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Olivier Lepais

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  • Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo)
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Publications

Genetic diversity of aquatic macrophytes in Aquitaine lakes

Debailleul Estelle-Marie , Jamoneau Aurélien , Lepais Olivier

Conservation Genetics, 2026, 27 (1), pp.20. ⟨10.1007/s10592-025-01746-7⟩

Article dans une revue hal-05508554v1
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High-throughput sequence-based microsatellite genotyping for the non-model Neotropical tree species Anadenanthera colubrina (Leguminosae)

Alejandra Lorena Goncalves , María Victoria García , Emilie Chancerel , Olivier Lepais , Myriam Heuertz

Plant Ecology and Evolution, 2025, 158 (1), pp.43 - 52. ⟨10.5091/plecevo.138834⟩

Article dans une revue hal-05006488v1
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Restricted Dispersal in the Late Successional Forest Tree Species <i>Nothofagus Pumilio</i>: Consequences Under Global Change

C. Soliani , J. Sekely , C Zamora‐ballesteros , K. Heer , Olivier Lepais et al.

Ecology and Evolution, 2025, 15 (5), ⟨10.1002/ece3.71002⟩

Article dans une revue hal-05168694v1
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Correction: Tracking repeat spawning anadromous fish migrations over multiple years in a fragmented river suggests philopatry and sex‑linked variation in space use

Peter Davies , J. Robert Britton , Demetra Andreou , Charles Crundwell , Jamie R Dodd et al.

Aquatic Sciences - Research Across Boundaries, 2025, 87 (2), pp.51. ⟨10.1007/s00027-025-01176-0⟩

Article dans une revue hal-04997981v1
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Counting the Invisible: New Tools to Estimate the Number of Contributors From Sequence‐Based Microsatellite Genotyping of Environmental DNA Samples

Olivier Lepais , Ivan Paz‐vinas

Molecular Ecology Resources, 2025, ⟨10.1111/1755-0998.70051⟩

Article dans une revue hal-05300732v1
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Low-frequency somatic mutations are heritable in tropical trees Dicorynia guianensis and Sextonia rubra

Sylvain Schmitt , Patrick Heuret , Valérie Troispoux , Mélanie Beraud , Jocelyn Cazal et al.

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2024, 121, ⟨10.1073/pnas.2313312121⟩

Article dans une revue hal-04481461v1
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Offspring sex ratio increases with paternal reproductive success in a colony of southern elephant seals

Hassen Allegue , Christophe Guinet , Samantha C Patrick , Cécile Ribout , Coraline Bichet et al.

Marine Mammal Science, 2024, 40 (3), ⟨10.1111/mms.13108⟩

Article dans une revue hal-04640059v1
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Genetic diversity and population structure of Botryosphaeria dothidea and Neofusicoccum parvum on English walnut (Juglans regia L.) in France

Marie Belair , Adeline Picot , Olivier Lepais , Cyrielle Masson , Marie-Neige Hébrard et al.

Scientific Reports, 2024, 14 (1), pp.19817. ⟨10.1038/s41598-024-67613-6⟩

Article dans une revue hal-04841244v1

Tracking repeat spawning anadromous fish migrations over multiple years in a fragmented river suggests philopatry and sex-linked variation in space use

Peter Davies , J. Robert Britton , Demetra Andreou , Charles Crundwell , Jamie Dodd et al.

Aquatic Sciences - Research Across Boundaries, 2024, 86 (2), pp.34. ⟨10.1007/s00027-024-01048-z⟩

Article dans une revue hal-04640042v1
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Development and characterization of microsatellite markers for the French endemic Angelica heterocarpa (Apiaceae) and congeneric sympatric species

Emmanuelle Revardel , Olivier Lepais

BMC Research Notes, 2022, 15 (1), pp.15. ⟨10.1186/s13104-021-05903-2⟩

Article dans une revue hal-04028545v1
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Joint analysis of microsatellites and flanking sequences enlightens complex demographic history of interspecific gene flow and vicariance in rear-edge oak populations

Olivier Lepais , Abdeldjalil Aissi , Errol Véla , Yassine Beghami

Heredity, 2022, 129, pp.169-182. ⟨10.1038/s41437-022-00550-0⟩

Article dans une revue hal-03705508v1
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Iguana insularis (Iguanidae) from the southern Lesser Antilles: An endemic lineage endangered by hybridization

Michel Breuil , David Schikorski , Barbara Vuillaume , Ulrike Krauss , Jennifer Daltry et al.

Zookeys, 2022, 1086, pp.137 - 161. ⟨10.3897/zookeys.1086.76079⟩

Article dans une revue hal-03608735v1

Sea trout ( Salmo trutta ) straying rate decreases as distance from river mouth increases

Joelle Chat , Amaia Lamarins , Olivier Lepais

Journal of Fish Biology, 2022, 8 p. ⟨10.1111/jfb.15152⟩

Article dans une revue hal-03766572v1
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Population genomic and historical analysis suggests a global invasion by bridgehead processes in Mimulus guttatus

Mario Vallejo-Marín , Jannice Friedman , Alex D Twyford , Olivier Lepais , Stefanie M Ickert-Bond et al.

Communications Biology, 2021, 4 (1), pp.1-12. ⟨10.1038/s42003-021-01795-x⟩

Article dans une revue hal-03310344v1

Analyse morphologique et taxonomique du complexe Quercus faginea (Fagaceae) en Algérie

Abdeldjalil Aissi , Yassine Beghami , Olivier Lepais , Errol Véla

Botany / Botanique, 2021, 99 (2), pp.99-113. ⟨10.1139/cjb-2020-0075⟩

Article dans une revue hal-03146455v1

Microhaplotype genotyping-by-sequencing of 98 highly polymorphic markers in three chestnut tree species

Benoît Laurent , Clément Larue , Emilie Chancerel , Erwan Guichoux , Rémy J. Petit et al.

Conservation Genetics Resources, 2020, ⟨10.1007/s12686-020-01157-5⟩

Article dans une revue hal-02882025v1
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Variable outcomes of hybridization between declining Alosa alosa and Alosa fallax

Laura Taillebois , Stephen Sabatino , Aurélie Manicki , Françoise Daverat , David José Nachon et al.

Evolutionary Applications, 2020, 13 (4), pp.636-651. ⟨10.1111/eva.12889⟩

Article dans une revue hal-02437628v1
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Fast sequence-based microsatellite genotyping development workflow

Olivier Lepais , Emilie Chancerel , Christophe Boury , Franck Salin , Aurélie Manicki et al.

PeerJ, 2020, 8, pp.1-28. ⟨10.7717/peerj.9085⟩

Article dans une revue hal-02936408v1

Disentangling individual movement between populations from effective dispersal in the facultative anadromous Salmo trutta L.

Séverine Masson , Olivier Lepais , Aurélie Manicki , Etienne Prévost , Joëlle Chat

Ecology of Freshwater Fish, 2018, 27 (1), pp.323-338. ⟨10.1111/eff.12349⟩

Article dans une revue hal-01604159v1

Estimating the effective number of breeders from single parr samples for conservation monitoring of wild populations of Atlantic salmon Salmo salar

Cécile Fanny Emilie Bacles , Colin Bouchard , Frédéric Lange , Aurélie Manicki , Cédric Tentelier et al.

Journal of Fish Biology, 2018, 92 (3), pp.699-726. ⟨10.1111/jfb.13537⟩

Article dans une revue hal-01716615v1
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DNA methylation of the promoter region of bnip3 and bnip3l genes induced by metabolic programming

Vincent Veron , Lucie Marandel , Jingwei Liu , Emilio J. Vélez , Olivier Lepais et al.

BMC Genomics, 2018, 19 (1), ⟨10.1186/s12864-018-5048-4⟩

Article dans une revue hal-01880453v1

Testing mate choice and overdominance at MH in natural families of Atlantic salmon Salmo salar

Cédric Tentelier , O. Barroso-Gomila , Olivier Lepais , Aurélie Manicki , I. Romero Garmendia et al.

Journal of Fish Biology, 2017, 90 (4), pp.1644-1659. ⟨10.1111/jfb.13260⟩

Article dans une revue hal-01606516v1
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Genetic architecture of threshold reaction norms for male alternative reproductive tactics in Atlantic salmon (Salmo salar L.)

Olivier Lepais , Aurélie Manicki , Stéphane Glise , Mathieu Buoro , Agnes Bardonnet

Scientific Reports, 2017, 7 (43552), ⟨10.1038/srep43552⟩

Article dans une revue hal-01607585v1
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With our powers combined: integrating behavioral and genetic data to estimate mating success and sexual selection

Zoé Gauthey , Cédric Tentelier , Olivier Lepais , Arturo Elosegi , Laura Royer et al.

Rethinking Ecology, 2017, 2, pp.1-26. ⟨10.3897/rethinkingecology.2.14956⟩

Article dans une revue hal-01588622v1

Sexual selection leads to a tenfold difference in reproductive success of alternative reproductive tactics in male Atlantic salmon

Cédric Tentelier , Olivier Lepais , Nicolas Larranaga , Aurélie Manicki , Frédéric Lange et al.

The Science of Nature Naturwissenschaften, 2016, 103 (5-6), 13 p. ⟨10.1007/s00114-016-1372-1⟩

Article dans une revue hal-01901385v1
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Remodelling of the hepatic epigenetic landscape of glucose-intolerant rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) by nutritional status and dietary carbohydrates

Lucie Marandel , Olivier Lepais , Eva Arbenoits , Vincent Veron , Karine Dias et al.

Scientific Reports, 2016, 6, 12 p. ⟨10.1038/srep32187⟩

Article dans une revue hal-01901393v1
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Space use and its effects on reproductive success of anadromous Atlantic salmon

Cédric Tentelier , Nicolas Larranaga , Olivier Lepais , Aurélie Manicki , Jacques Rives et al.

Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 2016, 73 (10), pp.1461-1471. ⟨10.1139/cjfas-2015-0518⟩

Article dans une revue hal-01901387v1
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Genetic Structure of a Natural Oak Community in Central Italy: Evidence of Gene Flow between Three Sympatric White Oak Species (Quercus, Fagaceae)

Gaby Antonecchia , Paola Fortini , Olivier Lepais , Sophie Gerber , Patrick Legér et al.

Annals of Forest Research, 2015, 58 (2), pp.205-216-216. ⟨10.15287/afr.2015.415⟩

Article dans une revue hal-02139663v1

The concentration of plasma metabolites varies throughout reproduction and affects offspring number in wild brown trout (Salmo trutta)

Zoé Gauthey , Marine Freychet , Aurélie Manicki , Alexandre Herman , Olivier Lepais et al.

Comparative Biochemistry and Physiology - Part A: Molecular and Integrative Physiology, 2015, 184, pp.90-96. ⟨10.1016/j.cbpa.2015.01.025⟩

Article dans une revue istex hal-01901347v1
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Genetic evidence of hybridization between the endangered native species Iguana delicatissima and the invasive Iguana iguana (Reptilia, Iguanidae) in the Lesser Antilles: management Implications

Barbara Vuillaume , Victorien Valette , Olivier Lepais , Frederic Grandjean , Michel Breuil

PLoS ONE, 2015, 10 (6), ⟨10.1371/journal.pone.0127575⟩

Article dans une revue (article de synthèse) hal-01901355v1

Two are better than one: combining landscape genomics and common gardens for detecting local adaptation in forest trees

Olivier Lepais , Cécile Fanny Emilie Bacles

Molecular Ecology, 2014, 23 (19), pp.4671-4673. ⟨10.1111/mec.12906⟩

Article dans une revue hal-02630547v1

SimRAD: an R package for simulation-based prediction of the number of loci expected in RADseq and similar genotyping by sequencing approaches.

Olivier Lepais , Jason T Weir

Molecular Ecology Resources, 2014, 14 (6), pp.1314-1321. ⟨10.1111/1755-0998.12273⟩

Article dans une revue istex hal-02633536v1
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High genetic diversity and distinctiveness of rear-edge climate relicts maintained by ancient tetraploidisation for Alnus glutinosa

Olivier Lepais , Serge D Muller , Samia Ben Saad-Limam , Mohamed Benslama , Laïla Rhazi et al.

PLoS ONE, 2013, 8 (9), 11 p. ⟨10.1371/journal.pone.0075029⟩

Article dans une revue hal-02644159v1

Strength and variability of postmating reproductive isolating barriers between four European white oak species

Olivier Lepais , Guy G. Roussel , Hubert François , Antoine Kremer , Sophie Gerber

Tree Genetics and Genomes, 2013, 9 (3), pp.841-853. ⟨10.1007/s11295-013-0602-3⟩

Article dans une revue istex hal-02650757v1

Leaf shape and size differentiation in white oaks : assessment of allometric relationships among three sympatric species and their hybrids

Vincenzo Viscosi , Gaby Antonecchia , Olivier Lepais , Paola Fortini , Sophie Gerber et al.

International Journal of Plant Sciences, 2012, 173 (8), pp.875-884. ⟨10.1086/667234⟩

Article dans une revue hal-02647636v1

Triploid bumblebees indicate a direct cost of inbreeding in fragmented populations

B. Darvill , Olivier Lepais , L.C. Woodall , D. Goulson

Molecular Ecology, 2012, 21 (16), pp.3988-3995. ⟨10.1111/j.1365-294X.2012.05679.x⟩

Article dans une revue istex hal-02651484v1

Genetic variation and population decline of an endangered hoverfly Blera fallax (Diptera : Syrphidae)

E.L. Rotheray , Olivier Lepais , A. Nater , M. Krützen , M. Greminger et al.

Conservation Genetics, 2012, 13 (5), pp.1283-1291. ⟨10.1007/s10592-012-0371-9⟩

Article dans une revue istex hal-02651829v1

Reconstructing demographic events from population genetic data: the introduction of bumblebees to New Zealand

G. C. Lye , Olivier Lepais , D. Goulson

Molecular Ecology, 2011, 20 (14), pp.2888-2900. ⟨10.1111/j.1365-294X.2011.05139.x⟩

Article dans une revue istex hal-02649972v1

Reproductive patterns shape introgression dynamics and species succession within the european white oak species complex

Olivier Lepais , Sophie Gerber

Evolution - International Journal of Organic Evolution, 2011, 65 (1), pp.156-170. ⟨10.1111/j.1558-5646.2010.01101.x⟩

Article dans une revue hal-02651325v1

Thirteen microsatellites developed by SSR-enriched pyrosequencing for Solanum rostratum (Solanaceae) and related species

M. Vallejo-Marin , L. Solis-Montero , Cécile Fanny Emilie Bacles , Olivier Lepais

American Journal of Botany, 2011, 98 (10), pp.e296-e299. ⟨10.3732/ajb.1100159⟩

Article dans une revue hal-02646317v1

Population structure, dispersal and colonization history of the garden bumblebee Bombus hortorum in the Western Isles of Scotland

D. Goulson , J. C. Kaden , Olivier Lepais , G. C. Lye , B. Darvill

Conservation Genetics, 2011, 12 (4), pp.867-879. ⟨10.1007/s10592-011-0190-4⟩

Article dans une revue istex hal-02652253v1

De Novo Discovery and Multiplexed Amplification of Microsatellite Markers for Black Alder (Alnus glutinosa) and Related Species Using SSR-Enriched Shotgun Pyrosequencing

Olivier Lepais , Cécile Fanny Emilie Bacles

Journal of Heredity, 2011, 102 (5), pp.627-632. ⟨10.1093/jhered/esr062⟩

Article dans une revue hal-02649970v1

Comparison of random and SSR-enriched shotgun pyrosequencing for microsatellite discovery and single multiplex PCR optimization in Acacia harpophylla F. Muell. Ex Benth

Olivier Lepais , Cécile Fanny Emilie Bacles

Molecular Ecology Resources, 2011, 11 (4), pp.711-724. ⟨10.1111/j.1755-0998.2011.03002.x⟩

Article dans une revue istex hal-02644253v1

Current trends in microsatellite genotyping

Erwan Guichoux , Lelia L. Lagache , Stefanie Wagner , Philippe Chaumeil , Patrick P. Léger et al.

Molecular Ecology Resources, 2011, 11 (4), pp.591-611. ⟨10.1111/j.1755-0998.2011.03014.x⟩

Article dans une revue istex hal-02652759v1

Cryptic differences in dispersal lead to differential sensitivity to habitat fragmentation in two bumblebee species

B. Darvill , S. O’connor , G. C. Lye , J. Waters , Olivier Lepais et al.

Molecular Ecology, 2010, 19 (1), pp.53-63. ⟨10.1111/j.1365-294X.2009.04423.x⟩

Article dans une revue istex hal-02666965v1

Effects of land use at a landscape scale on bumblebee nest density and survival

Dave Goulson , Olivier Lepais , Stéphanie O’connor , Juliet L. Osborne , Roy A. Sanderson et al.

Journal of Applied Ecology, 2010, 47 (6), pp.1207-1215. ⟨10.1111/j.1365-2664.2010.01872.x⟩

Article dans une revue hal-02666152v1

Estimation of bumblebee queen dispersal distances using sibship reconstruction method

Olivier Lepais , Ben Darvill , Stéphanie O’connor , Juliet L. Osborne , Roy A. Sanderson et al.

Molecular Ecology, 2010, 19 (4), pp.819-831. ⟨10.1111/j.1365-294X.2009.04500.x⟩

Article dans une revue istex hal-02661910v1

Leaf morphological analyses in four European oak species (Quercus) and their hybrids: A comparison of traditional and geometric morphometric methods

Vincenzo Viscosi , Olivier Lepais , Sophie Gerber , P. Fortini

Plant Biosystems, 2009, 143 (3), pp.564-574. ⟨10.1080/11263500902723129⟩

Article dans une revue hal-02668459v1

Species relative abundance and direction of introgression in oaks

Olivier Lepais , Remy R. Petit , Erwan Guichoux , J. E. Lavabre , Florian Alberto et al.

Molecular Ecology, 2009, 18 (10), pp.2228 - 2242. ⟨10.1111/j.1365-294X.2009.04137.x⟩

Article dans une revue istex hal-02665530v1

Phylogeography of north african atlas cedar (cedrus atlantica, pinaceae): combined molecular and fossil data reveal a complex quaternary history

Anass Terrab , Arndt Hampe , Olivier Lepais , Salvador Talavera , Errol Vela et al.

American Journal of Botany, 2008, 95 (10), pp.1262-1269. ⟨10.3732/ajb.0800010⟩

Article dans une revue hal-02660991v1

Characterization and identification of tunisian olive tree varieties by microsatellite markers

Imen Rekik , Amelia Salimonti , Sophie Gerber , Olivier Lepais , Enzo Perri et al.

HortScience, 2008, 43 (5), pp.1371-1376

Article dans une revue hal-02662168v1

High throughput microsatellite genotyping in oak species

Olivier Lepais , Valérie V. Léger , Sophie Gerber

Silvae Genetica, 2006, 55 (4-5), pp.238-240

Article dans une revue hal-02661668v1

Les travaux d’ECOVEA sur les espèces exotiques envahissantes

Aurélien Jamoneau , Vincent Bertrin , Gwilherm Jan , Olivier Lepais

Journées Techniques sur la gestion des déchets des plantes exotiques envahissantes, Oct 2025, Cestas, Gazinet, France

Communication dans un congrès hal-05320312v1
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Diversité génétique des communautés à isoétides des lacs et des étangs du littoral Aquitain

Estelle Debailleul , Aurélien Jamoneau , Olivier Lepais

Journée des doctorants de l'école doctorale Sciences et environnements, Ecole doctorale Sciences et Environnement n°304, Feb 2025, Bordeaux, France

Communication dans un congrès hal-05226978v1

Microbiome-Metabolome association approach to unravel the relationship between taxonomic and functional biodiversity in freshwater periphyton facing global change

Nicolas Creusot , Arthur Medina , Alidou Sana , Mélissa Eon , Zoé Delporte et al.

20. Annuel conference of the Metabolomics Society, Metabolomics Society, Jun 2024, Osaka (JP), Japan

Communication dans un congrès hal-04734680v1
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Biodiversity of the isoetid communities in Aquitaine shallow lakes: a conservation genetic perspective

Estelle-Marie Debailleul , Aurélien Jamoneau , Olivier Lepais

6èmes Journées Internationales de Limnologie et Océanographie, Association Française de Limnologie, Oct 2024, Pessac (33), France

Communication dans un congrès hal-05226989v1

Feline ecology in French Guiana: a Participatory Sciences and molecular non-invasive approach

Niklas Tysklind , Stéphanie Barthe , Valérie Troispoux , Maxime Galan , Erwan Guichoux et al.

Labex CEBA annual meeting 2024, LabEx CEBA, Oct 2024, Cayenne, French Guiana

Communication dans un congrès hal-04736342v1

Conserving genomic diversity in tropical trees from French Guiana

Myriam Heuertz , Julien Bonnier , Sylvain Schmitt , Olivier Lepais , Emilie Chancerel et al.

7th European Congress on Conservation Biology, SCB, Jun 2024, Bologna, Italy

Communication dans un congrès hal-04702058v1
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Genetic and taxonomic diversity of isoetid communities in Aquitaine shallow lakes

Estelle-Marie Blanquart , Aurélien Jamoneau , Olivier Lepais

16. International Symposium on Aquatic Plants, International Aquatic Plants Group, Nov 2023, Antwerp, Belgium

Communication dans un congrès hal-04382438v1
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Plant mutations: slaying beautiful hypotheses by surprising evidence

Niklas Tysklind , Sylvain Schmitt , Patrick Heuret , Valérie Troispoux , Mélanie Beraud et al.

EVOLTREE Conference 2023 - Resilient Forests for the Future, UNITBV, Brașov, Romania, Sep 2023, Brasov, Romania. ⟨10.31926/evoltree.2023⟩

Communication dans un congrès hal-04664198v1

Food for models : knowledge on metapopulation functioning and marine use of European shads (Alosa alosa and Alosa fallax

Françoise Daverat , Marie-Laure Acolas , C Antunes, , Agnes Bardonnet , Gilles Bareille et al.

Annual ICES Meeting, International Council for the Exploration of the Sea, Sep 2023, Bilbao, Spain

Communication dans un congrès hal-04235807v1

NGS : New-genotyping strategies

Olivier Lepais , Eric Petit

Réunion du réseau de génétique du Département EFPA, May 2019, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-02791697v1
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Estimation du nombre de reproducteurs efficaces : un nouvel indicateur de l’état des populations

Olivier Lepais , Cécile Fanny Emilie Bacles , Frédéric Lange , Aurélie Manicki

Journée Scientifique et technique du Pôle Migrateurs INRA AFB, Jun 2019, Paris, France. 12 p

Communication dans un congrès hal-02791159v1
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Hybridation entre l’alose vraie et la grande alose sur la façade Atlantique Française : causes et conséquences pour leur conservation

Olivier Lepais , Laura Taillebois

Réunion du réseau de génétique du Département EFPA, May 2019, Montpellier, France

Communication dans un congrès hal-02791213v1
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Approches moléculaires pour étudier l'effet de l'utilisation des terres d'un paysage agricole sur les populations de bourdons

Olivier Lepais

Rencontre d'écologie des paysages, Nov 2019, Bordeaux, France

Communication dans un congrès hal-02791503v1
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Génotypage de microsatellites par séquençage : aspects méthodologiques et analytiques

Olivier Lepais , Christophe Boury , Emilie Chancerel , Aurélie Manicki , Franck Salin et al.

Réunion du réseau de génétique du Département EFPA, May 2018, Avignon, France

Communication dans un congrès hal-02791698v1

Estimation du nombre de reproducteurs efficaces (NombReEff) : un nouvel indicateur de l'état des populations

Cécile Fanny Emilie Bacles , Frédéric Lange , Aurélie Manicki , Olivier Lepais

Réunion du réseau de génétique du Département EFPA, Jun 2017, Orléans, France. 16 diapos

Communication dans un congrès hal-01603135v1

Cost-efficient estimation of effective population size from single parr sample for Atlantic salmon conservation monitoring of rear-edge populations in southern France

Olivier Lepais , Frédéric Lange , Aurélie Manicki , Cécile Fanny Emilie Bacles

Fisheries Society of the British Isles Annual Symposium, Jul 2017, Exeter, United Kingdom

Communication dans un congrès hal-01605318v1

Développement rapide de marqueurs SNP pour l’aide à la gestion de la truite commune (Salmo trutta L.) dans le bassin de l’Adour

Charlotte Urien , Joëlle Chat , Aurélie Manicki , Christophe Boury , Franck Salin et al.

38. Réunion Annuelle du Groupe d'Etude de Biologie et Génétique des Populations, Jun 2017, Paris Saclay, France

Communication dans un congrès hal-01603236v1

Estimating movement and effective dispersal in a partially migratory fish

Séverine Masson , Joëlle Chat , Aurélie Manicki , Francois Gueraud , Jacques Rives et al.

Annual Meeting of the Ecological Genetics Group, Apr 2016, Aberystwyth, United Kingdom

Communication dans un congrès hal-01608138v1

Population genomics of early male parr maturation in Atlantic salmon natural populations

Olivier Lepais , Aurélie Manicki , Stéphane Glise , Agnes Bardonnet

Fisheries Society of the British Isles Annual Symposium, Jul 2016, Bangor, United Kingdom

Communication dans un congrès hal-02741168v1
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Planification d’expérience RADseq : approche par simulation.

Olivier Lepais

Approches RADseq pour l'étude de la biodiversité, Groupement de Recherche Génomique Environnementale (GDR3692). FRA., Nov 2016, Paris, France

Communication dans un congrès hal-02799371v1

Génétique de la maturation chez le saumon Atlantique

Olivier Lepais , Stéphane Glise , Francois Gueraud , Jacques Rives , Aurélie Manicki et al.

Réunion du réseau de génétique du Département EFPA, Oct 2015, Rennes, France. 13 diapos

Communication dans un congrès hal-02797408v1

Aspects génomiques de la maturation précoce chez les tacons mâles

Olivier Lepais

Réunion du Réseau Spam Salmonades du Département EFPA, Nov 2015, Thonon-les-Bains, France. 16 diapos

Communication dans un congrès hal-02798305v1

Des Pyrénées aux Alpes, la sélection sexuelle dans tous ses états chez la truite commune

Zoé Gauthey , Jordi Gil , Marine Freychet , Laura Royer , Elie Chantriaux et al.

Réunion du Réseau Spam Salmonades du Département EFPA, Nov 2015, Thonon les Bains, France. 35 diapos

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Do sea trout migrations promote interbasin connectivity between populations?

Joëlle Chat , Séverine Masson , Aurélie Manicki , Francois Gueraud , Jacques Rives et al.

2. International Sea Trout Symposium, Inland Fisheries Ireland. IRL., Oct 2015, Dundalk, Ireland

Communication dans un congrès hal-02742521v1

Simulation pour la prévision du nombre de locus ciblés par les approches de Génotypage par Séquençage

Olivier Lepais , Franck F. Salin , Christophe C. Boury , Erwan Guichoux , Yec'Han Laizet et al.

Réunion du réseau de génétique du Département EFPA, Nov 2014, Nancy, France

Communication dans un congrès hal-02799259v1

Paternal inheritance of alternative mating tactics in male Atlantic salmon: Toward an integrated population genomics perspective.

Olivier Lepais , Stéphane Glise , Francois Gueraud , Jacques Rives , Aurélie Manicki et al.

2. International Conference on Integrative Salmonid Biology, Jun 2014, Vancouver, Canada

Communication dans un congrès hal-02797180v1

Paternal inheritance of alternative mating tactics in male Atlantic salmon

Olivier Lepais , Stéphane Glise , Francois Gueraud , Jacques Rives , Aurélie Manicki et al.

BES-SFE Joint 2014 Annual Meeting, Dec 2014, Lille, France

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Diversité et structuration génétique des chênes à l’échelle de deux paysages : impact de l’écologie, de l’histoire et de la gestion

Olivier Lepais , Jessica Lavabre , Maya Gonzalez , Jerome Willm , Alain A. Cabanettes et al.

6. Colloque national du BRG. Ressources génétiques : des ressources partagées, Oct 2006, La Rochelle, France

Communication dans un congrès hal-02758287v1
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Diversité taxonomique et génétique des communautés à isoétides des lacs du littoral aquitain

Estelle-Marie Blanquart , Aurélien Jamoneau , Olivier Lepais

Doctoriales de la biodiversité 2023, Feb 2023, Biarritz, France

Poster de conférence hal-04382428v1
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Genetic and taxonomic diversity of Aquitaine coast lakes isoetid communities

Estelle-Marie Blanquart , Aurélien Jamoneau , Olivier Lepais

13th Symposium for European Freshwater Sciences, Jun 2023, Newcastle, United Kingdom. 2023

Poster de conférence hal-04207311v1
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Fast sequence-based microsatellite genotyping development workflow for any non-model species

Olivier Lepais , Emilie Chancerel , Christophe Boury , Franck Salin , Aurélie Manicki et al.

5. Colloque du GDR Génomique environnementales, 2019, La Rochelle, France. 2019

Poster de conférence hal-02791502v1

Impact of low flow on y-o-y Atlantic salmon : density-dependent and density-independent factors interact to decrease population resilience

Agnes Bardonnet , Olivier Lepais , Valérie Bolliet , Stéphane Panserat , Jean-Claude Salvado et al.

Fisheries Society of the British Isles Annual Symposium, Jul 2017, Exeter, United Kingdom. 162 p., 2017, Understanding fish populations. Symposium handbook

Poster de conférence hal-01604281v1

Sea trout migrations and management practices

Joëlle Chat , Séverine Masson , Aurélie Manicki , Francois Gueraud , Jacques Rives et al.

FSBI 2016. Annual symposium of the Fisheries Society of the British Isles, Jul 2016, Bangor, United Kingdom. , 1 p., 2016

Poster de conférence hal-01901394v1

Effects of density, environment and parental origin on Y-O-Y Atlantic salmon survival, growth and early maturation

Agnes Bardonnet , Olivier Lepais

Advances in the Population Ecology of Stream Salmonids, May 2015, Girona, Spain. , 62 p., 2015, Advances in the population ecology of stream salmonids - 4

Poster de conférence hal-01901357v1

Sex in space : how space use affects reproductive success of anadromous Atlantic salmon

Cédric Tentelier , Olivier Lepais , Nicolas Larranaga

Advances in the Population Ecology of Stream Salmonids, May 2015, Girona, Spain. , 62 p., 2015, Advances in the population ecology of stream salmonids - 4

Poster de conférence hal-01901361v1

Individual reproductive success of Atlantic salmon male alternative mating tactics in the wild

Cédric Tentelier , Olivier Lepais , Nicolas Larranaga

Advances in the Population Ecology of Stream Salmonids, May 2015, Girona, Spain. , 62 p., 2015, Advances in the population ecology of stream salmonids - 4

Poster de conférence hal-01901360v1

Genotyping By Sequencing development for Salmo salar: A simulation-based predictive approach using the R package SimRAD.

Olivier Lepais , Franck F. Salin , Christophe C. Boury , Erwan Guichoux , Yec'Han Laizet et al.

2. International Conference on Integrative Salmonid Biology, Jun 2014, Vancouver, Canada. , 2014

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Rapport intermédiaire du projet Vigie-Lacs

Vincent Bertrin , Sébastien Boutry , Estelle-Marie Debailleul , Alain Dutartre , Carine Fortin et al.

INRAE - EABX. 2025, pp.24

Rapport hal-05228361v1
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Rapport final du projet DIGEMAC "Diversité génétique dans le Massif central ". Mission d’accompagnement technique et méthodologique pour étudier la résilience des forêts face au changement climatique dans 3 parcs naturels régionaux (PNR) du Massif central. Financement dans le cadre du projet « Biodiversité de l’inter-parcs du Massif central ». Opération « Forêts anciennes volet 4 ».

Catherine Bodénès , Frédéric Jean , Olivier Lepais , Rémy Petit , Mehdi Pringarbe et al.

INRAE. 2025

Rapport hal-05228696v1
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Projet CRIJEST : Connectivité, cRoissance et Installation des Juvéniles de poissons dans les nourriceries ESTuariennes - Rapport final

Nils Teichert , Anne Lizé , Laure-Sarah Virag , Hélène Tabouret , Jézabel Lamoureux et al.

Muséum national d'Histoire naturelle; Station marine de Dinard; Office français de la biodiversité. 2024, 130 p

Rapport hal-04803899v1
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Projet CRIJEST : Connectivité, cRoissance et Installation des Juvéniles de poissons dans les nourriceries ESTuariennes

Nils Teichert , Anne Lizé , Éric Feunteun , Alexandre Carpentier , Laure-Sarah Virag et al.

Station marine de Dinard, Muséum National d’Histoire Naturelle. 2024

Rapport hal-05488647v1
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Les populations de truites de la Garonne (affluents girondins) et de la Leyre : génétique et scalimétrie

Joëlle Chat , Marin Tetillon , Aurélie Manicki , Francois Gueraud , Olivier Lepais

[Contrat] Fédération Départementale des Associations Agréées de Pêche et de Protection du Milieu Aquatique de la Gironde. 2018, 14 p. + annexes

Rapport (rapport contrat/projet) hal-02025839v1
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Estimation du nombre de reproducteurs efficaces : un nouvel indicateur de l’état des populations

Olivier Lepais

[Contrat] Inconnu. 2017, 42 p

Rapport (rapport contrat/projet) hal-02187476v1
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Dispersion et (re)colonisation du cours de la Sélune et de ses affluents

Eric Petit , Anthony Acou , Didier Azam , Agnes Bardonnet , Dominique D. Barloy et al.

[Rapport de recherche] Agence de l'Eau Seine-Normandie. 2016, pp.18

Rapport (rapport de recherche) hal-03357109v1
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Continuité écologique et conservation de la diversité génétique et écotypique d'un grand migrateur (Salmo trutta). Rapport final

Joëlle Chat , Aurélie Manicki , Francois Gueraud , Olivier Lepais

[Contrat] Inconnu. 2015, 55 p

Rapport (rapport contrat/projet) hal-01901356v1
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Étude comparée de la structuration génétique des chênes à l’échelle d’un paysage

Olivier Lepais

[Stage] Université des Sciences et Technologies (Bordeaux 1), Talence, FRA.; Université de Bordeaux Ségalen (Bordeaux 2), Bordeaux, FRA. 2004, 23 p

Rapport hal-02832233v1