
NP
Nicolas Parisot
157
Documents
Affiliation actuelle
- Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (BF2I)
Identifiants chercheurs
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nicolas-parisot
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0000-0001-5217-8415
-
181863030
- ResearcherID : C-8116-2012
Site web
Présentation
Positions
- 2015-now: Assistant Professor at INSA Lyon and BF2I Lab
- 2014-2015: Fixed term Assistant Professor (French ATER) at INSA Lyon and BF2I Lab. "High-throughput genomics and transcriptomics to study insect symbioses"
- 2011-2014: PhD student, Université Blaise Pascal (Clermont-Ferrand II, France), LMGE and CIDAM labs. "Selection of oligonucleotide probes for high-throughput study of complex environments"
Academic degrees
- 2011-2014: PhD thesis in Bioinformatics and Microbial Ecology, Université Blaise Pascal (Clermont-Ferrand II, France)
- 2010-2011: Master of Science in Biostatistics and Bioinformatics, Université Claude Bernard (Lyon I, France)
- 2008-2011: Master of Engineering degree in Bioinformatics and Modelling, INSA Lyon, France
- 2006-2008: Technology degree in Bioinformatics, Université d'Auvergne (Aurillac, France)
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Publications
Isolation of Insect as a Platform for Transcriptomic AnalysesRNA abundance analysis, 2170, pp.185-198, 2021, ⟨10.1007/978-1-0716-0743-5_13⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-03052268
v1
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Genetic Diversity of the Apoptotic Pathway in InsectsEvolution, Origin of Life, Concepts ans Methods, Springer International Publishing, pp.253-285, 2019, 978-3-030-30363-1. ⟨10.1007/978-3-030-30363-1_13⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-02304321
v1
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Targeted Gene Capture by Hybridization to Illuminate Ecosystem FunctioningMicrobial Environmental Genomics (MEG), 1399, Springer New York, pp.167-182, 2016, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-4939-3369-3_10⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-03772783
v1
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Probe design strategies for oligonucleotide microarraysMicroarray Technology, 1368, Editions Springer, 2016, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-3135-4. ⟨10.1007/978-1-4939-3136-1_6⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-01273700
v1
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Software tools for the selection of oligonucleotide probes for microarrays.Microarrays: Current technology, Innovations and Applications, Caister Academic Press, 2014
Chapitre d'ouvrage
hal-03772798
v1
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Eavesdropping on the intimate dialogue between an insect and its nutritional endosymbiont along key stages of their life togetherSymbNET International Conference on Host-Microbe Symbiosis, Jun 2024, Olhao - Faro, Portugal
Communication dans un congrès
hal-04798309
v1
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Evolution towards a two-way cooperation in a single symbiotic organ: the developmental chronicle of a multi-partner insect endosymbiosisInternational congress of Ecology and Evolution (SFE2), Société Française d'Ecologie et d'Evolution (SFE2), Oct 2024, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-04753005
v1
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Two-way cooperation in a single symbiotic organ: the developmental chronicle of a multi-partner insect endosymbiosis3rd Joint Congress on Evolutionary Biology, Jul 2024, Montreal, Canada
Communication dans un congrès
hal-04753845
v1
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RNAseq analysis reveals new roles for conserved metazoan pathways in the regulation of bacteriocyte dynamics14èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Oct 2024, Montpellier, France
Communication dans un congrès
hal-04783705
v1
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Evolutionarily conserved metazoan pathways have evolved new functions and regulate bacteriocytes' dynamics in the context of symbiosisXXVII International Congress of Entomology, Aug 2024, Kyoto, Japan
Communication dans un congrès
hal-04702864
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A genome-wide annotation of transcription factors in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum, and the related database, ATFdb13èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-04524595
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Acyrthosiphon pisum tissue-specific gene regulatory network inference13èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2023, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-04670574
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Cellular specialization inside the symbiotic organ of an insect pest: deciphering the dialog between host and symbiotic bacteria and their adaptation to different dietetic conditionsMicrolaser Biotech, Dec 2023, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-04807017
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Cellular specialization inside the symbiotic organ of an insect pest: deciphering the dialog between host and symbiotic bacteria and their adaptation to different dietetic conditionsMicrogenomics 2023, Jun 2023, Florence (IT), Italy
Communication dans un congrès
hal-04798331
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Étude des peptides antimicrobiens dans la symbiose mutualiste entre le charançon des céréales Sitophilus oryzae et la bactérie endosymbiotique Sodalis pierantoniusColloque du réseau "MultiFonction des Peptides AntiMicrobiens" (MuFoPAM), Oct 2023, Lille, France
Communication dans un congrès
hal-04530729
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Bacteriocyte-specific Cysteine-Rich (BCR) peptides form a new aphid-specific defensin-like family and are promising regulators of aphid symbiosisRencontres du Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID), May 2023, Poitiers, France
Communication dans un congrès
hal-04633283
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Peptides « Bacteriocyte-specific Cysteine Rich » (BCR) : un rôle dans le contrôle de la symbiose ? Focus sur BCR4 chez le puceron du pois.12èmes rencontres du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France
Communication dans un congrès
hal-04771966
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Bacteriocyte differentiation and cell death in the aphid/Buchnera symbiotic systemXXVI International Congress of Entomology, Jul 2022, Helsinki, Finland
Communication dans un congrès
hal-04670590
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Les peptides « Bacteriocyte-specific Cystein-Rich » : une nouvelle famille de défensine. Régulateurs de la symbiose chez les pucerons ?9ème Journées du GDR "MultiFonction des Peptides AntiMicrobiens" (MuFoPAM), Oct 2022, Amboise, France
Communication dans un congrès
hal-04633233
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Utilisation de méthodes d'apprentissage automatique pour la reconstruction et modélisation de réseaux géniques développementaux chez les bactériocytes d'insectes1er séminaire Métaprogramme DIGIT-BIO, Dec 2022, Ecully, France
Communication dans un congrès
hal-04889858
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Réseaux de régulation géniques : Méthodes d'inférence et questions biologiques dans le modèle puceronPremière rencontre SPE et Numérique, INRAE département SPE, May 2022, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-04783124
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Transposable element regulation in the cereal weevil Sitophilus oryzae and its potential association with an endosymbiotic bacteriaCNET (23d congrès national des éléments transposables), Jul 2022, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-04783612
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Unravelling the molecular bases of host-endosymbiont interactions at critical developmental stages of a cereal weevil10th congress of the International Symbiosis Society (ISS) - 3rd International Conference on Holobionts (joint meeting), Jul 2022, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-04771926
v1
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La face cachée des LncRNAs d’Acyrthosiphon pisum12ème Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés - BAPOA, May 2022, Nice, France
Communication dans un congrès
hal-04783582
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The assembly of the rice weevil Sitophilus oryzae is dominated by transposable elements and shades light on the evolution of endosymbiosis in a major crop pest.Arthropod Genomics Symposium 2022, Jun 2022, Notre Dame (Indiana), United States
Communication dans un congrès
hal-04783673
v1
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Décrypter le dialogue moléculaire hôte-symbiote pour l’étude systémique des interactions symbiotiques chez les insectes d’intérêt agronomiqueJournée de l'Enjeu Santé Globale et Bioingénierie de l'INSA Lyon, Nov 2021, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-04784485
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Immune functions and developmental processes promoting endosymbiosis maintenance in the cereal weevil Sitophilus spp.Journées du réseau Etudes Fonctionnelles chez les ORganismes modèles - EFOR, May 2021, Virtual, France
Communication dans un congrès
hal-04783524
v1
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The Inhibitor of APoptosis (IAP) gene family in aphids: between expansion and functional diversificationWebinaire du réseau français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), 2021, Villeurbanne (virtual), France
Communication dans un congrès
hal-03514209
v1
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Unraveling the molecular bases of the host-symbiont interactions at critical symbiotic stagesWebinaires du Groupe Régional de Recherche en Microbiologie des Interactions (G-RREMI) 2021, Jun 2021, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-04771798
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Analysis of the inhibitor of aPoptosis (IAP) repertoire in insects reveals a complex pattern of gene losses and amplificationsIncontri di diversità delle forme e degli animali, Università di Pisa, 2021, Pisa, Italy
Communication dans un congrès
hal-03514196
v1
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Unraveling the molecular bases of the host-symbiont interactions at critical symbiotic stagesMolecular mechanisms of interspecies interactions, Dec 2021, Virtual conference, Chile
Communication dans un congrès
hal-04792785
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Setting up a Dual-RNAseq approach to unravel the modulation of symbiotic structures during the metamorphosis of the cereal weevil Sitophilus oryzae.Insects: Immunity and Infection, Royal Entomology Society, Sep 2020, Virtual, France
Communication dans un congrès
hal-04806873
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PGRP-LB, acteur majeur du maintien et du contrôle de l’endosymbiose chez le charançon des céréales.Colloque Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID) et le réseau Immunologie des Invertébrés (IMMUNINV), May 2019, Montpellier, France
Communication dans un congrès
hal-04784679
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Development of a Dual-RNAseq strategy to unravel the molecular bases of host-symbiont interactionsColloque Réseau Ecologie des Interactions Durables (REID) et le réseau Immunologie des Invertébrés (IMMUNINV), May 2019, Montpellier, France
Communication dans un congrès
hal-04784637
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Study of insect-bacteria symbiotic interactions by dual RNAseqJournée Transcriptomique Complexe des GDR GE et BIM, Dec 2019, Nancy, France
Communication dans un congrès
hal-04784601
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IAP (Inhibitor-of-Apoptosis Protein) gene family expansion and functional diversification in aphids2nd UK-France Joint meeting on Aphids - Royal Entomologial Society, Apr 2019, Rothamsted, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-03512999
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Extreme makeover: Symbiosis remodeling and endosymbiont relocalization during host metamorphosis in the cereal weevil Sitophilus2nd Microbial Ecology & Environmental Microbiology Meeting - MEEM, May 2019, Melbourne (AUS), Australia
Communication dans un congrès
hal-04784732
v1
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IAP (Inhibitor-of-Apoptosis Protein) gene family expansion and functional characterization in aphids8th International Symposium on Molecular Insect Science, Jul 2019, Sitges, Spain
Communication dans un congrès
hal-03741297
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Expansion of genes encoding Apoptosis Inhibitor Proteins (IAPs) and their role in a novel bacteriocyte cell death process in aphid symbiosis22. Evolutionary Biology Meeting, Sep 2018, Marseille, France
Communication dans un congrès
hal-03509938
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Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisumINSA Lyon International Partner Days, Oct 2018, Villeurbanne (INSA-Lyon), France
Communication dans un congrès
hal-03514034
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Rôle clé du bactériocyte dans la résilience du puceron aux stress nutritionnels11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-03514026
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A novel cell death process is involved in the elimination of bacteriocytes and their symbionts through aphid agingFrance-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-03514078
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Another way to die for bacteriocytes in the aphid/Buchnera symbiotic systemJournée des doctorants du département SPE, Jun 2018, Nice, France
Communication dans un congrès
hal-03510629
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Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisumFrance-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-03514051
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Amplification des gènes codant les protéines de la famille des IAP et leur rôle dans l'homéostasie bactériocytaire11èmes rencontres du réseau de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-03741308
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Life history traits and tissue-specific gene expression changes underlying the symbiotic pea aphid resilience to a tyrosine and phenylalanine depleted diet9. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2016, Amiens, France
Communication dans un congrès
hal-03506796
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Une nouvelle forme de mort cellulaire impliquée dans la dégénérescence des cellules bactériocytaires chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisum18. Colloque Biologie de l'Insecte, Jun 2016, Tours, France
Communication dans un congrès
hal-03506790
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The long-term relationship with Buchnera aphidicola imposes another way to die for Acyrthosiphon pisum bacteriocytes9. Réunion annuelle du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), Nov 2016, Amiens, France
Communication dans un congrès
hal-03506794
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From SymbAphidBase to SymbAphidCyc: two companion databases to study and compare aphid symbionts from genomes to metabolic pathwaysJOBIM 2015 - Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA). FRA., Jul 2015, Clermont-Ferrand, France. 1 p
Communication dans un congrès
hal-01208786
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Propositional Logic for Efficient Microbial Community Assessment by DNA Microarray Data AnalysisJOBIM, 2015, Clermont-Fd, France. pp.1-9
Communication dans un congrès
hal-02077182
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Fungal secondary metabolites from Monascus spp. reduce methane production by affecting rumen methanogenic Archaea diversity in wethersGreenhouse Gases and Animal Agriculture Conference, 2013, Dublin, Ireland
Communication dans un congrès
hal-02746467
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MetaExploArrays: a large-scale oligonucleotide probe design software for explorative DNA microarrays13. International Conference on Parallel and Distributed Computing, Applications and Technologies, Dec 2012, Bejing, China. ⟨10.1109/PDCAT.2012.94⟩
Communication dans un congrès
hal-01393662
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Détermination de sondes oligonucléotidiques pour biopuces phylogénétiques en environnement grille de calculRencontres Scientifiques France Grilles 2011, Sep 2011, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-00658712
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Annotation et évolution des familles de transporteurs chez le puceron du pois (Acyrthosiphon pisum)3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France. n. p
Communication dans un congrès
hal-02818835
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Genomic analysis of the transport function in the symbiotic system of the pea aphid Acyrthosiphon pisum5. Meeting GDRE-RA "Comparative genomics", Institut d'Estudis Catalans (IEC). Barcelona, ESP., Nov 2010, Barcelone, Spain. n. p
Communication dans un congrès
hal-02823073
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Détermination de sondes oligonucléotidiques pour l'exploration à haut débit de la diversité taxonomique et fonctionnelle d'environnements complexesSciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2014. Français. ⟨NNT : 2014CLF22498⟩
Thèse
tel-01086970
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