Sofia STRUBBIA

Enseignant-chercheur en Santé Publique Vétérinaire, à Oniris VetAgro Bio Nantes
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Identifiants chercheurs

Présentation

Vétérinaire diplômée en Santé Publique et formée au concept « One Health », je suis enseignante-chercheuse à Oniris, et membre de l’UMR SECALIM, où je travaille sur la sécurité microbiologique des aliments. Mes recherches portent sur Campylobacter dans les filières industrielles (abattoirs et poulets de chair), en utilisant des approches de microbiologie et de génomique pour étudier la diversité génétique des souches, leur adaptation et leur variabilité. Mon parcours polyvalent me permet de collaborer avec des acteurs de différentes cultures scientifiques et de transmettre mes connaissances à la formation des futurs professionnels vétérinaires, contribuant ainsi à la santé humaine, animale et environnementale.


Compétences

Techniques de microbiologie et biologie moléculaire Métagénomique et analyse de données génomiques

Publications

Publications

Analyzing slaughter modalities and environmental factors to improve prediction of Campylobacter concentration in broiler carcasses

Francis Lauriau , Sofia Strubbia , Jean-Michel Cappelier , Benjamin Mahieu , Nabila Haddad et al.
Journal of Applied Poultry Research, 2026, 35 (2), pp.100662. ⟨10.1016/j.japr.2025.100662⟩
Article dans une revue hal-05450331 v1
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Harmonizing Campylobacter risk assessments across European countries – can the pooled process hygiene criteria data be used in the Danish risk assessment model ?

Francis Lauriau , Maarten Nauta , Nabila Haddad , Sofia Strubbia , Jean-Michel Cappelier et al.
Microbial Risk Analysis, 2024, 27-28, pp.100325. ⟨10.1016/j.mran.2024.100325⟩
Article dans une revue hal-04777973 v1

Use of Human Intestinal Enteroids to Evaluate Persistence of Infectious Human Norovirus in Seawater

Marion Desdouits , David Polo Montero , Cecile Le Mennec , Sofia Strubbia , Xi-Lei Zeng et al.
Emerging Infectious Diseases, 2022, 28 (7), pp.1475-1479. ⟨10.3201/eid2807.220219⟩
Article dans une revue hal-04203841 v1

Novel opportunities for NGS-based one health surveillance of foodborne viruses

Marion Desdouits , Miranda de Graaf , Sofia Strubbia , Bas B. Oude Munnink , Annelies Kroneman et al.
One Health Outlook, 2020, 2 (1), 14 (8p.). ⟨10.1186/s42522-020-00015-6⟩
Article dans une revue hal-04202614 v1

Metagenomic to evaluate norovirus genomic diversity in oysters: Impact on hexamer selection and targeted capture-based enrichment

Sofia Strubbia , Julien Schaeffer , Alban Besnard , Candice Wacrenier , Cecile Le Mennec et al.
International Journal of Food Microbiology, 2020, 323, 108588 (13p.). ⟨10.1016/j.ijfoodmicro.2020.108588⟩
Article dans une revue hal-04202540 v1

Metavirome Sequencing to Evaluate Norovirus Diversity in Sewage and Related Bioaccumulated Oysters

Sofia Strubbia , Julien Schaeffer , Bas B. Oude Munnink , Alban Besnard , My V. T. Phan et al.
Frontiers in Microbiology, 2019, 10 (2394), 13p. ⟨10.3389/fmicb.2019.02394⟩
Article dans une revue hal-04202419 v1

Characterization of Norovirus and Other Human Enteric Viruses in Sewage and Stool Samples Through Next-Generation Sequencing

Sofia Strubbia , My V. T. Phan , Julien Schaeffer , Marion Koopmans , Matthew Cotten et al.
Food and Environmental Virology, 2019, 11 (4), pp.400-409. ⟨10.1007/s12560-019-09402-3⟩
Article dans une revue hal-04202371 v1
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Occurrence of Bacterial Pathogens and Human Noroviruses in Shellfish-Harvesting Areas and Their Catchments in France

Alain Rincé , Charlotte Balière , Dominique Hervio-Heath , Joëlle Cozien , Solen Lozach et al.
Frontiers in Microbiology, 2018, 9, pp.2443. ⟨10.3389/fmicb.2018.02443⟩
Article dans une revue hal-02155425 v1

Analyse des variations génétiques de Campylobacter jejuni en lien avec sa survie au stress : vers l’identification de biomarqueurs ?

Charlotte Riou Delacourcelle , Sandrine Guillou , Sofia Strubbia , Nabila Haddad
Microbes 2025, Sep 2025, Bordeaux, France
Poster de conférence hal-05494951 v1

Towards a harmonized European Campylobacter risk assessment approach based on regulatory broiler surveillance data

Francis Lauriau , Maarten Nauta , Nabila Haddad , Sofia Strubbia , Jean-Michel Cappelier et al.
IAFP European Symposium, Apr 2024, Genève, Switzerland
Poster de conférence hal-05490689 v1

L'étape de ressuage comme levier potentiel pour contrôler la contamination des carcasses de poulets de chair à l'abattoir par Campylobacter

Francis Lauriau , Sofia Strubbia , Jean-Michel Cappelier , Nabila Haddad , Sandrine Guillou
Microbes 2023, Oct 2023, Rennes, France
Poster de conférence hal-05490856 v1
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Study of the Chicken Carcass Surface Cooling During the Slaughter Air-Ventilated Chilling Step

Francis Lauriau , Elodie Brams , Emma Deletrez , Jean-Michel Cappelier , Sofia Strubbia et al.
14th International Congress on Engineering and Food, (ICEF14), Jun 2023, Nantes, France
Poster de conférence hal-05430917 v1

The chilling stage as a potential lever at the slaughterhouse for controlling Campylobacter in broilers

Francis Lauriau , Sofia Strubbia , Jean-Michel Cappelier , Nabila Haddad , Sandrine Guillou
IAFP European Symposium, May 2023, Aberdeen (Ecosse), United Kingdom
Poster de conférence hal-05490857 v1