Federica Calevro

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Publications

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Cadmium tolerance is associated with tissue-specific plasticity of metallothionein gene expression in Gammarus fossarum field populations

Auréline Lalouette , Arnaud Chaumot , Louveline Lepeule , Karen Gaget , Nicolas Delorme et al.
Scientific Reports, 2025, 15 (1), pp.13913
Article dans une revue hal-05068990 v1
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NPF signaling-dependent maintenance of metabolic homeostasis in the pea aphid is mediated by a highly selective ligand-receptor interaction and tissue-specific changes in NPF and NPFR

Cissy Huygens , Mélanie Ribeiro Lopes , El-Sayed Baz , Jozef Vanden Broeck , Federica Calevro et al.
Heliyon, 2025, 11 (12), pp.e43504. ⟨10.1016/j.heliyon.2025.e43504⟩
Article dans une revue hal-05111335 v1
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Annotation of transcription factors, chromatin-associated factors, and basal transcription machinery in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum, and development of the ATFdb database, a resource for studies of transcriptional regulation

Nicolas Parisot , Mélanie Ribeiro Lopes , Sergio Peignier , Patrice Baa-Puyoulet , Hubert Charles et al.
Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2024, 177, pp.104217. ⟨10.1016/j.ibmb.2024.104217⟩
Article dans une revue hal-04832131 v1
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PacBio Hi-Fi genome assembly of Sipha maydis, a model for the study of multipartite mutualism in insects

François Renoz , Nicolas Parisot , Patrice Baa-Puyoulet , Léo Gerlin , Samir Fakhour et al.
Scientific Data , 2024, 11 (1), pp.450. ⟨10.1038/s41597-024-03297-x⟩
Article dans une revue hal-04632873 v1
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Reference genes to study the sex-biased expression of genes regulating Drosophila metabolism

Sofie de Groef , Melanie Ribeiro Lopes , Mattias Winant , Emily Rosschaert , Tom Wilms et al.
Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.9518. ⟨10.1038/s41598-024-58863-5⟩
Article dans une revue hal-04632870 v1
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Proteogenomic reconstruction of organ-specific metabolic networks in an environmental sentinel species, the amphipod Gammarus fossarum

Natacha Koenig , Patrice Baa-Puyoulet , Amélie Lafont , Isis Lorenzo-Colina , Vincent Navratil et al.
Comparative Biochemistry and Physiology - Part D: Genomics and Proteomics, 2024, 52, pp.101323. ⟨10.1016/j.cbd.2024.101323⟩
Article dans une revue hal-04704294 v1
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Identification and organ-specific patterns of expression of two metallothioneins in the sentinel species Gammarus fossarum

Davide Degli Esposti , Auréline Lalouette , Karen Gaget , Louveline Lepeule , Zineb Chaabi et al.
Comparative Biochemistry and Physiology. Part B, Biochemistry and Molecular Biology, 2024, 269, pp.110907. ⟨10.1016/j.cbpb.2023.110907⟩
Article dans une revue hal-04704318 v1
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Ensemble Learning Based Gene Regulatory Network Inference

Sergio Peignier , Baptiste Sorin , Federica Calevro
International Journal on Artificial Intelligence Tools, 2023, 32 (5), pp.113-120. ⟨10.1142/S0218213023600059⟩
Article dans une revue hal-04044951 v1
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Gene Self-Expressive Networks as a Generalization-Aware Tool to Model Gene Regulatory Networks

Sergio Peignier , Federica Calevro
Biomolecules, 2023, 13 (3), pp.526. ⟨10.3390/biom13030526⟩
Article dans une revue hal-04154047 v1
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GReNaDIne: A Data-Driven Python Library to Infer Gene Regulatory Networks from Gene Expression Data

Pauline Schmitt , Baptiste Sorin , Timothée Frouté , Nicolas Parisot , Federica Calevro et al.
Genes, 2023, 14 (2), pp.269. ⟨10.3390/genes14020269⟩
Article dans une revue hal-04045297 v1
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Plant choice for oviposition in the phytophagous insect Bemisia tabaci: cytotype, including symbionts, knows best!

Sylvain Benhamou , Emmanuel Desouhant , Zaïnab Belgaïdi , Hélène Henri , Fabrice Vavre et al.
Animal Behaviour, 2023, 200, pp.147-157. ⟨10.1016/j.anbehav.2023.04.001⟩
Article dans une revue hal-04706544 v1
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Editorial: Symbiotic organs in insects: development, metabolism, and physiological regulation

Federica Calevro , Patrick Callaerts , Yu Matsuura , Anna Michalik
Frontiers in Physiology, 2023, 14, pp.1248654. ⟨10.3389/fphys.2023.1248654⟩
Article dans une revue hal-04225297 v1
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Detection of Aphids on Hyperspectral Images Using One-Class SVM and Laplacian of Gaussians

Sergio Peignier , Virginie Lacotte , Marie-Gabrielle Duport , Patrice Baa-Puyoulet , Jean-Christophe Simon et al.
Remote Sensing, 2023, 15 (8), pp.2103. ⟨10.3390/rs15082103⟩
Article dans une revue hal-04122402 v1
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Discovery of an Insect Neuroactive Helix Ring Peptide from Ant Venom

Valentine Barassé , Laurence Jouvensal , Guillaume Boy , Arnaud Billet , Steven Ascoët et al.
Toxins, 2023, 15 (10), pp.600. ⟨10.3390/toxins15100600⟩
Article dans une revue hal-04390519 v1
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Compartmentalized into Bacteriocytes but Highly Invasive: the Puzzling Case of the Co-Obligate Symbiont Serratia symbiotica in the Aphid Periphyllus lyropictus

François Renoz , Mélanie Ribeiro Lopes , Karen Gaget , Gabrielle Duport , Marie-Christine Eloy et al.
Microbiology Spectrum, 2022, ⟨10.1128/spectrum.00457-22⟩
Article dans une revue hal-03704068 v1
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Bacteriocyte plasticity in pea aphids facing amino acid stress or starvation during development

Mélanie Ribeiro Lopes , Karen Gaget , François Renoz , Marie-Gabrielle Duport , Severine Balmand et al.
Frontiers in Physiology, 2022, 13, pp.982920. ⟨10.3389/fphys.2022.982920⟩
Article dans une revue hal-04014003 v1
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The Di-Symbiotic Systems in the Aphids Sipha maydis and Periphyllus lyropictus Provide a Contrasting Picture of Recent Co-Obligate Nutritional Endosymbiosis in Aphids

François Renoz , Jérôme Ambroise , Bertrand Bearzatto , Samir Fakhour , Nicolas Parisot et al.
Microorganisms, 2022, 10 (7), pp.1360. ⟨10.3390/microorganisms10071360⟩
Article dans une revue hal-03738802 v1
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Evolutionary diversification of insulin-related peptides (IRPs) in aphids and spatiotemporal distribution in Acyrthosiphon pisum

C. Huygens , Mélanie Ribeiro Lopes , Karen Gaget , G. Duport , S. Peignier et al.
Insect Biochemistry and Molecular Biology, In press, 141, pp.103670. ⟨10.1016/j.ibmb.2021.103670⟩
Article dans une revue hal-03507324 v1
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Aphid BCR4 Structure and Activity Uncover a New Defensin Peptide Superfamily

Karine Loth , Nicolas Parisot , Françoise Paquet , Hugo Terrasson , Catherine Sivignon et al.
International Journal of Molecular Sciences, 2022, 23 (20), pp.12480. ⟨10.3390/ijms232012480⟩
Article dans une revue hal-03862651 v1
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Sexual Dimorphism in Metabolic Responses to Western Diet in Drosophila melanogaster

Sofie de Groef , Tom Wilms , Severine Balmand , Federica Calevro , Patrick Callaerts
Biomolecules, 2022, 12 (1), pp.33. ⟨10.3390/biom12010033⟩
Article dans une revue hal-03521337 v1

Data-driven Gene Regulatory Networks Inference Based on Classification Algorithms

Sergio Peignier , Pauline Schmitt , Federica Calevro
International Journal on Artificial Intelligence Tools, 2021, 30 (04), pp.2150022. ⟨10.1142/S0218213021500226⟩
Article dans une revue hal-03297056 v1
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Sustainable laser-based technology for insect pest control

R. Gaetani , V. Lacotte , Vincent Dufour , A. Clavel , G. Duport et al.
Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.11068. ⟨10.1038/s41598-021-90782-7⟩
Article dans une revue hal-03239008 v1
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Cytotype Affects the Capability of the Whitefly Bemisia tabaci MED Species To Feed and Oviposit on an Unfavorable Host Plant

Sylvain Benhamou , Isabelle Rahioui , Hélène Henri , Hubert Charles , Pedro da Silva et al.
mBio, 2021, 12 (6), pp.1-16. ⟨10.1128/mBio.00730-21⟩
Article dans une revue hal-03432050 v1
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The transposable element-rich genome of the cereal pest Sitophilus oryzae

Nicolas Parisot , Carlos Vargas-Chávez , Clément Goubert , Patrice Baa-Puyoulet , Séverine Balmand et al.
BMC Biology, 2021, 19 (1), pp.241. ⟨10.1186/s12915-021-01158-2⟩
Article dans une revue hal-03627264 v1
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At the Gate of Mutualism: Identification of Genomic Traits Predisposing to Insect-Bacterial Symbiosis in Pathogenic Strains of the Aphid Symbiont Serratia symbiotica

François Renoz , Vincent Foray , Jérôme Ambroise , Patrice Baa-Puyoulet , Bertrand Bearzatto et al.
Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 2021, 11, pp.660007. ⟨10.3389/fcimb.2021.660007⟩
Article dans une revue hal-03297041 v1
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The genome sequence of the grape phylloxera provides insights into the evolution, adaptation, and invasion routes of an iconic pest

Claude Rispe , Fabrice Legeai , Paul Nabity , Rosa Fernández , Arinder Arora et al.
BMC Biology, 2020, 18 (1), pp.90. ⟨10.1186/s12915-020-00820-5⟩
Article dans une revue hal-02917617 v1
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Evolutionary novelty in the apoptotic pathway of aphids

Mélanie Ribeiro Lopes , Nicolas Parisot , Karen Gaget , Cissy Huygens , Sergio Peignier et al.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2020, 117 (51), pp.32545-32556. ⟨10.1073/pnas.2013847117⟩
Article dans une revue hal-03052353 v1
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Sawfly genomes reveal evolutionary acquisitions that fostered the mega-radiation of parasitoid and eusocial Hymenoptera

Jan Philip Oeyen , Patrice Baa-Puyoulet , Joshua Benoit , Leo Beukeboom , Erich Bornberg-Bauer et al.
Genome Biology and Evolution, 2020, 12 (7), pp.1099-1118. ⟨10.1093/gbe/evaa106⟩
Article dans une revue hal-02618254 v1
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Draft Genome Sequences of Two Cultivable Strains of the Bacterial Symbiont Serratia symbiotica

François Renoz , Jérôme Ambroise , Bertrand Bearzatto , Patrice Baa-Puyoulet , Federica Calevro et al.
Microbiology Resource Announcements, 2020, 9 (10), pp.e01579-19. ⟨10.1128/MRA.01579-19⟩
Article dans une revue hal-02505875 v1
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Drosophila-associated bacteria differentially shape the nutritional requirements of their host during juvenile growth

Jessika Consuegra , Théodore Grenier , Patrice Baa-Puyoulet , Isabelle Rahioui , Houssam Akherraz et al.
PLoS Biology, 2020, 18 (3), pp.e3000681. ⟨10.1371/journal.pbio.3000681⟩
Article dans une revue hal-02919023 v1
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Acyrthosiphon pisum

Federica Calevro , Denis Tagu , Patrick Callaerts
Trends in Genetics, 2019, 35 (10), pp.781-782. ⟨10.1016/j.tig.2019.07.003⟩
Article dans une revue hal-02279584 v1
Image document

Bis(monoacylglycero)phosphate regulates oxysterol binding protein-related protein 11 dependent sterol trafficking

Maud Arnal-Levron , Yinan Chen , Peter Greimel , Federica Calevro , Karen Gaget et al.
Biochimica et Biophysica Acta Molecular and Cell Biology of Lipids, 2019, 1864 (9), pp.1247-1257. ⟨10.1016/j.bbalip.2019.05.011⟩
Article dans une revue hal-02146150 v1
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Identification of Plant Virus Receptor Candidates in the Stylets of Their Aphid Vectors

Craig Webster , Elodie Pichon , Manuella van Munster , Baptiste Monsion , Maelle Deshoux et al.
Journal of Virology, 2018, 92 (14), pp.e00432-18. ⟨10.1128/JVI.00432-18⟩
Article dans une revue hal-01922319 v1
Image document

Bacteriocyte cell death in the pea aphid/ Buchnera symbiotic system

Pierre Simonet , Karen Gaget , Severine Balmand , Mélanie Ribeiro Lopes , Nicolas Parisot et al.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2018, 115 (8), pp.E1819 - E1828. ⟨10.1073/pnas.1720237115⟩
Article dans une revue hal-01768487 v1
Image document

Bacteriocyte Reprogramming to Cope With Nutritional Stress in a Phloem Sap Feeding Hemipteran, the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum

Stefano Colella , Nicolas Parisot , Pierre Simonet , Karen Gaget , Gabrielle Duport et al.
Frontiers in Physiology, 2018, 9, pp.1498. ⟨10.3389/fphys.2018.01498⟩
Article dans une revue hal-01905508 v1

Assessment of a 16S rRNA amplicon Illumina sequencing procedure for studying the microbiome of a symbiont-rich aphid genus

Eric Jousselin , A.L. Clamens , M. Galan , M. M. Bernard , Sarah Maman et al.
Molecular Ecology Resources, 2016, 16 (3), pp.628-640. ⟨10.1111/1755-0998.12478⟩
Article dans une revue istex hal-01449134 v1
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Direct flow cytometry measurements reveal a fine-tuning of symbiotic cell dynamics according to the host developmental needs in aphid symbiosis

Pierre Simonet , Gabrielle Duport , Karen Gaget , Michèle Weiss-Gayet , Stefano Colella et al.
Scientific Reports, 2016, 6, pp.19967. ⟨10.1038/srep19967⟩
Article dans une revue hal-01352561 v1
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Disruption of phenylalanine hydroxylase reduces adult lifespan and fecundity, and impairs embryonic development in parthenogenetic pea aphids

Pierre Simonet , Karen Gaget , Nicolas Parisot , Gabrielle Duport , Marjolaine Rey et al.
Scientific Reports, 2016, 6, pp.1-12. ⟨10.1038/srep34321⟩
Article dans une revue hal-01388523 v1
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ArthropodaCyc: a CycADS powered collection of BioCyc databases to analyse and compare metabolism of arthropods

Patrice Baa-Puyoulet , Nicolas Parisot , Gérard Febvay , Jaime Huerta-Cepas , Augusto F Vellozo et al.
Database - The journal of Biological Databases and Curation, 2016, pp.1-9. ⟨10.1093/database/baw081⟩
Article dans une revue hal-01352558 v1
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New insight into the RNA interference response against cathepsin-L gene in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum: Molting or gut phenotypes specifically induced by injection or feeding treatments.

Panagiotis Sapountzis , Gabrielle Duport , Severine Balmand , Karen Gaget , Stéphanie Jaubert-Possamai et al.
Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2014, 51, to be published. ⟨10.1016/j.ibmb.2014.05.005⟩
Article dans une revue hal-01002574 v1
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Genomic analysis of the regulatory elements and links with intrinsic DNA structural properties in the shrunken genome of Buchnera

Lilia Brinza , Federica Calevro , Hubert Charles
BMC Genomics, 2013, 14 (1), pp.73. ⟨10.1186/1471-2164-14-73⟩
Article dans une revue hal-00788161 v1
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Tyrosine pathway regulation is host-mediated in the pea aphid symbiosis during late embryonic and early larval development

Andréane Rabatel , Gérard Febvay , Karen Gaget , Gabrielle Duport , Patrice Baa-Puyoulet et al.
BMC Genomics, 2013, 14 (1), pp.235. ⟨10.1186/1471-2164-14-235⟩
Article dans une revue hal-00824527 v1
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A genomic reappraisal of symbiotic function in the aphid/buchnera symbiosis: reduced transporter sets and variable membrane organisations.

Hubert Charles , Severine Balmand , Araceli Lamelas , Ludovic Cottret , Vicente Pérez-Brocal et al.
PLoS ONE, 2011, 6 (12), pp.e29096. ⟨10.1371/journal.pone.0029096⟩
Article dans une revue hal-00659506 v1
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CycADS: an annotation database system to ease the development and update of BioCyc databases.

Augusto F Vellozo , Amélie S Véron , Patrice Baa-Puyoulet , Jaime Huerta-Cepas , Ludovic Cottret et al.
Database - The journal of Biological Databases and Curation, 2011, 2011, pp.bar008. ⟨10.1093/database/bar008⟩
Article dans une revue hal-00632965 v1
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Multimodal dynamic response of the Buchnera aphidicola pLeu plasmid to variations in leucine demand of its host, the pea aphid Acyrthosiphon pisum.

José Viñuelas , Gérard Febvay , Gabrielle Duport , Stefano Colella , Jean-Michel Fayard et al.
Molecular Microbiology, 2011, 81 (5), pp.1271-1285. ⟨10.1111/j.1365-2958.2011.07760.x⟩
Article dans une revue hal-00746846 v1
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Genome Sequence of the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum

Iagc The International Aphid Genomics Consortium , Federica Calevro , Hubert Charles , Stefano Colella , Gérard Febvay et al.
PLoS Biology, 2010, 8 (2), pp.e1000313. ⟨10.1371/journal.pbio.1000313⟩
Article dans une revue hal-00459970 v1

Genomic insight into the amino acid relations of the pea aphid, Acyrthosiphon pisum, with its symbiotic bacterium Buchnera aphidicola.

A. C. C. Wilson , P. D. Ashton , Federica Calevro , H. Charles , Stefano Colella et al.
Insect Molecular Biology, 2010, 19 Suppl 2 (S2), pp.249-58. ⟨10.1111/j.1365-2583.2009.00942.x⟩
Article dans une revue hal-00539196 v1
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Structure and dynamics of the operon map of Buchnera aphidicola sp. strain APS.

Lilia Brinza , Federica Calevro , Gabrielle Duport , Karen Gaget , Christian Gautier et al.
BMC Genomics, 2010, 11 (666), pp.666. ⟨10.1186/1471-2164-11-666⟩
Article dans une revue hal-00632959 v1
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Impact of host developmental age on the transcriptome of the symbiotic bacterium Buchnera aphidicola in the pea aphid (Acyrthosiphon pisum).

John Bermingham , Andréane Rabatel , Federica Calevro , José Viñuelas , Gérard Febvay et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2009, 75 (22), pp.7294-7. ⟨10.1128/AEM.01472-09⟩
Article dans une revue hal-00445867 v1

Systemic analysis of the symbiotic function of Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid Acyrthosiphon pisum.

Lilia Brinza , José Viñuelas , Ludovic Cottret , Federica Calevro , Yvan Rahbé et al.
Comptes Rendus. Biologies, 2009, 332 (11), pp.1034-49. ⟨10.1016/j.crvi.2009.09.007⟩
Article dans une revue istex hal-00445861 v1

Un vieux couple inséparable à la conquête des plantes vasculaires : le puceron et Buchnera, sa bactérie symbiotique

Yvan Rahbé , Gérard Febvay , Stefano Colella , Hubert Charles , Federica Calevro
Comptes Rendus de l'Académie d'Agriculture de France, 2009, 95 (5), pp.78-78
Article dans une revue hal-02657684 v1
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Conservation of the links between gene transcription and chromosomal organization in the highly reduced genome of Buchnera aphidicola.

José Viñuelas , Federica Calevro , Didier Remond , Jacques Bernillon , Yvan Rahbé et al.
BMC Genomics, 2007, 8, pp.143. ⟨10.1186/1471-2164-8-143⟩
Article dans une revue hal-00373371 v1

Unis pour survivre : les pucerons et leurs bactéries symbiotiques

Yvan Rahbé , H. Charles , Federica Calevro , Jean-Christophe Simon , C. Rispe
Biofutur, 2007, 279, pp.49-52
Article dans une revue hal-00391504 v1
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Different levels of transcriptional regulation due to trophic constraints in the reduced genome of Buchnera aphidicola APS

N. Reymond , Federica Calevro , J. Vinuelas , N. Morin , Yvan Rahbé et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2006, 72 (12), pp.7760-7766. ⟨10.1128/AEM.01118-06⟩
Article dans une revue hal-00391509 v1
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Codon usage bias and tRNA over-expression in Buchnera aphidicola after aromatic amino acid nutritional stress on its host Acyrthosiphon pisum

H. Charles , Federica Calevro , J. Vinuelas , J.M. Fayard , Yvan Rahbé
Nucleic Acids Research, 2006, 34 (16), pp.4583-4592. ⟨10.1093/nar/gkl597⟩
Article dans une revue hal-00391277 v1
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SITRANS: a web information system for microarray experiments

Frederique Laforest , A. Tchounikine , T. Chaari , H. Charles , Federica Calevro
Studies in Health Technology and Informatics, 2005, 116, pp.33-38
Article dans une revue hal-00391451 v1

Bioinformatique des puces à ADN et application à l'analyse du transcriptome de Buchnera aphidicola

H. Charles , Federica Calevro , N. Reymond , Yvan Rahbé , G. Febvay et al.
L'Echo des Puys, INRA Clermont-Ferrand, 2005, 79, pp.6
Article dans une revue hal-00391275 v1

Assessment of 35mer amino-modified oligonucleotide based microarray with bacterial samples.

Federica Calevro , Hubert Charles , Nancie Reymond , Vincent Dugas , Jean-Pierre Cloarec et al.
Journal of Microbiological Methods, 2004, 57 (2), pp.207-18. ⟨10.1016/j.mimet.2004.01.009⟩
Article dans une revue istex hal-00402180 v1

ROSO : Research on Optimized Oligonucleotide Probes for Microarrays

N. Reymond , H. Charles , L. Duret , Federica Calevro , G. Beslon et al.
Bioinformatics, 2004, 20, pp.271-273
Article dans une revue hal-00427641 v1
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Métabolisme d'une bactérie symbiotique et besoins nutritionnels de son hôte : une question d'offre et de demande ?

Léo Gerlin , Patrice Baa-Puyoulet , Karen Gaget , Garance Lapetoule , Isabelle Rahioui et al.
2nd Workshop Modélisation du Métabolisme, Mar 2024, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-04524685 v1

Functional analysis of interactions between bed bugs and their symbionts Wolbachia and BEV-like

Raphaël Jorge , Marius Poulain , Elodie Rosinski , Hélène Henri , Adil El Filali et al.
International congress of Ecology and Evolution (SFE2), Oct 2024, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-04805333 v1
Image document

Evolution towards a two-way cooperation in a single symbiotic organ: the developmental chronicle of a multi-partner insect endosymbiosis

François Renoz , Karen Gaget , Hubert Charles , Nicolas Parisot , Patrice Baa-Puyoulet et al.
International congress of Ecology and Evolution (SFE2), Société Française d'Ecologie et d'Evolution (SFE2), Oct 2024, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-04753005 v1

Two-way cooperation in a single symbiotic organ: the developmental chronicle of a multi-partner insect endosymbiosis

François Renoz , Karen Gaget , Hubert Charles , Mélanie Ribeiro Lopes , Nicolas Parisot et al.
3rd Joint Congress on Evolutionary Biology, Jul 2024, Montreal, Canada
Communication dans un congrès hal-04753845 v1

Subcellular localization of BCR4, an aphid-specific defensin peptide, in the bacteriocytes of Acyrthosiphon pisum

Hugo Terrasson , Karen Gaget , Séverine Balmand , Isabelle Rahioui , Patrick Callaerts et al.
2nd Webinaire du réseau "MultiFonction des Peptides AntiMicrobiens" (MuFoPAM), Apr 2024, Virtual, France
Communication dans un congrès hal-04633387 v1

BCR4, a defensin with a strong impact on aphid survival, embryo development and symbiotic cells of three Acyrthosiphon pisum lines

Hugo Terrasson , Karen Gaget , Garance Lapetoule , Isabelle Rahioui , François Renoz et al.
14èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2024, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-04772051 v1

RNAseq analysis reveals new roles for conserved metazoan pathways in the regulation of bacteriocyte dynamics

Mélanie Ribeiro Lopes , Sergio Peignier , Karen Gaget , François Renoz , Patrick Callaerts et al.
14èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Oct 2024, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-04783705 v1

Evolutionarily conserved metazoan pathways have evolved new functions and regulate bacteriocytes' dynamics in the context of symbiosis

Mélanie Ribeiro Lopes , Nicolas Parisot , Sergio Peignier , Karen Gaget , François Renoz et al.
XXVII International Congress of Entomology, Aug 2024, Kyoto, Japan
Communication dans un congrès hal-04702864 v1

Evolutionarily conserved metazoan pathways have evolved new functions in the context of symbiotic interactions

Federica Calevro
ERATO (Evolving Symbiosis Project International Seminar Series), Ryuichi Koga et Takema Fukatsu, May 2023, Webinar, Japan
Communication dans un congrès hal-04783979 v1

Bacteriocyte-specific Cysteine-Rich (BCR) peptides form a new aphid-specific defensin-like family and are promising regulators of aphid symbiosis

Hugo Terrasson , Karine Loth , Nicolas Parisot , Françoise Paquet , Isabelle Rahioui et al.
Rencontres du Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID), May 2023, Poitiers, France
Communication dans un congrès hal-04633283 v1

A genome-wide annotation of transcription factors in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum, and the related database, ATFdb

Nicolas Parisot , Mélanie Ribeiro Lopes , Hubert Charles , Sergio Peignier , Patrice Baa-Puyoulet et al.
13èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès hal-04524595 v1

Deciphering growth/nutrition dynamics at the aphid – symbiont interface through metabolic modeling

Léo Gerlin , Patrice Baa-Puyoulet , Karen Gaget , Isabelle Rahioui , Marie-Gabrielle Duport et al.
13e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès hal-04524579 v1

Acyrthosiphon pisum tissue-specific gene regulatory network inference

Sergio Peignier , Erwan Cruché , Elea Pauliat , Mélanie Ribeiro Lopes , Nicolas Parisot et al.
13èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès hal-04670574 v1

Study of host-symbionts coevolution in the whitefly Bemisia tabaci: an experimental evolution approach

Hubert Charles , Hélène Henri , Zainab Belgaidi , Isabelle Rahioui , Karen Gaget et al.
13e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès hal-04524543 v1

The pea aphid Acyrtosiphon pisum, an emerging model for developmental and evolutionary studies

Patrick Callaerts , Cissy Huygens , Federica Calevro
Unconventional and emerging experimental organisms in cell and developmental biology Meeting, The Company of Biologists, Sep 2023, Surrey, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-04785423 v1

Characterization of Neuropeptide F and its receptor in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum

Cissy Huygens , Jasmine Donckers , Mélanie Ribeiro Lopes , Karen Gaget , Federica Calevro et al.
13èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès hal-04670572 v1

Immunolocalisation des peptides "Bacteriocyte-specific cystein rich" (BCR), potentiels régulateurs de la symbiose chez les pucerons

Hugo Terrasson , Karen Gaget , Severine Balmand , Isabelle Rahioui , Patrick Callaerts et al.
13èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-04633315 v1

Modélisation du métabolisme et des interactions symbiotiques chez les pucerons

Léo Gerlin , Patrice Baa-Puyoulet , Federica Calevro , Hubert Charles
Journée scientifique enjeu « santé globale et bio‐ingénierie » de l'INSA Lyon, Apr 2023, Villeurbane, France
Communication dans un congrès hal-04121080 v1

Utilisation de méthodes d'apprentissage automatique pour la reconstruction et modélisation de réseaux géniques développementaux chez les bactériocytes d'insectes

Sergio Peignier , Nicolas Parisot , Federica Calevro
1er séminaire Métaprogramme DIGIT-BIO, Dec 2022, Ecully, France
Communication dans un congrès hal-04889858 v1

Peptides « Bacteriocyte-specific Cysteine Rich » (BCR) : un rôle dans le contrôle de la symbiose ? Focus sur BCR4 chez le puceron du pois.

Hugo Terrasson , Karine Loth , Nicolas Parisot , Françoise Paquet , Isabelle Rahioui et al.
12èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France
Communication dans un congrès hal-04771966 v1

Les peptides « Bacteriocyte-specific Cystein-Rich » : une nouvelle famille de défensine. Régulateurs de la symbiose chez les pucerons ?

Hugo Terrasson , Karine Loth , Nicolas Parisot , Françoise Paquet , Isabelle Rahioui et al.
9ème Journées du GDR "MultiFonction des Peptides AntiMicrobiens" (MuFoPAM), Oct 2022, Amboise, France
Communication dans un congrès hal-04633233 v1

Bacteriocyte differentiation and cell death in the aphid/Buchnera symbiotic system

Mélanie Ribeiro Lopes , Nicolas Parisot , Patrick Callaerts , Federica Calevro
XXVI International Congress of Entomology, Jul 2022, Helsinki, Finland
Communication dans un congrès hal-04670590 v1

Réseaux de régulation géniques : Méthodes d'inférence et questions biologiques dans le modèle puceron

Federica Calevro , Nicolas Parisot , Sergio Peignier
Première rencontre SPE et Numérique, INRAE département SPE, May 2022, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-04783124 v1

The bacteriocyte: a biological innovation to sustain and control bacterial symbionts in insect nutritional symbioses

Mélanie Ribeiro Lopes , Federica Calevro
Invited seminar at UMR 754 IVPC-SFR Biosciences, Nov 2022, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-04670597 v1

The pea aphid, Acyrthosiphon pisum: an emerging genomic model to study the cellular and molecular bases of bacterial symbiosis in insects

Federica Calevro
14th BioSciences SFR Day: Top Models in Biology, SFR Biosciences, Jun 2022, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-04783527 v1

Plasticity of bacteriocytes facing nutritional stresses in the pea aphid development.

Mélanie Ribeiro Lopes , Karen Gaget , François Renoz , Marie-Gabrielle Duport , Severine Balmand et al.
12èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France
Communication dans un congrès hal-03741301 v1

Sustainable laser-based technology for insect pest control

R. Gaetani , V. Lacotte , Vincent Dufour , Clavel A. , Marie-Gabrielle Duport et al.
6th International Conference on Energy and Environmental Science, Jan 2022, Virtual, France
Communication dans un congrès hal-03543644 v1

La face cachée des LncRNAs d’Acyrthosiphon pisum

Marion Cardinaud , Nicolas Parisot , Antonin Schmitz , Joris Villalba , Marie-Gabrielle Duport et al.
12ème Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés - BAPOA, May 2022, Nice, France
Communication dans un congrès hal-04783582 v1

The assembly of the rice weevil Sitophilus oryzae is dominated by transposable elements and shades light on the evolution of endosymbiosis in a major crop pest.

Nicolas Parisot , Carlos Vargas-Chávez , Clément Goubert , Patrice Baa-Puyoulet , Severine Balmand et al.
Arthropod Genomics Symposium 2022, Jun 2022, Notre Dame (Indiana), United States
Communication dans un congrès hal-04783673 v1

Ensemble Learning Based Gene Regulatory Network Inference

Sergio Peignier , Baptiste Sorin , Federica Calevro
33rd IEEE International Conference on Tools with Artificial Intelligence, Nov 2021, Washington, United States. pp.113-120, ⟨10.1109/ICTAI52525.2021.00024⟩
Communication dans un congrès hal-03630485 v1

Role of symbionts in insects’ ecological diversification: cytotype influences exploitation of an unfavorable host plant in the sap-feeder Bemisia tabaci

Sylvain Benhamou , Isabelle Rahioui , Hélène Henri , Hubert Charles , Pedro da Silva et al.
DECRYPthèse E2M2 Edition 20, May 2021, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès hal-03514227 v1

Détection de pucerons par imagerie hyperspectrale en conditions de laboratoire

V. Lacotte , Sergio Peignier , Marie-Gabrielle Duport , Karen Gaget , Abdelaziz Heddi et al.
Webinaire du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Sep 2021, Virtual, France
Communication dans un congrès hal-04772039 v1

Role of symbionts in insects’ ecological diversification: cytotype influences exploitation of an unfavorable host plant in the whitefly Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae)

Sylvain Benhamou , Isabelle Rahioui , Hélène Henri , Hubert Charles , Pedro da Silva et al.
Webinaires du Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions (G-RREMI) 2021, 2021, Villeurbanne (virtual), France
Communication dans un congrès hal-03514239 v1

Sustainable laser‑based technology for insect pest control

R. Gaetani , V. Lacotte , Vincent Dufour , Alain Clavel , Marie-Gabrielle Duport et al.
5th International Conference on Software and e-Business, Dec 2021, Virtual, France. pp.11068
Communication dans un congrès hal-04772105 v1

The Inhibitor of APoptosis (IAP) gene family in aphids: between expansion and functional diversification

Mélanie Ribeiro Lopes , Nicolas Parisot , Sergio Peignier , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport et al.
Webinaire du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), 2021, Villeurbanne (virtual), France
Communication dans un congrès hal-03514209 v1
Image document

Gene Regulatory Network Inference Using Ensembles of Predictors

Sergio Peignier , Baptiste Sorin , Federica Calevro
33rd IEEE International Conference on Tools with Artificial Intelligence, IEEE, Nov 2021, Virtual event, United States
Communication dans un congrès hal-03022606 v2

Evidence for high plasticity and modularity of the Inhibitor of APoptosis (IAP) repertoire in insects

Mélanie Ribeiro Lopes , Federica Calevro
Invited seminar at University of Pisa, Dec 2021, Pise, Italy
Communication dans un congrès hal-04670594 v1

Intégration de données multi-omiques pour l’identification d’enzymes clés du métabolisme lipidique chez l’espèce sentinelle Gammarus fossarum

Natacha Koenig , Patrice Baa-Puyoulet , Maxime Leprêtre , Jean-Charles Gaillard , J. Armengaud et al.
GDR Ecotoxicologie, Nov 2021, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-03810311 v1

Sustainable laser-based technology for insect pest control

R. Gaetani , V. Lacotte , Vincent Dufour , Alain Clavel , Marie-Gabrielle Duport et al.
International Conference on Sustainable Agriculture, Environment and Forestry, Jun 2021, London, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-04802970 v1

Analysis of the inhibitor of aPoptosis (IAP) repertoire in insects reveals a complex pattern of gene losses and amplifications

Mélanie Ribeiro Lopes , Jousselin Emmanuelle , Patrice Baa-Puyoulet , C. Huygens , Karen Gaget et al.
Incontri di diversità delle forme e degli animali, Università di Pisa, 2021, Pisa, Italy
Communication dans un congrès hal-03514196 v1

The bacteriocyte: “chamber of secrets” of insect-bacterial symbiosis

Federica Calevro
Earth and Life Institute - Université Catholique de Louvain, séminaire invité, Apr 2019, Louvain-la-Neuve, Belgium
Communication dans un congrès hal-04904118 v1

IAP (Inhibitor-of-Apoptosis Protein) gene family expansion and functional diversification in aphids

Mélanie Ribeiro Lopes , Nicolas Parisot , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Korneel Hens et al.
2nd UK-France Joint meeting on Aphids - Royal Entomologial Society, Apr 2019, Rothamsted, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-03512999 v1
Image document

Data-driven Gene Regulatory Network Inference based on Classification Algorithms

Sergio Peignier , Pauline Schmitt , Federica Calevro
31st IEEE International Conference on Tools with Artificial Intelligence, Nov 2019, Portland, Oregon, United States. pp.1065-1072, ⟨10.1109/ICTAI.2019.00149⟩
Communication dans un congrès hal-02361914 v1

IAP (Inhibitor-of-Apoptosis Protein) gene family expansion and functional characterization in aphids

Mélanie Ribeiro Lopes , Nicolas Parisot , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Korneel Hens et al.
8th International Symposium on Molecular Insect Science, Jul 2019, Sitges, Spain
Communication dans un congrès hal-03741297 v1

Live and die another way for aphid bacteriocytes: new secrets of an ancient insect-bacterial symbiotic system

Federica Calevro
2nd annual meeting of Japan-France Plant-Insect-Symbiont Interaction network (PISI-net), Nov 2019, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-04904131 v1

Influence of symbionts on their host niche and partner's choice

Sylvain Benhamou , Emmanuel Desouhant , Fabrice Vavre , Federica Calevro , Laurence Mouton
2nd annual meeting of Japan-France Plant-Insect-Symbiont Interaction network (PISI-net), Apr 2019, Le Rheu, France
Communication dans un congrès hal-04788476 v1

Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisum

Nicolas Parisot , Mélanie Ribeiro Lopes , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Patrice Baa-Puyoulet et al.
France-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès hal-03514051 v1

Amplification des gènes codant les protéines de la famille des IAP et leur rôle dans l'homéostasie bactériocytaire

Mélanie Ribeiro Lopes , Nicolas Parisot , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Korneel Hens et al.
11èmes rencontres du réseau de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-03741308 v1

Another way to die for bacteriocytes in the aphid/Buchnera symbiotic system

Mélanie Ribeiro Lopes , Pierre Simonet , Karen Gaget , Severine Balmand , Kurt Buhler et al.
Journée des doctorants du département SPE, Jun 2018, Nice, France
Communication dans un congrès hal-03510629 v1

Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisum

Nicolas Parisot , Stefano Colella , Mélanie Ribeiro Lopes , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport et al.
INSA Lyon International Partner Days, Oct 2018, Villeurbanne (INSA-Lyon), France
Communication dans un congrès hal-03514034 v1

Expansion of genes encoding Apoptosis Inhibitor Proteins (IAPs) and their role in a novel bacteriocyte cell death process in aphid symbiosis

Mélanie Ribeiro Lopes , Nicolas Parisot , Karen Gaget , Pierre Simonet , Severine Balmand et al.
22. Evolutionary Biology Meeting, Sep 2018, Marseille, France
Communication dans un congrès hal-03509938 v1

AphidCyc, une collection de bases de données métaboliques dédiée à l'étude et la comparaison du métabolisme chez les pucerons

Patrice Baa-Puyoulet , Hubert Charles , Federica Calevro
11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-03510642 v1

Rôle clé du bactériocyte dans la résilience du puceron aux stress nutritionnels

Federica Calevro , Nicolas Parisot , Mélanie Ribeiro Lopes , Stefano Colella , Karen Gaget et al.
11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-03514026 v1

A novel cell death process is involved in the elimination of bacteriocytes and their symbionts through aphid aging

Mélanie Ribeiro Lopes , Pierre Simonet , Karen Gaget , Severine Balmand , Nicolas Parisot et al.
France-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès hal-03514078 v1

Effecteurs et inhibiteurs de l’apoptose chez le puceron du pois : annotation et implication dans la mort cellulaire bactériocytaire

Mélanie Ribeiro Lopes , Pierre Simonet , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Severine Balmand et al.
10. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2017, Colmar, France
Communication dans un congrès hal-03506807 v1

Life history traits and tissue-specific gene expression changes underlying the symbiotic pea aphid resilience to a tyrosine and phenylalanine depleted diet

Nicolas Parisot , Pierre Simonet , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Patrice Baa-Puyoulet et al.
9. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2016, Amiens, France
Communication dans un congrès hal-03506796 v1

Une nouvelle forme de mort cellulaire impliquée dans la dégénérescence des cellules bactériocytaires chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisum

Pierre Simonet , Severine Balmand , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Nicolas Parisot et al.
18. Colloque Biologie de l'Insecte, Jun 2016, Tours, France
Communication dans un congrès hal-03506790 v1

The long-term relationship with Buchnera aphidicola imposes another way to die for Acyrthosiphon pisum bacteriocytes

Pierre Simonet , Severine Balmand , Karen Gaget , Karine Buhler , Nicolas Parisot et al.
9. Réunion annuelle du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), Nov 2016, Amiens, France
Communication dans un congrès hal-03506794 v1

Systems biology of symbiosis: from partners’ genomics to physiology of interactions

Hubert Charles , Federica Calevro , Gérard Febvay , Patrice Baa-Puyoulet , Marie-Gabrielle Duport et al.
First Meeting of the PRC Israel-France, Sep 2016, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès hal-03506791 v1
Image document

From SymbAphidBase to SymbAphidCyc: two companion databases to study and compare aphid symbionts from genomes to metabolic pathways

Patrice Baa-Puyoulet , Mathieu Labernardiere , Nicolas Parisot , Jean-Pierre Gauthier , Gérard Febvay et al.
JOBIM 2015 - Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA). FRA., Jul 2015, Clermont-Ferrand, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-01208786 v1

Direct flow cytometry measurements and cell imaging reveal a fine-tuning of endosymbiont and bacteriocyte cell dynamics during aphid development

Pierre Simonet , Marie-Gabrielle Duport , Karen Gaget , Severine Balmand , Stefano Colella et al.
UK – France joint meeting on Aphids (Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés – Aphids Special Interest Group of Royal Entomological Sociaty), Nov 2015, Paris, France
Communication dans un congrès hal-03506775 v1

Coordination des dynamiques cellulaires entre bactériocytes et endosymbiotes au cours du développement des insectes : Une nouvelle approche par cytométrie en flux.

Pierre Simonet , Marie-Gabrielle Duport , Karen Gaget , Michèle Weiss-Gayet , Stefano Colella et al.
Réunion annuelle du REID (Réseau National Ecologie des Interactions Durables), Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID). Montferrier/ Lez, FRA., Mar 2015, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès hal-02801005 v1

Specific body compartment phenotypes induced by dsRNA treatments in the pea aphid: the cathepsin-L and phenylalanine hydroxylase examples

Pierre Simonet , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Federica Calevro
7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France
Communication dans un congrès hal-02795336 v1

Dynamique de la cellule bactériocytaire et des populations symbiotiques au cours du développement du puceron du pois

Pierre Simonet , Marie-Gabrielle Duport , Karen Gaget , Michèle Weiss-Gayet , Stefano Colella et al.
7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France
Communication dans un congrès hal-02795335 v1

Dynamique de la cellule bactériocytaire et des populations symbiotiques au cours du développement du puceron du pois

Pierre Simonet , Marie-Gabrielle Duport , Karen Gaget , M. Weiss-Gayet , Stefano Colella et al.
7èmes journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), 2014, Avignon, France
Communication dans un congrès hal-03513906 v1

SymbAphidBase : une base de données nouvelle dédiée aux symbiotes de pucerons pour stocker et visualiser les génomes séquencés en standardisant leurs annotations

Mathieu Labernardiere , Patrice Baa-Puyoulet , Jean-Pierre Gauthier , Gérard Febvay , Federica Calevro et al.
7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-01208785 v1

Symbiose puceron – Buchnera : approche métabolomique chez Acyrthosiphon pisum

Marjolaine Rey , Floriant Bellvert , Marie-Gabrielle Duport , Patrice Baa-Puyoulet , Federica Calevro et al.
6èmes journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés, Oct 2013, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-03506758 v1

L'inactivation par RNAi du gène codant la phénylalanine hydrolase dans les compartiments symbiotiques provoque une baisse de la fécondité et des défauts de développement chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisum

Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Marjolaine Rey , Severine Balmand , Hubert Charles et al.
Réunion du GRREMI (Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions), Oct 2013, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-03506724 v1

Analyse métabolomique de la symbiose entre le puceron Acyrthosiphon pisum et la bactérie Buchnera aphidicola

Marjolaine Rey , Floriant Bellvert , Marie-Gabrielle Duport , Patrice Baa-Puyoulet , Federica Calevro et al.
7èmes Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique, Jun 2013, Amiens, France
Communication dans un congrès hal-03506751 v1

dsRNAi in aphids induces variable individual and tissue responses, and phenotypes specific to the administration methods

Panagiotis Sapountzis , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , G. Febvay , Hubert Charles et al.
Cycle de séminaires en Biophysique et Biologie Moléculaire de la Cellule et du Développement, Dipartimento di Fisiologia e Biochimica, Università di Pisa / Scuola Normale Superiore di Pisa, Oct 2013, Pisa, Italy
Communication dans un congrès hal-03506764 v1

Organisation, gene expression regulation and DNA structural properties in the shrunken genome of Buchnera, the endosymbiont of aphids

Hubert Charles , Federica Calevro , Stefano Colella , Gérard Febvay
1. International Research Workshop Lyon- France / São Paulo - Brazil, Nov 2013, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-03506769 v1

Phénotypes induits par l'inactivation fonctionnelle par RNAi du gène ACYPY007803 (phényalanine hydroxylase) chez le puceron du pois

Andréane Rabatel , Marie-Gabrielle Duport , Karen Gaget , Hubert Charles , Gérard Febvay et al.
5. Journées du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), Nov 2012, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-03506379 v1

Key genes for symbiosis and development in an emerging genomic model, the pea aphid

Federica Calevro , Stefano Colella , Gérard Febvay , Hubert Charles
Séminaire invité au Dipartimento di Fisiologia e Biochimica, Università di Pisa / Scuola Normale Superiore di Pisa, Universita degli studi di Pisa. Dipartimento di Fisiologia e Biochimica, Pisa, ITA., 2012, Pisa, Italy
Communication dans un congrès hal-02804850 v1

Aphicibles - Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticides

Yvan Rahbé , Denis Tagu , Guy Condemine , E Guiderdoni , Federica Calevro et al.
ANR - Colloque Plant Genomics 2012, Apr 2012, Pont Royal en Provence, France
Communication dans un congrès hal-03506701 v1

Analyse génomique des éléments régulateurs et des propriétés structurales intrinsèques de l'ADN dans le génome réduit de Buchnera

Lilia Brinza , Federica Calevro , Hubert Charles
5. Réunion Réseau BAPOA, Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). FRA., Nov 2012, Villeurbanne, France. 22 diapos
Communication dans un congrès hal-02808160 v1

Integration of metabolic pathways and host regulation in symbiosis: tyrosine and cuticular protein biosynthesis during the pea aphid embryonic development

Andréane Rabatel , Gérard Febvay , Karen Gaget , Gabrielle Duport , Nadia Bendridi et al.
Sixth International Symposium on Molecular Insect Science, 2011, Amsterdam, Netherlands
Communication dans un congrès hal-00748785 v1

Réévaluation génomique de la fonction de transport chez Buchnera, endocytobiote des pucerons : une faible diversité de transporteurs et une organisation membranaire variable

Hubert Charles , Severine Balmand , Araceli Lamelas , Ludovic Cottret , Vicente Pérez-Brocal et al.
4. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés, Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). FRA., Nov 2011, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02808863 v1

Exploration génomique et fonctionnelle des insectes et de leurs partenaires symbiotiques

Hubert Charles , Stefano Colella , Federica Calevro , Gérard Febvay , Yvan Rahbé et al.
Journée Sciences Croisées "Modélisation et Sciences Numériques : nouveaux instruments et opportunités", Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon). Conseil Scientifique de l'INSA, Villeurbanne, FRA., Oct 2010, Villeurbanne, France. n. p
Communication dans un congrès hal-02804281 v1

Fate of transcription units in the reductive evolution of the genome of Buchnera aphidicola

Lilia Brinza , Federica Calevro , Hubert Charles
6th International Symbiosis Society Congress (6 ISS 2009) Madison, Wisconsin USA, August 9-15 2009, Aug 2009, United States
Communication dans un congrès hal-00497818 v1

The power of combining genome annotation and systems level modeling.

S.J. Macdonald , J. Ramsey , G. Jander , Atsushi Nakabachi , G.H. Thomas et al.
5th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 2", Barcelona, Espagne, Juin 2009, Jun 2009, Spain
Communication dans un congrès hal-00498405 v1

Annotation et évolution des familles de transporteurs chez le puceron du pois (Acyrthosiphon pisum)

Nicolas Parisot , Karen Gaget , Stefano Colella , Andréane Rabatel , Federica Calevro et al.
3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France. n. p
Communication dans un congrès hal-02818835 v1

Individual and compartment specific response to RNAi in aphids: each individual matters

Panagiotis Sapountzis , Marie-Gabrielle Duport , Karen Gaget , Severine Balmand , Gérard Febvay et al.
3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-02821530 v1

Caractérisation transcriptomique du développement embryonnaire et larvaire du puceron du pois Acyrthosiphon pisum

Andréane Rabatel , Gérard Febvay , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Yvan Rahbé et al.
16. Colloque de Biologie de l’Insecte, Oct 2010, Lyon, France. 126 p
Communication dans un congrès hal-02755293 v1

Aphicibles : Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticides

Yvan Rahbé , Denis Tagu , Guy Condemine , Emmanuel Guiderdoni , Federica Calevro et al.
Genoplante 2010, Agence Nationale de la Recherche (ANR). Paris, FRA., Mar 2010, Avignon, France. 40 diapos
Communication dans un congrès hal-02824684 v1

Xylem consumption response to osmotic stress in aphids

J. Pompon , Yvan Rahbé , Federica Calevro , D. Quiring , C. Goyer et al.
Annual meeting, Entomological Society of Canada, Winnipeg - Canada, 2009, Canada
Communication dans un congrès hal-00496044 v1

Genomic insight into the amino acid relations of the pea aphid with its symbiotic bacterium Buchnera aphidicola

A.C.C. Wilson , P. Ashton , Federica Calevro , Hubert Charles , Stefano Colella et al.
8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), Catania, juin 2009, Italy, 2009, Italy
Communication dans un congrès hal-00497625 v1

Transcriptome analysis of embryo development in a parthenogenetic and symbiotic insect model, the pea aphid

Andréane Rabatel , Gérard Febvay , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Yvan Rahbé et al.
IPG'10 Integrative Post-Genomics, Centre Jacques Cartier. Lyon, FRA., Nov 2011, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-02814211 v1
Image document

Characterization of partenogenetic embryo development in the context of symbiosis using transcriptome analysis in the pea aphid model

Andréane Rabatel , Gérard Febvay , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Yvan Rahbé et al.
EMBO Workshop on Systems Biology of Development, EMBO. Heidelberg, DEU., Aug 2010, Ascona, Switzerland. 1 p
Communication dans un congrès hal-01231279 v1

Genomic analysis of the transport function in the symbiotic system of the pea aphid Acyrthosiphon pisum

Yvan Rahbé , Nicolas Parisot , Karen Gaget , Stefano Colella , Andréane Rabatel et al.
5. Meeting GDRE-RA "Comparative genomics", Institut d'Estudis Catalans (IEC). Barcelona, ESP., Nov 2010, Barcelone, Spain. n. p
Communication dans un congrès hal-02823073 v1

Chromosome organization and gene expression regulation in Buchnera aphidicola, the obligate intracellular bacteria of the pea aphid Acyrthosiphon pisum

Hubert Charles , Lilia Brinza , Federica Calevro
58. Annual Meeting of the Entomological Society of America, Entomological Society of America (ESA). Annapolis, MD, USA., Dec 2010, San Diego, CA, United States
Communication dans un congrès hal-02757719 v1

AcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses

Stefano Colella , Augusto Vellozo , Ludovic Cottret , Gérard Febvay , Federica Calevro et al.
Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, 2009, Paris, juin 2009, France
Communication dans un congrès hal-02815123 v1

Besoins en acides aminés des embryons de femelles parthénogénétiques du puceron du pois.

Andréane Rabatel , Nadia Bendridi , Gabrielle Duport , Marjolaine Rey , Stefano Colella et al.
Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Jun 2009, PARIS, France
Communication dans un congrès hal-00511624 v1

Metabolic requirements in essential amino acids in parthenogenetic pea aphid embryos

A. Rabatel , N. Bendridi , G. Duport , Stefano Colella , J. Bermingham et al.
8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania (Italie), juin 2009, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391499 v1

Metabolic requirements in essential amino acids in parthenogenetic pea aphid embryos

Andréane Rabatel , Nadia Bendridi , - Duport, G. , Marjolaine Rey , Stefano Colella et al.
8. International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania, juin 2009, Italy
Communication dans un congrès hal-02820893 v1

AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) : a model database to visualize and study the metabolic network underlying the pea aphid-Buchnera symbiosis

Stefano Colella , Augusto Vellozo , Ludovic Cottret , Gérard Febvay , Federica Calevro et al.
6. International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2009, Madison, août 2009, United States
Communication dans un congrès hal-02814342 v1

AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) and CycADS (Cyc Annotation Database System): moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses

Stefano Colella , A. Vellozo , L. Cottret , G. Febvay , Federica Calevro et al.
8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania (Italie), juin 2009, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391280 v1

CycADS: an annotation management system for the development and update of BioCyc metabolic network databases

A. Vellozo , Patrice Baa-Puyoulet , A. Veron , Jaime Huerta-Cepas , Ludovic Cottret et al.
1st International Workshop on Information Systems for Insect Pests, Rennes, FRANCE, 2009, France
Communication dans un congrès hal-00496032 v1

The Acyrthosiphon pisum Cyc database (AcypiCyc) created using a novel BioCyc Annotation Database System (CycADS): a useful tool to explore and study the pea aphid metabolism

Stefano Colella , A. Vellozo , Ludovic Cottret , Gérard Febvay , Federica Calevro et al.
5th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 2, Barcelona, Espagne, juin 2009, Jun 2009, France
Communication dans un congrès hal-00498411 v1

Un vieux couple à la conquête des plantes vasculaires : le puceron et sa bactérie symbiotique

Federica Calevro , Stefano Colella , Gérard Febvay , Hubert Charles , Yvan Rahbé
Séance commune Académie Agriculture et Académie des Sciences, Académie d'Agriculture de France (AAF). Paris, FRA., Dec 2009, Paris, France. 23 diapos
Communication dans un congrès hal-02824438 v1

AcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses

Stefano Colella , Augusto Vellozo , Ludovic Cottret , Gérard Febvay , Federica Calevro et al.
8. International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania, juin 2009, Italy
Communication dans un congrès hal-02814863 v1

Interactions trophiques dans la symbiose puceron - Buchnera : Régulations transcriptionnelles de la réponse à la carence en acides aminés essentiels

Federica Calevro , H. Charles , J.M. Fayard , G. Febvay , Yvan Rahbé et al.
Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, 2008, Paris (France), janvier 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391259 v1

Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisum

H. Charles , Federica Calevro , Stefano Colella , J.M. Fayard , G. Febvay et al.
Séminaire INRA AgroBI, 2008, Bordeaux (France), décembre 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391273 v1

Evolution des organismes bactériens

G. Beslon , Federica Calevro , H. Charles , J.M. Fayard , C. Knibbe et al.
Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391156 v1

Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc): from genome sequence to metabolic network analyses

A. Vellozo , Stefano Colella , L. Cottret , G. Febvay , Federica Calevro et al.
Integrative Post-Genomics - IPG'08, 2008, Lyon (France), novembre 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391519 v1

Annotation of metabolism genes: towads the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses

Stefano Colella , A. Vellozo , L. Cottret , G. Febvay , Federica Calevro et al.
4th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 1", 2008, Princetown (USA), juillet 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391279 v1

Interactions trophiques dans la symbiose puceron - Buchnera : Régulations transcriptionnelles de la réponse à la carence en acides aminés essentiels

Federica Calevro
1. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons. FRA., Jan 2008, Paris, France. 9 diapos
Communication dans un congrès hal-02820252 v1

Les réseaux métaboliques et génétiques

H. Charles , G. Beslon , Federica Calevro , Jean-François Boulicaut , J.M. Fayard et al.
Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391271 v1

Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) : from genome sequence to metabolic network analyses

Augusto Vellozo , Stefano Colella , Ludovic Cottret , Gérard Febvay , Federica Calevro et al.
Integrative Post-Genomics - IPG'08, 2008, Lyon, novembre 2008, France
Communication dans un congrès hal-02821711 v1

Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisum

Hubert Charles , Federica Calevro , Stefano Colella , Jean-Michel Fayard , Gérard Febvay et al.
Séminaire INRA AgroBI, 2008, Bordeaux, décembre 2008, France
Communication dans un congrès hal-02824972 v1

Evolution des organismes bactériens

Guillaume Beslon , Federica Calevro , Hubert Charles , Jean-Michel Fayard , Carole Knibbe et al.
Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", Jul 2008, Villeurbanne, France. 12 diapos
Communication dans un congrès hal-02822501 v1

Transcriptomique

Jean-François Boulicaut , Federica Calevro , H. Charles , J.M. Fayard , G. Febvay et al.
Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391255 v1

IGOIM, une méthode d'inférence de réseaux génétiques utilisant l'information mutuelle

L. Brinza , Federica Calevro , H. Charles
Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM) - Journée satellite "Analyse statistique du transcriptome", 2007, Marseille (France), juillet 2007, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391258 v1

Comparative analysis of gene expression in the aphid-Buchnera symbiosis: the role of Buchnera in the nutrition of aphid embryos

J. Bermingham , Federica Calevro , J. Vinuelas , H. Charles , T. Wilkinson
Society of Experimental Biology Annual Main Meeting 2007 (SEB 2007), 2007, Glasgow (UK), avril 2007, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391155 v1

Regulation of expression following nutritional stresses in the reduced genome of Buchnera aphidicola, "Is there any life left?

Yvan Rahbé , H. Charles , J. Vinuelas , N. Reymond , Federica Calevro et al.
Seminarios del Institut Cavanilles de Biodiversitat i Biologia Evolutiva (ICBiBE) - Univ. Valencia (ESP), 2007, Valencia (Espagne), juin 2007, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391505 v1

Conservation de la relation entre niveau d'expression des gènes et organisation du chromosome chez Buchnera aphidicola, symbiote primaire des pucerons : exemple d'un génome réduit mais non dégénéré

J. Vinuelas , Federica Calevro , D. Remond , J. Bernillon , Yvan Rahbé et al.
XVème Colloque de Physiologie de l'Insecte, Jul 2007, Rennes, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00373311 v1

Relationships between gene expression and genome properties in Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid

J. Vinuelas , Federica Calevro , J. Bernillon , Didier Remond , Yvan Rahbé et al.
5th International of Symbiosis Society Congress, Aug 2006, Autriche
Communication dans un congrès hal-00506826 v1

Régulation génétique et métabolique chez Buchnera aphidicola (AgroBi 2006)

L. Cottret , L. Brinza , J. Vinuelas , G. Duport , Federica Calevro et al.
Journée INRA-INRIA "Insertion des mathématiques dans les approches biologiques : du gène à l'organisme", 2006, Lyon (France), décembre 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391289 v1

Buchnera aphidicola, endocytobiote du puceron : transcriptome d'un génome "dégénéré

H. Charles , Federica Calevro , J. Vinuelas , G. Febvay , Yvan Rahbé et al.
Rencontres 2006 des Microbiologistes de l'INRA, 2006, Dourdan (France), juin 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391278 v1

Metabolic interactions between the bacterium Buchnera aphidicola and its obligate symbiotic partner, the pea aphid: nutritional studies combined with transcriptome analyses

Federica Calevro , N. Reymond , J. Vinuelas , G. Febvay , Yvan Rahbé et al.
5th International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2006, Vienna (Autriche), août 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391262 v1

Spatial transcriptomic patterns in the genome of the endosymbiotic bacterium Buchnera aphidicola

J. Vinuelas , Federica Calevro , Didier Remond , J. Bernillon , Yvan Rahbé et al.
Theoretical Approaches for the Genome Workshop, Nov 2006, France
Communication dans un congrès hal-00506911 v1

Relationship between gene expression and genome properties in Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid Acyrthosiphon pisum

J. Vinuelas , Federica Calevro , J. Bernillon , D. Remond , Yvan Rahbé et al.
5th International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2006, Vienna (Autriche), août 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391524 v1

Spatial transcriptomic patterns in the genome of the endosymbiotic bacterium Buchnera aphidicola

J. Vinuelas , Federica Calevro , D. Remond , J. Bernillon , Yvan Rahbé et al.
Workshop "Theoretical Approaches for the Genome", 2006, Annecy-le-Vieux (France), novembre 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391525 v1

Buchnera aphidicola: evidences for transcriptional regulation in a degenerated genome

Federica Calevro , N. Reymond , J. Vinuelas , A. Groppi , A. Barre et al.
Colloque INRA "Apports de la génomique à la physiologie et la pathologie de l'insecte", 2006, Montpellier (France), mars 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391267 v1

Bioinformatics analysis of the nucleoid associated protein FIS in Buchnera aphidicola, the intracellular symbiotic bacteria of aphids

L. Brinza , C. Armenise , E. Leproult , A. Paun , P. da Silva et al.
Integrative Post-Genomics - IPG'06, 2006, Lyon (France), novembre-décembre 2006, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391257 v1

Of lice and plants: metabolite flows in the trophic pathway of phloem feeding insects as analysed through genomic and EST data from the aphid symbiosis

Yvan Rahbé , Federica Calevro , H. Charles , G. Febvay , Denis Tagu
Society of Experimental Biology Annual Main Meeting 2005 (SEB 2005), 2005, Barcelona (Espagne), juillet 2005, France. pp.S233
Communication dans un congrès hal-00391503 v1

Transcriptional responses of Buchnera aphidicola to combined amino acid and osmotic stress in the diet of its symbiotic partner, Acyrthosiphon pisum

H. Charles , Federica Calevro , J. Vinuelas
COST853: Agricultural Biomarkers for Array-Technology - Combined WG4 & WG5 meetings "Chip production and analysis, and environmental monitoring", 2005, Lyon (France), novembre 2005, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391276 v1

SITRANS: a web information system for microarray experiments

Frederique Laforest , A. Tchounikine , T. Chaari , H. Charles , Federica Calevro
XIX International Congress of the European Federation for Medical Informatics, 2005, Genève (Suisse), août-septembre 2005, France. pp.33-38
Communication dans un congrès hal-00391450 v1

Analyse transcriptomique de la réponse de Buchnera aphidicola à un stress métabolique subi par son hôte le puceron du pois, Acyrthosiphon pisum

Federica Calevro , N. Reymond , N. Morin , A. Dumitru , Yvan Rahbé et al.
Journées Reseau Ecologie et Interactions Durables (REID), 2005, Lyon (France), janvier 2005, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391260 v1

Genomewide transcriptional changes associated with nutritional alterations affecting phenylalanine and tyrosine metabolism in Buchnera aphidicola

H. Charles , Federica Calevro , N. Reymond , N. Morin , Yvan Rahbé et al.
Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), 2005, Lyon (France), juillet 2005, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391274 v1

Buchnera aphidicola: evidences for transcriptional regulation in a degenerated genome

Federica Calevro , N. Reymond , J. Vinuelas , A. Groppi , A. Barre et al.
Integrative Post-Genomics - IPG'05, 2005, Lyon (France), novembre-décembre 2005, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391266 v1

Global transcriptional responses of Buchnera aphidicola to aromatic amino acid limitation in the diet of its symbiotic partner, the phloem sap feeding insect Acyrthosiphon pisum

Federica Calevro , N. Reymond , N. Morin , Yvan Rahbé , J. Bernillon et al.
Society of Experimental Biology Annual Main Meeting 2005 (SEB 2005), 2005, Barcelona (Espagne), juillet 2005, France. pp.S226
Communication dans un congrès hal-00391261 v1

Gene expression measurements with microarray technology in bacteria: transcriptomic analysis af the symbiotic bacteria, Buchnera aphidicola, in nutritional stress conditions of its aphid host Acyrthosiphon pisum

H. Charles , Federica Calevro
Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM) - Journée satellite Vicanne, 2005, Lyon (France), juillet 2005, France. pp.1-1
Communication dans un congrès hal-00391272 v1

Influence of probe sequence and strand lenght on the morphology and structuration of DNA chip

M.H. Rouillat , Vincent Dugas , Federica Calevro , J.P. P Cloarec , Hubert Charles et al.
Nano 8 : 8. International Conference of nanometer scale science and technology, Jul 2004, Venise, Italy
Communication dans un congrès hal-03506638 v1

Influence of sequence and strand length on the structuration of DNA-chip.

M.H. Rouillat , Vincent Dugas , Federica Calevro , Magali Phaner-Goutorbe
Nano-8, 8th International Conference on Nanometer Scale Science and Technology, Jun 2004, Venise, Italy
Communication dans un congrès hal-04924419 v1

Analyse du transcriptome de Buchnera, la bactérie symbiotique intracellulaire des pucerons : une approche méthodologique

Federica Calevro , Hubert Charles , Nancie Reymond , Vincent Dugas , J.P. P Cloarec et al.
14. Colloque de Physiologie de l’Insecte, Apr 2003, Amiens, France
Communication dans un congrès hal-03506495 v1

Buchnera aphidicola, bactérie endosymbiotique des pucerons : génomes et physiologie symbiotique

Yvan Rahbé , Z Al Ayoubi , Federica Calevro , Hubert Charles , Jean-Michel Fayard et al.
4. Colloque de Physiologie de l’Insecte, Apr 2003, Amiens, France
Communication dans un congrès hal-03506623 v1

Détection et segmentation automatisée de bactériocytes à partir d’images de microscopie optique

Nathan Hutin , Mélanie Ribeiro Lopes , Karen Gaget , Severine Balmand , Federica Calevro et al.
Colloque Français d'Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale (IABM) 2025, Mar 2025, Nice, France
Poster de conférence hal-05005315 v1
Image document

Automated detection and segmentation of bacteriocytes from light microscopy images

Nathan Hutin , Mélanie Ribeiro Lopes , Karen Gaget , Federica Calevro , Chantal Revol-Muller et al.
Colloque d'Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédical (IABM), Mar 2025, Nice, France
Poster de conférence hal-05109817 v1

The aphid BCR4 structure and activity uncover a new defensin peptide superfamily

Hugo Terrasson , Karine Loth , Nicolas Parisot , Françoise Paquet , Isabelle Rahioui et al.
XXVII International Congress of Entomology, Aug 2024, Kyoto, Japan
Poster de conférence hal-04702878 v1

Insulin and AKH signaling during development and under nutritional stress in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum

Cissy Huygens , Jozef Vanden Broeck , Federica Calevro , Patrick Callaerts
14èmes Rencontres du Réseau de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associées (BAPOA), Nov 2024, Montpellier, France
Poster de conférence hal-04783651 v1

Mathematical modeling of pea aphid metabolism

Ariane Paradan , Patrice Baa-Puyoulet , Federica Calevro , Hubert Charles , Léo Gerlin
14èmes rencontres du réseau de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2024, Montpellier, France
Poster de conférence hal-04788746 v1

Genome assembly of the cereal aphid Sipha maydis, a model for the study of dual endosymbiosis in insects

François Renoz , Nicolas Parisot , Patrice Baa-Puyoulet , Léo Gerlin , Samir Fakhour et al.
13e Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Poster de conférence hal-04524568 v1

Dynamics of endosymbionts in bed bugs during development

Raphaël Jorge , Marius Poulain , Elodie Rosinski , Hélène Henri , Adil El Filali et al.
Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions (G-RREMI), Nov 2023, Lyon, France
Poster de conférence hal-04805370 v1

The Bacteriocyte-specific Cysteine-Rich (BCR) proteins: a role in the control of aphid symbiosis ?

Hugo Terrasson , Karine Loth , Françoise Paquet , Nicolas Parisot , Isabelle Rahioui et al.
Journée scientifique enjeu « santé globale et bio‐ingénierie » de l'INSA Lyon, Apr 2023, Villeurbanne, France
Poster de conférence hal-04633269 v1

Neprilysin 1 controls SIFamide Levels to Regulate Feeding-related Behavior in Drosophila melanogaster

El-Sayed Baz , Maria Pons Vizcarra , Veerle Vulsteke , Sofie de Groef , Thomas Riemensperger et al.
27th European Drosophila Conference, Oct 2023, Lyon, France
Poster de conférence hal-04783950 v1

Secondary symbionts influence feeding and oviposition behavior in the whitefly Bemisia tabaci

Sylvain Benhamou , Isabelle Rahioui , Hélène Henri , Hubert Charles , Pedro da Silva et al.
XII European Congress of Entomology, Oct 2023, Heraklion, Greece
Poster de conférence hal-04524520 v1

Functional analysis of interactions between bed bugs and their nutritional symbiont Wolbachia

Raphaël Jorge , Marius Poulain , Elodie Rosinski , Hélène Henri , Adil El Filali et al.
Rencontres du Réseau Ecologie des Interactions Durables 2023, May 2023, Poitiers, France
Poster de conférence hal-04805475 v1

Functional analysis of interactions between bed bugs and their nutritional symbiont Wolbachia

Raphaël Jorge , Marius Poulain , Elodie Rosinski , Hélène Henri , Adil El Filali et al.
Journée scientifique enjeu « santé globale et bio‐ingénierie » de l'INSA Lyon, Apr 2023, Lyon, France
Poster de conférence hal-04805501 v1

From genomes to metabolism reconstruction: companion collections of databases to study symbiotic interactions between insects and their bacterial symbionts

Patrice Baa-Puyoulet , Nicolas Parisot , Sergio Peignier , Federica Calevro , Hubert Charles
10th congress of the International Symbiosis Society (ISS) - 3rd International Conference on Holobionts (joint meeting), Jul 2022, Lyon, France
Poster de conférence hal-04784498 v1

Extreme plasticity of bacteriocytes facing nutritional stresses during pea aphid development

Mélanie Ribeiro Lopes , Karen Gaget , François Renoz , Marie-Gabrielle Duport , Severine Balmand et al.
10th congress of the International Symbiosis Society (ISS) - 3rd International Conference on Holobionts (joint meeting), Jul 2022, Lyon, France
Poster de conférence hal-03741327 v1

High-throughput genomics and transcriptomics to decipher host-symbiont molecular dialogue in the cereal weevil Sitophilus oryzae and Sodalis pierantonius endosymbiotic association

Nicolas Parisot , Mariana Galvão Ferrarini , Clément Goubert , Carlos Vargas-Chávez , Agnès Vallier et al.
10th congress of the International Symbiosis Society (ISS) - 3rd International Conference on Holobionts (joint meeting), Jul 2022, Lyon, France
Poster de conférence hal-03810657 v1

Influence of bacterial symbionts on host niche and ecological diversification: an integrative approach in a whitefly model

Sylvain Benhamou , Isabelle Rahioui , Hélène Henri , Pedro da Silva , Hubert Charles et al.
XXVI International Congress of Entomology, Jul 2022, Helsinki, Finland
Poster de conférence hal-03927204 v1

From genomes to metabolism reconstruction: companion collections of databases to study symbiotic interactions between insects and their bacterial symbionts.

Patrice Baa-Puyoulet , Nicolas Parisot , Sergio Peignier , Federica Calevro , Hubert Charles
12èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France
Poster de conférence hal-03810352 v1

ER stress as a major regulator of aphid bacteriocyte cell death

Karen Gaget , Mélanie Ribeiro Lopes , Marie-Gabrielle Duport , Patrick Callaerts , Nicolas Parisot et al.
12èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France
Poster de conférence hal-03741344 v1

Role of symbionts in insects' ecological diversification: cytotype influences exploitation of an unfavorable host plant in the sap-feeder Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae).

Sylvain Benhamou , Isabelle Rahioui , Zainab Belgaidi , Hélène Henri , Hubert Charles et al.
Rencontres du Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions (G-RREMI) 2022, Nov 2022, Villeurbanne, France
Poster de conférence hal-03927225 v1

Embedded into bacteriocytes, but highly invasive: the puzzling case of the co-obligate symbiont Serratia symbiotica in the aphid Periphyllus lyropictus

François Renoz , Mélanie Ribeiro Lopes , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Marie-Christine Eloy et al.
ELI-Day, Annual meeting of the Earth and Life Institute of the University of Louvain-la-Neuve, May 2022, Louvain-la-Neuve, Belgium
Poster de conférence hal-03741341 v1

Influence of secondary symbionts on host plant utilization and selection in the whitefly Bemisia tabaci.

Sylvain Benhamou , Isabelle Rahioui , Hélène Henri , Zainab Belgaidi , Hubert Charles et al.
10th congress of the International Symbiosis Society (ISS) - 3rd International Conference on Holobionts (joint meeting), Jul 2022, Lyon, France
Poster de conférence hal-03927184 v1

Bacteriocytes and the interorgan communication network regulating physiology and metabolism of the pea aphid

Cissy Huygens , Mélanie Ribeiro Lopes , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Sergio Peignier et al.
10th congress of the International Symbiosis Society (ISS) - 3rd International Conference on Holobionts (joint meeting), Jul 2022, Lyon, France
Poster de conférence hal-03741324 v1

The role of GPCRs in metabolism and physiology of the pea aphid, Acyrthosiphon pisum

Cissy Huygens , Mélanie Ribeiro Lopes , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Federica Calevro et al.
XXVI International Congress of Entomology, Jul 2022, Helsinki, Finland
Poster de conférence hal-03741320 v1

Bacteriocyte specific Cystein Rich peptides, a new defensin like protein family , are promising regulators of aphid symbiosis

Hugo Terrasson , Karine Loth , Nicolas Parisot , Françoise Paquet , Isabelle Rahioui et al.
10th congress of the International Symbiosis Society (ISS) - 3rd International Conference on Holobionts (joint meeting), Jul 2022, Lyon, France
Poster de conférence hal-04771990 v1

From genomes to metabolism reconstruction: companion collections of databases to study symbiotic interactions between insects and their bacterial symbionts

Patrice Baa-Puyoulet , Nicolas Parisot , Sergio Peignier , Federica Calevro , Hubert Charles
13. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), 2020, Nice (virtuel), France
Poster de conférence hal-03514174 v1

Développement d’approches métabolomiques pour étudier la contribution des symbiotes à l’exploitation et à la spécialisation de niche de Bemisia tabaci, insecte invasif ravageur de cultures

Federica Calevro , Isabelle Rahioui , Laurence Mouton
Journées d’échanges - Fédération BioEnvironnement et Santé, Feb 2019, Villeurbanne, France
Poster de conférence hal-04904092 v1

Influence of bacterial symbionts on host niche and ecological diversification: a metabolic approach in a whitefly model.

Sylvain Benhamou , Isabelle Rahioui , Emmanuel Desouhant , Abdelaziz Heddi , Fabrice Vavre et al.
Colloque Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID) et le réseau Immunologie des Invertébrés (IMMUNINV), May 2019, Montpellier, France
Poster de conférence hal-04788462 v1

A novel cell death process eliminates both bacteriocytes and their symbionts in the pea aphid/Buchnera symbiotic system

Mélanie Ribeiro Lopes , Pierre Simonet , Karen Gaget , Severine Balmand , Nicolas Parisot et al.
2nd UK-France Joint meeting on Aphids - Royal Entomological Society, Apr 2019, Rothamsted, United Kingdom
Poster de conférence hal-03513018 v1

Les insectes, leur biodiversité et leur potentiel en ingénierie bio-inspirée : structure, fonctions, adaptations

Federica Calevro , Patrick Callaerts , Pedro da Silva , Abdelaziz Heddi , Yvan Rahbé
Exposition/Colloque “Biomimétique : l’imitation sans limitation, Mar 2019, Villeurbanne, France
Poster de conférence hal-04904104 v1

Bacteriocyte reprogramming to maintain organismal homeostasis under nutritional stress in aphid symbiosis

Nicolas Parisot , Stefano Colella , Pierre Simonet , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport et al.
2nd UK-France Joint meeting on Aphids - Royal Entomological Society, Apr 2019, Rothamsted, United Kingdom
Poster de conférence hal-03513048 v1

Influence of bacterial symbionts on host niche and ecological diversification: a metabolic approach in a whitefly model.

Sylvain Benhamou , Isabelle Rahioui , Abdelaziz Heddi , Emmanuel Desouhant , Fabrice Vavre et al.
Auvergne Rhône-Alpes Regional Workshop on Microbiome, Nov 2019, Lyon, France
Poster de conférence hal-04788456 v1

A novel cell death process eliminates both bacteriocytes and their symbionts in the pea aphid/Buchnera symbiotic system

Karen Gaget , Severine Balmand , Kurt Buhler , Patrick Callaerts , Nicolas Parisot et al.
INSA Lyon International Partner Days, Oct 2018, Villeurbanne (INSA-Lyon), France
Poster de conférence hal-03514067 v1

Molecular characterization of aphid bacteriocyte cell death by RNAseq analysis

Mélanie Ribeiro Lopes , Nicolas Parisot , Karen Gaget , Patrick Callaerts , Federica Calevro
11th European Congress of Entomology, Jul 2018, Naples, Italy
Poster de conférence hal-03741337 v1

Molecular characterization of aphid bacteriocyte cell death by RNAseq analysis

Nicolas Parisot , Stefano Colella , Mélanie Ribeiro Lopes , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport et al.
INSA Lyon International Partner Days, Oct 2018, Lyon, France
Poster de conférence hal-03741347 v1

A novel cell death process eliminates both bacteriocytes and their symbionts in the pea aphid/Buchnera symbiotic system

Mélanie Ribeiro Lopes , Pierre Simonet , Karen Gaget , Severine Balmand , Nicolas Parisot et al.
11. European Congress of Entomology, Jul 2018, Naples, Italy
Poster de conférence hal-03509913 v1

Evaluating the essentiality of the primary endosymbiont of the rice weevil Sitophilus oryzae through genome analysis

Carlos Vargas-Chavez , Nicolas Parisot , C. Goubert , Patrice Baa-Puyoulet , Severine Balmand et al.
VI Meeting of the Spanish Society for Evolutionary Biology (SESBE), Jan 2018, Palma de Mallorca, Spain
Poster de conférence hal-03514015 v1

Bacteriocyte reprogramming to maintain organismal homeostasis under nutritional stress in aphid symbiosis

Nicolas Parisot , Stefano Colella , Pierre Simonet , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport et al.
XIth European Congress of Entomology, Jul 2018, Naples, Italy
Poster de conférence hal-03509885 v1

The draft genome sequence of the rice weevil Sitophilus oryzae as a model to explore the host-symbiont interactions in a nascent stage of endosymbiosis

Carlos Vargas-Chavez , Nicolas Parisot , Clément Goubert , Patrice Baa-Puyoulet , Severine Balmand et al.
Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), Jun 2016, Lyon, France
Poster de conférence hal-03506786 v1
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SymbAphidBase: a new database dedicated to aphid symbionts to store novel sequenced genomes and standardize their annotations

Mathieu Labernardiere , Patrice Baa-Puyoulet , Jean-Pierre Gauthier , Gérard Febvay , Federica Calevro et al.
13. European Conference on Computational Biology (ECCB), Sep 2014, Strasbourg, France. , 1 p., 2014
Poster de conférence hal-02798649 v1

Cathepsin-L proteinase is involved in cuticle remodeling during the molting process in the pea aphid, <em>Acyrthosiphon pisum</em>

Pierre Simonet , Panagiotis Sapountzis , Marie-Gabrielle Duport , Severine Balmand , Karen Gaget et al.
7. International Symposium on Molecular Insect Science, Jul 2014, Amsterdam, Netherlands. , 1 p., 2014
Poster de conférence hal-02797200 v1
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Tyrosine metabolism and parthenogenetic development in a symbiotic insect, the pea aphid: the central function of phenylalanine hydroxylase

Pierre Simonet , Karen Gaget , Marjolaine Rey , Marie-Gabrielle Duport , Hubert Charles et al.
7. International Symposium on Molecular Insect Science, Jul 2014, Amsterdam, Netherlands. 1 p., 2014
Poster de conférence hal-02792558 v1

Métabolisme de la tyrosine et développement parthénogénétique chez le puceron du pois : la fonction centrale de la phenylalanine hydroxylase

Pierre Simonet , Karen Gaget , Marjolaine Rey , Marie-Gabrielle Duport , Hubert Charles et al.
7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2014, Avignon, France. 2014
Poster de conférence hal-02795333 v1

Implication de la cathepsine-L dans le remodelage cuticulaire durant le processus de mue chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisum

Pierre Simonet , Panagiotis Sapountzis , Marie-Gabrielle Duport , Severine Balmand , Karen Gaget et al.
7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2014, Avignon, France. 2014
Poster de conférence hal-02795332 v1

Génomique fonctionnelle des interactions bactérie / hôte eucaryote : intégration systémique de données génomiques et métaboliques

Floriant Bellvert , Federica Calevro , Hubert Charles , Stefano Colella , Gérard Febvay et al.
Journée de la FR41 BioEnvironnement et Santé, Feb 2014, Villeurbanne, France. 1 p., 2014
Poster de conférence hal-02791821 v1
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Annotating arthropods genome to study and compare their metabolism: the ArthropodaCyc collection of Cyc databases powered by CycADS

Patrice Baa-Puyoulet , Augusto Vellozo , Jaime Huerta-Cepas , Gérard Febvay , Federica Calevro et al.
13. European Conference on Computational Biology (ECCB), Sep 2014, Strasbourg, France. , 1 p., 2014
Poster de conférence hal-02798101 v1

The CycADS annotation database system to support the development and update of enriched BioCyc databases: development of ad hoc BioCyc DB (AcypiCyc, ArthropodaCyc

Patrice Baa-Puyoulet , Augusto Vellozo , Jaime Huerta-Cepas , Gérard Febvay , Federica Calevro et al.
8. Meeting of the International Aphid Genomics Consortium, Jan 2013, Harpenden, United Kingdom
Poster de conférence hal-03506707 v1

Diminution de fécondité et défauts de développement induits par l’inactivation fonctionnelle par RNAi du gène codant la phénylalanine hydroxylase chez le puceron du pois, Acyrthosiphon

Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Marjolaine Rey , Severine Balmand , Hubert Charles et al.
17. Colloque de Biologie de l’Insecte - CBI-2013, Oct 2013, Montpellier, France
Poster de conférence hal-03506719 v1

Phenotypic effects of ACYPI007803 knockdown by RNAi in the pea aphid

Andréane Rabatel , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Hubert Charles , Gérard Febvay et al.
8. Meeting of the International Aphid Genomics Consortium., Jan 2013, Harpenden, United Kingdom
Poster de conférence hal-03506744 v1

« ArthropodaCyc » : une collection de bases de données enrichies à l’aide de CycADS pour étudier et comparer le métabolisme des arthropodes.

Patrice Baa-Puyoulet , Stefano Colella , Augusto Vellozo , Jaime Huerta-Cepas , Gérard Febvay et al.
17. Colloque de Biologie de l’Insecte - CBI-2013, Oct 2013, Montpellier, France
Poster de conférence hal-03506713 v1

Integration of metabolic pathways and host regulation in symbiosis: tyrosine and cuticular protein biosynthesis during the pea aphid embryonic development

Andréane Rabatel , Gérard Febvay , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Nadia Bendridi et al.
4. Réunion Réseau BAPOA, Nov 2011, Paris, France. 1 p., 2011
Poster de conférence hal-02805925 v1

Integration of metabolic pathways and host regulation in symbiosis: tyrosine and cuticular protein biosynthesis during the pea aphid embryonic development

Andréane Rabatel , Gérard Febvay , Karen Gaget , Marie-Gabrielle Duport , Nadia Bendridi et al.
6. International Symposium on Molecular Insect Science, Oct 2011, Amsterdam, Netherlands. Elsevier, 2011,  
Poster de conférence hal-02747829 v1

Single insect and tissue compartment specific response to RNAi microinjection in aphids: each individual matters

Panagiotis Sapountzis , Marie-Gabrielle Duport , Karen Gaget , Thomas Horn , Michael Boutros et al.
4. Annual Arthropod Genomics Symposium on “Arthropod Genomics: New Approaches and Outcomes”, Jun 2010, Kansas City, United States. 1 p., 2010
Poster de conférence hal-02820936 v1

Evolution of the regulatory network in Buchnera aphidicola, the obligate intracellular symbiotic bacteria of aphids

Lilia Brinza , Federica Calevro , Marie-Gabrielle Duport , Yvan Rahbé , Pedro da Silva et al.
18. Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, Apr 2010, Lyon, France. 1 p., 2010
Poster de conférence hal-02811608 v1

Analyse génomique de la fonction de transport dans le système symbiotique du puceron du pois Acyrthosiphon pisum

Nicolas Parisot , Karen Gaget , Stefano Colella , Andréane Rabatel , Federica Calevro et al.
16. Colloque de Biologie de l’Insecte, Oct 2010, Lyon, France. , 126 p., 2010, CBI-2010 : 16ème Colloque de Biologie de l’Insecte, Lyon, 18 au 20 octobre 2010
Poster de conférence hal-02755294 v1

Réponse tissu-spécifique au traitement par RNAi chez le puceron du pois : une étude cinétique à l’échelle de l’individu

Panagiotis Sapountzis , Marie-Gabrielle Duport , Karen Gaget , Severine Balmand , Stéphanie Jaubert-Possamai et al.
16. Colloque de Biologie de l’Insecte, Oct 2010, Lyon, France. , 126 p., 2010, CB-2010 : 16ème Colloque de Biologie de l'Insecte, Lyon, 18 au 20 octobre 2010
Poster de conférence hal-02755004 v1

Using the “CycADS” annotation management system to develop a BioCyc metabolic network database for sequenced arthropods genomes: first steps towards “ArthropodsCyc”

Augusto Vellozo , Patrice Baa-Puyoulet , Jaime Huerta-Cepas , Gérard Febvay , Federica Calevro et al.
4. Annual Arthropod Genomics Symposium on “Arthropod Genomics: New Approaches and Outcomes”, Jun 2010, Kansas City, United States. 45 p., 2010, Fourth Annual Arthropod Genomics Symposium
Poster de conférence hal-02753908 v1

Chromosome organisation in Buchnera: a dynamic active structure involved in gene expression regulation

Lilia Brinza , Federica Calevro , J. Vinuelas , Christian Gautier , Hubert Charles
Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), Jun 2009, Nantes, France
Poster de conférence hal-03506644 v1

Annotation of metabolism genes : towads the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses

Stefano Colella , Augusto Vellozo , L. Cottret , Gérard Febvay , Federica Calevro et al.
4. Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 1", 2008, Princetown, juillet 2008, United States. 2008
Poster de conférence hal-02818508 v1

Genomic DNA: an attractive candidate for microarray data normalization

J. Vinuelas , Federica Calevro , J. Bernillon , Yvan Rahbé , G. Febvay et al.
Integrative Post-Genomics - IPG'05, 2005, Lyon (France), novembre-décembre 2005, France. , pp.1-1, 2005
Poster de conférence hal-00391523 v1

A preliminary methodological approach to study the transcriptome of Buchnera, the intracellular symbiotic bacteria of aphids

Federica Calevro , Hubert Charles , Nancie Reymond , Vincent Dugas , J.P. P Cloarec et al.
Journées de Post-Génomique de la Doua - JPGD'03, May 2003, Villeurbanne, France
Poster de conférence hal-03506498 v1

Bioinformatique du transcriptome de Buchnera, symbiote intracellulaire des pucerons

Hubert Charles , Federica Calevro , Nancie Reymond , Frederique Laforest , Anne Tchounikine et al.
Rencontres 2003 des Microbiologistes de l'INRA, May 2003, Dourdan, France
Poster de conférence hal-03506503 v1

Analyse du transcriptome de Buchnera: développement d'une première puce à ADN

Federica Calevro , Hubert Charles , Nancie Reymond , J.P. P Cloarec , Yvan Rahbé et al.
Journées de Post-Génomique de la Doua - JPGD'02, Mar 2002, Villeurbanne, France
Poster de conférence hal-03506459 v1

Isolation of Insect as a Platform for Transcriptomic Analyses

Mélanie Ribeiro Lopes , Pierre Simonet , Gabrielle Duport , Karen Gaget , Severine Balmand et al.
RNA abundance analysis, 2170, pp.185-198, 2021, ⟨10.1007/978-1-0716-0743-5_13⟩
Chapitre d'ouvrage hal-03052268 v1

Genetic Diversity of the Apoptotic Pathway in Insects

Mélanie Ribeiro Lopes , Nicolas Parisot , Patrick Callaerts , Federica Calevro
Evolution, Origin of Life, Concepts ans Methods, Springer International Publishing, pp.253-285, 2019, 978-3-030-30363-1. ⟨10.1007/978-3-030-30363-1_13⟩
Chapitre d'ouvrage hal-02304321 v1

Functional and evolutionary genomics in aphids.

Denis Tagu , Federica Calevro , Stefano Colella , Toni Gabaldon , Akiko Sugio
Biology and Ecology of Aphids, 3, CRC Press, 2016, 978-1-4822-3678-1
Chapitre d'ouvrage hal-02800093 v1
Image document

Définition des séquences sonde pour la PCR et pour les puces à ADN

Hubert Charles , Federica Calevro
Bioinformatique : Principes d’utilisation des outils, Editions Quae, 272 p., 2010, Savoir Faire (Quae), 978-2-7592-0870-8 978-2-7592-0870-8
Chapitre d'ouvrage hal-02813659 v1

ArtSymbioCyc, a metabolic network database collection dedicated to arthropod symbioses: a case study, the tripartite cooperation in Sipha maydis

Patrice Baa-Puyoulet , Léo Gerlin , Nicolas Parisot , Sergio Peignier , François Renoz et al.
2025
Pré-publication, Document de travail hal-04987746 v1

Cadmium tolerance is associated with metallothionein gene expression plasticity in Gammarus fossarum field populations

Auréline Lalouette , Arnaud Chaumot , Louveline Lepeule , Karen Gaget , Nicolas Delorme et al.
2024
Pré-publication, Document de travail hal-04792699 v1
Image document

Comprehensive annotation of transcription factors, chromatin-associated factors, and basal transcription machinery in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum

Nicolas Parisot , Mélanie Ribeiro Lopes , Sergio Peignier , Patrice Baa-Puyoulet , Hubert Charles et al.
2024
Pré-publication, Document de travail hal-04792881 v1

Strong impact of orally administered BCR4 defensin on aphid survival, embryo development and symbiotic cells in three Acyrthosiphon pisum parthenogenetic lines

Hugo Terrasson , Karen Gaget , Garance Lapetoule , Isabelle Rahioui , François Renoz et al.
2025
Pré-publication, Document de travail hal-04987737 v1

The transposable element-rich genome of the cereal pest Sitophilus oryzae

Nicolas Parisot , Carlos Vargas-Chavez , Clément Goubert , Patrice Baa-Puyoulet , Séverine Balmand et al.
2024
Pré-publication, Document de travail hal-04706472 v1
Image document

GReNaDIne: Data-Driven Approaches to Infer Gene Regulatory Networks in Python

Sergio Peignier , Pauline Schmitt , Federica Calevro
2020
Pré-publication, Document de travail hal-02863880 v1