Frédéric Dalle

PU PH Parasitologie - Mycologie CHU DIJON BOURGOGNE UNIVERSITE BOURGOGNE EUROPE

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Université Bourgogne Europe (UBE)
Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)
Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] (PAM)
Aliment, Fermentation, Interaction, Microbiote (AFIM)

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Domaines de recherche

Microbiologie et Parasitologie

Publications

	Clinical Manifestations of Emerging Trichosporon spp. Infections, France Marie Desnos-Ollivier , Alexandre Alanio , Maud Gits-Muselli , Karine Boukris-Sitbon , Agathe Bertho et al. Emerging Infectious Diseases, 2026, 32 (1), pp.93-102. ⟨10.3201/eid3201.250504⟩ Article dans une revue hal-05491298v1
	Assessing laboratory capacity for diagnosis of fungal infections in France: A multicentre survey within the SINFONI network Florent Morio , Alexandre Alanio , Karine Boukris-Sitbon , Dea Garcia-Hermoso , Eric Dannaoui et al. Medical Mycology, 2026, 64 (5), pp.myag050. ⟨10.1093/mmy/myag050⟩ Article dans une revue hal-05643798v1
	Immunological fitness of echinocandin-resistant Nakaseomyces glabratus (former Candida glabrata ): The impact on the management of candidemia Louise Basmaciyan , Nidia Alvarez-Rueda , Delphine Aldebert , Hafsa Sahnouni , Cecile Garnaud et al. Virulence, 2026, 17 (1), pp.2665015. ⟨10.1080/21505594.2026.2665015⟩ Article dans une revue hal-05641236v1
	A decade of ocular fungal infections due to <i>Penicillium</i> -like fungi in France (2012 to 2021) Lorra Monpierre , Eric Dannaoui , Olivier Lortholary , Karine Boukris-Sitbon , Lilia Merabet et al. Medical Mycology, 2026, 64 (4), pp.myag025. ⟨10.1093/mmy/myag025⟩ Article dans une revue hal-05582841v1
	Elevating fungal care: bridging Brazil’s healthcare practices to global standards Jon Salmanton-García , Diego Falci , Oliver Cornely , Alessandro Pasqualotto , Afonso Barth et al. Microbiology Spectrum, 2025, 13 (4), ⟨10.1128/spectrum.02112-24⟩ Article dans une revue hal-05633119v1
	Performance of 30 protocol combinations for the detection of Cryptosporidium parvum in stool samples Eloïse Bailly , Chloé Baranton , Stéphane Valot , Anne Vincent , Hervé Begue et al. Journal of Microbiology, Immunology and Infection, 2025, 58 (3), pp.368-375. ⟨10.1016/j.jmii.2025.01.003⟩ Article dans une revue hal-05172289v1
	Candida albicans releases a peptide from the Rbt1 protein to promote its invasion into the gut epithelium Hervé Bègue , Amandine Ducreux , Tracy Paradis , Alicia Loiselet , Thierry Mourer et al. Gut microbes, 2025, 17 (1), pp.2573038. ⟨10.1080/19490976.2025.2573038⟩ Article dans une revue pasteur-05441593v1
	Use of the Mucorales qPCR on blood to screen high-risk hematology patients is associated with better survival Anne-Pauline Bellanger , Houssein Gbaguidi-Haore , Ana Berceanu , Laura Gouzien , Chaima El Machhour et al. Medical Mycology, 2024, 62 (4), ⟨10.1093/mmy/myae030⟩ Article dans une revue hal-05633070v1
	Risk of fungal exposure in the homes of patients with hematologic malignancies Marc Sautour , Adrien Guilloteau , Stéphane Valot , Louise Basmaciyan , Eloïse Bailly et al. Journal of Medical Mycology = Journal de Mycologie Médicale, 2024, 34 (3), pp.101492. ⟨10.1016/j.mycmed.2024.101492⟩ Article dans une revue hal-05633092v1
	Label-Free Optical Transmission Tomography for Direct Mycological Examination and Monitoring of Intracellular Dynamics Eliott Teston , Marc Sautour , Léa Boulnois , Nicolas Augey , Abdellah Dighab et al. Journal of Fungi, 2024, 10 (11), pp.741. ⟨10.3390/jof10110741⟩ Article dans une revue hal-05178474v1
	Current knowledge and practice of Candida auris screening in France: A nationwide survey from the French Society of Medical Mycology (SFMM) Juliette Guitard , Anne-Pauline Bellanger , Joséphine Dorin , Sophie Cassaing , Agathe Capitaine et al. Journal of Medical Mycology = Journal de Mycologie Médicale, 2024, 34 (3), pp.101490. ⟨10.1016/j.mycmed.2024.101490⟩ Article dans une revue hal-04675511v1
	Risk of fungal exposure in the homes of patients with hematologic malignancies Marc Sautour , Adrien Guilloteau , Stéphane Valot , Louise Basmaciyan , Eloise Bailly et al. Journal of Medical Mycology = Journal de Mycologie Médicale, 2024, 34 (3), pp.101492. ⟨10.1016/j.mycmed.2024.101492⟩ Article dans une revue hal-05324991v1
	Invasive fungal diseases in patients with autoimmune diseases: a case series from the French RESSIF network Simon Galmiche , Benjamin Thoreau , Stéphane Bretagne , Alexandre Alanio , André Paugam et al. RMD Open, 2023, 9 (3), pp.e003281. ⟨10.1136/rmdopen-2023-003281⟩ Article dans une revue hal-04205646v1
	Intestinal Candida albicans overgrowth in IgA deficiency Alicia Moreno-Sabater , Delphine Sterlin , Lejla Imamovic , Fabienne Bon , Anne-Cecile Normand et al. Journal of Allergy and Clinical Immunology, In press, ⟨10.1016/j.jaci.2023.03.033⟩ Article dans une revue hal-04099050v1
	Summer diarrhea in children: a monocentric French epidemiological observational study Camille Mallier , Elisa Creuzet , Céline Lambert , Julien Delmas , Audrey Mirand et al. Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.15078. ⟨10.1038/s41598-023-42098-x⟩ Article dans une revue hal-04990345v1
	Gradient concentration strip–specific epidemiological cut-off values of antifungal drugs in various yeast species and five prevalent Aspergillus species complexes Victor Mercier , Valérie Letscher-Bru , Marie-Elisabeth Bougnoux , Laurence Delhaes , Françoise Botterel et al. Clinical Microbiology and Infection, 2023, 29 (5), pp.652.e9-652.e15. ⟨10.1016/j.cmi.2022.11.030⟩ Article dans une revue hal-03994435v2
	From modern-day parasitology to paleoparasitology: the elusive past record and evolution of Cryptosporidium Kévin Roche , Frédéric Dalle , Nicolas Capelli , Romain Borne , Isabelle Jouffroy-Bapicot et al. Frontiers in Microbiology, 2023, 14, ⟨10.3389/fmicb.2023.1249884⟩ Article dans une revue hal-05633133v1
	Aspergillus colonisation in severe community-acquired pneumonia: not just a mere colonisation Valentin Pineau , Adrien Guilloteau , Christine Binquet , Jean-Pierre Quenot , Belaid Bouhemad et al. ERJ Open Research, 2023, 9 (5), pp.00221-2023. ⟨10.1183/23120541.00221-2023⟩ Article dans une revue hal-05628659v1
	Dynamic full-field optical coherence tomography for live-cell imaging and growth-phase monitoring in Aspergillus fumigatus Thomas Maldiney , Dea Garcia-Hermoso , Emilie Sitterlé , Jean-Marie Chassot , Olivier Thouvenin et al. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 2023, 13, pp.1183340. ⟨10.3389/fcimb.2023.1183340⟩ Article dans une revue pasteur-04173133v1
	Endotracheal tube biofilm in critically ill patients during the COVID-19 pandemic : description of an underestimated microbiological compartment Thomas Maldiney , Valentin Pineau , Catherine Neuwirth , Linda Ouzen , Isabelle Eberl et al. Scientific Reports, 2022, 12 (1), pp.22389. ⟨10.1038/s41598-022-26560-w⟩ Article dans une revue hal-05178578v1
	Membrane protective role of autophagic machinery during infection of epithelial cells by Candida albicans Pierre Lapaquette , Amandine Ducreux , Louise Basmaciyan , Tracy Paradis , Fabienne Bon et al. Gut microbes, 2022, 14 (1), pp.2004798. ⟨10.1080/19490976.2021.2004798⟩ Article dans une revue hal-03553809v1
	Evaluation of the relevance of use of the BD-BACTEC®MycosisIC/F, BD-BACTEC®PlusAerobic/F, BD-BACTEC®Lytic/10 anaerobic/F and BD-BACTEC®PedsPlus/F culture bottle system for fungemia detection: A 4-year retrospective study at the Dijon university hospital, France Arnaud Magallon , Louise Basmaciyan , Angélique Chapuis , Stéphane Valot , Marc Sautour et al. Journal of Medical Mycology = Journal de Mycologie Médicale, 2022, 32 (4), pp.101295. ⟨10.1016/j.mycmed.2022.101295⟩ Article dans une revue hal-05325016v1
	Dynamic full-field optical coherence tomography as complementary tool in fungal diagnostics Thomas Maldiney , Jean-Marie Chassot , Claude Boccara , Mathieu Blot , Lionel Piroth et al. Journal of Medical Mycology = Journal de Mycologie Médicale, 2022, 32 (4), pp.101303. ⟨10.1016/j.mycmed.2022.101303⟩ Article dans une revue pasteur-04173114v1
	Evaluation of the Bio-Evolution Microsporidia generic and typing real-time PCR assays for the diagnosis of intestinal microsporidiosis Maxime Moniot , Céline Nourrisson , Virginie Bonnin , Céline Damiani , Nicolas Argy et al. Parasite, 2022, 29 (55), pp.1-8. ⟨10.1051/parasite/2022055⟩ Article dans une revue hal-04313096v1
	Cryptosporidiosis outbreak in Amazonia, French Guiana, 2018 Estelle Menu , Emilie Mosnier , Arnaud Cotrel , Loic Favennec , Romy Razakandrainibe et al. PLoS Neglected Tropical Diseases, 2022, 16 (1), pp.e0010068. ⟨10.1371/journal.pntd.0010068⟩ Article dans une revue hal-03678998v1
	A summary of cryptosporidiosis outbreaks reported in France and overseas departments, 2017–2020 Damien Costa , Romy Razakandrainibe , Louise Basmaciyan , Jérôme Raibaut , Pascal Delaunay et al. Food and Waterborne Parasitology, 2022, 27, pp.e00160. ⟨10.1016/j.fawpar.2022.e00160⟩ Article dans une revue hal-03859494v1
	Evaluation of Next-Generation Sequencing Applied to Cryptosporidium parvum and Cryptosporidium hominis Epidemiological Study Eloïse Bailly , Stéphane Valot , Anne Vincent , Yannis Duffourd , Nadège Grangier et al. Pathogens, 2022, 11 (8), pp.938. ⟨10.3390/pathogens11080938⟩ Article dans une revue hal-05620370v1
	Evaluation of serum Mucorales PCR for the diagnosis of Mucormycoses: The MODIMUCOR prospective trial Laurence Millon , Denis Caillot , Ana Berceanu , Stéphane Bretagne , Fanny Lanternier et al. Clinical Infectious Diseases, 2022, 75 (5), pp.777-785. ⟨10.1093/cid/ciab1066⟩ Article dans une revue hal-03528144v1
	Selecting a multiplex PCR panel for accurate molecular diagnosis of intestinal protists: a comparative study of Allplex ® (Seegene ® ), G-DiaParaTrio (Diagenode ® ), and RIDA ® GENE (R-Biopharm ® ) assays and microscopic examination Nicolas Argy , Céline Nourrisson , Ahmed Aboubacar , Philippe Poirier , Stéphane Valot et al. Parasite, 2022, 29, pp.5. ⟨10.1051/parasite/2022003⟩ Article dans une revue hal-03572136v1
	Active Surveillance Program to Increase Awareness on Invasive Fungal Diseases: the French RESSIF Network (2012 to 2018) Stéphane Bretagne , Karine Sitbon , Marie Desnos-Ollivier , Dea Garcia-Hermoso , Valérie Letscher-Bru et al. mBio, 2022, 13 (3), pp.e0092022. ⟨10.1128/mbio.00920-22⟩ Article dans une revue hal-03658122v1
	Disseminated Cryptosporidium infection in an infant with CD40L deficiency Fleur Dupuy , Stéphane Valot , Frédéric Dalle , Arthur Sterin , Coralie L’ollivier IDCases, 2021, 24, pp.e01115. ⟨10.1016/j.idcr.2021.e01115⟩ Article dans une revue hal-05633233v1
	Comparative Study of Eleven Mechanical Pretreatment Protocols for Cryptosporidium parvum DNA Extraction from Stool Samples Laure Claudel , Nicolas Valeix , Louise Basmaciyan , Bruno Pereira , Damien Costa et al. Microorganisms, 2021, 9 (2), pp.297. ⟨10.3390/microorganisms9020297⟩ Article dans une revue hal-05633143v1
	Tight Junctions as a Key for Pathogens Invasion in Intestinal Epithelial Cells Tracy Paradis , Hervé Bègue , Louise Basmaciyan , Frédéric Dalle , Fabienne Bon International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (5), pp.2506. ⟨10.3390/ijms22052506⟩ Article dans une revue hal-05633216v1
	Detection and survival of Candida albicans in soils Marc Sautour , Jean‐paul Lemaître , Lionel Ranjard , Caroline Truntzer , Louise Basmaciyan et al. Environmental DNA, 2021, 3 (6), pp.1093-1101. ⟨10.1002/edn3.230⟩ Article dans une revue hal-03631995v1
	Assessment of a Multiplex PCR for the Simultaneous Diagnosis of Intestinal Cryptosporidiosis and Microsporidiosis Maxime Moniot , Céline Nourrisson , Charlotte Faure , Frédéric Delbac , Loïc Favennec et al. Journal of Molecular Diagnostics, 2021, 23 (4), pp.417-423. ⟨10.1016/j.jmoldx.2020.12.005⟩ Article dans une revue hal-05633222v1
	Multicenter Evaluation of an ELISA for the Detection of Cryptosporidium spp. Antigen in Clinical Human Stool Samples Romy Razakandrainibe , Célia Mérat , Nathalie Kapel , Marc Sautour , Karine Guyot et al. Microorganisms, 2021, 9 (2), pp.209. ⟨10.3390/microorganisms9020209⟩ Article dans une revue hal-05633138v1
	Comparative Performance of Eight PCR Methods to Detect Cryptosporidium Species Damien Costa , Louise Soulieux , Romy Razakandrainibe , Louise Basmaciyan , Gilles Gargala et al. Pathogens, 2021, 10 (6), pp.647. ⟨10.3390/pathogens10060647⟩ Article dans une revue hal-05633207v1
	Detection and survival of Candida albicans in soils Marc Sautour , Jean‐paul Lemaître , Lionel Ranjard , Caroline Truntzer , Louise Basmaciyan et al. Environmental DNA, 2021, 3 (6), pp.1093-1101. ⟨10.1002/edn3.230⟩ Article dans une revue hal-05633227v1
	Characteristics and outcome according to underlying disease in non-AIDS patients with acute respiratory failure due to Pneumocystis pneumonia Gaston Burghi , Lucie Biard , Antoine Roux , Sandrine Valade , Florence Robert-Gangneux et al. European Journal of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 2021, 40 (6), pp.1191-1198. ⟨10.1007/s10096-020-04118-w⟩ Article dans une revue hal-03131261v1
	Pneumocystis Infection Outbreaks in Organ Transplantation Units in France: A Nation-Wide Survey Solène Le Gal , Dominique Toubas , Anne Totet , Frédéric Dalle , Ahmed Abou Bacar et al. Clinical Infectious Diseases, 2020, 70 (10), pp.2216-2220. ⟨10.1093/cid/ciz901⟩ Article dans une revue hal-02543278v1
	Epigastric cutaneous discharge: think amoebiasis Y. Merad , L. Behague , S. Valot , L. Basmaciyan , Frédéric Dalle et al. British Journal of Dermatology, 2020, 183 (5), ⟨10.1111/bjd.19246⟩ Article dans une revue hal-05633254v1
	Epidemiology of Cryptosporidiosis in France from 2017 to 2019 Damien Costa , Romy Razakandrainibe , Stéphane Valot , Margot Vannier , Marc Sautour et al. Microorganisms, 2020, 8 (9), pp.1358. ⟨10.3390/microorganisms8091358⟩ Article dans une revue hal-05633243v1
	Cryptosporidiosis after treatment with fingolimod: a case report and pharmacovigilance review M. Martinot , A. Abou-Bacar , M. Lamothe , M. Alt Tebacher , M. Mohseni Zadeh et al. BMC Infectious Diseases, 2020, 20 (1), pp.257. ⟨10.1186/s12879-020-04988-7⟩ Article dans une revue hal-05633249v1
	Assessment of the first commercial multiplex PCR kit (ParaGENIE Crypto-Micro Real-Time PCR) for the detection of Cryptosporidium spp., Enterocytozoon bieneusi, and Encephalitozoon intestinalis from fecal samples Florent Morio , Philippe Poirier , Yohann Le Govic , Adrien Laude , Stephane Valot et al. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, 2019, 95 (1), pp.34-37. ⟨10.1016/j.diagmicrobio.2019.04.004⟩ Article dans une revue istex hal-02483139v1
	Rapid diagnostic tests relying on antigen detection from stool as an efficient point of care testing strategy for giardiasis and cryptosporidiosis? Evaluation of a new immunochromatographic duplex assay Adeline Goudal , Adrien Laude , Stéphane Valot , Guillaume Desoubeaux , Nicolas Argy et al. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, 2019, 93 (1), pp.33-36. ⟨10.1016/j.diagmicrobio.2018.07.012⟩ Article dans une revue istex hal-01987699v1
	“ Candida Albicans Interactions With The Host: Crossing The Intestinal Epithelial Barrier” Louise Basmaciyan , Fabienne Bon , Tracy Paradis , Pierre Lapaquette , Frédéric Dalle Tissue Barriers , 2019, 7 (2), pp.1612661. ⟨10.1080/21688370.2019.1612661⟩ Article dans une revue hal-02172078v1
	Influenza infection and bacteremic pneumococcal pneumonia M. Blot , R. Bruyère , P. Chavanet , Frédéric Dalle , L. Piroth et al. Médecine et Maladies Infectieuses Formation, 2019, 49 (6), pp.483-484. ⟨10.1016/j.medmal.2019.03.014⟩ Article dans une revue istex hal-05633886v1
	Systematic gene overexpression in Candida albicans identifies a regulator of early adaptation to the mammalian gut. Sadri Znaidi , Lasse Van Wijlick , Arturo Hernández-Cervantes , Natacha Sertour , Jean-Luc Desseyn et al. Cellular Microbiology, 2018, 20 (11), pp.e12890. ⟨10.1111/cmi.12890⟩ Article dans une revue hal-01873758v1
	Human cryptosporidiosis in immunodeficient patients in France (2015–2017) Damien Costa , Romy Razakandrainibe , Marc Sautour , Stéphane Valot , Louise Basmaciyan et al. Experimental Parasitology, 2018, 192, pp.108-112. ⟨10.1016/j.exppara.2018.08.001⟩ Article dans une revue istex hal-02902544v1
	Evaluation of five automated and one manual methods for Toxoplasma and human DNA extraction from artificially spiked amniotic fluid Hélène Yera , Louise Ménégaut , Marie-Pierre Brenier-Pinchart , Feriel Touafek , Patrick Bastien et al. Clinical Microbiology and Infection, 2018, 24 (10), pp.1100.e7-1100.e11. ⟨10.1016/j.cmi.2018.01.014⟩ Article dans une revue hal-01706716v1
	First Case of Human Primary Vertebral Cystic Echinococcosis Due to Echinococcus Ortleppi Louise Basmaciyan , Bénédicte Burlet , Selim Ramla , Mathieu Blot , Sophie Mahy et al. Journal of Clinical Medicine Research, 2018, 7 (11), pp.443. ⟨10.3390/jcm7110443⟩ Article dans une revue hal-01943639v1
	Cryptosporidiosis Outbreak in Immunocompetent Children from a Remote Area of French Guiana Emilie Mosnier , Noémie Martin , Romy Razakandrainibe , Frédéric Dalle , Guillaume Roux et al. American Journal of Tropical Medicine and Hygiene, 2018, 98 (6), pp.1727 - 1732. ⟨10.4269/ajtmh.17-0609⟩ Article dans une revue inserm-01811281v1
	Oestrus ovis external ophtalmomyiasis: a case report in Burgundy France Louise Basmaciyan , Pierre Henry Gabrielle , Stéphane Valot , Marc Sautour , Jean-Christophe Buisson et al. BMC Ophthalmology, 2018, 18 (1), pp.335. ⟨10.1186/s12886-018-1003-z⟩ Article dans une revue (article de synthèse) hal-02628316v1
	Myelitis and tenosynovitis attributed to toxocariasis Amélie Bohm , Arnaud Salmon-Rousseau , Arnaud Gentil , Frédéric Dalle Joint Bone Spine, In press, ⟨10.1016/j.jbspin.2018.09.014⟩ Article dans une revue istex hal-01916592v1
	Prenatal therapy with pyrimethamine + sulfadiazine vs spiramycin to reduce placental transmission of toxoplasmosis: a multicenter, randomized trial Laurent Mandelbrot , Francois Kieffer , Rémi Sitta , Hélène Laurichesse-Delmas , Norbert Winer et al. American Journal of Obstetrics and Gynecology, 2018, 219 (4), pp.386.e1-386.e9. ⟨10.1016/j.ajog.2018.05.031⟩ Article dans une revue istex hal-01987714v1
	First case of proven invasive pulmonary infection due to Trichoderma longibrachiatum in a neutropenic patient with acute leukemia Marc Sautour , M.-L. Chretien , S. Valot , I. Lafon , Louise Basmaciyan et al. Journal of Medical Mycology = Journal de Mycologie Médicale, 2018, 28 (4), pp.659-662. ⟨10.1016/j.mycmed.2018.10.001⟩ Article dans une revue istex hal-01961727v1
	Circulating cell-free DNA in patients with alveolar echinococcosis Alice Baraquin , Eric Hervouet , Carine Richou , Pierre Flori , Paul Peixoto et al. Molecular and Biochemical Parasitology, 2018, 222, pp.14 - 20. ⟨10.1016/j.molbiopara.2018.04.004⟩ Article dans une revue istex hal-01863922v1
	La présence du signe du halo inversé (SHI) au scanner thoracique est étroitement associée à la présence d’ADN circulant de mucorales dans le sérum de patients présentant des signes d’infections fongiques invasives S. Valot , C. Legouge , L. Basmaciyan , Marc Sautour , C. Favennec et al. Journal of Medical Mycology = Journal de Mycologie Médicale, 2016, 26 (2), pp.e17. ⟨10.1016/j.mycmed.2016.04.039⟩ Article dans une revue istex hal-05648186v1
	Is It Time to Include CT “Reverse Halo Sign” and qPCR Targeting Mucorales in Serum to EORTC-MSG Criteria for the Diagnosis of Pulmonary Mucormycosis in Leukemia Patients ? Denis Caillot , Stéphane Valot , Ingrid Lafon , Louise Basmaciyan , Marie Lorraine Chretien et al. Open Forum Infectious Diseases, 2016, 3 (4), ⟨10.1093/ofid/ofw190⟩ Article dans une revue hal-01484030v1
	Airborne Aspergillus contamination during hospital construction works: Efficacy of protective measures Isabelle Fournel , Marc Sautour , Ingrid Lafon , Nathalie Sixt , Coralie L'Ollivier et al. American Journal of Infection Control, 2010, 38 (3), pp.189-194. ⟨10.1016/j.ajic.2009.07.011⟩ Article dans une revue istex hal-05325764v1

	The pore-forming toxin Candidalysin dampens the autophagy-related plasma membrane stress response during Candida albicans invasion of epithelial cells. Pierre Lapaquette , Amandine Ducreux , Louise Basmaciyan , Fabienne Bon , Pascale Winckler et al. Symposium HARMI, Sep 2025, Dole, France Communication dans un congrès hal-05515819v1
	Contamination des circuits d’alimentation en eau par Fusarium. Marc Sautour , Edel-Hermann V , Steinberg C , Sixt N , Aho S et al. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., Nov 2014, Paris, France Communication dans un congrès hal-05289269v1
	Les cellules M: une porte d’entrée pour le franchissement de la barrière intestinale par Candida albicans. Albac S , Lopez C , Schmitz A , D’enfert C , Marc Sautour et al. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., Nov 2014, Paris, France Communication dans un congrès hal-05289260v1
	Spores fongiques dispersées dans l’air à partir de réseaux hydriques: cas de Fusarium Marc Sautour , Sixt N , Aho S , Hartemann H , Steinberg C et al. 2ème rencontre d’hygiène hospitalière, Nov 2013, Dijon, France Communication dans un congrès hal-05291383v1
	Adaptation inattendue de populations de Fusarium au milieu aquatique urbain des conduites d’eau de bâtiments hospitaliers à Dijon et Nancy. Steinberg C , Laurent J , Edel-Hermann V , Barbezant M , Gautheron N et al. 5ème colloque de l’Association Francophone d'Ecologie Microbienne, Oct 2013, Clermont Ferrant, France Communication dans un congrès hal-05291566v1

	Cryptosporidium, un pathogène HPE (Haut Potentiel Epidémique) : Retour sur les épidémies investiguées par le CNR des Cryptosporidioses, Microsporidies et Autres Protozooses digestives depuis 2018. Louise Basmaciyan , Bailly E , Marc Sautour , Costa D , Favennec L et al. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., Jun 2025, Amiens, France Poster de conférence hal-05288657v1
	Infection pulmonaire invasive à Trichoderma longibrachiatum, à propos d’un cas. Gonssaud B , Verrier T , Marc Sautour , Valot S , Lafon I et al. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., May 2025, Bordeaux, France Poster de conférence hal-05289032v1
	Ne sous-estimez pas les amoeboses ! Louise Basmaciyan , Bailly E , Marc Sautour , Valot S , Frédéric Dalle Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., Jun 2025, Amiens, France Poster de conférence hal-05288660v1
	Comment le NGS nous aide dans la compréhension de l’´epidémiologie de Cryptosporidium sp. Bailly E , Valot S , Marc Sautour , Louise Basmaciyan , Frédéric Dalle Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., Jun 2025, Amiens, France Poster de conférence hal-05288666v1
	The pore-forming toxin Candidalysin dampens the autophagy-related plasma membrane stress response during Candida albicans invasion of epithelial cells Pierre Lapaquette , Amandine Ducreux , Louise Basmaciyan , Fabienne Bon , Pascale Winckler et al. CFATG12, 12th Scientific days on Autophagy, Mar 2025, Dijon, France Poster de conférence hal-05515811v1
	Risque environnementale fongique au domicile de patients atteints d’hémopathies malignes Marc Sautour , A. Guilloteau , S. Valot , Louise Basmaciyan , E. Bailly et al. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., May 2023, Marrakech, Morocco Poster de conférence hal-05288673v1
	Prospective evaluation of the AllplexTM assays for protozoa and helminths detection in stool samples. Queune J , Valot S , Béclère C , Bailly E , Costa D et al. SFP-SFMM, Oct 2021, Lyon, France Poster de conférence hal-05288695v1
	Identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse MALDI TOF : influence de l’âge des colonies sur les résultats d’identification. A Brustel , Marc Sautour , Valot S , Louise Basmaciyan , Normand Ac et al. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., May 2019, Tours, France Poster de conférence hal-05288867v1
	Etude du dosage de la mannose Binding Lectin (MBL) comme marqueur prédictif de la survenue d’infection fongique invasive au cours d’aplasies chimio-induites chez les patients atteints de leucémie aiguë. Louise Basmaciyan , Figaro Y , Lafon I , Valot S , Chretien Ml et al. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., May 2018, Nice, France Poster de conférence hal-05288919v1
	Evaluation des Kits simplex VIASURE et multiplex VIASURE , FTD Stool parasites et G-DiaPara pour la détection de Cryptosporidium sp., Giardia intestinalis et Entamoeba histolytica dans des échantillons de selles. Louise Basmaciyan , François A , Vincent A , Valot S , Marc Sautour et al. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., May 2018, Nice, France Poster de conférence hal-05288908v1
	Evaluation de la performance des hémocultures BD BACTECTM mycosis IC/F, BD BACTECTM Plus Aerobic/F, BD BACTECTM Lytic/10 anaerobic/F et BD BACTECTM Peds Plus/F dans la détection des fongémies: étude rétrospective de 4 ans. Magallon A , Louise Basmaciyan , Valot S , C Goulard de Curraize , Marc Sautour et al. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., May 2018, Nice, France Poster de conférence hal-05288963v1
	Ophtalmomyiase externe humaine : A propos d’un cas en Bourgogne. Comte A , Louise Basmaciyan , Valot S , Marc Sautour , Buisson Jc et al. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., Mar 2017, Toulouse, France Poster de conférence hal-05289016v1
	Profil épidémiologique et mycologique des dermatophytoses au CHU de Dijon (2007–2016) Tainturier R , Marc Sautour , Valot S , Louise Basmaciyan , Bonnin A et al. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., Mar 2017, Toulouse, France Poster de conférence hal-05288998v1
	Mucormycose osseuse à Saksenaea vasiformis. Barry F , Marc Sautour , Valot S , Louise Basmaciyan , Maréchal E et al. 4ème journées franco-maghrébines de Parasitologie-Mycologie., Oct 2017, Alger, Algeria Poster de conférence hal-05288974v1
	Evaluation du kit de PCR en temps réel MycoGENIE® Pneumocystis jirovecii pour le diagnostic moléculaire de la pneumocystose. Marty S , Valot S , Lamy A , Louise Basmaciyan , Marc Sautour et al. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., Mar 2017, Toulouse, France Poster de conférence hal-05289007v1
	Ophtalmomyiase externe humaine : A propos d’un cas en Bourgogne. Comte A , Louise Basmaciyan , Valot S , Marc Sautour , Buisson Jc et al. Congrès de la Société Française de Parasitologie., Mar 2017, Toulouse, France Poster de conférence hal-05288983v1
	Identification clinique par spectrométrie de masse MALDI-TOF des champignons filamenteux : construction de banques de données pour les dermatophytes et les Fusarium. G Lucchi , Rageot D , Sorez M , Marc Sautour , Frédéric Dalle Congrès de la Société française de Spectrométrie de Masse., Sep 2015, Ajaccio, France Poster de conférence hal-05289022v1
	Candida albicans interaction with M cells in an in vitro model of the human intestinal Follicle Associated Epithelium (FAE). Albac S , Lopez C , Marc Sautour , C D’enfert , Frédéric Dalle Fifth FEBS Advanced Lecture Course on Human Fungal Pathogens: Molecular Mechanisms of Host-Pathogen Interactions and Virulence., May 2013, La Colle sur Loup, France Poster de conférence hal-05289052v1
	Résistance au chlore d’isolats de Fusarium oxysporum provenant du réseau hydrique de divers sites hospitaliers. Marc Sautour , Steinberg C , Laurent L , Edel-Hermann V , Barbezant M et al. Journées franco-maghrébines de Parasitologie-Mycologie: les parasites du bassin méditerranéen., Oct 2013, Rabat, Morocco Poster de conférence hal-05289044v1
	Genetic and phenotypic characterization of commensal and clinical Candida albicans isolates reveals heterogenous distribution of adherence and invasiveness properties. Vincent F , Marc Sautour , C L’ollivier , Truntzer C , Alain Bonnin et al. 11th ASM Conference on Candida and Candidiasis., Mar 2012, San Francisco, United States Poster de conférence hal-05289067v1
	Development of a High Throughput Cytotoxicity Assay of Caco-2 Cells using a Candida albicans Homozygous Deletion Library. Vincent F , Znaidi S , Marc Sautour , Truntzer C , C D’enfert et al. ISHAM, Jun 2012, Berlin, Germany Poster de conférence hal-05289061v1
	Detection and survival of Candida albicans in soils. Marc Sautour , J.P. Lemaître , Garmyn D , A Hartmann , Jandot E et al. European Student Conference on Microbial Communication., Sep 2010, Jena, Germany Poster de conférence hal-05289075v1
	Hydro-contamination fongique par Fusarium spp. en milieu hospitalier pendant une période de construction. Marc Sautour , Steinberg C , Sixt N , Edel-Hermann V , Laurent J et al. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., Jun 2009, Poitiers, France Poster de conférence hal-05289090v1
	Mycose exotique à Penicillium marneffei : à propos d’un cas. E Scalici , Jeudy G , Collet E , C L'Ollivier , Frédéric Dalle et al. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., Jun 2009, Poitiers, France Poster de conférence hal-05289081v1
	A prospective survey of air and surfaces fungal contamination in a medical mycology laboratory at a tertiary care university hospital. Marc Sautour , Frédéric Dalle , N. Sixt , C. Olivieri , C. Cachia et al. 28ème réunion interdisciplinaire de chimiothérapie anti-infectieuse., Dec 2008, Paris, France Poster de conférence hal-05289149v1
	Evaluation du milieu chromogène OCCA® : étude d’un pannel d’espèces de levures caractérisées. Vagner O , Petit M , Frédéric Dalle , C l'Ollivier , Cuisenier B et al. Congrès de la Société Française de Mycologie Médicale., Nov 2007, Paris, France Poster de conférence hal-05289165v1
	Evaluation of indoor fungal contamination during building construction on a hospital site. Marc Sautour , Sixt N , Frédéric Dalle , Lafon I , Aho S et al. 26ème réunion interdisciplinaire de chimiothérapie anti-infectieuse., Dec 2006, Paris, France Poster de conférence hal-05289213v1
	Intérêt du PLASMAIR® dans la réduction de l’aérocontamination fongique en milieu hospitalier. Sixt N , Frédéric Dalle , Lafon I , Aho S , Couillot G et al. Réunion d’allergologie de la SAICO – 11èmes journées d’études scientifiques., Dec 2006, Angers, France Poster de conférence hal-05289203v1

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Frédéric Dalle

Domaines de recherche

Publications

Publications

Clinical Manifestations of Emerging Trichosporon spp. Infections, France

Assessing laboratory capacity for diagnosis of fungal infections in France: A multicentre survey within the SINFONI network

Immunological fitness of echinocandin-resistant Nakaseomyces glabratus (former Candida glabrata ): The impact on the management of candidemia

A decade of ocular fungal infections due to &lt;i&gt;Penicillium&lt;/i&gt; -like fungi in France (2012 to 2021)

Elevating fungal care: bridging Brazil’s healthcare practices to global standards

Performance of 30 protocol combinations for the detection of Cryptosporidium parvum in stool samples

Candida albicans releases a peptide from the Rbt1 protein to promote its invasion into the gut epithelium

Use of the Mucorales qPCR on blood to screen high-risk hematology patients is associated with better survival

Risk of fungal exposure in the homes of patients with hematologic malignancies

Label-Free Optical Transmission Tomography for Direct Mycological Examination and Monitoring of Intracellular Dynamics

Current knowledge and practice of Candida auris screening in France: A nationwide survey from the French Society of Medical Mycology (SFMM)

Risk of fungal exposure in the homes of patients with hematologic malignancies

Invasive fungal diseases in patients with autoimmune diseases: a case series from the French RESSIF network

Intestinal Candida albicans overgrowth in IgA deficiency

Summer diarrhea in children: a monocentric French epidemiological observational study

Gradient concentration strip–specific epidemiological cut-off values of antifungal drugs in various yeast species and five prevalent Aspergillus species complexes

From modern-day parasitology to paleoparasitology: the elusive past record and evolution of Cryptosporidium

Aspergillus colonisation in severe community-acquired pneumonia: not just a mere colonisation

Dynamic full-field optical coherence tomography for live-cell imaging and growth-phase monitoring in Aspergillus fumigatus

Endotracheal tube biofilm in critically ill patients during the COVID-19 pandemic : description of an underestimated microbiological compartment

Membrane protective role of autophagic machinery during infection of epithelial cells by Candida albicans

Evaluation of the relevance of use of the BD-BACTEC®MycosisIC/F, BD-BACTEC®PlusAerobic/F, BD-BACTEC®Lytic/10 anaerobic/F and BD-BACTEC®PedsPlus/F culture bottle system for fungemia detection: A 4-year retrospective study at the Dijon university hospital, France

Dynamic full-field optical coherence tomography as complementary tool in fungal diagnostics

Evaluation of the Bio-Evolution Microsporidia generic and typing real-time PCR assays for the diagnosis of intestinal microsporidiosis

Cryptosporidiosis outbreak in Amazonia, French Guiana, 2018

A summary of cryptosporidiosis outbreaks reported in France and overseas departments, 2017–2020

Evaluation of Next-Generation Sequencing Applied to Cryptosporidium parvum and Cryptosporidium hominis Epidemiological Study

Evaluation of serum Mucorales PCR for the diagnosis of Mucormycoses: The MODIMUCOR prospective trial

Selecting a multiplex PCR panel for accurate molecular diagnosis of intestinal protists: a comparative study of Allplex ® (Seegene ® ), G-DiaParaTrio (Diagenode ® ), and RIDA ® GENE (R-Biopharm ® ) assays and microscopic examination

Active Surveillance Program to Increase Awareness on Invasive Fungal Diseases: the French RESSIF Network (2012 to 2018)

Disseminated Cryptosporidium infection in an infant with CD40L deficiency

Comparative Study of Eleven Mechanical Pretreatment Protocols for Cryptosporidium parvum DNA Extraction from Stool Samples

Tight Junctions as a Key for Pathogens Invasion in Intestinal Epithelial Cells

Detection and survival of Candida albicans in soils

Assessment of a Multiplex PCR for the Simultaneous Diagnosis of Intestinal Cryptosporidiosis and Microsporidiosis

Multicenter Evaluation of an ELISA for the Detection of Cryptosporidium spp. Antigen in Clinical Human Stool Samples

Comparative Performance of Eight PCR Methods to Detect Cryptosporidium Species

Detection and survival of Candida albicans in soils

Characteristics and outcome according to underlying disease in non-AIDS patients with acute respiratory failure due to Pneumocystis pneumonia

Pneumocystis Infection Outbreaks in Organ Transplantation Units in France: A Nation-Wide Survey

Epigastric cutaneous discharge: think amoebiasis

Epidemiology of Cryptosporidiosis in France from 2017 to 2019

Cryptosporidiosis after treatment with fingolimod: a case report and pharmacovigilance review

Assessment of the first commercial multiplex PCR kit (ParaGENIE Crypto-Micro Real-Time PCR) for the detection of Cryptosporidium spp., Enterocytozoon bieneusi, and Encephalitozoon intestinalis from fecal samples

Rapid diagnostic tests relying on antigen detection from stool as an efficient point of care testing strategy for giardiasis and cryptosporidiosis? Evaluation of a new immunochromatographic duplex assay

“ Candida Albicans Interactions With The Host: Crossing The Intestinal Epithelial Barrier”

Influenza infection and bacteremic pneumococcal pneumonia

Systematic gene overexpression in Candida albicans identifies a regulator of early adaptation to the mammalian gut.

Human cryptosporidiosis in immunodeficient patients in France (2015–2017)

Evaluation of five automated and one manual methods for Toxoplasma and human DNA extraction from artificially spiked amniotic fluid

First Case of Human Primary Vertebral Cystic Echinococcosis Due to Echinococcus Ortleppi

Cryptosporidiosis Outbreak in Immunocompetent Children from a Remote Area of French Guiana

Oestrus ovis external ophtalmomyiasis: a case report in Burgundy France

Myelitis and tenosynovitis attributed to toxocariasis

Prenatal therapy with pyrimethamine + sulfadiazine vs spiramycin to reduce placental transmission of toxoplasmosis: a multicenter, randomized trial

First case of proven invasive pulmonary infection due to Trichoderma longibrachiatum in a neutropenic patient with acute leukemia

Circulating cell-free DNA in patients with alveolar echinococcosis

La présence du signe du halo inversé (SHI) au scanner thoracique est étroitement associée à la présence d’ADN circulant de mucorales dans le sérum de patients présentant des signes d’infections fongiques invasives

Is It Time to Include CT “Reverse Halo Sign” and qPCR Targeting Mucorales in Serum to EORTC-MSG Criteria for the Diagnosis of Pulmonary Mucormycosis in Leukemia Patients ?

Airborne Aspergillus contamination during hospital construction works: Efficacy of protective measures

The pore-forming toxin Candidalysin dampens the autophagy-related plasma membrane stress response during Candida albicans invasion of epithelial cells.

Contamination des circuits d’alimentation en eau par Fusarium.

Les cellules M: une porte d’entrée pour le franchissement de la barrière intestinale par Candida albicans.

Spores fongiques dispersées dans l’air à partir de réseaux hydriques: cas de Fusarium

Adaptation inattendue de populations de Fusarium au milieu aquatique urbain des conduites d’eau de bâtiments hospitaliers à Dijon et Nancy.

Cryptosporidium, un pathogène HPE (Haut Potentiel Epidémique) : Retour sur les épidémies investiguées par le CNR des Cryptosporidioses, Microsporidies et Autres Protozooses digestives depuis 2018.

Infection pulmonaire invasive à Trichoderma longibrachiatum, à propos d’un cas.

Ne sous-estimez pas les amoeboses !

Comment le NGS nous aide dans la compréhension de l’´epidémiologie de Cryptosporidium sp.

The pore-forming toxin Candidalysin dampens the autophagy-related plasma membrane stress response during Candida albicans invasion of epithelial cells

Risque environnementale fongique au domicile de patients atteints d’hémopathies malignes

Prospective evaluation of the AllplexTM assays for protozoa and helminths detection in stool samples.

Identification des champignons filamenteux par spectrométrie de masse MALDI TOF : influence de l’âge des colonies sur les résultats d’identification.

Etude du dosage de la mannose Binding Lectin (MBL) comme marqueur prédictif de la survenue d’infection fongique invasive au cours d’aplasies chimio-induites chez les patients atteints de leucémie aiguë.

Evaluation des Kits simplex VIASURE et multiplex VIASURE , FTD Stool parasites et G-DiaPara pour la détection de Cryptosporidium sp., Giardia intestinalis et Entamoeba histolytica dans des échantillons de selles.

Evaluation de la performance des hémocultures BD BACTECTM mycosis IC/F, BD BACTECTM Plus Aerobic/F, BD BACTECTM Lytic/10 anaerobic/F et BD BACTECTM Peds Plus/F dans la détection des fongémies: étude rétrospective de 4 ans.

A decade of ocular fungal infections due to <i>Penicillium</i> -like fungi in France (2012 to 2021)