Olivier Gargominy

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New species and new records of families, genera and species of land snails (Mollusca, Gastropoda) from French Guiana

Olivier Gargominy , Benoît Fontaine , Sandrine Tercerie , Dario Zuccon
Zookeys, 2025, 1230, pp.155-194. ⟨10.3897/zookeys.1230.133585⟩
Article dans une revue mnhn-04981139 v1
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In the Shadow of Medicine: The Glaring Absence of Occurrence Records of Human-Hosted Biodiversity

Rémy Poncet , Olivier Gargominy
Online Journal of Public Health Informatics, 2024, 16, pp.e60140. ⟨10.2196/60140⟩
Article dans une revue hal-04837272 v1
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Systématique, taxonomie, nomenclature, TAXREF et SINP : tour d’horizon des concepts, normes, référentiels et standards qui fondent le langage commun utilisé par les scientifiques et les naturalistes en France et à l’international

Rémy Poncet , Océane Fogliani , Sandrine Tercerie , Noëlie Maurel , Solène Robert et al.
Bulletin de l'Association française de Lichénologie, 2024, 42 (2), pp.197-208
Article dans une revue hal-04837252 v1
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Knowledge Base on Species Life Traits : A Spanish/French Plinian Core implementation use case

Sophie Pamerlon , Anne-Sophie Archambeau , Francisco Pando de la Hoz , Olivier Gargominy , Franck Michel et al.
Biodiversity Information Science and Standards, 2023, 7, pp.e111784. ⟨10.3897/biss.7.111784⟩
Article dans une revue hal-04198414 v1

Conservation assessment based on large-scale monitoring of eDNA: Application to freshwater mussels

Vincent Prié , Alain Danet , Alice Valentini , Manuel Lopes-Lima , Pierre Taberlet et al.
Biological Conservation, 2023, 283, pp.110089. ⟨10.1016/j.biocon.2023.110089⟩
Article dans une revue hal-04894456 v1
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Pre-assessments of plant conservation status in islands: the case of French Overseas Territories

Simon Véron , Arthur Bernard , Elise Lebreton , Carlos Rodrigues-Vaz , M Durand et al.
Biodiversity and Conservation, 2023, 32 (4), pp.1165-1187. ⟨10.1007/s10531-023-02544-8⟩
Article dans une revue mnhn-03952485 v1
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Les mollusques continentaux de Saül (Guyane). Bilan des missions 2018-2020 de l'Atlas de la biodiversité communale

Olivier Gargominy , Benoît Fontaine , Sandrine Tercerie , Ahmed Abdou , Sébastien Sant
Les Cahiers scientifiques du parc amazonien de Guyane, 2022, 7 (2), pp.83-99
Article dans une revue mnhn-03987857 v1
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The first large-scale All Taxa Biodiversity Inventory in Europe: description of the Mercantour National Park ATBI datasets

Jean Ichter , Olivier Gargominy , Marie-France Leccia , Solène Robert , Laurent Poncet
Biodiversity Data Journal, 2022, 10, pp.e85901. ⟨10.3897/bdj.10.e85901⟩
Article dans une revue (data paper) hal-04133216 v1

An assessment of the endemic spermatophytes, pteridophytes and bryophytes of the French Overseas Territories: towards a better conservation outlook

Simon Véron , Carlos Rodrigues-Vaz , Elise Lebreton , Claudine Ah-Peng , Vincent Boullet et al.
Biodiversity and Conservation, 2021, 30 (7), pp.2097-2124. ⟨10.1007/s10531-021-02186-8⟩
Article dans une revue mnhn-03217441 v1
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Discovery of the only living population of Pupoidopsis hawaiensis (Gastropoda: Pupillidae) in the last 50 years

Olivier Gargominy , Jean-François Butaud , Benoît Fontaine , Vincent Prié , Dario Zuccon et al.
American malacological Bulletin, 2020, 38 (1), pp.50. ⟨10.4003/006.038.0103⟩
Article dans une revue mnhn-03084456 v1
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Integration of Web APIs and Linked Data Using SPARQL Micro-Services - Application to Biodiversity Use Cases

Franck Michel , Catherine Faron Zucker , Olivier Gargominy , Fabien Gandon
Information, 2018, Special Issue "Semantics for Big Data Integration", 9 (12), ⟨10.3390/info9120310⟩
Article dans une revue hal-01947589 v1
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Breathing device of a new Streptaulus species from Vietnam extends understanding of the function and structure of respiratory tubes in cyclophoroids (Gastropoda: Caenogastropoda: Pupinidae)

Barna Páll-Gergely , Olivier Gargominy , Benoît Fontaine , Takahiro Asami
Journal of Molluscan Studies, 2017, 83 (2), pp.243-248. ⟨10.1093/mollus/eyx006⟩
Article dans une revue hal-03864281 v1
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De l'utilité d'un inventaire national

Olivier Gargominy , Lilian Léonard , Vincent Prié , Xavier Cucherat
MalaCo : Le journal de malacologie continentale, 2016, Actes du colloque national de malacologie continentale du 30 et 31 mars 2016 à Barenton-Bugny (Aisne) (12), pp.67-87
Article dans une revue mnhn-04431542 v1

PESI - a taxonomic backbone for Europe

Yde de Jong , Juliana Kouwenberg , Louis Boumans , Charles Hussey , Roger Hyam et al.
Biodiversity Data Journal, 2015, 3, pp.e5848. ⟨10.3897/BDJ.3.e5848⟩
Article dans une revue hal-02060422 v1
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Biogeographic comparisons of herbivore attack, growth and impact of Japanese knotweed between Japan and France

Noëlie Maurel , Maasaki Fujiyoshi , Audrey Muratet , Emmanuelle Porcher , Eric Motard et al.
Journal of Ecology, 2013, 101 (1), pp.118-127. ⟨10.1111/1365-2745.12026⟩
Article dans une revue mnhn-02265411 v1
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New Species in the Old World: Europe as a Frontier in Biodiversity Exploration, a Test Bed for 21st Century Taxonomy

Benoît Fontaine , Kees van Achterberg , Miguel Angel Alonso-Zarazaga , Rafael Araujo , Manfred Asche et al.
PLoS ONE, 2012, 7 (5), pp.e36881. ⟨10.1371/journal.pone.0036881⟩
Article dans une revue hal-04178075 v1

National Inventory of Natural Heritage website: recent, historical and archaeological data

Cécile Callou , Isabelle Baly , Olivier Gargominy , Elodie Rieb
SAA Archaeological Record, 2011, 11 (1), pp.37-40
Article dans une revue mnhn-02103401 v1

Foot mucus stored on FTA cards is a reliable and non-invasive source of DNA for genetics studies in molluscs.

Claire Régnier , Olivier Gargominy , G. Falkner , Nicolas Puillandre
Conservation Genetics Resources, 2011, 3(2), pp.377-382
Article dans une revue hal-00575851 v1
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Les noms scientifiques français des mollusques continentaux de France: processus d'établissement d'une liste de référence

Benoît Fontaine , Jean-Michel Bichain , Xavier Cucherat , Olivier Gargominy , Vincent Prie
Revue d'Écologie, 2010, 65 (4), pp.293-317
Article dans une revue hal-03530343 v1

Quatre espèces nouvelles d'Endodontidae (Mollusca, Pulmonata) éteints de Rurutu (Îles Australes, Polynésie française)

Gabrielle Zimmermann , Olivier Gargominy , Benoît Fontaine
Zoosystema, 2009, 31 (4), pp.791-805
Article dans une revue hal-00455821 v1
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Pagodulina subdola (Gredler, 1856) (Gastropoda, Stylommatophora, Orculidae) fait bien partie de la faune de France Occurrence in France confirmed for Pagodulina subdola (Gredler, 1856) (Gastropoda, Stylommatophora, Orculidae)

Olivier Gargominy , Theo E.J. Ripken , Alexis Matamoro-Vidal , Daniel Reboul
MalaCo : Le journal de malacologie continentale, 2008
Article dans une revue hal-03925457 v1

In memoriam - L'escargot de Corse, Helix ceratina

Olivier Gargominy , Benoît Fontaine
Le Courrier de l'environnement de l'INRA, 1999, 36 (36)
Article dans une revue hal-01212998 v1
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Conséquences des introductions d'espèces animales et végétales sur la biodiversité en Nouvelle-Calédonie

Olivier Gargominy , Philippe Bouchet , Michel Pascal , Tanguy Jaffre , Jean-Christophe Tourneur
Revue d'Écologie, 1996, 51 (4), pp.375-402
Article dans une revue hal-03528969 v1

Conséquences des introductions d'espèces animales et végétales sur la biodiversité en Nouvelle-Calédonie

Olivier Gargominy , Philippe Bouchet , Michel Pascal , Tanguy Jaffré , Jean-Christophe Tourneur
Revue d'Écologie, 1996, 51 (4), pp.375-402
Article dans une revue hal-03191921 v1
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Référentiel des séquences génétiques des espèces de France : note pour la mise en place d’un nouvel outil national

Lacoeuilhe Aurélie , Gaël P.J. Denys , Pascal Dupont , Anne-Sophie Archambeau , Bertrand Bed’hom et al.
PatriNat (OFB-MNHN-CNRS-IRD). 2025, pp.32
Rapport hal-04931482 v1
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Synthèse sur les récoltes de mollusques continentaux dans le cadre commun de La Planète revisitée et de l'ABC de Poum

Lilian Léonard , Olivier Gargominy
Patrinat (OFB-MNHN-CNRS-IRD). 2024, pp.21
Rapport (rapport technique) hal-05002776 v1
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TAXREF, référentiel taxonomique pour la France : méthodologie, mise en œuvre et diffusion

Olivier Gargominy , Sandrine Tercerie , Claire Régnier , Thibault Ramage , Pascal Dupont et al.
PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2022, 48 p
Rapport (rapport technique) mnhn-04148966 v1
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La Planète Revisitée en Corse. Expéditions terrestres 2021 - Côte orientale et <i>Capicorsu</i>

Jean Ichter , François Dusoulier , Jérôme Barbut , Cyril Berquier , Alain Canard et al.
Muséum national d'Histoire naturelle. 2022
Rapport mnhn-04143025 v1
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Inventaire des mollusques terrestres de Corse : Focus sur les genres Tacheocampylaea et Oxychilus

Olivier Gargominy , Lilian Léonard , Sandrine Tercerie , Xavier Cucherat , Benoît Fontaine et al.
PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2022, 78 p
Rapport hal-03953841 v1
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Enquête de satisfaction sur l'utilisation et les besoins de services associés au référentiel taxonomique national TAXREF

Laure Idzack , Olivier Gargominy , Pascal Dupont
PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2022, 20 p
Rapport mnhn-04133278 v1
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La Planète Revisitée en Corse. Bilan scientifique des expéditions terrestres 2020 : Agriate, Capicorsu et Saint-Florent

Jean Ichter , François Dusoulier , Jérôme Barbut , Alain Canard , Marie Canut et al.
Muséum national d'Histoire naturelle; PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2021, 69 p
Rapport mnhn-04166355 v1

Base de connaissance "Statuts" des espèces en France. Version pour TAXREF v13.0

Olivier Gargominy , C Régnier
PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2020
Rapport mnhn-04254147 v1
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TAXREF v14, référentiel taxonomique pour la France : méthodologie, mise en œuvre et diffusion

Olivier Gargominy , Sandrine Tercerie , Claire Régnier , Thibault Ramage , Pauline Dupont et al.
PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2020, 64 p
Rapport mnhn-04254870 v1
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Guide d'utilisation de CardObs - v4.0

Olivier Gargominy , Claire Jacquet
PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2020, pp.26
Rapport mnhn-04254123 v1

BiodiversiClés : Escargots de France métropolitaine (MALACO-FR)

Olivier Gargominy
PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2020
Rapport mnhn-04254168 v1

Base de données pour MALACO-GF, application Android d'aide à l'identification des escargots de Guyane française

Olivier Gargominy
PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2020
Rapport mnhn-04254257 v1
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Inventaire des mollusques terrestres de Corse : Focus sur le genre Tacheocampylaea

Olivier Gargominy , Lilian Léonard , Sandrine Tercerie , Xavier Cucherat , Dario Zuccon
PatriNat (AFB-CNRS-MNHN). 2018, 55 p
Rapport mnhn-04271593 v1
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Les inventaires généraux de la biodiversité en France et dans le monde

Jean Ichter , Marie-France Leccia , Julien Touroult , Patrick Blandin , Pierre-Henri Aberlenc et al.
UMS Patrimoine Naturel (AFB-CNRS-MNHN); Inventaire National du Patrimoine Naturel (MNHN); Parc national du Mercantour. 2018, pp.1-61
Rapport mnhn-04271668 v1
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Diffusion des statuts des espèces : principes et objectifs

C Régnier , Olivier Gargominy
PatriNat (AFB-CNRS-MNHN). 2018, pp.8
Rapport mnhn-04276794 v1

TAXREF v11, référentiel taxonomique pour la France : méthodologie, mise en œuvre et diffusion

Olivier Gargominy , Sandrine Tercerie , Claire Régnier , Thibault Ramage , Pauline Dupont et al.
PatriNat (AFB-CNRS-MNHN). 2017, 60 p
Rapport mnhn-04287321 v1

Base de données des espèces protégées et réglementées en France. Version pour TAXREF v11.0

Olivier Gargominy , C Régnier
PatriNat (AFB-CNRS-MNHN). 2017
Rapport mnhn-04287234 v1
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TAXREF v11.0, référentiel taxonomique pour la France : méthodologie, mise en œuvre et diffusion

Olivier Gargominy , S Tercerie , C Régnier , T Ramage , P Dupont et al.
PatriNat (AFB-CNRS-MNHN). 2017, pp.60
Rapport mnhn-04282282 v1
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TAXREF v11, référentiel taxonomique pour la France. Partie 5: Sources

Olivier Gargominy , S Tercerie , C Régnier , T Ramage , P Dupont et al.
PatriNat (AFB-CNRS-MNHN). 2017, pp.59-151
Rapport mnhn-04282269 v1

Santo 2006 Progress Report

Josep Antoni Alcover Tomas , Anne Bedos , Philippe Bouchet , Geoff Boxshall , Florence Brunois et al.
[0] MNHN. 2007
Rapport hal-02823400 v1
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Des données aux résultats d’évaluation, retour sur la première Liste rouge des mollusques continentaux de France métropolitaine

Guillaume Gigot , Olivier Gargominy
3ème Colloque national de malacologie continentale, Conservatoire botanique national de Franche-Comté – Observatoire régional des Invertébrés (CBNFC-ORI); PatriNat (OFB-MNHN-CNRS-IRD), Oct 2023, Besançon (Doubs), France
Communication dans un congrès mnhn-05023480 v1
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Biodiversity Knowledge Graphs: Time to move up a gear!

Franck Michel , Antonia Ettorre , Catherine Faron , Julien Kaplan , Olivier Gargominy
TDWG 2021 annual virtual conference, Oct 2021, Virtual, France. pp.e73699, ⟨10.3897/biss.5.73699⟩
Communication dans un congrès hal-03373536 v1

Unleash the Potential of your Website! 180,000 webpages from the French Natural History Museum marked up with Bioschemas/Schema.org biodiversity types

Franck Michel , Olivier Gargominy , Benjamin Ledentec , Bioschemas Community
TDWG 2020 annual conference, Oct 2020, Virtual, France. ⟨10.3897/biss.4.59046⟩
Communication dans un congrès hal-02976710 v1
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Assisting Biologists in Editing Taxonomic Information by Confronting Multiple Data Sources using Linked Data Standards

Franck Michel , Sandrine Tercerie , Antonia Ettorre , Olivier Gargominy , Catherine Faron Zucker
Biodiversity Next, Oct 2019, Leiden, Netherlands. ⟨10.3897/biss.3.37421⟩
Communication dans un congrès hal-02168164 v1
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Modelling Biodiversity Linked Data: Pragmatism May Narrow Future Opportunities

Franck Michel , Catherine Faron Zucker , Sandrine Tercerie , Olivier Gargominy
SPNHC+TDWG 2018 Conference, Aug 2018, Dunedin, New Zealand. ⟨10.3897/biss.2.26235⟩
Communication dans un congrès hal-01856363 v1

Construction du référentiel taxonomique commun TAXREF, socle pour la connaissance et l'échange de données

Olivier Gargominy , Franck Michel , Sandrine Tercerie
Séminaire Interopérabilité des systèmes d'information sur l'eau (INSIDE 2017), Mar 2017, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01585294 v1
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A Model to Represent Nomenclatural and Taxonomic Information as Linked Data. Application to the French Taxonomic Register, TAXREF

Franck Michel , Olivier Gargominy , Sandrine Tercerie , Catherine Faron Zucker
ISWC 2017 Workshop on Semantics for Biodiversity (S4Biodiv 2017), Oct 2017, Vienna, Austria. pp.1-12
Communication dans un congrès hal-01617708 v1
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TAXREF-LD: A Reference Thesaurus for Biodiversity on the Web of Linked Data

Franck Michel , Catherine Faron Zucker , Sandrine Tercerie , Olivier Gargominy
Biodiversity Information Standards (TDWG), Oct 2017, Ottawa, Canada. ⟨10.3897/tdwgproceedings.1.20232⟩
Communication dans un congrès hal-01612451 v1

Construction d’un référentiel taxonomique commun pour des études sur l’histoire de la zoologie, l’archéozoologie et la biologie

Franck Michel , Cécile Callou , Catherine Faron Zucker , Olivier Gargominy , Chloé Martin et al.
SemWeb.Pro 2016, Nov 2016, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01401357 v1
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Actes du séminaire des inventaires généraux de la biodiversité (IGB/ATBI)

Jean Ichter , Henri-Pierre Aberlenc , Vincent Augé , Richard Bonet , Damien Combrisson et al.
Séminaire des inventaires généraux de la biodiversité (IGB/ATBI), PatriNat (OFB/MNHN) / Parc national des Écrins, 2024
Proceedings/Recueil des communications hal-04607210 v2
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À la rencontre des Mollusques (2023)

Victor Robin-Havret , Florian Barnier , Sarah Figuet , Olivier Gargominy , Lilian Léonard et al.
PatriNat (OFB-MNHN-CNRS-IRD), Paris. pp.16, 2023, La biodiversité en France
Ouvrages (manuel) mnhn-04225071 v1