Olivier Gargominy

59
Documents

Publications

Publications

Deposit thumbnail

Inventaires naturalistes du Domaine national de Chambord incluant un test de recensement des Odonates par ADNe - Sortie de service 2024

Rémy Poncet , Aurélie Lacoeuilhe , Violette Lervy-Mayere , Antoine Lévêque , Julien Touroult et al.

PatriNat (OFB-MNHN-CNRS-IRD). 2025, 28 p

Rapport hal-05140351v1
Deposit thumbnail

Référentiel des séquences génétiques des espèces de France : note pour la mise en place d'un nouvel outil national

Aurélie Lacoeuilhe , Gaël P.J. Denys , Pascal Dupont , Anne-Sophie Archambeau , Bertrand Bed’hom et al.

PatriNat (OFB-MNHN-CNRS-IRD). 2025, 25 p. + annexes

Rapport hal-04931482v1
Deposit thumbnail

Synthèse sur les récoltes de mollusques continentaux dans le cadre commun de La Planète revisitée et de l'ABC de Poum

Lilian Léonard , Olivier Gargominy

Patrinat (OFB-MNHN-CNRS-IRD). 2024, 23 p

Rapport (rapport technique) hal-05002776v2
Deposit thumbnail

TAXREF, référentiel taxonomique pour la France : méthodologie, mise en œuvre et diffusion

Olivier Gargominy , Sandrine Tercerie , Claire Régnier , Thibault Ramage , Pascal Dupont et al.

PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2022, 48 p

Rapport (rapport technique) mnhn-04148966v1
Deposit thumbnail

La Planète Revisitée en Corse. Expéditions terrestres 2021 - Côte orientale et <i>Capicorsu</i>

Jean Ichter , François Dusoulier , Jérôme Barbut , Cyril Berquier , Alain Canard et al.

Muséum national d'Histoire naturelle. 2022

Rapport mnhn-04143025v1
Deposit thumbnail

Inventaire des mollusques terrestres de Corse : Focus sur les genres Tacheocampylaea et Oxychilus

Olivier Gargominy , Lilian Léonard , Sandrine Tercerie , Xavier Cucherat , Benoît Fontaine et al.

PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2022, 76 p

Rapport hal-03953841v1
Deposit thumbnail

Enquête de satisfaction sur l'utilisation et les besoins de services associés au référentiel taxonomique national TAXREF

Laure Idzack , Olivier Gargominy , Pascal Dupont

PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2022, 20 p

Rapport mnhn-04133278v1
Deposit thumbnail

La Planète Revisitée en Corse. Bilan scientifique des expéditions terrestres 2020 : Agriate, Capicorsu et Saint-Florent

Jean Ichter , François Dusoulier , Jérôme Barbut , Alain Canard , Marie Canut et al.

Muséum national d'Histoire naturelle; PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2021, 69 p

Rapport mnhn-04166355v1

Base de connaissance "Statuts" des espèces en France. Version pour TAXREF v13.0

Olivier Gargominy , Claire Régnier

PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2020

Rapport mnhn-04254147v1
Deposit thumbnail

TAXREF v14, référentiel taxonomique pour la France : méthodologie, mise en œuvre et diffusion

Olivier Gargominy , Sandrine Tercerie , Claire Régnier , Thibault Ramage , Pauline Dupont et al.

PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2020, 64 p

Rapport mnhn-04254870v1
Deposit thumbnail

Guide d'utilisation de CardObs - v4.0

Olivier Gargominy , Claire Jacquet

PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2020, pp.26

Rapport mnhn-04254123v1

Base de données pour MALACO-GF, application Android d'aide à l'identification des escargots de Guyane française

Olivier Gargominy

PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2020

Rapport mnhn-04254257v1

BiodiversiClés : Escargots de France métropolitaine (MALACO-FR)

Olivier Gargominy

PatriNat (OFB-CNRS-MNHN). 2020

Rapport mnhn-04254168v1
Deposit thumbnail

Inventaire des mollusques terrestres de Corse : Focus sur le genre Tacheocampylaea

Olivier Gargominy , Lilian Léonard , Sandrine Tercerie , Xavier Cucherat , Dario Zuccon

PatriNat (AFB-CNRS-MNHN). 2018, 55 p

Rapport mnhn-04271593v1
Deposit thumbnail

Les inventaires généraux de la biodiversité en France et dans le monde

Jean Ichter , Marie-France Leccia , Julien Touroult , Patrick Blandin , Pierre-Henri Aberlenc et al.

UMS Patrimoine Naturel (AFB-CNRS-MNHN); Inventaire National du Patrimoine Naturel (MNHN); Parc national du Mercantour. 2018, pp.1-61

Rapport mnhn-04271668v1
Deposit thumbnail

Diffusion des statuts des espèces : principes et objectifs

Claire Régnier , Olivier Gargominy

PatriNat (AFB-CNRS-MNHN). 2018, 8 p

Rapport mnhn-04276794v1
Deposit thumbnail

TAXREF v11, référentiel taxonomique pour la France : méthodologie, mise en œuvre et diffusion

Olivier Gargominy , Sandrine Tercerie , Claire Régnier , Thibault Ramage , Pascal Dupont et al.

PatriNat (AFB-CNRS-MNHN). 2017, 60 p

Rapport mnhn-04282282v1

Base de données des espèces protégées et réglementées en France. Version pour TAXREF v11.0

Olivier Gargominy , Claire Régnier

PatriNat (AFB-CNRS-MNHN). 2017

Rapport mnhn-04287234v1
Deposit thumbnail

TAXREF v11, référentiel taxonomique pour la France. Partie 5 : Sources

Olivier Gargominy , Sandrine Tercerie , Claire Régnier , Thibault Ramage , Pascal Dupont et al.

PatriNat (AFB-CNRS-MNHN). 2017, pp.59-151

Rapport mnhn-04282269v1

Santo 2006 Progress Report

Josep Antoni Alcover Tomas , Anne Bedos , Philippe Bouchet , Geoff Boxshall , Florence Brunois et al.

[0] MNHN. 2007

Rapport hal-02823400v1
Deposit thumbnail

New species and new records of families, genera and species of land snails (Mollusca, Gastropoda) from French Guiana

Olivier Gargominy , Benoît Fontaine , Sandrine Tercerie , Dario Zuccon

Zookeys, 2025, 1230, pp.155-194. ⟨10.3897/zookeys.1230.133585⟩

Article dans une revue mnhn-04981139v1
Deposit thumbnail

BeeFunc, a comprehensive trait database for French bees

Lucas Aubouin , David Genoud , Bérénice Givord-Coupeau , Sandrine Tercerie , Olivier Gargominy et al.

Scientific Data , 2025, 12 (1), pp.1302. ⟨10.1038/s41597-025-05626-0⟩

Article dans une revue hal-05233153v1
Deposit thumbnail

In the Shadow of Medicine: The Glaring Absence of Occurrence Records of Human-Hosted Biodiversity

Rémy Poncet , Olivier Gargominy

Online Journal of Public Health Informatics, 2024, 16, pp.e60140. ⟨10.2196/60140⟩

Article dans une revue hal-04837272v1
Deposit thumbnail

Systématique, taxonomie, nomenclature, TAXREF et SINP : tour d’horizon des concepts, normes, référentiels et standards qui fondent le langage commun utilisé par les scientifiques et les naturalistes en France et à l’international

Rémy Poncet , Océane Fogliani , Sandrine Tercerie , Noëlie Maurel , Solène Robert et al.

Bulletin de l'Association française de Lichénologie, 2024, 42 (2), pp.197-208

Article dans une revue hal-04837252v1
Deposit thumbnail

Knowledge Base on Species Life Traits : A Spanish/French Plinian Core implementation use case

Sophie Pamerlon , Anne-Sophie Archambeau , Francisco Pando de la Hoz , Olivier Gargominy , Franck Michel et al.

Biodiversity Information Science and Standards, 2023, 7, pp.e111784. ⟨10.3897/biss.7.111784⟩

Article dans une revue hal-04198414v1
Deposit thumbnail

Conservation assessment based on large-scale monitoring of eDNA: Application to freshwater mussels

Vincent Prié , Alain Danet , Alice Valentini , Manuel Lopes-Lima , Pierre Taberlet et al.

Biological Conservation, 2023, 283, pp.110089. ⟨10.1016/j.biocon.2023.110089⟩

Article dans une revue hal-04894456v1
Deposit thumbnail

Pre-assessments of plant conservation status in islands: the case of French Overseas Territories

Simon Véron , Arthur Bernard , Élise Lebreton , Carlos Rodrigues-Vaz , M Durand et al.

Biodiversity and Conservation, 2023, 32 (4), pp.1165-1187. ⟨10.1007/s10531-023-02544-8⟩

Article dans une revue mnhn-03952485v1
Deposit thumbnail

Les mollusques continentaux de Saül (Guyane). Bilan des missions 2018-2020 de l'Atlas de la biodiversité communale

Olivier Gargominy , Benoît Fontaine , Sandrine Tercerie , Ahmed Abdou , Sébastien Sant

Les Cahiers scientifiques du parc amazonien de Guyane, 2022, 7 (2), pp.83-99

Article dans une revue mnhn-03987857v1
Deposit thumbnail

The first large-scale All Taxa Biodiversity Inventory in Europe: description of the Mercantour National Park ATBI datasets

Jean Ichter , Olivier Gargominy , Marie-France Leccia , Solène Robert , Laurent Poncet

Biodiversity Data Journal, 2022, 10, pp.e85901. ⟨10.3897/bdj.10.e85901⟩

Article dans une revue (data paper) hal-04133216v1

An assessment of the endemic spermatophytes, pteridophytes and bryophytes of the French Overseas Territories: towards a better conservation outlook

Simon Véron , Carlos Rodrigues-Vaz , Elise Lebreton , Claudine Ah-Peng , Vincent Boullet et al.

Biodiversity and Conservation, 2021, 30 (7), pp.2097-2124. ⟨10.1007/s10531-021-02186-8⟩

Article dans une revue mnhn-03217441v1
Deposit thumbnail

Discovery of the only living population of Pupoidopsis hawaiensis (Gastropoda: Pupillidae) in the last 50 years

Olivier Gargominy , Jean-François Butaud , Benoît Fontaine , Vincent Prié , Dario Zuccon et al.

American malacological Bulletin, 2020, 38 (1), pp.50. ⟨10.4003/006.038.0103⟩

Article dans une revue mnhn-03084456v1
Deposit thumbnail

Integration of Web APIs and Linked Data Using SPARQL Micro-Services - Application to Biodiversity Use Cases

Franck Michel , Catherine Faron Zucker , Olivier Gargominy , Fabien Gandon

Information, 2018, Special Issue "Semantics for Big Data Integration", 9 (12), ⟨10.3390/info9120310⟩

Article dans une revue hal-01947589v1
Deposit thumbnail

Breathing device of a new Streptaulus species from Vietnam extends understanding of the function and structure of respiratory tubes in cyclophoroids (Gastropoda: Caenogastropoda: Pupinidae)

Barna Páll-Gergely , Olivier Gargominy , Benoît Fontaine , Takahiro Asami

Journal of Molluscan Studies, 2017, 83 (2), pp.243-248. ⟨10.1093/mollus/eyx006⟩

Article dans une revue hal-03864281v1
Deposit thumbnail

De l'utilité d'un inventaire national

Olivier Gargominy , Lilian Léonard , Vincent Prié , Xavier Cucherat

MalaCo : Le journal de malacologie continentale, 2016, Actes du colloque national de malacologie continentale du 30 et 31 mars 2016 à Barenton-Bugny (Aisne) (12), pp.67-87

Article dans une revue mnhn-04431542v1

PESI - a taxonomic backbone for Europe

Yde de Jong , Juliana Kouwenberg , Louis Boumans , Charles Hussey , Roger Hyam et al.

Biodiversity Data Journal, 2015, 3, pp.e5848. ⟨10.3897/BDJ.3.e5848⟩

Article dans une revue hal-02060422v1
Deposit thumbnail

Biogeographic comparisons of herbivore attack, growth and impact of Japanese knotweed between Japan and France

Noëlie Maurel , Maasaki Fujiyoshi , Audrey Muratet , Emmanuelle Porcher , Eric Motard et al.

Journal of Ecology, 2013, 101 (1), pp.118-127. ⟨10.1111/1365-2745.12026⟩

Article dans une revue mnhn-02265411v1
Deposit thumbnail

New Species in the Old World: Europe as a Frontier in Biodiversity Exploration, a Test Bed for 21st Century Taxonomy

Benoît Fontaine , Kees van Achterberg , Miguel Angel Alonso-Zarazaga , Rafael Araujo , Manfred Asche et al.

PLoS ONE, 2012, 7 (5), pp.e36881. ⟨10.1371/journal.pone.0036881⟩

Article dans une revue hal-04178075v1

National Inventory of Natural Heritage website: recent, historical and archaeological data

Cécile Callou , Isabelle Baly , Olivier Gargominy , Elodie Rieb

SAA Archaeological Record, 2011, 11 (1), pp.37-40

Article dans une revue mnhn-02103401v1

Foot mucus stored on FTA cards is a reliable and non-invasive source of DNA for genetics studies in molluscs.

Claire Régnier , Olivier Gargominy , G. Falkner , Nicolas Puillandre

Conservation Genetics Resources, 2011, 3(2), pp.377-382

Article dans une revue hal-00575851v1
Deposit thumbnail

Les noms scientifiques français des mollusques continentaux de France: processus d'établissement d'une liste de référence

Benoît Fontaine , Jean-Michel Bichain , Xavier Cucherat , Olivier Gargominy , Vincent Prie

Revue d'Écologie (La Terre et La Vie) , 2010, 65 (4), pp.293-317

Article dans une revue hal-03530343v1

Quatre espèces nouvelles d'Endodontidae (Mollusca, Pulmonata) éteints de Rurutu (Îles Australes, Polynésie française)

Gabrielle Zimmermann , Olivier Gargominy , Benoît Fontaine

Zoosystema, 2009, 31 (4), pp.791-805

Article dans une revue hal-00455821v1
Deposit thumbnail

Pagodulina subdola (Gredler, 1856) (Gastropoda, Stylommatophora, Orculidae) fait bien partie de la faune de France Occurrence in France confirmed for Pagodulina subdola (Gredler, 1856) (Gastropoda, Stylommatophora, Orculidae)

Olivier Gargominy , Theo E.J. Ripken , Alexis Matamoro-Vidal , Daniel Reboul

MalaCo : Le journal de malacologie continentale, 2008

Article dans une revue hal-03925457v1

In memoriam - L'escargot de Corse, Helix ceratina

Olivier Gargominy , Benoît Fontaine

Le Courrier de l'environnement de l'INRA, 1999, 36 (36)

Article dans une revue hal-01212998v1
Deposit thumbnail

Conséquences des introductions d'espèces animales et végétales sur la biodiversité en Nouvelle-Calédonie

Olivier Gargominy , Philippe Bouchet , Michel Pascal , Tanguy Jaffre , Jean-Christophe Tourneur

Revue d'Écologie (La Terre et La Vie) , 1996, 51 (4), pp.375-402

Article dans une revue hal-03528969v1

Conséquences des introductions d'espèces animales et végétales sur la biodiversité en Nouvelle-Calédonie

Olivier Gargominy , Philippe Bouchet , Michel Pascal , Tanguy Jaffré , Jean-Christophe Tourneur

Revue d'Écologie (La Terre et La Vie) , 1996, 51 (4), pp.375-402

Article dans une revue hal-03191921v1
Deposit thumbnail

Des données aux résultats d’évaluation, retour sur la première Liste rouge des mollusques continentaux de France métropolitaine

Guillaume Gigot , Olivier Gargominy

3ème Colloque national de malacologie continentale, Conservatoire botanique national de Franche-Comté – Observatoire régional des Invertébrés (CBNFC-ORI); PatriNat (OFB-MNHN-CNRS-IRD), Oct 2023, Besançon (Doubs), France

Communication dans un congrès mnhn-05023480v1
Deposit thumbnail

Biodiversity Knowledge Graphs: Time to move up a gear!

Franck Michel , Antonia Ettorre , Catherine Faron , Julien Kaplan , Olivier Gargominy

TDWG 2021 annual virtual conference, Oct 2021, Virtual, France. pp.e73699, ⟨10.3897/biss.5.73699⟩

Communication dans un congrès hal-03373536v1

Unleash the Potential of your Website! 180,000 webpages from the French Natural History Museum marked up with Bioschemas/Schema.org biodiversity types

Franck Michel , Olivier Gargominy , Benjamin Ledentec , Bioschemas Community

TDWG 2020 annual conference, Oct 2020, Virtual, France. ⟨10.3897/biss.4.59046⟩

Communication dans un congrès hal-02976710v1
Deposit thumbnail

Assisting Biologists in Editing Taxonomic Information by Confronting Multiple Data Sources using Linked Data Standards

Franck Michel , Sandrine Tercerie , Antonia Ettorre , Olivier Gargominy , Catherine Faron Zucker

Biodiversity Next, Oct 2019, Leiden, Netherlands. ⟨10.3897/biss.3.37421⟩

Communication dans un congrès hal-02168164v1
Deposit thumbnail

Modelling Biodiversity Linked Data: Pragmatism May Narrow Future Opportunities

Franck Michel , Catherine Faron Zucker , Sandrine Tercerie , Olivier Gargominy

SPNHC+TDWG 2018 Conference, Aug 2018, Dunedin, New Zealand. ⟨10.3897/biss.2.26235⟩

Communication dans un congrès hal-01856363v1

Construction du référentiel taxonomique commun TAXREF, socle pour la connaissance et l'échange de données

Olivier Gargominy , Franck Michel , Sandrine Tercerie

Séminaire Interopérabilité des systèmes d'information sur l'eau (INSIDE 2017), Mar 2017, Paris, France

Communication dans un congrès hal-01585294v1
Deposit thumbnail

A Model to Represent Nomenclatural and Taxonomic Information as Linked Data. Application to the French Taxonomic Register, TAXREF

Franck Michel , Olivier Gargominy , Sandrine Tercerie , Catherine Faron Zucker

ISWC 2017 Workshop on Semantics for Biodiversity (S4Biodiv 2017), Oct 2017, Vienna, Austria. pp.1-12

Communication dans un congrès hal-01617708v1
Deposit thumbnail

TAXREF-LD: A Reference Thesaurus for Biodiversity on the Web of Linked Data

Franck Michel , Catherine Faron Zucker , Sandrine Tercerie , Olivier Gargominy

Biodiversity Information Standards (TDWG), Oct 2017, Ottawa, Canada. ⟨10.3897/tdwgproceedings.1.20232⟩

Communication dans un congrès hal-01612451v1

Construction d’un référentiel taxonomique commun pour des études sur l’histoire de la zoologie, l’archéozoologie et la biologie

Franck Michel , Cécile Callou , Catherine Faron Zucker , Olivier Gargominy , Chloé Martin et al.

SemWeb.Pro 2016, Nov 2016, Paris, France

Communication dans un congrès hal-01401357v1
Deposit thumbnail

Projet de Liste rouge nationale des mollusques continentaux de France métropolitaine : état des lieux des données disponibles et mise en œuvre

Claire Régnier , Olivier Gargominy , Guillaume Gigot

Colloque national de malacologie continentale, ADREE - Association pour le Développement de la Recherche et de l'Enseignement sur l'Environnement; Service du Patrimoine Naturel (MNHN); Naturagora, Mar 2016, Barenton-Bugny, France

Communication dans un congrès mnhn-05023906v1
Deposit thumbnail

Actes du séminaire des inventaires généraux de la biodiversité (IGB/ATBI)

Jean Ichter , Henri-Pierre Aberlenc , Vincent Augé , Richard Bonet , Damien Combrisson et al.

Séminaire des inventaires généraux de la biodiversité (IGB/ATBI), PatriNat (OFB/MNHN) / Parc national des Écrins, 2024

Proceedings/Recueil des communications hal-04607210v2
Deposit thumbnail

À la rencontre des Mollusques (2023)

Victor Robin-Havret , Florian Barnier , Sarah Figuet , Olivier Gargominy , Lilian Léonard et al.

PatriNat (OFB-MNHN-CNRS-IRD), Paris. pp.16, 2023, La biodiversité en France

Ouvrages (manuel) mnhn-04225071v1