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FBI DATA : une gestion FAIR et libre des données de bio-imagerie
Théo Barnouin
,
Emmanuel Faure
,
Perrine Gilloteaux
,
Jean-François Guillaume
,
Marc Mongy
et al.
JRES 2024 - Journées réseaux de l'enseignement et de la recherche, Renater, Dec 2024, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-04893882
v1
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How to describe bioimage data? Toward a community consensus, or how to create a metadata standard
Perrine Paul-Gilloteaux
Journée "Cycle de vie / Gestion des données de la biologie", Frédéric Brau, Apr 2024, Sophia Antipolis, France
Communication dans un congrès
hal-04555129
v1
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Linking and analyzing correlative datasets
Perrine Paul-Gilloteaux
ALL-HANDS NODES MEETINg&MORE, iNext DISCOVERY, Apr 2023, Heidelberg, Germany
Communication dans un congrès
hal-04217201
v1
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Correlative microscopies : comulisglobe and news from ec-clem
Perrine Paul-Gilloteaux
France BioImaging CLEM day: What's new in multimodal imaging, Mar 2023, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-04217188
v1
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Image analysis tools and applications for correlative microscopy
Perrine Paul-Gilloteaux
Séminaire de l'Institut de Génétique & Développement de Rennes, Apr 2023, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-04217158
v1
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Development of correlation software for Correlative cryo light Soft X-Ray Tomography : example of 3d correlative cryo-structured illumination fluorescence and soft x-ray microscopy to ellucidate reovirus intracellular release pathway
Perrine Paul-Gilloteaux
INSTRUCT Soft X-ray Tomography workshop, Sep 2023, Didcot, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-04217085
v1
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France Bio Imaging : setting up image data management solutions at the national level
Perrine Paul-Gilloteaux
BioImaging and the European Open Science Cloud, EOSC-Life, Apr 2023, Heidelberg, Germany
Communication dans un congrès
hal-04217222
v1
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Correlative microscopies : image registration for clem and for deep learning What can bring error estimation ?
Perrine Paul-Gilloteaux
Colloque Français d'Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédicale, Instituts 3IA MIAI, 3IA Cote d'Azur et PRAIRIE, Mar 2023, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-04217245
v1
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La tomographie par cohérence optique plein champ : un nouvel outil de microscopie optique dynamique pour l'analyse du système nerveux entérique
T Durand
,
L Laboudie
,
Perrine Paul-Gilloteaux
,
Isabelle Neveu
,
Philippe Naveilhan
et al.
JFHOD, Mar 2022, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-03548856
v1
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Image processing and analysis in clem : methods and pitfalls
Perrine Paul-Gilloteaux
Symposium on recent developments in cellular electron microscopy, AVIESAN ITMO MOLECULAR AND STRUCTURAL BASIS OF LIFE SCIENCES, Mar 2022, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-04217262
v1
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Correlative microscopies: image registration for CLEM and for Deep Learning
Perrine Paul-Gilloteaux
Crick BioImage Analysis Symposium (CBIAS), Nov 2022, Londres (London), United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-04217278
v1
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EcClemv2: A new version of a flexible software for correlative workflows
Perrine Paul-Gilloteaux
,
Guillaume Potier
,
Frédéric Lavancier
COMULIS Conference, Sep 2021, Gothenburg, Sweden
Communication dans un congrès
hal-04219791
v1
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A Registration Error Estimation Framework for Correlative Imaging
Guillaume Potier
,
Frederic Lavancier
,
Stephan Kunne
,
Perrine Paul-Gilloteaux
Communication dans un congrès
hal-03327500
v1
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Méthodes et écueils du traitement des images issues de microscopie corrélative
Perrine Paul-Gilloteaux
6eme rencontre des microscopistes clermontois, Igred et Inrae, Oct 2021, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès
hal-04214182
v1
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A FULL 3D CORRELATIVE IMAGING WORKFLOW: CHALLENGES IN COMPUTER VISION
Perrine Paul-Gilloteaux
,
Nina Vyas
,
Guillaume Potier
,
Stephan Kunne
,
Thomas M Fish
et al.
IEEE ISBI 2021 (VIRTUAL)., Apr 2021, Nice, France
Communication dans un congrès
hal-03258718
v1
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Quantification: extracting quantitative information from correlated multimodal dataset
Perrine Paul-Gilloteaux
IMAGE PROCESSING FOR CORRELATED AND MULTIMODAL IMAGING TECHNIQUES, VIB Training, Oct 2020, Ghent, Belgium
Communication dans un congrès
hal-04214173
v1
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Leveraging Molecular and Cellular Fiducial Markers for Correlative Bio-Imaging
Chidinma Okolo
,
Ilias Kounatidis
,
Thomas Fish
,
Perrine Paul-Gilloteaux
,
Ian Dobbie
et al.
Quantitative BioImaging, Jan 2020, Oxford, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-04219534
v1
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French gastronomy and bio image analysis workflows
Perrine Paul-Gilloteaux
Virtual Analytical and Quantitative Microscopy, May 2020, Woods Hole, United States
Communication dans un congrès
hal-02736886
v1
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Cross-modal registration using point clouds and graph-matching in the context of correlative microscopies
Stephan Kunne
,
Guillaume Potier
,
Jean Merot
,
Perrine Paul-Gilloteaux
iTWIST : international Traveling Workshop on Interactions between low-complexity data models and Sensing Techniques, Dec 2020, Nantes, France
Communication dans un congrès
hal-03039114
v1
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Le dorica castra des images
Perrine Paul-Gilloteaux
,
Laurence Dubreil
Nuit Blanche des Chercheurs, Feb 2020, Nantes, France
Communication dans un congrès
hal-02509532
v1
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Les bases de données images: limitations et aspirations
Perrine Paul-Gilloteaux
Journée partenaire industriel GDR IMABIO, Jun 2019, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02745126
v1
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Interdisciplinarity in a (still short) carreer: living and contributing to the creation of a new research field in biomedical image informatics.
Perrine Paul-Gilloteaux
Opening conference of Angers Summer schools, Jun 2019, Angers, France
Communication dans un congrès
hal-02745462
v1
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An in Vitro and in Silico Validation Study for PC MRI and Derived Bio‐markers
Marco Castagna
,
Sébastien Levilly
,
Perrine Paul-Gilloteaux
,
Félicien Bonnefoy
,
Jérôme Idier
et al.
31st Society for Magnetic Resonance Angiography conference (SMRA 2019), Aug 2019, Nantes, France
Communication dans un congrès
hal-03130185
v1
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Introduction to Correlation Software in CLEM
Perrine Paul-Gilloteaux
Correlated Multimodal Imaging Conference, Nov 2019, Vienne, Austria
Communication dans un congrès
hal-02744299
v1
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NEUBIAS: BIOIMAGE ANALYSTS NETWORK TO SUPPORT LIFE SCIENTISTS THROUGH TRAINING, ONLINE TOOLS REPOSITORIES AND BENCHMARKING DEPLOYMENT FOR BIOIMAGE ANALYSIS WORKFLOWS
Kota Miura
,
Sebastian Munck
,
Florian Levet
,
Gabriel Martins
,
Fabrice Cordelières
et al.
Focus on Microscopy, Apr 2019, Londres, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-02746229
v1
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Introduction to transformations and registrations
Perrine Paul-Gilloteaux
,
Martin Schorb
High-Accuracy CLEM: Applications at Room Temperature and in cryo, Apr 2019, Heidelberg, Germany
Communication dans un congrès
hal-02746707
v1
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Advanced Image analysis
Perrine Paul-Gilloteaux
Analytical & Quantitative Light Microscopy, May 2019, Woods Hole, United States
Communication dans un congrès
hal-02736802
v1
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RECALAGE EN MICROSCOPIES CORRÉLATIVES POUR LA CARACTÉRISATION PHYSIOPATHOLOGIQUE DE LA VALVULOPATHIE
Perrine Paul-Gilloteaux
16eme colloque de la société Française des Microscopies, Jul 2019, Poitiers, France
Communication dans un congrès
hal-02745967
v1
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|
Linking cell scales: methods and software for correlative imaging workflows
Perrine Paul-Gilloteaux
La microscopie électronique pour les sciences du vivant. Journées Scientifiques de l'Université de Nantes, Jun 2019, Nantes, France
Communication dans un congrès
hal-02745260
v1
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Automatic Registration of Correlative Microscopies with Error Assessment and Applications for the Optimization of Multimodal Acquisitions
Perrine Paul-Gilloteaux
SCANDEM 2019, Jun 2019, Gothenburg, Sweden
Communication dans un congrès
hal-02736339
v1
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Computer vision methods for multidimensional correlative microscopies
Perrine Paul-Gilloteaux
Journées communes des GdR MIA et ImaBio "Microscopie et traitement d'image", Nov 2018, Strasbourg, France
Communication dans un congrès
hal-02736491
v1
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Automatic registration for multidimensional correlative microscopies with error assessment and detections of deformations
Perrine Paul-Gilloteaux
International Microscopy Congress, Sep 2018, Sydney, Australia
Communication dans un congrès
hal-02736564
v1
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Computer vision methods for multidimensional correlative microscopies: optimizing acquisitions using maths
Perrine Paul-Gilloteaux
Colloqium: Future Microscopy and Analysis, Nov 2018, Ghent, Belgium
Communication dans un congrès
hal-02736454
v1
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Constructing workflows in Bio Image Analysis
Perrine Paul-Gilloteaux
Analytical & Quantitative Light Microscopy, May 2018, Woods Hole, United States
Communication dans un congrès
hal-02736843
v1
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Bio-Imagerie: mathématiques et informatique pour la compréhension du vivant
Perrine Paul-Gilloteaux
Immersion Science, Mar 2018, Ile Tudy, France
Communication dans un congrès
hal-02736939
v1
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Bio-image DATA in Life Sciences Research Infrastructures. From SCRATCH to intelligent integrated solutions
Perrine Paul-Gilloteaux
Storage Day, Jan 2018, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02737009
v1
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COMULIS, a new network to bridge (pre) clinical imaging and correlative Light Electron microscopy. Focus on multidimensional registration software
Perrine Paul-Gilloteaux
ASCB-EMBO 2018, Dec 2018, San Diego, United States
Communication dans un congrès
hal-02736408
v1
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|
Besoins en bio-informatique liés àl’activité de l’infrastructure nationale France Bio Imaging
Perrine Paul-Gilloteaux
Assemblée générale de l'INBS Institut Français de Bioinformatique, Jan 2017, paris, France
Communication dans un congrès
hal-02747035
v1
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Le recalage d'image sous ICY
Perrine Paul-Gilloteaux
,
Xavier Heiligenstein
Journée Thématique conjointe sur le repositionnement et la relocalisation/recalage, Nov 2017, Orléans, France
Communication dans un congrès
hal-02746899
v1
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Challenges in image correlation for CLEM (and partial solutions)
Perrine Paul-Gilloteaux
Crick Electron Microscopy Opening Symposium, Jul 2017, Londres, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-02747126
v1
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Introduction to transformations and registrations
Perrine Paul-Gilloteaux
,
Martin Schorb
High-Accuracy CLEM: Applications at Room Temperature and in cryo, Dec 2017, Heidelberg, Germany
Communication dans un congrès
hal-02746508
v1
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Filtrage spatio-temporel en IRM de flux sanguin 4D
Sébastien Levilly
,
Jérôme Idier
,
Félicien Bonnefoy
,
David Le Touzé
,
Perrine Paul-Gilloteaux
et al.
XXVIème colloque GRETSI sur le Traitement du Signal et des Images, Sep 2017, Juan-Les-Pins, France
Communication dans un congrès
hal-01720339
v1
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Flexible multidimensional registration software for correlative microscopies with refined accuracy mapping: eC-CLEM easy Cell Correlative Light to Electron Microscopy
Perrine Paul-Gilloteaux
Symposium and Workshop on correlative light, electron, and X-ray microscopy, Mar 2017, Harwell, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-02747152
v1
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Gestion et analyse d’images à moyen débit : exemple en microscopie confocale et sur lames virtuelles
Perrine Paul-Gilloteaux
Quand la bio-imagerie rencontre la bio-informatique : vers une intégration des données hétérogènes. Journée d'animation Biogenouest, Oct 2017, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-02745560
v1
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Cycle de vie des images en microscopie : de l’acquisition au partage des données
Perrine Paul-Gilloteaux
La diversité tumorale à travers les plateformes technologiques franciliennes, Jan 2016, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02746957
v1
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|
Ec-CLEM: an open source plugin for CLEM image and volume registration
Perrine Paul-Gilloteaux
EMBL Workshop: From 3D Light to 3D Electron Microscopy, Mar 2016, Heidelberg, Germany
Communication dans un congrès
hal-02746474
v1
|
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Multiscale and multidimensional Image registration for CLEM : techniques and pitfalls
Perrine Paul-Gilloteaux
High-Accuracy Correlated Light and Electron Microscopy: Applications at Room Temperature and in Cryo, Apr 2016, Heildelberg, Germany
Communication dans un congrès
hal-02746687
v1
|
|
Le numérique dans les biotechnologies: exemple de la bio imagerie
Perrine Paul-Gilloteaux
TechnoConférence Pole Image et Réseau #17, Jun 2016, Nantes, France
Communication dans un congrès
hal-02746143
v1
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Methodes de traitement et analyse d’images comme aide à la quantification des biomarqueurs en imagerie: de l’in vitro à la clinique
Perrine Paul-Gilloteaux
Ateliers du DHU2020, Jun 2015, Nantes, France
Communication dans un congrès
hal-02908867
v1
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Gestion du cycle de vie des images en microscopie pour la biologie: Extraction de connaissances à partir d’une base de données images
Perrine Paul-Gilloteaux
Séminaire de l'INRA OPEN DATA, Dec 2015, Montpellier, France
Communication dans un congrès
hal-02908891
v1
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Développement et déploiement d’une base de données image commune : bilan
Perrine Paul-Gilloteaux
,
Corinne Laplace-Builhé
Imagerie et cancers : optique et imagerie multiphotonique, Sep 2014, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02746819
v1
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Aggregation of patch-based estimations for illumination-invariant optical flow in live cell imaging
Denis Fortun
,
Patrick Bouthemy
,
Perrine Paul-Gilloteaux
,
Charles Kervrann
ISBI - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2013, San-Francisco, United States. pp.660-663, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556561⟩
Communication dans un congrès
hal-00931377
v1
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Correlation and variational approaches for motion and diffusion estimation in fluorescence imaging
Denis Fortun
,
Chen Chen
,
Perrine Paul-Gilloteaux
,
François Waharte
,
Jean Salamero
et al.
EUSIPCO 2013 - European Signal Processing Conference, Sep 2013, Marrakech, Morocco. pp.1-5
Communication dans un congrès
hal-00931408
v1
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Robust parametric stabilization of moving cells with intensity correction in light microscopy image sequences
Solene Ozere
,
Patrick Bouthemy
,
Fabien Spindler
,
Perrine Paul-Gilloteaux
,
Charles Kervrann
ISBI - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2013, San-Francisco, United States. pp.468-471, ⟨10.1109/ISBI.2013.6556513⟩
Communication dans un congrès
hal-00931371
v1
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Computational modeling of the consequences of embryonic neurogenesis disorders
Perrine Paul-Gilloteaux
,
Renata Basto
,
Veronique Marthiens
Communication dans un congrès
hal-02908946
v1
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|
Correlation and variational approaches for motion and diffusion estimation in fluorescence imaging
Denis Fortun
,
Chen Chen
,
Perrine Paul-Gilloteaux
,
François Waharte
,
Jean Salamero
et al.
European Light Microscopy Initiative (ELMI'13), May 2013, Arcachon, France
Communication dans un congrès
hal-00931593
v1
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Image Data Base on a microscopy facility: Presentation and use for remote collaborations
Perrine Paul-Gilloteaux
Nouvelles méthodologies en imagerie du vivant, Dec 2012, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-02746303
v1
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Developpement des methodes de correlation d images pour l analyse de la mobilite moleculaire dans un systeme biologique complexe spatialement et temporellement
C. Chen
,
P. Paul-Gilloteaux
,
T. Vignaud
,
J. Salamero
,
F. Waharte
OPTDIAG, May 2012, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02746408
v1
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Study of the 3D repartition of vesicles normalized by the distance to the cell periphery
Perrine Paul-Gilloteaux
,
Elisabetta Padovan
,
Claire L Hivroz
Focus On Microscopy, Apr 2011, Konstanz, Germany
Communication dans un congrès
hal-02746059
v1
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Automatic quality assessment for fluorescence microscopy images
Perrine Paul
,
Dimitrios Kalamatianos
,
Heiko Duessmann
,
Heinrich Huber
2008 8th IEEE International Conference on Bioinformatics and BioEngineering (BIBE), Oct 2008, Athens, France. pp.1-6, ⟨10.1109/BIBE.2008.4696665⟩
Communication dans un congrès
hal-02735370
v1
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Image Guidance in neurosurgical procedures, the "VISAGES" point of view
Christian Barillot
,
Pierrick Coupé
,
Bernard Gibaud
,
Pierre Hellier
,
Pierre Jannin
et al.
4th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging: From Nano to Macro, Apr 2007, Arlington, United States. pp.1056-1059, ⟨10.1109/ISBI.2007.357037⟩
Communication dans un congrès
inserm-00152147
v1
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Knowledge modeling in image guided neurosurgery: application in understanding intra-operative brain shift
Perrine Paul
,
Xavier Morandi
,
Pierre Jannin
,
Julien Cohen-Adad
SPIE Medical Imaging 2006: Visualization, Image-Guided Procedures and Display, Mar 2006, San Diego, United States. ⟨10.1117/12.655752⟩
Communication dans un congrès
inserm-00147527
v1
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A surface registration approach for video-based analysis of intraoperative brain surface deformations
Perrine Paul
,
Aurélie Quere
,
Élise Arnaud
,
Xavier Morandi
,
Pierre Jannin
Oct 2006, pp.0
Communication dans un congrès
inserm-00109455
v1
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Virtualité augmentée en neurochirurgie guidée par l'image
Perrine Paul
,
Oliver J. Fleig
,
Xavier Morandi
,
Pierre Jannin
2005, pp.99-104
Communication dans un congrès
inserm-00138138
v1
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Performance Evaluation of a Stereoscopic Based 3D Surface Localiser for Image-Guided Neurosurgery
Perrine Paul
,
Oliver J. Fleig
,
Sabine Tranchant
,
Pierre Jannin
Communication dans un congrès
hal-02735433
v1
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