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Inferring cellular heterogeneity with mixture models for DNA methylation rates
Hugo Barbot
,
David Causeur
,
Yuna Blum
,
Magali Richard
JdS, Jun 2025, Marseille, France
Communication dans un congrès
hal-05065027
v1
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Multi-omic statistical inference of cellular heterogeneity - IGDR SCAN 26/03/2025
Hugo Barbot
,
David Causeur
,
Yuna Blum
,
Magali Richard
IGDR SCAN, Mar 2025, Rennes (CHU), France
Communication dans un congrès
hal-05065011
v1
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Multi-omic statistical inference of cellular heterogeneity - JOBIM 2024
Hugo Barbot
,
David Causeur
,
Yuna Blum
,
Magali Richard
JOBIM 2024, Jun 2024, Toulouse, France
Communication dans un congrès
hal-04664788
v1
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Multi-omic statistical inference of cellular heterogeneity - JdS 2024
Hugo Barbot
,
David Causeur
,
Yuna Blum
,
Magali Richard
JdS 2024, May 2024, Bordeaux, France
Communication dans un congrès
hal-04664748
v1
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Statistical modeling of in vitro pepsin specificity
Ousmane Suwareh
,
David Causeur
,
Julien Jardin
,
Valérie Briard-Bion
,
Steven Le Feunteun
et al.
Virtual International Conference on Food Digestion, Cost Infogest, May 2021, Virtual International Conference on Food Digestion (#VICFD2021) on 6-7th May 2021., France
Communication dans un congrès
hal-03220832
v1
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Statistical modelling of in vitro pepsinolysis using peptidomic data
Ousmane Suwareh
,
David Causeur
,
Francoise Nau
Journées Scientifiques de l'ED EGAAL 2021, L’école doctorale « Écologie, Géosciences, Agronomie, ALimentation, Jun 2021, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-03318607
v1
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Prediction of fatty acids in the rainbow trout Oncorhynchus mykiss: a Raman scattering spectroscopy approach
E. Prado
,
Christophe Eklouh-Molinier
,
Florian Enez
,
C. Blay
,
Mathilde Dupont-Nivet
et al.
Communication dans un congrès
hal-02948337
v1
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Identification of the physicochemical characteristics of peptides that influence their hydrolysis by pepsin
Ousmane Suwareh
,
Francoise Nau
,
David Causeur
Workshop Infogest statistical treatment of peptidomic data, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR UMR INRA / AgroCampus Rennes : Science et Technologie du Lait et de l'?uf (1253)., Dec 2019, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-02737436
v1
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|
Décorrélation adaptative pour la prédiction en grande dimension
Florian Hébert
,
Mathieu Emily
,
David Causeur
51es Journées de Statistique 2019, Société Française de Statistique, Jun 2019, Nancy, France
Communication dans un congrès
hal-02361735
v1
|
|
PROPENSITY WEIGHTING FOR SURVEY NONRESPONSE THROUGH MACHINE LEARNING
Brigitte Gelein
,
David Haziza
,
David Causeur
13es Journées de méthodologie statistique de l'Insee (JMS), Jun 2018, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02076739
v1
|
|
Identification des fonctions biologiques, spécifiques d’un tissu ou partagées entre tissus, associées aux différences d’efficacité alimentaire chez le porc en croissance
Florence Gondret
,
Annie Vincent
,
Magalie Houee
,
Anne Siegel
,
Sandrine Lagarrigue
et al.
49. Journées de la Recherche Porcine, Jan 2017, Paris, France. pp.13-18
Communication dans un congrès
hal-01602699
v1
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|
Variable selection for correlated data in high dimension using decorrelation methods
Emeline Perthame
,
David Causeur
,
Ching-Fan Sheu
,
Chloé Friguet
Statlearn: Challenging problems in statistical learning, Apr 2016, Vannes, France
Communication dans un congrès
hal-01310571
v1
|
|
Data integration
Florence Gondret
,
Isabelle Louveau
,
Magalie Houee
,
David Causeur
,
Anne Siegel
Meeting INRA-ISU, Mar 2015, Ames, United States. 11 diapositives
Communication dans un congrès
hal-01210940
v1
|
|
FADA: an R package for variable selection in supervised classification of strongly dependent data
Emeline Perthame
,
Chloé Friguet
,
David Causeur
useR!2014, UCLA Statistics Department; Foundation for Open Access Statistics; Los Angels R user group, Jun 2014, Los Angeles, United States
Communication dans un congrès
hal-01167304
v1
|
|
Dealing with long-time range dependence in large-scale multiple testing of Event-Related Potentials data
Emeline Perthame
,
Ching-Fan Sheu
,
David Causeur
,
Yuh-Shiow Lee
46e Journées de Statistique, Société Française de Statistique, Jun 2014, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-01167092
v1
|
|
ERP: an R package for Event-Related Potentials data analysis
Emeline Perthame
,
David Causeur
,
Ching-Fan Sheu
useR!2014, UCLA Statistics Department; Foundation for Open Access Statistics; Los Angels R user group, Jun 2014, Los Angeles, United States
Communication dans un congrès
hal-01167321
v1
|
|
Sparse factor model for gene co-expression networks
Anne Blum
,
Magalie Houee
,
Aldons J. Lusis
,
Sandrine Lagarrigue
,
David Causeur
BioNetVisA Workshop, Sep 2014, Strasbourg, France
Communication dans un congrès
hal-01210988
v1
|
|
Generalized linear factor modeling for dependence between SNPs in GWAS
Mathieu Emily
,
David Causeur
Statistical fort Genomic Data (SMPGD'13), Jan 2013, Amsterdam, Netherlands
Communication dans un congrès
hal-01451794
v1
|
|
Stabilité de la sélection de variables pour la classification de données en grande dimension
Emeline Perthame
,
Chloé Friguet
,
David Causeur
45 èmes Journées de Statistique, May 2013, Toulouse, France
Communication dans un congrès
hal-00913047
v1
|
|
Inférence de réseaux de co-expression génique
Yuna Blum
,
M. Houée
,
David Causeur
10ème Journée Biogenouest, Nov 2012, Rennes (FR), France. non paginé
Communication dans un congrès
hal-00841018
v1
|
|
Inferring gene networks using a sparse factor model approach
Anne Blum
,
Magalie Houee
,
Chloé Friguet
,
Sandrine Lagarrigue
,
David Causeur
Statistical learning and data science, May 2012, Florence, Italy. 12 p
Communication dans un congrès
hal-02806777
v1
|
|
Genetic analysis of a complex trait using transcriptomic data: contribution of gene regulatory network modeling
Yuna Blum
,
Magalie Houée
,
Chloé Friguet
,
Sandrine Lagarrigue
,
David Causeur
XX. Conference of the plant & animal genome (PAG), Jan 2012, San Diego, United States. 1 p
Communication dans un congrès
hal-00841103
v1
|
|
Transcriptome profiling reveals interaction between two QTL for fatness in chicken
Yuna Blum
,
Guillaume Le Mignon
,
Frederique Pitel
,
David Causeur
,
Olivier Demeure
et al.
15th European workshop on QTL mapping and marker assisted selection (QTLMAS), May 2011, Rennes (FR), France. 1 p
Communication dans un congrès
hal-00841016
v1
|
|
Inferring gene networks using a sparse factor model approach, Statistical Learning and Data Science
Yuna Blum
,
Magali Houée
,
Chloé Friguet
,
Sandrine Lagarrigue
,
David Causeur
Learning and Data Science, May 2012, Florence (IT), Italy
Communication dans un congrès
hal-00841017
v1
|
|
Sparse factor models for gene co-expression networks.
Yuna Blum
,
M. Houée
,
David Causeur
Séminaire de Biostatistiques, Dec 2012, Toulouse (FR), France. non paginé
Communication dans un congrès
hal-00841019
v1
|
|
Effect of the gene diacylglycerol-O-transferase 1 (DGAT1) polymorphism on the global expression pattern of genes in the mammary gland tissue of dairy cows
Núria Mach
,
Yuna Blum
,
David Causeur
,
Sandrine Lagarrigue
,
M. A. Smits
62. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2011, Stavanger, Norway
Communication dans un congrès
hal-02747109
v1
|
|
Large-scale significance testing of high thoroughput Data with FAMT
Magalie Houée-Bigot
,
Chloé Friguet
,
Sandrine Lagarrigue
,
Anne Blum
,
David Causeur
14. Conference of the Applied Stochastic Models and Data Analysis International Society, Jun 2011, Rome, Italy
Communication dans un congrès
hal-02746752
v1
|
|
Selection stability for supervised classification of heterogeneous data.
David Causeur
Selection stability for supervised classification of heterogeneous data., Oct 2011, Rennes (FR), France. non paginé
Communication dans un congrès
hal-00842502
v1
|
|
Feature selection stability in high-dimensional heterogeneous data.
David Causeur
Cladag 2011, Sep 2011, Pavia (IT), Italy. non paginé
Communication dans un congrès
hal-00842499
v1
|
|
Integrating QTL controlling fatness, lipid metabolites and gene expressions to genetically dissect the adiposity complex trait in a meat chicken cross
Yuna Blum
,
Olivier O. Demeure
,
Colette Désert
,
Hervé Guillou
,
J Bertrand-Michel
et al.
62. Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), Aug 2011, Stavanger, Norway
Communication dans un congrès
hal-02748764
v1
|
|
Integrating biological knowledge in gene expression data analysis
David Causeur
,
Sébastien Lê
ISI 2011, Aug 2011, Dublin (IE), Ireland. non paginé
Communication dans un congrès
hal-00842500
v1
|
|
Inférence sur réseaux géniques par Analyse en Facteurs
Yuna Blum
,
Chloé Friguet
,
Sandrine Lagarrigue
,
David Causeur
42èmes Journées de Statistique, 2010, Marseille, France, France
Communication dans un congrès
inria-00494802
v1
|
|
A factor model to analyze heterogeneity in gene expression in a context of QTL mapping
Yuna Blum
,
Sandrine Lagarrigue
,
David Causeur
8th workshop " Statistical Methods for Post-Genomic Data ", Jan 2010, Marseille, France
Communication dans un congrès
hal-00459362
v1
|
|
Estimation conditionnelle de la proportion d'hypothèses nulles en grande dimension
Chloé Friguet
,
David Causeur
41èmes Journées de Statistique, SFdS, Bordeaux, 2009, Bordeaux, France, France
Communication dans un congrès
inria-00386591
v1
|
|
Estimation conditionnelle de la proportion d'hypotheses nulles en grande dimension
Chloé Friguet
,
David Causeur
41èmes Journées de Statistiques, Société Française de Statistiques, May 2009, Bordeaux, France
Communication dans un congrès
hal-00461645
v1
|
|
Factor Analysis for Multiple Testing (FAMT) : an R package for simultaneous tests under dependence in high-dimensional data
Maela Kloareg
,
Chloé Friguet
,
David Causeur
UseR!2009. Agrocampus, Jul 2009, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-00461700
v1
|
|
Conditional Fdr estimation based on a factor analytic approach of multiple testing
David Causeur
,
Chloé Friguet
Workshop on Simulation, Jun 2009, St Petersburg, Russia
Communication dans un congrès
hal-00461697
v1
|
|
Factor Analysis for Multiple Testing: a general approach for differential analysis of genome-scale dependent data
Chloé Friguet
,
Maela Kloareg
,
David Causeur
Workshop on Statistical advances in Genome-scale Data Analysis, May 2009, Ascona, Switzerland
Communication dans un congrès
hal-00461632
v1
|
|
Factor Analysis for Multiple Testing: an R-package to analyze a genome-scale dataset
Maela Kloareg
,
Chloé Friguet
,
David Causeur
Workshop « Statistical advances in Genome-scale Data Analysis », May 2009, Ascona, Switzerland
Communication dans un congrès
hal-00459370
v1
|
|
Estimation of the proportion of null p-values among dependent tests
Chloé Friguet
,
David Causeur
Petersburg Workshop on Simulation, Jun 2009, St Petersburg, Russia
Communication dans un congrès
hal-00461648
v1
|
|
Improving supervised classification for high dimensional data by adding external information. Application to microarray data
Maela Kloareg
,
David Causeur
Annual conference of the Société française de Statistique (SFdS) and the Statistical Society of Canada (SSC), May 2008, Ottawa, Canada
Communication dans un congrès
hal-00461717
v1
|
|
Approche conditionnelle des tests multiples pour données biologiques à haut-débit
Chloé Friguet
,
David Causeur
7ème Journée Jeunes Chercheurs (Société Française de Biométrie). INSERM, Dec 2008, Villejuif, France
Communication dans un congrès
hal-00461708
v1
|
|
Multiple tests for high-throughput data assuming a factor modeling of dependence
Chloé Friguet
,
David Causeur
40th Journées de Statistiques (Société Française de Statistiques) / joint with Société Statistique, May 2008, Ottawa, Canada
Communication dans un congrès
hal-00461705
v1
|
|
Impact of Dependence on the Stability of Model Selection in Supervised Classification for High-Throughput Data
David Causeur
,
Maela Kloareg
,
Chloé Friguet
International Indian Statistical Association (IISA) Conference on Frontiers of Probability and Statistical Science, May 2008, Storrs, United States
Communication dans un congrès
hal-00461704
v1
|
|
Accounting for a factor structure in high-dimensional data to improve multiple testing procedures
Chloé Friguet
,
David Causeur
6th workshop on Statistical Methods for Post-Genomic Data. Agrocampus, Feb 2008, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-00461702
v1
|
|
Reducing the non-discovery rate by use of auxiliary variables in microarray experiments
Maela Kloareg
,
David Causeur
,
Marie M. Damon
5. Workshop Statistical Methods for Post-Genomic Data (SMPGD), Jan 2007, Paris, France. 2 p
Communication dans un congrès
hal-02818987
v1
|
|
Improving type II error rates of multiple tests by use of auxiliary variables. Application to microarray data
Maela Kloareg
,
David Causeur
XIIth International conference on Applied Stochastic Models andData Analysis (ASMDA2007), May 2007, Chania, Greece
Communication dans un congrès
hal-00461712
v1
|
|
Variations in mammary extraction of nutrients under the effect of a 36-h milk accumulation into the udder in dairy cows
Jocelyne Guinard-Flament
,
D. Causeur
,
Eloise E. Delamaire
2. International Symposium on Energy and protein metabolism and nutrition ISEP, Sep 2007, Vichy, France
Communication dans un congrès
hal-02757430
v1
|
|
Reducing the Non-Discovery Rate by use of auxiliary variables in microarray experiments
Maela Kloareg
,
David Causeur
,
M. Damon
5th Workshop: Statistical methods for post-genomic data, Jan 2007, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-00461724
v1
|
|
Maximizing piglet survival
J. Le Dividich
,
Yannick Le Cozler
,
David Causeur
57th Annual Meeting of the European Association for Animal Production, Sep 2006, Antalya, Turkey
Communication dans un congrès
hal-00461746
v1
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Facteurs de variation de la détection des chaleurs chez la vache laitière conduite en vêlages groupés
Erwan Cutullic
,
Luc Delaby
,
David Causeur
,
Catherine Disenhaus
XIIIè Rencontres recherche ruminants, Dec 2006, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-00461729
v1
|
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Facteurs de variation de la détection des chaleurs chez la vache laitière conduite en vêlages groupés
Erwan Cutullic
,
Luc Delaby
,
D. Causeur
,
Catherine Disenhaus
13. Rencontres Recherches Ruminants, Dec 2006, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02755093
v1
|
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Maximising piglet survival
Jean Le Dividich
,
Yannick Le Cozler
,
D. Causeur
57. Annual Meeting of the European Association for Animal Production, Sep 2006, Antalya, Turkey
Communication dans un congrès
hal-02754310
v1
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Prédiction de la composition chimique des truies reproductrices à partir du poids vif et de l'épaisseur de lard dorsal : Application à la définition des besoins énergétiques
Jean-Yves Dourmad
,
M. Etienne
,
Jean Noblet
,
D. Causeur
29. Journées de la recherche porcine en France, Feb 1997, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02841306
v1
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Prediction sur matrices de distances
D. Causeur
,
T. Dhorne
Journees de Statistique, May 1993, Vannes, France
Communication dans un congrès
hal-02779050
v1
|