
Mélanie Ribeiro Lopes
- Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (BF2I)
Présentation
Positions
2021-now: Associate Professor at INSA Lyon and BF2I Lab 2020-2021: Fixed term Assistant Professor (French ATER) at INSA Lyon and BF2i Lab 2017-2020: PhD student, INSA Lyon (Villeurbanne, France), BF2i lab. "A new type of non-apoptotic cell death involved in bacteriocyte elimination in aphids: molecular mechanisms and physiological regulation"
Academic degrees
2020: PhD thesis in Microorganisms, interactions, infections, INSA Lyon, Villeurbanne, France 2017: Master of Science in Molecular Microbiology, Pathogeny and Microbial Ecology, Université Claude Bernard Lyon 1, Villeurbanne, France 2017: Engineering degree in Biochemistry and Biotechnology, INSA Lyon, Villeurbanne, France 2014: Bachelor in Chemistry and Biology, University Paris-Est Créteil Paris XII, Créteil, France
Research focus
Insect symbiosis Host-symbiont interactions Regulation of bateriocyte dynamics
Domaines de recherche
Publications
Publications
|
Evolution towards a two-way cooperation in a single symbiotic organ: the developmental chronicle of a multi-partner insect endosymbiosisInternational congress of Ecology and Evolution (SFE2), Société Française d'Ecologie et d'Evolution (SFE2), Oct 2024, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-04753005
v1
|
Two-way cooperation in a single symbiotic organ: the developmental chronicle of a multi-partner insect endosymbiosis3rd Joint Congress on Evolutionary Biology, Jul 2024, Montreal, Canada
Communication dans un congrès
hal-04753845
v1
|
|
Subcellular localization of BCR4, an aphid-specific defensin peptide, in the bacteriocytes of Acyrthosiphon pisum2nd Webinaire du réseau "MultiFonction des Peptides AntiMicrobiens" (MuFoPAM), Apr 2024, Virtual, France
Communication dans un congrès
hal-04633387
v1
|
|
BCR4, a defensin with a strong impact on aphid survival, embryo development and symbiotic cells of three Acyrthosiphon pisum lines14èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2024, Montpellier, France
Communication dans un congrès
hal-04772051
v1
|
|
RNAseq analysis reveals new roles for conserved metazoan pathways in the regulation of bacteriocyte dynamics14èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Oct 2024, Montpellier, France
Communication dans un congrès
hal-04783705
v1
|
|
Evolutionarily conserved metazoan pathways have evolved new functions and regulate bacteriocytes' dynamics in the context of symbiosisXXVII International Congress of Entomology, Aug 2024, Kyoto, Japan
Communication dans un congrès
hal-04702864
v1
|
|
A genome-wide annotation of transcription factors in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum, and the related database, ATFdb13èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-04524595
v1
|
|
Acyrthosiphon pisum tissue-specific gene regulatory network inference13èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-04670574
v1
|
|
Characterization of Neuropeptide F and its receptor in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum13èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-04670572
v1
|
|
Immunolocalisation des peptides "Bacteriocyte-specific cystein rich" (BCR), potentiels régulateurs de la symbiose chez les pucerons13èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-04633315
v1
|
|
Bacteriocyte-specific Cysteine-Rich (BCR) peptides form a new aphid-specific defensin-like family and are promising regulators of aphid symbiosisRencontres du Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID), May 2023, Poitiers, France
Communication dans un congrès
hal-04633283
v1
|
|
Plasticity of bacteriocytes facing nutritional stresses in the pea aphid development.12èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France
Communication dans un congrès
hal-03741301
v1
|
|
The bacteriocyte: a biological innovation to sustain and control bacterial symbionts in insect nutritional symbiosesInvited seminar at UMR 754 IVPC-SFR Biosciences, Nov 2022, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-04670597
v1
|
|
Peptides « Bacteriocyte-specific Cysteine Rich » (BCR) : un rôle dans le contrôle de la symbiose ? Focus sur BCR4 chez le puceron du pois.12èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France
Communication dans un congrès
hal-04771966
v1
|
|
Les peptides « Bacteriocyte-specific Cystein-Rich » : une nouvelle famille de défensine. Régulateurs de la symbiose chez les pucerons ?9ème Journées du GDR "MultiFonction des Peptides AntiMicrobiens" (MuFoPAM), Oct 2022, Amboise, France
Communication dans un congrès
hal-04633233
v1
|
|
Bacteriocyte differentiation and cell death in the aphid/Buchnera symbiotic systemXXVI International Congress of Entomology, Jul 2022, Helsinki, Finland
Communication dans un congrès
hal-04670590
v1
|
|
The inhibitor of apoptosis (IAP) gene family in aphids: amplification, diversification and function in bacteriocyte dynamicsJoint DGIMI/BF2i webinar, Oct 2021, Virtual, France
Communication dans un congrès
hal-04783715
v1
|
|
The Inhibitor of APoptosis (IAP) gene family in aphids: between expansion and functional diversificationWebinaire du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), 2021, Villeurbanne (virtual), France
Communication dans un congrès
hal-03514209
v1
|
|
Evidence for high plasticity and modularity of the Inhibitor of APoptosis (IAP) repertoire in insectsInvited seminar at University of Pisa, Dec 2021, Pise, Italy
Communication dans un congrès
hal-04670594
v1
|
|
Analysis of the inhibitor of aPoptosis (IAP) repertoire in insects reveals a complex pattern of gene losses and amplificationsIncontri di diversità delle forme e degli animali, Università di Pisa, 2021, Pisa, Italy
Communication dans un congrès
hal-03514196
v1
|
|
IAP (Inhibitor-of-Apoptosis Protein) gene family expansion and functional diversification in aphids2nd UK-France Joint meeting on Aphids - Royal Entomologial Society, Apr 2019, Rothamsted, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-03512999
v1
|
|
IAP (Inhibitor-of-Apoptosis Protein) gene family expansion and functional characterization in aphids8th International Symposium on Molecular Insect Science, Jul 2019, Sitges, Spain
Communication dans un congrès
hal-03741297
v1
|
|
Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisumINSA Lyon International Partner Days, Oct 2018, Villeurbanne (INSA-Lyon), France
Communication dans un congrès
hal-03514034
v1
|
|
Expansion of genes encoding Apoptosis Inhibitor Proteins (IAPs) and their role in a novel bacteriocyte cell death process in aphid symbiosis22. Evolutionary Biology Meeting, Sep 2018, Marseille, France
Communication dans un congrès
hal-03509938
v1
|
|
Rôle clé du bactériocyte dans la résilience du puceron aux stress nutritionnels11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-03514026
v1
|
|
A novel cell death process is involved in the elimination of bacteriocytes and their symbionts through aphid agingFrance-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-03514078
v1
|
|
Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisumFrance-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-03514051
v1
|
|
Amplification des gènes codant les protéines de la famille des IAP et leur rôle dans l'homéostasie bactériocytaire11èmes rencontres du réseau de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-03741308
v1
|
|
Another way to die for bacteriocytes in the aphid/Buchnera symbiotic systemJournée des doctorants du département SPE, Jun 2018, Nice, France
Communication dans un congrès
hal-03510629
v1
|
|
Effecteurs et inhibiteurs de l’apoptose chez le puceron du pois : annotation et implication dans la mort cellulaire bactériocytaire10. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2017, Colmar, France
Communication dans un congrès
hal-03506807
v1
|
Détection et segmentation automatisée de bactériocytes à partir d’images de microscopie optiqueColloque Français d'Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale (IABM) 2025, Mar 2025, Nice, France
Poster de conférence
hal-05005315
v1
|
|
Origin and evolution of Inhibitors of apoptosis (IAP) in early metazoansConférences Jacques-Monod, Jun 2025, Roscoff, France
Poster de conférence
hal-05137897
v1
|
|
The aphid BCR4 structure and activity uncover a new defensin peptide superfamilyXXVII International Congress of Entomology, Aug 2024, Kyoto, Japan
Poster de conférence
hal-04702878
v1
|
|
The Bacteriocyte-specific Cysteine-Rich (BCR) proteins: a role in the control of aphid symbiosis ?Journée scientifique enjeu « santé globale et bio‐ingénierie » de l'INSA Lyon, Apr 2023, Villeurbanne, France
Poster de conférence
hal-04633269
v1
|
|
Extreme plasticity of bacteriocytes facing nutritional stresses during pea aphid development10th congress of the International Symbiosis Society (ISS) - 3rd International Conference on Holobionts (joint meeting), Jul 2022, Lyon, France
Poster de conférence
hal-03741327
v1
|
|
Embedded into bacteriocytes, but highly invasive: the puzzling case of the co-obligate symbiont Serratia symbiotica in the aphid Periphyllus lyropictusELI-Day, Annual meeting of the Earth and Life Institute of the University of Louvain-la-Neuve, May 2022, Louvain-la-Neuve, Belgium
Poster de conférence
hal-03741341
v1
|
|
ER stress as a major regulator of aphid bacteriocyte cell death12èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France
Poster de conférence
hal-03741344
v1
|
|
Bacteriocytes and the interorgan communication network regulating physiology and metabolism of the pea aphid10th congress of the International Symbiosis Society (ISS) - 3rd International Conference on Holobionts (joint meeting), Jul 2022, Lyon, France
Poster de conférence
hal-03741324
v1
|
|
The role of GPCRs in metabolism and physiology of the pea aphid, Acyrthosiphon pisumXXVI International Congress of Entomology, Jul 2022, Helsinki, Finland
Poster de conférence
hal-03741320
v1
|
|
Bacteriocyte specific Cystein Rich peptides, a new defensin like protein family , are promising regulators of aphid symbiosis10th congress of the International Symbiosis Society (ISS) - 3rd International Conference on Holobionts (joint meeting), Jul 2022, Lyon, France
Poster de conférence
hal-04771990
v1
|
|
A novel cell death process eliminates both bacteriocytes and their symbionts in the pea aphid/Buchnera symbiotic system2nd UK-France Joint meeting on Aphids - Royal Entomological Society, Apr 2019, Rothamsted, United Kingdom
Poster de conférence
hal-03513018
v1
|
|
A novel cell death process eliminates both bacteriocytes and their symbionts in the pea aphid/Buchnera symbiotic systemINSA Lyon International Partner Days, Oct 2018, Villeurbanne (INSA-Lyon), France
Poster de conférence
hal-03514067
v1
|
|
Molecular characterization of aphid bacteriocyte cell death by RNAseq analysisINSA Lyon International Partner Days, Oct 2018, Lyon, France
Poster de conférence
hal-03741347
v1
|
|
A novel cell death process eliminates both bacteriocytes and their symbionts in the pea aphid/Buchnera symbiotic system11. European Congress of Entomology, Jul 2018, Naples, Italy
Poster de conférence
hal-03509913
v1
|
|
Molecular characterization of aphid bacteriocyte cell death by RNAseq analysis11th European Congress of Entomology, Jul 2018, Naples, Italy
Poster de conférence
hal-03741337
v1
|
Isolation of Insect as a Platform for Transcriptomic AnalysesRNA abundance analysis, 2170, pp.185-198, 2021, ⟨10.1007/978-1-0716-0743-5_13⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-03052268
v1
|
|
Genetic Diversity of the Apoptotic Pathway in InsectsEvolution, Origin of Life, Concepts ans Methods, Springer International Publishing, pp.253-285, 2019, 978-3-030-30363-1. ⟨10.1007/978-3-030-30363-1_13⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-02304321
v1
|
Un nouveau type de mort cellulaire impliqué dans l’élimination des bactériocytes chez les pucerons : Mécanismes moléculaires et régulations physiologiquesInteractions entre organismes. Lyon, 2020. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse
tel-04903991
v1
|