Jonathan Dikec

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Microbiology Molecular biology (qPCR, PMA-qPCR) Spectroscopy (Raman, FITR, O-PTIR) Microscopy (Super resolved STORM and PALM, fluorescence, two photon excitation, fluorescence-lifetime imaging) Data analysis (Python) / Machine learning (Python)

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Influence of hydration on calcium dipicolinate (CaDPA) during UVb and UVc exposure studied via Raman, FTIR and O-PTIR spectroscopy

Jonathan Dikec , Maxime Pacheco , Laurence Dujourdy , Christophe Sandt , Pascale Winckler et al.
Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry, 2023, 443, pp.114823. ⟨10.1016/j.jphotochem.2023.114823⟩
Article dans une revue hal-04098103 v1

Uptake of UVc induced photoproducts of dipicolinic acid by Bacillus subtilis spores – Effects on the germination and UVc resistance of the spores

Jonathan Dikec , Maxime Pacheco , M. Lavaud , Pascale Winckler , Jean-Marie Perrier-Cornet
Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology, 2022, 236, pp.112569. ⟨10.1016/j.jphotobiol.2022.112569⟩
Article dans une revue hal-03792017 v1
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Spectroscopic and microscopic characterization of dipicolinic acid and its salt photoproducts – A UVc effect study on DPA in solution and in bacterial spores

Maxime Pacheco , Jonathan Dikec , Pascale Winckler , Jean-Marie Perrier-Cornet , Christian Coelho
Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy [1994-..], 2022, 280, pp.121502. ⟨10.1016/j.saa.2022.121502⟩
Article dans une revue hal-03761812 v1

Effects of pulsed near infrared light (NIR) on Bacillus subtilis spores

Jonathan Dikec , Shaliha Bechoua , Pascale Winckler , Jean-Marie Perrier-Cornet
Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology, 2022, 234, pp.112530. ⟨10.1016/j.jphotobiol.2022.112530⟩
Article dans une revue hal-03762800 v1

Hyphal network whole field imaging allows for accurate estimation of anastomosis rates and branching dynamics of the filamentous fungus Podospora anserina

J. Dikec , A. Olivier , C. Bobée , Y. D’angelo , R. Catellier et al.
Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.3131. ⟨10.1038/s41598-020-57808-y⟩
Article dans une revue hal-03857721 v1
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Identification et détermination de l’état de viabilité de Listeria monocytogenes et Vibrio parahaemolyticus à l’échelle de la cellule unique par microspectroscopie Raman

Darius L. Abedini , Jonathan Dikec , Célia Afgoun , Graziella Midelet , Mélanie Gay et al.
Microbes 2025, Sep 2025, Bordeaux, France.
Poster de conférence hal-05421587 v1
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Identification and viability state determination of Listeria monocytogenes and Vibrio parahaemolyticus at a single-cell level by Raman microspectroscopy

Darius L. Abedini , Jonathan Dikec , Célia Afgoun , Mélanie Gay , Graziella Midelet et al.
JSDA, Jun 2025, Maisons-Alfort, France. 2025
Poster de conférence hal-05421626 v1

Evaluation de l’état de viabilité de Listeria monocytogenes en biofilm après traitement biocide par microspectroscopie Raman-DIP

Jonathan Dikec , Simon Shakya , Abedini Darius Lucas , Graziella Midelet , Sabine Debuiche et al.
Microbes 2025, Sep 2025, Bordeaux (France), France
Poster de conférence hal-05422913 v1

OPTIR : infrared microspectroscopy for advanced characterization of microorganisms

Pascale Winckler , Maxime Pacheco , Elie Sarkees , Jonathan Dikec , Jean-Marie Perrier-Cornet
Symposium HARMI 2025, Sep 2025, Dole, France
Poster de conférence hal-05264271 v1

Détection de l’état Viables Non Cultivables de bactéries pathogènes : Présentation d’une méthode innovante de microspectroscopie Raman couplé à un marquage au deutérium

Jonathan Dikec , Pierre R. Marcoux , Abedini Darius Lucas , Olivier Ducloux , Graziella Midelet et al.
Microbes 2024, Oct 2024, Lille, France
Poster de conférence hal-05423063 v1
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Identification de bactéries pathogènes Listeria monocytogenes et Vibrio parahaemolyticus et détermination de leur état de viabilité par microspectroscopie Raman couplée au marquage isotopique

Abedini Darius Lucas , Jonathan Dikec , Sabine Debuiche , Olivier Ducloux , Pierre R Marcoux et al.
Journée Régionale des Doctorants en Sciences de la Mer et Automatique, Jul 2024, Boulogne-sur-Mer, France
Poster de conférence hal-05422911 v1