Géraldine Pascal
94
Documents
Identifiants chercheurs
- geraldine-pascal
- IdRef : 09741218X
Présentation
Bioinformatics - Comparative Genomics & Metagenomics
========================================================
Publications
- 3
- 3
- 2
- 2
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 5
- 5
- 4
- 4
- 3
- 3
- 3
- 3
- 3
- 3
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 2
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 4
- 14
- 6
- 7
- 7
- 11
- 7
- 1
- 6
- 2
- 6
- 5
- 4
- 4
- 3
- 1
- 2
- 2
- 1
A richer gut microbiota is related to better feed efficiency and diet adaptability in laying hens74. Annual meeting of the european federation of animal science (EAAP), EAAP, Aug 2023, Lyon, France. pp.740
Communication dans un congrès
hal-04199104v1
|
|
|
The benefits of long read HiFi sequencing for metagenomic analysisFrance génomique - VIIème Animation Wetlab et Bioinfo, Nov 2022, Strasbourg, France
Communication dans un congrès
hal-03896074v1
|
|
The benefits of long read HiFi sequencing for metabarcoding analysisPACBIO DISCOVERIES ROADSHOW PARIS, PACBIO, May 2022, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-03740586v1
|
metagWGS : a workflow to analyse short or long HiFi metagenomic readsBioinfo Biosta Genotoul day, Dec 2022, Castanet Tolosan, France
Communication dans un congrès
hal-03944382v1
|
|
|
Both quantitative and energetic intake level affect caecal microbiota composition and activity in the growing rabbit12th World Rabbit Congress, Nov 2021, Nantes, France
Communication dans un congrès
hal-03649231v1
|
|
Stimuler l'ingestion d'aliments solides au début de la vie : une stratégie prometteuse pour piloter la co-maturation du microbiote et de la muqueuse intestinaleSéminaire Défis Scientifiques, Département de Physiologie Animale et Systèmes d’Elevage, Nov 2019, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-02884240v1
|
The journey of a team of engineers in learning packaging technologyGalaxy Community Conference - GCC2018, Jun 2018, Portland, United States
Communication dans un congrès
hal-02784992v1
|
|
|
MACADAM a user-friendly MetAboliC pAthway DAtabase for complex Microbial community function analysisJobim (Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques), Jul 2018, Marseille, France
Communication dans un congrès
hal-02789596v1
|
Microbiota as a tool to promote spontaneous liver steatosis in Greylag geese: promising results69. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2018, Dubrovnik, Croatia
Communication dans un congrès
hal-01901325v1
|
|
|
Genetic determinism of dairy sheep ruminal microbiota69. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2018, Dubrovnik, Croatia. 705 p
Communication dans un congrès
hal-02737262v1
|
Microbial metacommunity: a METABAR coding approach2017 Scientific MEM days: Journées scientifiques MEM (Métaomiques et écosystèmes microbiens), Jan 2017, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-01607836v1
|
|
|
Effect of feeding strategy on the maturation of ceacal microbiota in young rabbits11. World Rabbit Congress, Jun 2016, Qingdao, China. 417 p
Communication dans un congrès
hal-02739131v1
|
Implantation du microbiote intestinal dans l'iléon et les ceca des canetons Barbarie, Pékin et Mulard par séquençage miseQ11. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2015, Tours, France
Communication dans un congrès
hal-02739751v1
|
|
|
Modulation de la composition l'écosystème digestif caecal du lapereau par voie alimentaire et relation avec son fonctionnement16. Journées de la Recherche Cunicole, Nov 2015, Le Mans, France. 264 p
Communication dans un congrès
hal-02742208v1
|
Find Rapidly OTU with Galaxy SolutionJOBIM 2015 - Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Jul 2015, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès
hal-01535378v1
|
|
Rôle des cellules d'oviducte dans la fécondation équine et identification des protéines impliquées38. Journée de la Recherche Equine, Institut Français du Cheval et de l'Equitation (IFCE). Labo/service de l'auteur, Le Pin, FRA., Mar 2012, Paris, France. 232 p
Communication dans un congrès
hal-02748627v1
|
|
Etude des mécanismes de la fécondation dans l'espèce équine par une approche comparative entre les modèles équin et porcin.36. Journée de la Recherche Equine, Mar 2010, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02752835v1
|
|
Identification et rôle fonctionnel des acides aminés sous sélection positive des Odorant Binding Proteins: implication dans la spéciationJournées d’Animation des Crédits Incitatifs du Département de Physiologie Animale et Systèmes d’Elevage (JACI Phase), 2010, Tours, France
Communication dans un congrès
hal-01607662v1
|
|
The richer the better: 16S metabarcoding analysis of gut microbiota of laying hens in relation to feed efficiency and adaptation to diet change13. International Gut Microbiology Symposium 2023, Jun 2023, Aberdeen, United Kingdom. , 2023, Programme and book of abstracts
Poster de conférence
hal-04127869v1
|
|
PERFORM PROTOCOL TESTS AND SEQUENCE CHECKS ? THE EXPERIENCE FROM MULTIOMICS MICROBIOTA DATA25ème Séminaire des Doctorants du Département de Génétique Animale (SDDGA 2022), Sep 2022, Bordeaux, France.
Poster de conférence
hal-03930031v1
|
|
FROGSFUNC: Smart integration of PICRUSt2 software into FROGS pipelinePoster de conférence hal-03806133v1 |
|
Avancées réalisées en métabarcoding et en métagénomique dans le cadre du projet SeqOccIn grâce au séquençage longs fragmentsPoster de conférence hal-03776011v1 |
|
Impact of host genetics and abiotic stresses on caecal microbiota composition in four different laying hen lines?Journées Scientifiques du Département de Génétique Animale, Sep 2022, Bordeaux, France
Poster de conférence
hal-03930049v1
|
|
metagWGS: a workflow to analyse short and long HiFi metagenomic readsECCB2022, Sep 2022, Sitges, Spain
Poster de conférence
hal-03788263v1
|
CONSTRUCTION OF A 16S MINI BARCODE LIBRARY FOR FRENCH WILD BEES9th European Congress of Apidology, Sep 2022, belgrade, Serbia
Poster de conférence
hal-03855355v1
|
|
|
Strengths and limits of long read metabarcodingECCB 2022, Sep 2022, Meliá Sitges, Spain
Poster de conférence
hal-03848228v1
|
|
Implementation of new methods for metagenomics analysis using PacBio HiFi sequencingPlant & Animal Genome Conference (PAG) 2022, Jan 2022, San Diego, United States
Poster de conférence
hal-03541346v1
|
|
metagWGS: a workflow to analyse short and long HiFi metagenomic reads Taxonomic profile HiFi vs Short reads assemblyJOBIM 2022, Jul 2022, Rennes, France. Actes des exposés (keynotes, contributions orales, mini-symposia) : JOBIM2022_proceedings_oral.pdf (23 Mo) et actes des posters et démos : JOBIM2022_proceedings_posters_demos.pdf (19 Mo). ⟨10.15454/1.5572369328961167E12⟩
Poster de conférence
hal-03771202v1
|
|
Benefits of PacBio HiFi long reads for metagenomic whole genome analysisEnvironmental And Agronomical Genomics Symposium, Oct 2021, Tours, France
Poster de conférence
hal-03538657v1
|
|
A Long Read project to find optimal technologic combinations for genome assembly and variability, epigenetic marks detection and metagenomic analysisPAG XXVIII, Plant and Animal Genome, Jan 2020, San Diego, United States. 2020
Poster de conférence
hal-02947690v1
|
|
Functional inference integrated in the FROGS suiteJOBIM2020, Jun 2020, Montpellier, France. , ⟨10.1038/s41587-⟩
Poster de conférence
hal-03176828v1
|
|
Whole metagenome analysis with metagWGSJOBIM2020, Jun 2020, Montpellier, France
Poster de conférence
hal-03176836v1
|
|
Improving microbial taxonomic profiling with long read technologiesJOBIM2020, Jun 2020, Montpellier (virtuel), France
Poster de conférence
hal-03177058v1
|
|
Des solutions informatiques innovantes pour l’utilisation et le développement de biomarqueurs de diversité du microbiote.DefisPHASE 2019, 2019, Rennes, France
Poster de conférence
hal-03851900v1
|
|
Identification of genomic regions for high-resolution taxonomic profiling using long-read sequencing technologyPoster de conférence hal-02791605v1 |
|
MACADAM: A user-friendly MetAboliC pAthways DAtabase for complex Microbial community function Analysis17. European Conference on Computational Biology (ECCB 2018, Workshop "Recent Computational Advances in Metagenomics (RCAM)", Sep 2018, Athens, Greece. 2018
Poster de conférence
hal-02785402v1
|
|
Genetic links between feeding behavior and microbiota of Romane lambs11. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Feb 2018, Auckland, New Zealand. Massey University, 1130 p., 2018, Proceedings of the 11th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP)
Poster de conférence
hal-02736414v1
|
|
Rumen bacteria in sheep : first evidence of host’s genetic control10. International Symposium on the Nutrition of Herbivores (ISNH10), Sep 2018, Clermont-Ferrand, France. Cambridge University Press, Advances in Animal Biosciences, 9 (3), 2018, 10th. International Symposium on the Nutrition of Herbivores (ISNH10)
Poster de conférence
hal-02737229v1
|
The journey of a team of engineers in learning packaging technologyJobim (Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques), Jul 2018, Marseille, France. , 2018, JOBIM 2018
Poster de conférence
hal-02733639v1
|
|
|
ARMOr project : genome-wide association analysis of ruminal microbiota in ovisCRB ANIM - Réunion du Réseau de Centres de Ressources Biologiques pour les animaux domestiques, May 2017, Paris, France. 2017
Poster de conférence
hal-02788449v1
|
|
FROGS : Find Rapidly OTUs with Galaxy SolutionColloque d'Écologie Microbienne organisé par l'Association Française d'Écologie Microbienne (AFEM), Nov 2015, Anglet, France. Oxford University Press, 34, 7 p., 2015, Bioinformatics
Poster de conférence
hal-01886389v1
|
How to design an efficient and robust pipeline for 16S rRNA-gene sequence analysis to improve our understanding on microbial communities?JOBIM 16. Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Jul 2015, Clermont-Ferrand, France. , 2015
Poster de conférence
hal-01195512v1
|
|
Oviductal secretions have a positive effect on fertilization in equine species, which involves DMBT164. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, Aug 2013, Nantes, France. Wageningen Academic Publishers, Annual Meeting of the European Association for Animal Production, 19, 660 p., 2013, 64th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science
Poster de conférence
hal-02749534v1
|
|
|
Evolutionary aspect of BMP15 function in folliculogenesis17. Evolutionary Biology Meeting, Sep 2013, Marseille, France. 2013
Poster de conférence
hal-02806825v1
|
The ovarian failure associated Y235 residue of human BMP15 gene is target of evolutionary positive selection15. International and 14. European Congress on Endocrinology, May 2012, Florence, Italy. BioScientifica, Endocrine Abstracts, 29, 2012, 15th International and 14th European Congress on Endocrinology
Poster de conférence
hal-02746767v1
|
|
An evolutionary signature of sperm-egg interaction in vertebratesEvolution 2011, Jun 2011, Norman, United States. 1 p., 2011
Poster de conférence
hal-02804899v1
|
Evolution et reproductionLa Reproduction animale et humaine, Editions Quae, 751 p., 2014, Collection Synthèses, 978-2-7592-2208-7
Chapitre d'ouvrage
hal-01205107v1
|
FROGS : Find Rapidly OTU with Galaxy Solution2017
Autre publication scientifique
hal-01886442v1
|
|
Etude des biais de composition en acides aminés des protéines microbiennesAutre [q-bio.OT]. Université d'Evry-Val d'Essonne, 2005. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse
tel-00011839v1
|
Habilitation à Diriger des RecherchesAutre [q-bio.OT]. Université François Rabelais (Tours), 2013
HDR
tel-02809214v1
|
|
Formation FROGS juillet 2019Master. (Trainingon Galaxy : Metagenomics / ITS analysisin FROGS ? / Trainingon Galaxy: Statistics to explore metagenomics), 2019
Cours
hal-02790029v1
|
|
FROGS Training on Galaxy : Metagenomics November 2017Formation Métagénomique avec le logiciel FROGS (Find, Rapidly, Otus with Galaxy Solution), 2017, 270 p
Cours
hal-02791696v1
|
|
Février_2017_Formation Métagénomique avec le logiciel FROGS2017
Cours
hal-02785427v1
|
|
FROGS Training on Galaxy : Statistics to Explore MetagenomicsTraining on Galaxy : Statistics to Explore Metagenomics - FROGS (Find, Rapidly, Otus with Galaxy Solution), 2017, 116 p
Cours
hal-02788316v1
|