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Nathalie Vialaneix

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Publications

A single-cell atlas of transcriptome changes in the intestinal epithelium at the suckling-to-weaning transition in male rabbits

Tania Malonga , Christelle Knudsen , Julie Alberge , Emeline Lhuillier , Patrick Aymard et al.

Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology, 2026, 20 (1), pp.101628. ⟨10.1016/j.jcmgh.2025.101628⟩

Article dans une revue hal-05528807v1

Serum metabolomic signatures associated with frailty-related phenotypes in a cohort of older people

Céline Bougel , Rémi Servien , Nathalie Vialaneix , Elise Maigne , Yves Boirie et al.

GeroScience, In press, ⟨10.1007/s11357-026-02116-y⟩

Article dans une revue hal-05524168v1
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No detectable impact of chronic oral lactic acid exposure on honey bee health: Insights from survival, lactate accumulation and head transcriptome

Caroline Vilarem , Vincent Piou , Lucie Bouly , Frédéric Julien , Rachel Fourdin et al.

Ecotoxicology and Environmental Safety, 2025, 303, pp.118807. ⟨10.1016/j.ecoenv.2025.118807⟩

Article dans une revue hal-05314855v1
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Metabolomic analysis of the endometrium of Large White and Meishan pigs reveals differences in biological processes during late gestation

Agnes Bonnet , Alyssa Imbert , Laure Gress , Nathalie Marty-Gasset , Annabelle Meynadier et al.

BMC Genomics, 2025, 27 (1), pp.11. ⟨10.1186/s12864-025-12276-4⟩

Article dans une revue hal-05461714v1
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Phoenics: a novel statistical approach for longitudinal metabolomic pathway analysis

Camille Guilmineau , Marie Tremblay-Franco , Nathalie Vialaneix , Rémi Servien

BMC Bioinformatics, 2025, 26 (1), pp.105. ⟨10.1186/s12859-025-06118-z⟩

Article dans une revue hal-05037118v1
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A comprehensive review and benchmark of differential analysis tools for Hi-C data

Elise Jorge , Sylvain Foissac , Pierre Neuvial , Matthias Zytnicki , Nathalie Vialaneix

Briefings in Bioinformatics, 2025, 26 (2), ⟨10.1093/bib/bbaf074⟩

Article dans une revue hal-04989132v1

NMFProfiler: a multi-omics integration method for samples stratified in groups

Aurélie Mercadié , Éléonore Gravier , Gwendal Josse , Isabelle Fournier , Cécile Viodé et al.

Bioinformatics, 2025, 41 (2), pp.btaf066. ⟨10.1093/bioinformatics/btaf066⟩

Article dans une revue hal-04992913v1

The CRAN Task View Initiative

Achim Zeileis , Roger Bivand , Dirk Eddelbuettel , Kurt Hornik , Julia Piaskowski et al.

The R Journal, 2025, 17 (2), pp.4-14. ⟨10.32614/RJ-2025-011⟩

Article dans une revue hal-05332611v1
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A two-sample tree-based test for hierarchically organized genomic signals

Pierre Neuvial , Nathanaël Randriamihamison , Marie Chavent , Sylvain Foissac , Nathalie Vialaneix

Journal of the Royal Statistical Society: Series C Applied Statistics, 2024, pp.qlae011. ⟨10.1093/jrsssc/qlae011⟩

Article dans une revue hal-04516167v1
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A random forest approach for interval selection in functional regression

Rémi Servien , Nathalie Vialaneix

Statistical Analysis and Data Mining, 2024, 17 (4), pp.e11705. ⟨10.1002/sam.11705⟩

Article dans une revue hal-04663826v1
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RNA-seq data of pig placenta and endometrium during late gestation

Sarah Maman-Haddad , Laure Gress , Amandine Suin , Nathalie Vialaneix , Agnès Bonnet

Data in Brief, 2024, 57, pp.111178. ⟨10.1016/j.dib.2024.111178⟩

Article dans une revue (data paper) hal-04831303v1

Should we really use graph neural networks for transcriptomic prediction?

Céline Brouard , Raphaël Mourad , Nathalie Vialaneix

Briefings in Bioinformatics, 2024, 25 (2), pp. bbae027. ⟨10.1093/bib/bbae027⟩

Article dans une revue hal-04459067v1
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BEST4 + cells in the intestinal epithelium

Tania Malonga , Nathalie Vialaneix , Martin Beaumont

American Journal of Physiology - Cell Physiology, 2024, 326 (5), pp.C1345-C1352. ⟨10.1152/ajpcell.00042.2024⟩

Article dans une revue hal-04572846v1
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ASTERICS: A Simple Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

Élise Maigné , Céline Noirot , Julien Henry , Yaa Adu Kesewaah , Ludovic Badin et al.

BMC Bioinformatics, 2023, 24 (1), pp.391. ⟨10.1186/s12859-023-05504-9⟩

Article dans une revue hal-04248315v1
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Plasma 1H-NMR metabolic and amino acid profiles of newborn piglets from two lines divergently selected for residual feed intake

Laurence Liaubet , Camille Guilmineau , Gaëlle Lefort , Yvon Billon , Sébastien Reigner et al.

Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.7127. ⟨10.1038/s41598-023-34279-5⟩

Article dans une revue hal-04091374v1
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Feature selection for kernel methods in systems biology

Celine Brouard , Jérôme J. Mariette , Rémi Flamary , Nathalie Vialaneix

NAR Genomics and Bioinformatics, 2022, 4 (1), ⟨10.1093/nargab/lqac014⟩

Article dans une revue hal-03601435v1
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Network analyses reveal negative link between changes in adipose tissue GDF15 and BMI during dietary-induced weight loss

Alyssa Imbert , Nathalie Vialaneix , Julien Marquis , Julie Vion , Aline Charpagne et al.

Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism, 2022, 107 (1), pp.e130-e142. ⟨10.1210/clinem/dgab621⟩

Article dans une revue hal-03540946v1
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R-miss-tastic: a unified platform for missing values methods and workflows

Imke Mayer , Aude Sportisse , Nicholas Tierney , Nathalie Vialaneix , Julie Josse

The R Journal, 2022, 14 (2), pp.244-266. ⟨10.32614/RJ-2022-040⟩

Article dans une revue hal-02879337v3
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Joint automatic metabolite identification and quantification of a set of 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Nathalie Marty-Gasset , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix et al.

Analytical Chemistry, 2021, 93 (5), pp.2861-2870. ⟨10.1021/acs.analchem.0c04232⟩

Article dans une revue hal-03224485v1
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Major reorganization of chromosome conformation during muscle development in pig

Maria Marti-Marimon , Nathalie Vialaneix , Yvette Lahbib Mansais , Matthias Zytnicki , Sylvie Camut et al.

Frontiers in Genetics, 2021, 12, pp.19 P. ⟨10.3389/fgene.2021.748239⟩

Article dans une revue hal-03367056v1
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Applicability and interpretability of Ward's hierarchical agglomerative clustering with or without contiguity constraints

Nathanaël Randriamihamison , Nathalie Vialaneix , Pierre Neuvial

Journal of Classification, 2021, 38, pp.363-389. ⟨10.1007/s00357-020-09377-y⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02294847v2
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The maturity in fetal pigs using a multi-fluid metabolomic approach

Gaëlle Lefort , Rémi Servien , Hélène Quesnel , Yvon Billon , Laurianne L. Canario et al.

Scientific Reports, 2020, 10, pp.19912. ⟨10.1038/s41598-020-76709-8⟩

Article dans une revue hal-03034560v1
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ASICS: an R package for a whole analysis workflow of 1D 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Patrick Tardivel , Marie-Christine Pere et al.

Bioinformatics, 2019, 35 (21), pp.4356-4363. ⟨10.1093/bioinformatics/btz248⟩

Article dans une revue hal-02626125v1
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Interpretable sparse SIR for functional data

Victor Picheny , Rémi Servien , Nathalie Vialaneix

Statistics and Computing, 2019, 29 (2), pp.255 - 267. ⟨10.1007/s11222-018-9806-6⟩

Article dans une revue hal-02618466v1
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Multi-species annotation of transcriptome and chromatin structure in domesticated animals

Sylvain Foissac , Sarah Djebali , Kylie Munyard , Nathalie Vialaneix , Andrea Rau et al.

BMC Biology, 2019, 17 (1), 25 p. ⟨10.1186/s12915-019-0726-5⟩

Article dans une revue hal-02437599v1

Reprise atypique de la cyclicité ovarienne chez la vache laitière : une forte association avec la cétose

Sylvie S. Chastant-Maillard , Claire Saby , Wenting Zhang , René Fournier , Rémi Servien et al.

Le Point vétérinaire, 2019, 393

Article dans une revue hal-02617694v1
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Adjacency-constrained hierarchical clustering of a band similarity matrix with application to Genomics

Christophe Ambroise , Alia Dehman , Pierre Neuvial , Guillem Rigaill , Nathalie Vialaneix

Algorithms for Molecular Biology, 2019, 14, pp.22. ⟨10.1186/s13015-019-0157-4⟩

Article dans une revue hal-02006331v2
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Multiple hot-deck imputation for network inference from RNA sequencing data

Alyssa Imbert , Armand Valsesia , Caroline Le Gall , Claudia Armenise , Gregory Lefebvre et al.

Bioinformatics, 2018, 34 (10), pp.1726 - 1732. ⟨10.1093/bioinformatics/btx819⟩

Article dans une revue hal-01794575v1
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A new approach of gene co-expression network inference reveals significant biological processes involved in porcine muscle development in late gestation

Maria Marti-Marimon , Nathalie Vialaneix , Valentin Voillet , Martine Bouissou-Matet , Yvette Lahbib Mansais et al.

Scientific Reports, 2018, 8, ⟨10.1038/s41598-018-28173-8⟩

Article dans une revue hal-02622725v1

Cutting edge bioinformatics and biostatistics approaches are bringing precision medicine and nutrition to a new era

Sanjeena Dang , Nathalie Vialaneix

Lifestyle Genomics, 2018, 11 (2), pp.73-76. ⟨10.1159/000494131⟩

Article dans une revue hal-02624369v1
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Décrire, prendre en compte, imputer et évaluer les valeurs manquantes dans les études statistiques : une revue des approches existantes

Alyssa Imbert , Nathalie Vialaneix

Journal de la Société Française de Statistique, 2018, 159 (2), pp.1-55

Article dans une revue (article de synthèse) hal-02618033v1
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Self-Organizing Maps, theory and applications

Marie Cottrell , Madalina Olteanu , Fabrice Rossi , Nathalie N. Villa-Vialaneix

Revista de Investigacion Operacional, 2018, 39 (1), pp.1-22

Article dans une revue hal-01796059v1
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Unsupervised multiple kernel learning for heterogeneous data integration

Jérôme J. Mariette , Nathalie Vialaneix

Bioinformatics, 2018, 34 (6), pp.1009-1015. ⟨10.1093/bioinformatics/btx682⟩

Article dans une revue hal-01738461v1

Molecular biomarkers for weight control in obese individuals subjected to a multiphase dietary intervention

Jennifer Bolton , Emilie Montastier , Jérôme Carayol , Sophie Bonnel , Lucile Mir et al.

Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism, 2017, 102 (8), pp.2751-2761. ⟨10.1210/jc.2016-3997⟩

Article dans une revue hal-01608397v1
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(NMR)-N-1H-Based metabolomic profiling method to develop plasma biomarkers for sensitivity to chronic heat stress in growing pigs

Samir Dou , Nathalie Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Yvon Billon , Mario Giorgi et al.

PLoS ONE, 2017, 12 (11), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0188469⟩

Article dans une revue hal-02626025v1
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Random Forests for Big Data

Robin Genuer , Jean-Michel Poggi , Christine Tuleau-Malot , Nathalie Vialaneix

Big Data Research, 2017, 9, pp.28-46. ⟨10.1016/j.bdr.2017.07.003⟩

Article dans une revue hal-01233923v2
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Efficient interpretable variants of online SOM for large dissimilarity data

Jérôme J. Mariette , Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix

Neurocomputing, 2017, 225, pp.31-48. ⟨10.1016/j.neucom.2016.11.014⟩

Article dans une revue hal-01465340v1
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Time course study of the response to LPS targeting the pig immune gene networks

Elena Terenina , Valérie Sautron , Caroline Ydier , Darya Bazovkina , Amélie Sevin-Pujol et al.

BMC Genomics, 2017, 18, ⟨10.1186/s12864-017-4363-5⟩

Article dans une revue hal-02627295v1
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Analyse statistique des profils et de l’activité des participants d’un MOOC

Avner Bar-Hen , Hubert Javaux , Nathalie N. Villa-Vialaneix

Revue internationale des technologies en pédagogie universitaire, 2016, 12 (1-2), pp.11-22

Article dans une revue hal-02630053v1
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On combining wavelets expansion and sparse linear models for Regression on metabolomic data and biomarker selection

Nathalie Vialaneix , Noslen Hernández , Alain Paris , Céline Domange , Nathalie Priymenko et al.

Communications in Statistics - Simulation and Computation, 2016, 45 (1), pp.282-298. ⟨10.1080/03610918.2013.862273⟩

Article dans une revue hal-01270963v1

Statistical Analysis of the profiles and of the activity of participants of MOOC

Avner Bar-Hen , Hubert Javaux , Nathalie N. Villa-Vialaneix

Revue internationale des technologies en pédagogie universitaire, 2015, 12 (1-2), pp.11-22. ⟨10.18162/ritpu-2015-v12n12-03⟩

Article dans une revue hal-02636153v1
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A non parametric approach for calibration with functional data

Noslen Hernández , Rolando Biscay , Nathalie Vialaneix , Isneri Talavera

Statistica Sinica, 2015, 22 (4), pp.1547-1566. ⟨10.5705/ss.2013.242⟩

Article dans une revue hal-01199287v1
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Analyse statistique des profils et de l’activité des participants d’un MOOC

Avner Bar-Hen , Hubert Javaux , Nathalie Vialaneix

Revue internationale des technologies en pédagogie universitaire, 2015, 12 (1-2), pp.11-22

Article dans une revue hal-01270885v1
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Using SOMbrero for clustering and visualizing graphs

Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix

Journal de la Société Française de Statistique, 2015, 156 (3), pp.95-119

Article dans une revue hal-01232672v1
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Time course of the response to ACTH in pig: biological and transcriptomic study

Valérie Sautron , Elena Terenina , Laure Gress , Yannick Lippi , Yvon Billon et al.

BMC Genomics, 2015, 16 (961), pp.PMC4650497. ⟨10.1186/s12864-015-2118-8⟩

Article dans une revue hal-01271063v1
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On-line relational and multiple relational SOM

Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix

Neurocomputing, 2015, 147, pp.15-30. ⟨10.1016/j.neucom.2013.11.047⟩

Article dans une revue hal-01063831v1
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Beyond multidimensional data in model visualization: High-dimensional and complex nonnumeric data

Nathalie Vialaneix , Anne Ruiz-Gazen

Statistical Analysis and Data Mining, 2015, 8 (4), pp.232-239. ⟨10.1002/sam.11274⟩

Article dans une revue hal-01182932v1
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System Model Network for Adipose Tissue Signatures Related to Weight Changes in Response to Calorie Restriction and Subsequent Weight Maintenance

Emilie Montastier , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Sylvie Caspar-Bauguil , Petr Hlavaty , Eva Tvrzicka et al.

PLoS Computational Biology, 2015, 11 (1), pp.e1004047. ⟨10.1371/journal.pcbi.1004047⟩

Article dans une revue inserm-02150615v1
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Statistical exploratory analysis of agent-based simulations in a social context

Nathalie Villa-Vialaneix , Christophe Sibertin-Blanc , Pascal Roggero

Case Studies in Business, Industry and Government Statistics, 2014, 5 (2), pp.132-149

Article dans une revue hal-02629776v2

Inferring networks from multiple samples with consensus LASSO

Nathalie N. Villa-Vialaneix , Matthieu Vignes , Nathalie Viguerie , Magali San Cristobal

Quality technology & quantitative management, 2014, 11 (1), pp.39-60

Article dans une revue hal-02641674v1
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Exploration of a large database of French notarial acts with social network methods

Fabrice Rossi , Nathalie Vialaneix , Florent Hautefeuille

Digital Medievalist, 2014, 9, pp.2013

Article dans une revue hal-01053673v1
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Le metabolome, un moyen pour trouver de nouveaux biomarqueurs ?

Magali San Cristobal , Marie-Pierre Sanchez , Marie‐josé Mercat , Florian Rohart , Laurence Liaubet et al.

La revue française de la recherche en viandes et produits carnés, 2014, Février, pp.1-5

Article dans une revue hal-01222422v1
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Inferring networks from multiple samples with Consensus LASSO

Nathalie Villa-Vialaneix , Matthieu Vignes , Nathalie Viguerie , Magali San Cristobal

Quality technology & quantitative management, 2014, 11 (1), pp.39-60

Article dans une revue hal-00971458v1

Exploration of a large database of French notarial acts with social network methods

Fabrice Rossi , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Florent Hautefeuille

Digital Medievalist, 2013, 9

Article dans une revue hal-02648351v1

Spatial correlation in bipartite networks

Nathalie Villa-Vialaneix , Bertrand Jouve , Fabrice Rossi , Florent Hautefeuille

Revue des Nouvelles Technologies de l'Information, 2013, pp.97-110

Article dans une revue hal-00761081v1
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The Structure of a Gene Co-Expression Network Reveals Biological Functions Underlying eQTLs

Nathalie Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Thibault Laurent , Pierre Cherel , Adrien Gamot et al.

PLoS ONE, 2013, pp.e60045

Article dans une revue hal-00817655v1
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The Structure of a Gene Co-Expression Network Reveals Biological Functions Underlying eQTLs

Nathalie N. Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Thibault Laurent , Pierre Cherel , Adrien Gamot et al.

PLoS ONE, 2013, 8, online (4), Non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0060045⟩

Article dans une revue hal-02646005v1
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J'ai testé pour vous... un MOOC

Nathalie Villa-Vialaneix

Statistique et Enseignement, 2013, 4 (2), pp.3-17

Article dans une revue hal-00940787v1
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Determinants of human adipose tissue gene expression: impact of diet, sex, metabolic status, and cis genetic regulation.

Nathalie Viguerie , Emilie Montastier , Jean-José Maoret , Balbine Roussel , Marion Combes et al.

PLoS Genetics, 2012, 8 (9), pp.e1002959. ⟨10.1371/journal.pgen.1002959⟩

Article dans une revue hal-00757837v1

Phenotypic prediction based on metabolomic data on the growing pig from three main European breeds.

F. Rohart , Alain Paris , Béatrice Laurent , Cécile Canlet , Jerome Molina et al.

Journal of Animal Science, 2012, 90 (13), epub ahead of print. ⟨10.2527/jas.2012-5338⟩

Article dans une revue hal-00757827v1
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A comparison of eight metamodeling techniques for the simulation of N2O fluxes and N leaching from corn crops

Nathalie Villa-Vialaneix , Marco Follador , Marco Ratto , Adrian Leip

Environmental Modelling and Software, 2012, 34, pp.51-66. ⟨10.1016/j.envsoft.2011.05.003⟩

Article dans une revue hal-00654753v1
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Neural Networks for Complex Data

Marie Cottrell , Madalina Olteanu , Fabrice Rossi , Joseph Rynkiewicz , Nathalie Villa-Vialaneix

KI - Künstliche Intelligenz, 2012, 26 (4), pp.373-380. ⟨10.1007/s13218-012-0207-2⟩

Article dans une revue hal-00744929v1
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What is a good (gene) network?

Nathalie Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Magali San Cristobal

Journal of Animal Breeding and Genetics, 2011, 128 (1), pp.1-2. ⟨10.1111/j.1439-0388.2010.00916.x⟩

Article dans une revue hal-00658814v1
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Recherche et représentation de communautés dans un grand graphe. Une approche combinée

Nathalie Villa-Vialaneix , Taoufiq Dkaki , Sébastien Gadat , Jean-Michel Inglebert , Quoc-Dinh Truong

Document numérique - Revue des sciences et technologies de l'information. Série Document numérique, 2011, 14 (1), pp.59-80. ⟨10.3166/dn.14.1.59-80⟩

Article dans une revue hal-00590612v1
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Représentation d'un grand réseau à partir d'une classification hiérarchique de ses sommets

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix

Journal de la Société Française de Statistique, 2011, 152 (3), pp.34-65

Article dans une revue hal-00651577v1
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Consistency of functional learning methods based on derivatives

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix

Pattern Recognition Letters, 2011, 32 (8), pp.1197-1209. ⟨10.1016/j.patrec.2011.03.001⟩

Article dans une revue hal-00589738v1
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Using spatial indexes for labeled network analysis

Thibault Laurent , Nathalie Villa-Vialaneix

Revue I3 - Information Interaction Intelligence, 2011, 11 (1), pp.1

Article dans une revue hal-00654754v1
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A Simulation Study of Functional Density-Based Inverse Regression

Noslen Hernández , Rolando Biscay , Nathalie Villa-Vialaneix , Isneri Talavera

Revista Investigacion Operacional, 2011, 32 (2), pp.146-159

Article dans une revue hal-00654751v1

Optimizing an Organized Modularity Measure for Topographic Graph Clustering: a Deterministic Annealing Approach

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix

Neurocomputing, 2010, 73 (7-9), pp.Pages 1142-1163. ⟨10.1016/j.neucom.2009.11.023⟩

Article dans une revue hal-00515892v1
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Batch kernel SOM and related Laplacian methods for social network analysis

Romain Boulet , Bertrand Jouve , Fabrice Rossi , Nathalie Villa

Neurocomputing, 2008, 71 (7-9), pp.1257-1273. ⟨10.1016/j.neucom.2007.12.026⟩

Article dans une revue hal-00202339v1
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Storms prediction : Logistic regression vs random forest for unbalanced data

Anne Ruiz-Gazen , Nathalie Villa

Case Studies in Business, Industry and Government Statistics, 2007, 1 (2), pp.91-101

Article dans une revue hal-00270176v1
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Various Approaches for Predicting Land Cover in Mountain Areas

Nathalie Villa , Martin Paegelow , Maria T. Camacho Olmedo , Laurence Cornez , Frédéric Ferraty et al.

Communications in Statistics - Simulation and Computation, 2007, 36 (1), pp.73-86. ⟨10.1080/03610910601096379⟩

Article dans une revue hal-00144147v1
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Support vector machine for functional data classification

Fabrice Rossi , Nathalie Villa

Neurocomputing, 2006, 69 (7-9), pp.730-742. ⟨10.1016/j.neucom.2005.12.010⟩

Article dans une revue hal-00144141v1
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Un résultat de consistance pour des SVM fonctionnels par interpolation spline

Nathalie Villa , Fabrice Rossi

Comptes rendus de l'Académie des sciences. Série I, Mathématique, 2006, 343 (8), pp.555-560. ⟨10.1016/j.crma.2006.09.025⟩

Article dans une revue hal-00144142v1
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Multilayer Perceptron with Functional Inputs: an Inverse Regression Approach

Louis Ferré , Nathalie Villa

Scandinavian Journal of Statistics, 2006, 33 (4), pp.807-823. ⟨10.1111/j.1467-9469.2006.00496.x⟩

Article dans une revue hal-00144144v1
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Discrimination de courbes par régression inverse fonctionnelle

Louis Ferré , Nathalie Villa

Revue de Statistique Appliquée, 2005, LIII (1), pp.39-57

Article dans une revue hal-00144140v1
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Modélisations prospectives de l'occupation du sol. Le cas d'une montagne méditerranéenne

Martin Paegelow , Nathalie Villa , Laurence Cornez , Frédéric Ferraty , Louis Ferré et al.

Cybergeo : Revue européenne de géographie / European journal of geography, 2004, 295, 15 p

Article dans une revue hal-00144134v2
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Modélisation prospective de l’occupation du sol. Le cas d’une montagne méditerrannéenne.

Martin Paegelow , Nathalie Villa , Laurence Cornez , Frédéric Ferraty , Louis Ferré et al.

Cybergeo : Revue européenne de géographie / European journal of geography, 2004, 295, 21 p. en ligne

Article dans une revue hal-03160711v1
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Inférence post hoc pour l'analyse différentielle de données Hi-C

Élise Jorge , Pierre Neuvial , Nathalie Vialaneix , Sylvain Foissac

56e Journées de Statistique de la SFdS (JdS 2025), Société Française de Statistique, Jun 2025, Marseille, France. pp.446

Communication dans un congrès hal-05113438v1
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phoenics : une nouvelle approche statistique pour l'analyse différentielle longitudinale de voies métaboliques

Camille Guilmineau , Rémi Servien , Marie Tremblay-Franco , Nathalie Vialaneix

56. Journées de Statistique de la SFdS (JdS 2025), Société Française de Statistique, Jun 2025, Marseille, France. pp.463

Communication dans un congrès hal-05113439v1
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Analyse de la spécificité des associations génétiques dans les études multi-population

Jeong Hwan Ko , Andrea Rau , Nathalie Vialaneix

Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France

Communication dans un congrès hal-04593233v1
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Réseaux de gènes : inférence, évaluation, utilisation et au-delà

Nathalie Vialaneix

Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France

Communication dans un congrès hal-04593166v1
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Analyse différentielle longitudinale des voies métaboliques

Camille Guilmineau , Rémi Servien , Marie Tremblay-Franco , Nathalie Vialaneix

56. Journées de Statistique de la SFdS (JdS 2025), Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France

Communication dans un congrès hal-04595237v1
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La transcriptomique en cellule unique révèle les processus de maturation induits dans chaque type de cellule épithéliale intestinale lors de l'introduction de l'alimentation solide

Tania Malonga , Christelle Knudsen , Emeline Lhuillier , Patrick Aymard , Elodie Riant et al.

CECED 2024, Club des Cellules Epithéliales Digestives, Mar 2024, Montpellier, France. pp.P12

Communication dans un congrès hal-04527178v1
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Utilisation de la NMF supervisée intégrative pour l'étude d'altérations de la peau

Aurélie Mercadié , Eleonore Gravier , Gwendal Josse , Nathalie Vialaneix , Celine Brouard

Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France

Communication dans un congrès hal-04595238v1
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Procédure de test hiérarchique pour l'analyse différentielle de données Hi-C

Élise Jorge , Pierre Neuvial , Nathalie Vialaneix , Sylvain Foissac

Journées de statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2024, Bordeaux, France

Communication dans un congrès hal-04593207v1
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Extension de la NMF supervisée pour l'intégration de données omiques

Aurélie Mercadié , Eléonore Gravier , Gwendal Josse , Nathalie Vialaneix , Celine Brouard

Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Nov 2023, Toulouse, France

Communication dans un congrès hal-04746164v1
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Modélisation de données métabolomiques longitudinales par voies métaboliques

Camille Guilmineau , Marie Tremblay-Franco , Nathalie Vialaneix , Rémi Servien

54. Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, Jul 2023, Bruxelles, Belgique

Communication dans un congrès hal-04154758v1
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Extension de la NMF supervisée pour l'intégration de données omiques

Aurélie Mercadié , Eleonore Gravier , Gwendal Josse , Nathalie Vialaneix , Celine Brouard

Journée de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, Jul 2023, Bruxelles, Belgium

Communication dans un congrès hal-04154752v1
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ASTERICS: A Simple Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

Élise Maigné , Céline Noirot , Julien Henry , Yaa Adu Kesewaah , Sébastien D Éjean et al.

Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Nov 2023, Toulouse, France. ⟨10.57745/TCKSTD⟩

Communication dans un congrès hal-04746181v1

ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

Élise Maigné , Céline Noirot , Jérôme Mariette , Yaa Adu Kesewaah , Sébastien Déjean et al.

Les Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), Inria; INRAE, Jul 2022, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-03697843v1
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Sélection d'intervalles pour des prédicteurs fonctionnels à partir de forêts aléatoires

Rémi Servien , Nathalie Vialaneix

Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2022, Lyon, France

Communication dans un congrès hal-03697845v1

Multi-omics data integration methods: kernel and other machine learning approaches

Nathalie Vialaneix

Machine Learning for Life Sciences, Key Initiative MUSE, Université de Montpellier, Nov 2022, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-03856931v1
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CRAN Task Views para Guiar a usuaries de paquetes de R

Rocío Joo , Nathalie Vialaneix , Roger Bivand , Dirk Eddelbuettel , David Meyer et al.

LatinR, Oct 2022, Online, Francia

Communication dans un congrès hal-03809780v1

Plasmatic and ruminal metabolomes of lambs divergently selected on residual feed intake

Florian Touitou , Flavie Tortereau , Nathalie Marty-Gasset , Nathalie Vialaneix , Gaëlle Lefort et al.

EAAP – European Federation of Animal Science 2021, Aug 2021, Davos, Switzerland

Communication dans un congrès hal-03547250v1
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ASICS: identification and quantification of metabolites in complex 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Nathalie Villa , Rémi Servien

European RFMF Metabomeeting 2020, Jan 2020, Toulouse, France

Communication dans un congrès hal-02737383v1
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Analyse différentielle de données Hi-C via la classification ascendante hiérarchique sous contrainte de contiguïté

Nathanaël Randriamihamison , Marie Chavent , Sylvain Foissac , Nathalie Vialaneix , Pierre Neuvial

JDS2020 : 52èmes Journées de Statistique de la Société Française de Statistique (SFdS), Société Française de Statistique, May 2020, Nice, France. pp.655-660

Communication dans un congrès hal-02892664v1

Chromatin accessibility conservation across four livestock species

Sarah Djebali Quelen , Sylvain Foissac , Nathalie Vialaneix , Kylie Munyard , Andrea Rau et al.

Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG 2019), Jul 2019, Llieda, Spain

Communication dans un congrès hal-02788732v1
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Classification ascendante hiérarchique, contrainte d'ordre : conditions d'applicabilité, interprétabilité des dendrogrammes

Nathanaël Randriamihamison , Pierre Neuvial , Nathalie Vialaneix

51èmes Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2019, Nancy, France

Communication dans un congrès hal-02734011v1

Organisation nucléaire et expression génique lors du développement chez le porc

Yvette Lahbib Mansais , Maria Marti-Marimon , Nathalie Vialaneix , Sylvain Foissac , Martine Bouissou-Matet et al.

5. Journée d'Animation Scientifique du réseau épiPhase, Jun 2019, Toulouse, France. 35 p

Communication dans un congrès hal-02736301v1
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Unsupervised variable selection for kernel methods in systems biology

Jérôme J. Mariette , Celine Brouard , Remi Flamary , Nathalie Vialaneix

Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Oct 2019, Toulouse, France

Communication dans un congrès hal-02787253v1
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ASICS : identifier et quantifier des métabolites à partir d'un spectre RMN 1H

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix , Rémi Servien

51. Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique (SFdS). FRA., Jun 2019, Nancy, France

Communication dans un congrès hal-02737497v1

Multi-level conservation of chromosome conformation across livestock species reveals evolutionary links between genome structure and function

Sylvain Foissac , Sarah Djebali Quelen , Nathalie Vialaneix , Matthias Zytnicki , Andrea Rau et al.

Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG 2019), Jul 2019, Lleida, Spain

Communication dans un congrès hal-02788476v1

Functional annotation of livestock genomes: chromatin structure and regulation of gene expression

Sylvain Foissac , Sarah Djebali , Kylie Munyard , Nathalie Vialaneix , Andrea Rau et al.

ASAS/ASDS Midwest Joint Meeting, Mar 2019, Omaha, United States. ⟨10.1093/jas/skz122.028⟩

Communication dans un congrès hal-02735898v1
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Random forests for big data

Robin Genuer , Jean-Michel Poggi , Christine Tuleau-Malot , Nathalie Villa-Vialaneix

Data Science, Statistics & Visualization (DSSV) 2018, Jul 2018, Vienne, Austria

Communication dans un congrès hal-02787208v1
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ASICS : un package R pour l'identification et la quantification de métabolites dans un spectre RMN 1H

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Nathalie Villa-Vialaneix , Rémi Servien

7ème Rencontres R, Jul 2018, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-02791362v1
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Multiple hot-deck imputation for network inference from RNA sequencing data

Alyssa Imbert , Armand Valsesia , Claudia Armenise , Gregory Lefebvre , Pierre-Antoine Gourraud et al.

European Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece

Communication dans un congrès hal-02788524v1
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Using ASICS to quantify metabolites in 1D 1H NMR spectra: an application to perinatal survival in pigs

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Patrick Tardivel , Cécile Canlet , Marie Tremblay-Franco et al.

Journée des Plateformes BioInfo et BioStat du Génotoul, Jan 2018, Toulouse, France

Communication dans un congrès hal-02788399v1

An innovative method of gene co expression network inference reveals significant biological processes involved in fetal porcine muscle development

Maria Marti-Marimon , Nathalie Villa-Vialaneix , Valentin Voillet , Martine Yerle-Bouissou , Laurence Liaubet et al.

23rd International Colloquium on Animal Cytogenetics and Genomics, Jun 2018, Saint Petersburg, Russia. pp.2

Communication dans un congrès hal-02734342v1
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RNAseqNet : un package pour l'inférence de réseaux à partir de données RNA-seq

Alyssa Imbert , Nathalie Villa-Vialaneix

7ème Rencontres R, Jul 2018, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-02791466v1

Adjacency-constrained hierarchical clustering of a band similarity matrix with application to genomics

Christophe Ambroise , Alia Dehman , Michel Koskas , Pierre Neuvial , Guillem Rigaill et al.

Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Dec 2018, Toulouse, France

Communication dans un congrès hal-02788245v1
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Learning from (dis)similarity data

Nathalie Vialaneix

European R Users Meeting (eRum 2018), May 2019, Budapest, Hungary. 70 p

Communication dans un congrès hal-02785273v1
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Accelerating stochastic kernel SOM

Jérôme J. Mariette , Fabrice Rossi , Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix

XXVth European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning, Apr 2017, Bruges, Belgium. 6 p

Communication dans un congrès hal-02734663v1

Progesterone and betahydroxybutyrate in line measurements for a better description and understanding of Holstein cows fertility in field conditions

Claire Saby , Wenting Zhang , René Fournier , Rémi Servien , Nathalie Villa-Vialaneix et al.

8th European Conference on Precision Livestock Farming (EC-PLF), Sep 2017, Nantes, France. 7 p

Communication dans un congrès hal-01607267v1

Random forests for big data

Robin Genuer , Jean-Michel Poggi , Christine Tuleau-Malot , Nathalie Villa-Vialaneix

10th International Conference of the ERCIM WG on Computational and Methodological Statistics, Dec 2017, Londres, United Kingdom

Communication dans un congrès hal-02785199v1
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Characterization of 3D genomic interactions in fetal pig muscle

Maria Eugenia Marti Marimon , Hervé Acloque , Matthias Zytnicki , David Robelin , Sarah Djebali Quelen et al.

36. International Society for Animal Genetics Conference (ISAG), Jul 2017, Dublin, Ireland. pp.43

Communication dans un congrès hal-02868765v1
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Stochastic Self-Organizing Map variants with the R package SOMbrero

Nathalie Villa-Vialaneix

12th International Workshop on Self-Organizing Maps and Learning Vector Quantization, Clustering and Data Visualization (WSOM), Jun 2017, Nancy, France. 7 p., ⟨10.1109/WSOM.2017.8020014⟩

Communication dans un congrès hal-01605663v1
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Accelerating stochastic kernel SOM

Jérôme J. Mariette , Fabrice Rossi , Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix

XXVth European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning, Apr 2017, Bruges, Belgium. pp.269-274

Communication dans un congrès hal-01516660v1
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Unsupervised multiple kernel learning to integrate various metagenomic sources

Jérôme J. Mariette , Nathalie Villa-Vialaneix

4ème colloque de Génomique Environnementale, Sep 2017, Marseille, France

Communication dans un congrès hal-01604708v1
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Theoretical and applied aspects of the self-organizing maps

Marie Cottrell , Madalina Olteanu , Fabrice Rossi , Nathalie Vialaneix

WSOM 2016, Jan 2016, Houston, United States. pp.3-26, ⟨10.1007/978-3-319-28518-4_1⟩

Communication dans un congrès hal-01270701v1

Using SOMbrero for clustering and visualizing complex data

Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix

9th International Conference of the ERCIM WG on Computational and Methodological Statistics, Dec 2016, Séville, Spain

Communication dans un congrès hal-01604379v1
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Integrating Tara oceans data sets using multiple kernels

Jérôme J. Mariette , Helene H. Chiapello , Nathalie N. Villa-Vialaneix

15th European Conference on Computational Biology (ECCB 2016), Workshop "Recent Computational Advances in Metagenomics (RCAM)", Sep 2016, The Hague, Netherlands. pp.3

Communication dans un congrès hal-02792439v1
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Sparse online self-organizing maps for large relational data

Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix

WSOM 2016, Jan 2016, Houston, United States. pp.27-37, ⟨10.1007/978-3-319-28518-4_6⟩

Communication dans un congrès hal-01270710v1

3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes in pig fetal cells

Yvette Lahbib Mansais , Maria Marti-Marimon , Valentin Voillet , Harmonie Barasc , Florence Mompart et al.

22. International Colloquim on Animal Cytogenetics and Genomics (ICACG), Jul 2016, Toulouse, France. 116 p

Communication dans un congrès hal-02743243v1

Multiway-SIR for longitudinal multi-table data integration

Valérie Sautron , Marie Chavent , Nathalie Viguerie , Nathalie N. Villa-Vialaneix

22nd International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT), Aug 2016, Oviedo, Spain. pp.1

Communication dans un congrès hal-02796270v1

Interval sparsity for functional inverse regression

Rémi Servien , Victor Picheny , Nathalie N. Villa-Vialaneix

2016 CRoNoS Summer Course, 22nd International Conference on Computational Statistics (COMPSTAT), Aug 2016, Oviedo, Spain

Communication dans un congrès hal-02799603v1

3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes

Yvette Lahbib Mansais , Maria Marti-Marimon , Valentin Voillet , Harmonie Barasc , Florence Mompart et al.

35. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2016, Salt Lake City, United States

Communication dans un congrès hal-02742818v1
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Outils pour l'analyse et la simulation de données RNA-seq

Alyssa Imbert , Nathalie N. Villa-Vialaneix

Cinquièmes Rencontres R 2016, Jun 2016, Toulouse, France. 2 p

Communication dans un congrès hal-02739876v1

Random forests for big data

Nathalie N. Villa-Vialaneix , Robin Genuer , Jean-Michel Poggi , Christine Tuleau-Malot

Journées de Statistique de Rennes (JSTAR), Oct 2016, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-02796431v1
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Aggregating Self-Organizing Maps with Topology Preservation

Jérôme J. Mariette , Nathalie Vialaneix

WSOM 2016, Jan 2016, Houston, United States. pp.27-37, ⟨10.1007/978-3-319-28518-4_2⟩

Communication dans un congrès hal-01270640v1

Using SOMbrero for clustering and visualizing complex data

Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix

CMStatistics, Dec 2016, Séville, Spain

Communication dans un congrès hal-01519707v1
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Parcimonie par intervalle pour la régression inverse par tranche fonctionnelle

Victor Picheny , Rémi Servien , Nathalie Vialaneix

48e Journées de Statistique de la SFdS, May 2016, Montpellier, France. pp.6

Communication dans un congrès hal-01325538v1
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Interpretable sparse sliced inverse regression for functional data

Victor Picheny , Rémi Servien , Nathalie N. Villa-Vialaneix

Workshop Learning with Functional Data, Oct 2016, Lille, France

Communication dans un congrès hal-02799481v1
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Outils pour chercher de l'information sur R et se former

Nathalie Vialaneix , Christophe Bontemps , Sébastien Dejean

Cinquièmes Rencontres R 2016, Jun 2016, Toulouse, France

Communication dans un congrès hal-01352178v1
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Imputation de données manquantes pour l'inférence de r éseau à partir de données RNA-seq

Alyssa Imbert , Caroline Le Gall , Claudia Armenise , Gregory Lefebvre , Jorg Hager et al.

48e Journées de la Société Française de Statistique, May 2016, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-01325523v1
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Random forests and big data

Robin Genuer , Jean-Michel Poggi , Christine Tuleau-Malot , Nathalie Villa-Vialaneix

47ème Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, Jun 2015, Lille, France

Communication dans un congrès hal-01160643v1
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Enseigner la statistique pour l'analyse de mégadonnées

Philippe Besse , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Anne Ruiz-Gazen

47ème Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique (SFdS). FRA., Jun 2015, Lille, France

Communication dans un congrès hal-02742204v1
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Enseigner la statistique pour l'analyse de mégadonnées

Philippe Besse , Nathalie Villa-Vialaneix , Anne Ruiz-Gazen

47èmes Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2015, Lille, France

Communication dans un congrès hal-01160638v1
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Classification et visualisation de graphes avec SOMbrero

Madalina Olteanu , Nathalie N. Villa-Vialaneix

Quatrièmes Rencontres R, Jun 2015, Grenoble, France. pp.2

Communication dans un congrès hal-02795287v1
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Multiple dissimilarity SOM for clustering and visualizing graphs with node and edge attributes

Nathalie Vialaneix , Madalina Olteanu

International Conference on Machine Learning, Workshop FEAST, Jul 2015, Lille, France. 1p

Communication dans un congrès hal-01175731v1

What is a MOOC?

Nathalie N. Villa-Vialaneix

15th Annual Conference of ENBIS, Sep 2015, Prague, Czech Republic

Communication dans un congrès hal-02792063v1
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Classification et visualisation de graphes avec SOMbrero

Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix

Quatrièmes Rencontres R, Jun 2015, Grenoble, France

Communication dans un congrès hal-01171557v1
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Data analysis of social simulations outputs: Interpreting the dispersion of variables

Christophe Sibertin-Blanc , Nathalie Vialaneix

15th International Workshop on Multi-Agent-Based Simulation (MBAS 2014 @ AAMAS), May 2014, Paris, France. pp.133-150, ⟨10.1007/978-3-319-14627-0_10⟩

Communication dans un congrès hal-01270802v1
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Self-organizing maps for clustering and visualization of bipartite graphs

Madalina Olteanu , Nathalie N. Villa-Vialaneix

46e Journées de la Société Française de Statistique, Jun 2014, Rennes, France. pp.109

Communication dans un congrès hal-02739820v1

Adipose tissue signatures related to weight changes in response to calorie restriction and subsequent weight maintenance using lipidome and gene profiling network analysis

Emilie Montastier , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Ignacio González , Sylvie Caspar-Bauguil , Wim H.M. Saris et al.

Bioinformatics/Biostatistics regional workshop, Jun 2014, Toulouse, France. 2 p

Communication dans un congrès hal-02797111v1
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J'ai testé pour vous... un MOOC

Nathalie Vialaneix

Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2014, Rennes, France. pp.90

Communication dans un congrès hal-01001759v1
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Bagged kernel SOM

Jérôme J. Mariette , Madalina Olteanu , Julien Boelaert , Nathalie Vialaneix

10th International Workshop, WSOM 2014, Hochschule Esslingen University of Applied Sciences. DEU., Jul 2014, Mittweida, Germany. pp.45-54, ⟨10.1007/978-3-319-07695-9⟩

Communication dans un congrès hal-01018374v1
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Self-Organizing Maps for clustering and visualization of bipartite graphs

Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix

46e Journées de Statistique de la SFdS, Jun 2014, Rennes, France. pp.109

Communication dans un congrès hal-01001991v1

Inferring networks from multiple samples with consensus LASSO

Nathalie Vialaneix , Matthieu Vignes , Nathalie Viguerie , Magali San Cristobal

ENBIS Spring Meeting, Apr 2014, Paris, France

Communication dans un congrès hal-02793667v1
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Reconstruction quality of a biological network when its constituting elements are partially observed

Victor Picheny , Jimmy Vandel , Matthieu Vignes , Nathalie Villa-Vialaneix

Seventeenth International Conference on Artificial Intelligence and Statistics (AI & Statistics 2014), Apr 2014, Reykjavik, Iceland. pp.L014

Communication dans un congrès hal-00982758v1

SOMbrero: an R package for numeric and non-numeric self-organizing maps

Julien Boelaert , Laura Bendhaiba , Madalina Olteanu , Nathalie N. Villa-Vialaneix

WSOM 2014, Jul 2014, Mittweida, Germany. ⟨10.1007/978-3-319-07695-9_21⟩

Communication dans un congrès hal-02743631v1
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Genetics systems of stress responses in pigs

Valérie Sautron , Elena Mormede Terenina , Pierre Mormède , Nathalie N. Villa-Vialaneix

Bioinformatics/Biostatistics regional workshop, Jun 2014, Toulouse, France

Communication dans un congrès hal-02793146v1
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SOMbrero: an R package for numeric and non-numeric Self-Organizing Maps

Julien Boelaert , Laura Bendhaiba , Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix

10th International Workshop, WSOM 2014, Jul 2014, Mittweida, Germany. pp.219-228

Communication dans un congrès hal-01018732v1
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Blood transcriptome response to LPS in pigs

Elodie Merlot , Armelle Prunier , Marie Damon , Florence Vignoles , Nathalie Villa-Vialaneix et al.

65. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2014, Copenhague, Denmark. pp.274

Communication dans un congrès hal-01210717v1
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J'ai testé pour vous... un MOOC

Nathalie N. Villa-Vialaneix

46e Journées de la Société Française de Statistique, Société Française de Statistique (SFdS). FRA., Jun 2014, Rennes, France

Communication dans un congrès hal-02740506v1
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Data Analysis of Social Simulations Outputs - Focus on variables dispersion

Christophe Sibertin-Blanc , Nathalie Vialaneix

Workshop on Multi-Agent-Based Simulation, May 2014, Paris, France. Paper session 3, paper 2

Communication dans un congrès hal-00990219v1
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Multiple kernel self-organizing maps

Madalina Olteanu , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Christine Cierco-Ayrolles

21. European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning (ESANN 2013), Apr 2013, Bruges, Belgium

Communication dans un congrès hal-02747111v1
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sexy-rgtk: a package for programming RGtk2 GUI in a user-friendly manner

Damien Leroux , Nathalie Villa-Vialaneix

2èmes Rencontres R, Jun 2013, Lyon, France. pp.103-104

Communication dans un congrès hal-00850516v1
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SOMbrero : Cartes auto-organisatrices stochastiques pour l'intégration de données décrites par des tableaux de dissimilarités

Laura Bendhaiba , Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix

2èmes Rencontres R, Jun 2013, Lyon, France. pp.99-100

Communication dans un congrès hal-00850514v1
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Carte auto-organisatrice pour graphes étiquetés.

Nathalie Villa-Vialaneix , Madalina Olteanu , Christine Cierco-Ayrolles

Atelier Fouilles de Grands Graphes (FGG) - EGC'2013, Jan 2013, Toulouse, France. pp.Article numéro 4

Communication dans un congrès hal-00783860v1
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Which dissimilarity is to be used when extracting typologies in sequence analysis? A comparative study

Sébastien Massoni , Madalina Olteanu , Nathalie N. Villa-Vialaneix

International Workshop on Artificial Neural Networks, Jun 2013, Puerto de la Cruz, Tenerife, Spain

Communication dans un congrès hal-02806089v1
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Multiple kernel self-organizing maps

Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix , Christine Cierco-Ayrolles

European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning, Apr 2013, Bruges, Belgium. pp.83

Communication dans un congrès hal-00817920v1
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On-line relational SOM for dissimilarity data

Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix , Marie Cottrell

WSOM 2012, Dec 2012, Santiago, Chile. pp.13-22

Communication dans un congrès hal-00768948v1
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Consensus LASSO : inférence conjointe de réseaux de gènes dans des conditions expérimentales multiples

Nathalie Villa-Vialaneix , Magali San Cristobal

45èmes Journées de Statistique de la SFdS, May 2013, Toulouse, France

Communication dans un congrès hal-00829157v1

Carte auto-organisatrice pour graphes étiquetés

Nathalie N. Villa-Vialaneix , Madalina Olteanu , Christine Cierco-Ayrolles

Atelier Fouilles de Grands Graphes - EGC, Jan 2013, Toulouse, France

Communication dans un congrès hal-02807496v1
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Classification non supervisée d'un graphe de co-expression avec des méta-données pour la détection de micro-ARNs

Florian Brunet , Jérôme J. Mariette , Christine Cierco-Ayrolles , Christine Gaspin , Philippe Bardou et al.

MARAMI (Modèles et l'Analyse des Réseaux : Approches Mathématiques et Informatiques) 2013, Oct 2013, Saint-Étienne, France. pp.SI-1

Communication dans un congrès hal-00877561v1
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Which dissimilarity is to be used when extracting typologies in sequence analysis? A comparative study

Sébastien Massoni , Madalina Olteanu , Nathalie Villa-Vialaneix

IWANN 2013, Jun 2013, Puerto de la Cruz, Tenerife, Spain. session 12-1A, paper 2

Communication dans un congrès hal-00854302v1

Exploration relationnelle d'un corpus d'actes notariés médiévaux

Nathalie Villa-Vialaneix , Fabrice Rossi , Florent Hautefeuille

Colloque Configuration(s), Jun 2012, Paris, France

Communication dans un congrès hal-00721403v1
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Comparison of network inference packages and methods for multiple network inference

Nathalie Villa-Vialaneix , Nicolas A. Edwards , Laurence Liaubet , Nathalie Viguerie , Magali San Cristobal

1ères Rencontres R, Jul 2012, Bordeaux, France. pp.93-94

Communication dans un congrès hal-00714444v1
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Analyse de données pour des graphes étiquetés

Thibault Laurent , Nathalie Villa-Vialaneix

44èmes Journées de Statistique, May 2012, Bruxelles, Belgique. pp.196

Communication dans un congrès hal-00707779v1
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Comparison of network inference packages and methods for multiple network inference

Nathalie Villa-Vialaneix , Nicolas A. Edwards , Laurence Liaubet , Nathalie Viguerie , Magali San Cristobal

1ères Rencontres R, Jul 2012, Bordeaux, France

Communication dans un congrès hal-00717549v1
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Genetic and phenotypic fine characterizations of French porcine reference populations

Magali San Cristobal , Simon Boitard , Maria Inès Fariello Rico , Hélène Gilbert , Laurence Liaubet et al.

ISAG, Jul 2012, Cairns, Australia. pp.1

Communication dans un congrès hal-01019125v1

Exploration of a Large Database of French Charters with Social Network Methods

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix , Florent Hautefeuille

International Medieval Congress (IMC 2011), Jul 2011, Leeds, United Kingdom

Communication dans un congrès hal-00668229v1
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L'analyse d'un réseau de co-expression génique met en valeur des groupes fonctionnels homogènes et des gènes importants relatifs a un phénotype d'intérêt

Nathalie Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Thibault Laurent , Adrien Gamot , Pierre Cherel et al.

Journées de la Société Française de Statistique, May 2011, Tunis, Tunisie. pp.172

Communication dans un congrès hal-00666613v1
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Diversité et biologie intégrative : des pistes à explorer pour combler le gap entre diversité génétique et diversité phénotypique

Magali San Cristobal , Simon S. Boitard , Marcel M. Bouffaud , Cécile Canlet , Leonor L. Chaltiel et al.

COLLOQUE FRB : Les Ressources Génétiques (RG) face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociétaux, Sep 2011, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-01000087v1
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Sensitivity of the process-based model DNDC on microbiological parameters

Adrian Leip , Marco Follador , Stefano Tarantola , Mirko Busto , Nathalie Villa-Vialaneix

Nitrogen and Global Change - Key findings & Future challenges, Apr 2011, Edinburgh, United Kingdom. pp.S10

Communication dans un congrès hal-00674167v1
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The structure of a gene network reveals 7 biological sub-graphs underlying eQTLs in pig

Laurence Liaubet , Nathalie Villa-Vialaneix , Adrien Gamot , Fabrice Rossi , Pierre Cherel et al.

World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany. pp.0147

Communication dans un congrès hal-00666597v1
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Classification and regression based on derivatives : a consistency result

Nathalie Villa-Vialaneix , Fabrice Rossi

II Simposio sobre Modelamiento Estadístico, Dec 2010, Valparaiso, Chile

Communication dans un congrès hal-00668212v1
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A comparison of three learning methods to predict N2O fluxes and N leaching

Nathalie Villa-Vialaneix , Marco Follador , Adrian Leip

Modèles et Apprentissage en Sciences Humaines et Sociales, Jun 2010, Lille, France. pp.57-66

Communication dans un congrès hal-00491583v1
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Analysis of the influence of a network on the values of its nodes : the use of spatial indexes.

Thibault Laurent , Nathalie Villa-Vialaneix

Modèles et l′Analyse des Réseaux : Approches Mathématiques et Informatique, Oct 2010, Toulouse, France. pp.Session 1 - 1

Communication dans un congrès hal-00668202v1
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A functional density-based nonparametric approach for statistical calibration

Noslen Hernández , Rolando Biscay , Nathalie Villa-Vialaneix , Isneri Talavera

15th Iberoamerican Congress on Pattern Recognition (CIARP 2010), Nov 2010, Sao Paulo, Brazil. pp.450-457, ⟨10.1007/978-3-642-16687-7_60⟩

Communication dans un congrès hal-00658811v1
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Phenotypic prediction based on metabolomic data : lasso vs Bolasso, primary data vs wavelet transformation

Florian Rohart , Nathalie Villa-Vialaneix , Alain Paris , Cécile Canlet , J. Molina et al.

World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany. pp.3-55

Communication dans un congrès hal-00658819v1

Are gene networks always meaningful?

Adrien Gamot , Nathalie Villa , Laurence Liaubet , Fabrice Rossi , Gwenola Tosser-Klopp et al.

European Animal Disease Genomics Network of Excellence for Animal Health and Food Safety (EADGENE Days 2009), Oct 2009, Paris, France

Communication dans un congrès hal-00668239v1
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Méthode de classification organisée pour la recherche de communautés dans les réseaux sociaux

Nathalie Villa , Fabrice Rossi

41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France

Communication dans un congrès inria-00386797v1
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Recherche et représentation de communautés dans des grands graphes

Nathalie Villa , Taoufiq Dkaki , Sébastien Gadat , Jean-Michel Inglebert , Quoc-Dinh Truong

Veille Stratégique Scientifique & Technologique, Mar 2009, Nancy, France. Recherche et représentation de communautés dans des grands graphes

Communication dans un congrès hal-00371956v1
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Topologically Ordered Graph Clustering via Deterministic Annealing

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix

European Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2009, Bruges, Belgium. pp.529-534

Communication dans un congrès hal-00666602v1

Are gene networks always meaningful ?

Adrien Gamot , Nathalie Villa , Laurence Liaubet , F. Rossi , Gwenola Tosser-Klopp et al.

EADGENE Genomics for Animal Health: Outlook for the Future, Oct 2009, Paris, France

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Consistency of Derivative Based Functional Classifiers on Sampled Data

Fabrice Rossi , Nathalie Villa-Vialaneix

ESANN 2008, 16th European Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2008, Bruges, Belgium. pp.445-450

Communication dans un congrès hal-00666609v1
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Mining a medieval social network by kernel SOM and related methods

Nathalie Villa , Fabrice Rossi , Quoc-Dinh Truong

MASHS 2008 (Modèles et Apprentissages en Sciences Humaines et Sociales), Jun 2008, Créteil, France

Communication dans un congrès hal-00278196v1
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A comparison between dissimilarity SOM and kernel SOM for clustering the vertices of a graph

Nathalie Villa-Vialaneix , Fabrice Rossi

WSOM'07 - Workshop on Self-Organizing Maps, Sep 2007, Bielefeld, Germany. pp.WeP-1

Communication dans un congrès hal-00674189v1
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Clustering a medieval social network by SOM using a kernel based distance measure

Nathalie Villa , Romain Boulet

European Symposium on Artificial Neural Networks, Apr 2007, Bruges, Belgium. pp.31-36

Communication dans un congrès hal-00145117v1
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Sur l'analyse de réseaux de sociabilité de la société paysanne médiévale

Romain Boulet , Florent Hautefeuille , Bertrand Jouve , Pascale Kuntz , Bleuenn Le Goffic et al.

Computational Methods for Modelling and learning in Social and Human Sciences (MASHS), May 2007, Brest, France. pp.3b-3

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SVM fonctionnels par interpolation spline

Nathalie Villa , Fabrice Rossi

Journée de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique, May 2006, Clamart (FR), France

Communication dans un congrès hal-04176653v1
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Integrating Remote Sensing, GIS and Prediction Models to Monitor the Deforestation and Erosion in Peten Reserve, Guatemala

Roberto Bruno , Marco Follador , Martin Paegelow , Fernanda Renno , Nathalie Villa

IAMG'2006 Annual Conference on Quantitative Geology from Multiple Sources, Sep 2006, Liège, Belgium. pp.Integrating Remote Sensing, GIS and Prediction Models to Monitor the Deforestation and Erosion in Pe

Communication dans un congrès hal-00372648v1
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Support Vector Machine For Functional Data Classification

Nathalie Villa , Fabrice Rossi

XIIIth European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning (ESANN 2005), Apr 2005, Bruges, Belgium. pp.467-472

Communication dans un congrès hal-04176766v1
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Classification in Hilbert Spaces with Support Vector Machines

Fabrice Rossi , Nathalie Villa

XIth International Symposium on Applied Stochastic Models and Data Analysis (ASMDA 2005), May 2005, Brest, France. pp.635-642

Communication dans un congrès hal-04176760v1

A comprehensive review and benchmark of differential analysis tools for Hi-C data

Élise Jorge , Sylvain Foissac , Pierre Neuvial , Matthias Zytnicki , Nathalie Vialaneix

ISMB/ECCB, Jul 2025, Liverpool, United Kingdom

Poster de conférence hal-05185342v1
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The Genotoul-Bioinfo platform

Florent Blaise , Philippe Bordron , Patrice Dehais , Vincent Dominguez , Christine Gaspin et al.

JOBIM2025, Jul 2025, Bordeaux, France

Poster de conférence hal-05163782v1

P13-31 Characterization of human isogenic epithelial cell lines as a relevant tool to study colon carcinogenesis and interaction between genes and environment

Arnaud Tête , L. Arnaud , H. Le Mentec , N. Poupin , I. Gallais et al.

58th Congress of the European Societies of Toxicology (EUROTOX 2024), Sep 2024, Copenhague, Denmark. 399, pp.S222-S223, 2024, ⟨10.1016/j.toxlet.2024.07.547⟩

Poster de conférence hal-04690388v1
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Characterization of the endometrial metabolome in late gestation

Alyssa Imbert , Nathalie Marty-Gasset , Laure Gress , Cecile Bonnefont , Nathalie Vialaneix et al.

International Conference on Pig Reproduction 2023, Jun 2023, Ghent, Belgium

Poster de conférence hal-04126140v1
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Transcriptome of the feto-maternal interface in pigs in late gestation: part1fetal placenta

Agnès Bonnet , Sarah Maman , Laure Gress , Amandine Suin , Céline Bravo et al.

Joint International Congress on Animal Science (EEAP 2023), Aug 2023, Lyon, France. pp.37.20

Poster de conférence hal-04193423v1

Neonatal metabolic profiling shows relationships between metabolites and biometric phenotypes related to piglet maturity at birth

Laurence Liaubet , Gaëlle Lefort , Yvon Billon , Sébastien Reigner , Jean Bailly et al.

11. International Conference on Pig Reproduction (ICPR), Jun 2023, Ghent, Belgium. 90 (7), p. 732, n°49, 2023

Poster de conférence hal-04121651v1

1H-NMR metabolomic study of Large White and Meishan pigs in late gestation: part 2 - sow endometrium

Alyssa Imbert , Nassim Duprat , Nathalie Marty-Gasset , Laure Gress , Cécile Canlet et al.

Joint International Congress on Animal Science (EEAP 2023), Aug 2023, Lyon, France. pp.37.22

Poster de conférence hal-04193451v1
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Transcriptome of the feto-maternal interface in pigs in late gestation: part2 - sow endometrium

Agnès Bonnet , Sarah Maman , Laure Gress , Amandine Suin , Sabrina Legoueix et al.

Joint International Congress on Animal Science (EEAP 2023), Aug 2023, Lyon, France. pp.37.21

Poster de conférence hal-04193444v1
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ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

Élise Maigné , Céline Noirot , Jérôme J. Mariette , Yaa Adu Kesewaah , Sébastien Dejean et al.

Journée Régional Bioinfo/Biostat, Dec 2022, Toulouse, France

Poster de conférence hal-03882998v1
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Identification par une approche de métabolomique des voies métaboliques associées à la fragilité dans une cohorte de personnes âgées

Céline Bougel , Rémi Servien , Nathalie Vialaneix , Cécile Canlet , Laurent Debrauwer et al.

Journées Francophones de Nutrition (JFN 2022), Nov 2022, Toulouse, France

Poster de conférence hal-03856941v1
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ASTERICS: A Tool for the ExploRation and Integration of omiCS data

Élise Maigné , Céline Noirot , Jérôme J. Mariette , Yaa Adu Kesewaah , Sébastien Dejean et al.

ECCB: 21st European Conference on Computational Biology, Sep 2022, Sitges, Spain. , 2022, ⟨10.7490/f1000research.1119290.1⟩

Poster de conférence hal-03890660v1

Leçons apprises de l' évaluation des méthodes d'inférence de réseau de gènes chez Bacillus subtilis

Léa Grima , Celine Brouard , Simon De Givry , Anne Goelzer , Élise Maigné et al.

Journée Régionale Bioinfo/Biostat, Dec 2022, Toulouse, France.

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Characterization of human isogenic epithelial cell lines as a relevant tool to study colon carcinogenesis and interaction between genes and environment

Arnaud Tête , Liana C. Arnaud , Hélène Le Mentec , Isabelle Gallais , Nathalie Poupin et al.

Society of Toxicology Annual Meeting (SOT 2022), Mar 2022, San Diego, United States. , 3579, pp.P204

Poster de conférence hal-03637792v1
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Characterization of human isogenic epithelial cell lines as a relevant tool to study colon carcinogenesis and interaction between genes and environment

Arnaud Tête , Liana C. Arnaud , Hélène Le Mentec , Isabelle Gallais , Noémie Tournadre et al.

Congrès Annuel de la Société Française de Biochimie et Biologie Moléculaire, Jul 2021, Paris, France

Poster de conférence hal-03279912v1
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Étude de la maturité des porcelets en fin de gestation par une approche métabolomique multifluide

Gaëlle Lefort , Nathalie Vialaneix , Hélène Quesnel , Marie-Christine Pere , Yvon Billon et al.

52. Journées de la Recherche Porcine, Feb 2020, Paris, France. IFIP - Institut du Porc, Journées de la Recherche Porcine en France, pp.411-412, 2020, 52èmes journées de la recherche porcine

Poster de conférence hal-02479994v1
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Joint automatic metabolite identification and quantification of a set of 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Nathalie Marty-Gasset , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix et al.

Metabolomics 2020, Oct 2020, Online, France

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Study of fetal pig maturity in relation with neonatal survival using a multi-fluids metabolomic approach

Gaëlle Lefort , Nathalie Vialaneix , Hélène Quesnel , Marie-Christine Pere , Nathalie Iannuccelli et al.

15. Annual Conference of the Metabolomics Society (Metabolomics 2019), Jun 2019, La Haye, Netherlands. , 2019

Poster de conférence hal-02791588v1
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Classification ascendante hiérarchique, contrainte d'ordre : conditions d'applicabilité, interprétabilité des dendrogrammes

Nathanaël Randriamihamison , Pierre Neuvial , Nathalie Vialaneix

Conférence sur l'Apprentissage Automatique (CAp 2019), Jul 2019, Toulouse, France. , 2019

Poster de conférence hal-02786174v1

ASICS: identification and quantification of metabolites in complex 1D 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Hélène Quesnel , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix et al.

15th Annual Conference of the Metabolomics Society (Metabolomics 2019), Jun 2019, La Haye, Netherlands. , 2019

Poster de conférence hal-02790207v1
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ASICS : un package R pour l'identification et la quantification de métabolites dans un spectre RMN 1H

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix , Rémi Servien

Journée Régionale de Bioinformatique et Biostatistique, Génopole Toulouse, Oct 2019, Toulouse, France. 2019

Poster de conférence hal-02788670v1
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Adjacency-constrained hierarchical clustering of a band similarity matrix with application to genomics

Christophe Ambroise , Alia Dehman , Pierre Neuvial , Guillem Rigaill , Nathalie Vialaneix

Statistical Methods for Post-Genomic Data (SMPGD), Jan 2019, Barcelona, Spain. 2019

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ASICS: a new R package for identification and quantification of metabolites in complex 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Hélène Quesnel , Nathalie Vialaneix et al.

useR! 2019, Jul 2019, Toulouse, France. , 2019

Poster de conférence hal-02788659v1

ASICS: a new R package for identification and quantification of metabolites in complex 1D 1H NMR spectra

Gaëlle Lefort , Laurence Liaubet , Cécile Canlet , Nathalie Vialaneix , Rémi Servien

European Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece. , 2018

Poster de conférence hal-02789726v1

Integrative analyses of chromosome conformation, chromatin accessibility and gene expression in human and livestock genomes

Camille Mestre , Sarah Djebali Quelen , Thomas Faraut , Nathalie Vialaneix , Andrea Rau et al.

European Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece. , 2018

Poster de conférence hal-02784857v1

Developpement de biomarqueurs sanguins pour évaluer la sensibilité des porcs à la chaleur

Samir Dou , Nathalie Villa-Vialaneix , Laurence Liaubet , Hélène Gilbert , Jean-Luc Gourdine et al.

Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2018), Apr 2018, Rennes, France. , 2018, Journées d’animation scientifiques du département Phase - Recueil des résumés

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Integrative and differential analysis of transcriptomes and chromatin accessibility regions reveals regulatory mechanisms involved in pig immune and metabolic functions

Sarah Djebali Quelen , Kylie Munyard , Nathalie Villa-Vialaneix , Cédric Cabau , Andrea Rau et al.

36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book

Poster de conférence hal-01603033v1
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Characterization of 3D genomic interactions in fetal pig muscle

Maria Marti-Marimon , Hervé Acloque , Matthias Zytnicki , Sarah Djebali Quelen , Nathalie Villa-Vialaneix et al.

36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book

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Reprise de cyclicité post partum et performances de reproduction chez la vache laitière Prim'Holstein en France

Claire Saby , Wenting Zhang , René Fournier , Rémi Servien , Nathalie Villa-Vialaneix et al.

Journées Nationales des GTV 2017, May 2017, Reims, France. , 7 p., 2017, Recueil des Journées Nationales des GTV 2017

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Profiling the landscape of transcription, chromatin accessibility and chromosome conformation of cattle, pig, chicken and goat genomes [FAANG pilot project]

Sylvain Foissac , Sarah Djebali Quelen , Hervé Acloque , Philippe Bardou , Fany Blanc et al.

36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book

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Time course of the response to ACTH in pig: biological and transcriptomic study

Valérie Sautron , Elena Mormede Terenina , Laure Gress , Yannick Lippi , Yvon Billon et al.

35. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2016, Salt Lake City, United States. ASAS - American Society of Animal Science, 94 (S4), 2016, 35th Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG)

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Estimating nitrous oxide fluxes from agricultural soils at European scale using a crop generic meta-model

Lily Paniagua , Adrian Leip , Nathalie N. Villa-Vialaneix , Wim de Vries

19th Nitrogen Workshop, Jun 2016, Skara, Sweden. , 2016

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Multiway SIR for biological data integration

Valérie Sautron , Marie Chavent , Nathalie Viguerie , Nathalie N. Villa-Vialaneix

Statistical Methods for Post Genomic Data, Feb 2016, Lille, France. , 2016

Poster de conférence hal-02791870v1

3D nuclear positioning of IGF2 alleles and trans interactions with imprinted genes in pig fetal cells

Yvette Lahbib Mansais , Maria Marti-Marimon , Valentin Voillet , Harmonie Barasc , Florence Mompart et al.

Conference on Genome Architecture in Space and Time, Jun 2016, Trieste, Italy. 2016

Poster de conférence hal-02794242v1
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Reconstruction quality of a biological network when its constituting elements are partially observed

Victor Picheny , Jimmy Vandel , Matthieu Vignes , Nathalie N. Villa-Vialaneix

17th International Conference on Artificial Intelligence and Statistics - AI & Statistics 2014, Apr 2014, Reykjavik, Iceland. , pp.1, 2014, AISTATS 2014 Talks and Papers

Poster de conférence hal-02739296v1
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Comprendre l'organisation spatiale de l'ADN à l'aide de la statistique

Pierre Neuvial , Sylvain Foissac , Nathalie Vialaneix

Martina Knoop, Stéphane Blanc, Mokrane Bouzeghoub. L’Interdisciplinarité, CNRS Editions, pp.178-182, 2023

Chapitre d'ouvrage hal-03930070v1
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Des noyaux pour les omiques

Jérôme J. Mariette , Nathalie Vialaneix

Intégration de Données Biologiques, 2022

Chapitre d'ouvrage hal-03809784v1
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Kernel and dissimilarity methods for exploratory analysis in a social context

Jérôme J. Mariette , Madalina Olteanu , Nathalie Vialaneix

Advances in Contemporary Statistics and Econometrics. Festschrift in Honor of Christine Thomas-Agnan, 2021

Chapitre d'ouvrage hal-03279887v1
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Apprentissage connexionniste

Nathalie Villa-Vialaneix , Stéphane Canu

Apprentissage Statistique et Données Massives, Editions Technip, pp.536, 2018, 9782710811824

Chapitre d'ouvrage hal-01849298v1

Large-Scale Measurement of mRNA Degradation in Escherichia coli: To Delay or Not to Delay

Sandrine Laguerre , Ignacio González , Sébastien Nouaille , Annick Moisan , Nathalie Villa-Vialaneix et al.

High-density sequencing applications in microbial molecular genetics, 612, ELSEVIER ACADEMIC PRESS INC, pp.47-66, 2018, Methods in Enzymology, 978-0-12-815993-4. ⟨10.1016/bs.mie.2018.07.003⟩

Chapitre d'ouvrage hal-02107623v1
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Méthodes pour l’apprentissage de données massives

Nathalie Villa-Vialaneix , Fabrice Rossi

Apprentissage Statistique et Données Massives, Editions Technip, pp.536, 2018, 9782710811824

Chapitre d'ouvrage hal-01849297v1
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Depicting gene co-expression networks underlying eQTLs

Nathalie Vialaneix , Laurence Liaubet , Magali San Cristobal

Haja N. Kadarmideen. Systems Biology in Animal Production and Health vol 2, 2, Springer International Publishing, pp.1-31, 2016, 978-3-319-43330-1. ⟨10.1007/978-3-319-43332-5_1⟩

Chapitre d'ouvrage hal-01390589v1
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Tropical deforestation modelling : a comparative analysis of different predictive approaches. The case study of Peten, Guatemala.

Marco Follador , Nathalie Villa , Martin Paegelow , Fernanda Renno , Roberto Bruno

Modelling Environmental Dynamics, Springer, pp.77-108, 2008, ⟨10.1007/978-3-540-68498-5_3⟩

Chapitre d'ouvrage hal-00667122v1

Recent advances in the use of SVM for functional data classification

Fabrice Rossi , Nathalie Villa

Sophie Dabo-Niang, Frédéric Ferraty. Functional and operatorial statistics, Physica-Verlag/Springer, pp.273-280, 2008, Contrib. Statist., ⟨10.1007/978-3-7908-2062-1_41⟩

Chapitre d'ouvrage istex hal-00635480v1
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Prospective modelling of environmental dynamics. A methodological comparison applied to mountain land cover changes

Martin Paegelow , Maria T. Camacho Olmedo , Frédéric Ferraty , Louis Ferré , Pascal Sarda et al.

Modelling Environmental Dynamics, Springer, pp.141-168, 2008, ⟨10.1007/978-3-540-68498-5_5⟩

Chapitre d'ouvrage hal-00667123v1
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Contributions à l'analyse de données non vectorielles

Nathalie Villa-Vialaneix

Statistiques [math.ST]. Université de Toulouse, 2014

HDR tel-01088152v1
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Contributions à l’analyse de données non vectorielles

Nathalie Villa-Vialaneix

Applications [stat.AP]. Université Toulouse 1 Capitole (UT1 Capitole), 2014

HDR tel-01523743v1

SOMbrero: SOM Bound to Realize Euclidean and Relational Outputs

Nathalie Vialaneix , Elise Maigne , Jerome Mariette , Madalina Olteanu , Fabrice Rossi Logiciel hal-04860539v1

NMFProfiler

Aurélie Mercadié , Eric Casellas , Eléonore Gravier , Gwendal Josse , Nathalie Vialaneix et al. Logiciel hal-04683370v1

ASTERICS

Elise Maigné , Céline Noirot , Julien Henry , Yaa Adu Kesewaah , Ludovic Badin et al. Logiciel hal-04095877v1

RNAseqNet: Log-Linear Poisson Graphical Model with Hot-Deck Multiple Imputation (R package, available on CRAN)

Nathalie Vialaneix , Alyssa Imbert

2018

Logiciel hal-02788053v1

ASICS: Automatic Statistical Identification in Complex Spectra (R package, available on Bioconductor)

Gaëlle Lefort , Rémi Servien , Patrick Tardivel , Nathalie Vialaneix

2017

Logiciel hal-02790128v1

mixKernel: Omics Data Integration Using Kernel Methods

Jérôme J. Mariette , Nathalie Vialaneix

2017

Logiciel hal-02791779v1

adjclust: Adjacency-Constrained Clustering of a Block-Diagonal Similarity Matrix (R package, available on CRAN)

Pierre Neuvial , Christophe Ambroise , Shubham Chaturvedi , Alia Dehman , Michel Koskas et al.

2017

Logiciel hal-02791370v1

SISIR: Sparse Interval Sliced Inverse Regression (R package, available on CRAN)

Nathalie Vialaneix , Victor Picheny , Rémi Servien

2016

Logiciel hal-02794207v1

SOMbrero: SOM Bound to Realize Euclidean and Relational Outputs (R package, available on CRAN)

Nathalie Vialaneix , Jérôme J. Mariette , Madalina Olteanu , Fabrice Rossi , Laura Bendhaiba et al.

2015

Logiciel hal-02794474v1