , Magali San Cristobal
Haja N. Kadarmideen. Systems Biology in Animal Production and Health vol 2, 2, Springer International Publishing, pp.1-31, 2016, 978-3-319-43330-1. ⟨10.1007/978-3-319-43332-5_1⟩
Chapitre d'ouvrage hal-01390589 v1
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Prospective modelling of environmental dynamics. A methodological comparison applied to mountain land cover changes

Martin Paegelow , Maria T. Camacho Olmedo , Frédéric Ferraty , Louis Ferré , Pascal Sarda et al.
Modelling Environmental Dynamics, Springer, pp.141-168, 2008, ⟨10.1007/978-3-540-68498-5_5⟩
Chapitre d'ouvrage hal-00667123 v1
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Tropical deforestation modelling : a comparative analysis of different predictive approaches. The case study of Peten, Guatemala.

Marco Follador , Nathalie Villa , Martin Paegelow , Fernanda Renno , Roberto Bruno
Modelling Environmental Dynamics, Springer, pp.77-108, 2008, ⟨10.1007/978-3-540-68498-5_3⟩
Chapitre d'ouvrage hal-00667122 v1

Recent advances in the use of SVM for functional data classification

Fabrice Rossi , Nathalie Villa
Sophie Dabo-Niang, Frédéric Ferraty. Functional and operatorial statistics, Physica-Verlag/Springer, pp.273-280, 2008, Contrib. Statist., ⟨10.1007/978-3-7908-2062-1_41⟩
Chapitre d'ouvrage istex hal-00635480 v1
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Contributions à l’analyse de données non vectorielles

Nathalie Villa-Vialaneix
Applications [stat.AP]. Université Toulouse 1 Capitole (UT1 Capitole), 2014
HDR tel-01523743 v1
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Contributions à l'analyse de données non vectorielles

Nathalie Villa-Vialaneix
Statistiques [math.ST]. Université de Toulouse, 2014
HDR tel-01088152 v1

SOMbrero: SOM Bound to Realize Euclidean and Relational Outputs

Nathalie Vialaneix , Elise Maigne , Jerome Mariette , Madalina Olteanu , Fabrice Rossi
Logiciel hal-04860539 v1

NMFProfiler

Aurélie Mercadié , Eric Casellas , Eléonore Gravier , Gwendal Josse , Nathalie Vialaneix et al.
Logiciel hal-04683370 v1

ASTERICS

Elise Maigné , Céline Noirot , Julien Henry , Yaa Adu Kesewaah , Ludovic Badin et al.
Logiciel hal-04095877 v1

RNAseqNet: Log-Linear Poisson Graphical Model with Hot-Deck Multiple Imputation (R package, available on CRAN)

Nathalie Vialaneix , Alyssa Imbert
2018
Logiciel hal-02788053 v1

ASICS: Automatic Statistical Identification in Complex Spectra (R package, available on Bioconductor)

Gaëlle Lefort , Rémi Servien , Patrick Tardivel , Nathalie Vialaneix
2017
Logiciel hal-02790128 v1

mixKernel: Omics Data Integration Using Kernel Methods

Jérôme J. Mariette , Nathalie Vialaneix
2017
Logiciel hal-02791779 v1

adjclust: Adjacency-Constrained Clustering of a Block-Diagonal Similarity Matrix (R package, available on CRAN)

Pierre Neuvial , Christophe Ambroise , Shubham Chaturvedi , Alia Dehman , Michel Koskas et al.
2017
Logiciel hal-02791370 v1

SISIR: Sparse Interval Sliced Inverse Regression (R package, available on CRAN)

Nathalie Vialaneix , Victor Picheny , Rémi Servien
2016
Logiciel hal-02794207 v1

SOMbrero: SOM Bound to Realize Euclidean and Relational Outputs (R package, available on CRAN)

Nathalie Vialaneix , Jérôme J. Mariette , Madalina Olteanu , Fabrice Rossi , Laura Bendhaiba et al.
2015
Logiciel hal-02794474 v1