Federica Calevro
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Researcher identifiers
federica-calevro
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0000-0001-7856-9617
Presentation
**Federica Calevro-Eisenlohr**
ORCID: 0000-0001-7856-9617
IdHAL: federica-calevro
### **Positions**
Since Sept. 2020 INRAE Research Director (DR2), BF2i Unit (INRAE – INSA Lyon) Lyon, France
2004-2020 Associate Professor, Department of Biosciences (INSA Lyon) and BF2i Unit, Lyon, France
2001-2004 Temporary Lecturer and Research Assistant, Department of Biosciences (INSA Lyon) and BF2i Unit, Lyon, France
**Other appointments or responsabilities**
Since Jan. 2021 INSA Lyon Directors’ Board
Since Jan. 2021 Head of the BF2i Unit, Lyon, France
Since Jan. 2021 Member (elected) of the scientific advisory board of the INRAE Plant Health and Environment (SPE) Division
2018-present Member of the pedagogic and orientation advisory board of the E2M2 (Evolution, Ecosystems, Microbiology & Modeling) Doctoral School, University of Lyon
2017-present Co-coordinator of the French Aphid research network (BAPOA, more than 230 members in France, Belgium and Switzerland) of the INRAE SPE Division
2015-present Leader of the Trophic Symbioses team (SymT), BF2i Unit, Lyon
2015-2020 Deputy Head of the BF2i Unit, Lyon
2012-2020 Director of the Biology teaching service and member of the Executive Committe of the Department of Biosciences, INSA Lyon
### **Education and Training**
2018 Accreditation to supervise research (French HDR), INSA Lyon and University of Lyon
2000-2001 Postdoctoral Fellow, Pasteur Institute of Lille, Lille, France
1999-2000 Postdoctoral Fellow WHO, International Agency of Research on Cancer (IARC), Lyon, France
1995-1998 PhD, Biology (Cell and Developmental Biology) and Research Assistant, Department of Physiology and Biochemistry, University of Pisa, Italy
1998 Visiting Scientist, Brain Research Institute, University of Bremen, Germany
1997 Visiting Scientist, Department of Biochemistry, University of Bremen, Germany
1996 Professional Qualification (Biologist), University of Pisa, Italy, summa cum laude (50/50 cum laude)
1995 Diploma of Laurea, Molecular and Developmental Biology, University of Pisa, Italy, summa cum laude (110/110 cum laude)
### **Awards**
2000-2001 Director’s Fellow from the Pasteur Institute of Lille (Post-doc position)
1999-2000 WHO Fellowship (Post-doc position at IARC)
1998 Brain Research Institute Fellowship (visit to Bremen University, G. Roth lab)
1997 EMBO Short term Fellowship (visit to Bremen University, D. Beyersmann lab)
1997 Doctoral Mobility Fellowship from the University of Pisa (visit to Bremen University)
1995-1998 Doctoral Fellowship from the Italian National Agency for new technologies, Energy and sustainable Economic development (ENEA)
1994-1995 Pre-Graduate Fellowship from University of Pisa (1-year laboratory training)
### **Supervision of graduate students and post-doc fellows**
### Since 1995:
### 7 Postdocs
### 7 PhD students (degrees obtained in 2004, 2008, 2010, 2011, 2016, 2020, 2021) 6 have been recruited as Scientists (5 permanent positions/1 post-doc). 2 PhD projects are ongoing.
### 20 Master Students (11 M2 level and 9 M1 level).
### 3 students from University Institutes (*e.g.* IUT).
### **Teaching**
### Since 2020: INSA-Lyon, 12 h/year: Molecular genetics.
### 2001-2020: INSA-Lyon. 200-220 h/year: Anatomy, Biotechnology, Cell biology, Molecular genetics.
### 1995-1998: University of Pisa. 50 h/year: Molecular biology, Molecular toxicology, Comparative anatomy.
**Fundings**
43 funded research projects: 2 International, 4 European, 2 IDEX and 6 ANR Programs, 1 France-Génomique grant, 1 Agropolis Foundation grant, 1 SPE-INRAE grant, 4 regional grants, 4 INSA Bonus, 4 INSA Invited Professorships, 4 FR BioEEnViS grants, 4 Investment Programs, 6 projects with industry (including 1 ANR).
### **Scientific Impact and other scientific output**
***Publications:*** 50 original publications, 2 invited reviews, 6 invited contributions to book chapters, 2323 citations, H-index 24, i10-index 33.
***Metabolic databases for arthropod genomes (most recent):*** 1) **DakvicCyc**, <http://arthropodacyc.cycadsys.org/DAKVI/>, *Daktulosphaira vitifoliae*, doi: 10.1186/s12915-020-00820-5 ; 2) **OruabCyc** et **AthroCyc**, <http://arthropodacyc.cycadsys.org/ORUAB/> et <http://arthropodacyc.cycadsys.org/ATHRO/>, *Orussus abietinus* et *Athalia rosae*, doi: 10.1093/gbe/**,** 3) **SitorCyc**, <http://arthropodacyc.cycadsys.org/SITOR/>, *Sitophilus oryzae*, doi: 10.1186/s12915-021-01158-2; **ArtSymbioCyc** (<http://artsymbiocyc.cycadsys.org/>) project containing the reconstruction of the integrated symbiotic metabolism between arthropods and their symbiotic or mutualistic bacteria, private.
***Tools (most recent):*** GReNaDIne: Data-Driven Approaches to Infer Gene Regulatory Networks in Python. <https://grenadine.readthedocs.io/en/latest/>
***Organization of meetings (most important*):** Joint 10th International Symbiosis Society & 3rd International Conference on Holobionts (Lyon, July 2022); Annual Entomophagous meeting (2017, Lyon); Annual meetings of the Aphid French Network: 2010 and 2012 (Lyon), 2018 (Rennes) and 2022 (Nice); Colloque de Biologie de l’Insecte (16th edition, 2010, Lyon); Lyon’s International Multidisciplinary Meeting on Post-Genomics (5 editions, from 2006 to 2010, Lyon).
***Organization of practical courses:*** « Insect cell cultures », Aphid French Network (Bordeaux, October 2019); « Isolation of aphid bacteriocytes as a platform for transcriptomic analyses », HMicMac ANR grant (May 2017, Lyon); « RNAi in aphids: feeding and injection techniques », Aphid French Network (March 2008, Lyon).
***Ad hoc reviewer for Grant Organizations.*** Western University (Canada); FWO (Belgium); HRZZ (Croatian Science Foundation); CNR (Italy); ANR (France); FranceAgriMer (France); INRAE SPE research grants (France); Research Federation BioEEnViS University of Lyon (France); BQR (Bonus Qualité Recherche) INSA Lyon (France).
***Ad hoc reviewer for journals.*** Apoptosis, Arch. Insect Biochem. Physiol., BMC Biol., BMC Genomics, Cell Death Differ., Cell Rep., Current Biol., Cytom. Part A, Entomol. Exp. Appl., Environ. Microbiome, Eur. J. Entomol., FEMS Microbiol. Ecol., Insect Biochem. Mol. Biol., Insect Mol. Biol., Insect Sci., Insects, Int. J. Mol. Sci., iScience, J. Pest Sci., Microbiome, Microbiol. Spectr., Mol. Ecol., PNAS, Peptides, PlosOne, Sci. Rep., ISME J.
***Member of University selection committees (France).* INSA Lyon**: « Physiology » in 2012, « Insect symbiosis » in 2013, President of the jury « Insect Genomics » in 2015, « Symbiotic network modeling » in 2018, Coordinator of the jury « Microbes and Adaptation » in 2021, « Developmental genetics » in 2021. **University Claude Bernard Lyon1**: « Environmental and molecular microbiology » in 2012, « Plant physiology » in 2017. **University of Dijon:** « Invertebrate physiology » in 2015, **University of Nice**: « Host-Microbes interactions » in 2010 and 2012.
Publications
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Modélisation du métabolisme et des interactions symbiotiques chez les puceronsJournée de l'Enjeu Santé Globale et Bioingénierie de l'INSA, Apr 2023, Villeurbane, France
Conference papers
hal-04121080v1
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Peptides « Bacteriocyte-specific Cysteine Rich » (BCR) : un rôle dans le contrôle de la symbiose ? Focus sur BCR4 chez le puceron du pois12. Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France
Conference papers
hal-03741305v1
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Plasticity of bacteriocytes facing nutritional stresses in the pea aphid development.12. Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France
Conference papers
hal-03741301v1
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Ensemble Learning Based Gene Regulatory Network Inference2021 IEEE 33rd International Conference on Tools with Artificial Intelligence (ICTAI), Nov 2021, Washington, France. pp.113-120, ⟨10.1109/ICTAI52525.2021.00024⟩
Conference papers
hal-03630485v1
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Analysis of the Inhibitor of aPoptosis (IAP) repertoire in insects reveals a complex pattern of gene losses and amplificationsWebinaires BAPOA 2021, 2021, Villeurbanne (virtual), France
Conference papers
hal-03514209v1
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Gene Regulatory Network Inference Using Ensembles of Predictors33rd IEEE International Conference on Tools with Artificial Intelligence, IEEE, Nov 2021, Virtual event, United States
Conference papers
hal-03022606v2
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Analysis of the inhibitor of aPoptosis (IAP) repertoire in insects reveals a complex pattern of gene losses and amplificationsIncontri di diversità delle forme e degli animali, Università di Pisa, 2021, Pisa, Italy
Conference papers
hal-03514196v1
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Intégration de données multi-omiques pour l’identification d’enzymes clés du métabolisme lipidique chez l’espèce sentinelle Gammarus fossarumGDR Ecotoxicologie, Nov 2021, Rennes, France
Conference papers
hal-03810311v1
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Role of symbionts in insects’ ecological diversification: cytotype influences exploitation of an unfavorable host plant in the sap-feeder Bemisia tabaciDECRYPthèse E2M2 Edition 20, May 2021, Villeurbanne, France
Conference papers
hal-03514227v1
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Role of symbionts in insects’ ecological diversification: cytotype influences exploitation of an unfavorable host plant in the whitefly Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae)G-RREMI 2021 - Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions, 2021, Villeurbanne (virtual), France
Conference papers
hal-03514239v1
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Role of symbionts in insects' ecological diversification: cytotype influences exploitation of an unfavorable host plant in the sap-feeder Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae).DECRYPthèse E2M2, May 2021, Villeurbanne, France
Conference papers
hal-03927225v1
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Data-driven Gene Regulatory Network Inference based on Classification Algorithms31st IEEE International Conference on Tools with Artificial Intelligence, Nov 2019, Portland, Oregon, United States. ⟨10.1109/ICTAI.2019.00149⟩
Conference papers
hal-02361914v1
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IAP (Inhibitor-of-Apoptosis Protein) gene family expansion and functional diversification in aphidsUK-France joint Meeting Aphid Special Interest Group – BAPOA, Apr 2019, Rothamsted, United Kingdom
Conference papers
hal-03512999v1
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Expansion of genes encoding Apoptosis Inhibitor Proteins (IAPs) and their role in a novel bacteriocyte cell death process in aphid symbiosis22. Evolutionary Biology Meeting, Sep 2018, Marseille, France
Conference papers
hal-03509938v1
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Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisumInternational Partner Days, Oct 2018, Villeurbanne (INSA-Lyon), France
Conference papers
hal-03514034v1
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A novel cell death process is involved in the elimination of bacteriocytes and their symbionts through aphid agingFrance-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Conference papers
hal-03514078v1
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Rôle clé du bactériocyte dans la résilience du puceron aux stress nutritionnels11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Conference papers
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AphidCyc, une collection de bases de données métaboliques dédiée à l'étude et la comparaison du métabolisme chez les pucerons11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Conference papers
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Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisumFrance-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Conference papers
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Amplification des gènes codant les protéines de la famille des IAP et leur rôle dans l'homéostasie bactériocytaire11. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Conference papers
hal-03741308v1
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Another way to die for bacteriocytes in the aphid/Buchnera symbiotic systemJournée des doctorants du département SPE, Jun 2018, Nice, France
Conference papers
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Effecteurs et inhibiteurs de l’apoptose chez le puceron du pois : annotation et implication dans la mort cellulaire bactériocytaire10. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2017, Colmar, France
Conference papers
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Une nouvelle forme de mort cellulaire impliquée dans la dégénérescence des cellules bactériocytaires chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisum18. Colloque Biologie de l'Insecte, Jun 2016, Tours, France
Conference papers
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The long-term relationship with Buchnera aphidicola imposes another way to die for Acyrthosiphon pisum bacteriocytes9. Réunion annuelle du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), Nov 2016, Amiens, France
Conference papers
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Systems biology of symbiosis: from partners’ genomics to physiology of interactionsFirst Meeting of the PRC Israel-France, Sep 2016, Villeurbanne, France
Conference papers
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Life history traits and tissue-specific gene expression changes underlying the symbiotic pea aphid resilience to a tyrosine and phenylalanine depleted diet9. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2016, Amiens, France
Conference papers
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Direct flow cytometry measurements and cell imaging reveal a fine-tuning of endosymbiont and bacteriocyte cell dynamics during aphid developmentUK – France joint meeting on Aphids (Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés – Aphids Special Interest Group of Royal Entomological Sociaty), Nov 2015, Paris, France
Conference papers
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Coordination des dynamiques cellulaires entre bactériocytes et endosymbiotes au cours du développement des insectes : Une nouvelle approche par cytométrie en flux.Réunion annuelle du REID (Réseau National Ecologie des Interactions Durables), Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID). Montferrier/ Lez, FRA., Mar 2015, Villeurbanne, France
Conference papers
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From SymbAphidBase to SymbAphidCyc: two companion databases to study and compare aphid symbionts from genomes to metabolic pathwaysJOBIM 2015 - Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA). FRA., Jul 2015, Clermont-Ferrand, France. 1 p
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SymbAphidBase : une base de données nouvelle dédiée aux symbiotes de pucerons pour stocker et visualiser les génomes séquencés en standardisant leurs annotations7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France. 1 p
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Dynamique de la cellule bactériocytaire et des populations symbiotiques au cours du développement du puceron du pois7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France
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Specific body compartment phenotypes induced by dsRNA treatments in the pea aphid: the cathepsin-L and phenylalanine hydroxylase examples7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France
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Dynamique de la cellule bactériocytaire et des populations symbiotiques au cours du développement du puceron du pois7èmes journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), 2014, Avignon, France
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Symbiose puceron – Buchnera : approche métabolomique chez Acyrthosiphon pisum6èmes journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés, Oct 2013, Montpellier, France
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L'inactivation par RNAi du gène codant la phénylalanine hydrolase dans les compartiments symbiotiques provoque une baisse de la fécondité et des défauts de développement chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisumRéunion du GRREMI (Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions), Oct 2013, Lyon, France
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Organisation, gene expression regulation and DNA structural properties in the shrunken genome of Buchnera, the endosymbiont of aphids1. International Research Workshop Lyon- France / São Paulo - Brazil, Nov 2013, Lyon, France
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Analyse métabolomique de la symbiose entre le puceron Acyrthosiphon pisum et la bactérie Buchnera aphidicola7èmes Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Jun 2013, Amiens, France
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dsRNAi in aphids induces variable individual and tissue responses, and phenotypes specific to the administration methodsCycle de séminaires en Biophysique et Biologie Moléculaire de la Cellule et du Développement, Dipartimento di Fisiologia e Biochimica, Università di Pisa / Scuola Normale Superiore di Pisa, Oct 2013, Pisa, Italy
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Phénotypes induits par l'inactivation fonctionnelle par RNAi du gène ACYPY007803 (phényalanine hydroxylase) chez le puceron du pois5. Journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), Nov 2012, Lyon, France
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Key genes for symbiosis and development in an emerging genomic model, the pea aphidSéminaire invité au Dipartimento di Fisiologia e Biochimica, Università di Pisa / Scuola Normale Superiore di Pisa, Universita degli studi di Pisa. Dipartimento di Fisiologia e Biochimica, Pisa, ITA., 2012, Pisa, Italy
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Aphicibles - Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticidesANR - Colloque Plant Genomics 2012, Apr 2012, Pont Royal en Provence, France
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Analyse génomique des éléments régulateurs et des propriétés structurales intrinsèques de l'ADN dans le génome réduit de Buchnera5. Réunion Réseau BAPOA, Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). FRA., Nov 2012, Villeurbanne, France. 22 diapos
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Transcriptome analysis of embryo development in a parthenogenetic and symbiotic insect model, the pea aphidIPG'10 Integrative Post-Genomics, Centre Jacques Cartier. Lyon, FRA., Nov 2011, Lyon, France
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Réévaluation génomique de la fonction de transport chez Buchnera, endocytobiote des pucerons : une faible diversité de transporteurs et une organisation membranaire variable4. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés, Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). FRA., Nov 2011, Paris, France
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Integration of metabolic pathways and host regulation in symbiosis: tyrosine and cuticular protein biosynthesis during the pea aphid embryonic developmentSixth International Symposium on Molecular Insect Science, 2011, Amsterdam, Netherlands
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Individual and compartment specific response to RNAi in aphids: each individual matters3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France
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Annotation et évolution des familles de transporteurs chez le puceron du pois (Acyrthosiphon pisum)3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France. n. p
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Chromosome organization and gene expression regulation in Buchnera aphidicola, the obligate intracellular bacteria of the pea aphid Acyrthosiphon pisum58. Annual Meeting of the Entomological Society of America, Entomological Society of America (ESA). Annapolis, MD, USA., Dec 2010, San Diego, CA, United States
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Exploration génomique et fonctionnelle des insectes et de leurs partenaires symbiotiquesJournée Sciences Croisées "Modélisation et Sciences Numériques : nouveaux instruments et opportunités", Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon). Conseil Scientifique de l'INSA, Villeurbanne, FRA., Oct 2010, Villeurbanne, France. n. p
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Genomic analysis of the transport function in the symbiotic system of the pea aphid Acyrthosiphon pisum5. Meeting GDRE-RA "Comparative genomics", Institut d'Estudis Catalans (IEC). Barcelona, ESP., Nov 2010, Barcelone, Spain. n. p
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Characterization of partenogenetic embryo development in the context of symbiosis using transcriptome analysis in the pea aphid modelEMBO Workshop on Systems Biology of Development, EMBO. Heidelberg, DEU., Aug 2010, Ascona, Switzerland. 1 p
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Caractérisation transcriptomique du développement embryonnaire et larvaire du puceron du pois Acyrthosiphon pisum16. Colloque de Biologie de l’Insecte, Oct 2010, Lyon, France. 126 p
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Aphicibles : Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticidesGenoplante 2010, Agence Nationale de la Recherche (ANR). Paris, FRA., Mar 2010, Avignon, France. 40 diapos
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Besoins en acides aminés des embryons de femelles parthénogénétiques du puceron du pois.Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Jun 2009, PARIS, France
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The power of combining genome annotation and systems level modeling.5th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 2", Barcelona, Espagne, Juin 2009, Jun 2009, Spain
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analysesRéseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, 2009, Paris, juin 2009, France
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses8. International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania, juin 2009, Italy
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Un vieux couple à la conquête des plantes vasculaires : le puceron et sa bactérie symbiotiqueSéance commune Académie Agriculture et Académie des Sciences, Académie d'Agriculture de France (AAF). Paris, FRA., Dec 2009, Paris, France. 23 diapos
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Genomic insight into the amino acid relations of the pea aphid with its symbiotic bacterium Buchnera aphidicola8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), Catania, juin 2009, Italy, 2009, Italy
Conference papers
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The Acyrthosiphon pisum Cyc database (AcypiCyc) created using a novel BioCyc Annotation Database System (CycADS): a useful tool to explore and study the pea aphid metabolism5th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 2, Barcelona, Espagne, juin 2009, Jun 2009, France
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) and CycADS (Cyc Annotation Database System): moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania (Italie), juin 2009, France. pp.1-1
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CycADS: an annotation management system for the development and update of BioCyc metabolic network databases1st International Workshop on Information Systems for Insect Pests, Rennes, FRANCE, 2009, France
Conference papers
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Metabolic requirements in essential amino acids in parthenogenetic pea aphid embryos8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania (Italie), juin 2009, France. pp.1-1
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AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) : a model database to visualize and study the metabolic network underlying the pea aphid-Buchnera symbiosis6. International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2009, Madison, août 2009, United States
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Metabolic requirements in essential amino acids in parthenogenetic pea aphid embryos8. International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania, juin 2009, Italy
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Fate of transcription units in the reductive evolution of the genome of Buchnera aphidicola6th International Symbiosis Society Congress (6 ISS 2009) Madison, Wisconsin USA, August 9-15 2009, Aug 2009, United States
Conference papers
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Xylem consumption response to osmotic stress in aphidsAnnual meeting, Entomological Society of Canada, Winnipeg - Canada, 2009, Canada
Conference papers
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TranscriptomiqueJournée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1
Conference papers
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Evolution des organismes bactériensJournée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", Jul 2008, Villeurbanne, France. 12 diapos
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Annotation of metabolism genes: towads the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses4th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 1", 2008, Princetown (USA), juillet 2008, France. pp.1-1
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Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc): from genome sequence to metabolic network analysesIntegrative Post-Genomics - IPG'08, 2008, Lyon (France), novembre 2008, France. pp.1-1
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Evolution des organismes bactériensJournée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1
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Interactions trophiques dans la symbiose puceron - Buchnera : Régulations transcriptionnelles de la réponse à la carence en acides aminés essentielsRéseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, 2008, Paris (France), janvier 2008, France. pp.1-1
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Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisumSéminaire INRA AgroBI, 2008, Bordeaux (France), décembre 2008, France. pp.1-1
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Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) : from genome sequence to metabolic network analysesIntegrative Post-Genomics - IPG'08, 2008, Lyon, novembre 2008, France
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hal-02821711v1
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Interactions trophiques dans la symbiose puceron - Buchnera : Régulations transcriptionnelles de la réponse à la carence en acides aminés essentiels1. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons. FRA., Jan 2008, Paris, France. 9 diapos
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Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisumSéminaire INRA AgroBI, 2008, Bordeaux, décembre 2008, France
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Les réseaux métaboliques et génétiquesJournée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1
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Conservation de la relation entre niveau d'expression des gènes et organisation du chromosome chez Buchnera aphidicola, symbiote primaire des pucerons : exemple d'un génome réduit mais non dégénéréXVème Colloque de Physiologie de l'Insecte, Jul 2007, Rennes, France. pp.1-1
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Regulation of expression following nutritional stresses in the reduced genome of Buchnera aphidicola, "Is there any life left?"Seminarios del Institut Cavanilles de Biodiversitat i Biologia Evolutiva (ICBiBE) - Univ. Valencia (ESP), 2007, Valencia (Espagne), juin 2007, France. pp.1-1
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hal-00391505v1
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Comparative analysis of gene expression in the aphid-Buchnera symbiosis: the role of Buchnera in the nutrition of aphid embryosSociety of Experimental Biology Annual Main Meeting 2007 (SEB 2007), 2007, Glasgow (UK), avril 2007, France. pp.1-1
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hal-00391155v1
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IGOIM, une méthode d'inférence de réseaux génétiques utilisant l'information mutuelleJournées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM) - Journée satellite "Analyse statistique du transcriptome", 2007, Marseille (France), juillet 2007, France. pp.1-1
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Bioinformatics analysis of the nucleoid associated protein FIS in Buchnera aphidicola, the intracellular symbiotic bacteria of aphidsIntegrative Post-Genomics - IPG'06, 2006, Lyon (France), novembre-décembre 2006, France. pp.1-1
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hal-00391257v1
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Buchnera aphidicola: evidences for transcriptional regulation in a degenerated genomeColloque INRA "Apports de la génomique à la physiologie et la pathologie de l'insecte", 2006, Montpellier (France), mars 2006, France. pp.1-1
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Spatial transcriptomic patterns in the genome of the endosymbiotic bacterium Buchnera aphidicolaWorkshop "Theoretical Approaches for the Genome", 2006, Annecy-le-Vieux (France), novembre 2006, France. pp.1-1
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Relationship between gene expression and genome properties in Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid Acyrthosiphon pisum5th International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2006, Vienna (Autriche), août 2006, France. pp.1-1
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hal-00391524v1
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Spatial transcriptomic patterns in the genome of the endosymbiotic bacterium Buchnera aphidicolaTheoretical Approaches for the Genome Workshop, Nov 2006, France
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hal-00506911v1
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Régulation génétique et métabolique chez Buchnera aphidicola (AgroBi 2006)Journée INRA-INRIA "Insertion des mathématiques dans les approches biologiques : du gène à l'organisme", 2006, Lyon (France), décembre 2006, France. pp.1-1
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Relationships between gene expression and genome properties in Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid5th International of Symbiosis Society Congress, Aug 2006, Autriche
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Metabolic interactions between the bacterium Buchnera aphidicola and its obligate symbiotic partner, the pea aphid: nutritional studies combined with transcriptome analyses5th International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2006, Vienna (Autriche), août 2006, France. pp.1-1
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Buchnera aphidicola, endocytobiote du puceron : transcriptome d'un génome "dégénéré"Rencontres 2006 des Microbiologistes de l'INRA, 2006, Dourdan (France), juin 2006, France. pp.1-1
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hal-00391278v1
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Of lice and plants: metabolite flows in the trophic pathway of phloem feeding insects as analysed through genomic and EST data from the aphid symbiosis |